|
|
Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s852 | supercontig | LSalAtl2s852:119050..125715 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011979 >EMLSAP00000011979 ID=EMLSAP00000011979|Name=EMLSAP00000011979|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=122bp
MDSEAAGTEFNSREDPQALLGDRYTWRLAQRLHNKDPYDHPSTPGRRSGG
TPIAACVKKTRTTEFTDILLFFNHKXRGYARSSNGSNCEPVCSQRCYHGR
CVEPDKCECQPGYGGPSCSKYY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s852:119050..125715- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011979-707826 ID=EMLSAT00000011979-707826|Name=EMLSAT00000011979|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=6666bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s852:119050..125715- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGATTCGGTAAAGTTCAGTATTAGGACCAAACTTATCAGATCTTTAAC
CGGTCTTTAAGACTGTCAGCCCTAGACCTATTTAATAAAAAAAAATAAAG
TTGAGGGACGTCACCAAGGACAAAGCTTTACAAGTTTTAGGCCTGATATG
CAGGACTGAAGTTTACCGAACTGAGACTTAACTGGATTGGACTGCAGTCC
TAAATCAGGACTGACACAACACTAATAGATAGAAATTAATCAACAACTAC
AAAAATTGTTGTATACTTCAATATACAGTTATTACTAAATCTTTAATCAA
AATATAAGGAACGGTTTATCTGTGTGGGGAATATACCCCAATATACAAGG
AGTCAGAATAATTCCAAACACTGCGTTATGTGTTTATTTTATTTTATTAA
ATAAAGTTGAGTGATTTTTAATCAATATAATGTTCCGCTTCATTACTTCT
CTTTCATCTTTAAACATTAATTTTTATGGTGCACTTACAATACAATACAA
TGAATGAATGTACTTCTTTCATTCAAGAAGAGTAAAAAAAACTATTATGA
TTATAGTTCTTTATAACTATAAAAGTATAGTCAATGACTTTTTTTTCCCC
CCTCACCTTTGACTCGATTACCCCATATTTTTGTTTCATCTCCAGCAATA
CACTACATGAGTGTATATCTAACATTATAAGTCCGATCAATTATTATAGT
CTATCTGCATACCTATATACTATAGTACATTTGTCTGGAGTACTATGTAT
GTAATTTTATTATGAAAGGGGAAAAAATCTTGAGAGAATAATTTAAGTAC
CTTTTTTTTGTCTTTGCTAGAACTAAAATTCTCTTTCTTTATTCATGAAA
CTTTTTTTCATTTTTTTCATCGATGTTATCTAGAAATTAGAAAATGTAAG
AAAAATTAGACTTTTGTATGTGTATGGATGTGTTTTATTTTTCGTCTACT
TATCCACACTTTTTTCCTTACTGCTTTTTACACATACATACACACATATA
ATATGTAGCAGTCAAAGCTATTTTTTCTTCCTTCTATTTTGAGTATGTAC
ATATGTATAGAAAAAAAAATATGAACAATGATTTTCAGCATAGATAAAAC
AAATATTAAATTTGTTTTACTTTTCTGACTTGAACATATGCATGGAATAT
AGTATCTATTCGTATCTAGGTAGAAAATGCAAACGGGAGATAAATTTTTC
TAACTTAAATATACCTAATAACTAAGTCAATACTAGAATACTTTTTCCCA
AAATGGAATCTGGATTAGAATTCTTGTGGGTGGGAACACAAATCTTACTG
TATAATAAGCAAATGAGAAATTCCACACTTATACTTTAAATTCATAAATG
CGTAGAGTTAATTGTTAGGGGCGTCCGTGGCTGGAGTGCTGAGCCTCTCC
CCCCAGAAAAAAATTAAGGAAATTTTAATAAAAAATTTAATATTTGTAAT
TAAATTTAATTTTTCGATTTTTTTTTCCAAAAAAATTAATTTTCTGTCAA
AAGCTATGGATTTTTGAAATTTTTCATCAAAATATTTAATTTTGAAATTT
TTTTTAGAACAGCTGTGAATTTTTTTCCAAAAATCTTAATTTTTCTATTT
TTTCCAAAAATTAAAAATAAACCAAGCCCCTCCAAAAATAATATATAGTC
CTGATGACGCCACTGGTGATTGGAGCTGGTGATCCTCCAGATAGCTTTAA
AGCTCATTAGCTACTTTTTCTTAATTATTTTATAATCACTATTATCTTTT
TTCTTCTTCTTCTGGCTGATGAAGATACACAGCAAATGGAGATATCTACG
AAAATATTTATTATCATCTATAGTAGTTTTTTATTATTCATTTTAAAGTT
AAATTAAATGTACTATTTAGATACATGCAACTACATTTATGTTTTATATG
TATTTAGAAAGTATAATGAAGCATGATATCCTATTACAACTTTGTAGAAT
ATCATGCAAGGAAAATTATAAATATATATGTACTTTTATTCGAAACAAGT
ACTAACATATTTAAGAGATACATATAACTCATGTTATGACTAAAAAAATT
AAGTTCTTAATAGCAATAATAATATGTAAAGTTGTAAGTTTTGTATTTTT
ATATATAAACAACCTTTTTATTGCAAAAGTAGTTTTTCTGTTTGGTGAAT
ACAACTTTAGATAGTTAAATGATCACTTTACCTTGTATACCTATAGTGTG
GGGAAACAAAATTAGAAACATTTATCTATATGAACTTTGACACGCTGATT
CTCATGAACCACAAAAGTTAAGTCAATAATTCTTTTAGCAAAGAGATTAA
CTGACAAAAAAAAAAAATAGTACCAAGCAAAACATTCCGGATTTTGTCTG
GGTGAAAGGGCTACAGTCCGTACATCCCCCTTCTCAAGGAGAATTAATTA
CCACATGACATATAAAATTAAGAAAAGCGAGAAGATGGTACATCTGTCAA
GTACAAGGTCTTTTTATTCGCGAGATGTGTAGGAGGCTGCTGGAACAGAA
TTCAACAGTCGTGAGGATCCTCAAGCGTTATTGGGAGATCGGTATACTTG
GAGACTAGCTCAAAGGTTGCATAACAAGGACCCCTATGATCATCCAAGTA
CACCAGGGAGAAGATCCGGAGGAACCCCTATTGCAGCATGTGTCAAAAAG
ACAAGGACCACGGAGTTCACCGGTATGCAATGCAGAAGTTGTTCAAATTT
TAGCTCAGCATGTGTGCATACAATTGTTAGAAGAGGATCAGAATTTGGAG
GGGTTACTACATCTTTTTTGCATTTTTTACCAGTTAGTGGAGCTGTAATT
ACTTATTCCAATAACAGTTTTGTTTGAAAGTTGTCCATATCCTGGTACCA
TTAATATACGGTTTAACGAACAACACTAATCCTTAGCCTTTTTGAAAATA
CAATCTGCCTCTTTAAATTTTGGAGCCTTCTCATTTCTTTAAAATTTAAC
TATCATTACACGAATGTTATTAAAAAATATATATATGCCTGATTCAAGGC
ACAAAAAATGTATGATTCATATGTTGGATTTAGCAAATAGCCTAAGCTAT
CCATCATTTCTACTTTTTTTCTACGTTTTCCTTTCTTTAATGTTCACTCA
TTTCATAGGTCATTGGTAGGTGAATTTATAGATATGTTATATATATTTGT
ATGAAGGATAGTTAGAGTTGAAAGACAGCTAATGGAAAAACCATTTTCCA
GTGAAGCAATTCTCTAGTAACATATTATTTGGCTTTTTAGTTCCGTATAT
GTACTTATAAAGAATACATTTTACTTTAAAAAAATATATAATATGTGGTG
AGTTAACACAAAAACAATATGGAAGAACAGAAGTAATAAAAATAGATGTG
TCTTTATTTTAATCAATTGTATATACTGTGCAAAGGTATATCATTTCCCG
GGAAATCGTCTTTGAATGAAATATTTTCAAATCCCTGGAAATATGGGGAT
CCAATTAATAATAATGGGATATTTAAGTATATCTTTTTGTATTTTTTGAA
GAATATCAACATTTTTGTTTAGTTTTAAATAGTGATGGGACGATTATAGT
AAAAATTCCCAATTCTGATTCCAATTTTTAATACTTTAATAAAAAGTTCA
AAAATACCATTTTGCTATCAAGGGCATTTTGCTTGTTGTTTTTTGTTTAT
TTTTTGGCCGGGAGTATTTTCGTTTTTGGATTATTTGGAAAATAAAATTG
AAAAATTACAGATGTTAAAAAAAAAATTCCAAATTAATTTCAAATATAAA
ATTTGATTGTAAAATTGAAAACAATTTACAAAAATTATAAGCCCATACCC
ATTCTCAAAAAAAATTTCAAAAATAACCATTTTCTTACAAAAAAATTCAA
AAATCACCAGGTGTTCTACAAAAAAAACTATTTTTATAAAAATCCATACT
TATTCACAAATTTATTAATCATTATTTAAAAATTATTTGGAAAAAAATTA
AAATTCCTATATTACATTTTTTTGGAAAAAATTGAAAAATCGAAAGTTAT
TCACTAATATGAAATAAAAATTTTTTTTTAAACGTTCAATTTCATAGAAC
TTTTTTTCAAAAATCAATAGTTATTAACAAAAATTAACCTTTTCGGAAAA
AAAAATTGAAAAATTTAAGTTTTGAAAAAAAAAAATTCAATTTAAAATTT
TAATATATAATTTGATTTTTAAATTTAAAATTTACAACTATTTACAAAAA
AATAAATTTGTTTGAAAAAAATTTCAAAAATCTTCCGCTGTTTGAAATTT
TTTTAATAAATCTCAAACAGGTGCTCTACAAATAAAAAAATATATTTTAT
AAAAATCCGTACTTATTTACAAGTATTAAATTTTTTAGTAAAAAAGCCAT
AAAATATTTGTAAACAAAATGTAACAAAAATTTGGAAAAAATATAAATTC
AAATATTAAATTTTACGCTTGAAATTTCAAAAATTTATGGTCTAATATAT
TAAATTATATATTAAATTTTTTGAAAAAAAAAGTTCAAACGTTAAATTTT
TCGGAAATTATTTAAAAAAATCTATAGCTATTAACAAATGTTAAACTTTT
TGGAAAAAAATTAGAAAAATGACATTTTTTTGGAAAATAATTGAAATCAA
GTGATTTATGAGAATAATTTATGGATAGAAATTTGTGATAATTTGTTAAA
GAATAAAAATGTGCTTTAAACTGATTTTTGATCAGAAAATCCTTTTAGAG
TGTTTTTGTGTTGACAAGCTTTGTATTTGTACTTGTTCGCTTCTGTAAAA
CTAAATTATAATCCATGTAGTTAAAAATATGAATATAAAGTATATAAATG
TTATTCTTTTTTCTTTTTTAATAGATACACTGTGGCTGKAAAGGKTGAGG
RGAAACAACCTTATCGCCAAAGAACATATACCTGGTGCTGGGCCTTTCCT
CCAAGATGCTCTAAATATAAAATACAAATCAAAACCATTTCTCGAACTGA
GGTATAGCTAATCACTTTATTAATGATTGGAGATGTAAAAAGAAAAAAAG
AGACATTCACAGTGGCTGKAAAAACAACGTCTAAAAAGATGTAAAMTGAT
ATGCTACTGAGTCTTAAATTAGAGAGAGAAGCTGTTATTATTTTGCTGCT
TCATCCAAAAGTAGCTTTTATTTCATTATGGCTAMAARAGKTAATAAAWT
AGCCAAAATCATTATTAAGAAAATACTCATATATATATATTTTTTAATTC
GACTTTTCAATTTATTAAATTCCATTTTTAAATATTCTTTATTGGATTTT
ATCTCTAGTTGTTATGAGAACGAAGTAAAGAGTCATTTCCTACTAAGTTT
TTTTATTTTGTATATATGCTTTTTGAGTGATGAACTTACGCTAAGAAGGG
CTCTTTTTTTCACATCTCTAAATTAATATTCCATACTTGTTTAACAATAA
ATGTACTGTTTTAGGATGTTTCGTTTTCATATATATATTATGGCAAAAAT
ACATCTTTTTATATATAACTTAAGATGGGGTTTTCTCTACTTGAAATCAT
TTGTAATGCATTTTTGCATTAATTACCTTAAAACAAGCGCATTTAATTCA
ATTTTAATATATTTAAAACATAAAATATCCAACATGAATTTATCATATTA
TTTTAATGAGTTGGACCCCTTGAATTAAAAAGTACTTTATTATTCTGAAT
TCAGACATTTTACTTTTTTTTAATCACAAAANCCGTGGCTATGCGCGTAG
TTCAAATGGATCCAATTGTGAGCCAGTCTGTTCTCAACGCTGCTATCATG
GTCGATGTGTAGAACCTGATAAGTGTGAATGTCAGCCAGGCTATGGAGGT
CCTTCTTGCTCCAAGTGTAAGCATTTCTTAATTATTTATTTATTTATGAT
GGTAAAATTGAAAATGAAATATTCATATACAAATATATATACTTTTTTTT
TTTTTTTGCAAAGTACGTWTGGGGTTTTGACAAAATTATATTATAGTTAC
TTTGTTTTTCTTTTTCTATTATCATTTATATTTATGTACAATATTCAAAC
TATTCTTTTGGGATTTTTTGAATGTTATATATTATTTTTTTACGCCTACA
TATCATAATTATAATTCATTTTTTATTTAAAACAAAAAATAAAAACCTAG
GTACGTAAGATTAAATTTGAGGTTGAATTATTAATTTTAATATTTTTTTT
TCTCTCTTCCCTTATTACTATATGATTATTAATATTTTTTAATATCCTTT
CACGAAGATTAGAAGAATATCTTAGGTTTTTAAGAATTTATTTGCTTCAT
AGAGGCCCTGTACGCATTTCAATTTTTATTCCTACACACTGTAAGACTTT
ATGAAACCTTCCTTAATTCCTGGGGTGTTCATTTACCCCTTAAATGAAAA
TATCATTAGTTTATATCATTTTTTTGAAAAACTTTTTATCTCAATGTTTA
ATATAATTATTATATCCATTTTTTGCGGTATTTAATTGCAGTTTCTGAGC
ACTTATCAAATTTTGGAATTATTATAAATATTTAAATGATATTCATCTAT
CCCAACGATAAATAAGAAAAATATATTTGAGATGGAGAGATATATGAAAC
ATTTCTTGCTTAATAATTATGTATATTTTATAATTTATGTTAGAAATTAT
TTATCCACTATGTACATTCTTCACAATTTAAAATTATTTTATTCTACTAC
TATTTTAGATTATTAA back to top
|
