EMLSAT00000011923, EMLSAT00000011923-707770 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000011923
Unique NameEMLSAT00000011923-707770
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s841supercontigLSalAtl2s841:50785..68899 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000011923 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000011923EMLSAG00000011923-694689Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000053349EMLSAE00000053349-762277Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053350EMLSAE00000053350-762278Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053351EMLSAE00000053351-762279Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053352EMLSAE00000053352-762280Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053353EMLSAE00000053353-762281Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770672auto770672Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000011923EMLSAP00000011923Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000011923

>EMLSAP00000011923 ID=EMLSAP00000011923|Name=EMLSAP00000011923|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1376bp
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KIEEKKGYLERLKQELKSLKKEPFVIPDESEEEKEARILNRIQQLKKSSL
WFTFEPKKRMDPSLKKPKVHWDFVLEEMSWLSSIFQQEMKAKKLGAKKCA
KMVQKHFSDKALSVARAEKAHEQHLKKLASFQAKEIREFWSNVEKFFEFR
LQKRIEYMRKKALDEHLNFIVDKTEKFSNMLAESLAQDISSPSLKNEQQS
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SEIPIEELLRKYYSDQQASNSESEEKDKVMEVEKNDESEQVVKKEKSKEV
VSKMEEKDVEEVDNNYSKSDIISSPKDETSHDKKKENKVEEEEEEREYTL
ERLMNEEESDSDFNNVIAMAAKFQPTGNTLATTNVKTPIPFILKHSLREY
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ITSYKLVIQDHSSFRRKKWHYFILDEAQHIKNFKSQRWQMLLNFASDGRL
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NDGLIKRLHKVLRPFLLRRLKNEVEKQLPKKYEHIIRCGLSNRQRYLYDD
FMSRTKTKETLETGNFLSVINILMQLRKVCNHPNLFEPRPTVSPFVDFVV
QLDIPKLALRDRIRNLAVDFAYHPILLTPHEFTSSAYSSFRANQLKINKL
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DHELSVKIKRGSYAVHPCEVASKVPRVELEDPLFDYESSIKTNGDVEVEE
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CETNPVYGTDLIDAVRFISADAFSFPKISMMVPGDNEKLIHKYPHFPETN
LETVERLKPFFDYFMLYIPHCLSIKPLEHTSNEDVIKDDSLNGTASLQNN
LMCRPFNLLLPETRLIQYDCGKLQRLKTILSNLRADNSRVLIFTQMTKIL
DILEIFLNYLGYIYLRLDGSTKVEQRQILMERFNGSKKYFCFILSTRSGG
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EENILKKANQKRLLGDLAIEGGSFTXATLKKQTIRDLFDVNDETVSGTQV
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ETETSEKNEMEELIKSILDQLTSLERYALSHIEKMEKEWQDEQIAQAKAE
IEEQKRELNSKKIEELSDESSEEDDE
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mRNA from alignment at LSalAtl2s841:50785..68899+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000011923-707770 ID=EMLSAT00000011923-707770|Name=EMLSAT00000011923|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18115bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s841:50785..68899+ (Lepeophtheirus salmonis)
CGCGAGTTGTGATAATGTTGTTTAGTGTAAATATTGTTTTGCCGTTTTTT TTGAGGTAATGACGGGATATTAATATGATATTATTCAACACAAGCTTATG TTATTCTTAATGTTATCTAAATAGATTGGAATGGAAAGTGGATTACTTCG TAGGAGTACTCGGTACTCTCAGGAGAGTAATTATGGAGAAGAAGAGGACG AGGAGGAAGAAGAAGATGATGATGATGATGAAGAAGAACAAGATTCCTTC ACCAGAGCCGCTTCCGAAAAGTTAATCGAAAAAATAGAGGAGAAAAAAGG TTATTTGGAGCGACTGAAACAGGAATTGAAGAGCTTGAAGAAGGAACCGT TCGTGATTCCAGATGAATCCGAAGAGGAAAAAGAGGCTCGRATTTTAAAC CGTATTCAACAGCTCAAAAAGAGCTCACTTTGGTTCACTTTTGAGCCCAA GAAACGAATGGACCCCTCGTTGAAGAAGCCAAAAGTCCATTGGGATTTCG TCCTTGAAGAAATGTCGTGGCTCTCAAGCATTTTTCAGCAGGAAATGAAA GCCAAGAAATTAGGAGCTAAGAAATGTGCAAAAATGGTCCAAAAACACTT TTCAGATAAGGCTCTAAGTGTCGCAAGAGCGGAAAAAGCTCACGAACAAC ACCTTAAAAAGTTAGCGTCTTTTCAAGCTAAAGAAATTCGGGAGTTTTGG TCAAATGTCGAGAAGTTTTTTGAGTTTCGATTACAGAAGCGTATTGAGTA TATGCGTAAAAAAGCTCTGGATGAACATCTCAATTTCATTGTGGATAAAA CGGAAAAGTTTTCCAATATGTTGGCAGAAAGTTTGGCACAAGACATTTCT TCACCATCACTTAAAAACGAGCAGCAGTCCAAGATGATCCAAGAATCTGA GAGTGCTCCTGAAAAATATGAGAAGGAATATCGTCCTGATTCTTCTTCCG 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