EMLSAT00000011878, EMLSAT00000011878-707725 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000011878
Unique NameEMLSAT00000011878-707725
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s836supercontigLSalAtl2s836:236020..269010 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000011878 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000011878EMLSAG00000011878-694644Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000053135EMLSAE00000053135-762063Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053136EMLSAE00000053136-762064Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053137EMLSAE00000053137-762065Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053138EMLSAE00000053138-762066Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053139EMLSAE00000053139-762067Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053140EMLSAE00000053140-762068Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053141EMLSAE00000053141-762069Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053142EMLSAE00000053142-762070Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053143EMLSAE00000053143-762071Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775047auto775047Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000011878EMLSAP00000011878Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000011878

>EMLSAP00000011878 ID=EMLSAP00000011878|Name=EMLSAP00000011878|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=838bp
MFLRSLLFLLLSSGDLLYLSTSSSFYKRAISIKIGAIFHENELAGHSYKG
FQASVSLINRLNDLSNADSIIHLNYDSLTYTNTSSYYISKSLCDGFENKG
FHFSLNVRPQLREVSQAFTDVILTNGWTRVGFIFGEESFNVSSSIGNAAW
IISLQNTLLEQGVDTLTKGFYIGEQKDYYHILLDLDSNETLSFFQLCDKV
GLSNKDYHFLHLRLDFKVSPPSSLHFSRSFSYFQILDQENPNSVELATAL
GGPFTDLDLETAWIFDALSIVSLASAALDYDFSSSPSTSCYTKREWTPGP
TFFNYLNTISHEGLTGKLKFKLMAYSSKSYSVRQLGSWNSDSGLSLFNGT
EEPEDYTIVDPEEDKETLIIVTKEERPYVMFQEGLIGINAYDGFAIDLIK
AIAEVLGFKYRLYTVPDNLYGFYNHETGEWNGIVKQLIDKRADLAVASMT
INYARETVIDFTKPFMNLGISILFKAPKPQPTEHVNQLFSFMNPLALEIW
LYILFAYVLVSITIWIIARFSPYEWAYPNPCQDRNRLVFQNDFTLPNSFW
FAIGTLMQQGSDVNPKAASTRIVGGIWWFFTLIMISSYTANLAAFLTVER
MAXPIESAEDLAKQSNIGYGTLAGGSTMTFFRDSKVGNYQKMWRYMESKG
ENESFVTSYESGVEKVLSGNYAFLGESTMLDYLVQRNCNLTQIGDLIDSK
GYGIATPKGSKWRDKISQAILFLQEKGVIQMYYNKWWRNKSQSTSSSTHC
STKPRVVDSVKANALGIVNIGGIFVVLLCGLAVAVIVAIMEFCWSNSSSE
IPLVKYGKDFSNSHIPFFSNSKTKHEAPSQPNCSQCVL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s836:236020..269010-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000011878-707725 ID=EMLSAT00000011878-707725|Name=EMLSAT00000011878|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=32991bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s836:236020..269010- (Lepeophtheirus salmonis)
AAAGTTAAAAAAAAAGTGAGCTGTGATAGTTCTTTTTATCCTCTTGATGT GTTCGTTTGGACCATGTTCCTTAGGTCCTTACTCTTCCTTCTTCTCTCGA GTGGAGATCTCCTATACCTCTCAACCTCTTCCTCCTTTTATAAACGAGCC ATATCCATCAAAATAGGAGCCATTTTTCATGAAAATGAACTCGCCGGCCA TTCTTACAAAGGATTTCAGGTAAGATGACTATAAATTAGAGTGACCAGTT ACCGAAGGGGGAGACTTGAGACTCTATTTGGATTCGATTCCATATTTTGA AGGCTTGCTAACTCGACTTCATCTCACAATCGAAGGCCCAAGACTTTACA TGGACTCCATAGCTAAGACTTAAGACTCAAAAGCTATTTTATACTGTAAC ATAGGTAAGCTTTAACACTATGGATATACTCATATTATGTACTTGAAATG TGCTCAAAATAAATTGAAGGACTCAGACTGAACTTCAAAAAATTCTTCAA GGACTCAAAGTGCACTCGATGAGAATAATCAAGGACTTTGATTTGTGGGA AAATACATGAGGCACCACTTGGACTTAGAGTACATAACGATTGTTTCCCA ATAGTGATCGTTACTGCTTTCTTTCACTTAGATTTATTGTCTTCTAATAT CCTTTTCAAAGCGTTAGAGGACTTTTTTTATAAATTCATCATATGTTTGA TTTTTGAGGATTAAGTGGATTTTATTCGACTTCAAACAACTTTAAAAAAT TATAATTATGAAGAGACATAAATAAATAGAAAGTTTATTTAAAAAAACAA AAATCCAAAATAAGCAATATTATCAACTCATTAATATTGTATTACAGGAG TTCTTCCCAAATTTTGTACTCATCAACTATCCAAATTTCAGAATCTCAAT AAAGTTATTCCTTCTGATATTTTTTGTGTTCAGAAATTAAATGCCTTTTT TATATAAAAACCTTAAAAATTCAGTAACATTATTTTAAAGACAAATATTT TTTAATTAAGTAGAAGGCGTTTTATACGAGACTTCAATCCTCCCTTCCCC GATCCAACATTCCAACTTCCCTGTATGGGAATCTTTCTCCATAGAAGAAT AACTGTTTCAGATATTCTTTAAACATTAACACCCTTCTTCCTAGAACCCT CCTCACTGATGGAATCACAATTAAATATCAATACCACTTCTTTCTACATT TAGGTTTTTTTCTTTTTTTTTTATTGTCATCATGGATATAGGCCTCAGTT TCACTCATCAATCGTCTAAATGATTTATCCAATGCAGACTCCATTATTCA TCTCAACTATGACTCCCTTACCTATACAAACACTTCCAGCTACTACATTT CCAAATCCCTTTGTGATGGTTTTGAAAACAAGGGATTCCATGTAATCCTT GGACCTTCGGACCCATTGTTGAGGTAAGGTATTTTTTGATTAAATTATCT GTATGTGAGTGAACGCAAAAATCAATTTTGAACTAAAGTCATGAAAAGAA GAAATTTCCTATTCAGGTACTTTCAGTCCAATGAGGCATGAGCATTGTTT ACATACATATTCGTTTGTAAACAGAGAGTGGTACCACCTTATAGTAAAGT AAAACAACTACCTCTATGATAATATTATATAATAAAAATAACATTACCGA TGCCTCTCACATGAAGGGCCCTATTAAAATTATTCCCAATTTTTTTTTTA AACAAGCAACAGATTGTCACACCACCTTGCAGATAAAATCTGTTGTTTTA GTTTTATATTTATGGGATGAGTTGAGATATCCAAGAGTCTTAATTATAGT TTAAAGTAGCGTTTATTAAGGGGGGTGACGCGGCACACAGCTGTCAAAAA ATAAGTATTTAGACATTTATAAACAGGGATGCTTTTTAAAATTGTCCCAT ATTTTAAAGACTTGTATTCCATAAAATTACTGTCTGAAAAGTTTTGTTGT TAAATATATTTTCGGAAAAAATATATTTAACAAAACATTAAACTTTCATG ATTCCCCTGAAACAAATAAATTATGCAAAAAGTGGAAAAATCTCAAAGGG AACAGATTATAACTCCATTAAAAACTGGGCACACTTCCAAGTCAATCCAG GAGATTGTCAAGGTCAATCGGAAAATTAGTTAATGTGCAAAAAGCAATTG GAGGATGGAATTGAGTCTAATCAGAGTTGAATAACCAAAATTGTGACAAC TCCAAGGTTGGTCAAGGCTGTCTGTGAAAAAATTCGGCGAAATCCACGAA GATCCATATGGCCCAGGATCACAATGTAAGCAGAACCACTATTATTAAAG ATTACATTAGGATCAAAACTTACAAAATTCAGTATCGTCATCTTTTGTCA GAGGGTGACATTACAAAGAGAAATGATAGAACCAAAGTTTTGCTCAACTG GCATGTAGTACATAAGAATGTCAGTATGATTTATTCTGACGAAAAGTTAT TTACTCTAAGTTGGACAATCAACAAACAAAATGATAGAGTCTTGACAAAA TCATATGTCCTCATTGATTCCATCCACCCAAAAATGTATCTATAAAGTGA AAAAACAAGAGGCATTCATGATTTGGGGGCGTTGTTGCTTCAAAGGGGAC ATAATACCTATATTCCTGATTGGGTAAAAATTAATCAAAAAGTTTGTTTA GCAAAAACATAACCTCCGTTCGACTTCCTTGGCGAAGGTAATGAATAAGA AATTTCAATATGGGGTATATGGAAAACAAAAAAAATGAATAGAACCATGT AGCTCAGAGGACAGCACGATCCGGAGAAATTATTCTCTTGAGCTCAATAT GCGTAGGTTCGTGACGCAGTAATTCCTAGAAAAGTAAATATACTATGTGT ATATGGACTTCAAAGAAGTTTGGAAACCTTTAATTTAGAGTATTCATTTG CGACTGTATTTGACCCCAACGTGGGCTTTGAAATATAAAAAATCTAACAA TTAAAAAATTATTTATTGTAATAATAAATTTTTGCTAATTTGAAGTGATG TTTGAGGTACTTACAAAGGATAAATCATAATAATAAATTGTTAATAGAAA TTGACGATTTTTTATTGAAGAATACAAATATCATCCTGACTCCATTTAGA GAAAATTCATTCTTGCTTTTGTCTTGAATGACTGTTTATATGTATGCAAT KTAGGGAGAGGGGCGAGTTAAARAATAATTTACTATGATACCCCCCCCCC CCCACCACAACCACCGCCAACAAATGAAGTATATAAACCTTTTGTATAAA GACAGAACCAATTACCTACCTTTTTTTCTTCTTCAATATTGAAAATAATT GGAGAATGTGTGTTCGTGATAATTTGTATTAATGTAAAGATTGTCCAACG TGATGTTGAGTGGTTTTAGGATATTCCATTCATCAAAAAAGCTGTAGATT AATAAAAAACAGGGCGAAAAAATTATTTACAAGCAAATAGATCTATAAAA TGTACTAGAACAAAAATGTCCAACATTCCTTTTTTCATAAAAAAAACAAG AATTTAAGTATTTTCACCTTTTCATTTTTTATGAAAACATATATAAATCT TTAATCGCGGTAAAATTCTTATTAGTATTTTGAAACTTTTTGATATTTAT TCGACTAGAAATAGAGAACAAAATGTGGTCAAGGGGGATTTTATTTCATG ACGTTATTTAAAATTATTTCATTTATGCTTTGTTCTATGAAGTAATTTTT CTAGATAAGAAATTTGTAGGATTATGACGTTGAAAGGGCAATTTATTCAT AACGTAACGACACCGCAAGAATGGGTTCCAATATCTATTTAGCATAATAC CGTTTTTTGAAAGAAACATATTTTTATCCTAATACGTTTAAACCCCTATT TATGAAATTGGACTGTGGGTCATACCCAGACTTGCGACTGAGTCCTTCTC ATAACTCCACAAGTTCATTCACTTTGTACACAAGGGTCTTACCCACGTTT ACAGTCTTTCAAAAATTTAATTGAGCATGAGAACTGCAAAATGTTCCCGT TTTATTTCAATTACTTAGCTAAGCAAACACCGATTTCAACGTGAAGCATC TCGTTTGGAAGCCTTATTATTATACTTTTGGATCAACTAGGGATTTAACA GTTTCATACAGTGCGTTTTCAACGTATGAGAGGAAAATACATCTTGGGTC CTAGTTACATGATGGTGTGATCCCATGGGCCAAGGATTATACAATTAGTG TAGCATCTGACAGCTTTCCTTCTCGACTAAAGTTTTAGTTCTATAGATTC TAGTGTTTGTTCACACCATGCAATTGAATTTTGAGTACGTTAATAATAAA ACATCAACTTCATCTAAAAAGGAAACCGGAAGTTTGATCCCAACTAGTGT GGCTTTATTTGAGAGAACTATTTAAGCTTCTTTAAATGAAGCATGAGTTT TGTAGATCTTAGGCTTATCAAAAATGGCCAATTTTCGTGGGTAAGTAATT TTTTTTTTTGTTCTAACATTAAAATATCAAAGCTTCAGGCTGAAGATTCC TTTCTAATGTTACTAAAAATACCTATATAAACTGATAAAAAGAATTCTTT TGCAGGTAAAAAACTACGGCATTTATAATAAAACTAAAGTAATTGATAAA AATATTCAAAACATTTCTCAAATTTAAATTTTAGATTGTCTTAAGATCCT TTTCAAAGCCCTTGAGGGGTATCTTGAAGTTGACAGAAGATAACTTCATT TCTTCTTCATCCAAAGTCCACGAATTATTCGCCAATTGTAATTGAAAGTG 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AAGAATATAAGTGAAATGTTTTTTTTATGTCCTTTGAATAATCCCTGAAT TTGTCTTTTTACGAACCGTTCCATAAATTTTTTTTAAATTTGAAGTTAAT TATTCTTTTTATAATAATTTTCTTATGAAGTTTTGTTATCGAAATAAAAT ATACAAAATCAATTAATATTTATATCCCTCCGTTGTTGAACTGGGATATT ATACACGCTGAGATTTAGAAAAATTCTTCTTATATATTTTAAGTTACACT TTTACTTATGCACCTCAAATATTAAATCTGATTAAATGCAATTCTGGGTT CGTCTAGATAATGCCTTTTATAGGAATTTTTAATTGAGGTGTAGTTAATT TGATTAATTGGTTTACTTAAATGTTGTTCCTTTTGATTTCTTGTATTCTT CTTTTTTTTTAATCTAATGTTTCTACTTTAAGAATAATAAATTATATCTC TTTGAAACCCCAAACTCATGCTGTTAAGATGATTTTAAAATAAGGATTTA TTAAAAAAGAAATACCCCCTCCCAAATTAAGGAATTTTTTCCTTTTGACC GCTTTAATAAGAAAGAATGGGCTAACTACTACCAACTGAGGTTAGGTTTT TTCCGTTTCTATTTAAAAAAAAGGAAAGGTTGCAAGAGAGTGTAAAGGTT TTAATAAATTAGATTATAATGCAGTGGTCCCAAACTGGAGGTCCTCAGGG CCGTTGTACTCTGTGAATGATTATATAAATATTCCGCAAGAATTTAAAAA ATGCTATACTGGGTGCGTATAAATTCCGTGGATGTGACTTTATAAACTCA TAGCTAGGTTCTGTGCAAAGAAACGGATTTGAAATTTTGACAGATTTTTC GAGAATTTATTTGAAATCTTTTCGCTTCCAAATTTATTCTTTAGCCTAAT GTAAATTAAATAAAAAGCCGTTTGCTCAAACAATTGAAAATAGAGGCTCT 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TTCAACGTAAAGCTCAAAGTAGGTAGAGATTTTTAAGCAAATTTTGTAAA TGTAAGTAATACTAGAGCCTTTGGTTTCCTTGATGTTGATGTAATATTAT GAATGACTTTACTCATACCTTCTATACAAAAAACAAACATTTCAGGGAAA TATCATCCCGCATTAATTTGTTCTTGAATAAGGGTTTTCTAAAGGAATCA TTATATTCAATATACTGATTTCTTGGACTTGGTCAATTTGCCTTCAAACC ACATGAAACCCATATTTTTTATACGTTTTTTAAATCTAGATTTGCGGTTG TGGCTAAGTTGTGTAGTTCAAATTTATTTTAACCAATACGTGTTTCTTAT ATATCTCTCAATGTTTGCATATTTTTTATAAAAATTGTTTTTCGGCCTTT TTTGTATCAAAGAATTACAGATGGGATGGTGGGCTATGATTGGGGGGGAG GATTTTAAACTAGAATGTTTATTTATGATTTTTATTATCGTATTCCCACT TAATTAATTTTTTTATGTTATTTATGTTTGATACATGTGTTTGTGAAATA AAGCCCATAGAACAAAAAAATAGAAATCTAAAACATGAATGGACACAATC GTATTACTGTAAATGTATTATTTGACGAATAAGTGTTGACTTTTATCAAC AAATTATTTATACTAACCATTTGAAAGCGCTGAAAATTATACTTAAAGTA GAAGAAATGGATTGTCACATTAGGAAATTATTGTAATATATTAAAATTTG CATATCTGGGACAAATTTCATTTCATAAATTAAATGAAGATTCTGTACTA AAGTTAACATTGTTCGGTATCTTCATTCATCCCAAAAATTTAAATATAAA GCCTAAATTTGACGGAAATATGTCAATTAATTTGGGGGGAGTTTATTGTA TTTATGATGTGAAAAAAATAATTCGGACGTTCTCCTTTTCATGATTCCTA 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CCACCTTCTTCCCTCCACTTCTCGCGCAGTTTCTCCTATTTCCAAATATT GGATCAAGAGAATCCCAACAGTGTTGAATTGGCCACTGCTCTCGGAGGTC CTTTCACAGATCTGGATCTAGAAACTGCTTGGATATTTGATGCTCTTAGC ATAGTGTCCCTCGCCTCTGCAGCTCTCGACTATGACTTTTCAAGCTCTCC TTCGACATCATGCTATACAAAAAGGGAATGGACTCCAGGGCCTACTTTTT TTAATTATCTTAACACCATATCACACGAGGGCCTCACTGGGAAGTTGAAG TTTAGTGTGAGTAATGAGATAAATTATGTTGCTTTCTGGTTTTTTTATTA TTTTTATTCCTTTAGCATATAATTTTATTTAAATAAGAGTTATGTCTAAG AAACGGTTTCTTTTTTGTGTTTCTTGCTTTCATAATATGTATAACATAGA ATAAATGAGAAAATGTCTCATTTTATTTCATCTGTCCGTAGTAAAGACAG AATGAAAAAAAAAACATTTTAATGGCGAAGAAATTAATAACGACTCATAT ATTTTCATAGATCTTATTATAATTACTTATTTCCTGTATTATATGCAGAG TAGAACACTTGTCTTAATATTAAGTAGTATTCGAAGGCTTTGTAAACATA TGCATATAATTATTAAGGATATAACAATCCCCAAATTTTGACGTATTTTC CCATTCTAAACCTTAACATAATTTGTATGCCACATTTAGTTCAAATTTAA ATAACTCTTGATTCCAAAAGATTACCCACAATATTTTCACCTTGAAAGTA GTCTATCTGTATATATGAGGAATATATAGGTATAATACAGTTTGTGTTTT TCCTTTATGGGTGCCAACTCCGTTGAGTCTAGGAGGCTGAAATTTTGCAT GAGTGACTTTTTTGAACCTGATTAAATTTATTAAAAATCAAAAAAGTCAT 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