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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s84 | supercontig | LSalAtl2s84:620034..676369 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011969 >EMLSAP00000011969 ID=EMLSAP00000011969|Name=EMLSAP00000011969|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=253bp
MRRRLHQSFQMSPSSLSTGGLGVHNNSNTHHVSNNNSNNPNGSAIPSISV SVQTDXALIXAAAATTSSHLHHTSLVGNGHVINMAXLLXGPXSXGTAATS AYHHHHHTLPHSHFRGAGSGVGLVSSGDTDDNWTNSRGIPSAQSYRDVRE VIALPHMTSHSRENTLSRDHHLAEIGMRSSCTTENLTRSPSATTAATTNG GSGGPTTSNSGPMDDDLVLDYTEGDMMLGGRSGSTSTSNGNNNNSINNGI HRF back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s84:620034..676369+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011969-707816 ID=EMLSAT00000011969-707816|Name=EMLSAT00000011969|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=56336bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s84:620034..676369+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGAGACGTCGACTTCATCAAAGTTTTCAAATGTCCCCCTCTTCACTCTC
GACTGGGGGCCTTGGTGTTCACAACAACAGCAATACCCATCATGTATCTA
ATAATAACAGCAACAATCCCAACGGTTCAGCCATCCCTTCAATTTCCGTA
AGTGTTCAAACGGATYCCGCMCTCATTSCAGCCGCTGCTGCTACAACGAG
CTCACATTTGCATCATACATCCCTTGTTGGAAACGGACATGTGATTAATA
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AGGAAGTGGCGTGGGACTCGTGTCATCTGGAGATACTGATGACAATTGGA
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CTTATTTTGAAATGTGCTATCCCTGAAATTAAGAGAATTCGCGTAATTTC
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TTAGCCATATAATTGACTTAATTTTATTTAATTTTGAAATATTGTATTAC
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GAAGGCTTGGTACCCACTAATGATGTAGGCCCCTATCATGGCATAGCTCA
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GTGCATTTCCACCCTCACAAGGTCTTTGCACTCACTTTTTTATAACTCTT
CGGACAGTTTGATACGAAACTCAGAGATCTCTTGCATAGGCCCTCAAGGA
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TTTTTCTCCAACGTTTCGGACTTGCTGACGGCGTAAACGGTGGTCCTGGA
GACCCTCAACTGCTTGGAGTGCACGAATGGAAATTCTTCAATCACGTTCA
AGTGTCATATTCTCGACTTGTACATAAGCTAGAGAGCTCAGTTGTTGTTT
TTTTACCTAATTGTTTATGCTTTAATATATCGAAATATGAATTAATTTTA
ATAATCACTCAGCCTTAATTAATTATTGAATTAGTAAGTGTTTAGATTTC
AATGGACCCCCAGGTACCAGCTGAACGTTAACATAAACTTAGAAGTTTGT
GTATAATTGTTTTAACACTCTCAATTAGATATCAATATTCTAAATTTTAA
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CATTTCGTAGAGCGCGCTCTAGCGTGAGGAGAAGGCAGGAGATAATCTAA
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GAGAAAATGTATTGCCCCTATAAAAAGGAGAACCTTCAACATTTAAAATA
GCATTAGTATTGGAAAATATTAAAAATTCAATATTTAATTTGTTATGCAG
TTAAAAAAAAAATCACCAAAGTTAGCATTCATTCATATTTTAGCGAGATA
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ATGGACAACGCAGGGTTACCACCGAAACAATCTATGAAAAAATTAATATA
ATCTTAAAAAAGAACAATTGCAGCTACCGTTTCTCCTTTTTTAATCATAT
ACTGCTATTTTATTCTACGTTTTTCCCATCTCAGCTTATATAATCAGACT
ATGATCCATTTTGATATTTTTCTTCTTTTCTTGAAATAACAAATAATTCA
ATGTATTCTCTGACAAAATGTAACTATTAAATAAGTGTTAAAACTCTTGT
AAGCTGTAAACAAGGAGTGCCCCATATGTGTAATCCATCATAATCCCAAA
CAGAGCTTAAATGAAGTCGTTACATAGTGTACCTAATTACATACTTTCAA
TTATGACAGGGTAGAAAAAAAGGGAGAAAAACAAGAACAGAGTTGTTGTA
AAGACGAAGCTCCTTGTACGTACATGAACCAAATATGTGCATTGTAAAAC
TTTTTTAATGGGATAATACTCCTATTTATATGTCGTGAAATTAATTAATA
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TAGATTAAGCCTATCTAAAAAATTTAAAAAAGAACCTTTTACACCTAGTA
TTATGTCTAATCATTCAGCTCGTAGGAAGAGTGCATTTCAGATATATTGT
ACTCAATTTAAATCACCATTTAAAGTCTTAATCATAATTCAAATTAAAAA
CTAAAAATCTTCTAGGTTTGGTGACACTTTTTTTTATTTAATATTAAAAT
AATGATAAATATGTAACAGTAAAATAGATGCCGTTATTACTCTGTTCTAC
ACGGGACATGAAGCAAAATGCATTGCAAAGCTCATAAATTTCCACAATCG
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GATGAGTAAGACAACCTTCTACTGAGATGTTTCAGATTACCTTTGTCTAA
CCTCTTATCGCCTAACGGATTGTCATATACTCACTCATCGAATGAAGGAC
AAATAGGAAGATACTTCTTTTCTCTATAAAAGCCATTTCGTTTATTTTCT
AATGAAACACTCTTCACCGTAGATTGATCATTTAGCCAAACTGATAGTTG
GATAAGCTAAGATGTTCAGACAGGGTCCTGTTGTCTCCAGAAGCAATAAT
GTGACTGCTATTTTGACATTGGATATCATCAGCAGTGAATGCTTTGCTAT
GAATCCTTATTTTTTTAGTGTTTGCATCAAAATCAACAAAGATGTTTACA
TGGATGTCCTAGGAACGGTTATTGTACCCTGGATGAAGACTGTGGCTGAT
GACAGGCCATACACATTCCATCAAGACACTGCTGCACCACCACAGAATCA
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TTAATGTATGGCTTCCAAACTCCCCMGATTTAAGACCATGAAACCATGAC
TGTCTGAAACAGTCTGTATCTATGTTCATTACAACTCACATAATAAAAGA
TTGAGGTTCAAATGTATCATAATATTAATATTAAAAATGGTTTGTTGATT
GTCTAATGTTTTAACGAAAAGGAAATGTTGCATACTAGTGACATGTGGTA
CAATACATGGGATGGAGGAATGATATATTTCGTTATTTTTTACAGACTTA
ATGATGATAAGAATTGATAAATATTCATTCATGACATGCATTGTATTCAA
TTGAAAGGACAAGCATATAAATGTTTATTTACATCAACAGCTTGTTGATG
AATCCATTTTGAAAATGGGTAGACATACTTTGCTACAACGTATACATAAA
TGTATTACCAATGGGAAGTACGCTAACAAAATAACATCATGAGGCAATGA
CGGTCTTATGAGAATATACAGACTGTTTCAGATAAGGTGTCTTTATAAAT
TACCATTGTAGATTAATTTATTGTGACTTTATAAATGACTTTAAAAAAAA
TTTATAAGGATAATTCTTATGTTGAACAGTAGTGGATTTTTATATATTAA
ATATTGTTAAAATTTCATCAATGCTAAAAACTGTATGGTTCCTATAAAAA
TCTCAACCTACAAATAAAAATTTCATAACTAAAGTTAGACATTGAACATT
TTTTATGACTTATGAATAATTTTTTTCAGCAGCATACTTTTTTTGAGATT
AGTTATGTGGTAGGTTTAAAAAAGTAACAAAATAATACATTAGTCTATTA
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TCTTTAAAACAAAGAAACCCTGAATTTATTACGGCGATATCCTATGAACA
TTTAATTTATATTTCTTCGTCAGTTGTTGATTTTTCTACTTTTCTTGGCT
TTTTTATTGTTTCTGAATTTTGATTGATCAAAGACAATTTCGTATTAAAT
AGTGAACCATCCCCTATTATTATGAAGATTAATCCTACAGTTGGGAAGAA
ATGGGCTAACTACAAACTGATATTGGACCTTTTTCTCCCTTGTATTTTAT
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TCCGAATTCCAAATAGGTAATTATTCCACATATACCAAATTTTAAACCTA
GTTACGCCACTGAGTTTCCATCAATTGAAAGGTTGATTTGTAATTAATTA
ATGTAATAAAAATCATTTATTTTCTTATAAAACCTTTCTTATTTTGAAAG
AAAAGTTTGATACTTCCCAAAAATTATTACACAACTCTTAAGTAGTTTTA
AATCTAATTGTTTTCTAAATTTACATATGATAAGTTTGTACTTCTGTTTA
AAATAGGCTTCAACATTGATAAATAATAAGAAATGATAGCTAGAAGCCTA
TAATAGTAAGTTATGACCAAACACTTTCTACTTTAAACTTCTGCTATCTT
GTCTGTTGAAAGAAGTTATGTTGAATAGCTGAACAGGAATAATTAGTAAA
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TTTTATCCTTTGATCCTTTTGATAAAATCTTAATAAACAAAATGATCTAT
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TATTAGTTATTAATTAATAATAGCACAATAAGTGTCATATATAATCTATT
ATTTTGAAAATAAATAGAAAATAGAATATATTGCTCAATTTTAATTATAT
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GAAAATATATTTATATAGTCATAAATGTATTATAAAATTAAAACATTTGG
ATTTTGATAATTTGTACTCAAATATATGTTCTACTAATTAATTGTTATAT
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TAAAATTCTTATTAATAGACCATCAACAATGAAATTAACGTTATAATTAC
AATTTAAGGACGTGAATGCACTAAAACCATTGTTATAACTATTACTATTT
TAGATTTTAATGTCAAGATAAAGAAAATATTTGGTTATGCTTAGAAAAGT
TGAAATTGGTGCATTTTTAAGCGTGCAAGGATACAGTTGTAGAATCTATT
TGCAAAAATTGGATTTTTTGTAAAAACACATTGAACAATTATATTCTGAC
ACTCCTTAAAATGAGTGCACTTTCACTTATTTAGTTATGTTATAAACTTC
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TATTACTTTAAGTTTTTCAAAAATTACAATCTAGGACTCAATCTTCATTT
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TGGTGCATATGTTATCGGTAAATTACATCATTCTCCCCAACTGTTGGGAT
TTTCTTTATCTTATAGCAGTTAAAAGACTAACAATAAATAATTAAAGTTC
AATATTAATCAAATTGATAGCTGACAAATGAATGCAAAGAAGTTGTTCAA
GTCTTTTCGGATACTATTGAGAAAATACAATTCAGTGCTATTTGTTTTTG
TTTTGTTTTGTTTGTTTCTTTATATTTCGTACCAGTTTCGTCACATTAAA
TTTCGTCTTTATTTTGTCAAGAATATAAGATTTTTTTAGCCAGAAGAATT
ATTAAAATAAAATTATTCGCTTTATCTCTTATTTTTCATCAAAAAACATT
CTTTGACGAATACATTTCGAAATTAATACTAATTCAATTGAATATTTGAT
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TTCTTTTTACTCAAATTTGTTTATCTTAATGAGAGGGGGGGGGGGGGGAG
TGTTAATACCTTAAAGGCAACTTCTTTTTTTTTTGGCTTACTGACATAGC
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AGAAAACTTGAGAGTAGAGTTTTGTCCTCTGCAGCTAAATATGCTGCTTT
TTTGTTAAAAATATTGAGGATGGGCCGTGATACCTGGGATTATTCTATTG
ACATTGTCAAATACAAACTATCAGATTCAGCTCGATACATGACTAGTTTT
AAAAAACTTGTTTGGAGCTATGAACGCTTTCATCAAGGTAGATCAATGGA
TTGCTTACTATGTTTTGAAATATTTAATATATGATTATTTATATAACTTT
AAGTTCATCTTATTGGAATGTTTGATTATTTTTAGGGGTAGGTCTTGGGT
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TTCTTCCTAGCATTCTATATTATTTATTTTATGTATTGTATATATATGTA
TATAAATCTACATATAAAAGCTATCGGAAAACAATATGGATAGTCCCATA
ACAAAAATAAAAACCTGTCCAACAATTAAATAATAGTTAATCAATGCCAT
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TAATAAAATAGTTTTTTCACATACACAAAATCAAACTATCAATAAATGGC
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ACACAAAAACAAAAAAAAAACAATTGAAGCTTTTTGTCAGTTCTTTCGAA
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CTGCGAATGTAGATGCACACAAAGTTTGATATTATATAAAACTATGATGT
GTCCCTTGTATGAATATTTTGCACTATAAAATGGGGTATTCGTATAACGC
AGTTTCAAATACCGTGAATTTCGAATAACGCAGTGTTTGGAATCTCTGAC
TCCCCGTATAGTGGGTTATATTCACCTTATTTCGTGTTTTTGGATAATAT
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TGTTGTTGATAAGCTCATTCATACTATGCCTATATATTCATATAATGCAA
GTGTATTACTTTGCATATGGAGGAGTGTCCTGTAAGTATTTAATTTGATA
CCTAGACTTAAAACTTTTGGTTACTGATTTATAATACAAACTTGCAATTA
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AATTTTACAATTATTTTATTAAGTATCTGGTCTGGCATACATTATTTTAA
ATAACTTATGATTAATAAAATGTTTTTATTTTCTTGACCATACTAAAAAA
AAGGAATTATAGTAAAAAGTGGACTTCGAAAAATAATTAATCCCATTTTA
CATACCCTGTTGTCTTTATATAGACGTTCTTACAGTATCTTTGAATCACA
AATTGACAAGGTTGTGCCCGGTTCAGGGTTTCTATCGGCCCCGGTCTCGG
TTCTTTCATTTAAACAGTTTCTGGCTGCTTAAAACAATGGTTTTCAAAGT
GGGGCCGTGAGGGGATATTGGGAAGAAAGTTCAACTTTGTCCGCTAGATC
GATAAGGACACAACCTTACAAATATATGTTTATATCCTTAGATACAATGG
ATAAGTAAAATTACACCATATATTCAATAAATATAAAATACATATAAAAA
AACAATTTATCAACTATAATTTTTACTCAATTAATCACAATTTATATTCG
TAAAAAATACCATAAACAGGCTTGTATCTAAAGTTCAGATTGAAATAATT
AATAATACAACTCACAAATTTTAAATATGTACTTTTATTTTCTATGCGAA
CATCCAATTCTAAGAAAACGCACTTATGAGTTTTGTCGGAAAGGAATAAC
GCCTAGAGTTATCAACTTTTGTATGTCAAAGGAGTTTATTTGAAGCATAA
ATGATTTAAATTTCAGTTAGAAGATAAAAAATTATACTGAAAGGCTTAAA
TCAGCAGCAATATTGCTTTGATTTTATTTTTTTTGAAGCAAAATTCCTCA
AGGTTAAGTACTGAAAATTTTAAAATAATTCCGTGATAATGAATTATTAT
ATAAAACAAAATCAATCTAAATATAATTCTAATAGGTTATAAAGTCCGCT
TCTTATTGATTATTTCTCCAATAAAATAGAAAACACATCTATATTGACGT
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TTCAAAATTTCAATTATTCATTTATGTTTATGTATATATTTTNCGTATTG
GTAGGAGATATGGCCTGAATAATAGTTACAACACAGTTAGTTGGTAATAA
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ATTTTATGTGCAGTTCACAATATAAAATATTAAGACCTCTCAATATGAAA
CAAATATATATCCTAATATTCCATAACGATTATTTAATCATTTATAATAA
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TGATTTTTCTTTTTTTTGCCGTATTCAAAAATTTCGTTTTATATAAACAG
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TAAGTGTATTACATATCGGTCAAAAATGTTGTCCCGAGCCTAGATAGGAA
AACAACATTTTTTTGCCAAAATTCATTTTTATTCATCAATGTAATCTCCT
TTTAGAATGATACAATCATTTTAACGTCTTTCTATCTTTTCGATACCACG
GCTGTAGAACGATTTATCGAGACCTCCAAAATATGCTTCAGTTTCGACAA
TCGCTTCCTCATCTGAGCCAAATCTCTTCCCACGGAGCATCTTTTTGAGT
TCTGCGAAGAGCCAGTAGTCGCTGGAGCCAGATCAAAAAAATACAGTGGG
TGCGGTAGCAATTCAAAACCCAATTCGACCAATTTTGCAGCTGTTTTTAT
TGACTTGTGACATGGTACATTGTCTTGGTGAAAGAGCACCTTTTTCTTCC
TCAATTGAGGTATTTTCTGGGTAATTTCAMCCTTAAACGATCCAACAAAC
CAATAAAATAGTCGCGATTATTTGTTATTCCATGTTCTAAGTAGTCAATG
AATAAAATTCCATCCAAATCCAAAATACGGAGCACATGKCCTRCCCAGCC
GATGTTTGAGTCTTTGGACGCTTTGGACGGCTTTTCCCATCTGCACACTK
CTCAGGAGACTGCCGTTTTGATTCTGGAGTGAAATGGTGAATCCATGTTT
CATCCATTGTGATGTACCGAAGCAAAAACTCCTTCTTATTTAGCGTAAAC
ATCTCTAAACAGCTCATTGAATCATCTACTCGTTGTTGCTTTTGCTCTAG
TTTGAGCAAACACTGTACCCATTTGGAAAACAGCTTTTTCATACCCTTAT
GTTCGTATATGATGGTGTAAACACTACTACTGTGTCACCTATCTCTTGAA
ACTTCACTTTGCGATTGCCCATGATAATTCTCATGGTTTTTTCAATGTTT
TCCGGAATAACCGCCTCATTTGGCCGACCAGGGCGTTCAGCATCATCGAT
GTTCGTACGACCACGTTTGAAATTGGCCAACCATCGTTTGAGGGTTGTTT
TCTATGGGGCAGAGTACAGATAACATTTTTCAAGCCAAGCTTGTGCTTGA
AGGGTGTTTTTCCCCATCAAAAAGCAATGATAAATCAACACACGAAATTG
CTTTGAATCCATCGTTTTTAAGAATAACAAACGTCACTTAAACCACTGCA
GTTCGATAAATAATAAACCAAACGTGATGAAATTTTGACAGTAACCTTTT
CAATGTTTGTATTTCCAAAAATATTTTTTATTTTGTTAGAGGCACCATCT
GGTAGTTAGGTCCGGGATTTATTGACCGATGTAATATATATATGAAAAGT
TNNNAACGGATGTATGTACAAGGCATTTTTCTTTCCTTCTTTTTTTTTGC
TCCGAGGTCATATCCTTAAAATATTTTTAAACAGTCCTGTCTGAATCCTC
ATATATTTTTCAAGTTCATTTTAGTTTGATTTCGATAATTACTTTATAAA
ACAAAATTAATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTATTTTGATTACGTATGAATAATATTT
ATGCATTTGAAGAAAAAAGGCAGCTAAAAAGTGAGGGAGAAGAAGGAGAC
ACCCCTGTTAATATTTTTTTATTATTGTTATTATCTCAAAAGGTAGATGA
ATAAATAAATCGGCTATAAAAGTCATAAATCATTGAGGTAATTTTACACG
CAATATATGCTTAATATTACTATATTATTCCTTCATATTATTATTAGAGT
GAGGAACAGAGCTCTGCGTTTGTACACGAATCCAATTTATTTTCTTTAAT
ATTCAAAAGAGAGTCTTGTCAAACTTTATATTTACCTTTTTCTCACTAGG
TAGCACTTAAAACACATACTACATATATCGAAAAACTAAACAGTTACTCA
TAAAAGTAAGGGTCTTTTGTTTTTCTTGAATGAGGGATTATTAACAGCTC
ATGGAATTTGATTGTATCCAAGAGCAAATGCATTAATTCAATCCAAATAG
ATTAAGGAAGGGATTTTTAGTATGAGTATTAATTATTATGTACAACGTGG
AAATCCCCCTTTCGTAAAAAATTATAGCTGCACAGAATAGGTTATGGATT
ATGATCCATCAGAATCTCATTAGGTACACACATACTGTGTGTACATATAC
ATATACATACTGTAGGGAGGTTTATGTTTCTACTTTTTTCAAATTTAAAT
TAGGGCTAGTTTGAAAAAGTTACAGAATGGTAATGAAATAGTCTATGGAA
AATTTCATTGCCCTACAACGTCATCTTTATGTAGCACACCTAGATCAAAG
TTTGAAAGGAGACAAAACTTATTTATTTCGTCAATAACGATTATCATGCA
AGATTTATCATTATTTTGTATTTATTAATTAGAATAGATACAGTCAGCGT
GACTTAAATCTGAACAAATGTTAGTACAACACTATTTGATCCTATATCTC
ACGAATAATAAGAGACATAAACGTGAAATTTTATTTAAAAATTAATTCTA
AAGTTAAGTTATAGTATATTCAATAGGATTTCCATTAGATACCCCACCCC
TCCAAACAGGTCCTAAAAATTGATGTATCCCTCATCCATATTGTCCCAGG
TTGCAATGATAGAAACCTTCCGTTCATTCACATTCCTGCGAGAGGTTCGA
CAGGCTTCCTTCTCCACAACGCTCTATAGGCTGMACTCCGATGGATTCAG
ATCTGGTGATGATGGAGCCGCAGGGATGCAGCCCAAAAATGATATAAACT
GGACTCAAACCAAGCTTTGGGCTTTAAGCCTTCAAATTGAATCAGATGCC
TCCAATATGTCCCCAAACTGCACTCAAAGTGGTGCAGCAGCGTTCCAACT
GGCTGGCATTTGTTCTGGGCTCTATTCCAGCAAAATCAGGATGCTGTTTC
ATTTTGTTTGTTCTATAAATAAAATCAAAACAAAATATATAAAAGATACT
ACCTAATTTTTTTCATAAAATTATAATACTGCGGTAGAAAATTTAAAGCT
TGTGGGGTTTTTTTTTTGCTTTTTTTTTTGGTTTAAGTATTTATTGTTCT
TTTACATAGGTACGTAAATACTGATTCCATAAATAATTTGATATTATATA
CATAATGTAACTTCATAACTTCCTCATTTTGACAGACATAGTTGTTGAGG
TTAAAAAACATACAATACTATGTAAAGTTATGAATAATACATTAGTTATA
CACGACTACTTTTACACGGTTCATAGATGTGATAATCTGCTTAAGGATTC
ATAAATGTCTATACATACAATTGTTCTATTCAAATATTCTTAAGTCGAAT
AAACGTTTTAAATTTATATTTATTTTGTTTTACAAAATATTCCTATTTCA
AACCGATATGTTAGTCGATTTTCAAGACGTCAAACTATAACCTAGAATGT
AATGATGGGACAATTAATTGGAATCGGGAAGATTATATTTTAATTTATTA
TTCTGATTCTTATTTATTACTCTTATTCAACTGTTTATTACTTTTCTTAA
TTTATAAATTTCAAACTTGTTACTCAGATTTTGGTTACGCACGCTATTCA
TGAATAAACTCTAAAATACAAAAATATAAGCAAGCAAATCTTTCTTAATG
ACTTTGTGGATAGTGAATGAATTAAATTGGTATGGCCTATCAAGAAGTAT
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AAAAGGAGAGTAAATCGAAAAATATATAAAAAACTCAGTAAAATGTCGTT
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GTTCATATTGAGGTATGTTCATATATGTAGAAATGTGATTAATGGATATA
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CAGCCACTCTGACCTGCCAACTTCTCAAGCAATTGCCCTGATAAACTTTT
CTGAGTTCTTATTGAAGATTTGTTGGATTCTGGCCAGGAATTAGACCATG
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