EMLSAT00000012047, EMLSAT00000012047-707894 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012047
Unique NameEMLSAT00000012047-707894
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s85supercontigLSalAtl2s85:1183080..1190724 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012047 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012047EMLSAG00000012047-694813Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000053914EMLSAE00000053914-762842Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053915EMLSAE00000053915-762843Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053916EMLSAE00000053916-762844Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053917EMLSAE00000053917-762845Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780505auto780505Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012047EMLSAP00000012047Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012047

>EMLSAP00000012047 ID=EMLSAP00000012047|Name=EMLSAP00000012047|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=103bp
MMVKTLALRNIILRSQRIRTFHAPSSARTITATEADKIVFEKFKEGNSDA
TSESDIKIAKNNARVFTLNWMLATFAFLGIGFLSYLKFGPHDTLKKSIKR
HEQ
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mRNA from alignment at LSalAtl2s85:1183080..1190724+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012047-707894 ID=EMLSAT00000012047-707894|Name=EMLSAT00000012047|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7645bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s85:1183080..1190724+ (Lepeophtheirus salmonis)
CAGTGTTAGAGGGACGGGTGAGCGAAAGTACGTAACACTCCGCGCCTGGA ACTAAAATACATTTTTTCAATGGTAAGCGATGTTGCATATATTTGTATAC ATGTGTGGTGTACTAAAAGTGTTTCAACTAAAGAGAATATTTTTTTCTTC ATCCAAACGTTCCCAAAAGTTGTGTTATTCCTATTTGAGTCTTCGTTCAA GACATTTAACAAGTTTTTTCTCATTTTCTTTCAAGATATAAAAGGTAAGT CAACTATAGTGCTTAACTTTTGTAAATAGAATATATAGACGTTAGAATGA GGTTGAGTTAATTTTTGTACTTCCATCATGCAAACAACTGAAAAATTTTA ATCCATTATAATATTTAGAGGCCCCATTTTTAAGGAAGTATCAATCACTA TATTGAACGAAGCTCTTTGATATTTTTATTATCTATTCAATAATAAAAGT TATTTTCTTAACGTCATCAATAAGTGTCTTGTTTCAATATAGTTTTCTCT GGGGGTTTTATTGGTGAAGTAGCTGGTTAAGAGGAAGCTTTAGTTAATTG TAAAGTTAGATAGGCGTAGTATTTTCTGAAAATTACTCAAATTATTCACT TTCAATATTTTTGGACAAAATTTGGTATTACTTGGACTCTCAAAACAAAT TGAAAAATTAATATTACTTACAATGATAGATTTTTTTTTTATTATTTAAG GAAAAGTTGATCTATTCAAAAAATTAAAACCTCATTAAATATTATTTTCG TGAAAATTTGCAAAAAAGTCAAACTCTCCAATTATTATATTGACTTAMCC CGTCAACAAGACGCAAAACTCAAAAATTTGAGCTTGGCCTTACTCAAAAA TTGATACATTCGAACTCGACTGAACAAAAAACTCAAAAACGCCAGCTTGA CATATATTTTAAAAACAAAAATTTGATTTAAATAACAATTTATCATATTG TACTAACAATAAAACTAAATTTGACATATAATCCAAAATTTTGAAAGTGG CCGAACTCAAAATCCATGTTCAAACACTACCATTTGAACTTAGCCCAATT CAAAAATTGGCATAATCGAACTTGACTCAAAACAGAGCTTAAAAACTCCA ACTAGACCCAGTCAAAAAATTTGTATATTGTCCTAATACGAACTTGACTC GACACAGAACTCCAAATCTCAATCTCCACTGATTTCGAAAATTATTATAT TGTCCTAGCACAAACTCAACTATATACATTATTAAAAAAATTGAATGGGA TTGAACTTGCAATTTGATAAACTATTCTAACACTAACTTGCTTCGACACA TCATTCATAAATTTGAACTTGGCCGAACTCGAAAAAATATATATTGTCCT TACATAAACTCGACTGAACACATAGTGTAAAAATTGAAACTAGTCCGAGC TCCACAATGGGCTTGTATCCAACACTATATAATTAATTGTATTTGAATAA TACTGAATACTTTTTTTGTAATAGACTATTTATGTAAAATAAAATATTTT TCTGCAAAGCAGGGAAATTATGAAATCTCAAAAAATGGAGGAAAGGACTG ACACAGTTTGTTAAAATAGGCGGGGAGTTTTACTCTTCCTTTGTACATAT GTGCAACTCCCATGTTGTTATTGTGCGGCATAACGGTTCAAACATTCACC CATCCTCTCATTCAAAAAACATATACTGTATATCATGTTGTATTACAACT AACGGAATATTTTGTATAAAGTTCCCTTTTAGCTCTTAACAGTAGAACGA TGGTGGTATAGGAGTTCCCTTCGCAGGGATTGCTCATACTAAAAATAAAC CTACCCATTTCAATATAGGTCAAAGGAGTCATTTGACTGCAAAATTATTT TGACATAAAAAAAAGATTTTATGAACACTATTCTGAGTTTATTACTAACA AATAAAAGTGAAAGGAAAAAAAAGGAAATTAGCTAAGCTGTCATAACTTT TTGTTAGATAAGCTTTAAGCTTTCTTGGACTCCTAGTATCAAAATTGATC CCACGTTTGTTTCAAAACTTTTAAGAGCAACAAAATAATGATGTTTGAGT CTGATAAAATGACTAAAGATGCAATAAATGCTCCAAAAGATCAAAGAAAT ATTCTTCTAATATGTCTGAGTACATGTTTGAACATATATAAAATTGATAG ATAGAAGTCCACTGAAGTAGAATATAATGTTTTTTGATAATATTTTTGAA AAGACTCTGAAACGTCCTCTAGTCGACTTAATGTTATTATGCTTAATAAA TACATTTTTTTGGAAGGTTAGGGCTTGAAAATTAGATAATATTTTACGAG AAAGTATGTGGTATATGGTATTCAAAAATGAGCTCATCGTGGTTCTAATC TTAAAAATATTAAAGTTGAGTCGTCTCTCAAGTATAAAAATCTTGAGGGT TGTTAATTTTTTTTTCTTTACTGGTTTACTCTCTTTAGGCATAAATATGA TGGTTAAAACATTGGCATTGCGTAATATTATTCTTCGATCTCAAAGAATT CGTACATTCCATGCTCCTTCCTCTGCTAGGACCATTACTGCAACAGAAGC TGACAAAATCGTCTTTGAAAAGTTCAAGGAAGGAAATTCTGATGCCACCT CGTAAGTTAAATATGTTATATTACATTACTTATTTTTGATTATTGAGTGA GGATACTTGTAATTGAATTATGTTAAGGGACTATTAGAGTGTTCCTATAT CATTTAATTTTGTTCTAATATTGCACTTATTGTCGATCAAATCAGTTCCT TGAAAGATTATTTAATAATAGTACATTGAAACCTGCACAGATATAAGGCC CACGTAGGTAGGTTTTATAACAAAATATGATAATTAGACATTAAAAAATT AATGGAAAACATTTAAAGTTACAAAAAATATATAGATATTTTTTAAATGG CATTGAAAAAAAAAAATAATTAAAAAACTCTGTTTTTTATTTTCTAAACT AACCATAAACCAGCTCACCCTATTTGGCCTCAGTCATTATCCTTATACTG ACCAAATTTTGATTAGGGCCGCTCAATAAATAAGCACAGCACTGATTCTT GTACCCCAATTCAGAAGATCAGATTTAATAAAAAAACTGTGTTTCAATCT GAGACAGTAAGGGTTGCAAATCTGTGTGAGTGGGGTACATGCCCCTCCAG CATGAACATTTTAAGAATTCCAAAAGTTAGAAAGGCTCCCAAATTGTAAA AAAAAAGTTAAACTAATTAAGCAAGAATTGTAATTTATTTACCAGAAAAA TCAAGATTCTAAATTCATTTTCAAAAAATAAATCAAAAAATCAAAAATGG AACAAGTAGTCTAGGACTGTAAAAATTTTATATTGTGAAGAGGGCTTCAT AGTCGAGGGAGCACGTAGACTAAAGGAAGTTTGAAATATTAAAAAAAAAA TTATCCAAAGTTCGTCTCACAAAGTTGTATTTAAAAAAAAAATTCGAATT GTGTAAATGTGTAGCGAAAAATTTAGAATCGTCCTCTCCTCTGAAAATTG TTCCACCCAACAGCTTCCCTGAGACATGACTTTGACACTAATTTCATTAT GTTTATATAGTTATATGTTATTAATTCTTTCAAATGTGGTAATTAAGGGA ATTTTCTTAATATTTGGATAATTCCATATACAATCGTTAGGTGACATACT TGAGATGGTTTAGTTGTAGACAAAAGCGAATTGACTATATTTCATATGGG TTAAGGTGGATTTTATAAAATAATTTCATTGCAATTACACACAATATAAG ATTAAGTATCGTTAATTTTTTAATCAAATTGTATTACTGCTTCAAAATAG 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TTTTTAAGAAAACGATTTGAAGCTGGTTAAGGTATCCAAGTCCTCCTATA ACACCAGCACTGATTGTAATTCAATAATTAGTTTGAAATAATTAATTGTT TAAATGGAAAAAATCCANGCTCACAAAATATGTGAACAATATGGCCGATT TGTAAGCCAAATATTTATGGATTAAAAATAGAGCCTCGAAACTTGATGCA AATTTTTTCCAGAAGGAGTGTCGAGAAGCAAAACAGTTGATTTTCAAATC AATTACTTGTTCTGTCTAAAAGAGTACATAAGGCTACAAAAAACAACAAC ATTGATTTTAGCAAAAGTTTGTATTTTATTTTCAAAAACTAACTGAGACA AATAGGTCTCTGATAATTTTTATAAGCTTAGATTCAAATTTTTTGCCATT TTGCATTCAACTCTAAATATGTCTAGGACAGAGGCCCTAGTGTTCCAACG TTCTATTGTCTTGCAAATATTTTCTTTTCGGTAAGCCTTTGATATATCTA TTGATTTAACGTTATTTATGTCAATATATATGTACGCTGATTTATGATAA GGACATATAAAATAGTTTATTAATTGATAAAAAAAGGTATTTATAGTATA TATGTTACCCAACAACACAAAAACAAGGTAAAGTTTTTTTTTTTTTCTAA AATTGAATATGAATCTTCGACAAAGTAGCATCAAATTCATTTAACAAGAG AGGTTCTGATTGAATCTTGGGAGGTGTTAAAAATTCATCATCAAGTAGGA AAATTCATTGACATGGTGAAATAGTTGTATGTTTGTATATACAAGGCCAC AAGATGAGGGCAAATTAAGTTCCATATATCTAATAAAAGTTCTAAGCTAT GAGTAATATTCTTGTCTATCTAAACTTATTTCACAAATTTTGAACACAAC GTCAATAAGTGATTGAAGAATGTGAGTGAATTATTGTTTATGTGGTGTAA CAAAAAAAAGTTGAATTATCCCTTTGTCTTTATTTTTCTGCGAAATTGTT TTTTATATTAACTGACGTCATATATAGACGTTATATTCAAAACTTGCGCC TTAATCTAAGATACATAGGAATTAAAACCTTTATTTGATTAAAATGACTT ACCCATTTGGCCCCGATATATCCCGATATAGGTTTATATATAACCTATCA ATTGCTTATTTTTTAATTGTAACAATCAAATTTGGCTACTTTAATTGGTA CTTGCGGCCTCTCCCAAGGGTTAATAATTATTTTTTTTTGTTATAAGCAG AGGAAAATTTGTTCAAAAAATATATATGTAATCCACACTCATTTATAAAA CAATCATTTAAAATAGTTTTTAGGCAGATCTACAAATATTCAAAACCACA TATTATACATTGCACTACTTGAAATCACTACTTTAAATATTAATAAATTG ATTTTATTTCAGAGAGTCTGATATTAAAATAGCCAAAAACAATGCAAGAG TTTTCACACTTAACTGGATGTTGGCAACGTTTGCCTTTCTTGGAATAGGA TTCCTTTCCTATTTGAAATTTGGACCACATGACACTCTTAAAAAGAGCAT CAAACGACATGAGCAATAATAATATATTTCTCCCCCAAATCATATTTATT TTTATCGTTTCTGTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTAAGCCTTTAAAATTTCA TGCTGAATATATTTACAAACATTCCATTTGAACTATAAACTAAATGTCTC GGAAACTTTTCTAAAAAAAAAAAAATTCTTCTTAATTTGAAAAAGAATAT TTTCTTATACAATTTATTTAATTTACCGATATTTTCAGACTACTTTGTAG AAAATTTCAATTATTTAAGTTATTTATTTTTTAAATCAATCTATCGTATA TCATGAAATTTGAAATTTTAAAAATAAAGTACAAAACCAAAACTATTTTT TATGTGTATTTCATTAATTGAAATTGTATAAAATTATATGACTTA
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