EMLSAT00000011961, EMLSAT00000011961-707808 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000011961
Unique NameEMLSAT00000011961-707808
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s84supercontigLSalAtl2s84:1186001..1208377 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000011961 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000011961EMLSAG00000011961-694727Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000053545EMLSAE00000053545-762473Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053546EMLSAE00000053546-762474Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053547EMLSAE00000053547-762475Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053548EMLSAE00000053548-762476Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053549EMLSAE00000053549-762477Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780506auto780506Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000011961EMLSAP00000011961Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000011961

>EMLSAP00000011961 ID=EMLSAP00000011961|Name=EMLSAP00000011961|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=662bp
MILSILFNTSLNIQSTMLLRSYIFIFLVFLHQTRGASQFGGSPSIFHSQD
DQGGYNFGYESDRESKTEVKTADGVVRGKYKYIDANGILQTVYYISDDKG
FRVXXSNLPIXPEEPHVSPSTTTTTXTTTTTTQRIPSSPIRRPFILDNSP
IEQTESSRYPRQNTLKPEYLRQNTFQHEYPHSYSPYPSEYSNLYPYTPIP
HSKSYTPRILNPYAFYNNNPTTKPIYPVNTPYPSNPLLSRNPEVEQVPQS
SSPPQNEKTPSPLLDRKNFHVKDKDGHYAFGYEDQHSKRTEARYEGTVRG
SYDYIDADGNVQTVHYVADKEGFRVKGTNIPVANQEVVQDTPEVRKAREE
HFQIFKELENNFNDPSKRTRRDVPHTQVPTFVYPQGVPFFIPQPFVNNGG
PRHLSFEQIHGIPEGLPEEKFVQPILTEQNTFVEKIPEPIFVSSPIAAPE
SSFAPVEGPAYASNPIELPINGPLLVEDPIILPAVKPVEPLVSPISTFQF
HAQNEFGEYKYGFSNPTASKNEIKVDGIVRGSYSYIDANGEFQITNYISD
ALGFRLFQSPSSSKRCPSRXEANMRSLVQHTYLPYAVNYGYQNPSRALPL
PEVPDSPAYVPPPYSYADPTGKVKNVPSISSIVHLNSHDVSSKEDYVYLP
YASQHPYYYNLD
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mRNA from alignment at LSalAtl2s84:1186001..1208377+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000011961-707808 ID=EMLSAT00000011961-707808|Name=EMLSAT00000011961|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22377bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s84:1186001..1208377+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGATATTGTCAATCCTGTTTAACACTTCTTTAGTATTACAGGCTAAGGT TCAAATAGCCTTTCAATTCTAACATAAGATTAGTTTCATTCCTATGTATG ACGCAAGTTTCATTCAGGTTCTTTCTTATCTTGGGTTTTACTAACGTATA CGTAGCTACAATTATAAGTACAATACATACTCAACGCAGTATATACCTAT GTGTTTTTCAACAATAAAAAACCTATGCGATTGTTAAACCGCGCCCTTGT TTATATATACTCCCAAGGAGTAGCCATTTCAACTCAGTTGTTGAAACAGA CATAGATCGACCAAGAGGGCTTTTATTTTAGCAGCATTGGCGAAAAATTG TACCATCATTATAATTTTGTAGTGCTTCATCAATTATTGAGTCTAAAGAT TTAATAGTTAATATATATATTAATTATAGAACATTCAGTCCACGATGCTA CTTCGAAGTTACATATTTGTAAGTAATAACGTCTTTTTCTAGTATATTTA TTAATCAAATTATATTATACTGGTTTACTTACTTTTCTAAATGTAGCTTT TTATTTATGCAAATATATTTAATACTAACTTTAAATTTGAATTGTTTAAT GCGTGACGTAGAGTTGTTGAAACTTCAAAAGGGAATGTTAATTATGTAAT ATTTGAAAGATACATTTTGTACAAGTTTTCAATTGAATAAAAATAACATG TGATAGCAATTAAATAACGATGCAAGGAACTTTAAGGCATTATTTTGTGA CGCATTAAATATTGGCCTGAAAAAAAAATCATCAAATTGAAATAGAATCA AATTCAATTTTATAAATATTTATCTATTATAATTGTAGTCATTTAAGAAC AAAATTTTATCTCAAATGTTTTTTTTTTTAATTGTGAGTTTAAACCTTTC TGTTTAATTCATTGGACTTTTTATGTAATTCATGACTCCTTCGAAATTTG GTATGTTGAAACATAATAATGCTATCCATTAAGCCCAGTTATAAAGGGCT TAGTAGTATCCCAACCCATGAAAGACCCTTTCTTTTTTTCTTTCTTTTTT TAATGCTGAGATGTATATACGAGGGTGGTAAGAAAAGTTTCCAACCTCAA AGTGGAGATATTGCTAATCTTAAATAAAAGCTAGTCACATCTATCTAGCA TCTTCTGATAGTTAATCACCAAGGGTTCAGTAATTTTGGACACGCAGTTG TTATTTAACAGTCATTTGAGTGAGTTGATGTAAGTATTTTTGTAAAAATG GACAAAATCGAGTATCGAGGTGTTATTAATTTGTTTTTTTTAAGTAAAAC CTTTAAATAGATTCAAATAATAGCTGAAGTTTAAAGGATTGTTGTGTTAA AATTTTACGGTTCTAAGTCAATCCAACTCAGAGTAATTGAGCCACAAACA AAAAATGTCTTGTGAACCATTATTTTTAGGAGAATCCCCTTTTAGGAGAG TACTAATTGGACAGGTTACAGATATGGGAGAAATGTGTAGAAATAGATGG AGACTATGTTGAAAAATAAAAATTCAAAAAAAATATCTTGTATCTTTGTT AGGTCGGAAGCTTTTCAGATCCCCTCGTATATGTTGTTATATATTGTTAA ATCAATTGAAAATATTGTATTTTGTGCGTAACTAAGCGGATTTATCATTC CCTTTACTTTTTAGAAATTCAGTCTACATACGCTATGAAATTAAATGGGA TTTTGTTTGATATACATATGTGCATTATCAAATATTACTATTATTTTGCA ATATATATGCTAATAAGTGTTTAGACAACTTGTGTTTGAAGGGATATGAT AATATCTAACAACTTTTCTATTCCAGCTACTTTATGAAATATTAAAGAAA ATGCTTCTTTTTAATATTTAAAAATATATATATAAATTTAATTGAATAAA ATAAAGATTTGAGGTAGATTGAGGGAGCTCTTAGTGGATTTTTGCCACAC CCAAAACTAACCATGCTTCCACTAGATGATATTCAAAATTTGAATCTAAG AGCAAAGATGATAAAAAACTATCATATAAATCACCATAGGGGCTTATAAA GTTATGTTTATGATATATTCCATTTTCCATACTTGAATATTTTAGTAACA TAGTTTGAAATGACAGTAATTTAAGTACTTTGATCTTTAGTAAATTCTTT ATGCAAAATATTAAATCAGTCTCTCAATGTGAATATACACCACAATAAAG CATGCCAATTATTATATGCACTATATTTTCTTTTTTTAACGAACGACAGT TTTTATTATGGTATTTTTATGTGAAGAACATTACTTTCGAAGTAGGGAGG GGCATTTAGCATTGGGTTATGTCATCAGTGATCAAACTTTTTATAACGTA TCTATATTTATGAAACAGTAAGTATTGTTTCCAATACACAAATTAGTATA GGTTTTAATGTATTAATAGCCTGGTATCATTATAATACTGCTATACCAAG CAGCAATACTTTAAAGGCTCCTCCGTCTAACATGTAACATTTTTTGAAAG TTACAAAAATTGTTATATTTCAAAAAAATATCATCAAATTTGAAAAATTT AATTTATATATACAATCAAGGGATAATTTATTTACATTCTCAGTTAATAT AGTCGCATTTTGCCTTAATGGTCAGTTCCAGTTTGATGCAGACCTTTGCA CAGCAGTTCTTTACAAAGCTTTTTGCACGGGTTCACACTCTTTACTCGAT CTGAAGGCTTCAAACCCTGACAAGGAATTATCTTGTGGTCATTATGGCTT AAATCTTGCTTGACCAAGCTGTGCATGGTGGTCTGGCTGATGTCAAATTC ACATGTCATCTTACTTCTTCTGCCTTTAATGGTCCATTAACTATCTAAAC 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ATAATCCTGATCCTATTTTATTTAAGTCTGAGCTTAGAGTAAAATACATT TAAAATTTAACTTACTTTCGGATCTGTATCCAAAAGTTGGTGTGCCCGAA ATTGATCAAAATATTAAGGTCTAAAGATTCAAGCCTACCCAAATACGACA ATACGTGGATCTGTCCTATCTTTAGCCATGTACTTTCAGAATGCATCAAT GGTCCATAGTGTATCTTCCGATGAATCCATCATACAGACATCGTTCCAAG CATCAATAAGATTCTTACATGTAGATGTTGTATCAGGACGCACATTCATA ATTTGGGCACTACATTAAAGCCTTTCATAAGGATTACAATAAGACACTTA GAGCTCCTTTGTTCTATAAGACTTCTCCTTAGTTAGAAGAATGAAACGCT AATGAATTCAATTCATTCTTATCAACTAAGACTCATCTATCAGTTTAAGA AATATTATTCTTTGAAGAATACCCCACCTTTTAAAAAAAATATTTATTCT TAGATTTAATTAAGAATTTATACTGAGTAGGTAAAATCTTAGGTAAATTA TTCATAAAAATATCAATTTAAGGAATGTATCAGTTCTGACATTTTGACAT ATCATCCAGTCTCGTTATCAATCTTTCGTAAAAAGAACGCAAACAATGTC CAATAGTACAAAATTTAGAATATAAAATCAGTATACACATACGGTGTGAA AAAAATATGTCAAAGAAATAAAAAGGAAAAGTTACTAAGTGGAAAATGTA GAATTATTTAAATCTGAAGTAGCTAATAAAATAACATTATATTTTATCGA CATTTTATGATAATTTTATGATTCAATGGTGGTCTGAAAAGTTTATGAAT TCTATATAAATACGGCAGAACTCGTAAATAAAAGCTAGTCCCATCTATTT AACATCTGTTGACAGTTATCACCAAAGTTTCAGCCATTTTGGACGAGCAG 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TTTTATTCTTTTCTTTCCCATTTTTTTCCCCAAAAAAAAATATTTTCAGA TTTAGAGAATTTAAGAATATCTCATTTATTTTTTATTTTTGATAACTGTT ATTTCCTTATGTTTAAATTTATTTTTATTGTAAGTCGTTTTCCTTCAAAT CAACCCACATAAAACCTGACATATGAGTATTTTATAAATAAAGCTGCTCA AACACTTTGGAAATGATTTAAAGGAGGGCGTATACGTAAAAATAAAAATA ACGCATTGTTCATTTTCTAAAGCATAAAAATAGTTTTAAAGACTATTTCA AAAAAACTATGTTATACTGATTATCCTATTCTTTTGACTGGTTTTTAGAC AAGGTCATTTAGTATTTATAGACAGTTCTAATACTCTTAAGCATCCTGTG TTGTTGTTGTTTTTTTCTTTTAGAACAAAGCAACGCTGAAATCGTCAGTG TGTCTAGTTGTGTTGATTTTTTTTGAAGCAATTTCATGTCTACCTGTTTG TACAATACATCTGTATGTATAAACAAACTTTACAAAAAGTAAAAAAAGCT TATAGTTGGACATTTAACCTTCATTTCTAAGCAGAAATAATGATAAAACC ATAATACTATAACAATAATAAAAGAAGTTTGTCTTGAAAATATTTGCAAA AGAGCGGTTTGGTTCTCGATTTTTTTTCTTTCAAATTTCGATCACGGCCA GCGTGGAAAAGTTGTCATATGCTATGAAAATAACTTATGCAAAATTAAAT TGTGGCCATCTTTAGATCACACATCTTTATCAAATTAAGAAATAAGGCAA AAAATCTTTACTTAGTCTATATAAATAGATACTAAAGAGACATTTTTTTA ATGTCCCTTTAATTGGACAGAAGGAGTTGCTAAGTAGAAATAAACATTAA TATTCTAAATTTCCCATGTGACCTAGGGATCTCTTTTGAAGACCATATAC 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