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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s85 | supercontig | LSalAtl2s85:19923..61705 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012049 >EMLSAP00000012049 ID=EMLSAP00000012049|Name=EMLSAP00000012049|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=602bp
MYKNLSPSSMMFILFLSMHFISFFHTSLSSSCIDASKWINALGGYRVEVS NQNFDSSIITFTCAEGYYLIGSSKLNCYRGILNGSFPICSMDIGINGIPS QSNLMTCSQTLETDASPWWMLDLLQVVEISAIRIVLTHHNFDRIMVESME VRIGNSSNYQDNPICAFLIQDDKEVNENDTIVIPCAGARGRYISLNSVNT EPRFLILCKVLILVDPSKYIHPRQCLSPNEGYLHHQRLTRFKVINGRCVI WRRGKESSFLEARNFCEXRGLRLPLTSVDLNYHNVRSSILVRWLSHHFEY KSSPRSYTWVSISGTREKFEDDVNSSTTTKTTELNEEVMLDCWALDTANA WKWNLRPCESKAHVVCVSDPKTCVNPEVNFGTRIKKPHSFWIENKRPWXT GTTISYECMNKSRIIHPKSYQKRTCTKSGHWSGSTPFCIDSISDRHHHQF YHTLLAEHNXLIKDSXPASDSSLARDIEIEIQGEEEQVTYTGGSSQEQDS LINLSNNFVDLNVVKNCEDESENGTCSSYLFEDGRWLPIFLVAETSTPSF PSRIQSLELISNTPDSNLLKFPRISYSSSSSDSLLFLREIKMLLFIAAYG ME back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s85:19923..61705- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012049-707896 ID=EMLSAT00000012049-707896|Name=EMLSAT00000012049|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=41783bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s85:19923..61705- (Lepeophtheirus salmonis) ATGTATAAAAATTTAGTATTTATCTGTTTAAAACAATGATAGTTGTAGTT
CAATTAATCGTTGCTTTATCAGCGTATCAGAGTCAAACTTTATAACCTAT
CTTAAACACAAAAGCTTGAATAAGTAGAACATAGAGTGTGTCCTTGTGAA
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TGTTAATAGTTTTATTTTTTTTAAATATTTCTACAATTAATTTAATTTTT
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TAGTCATTGAGAGCAAAAAATATTAACGAAACACCACCTTGGCATTATTA
GTATTATAACTATTAACACCATATGAAATATCATGGATCAAAAGAAATTT
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AAGCTATCACAAAAAAAAATGAAATATTATGTTTTAAAAGAATATTTCAA
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TATTCTAATTTTAACGTATAAGTTATAAAAATAGTATTTGATTAAAACAA
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TTAATTTAATTTATTCAGACTTCTCTAATTTGAGAACTAATTTTGCTATT
TTAATTATTGTTCTATTTATTAATACTATTAAATATTGACAAAACTATAT
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TGTACCATAGGATTTGTATGTATGGCGTCATTTTCCTTCAACTTTTCGTT
TTACATGCTAAAAGTACATATTTTTTACTACTCATAAGTAGTTTTGGATC
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GTTAGTAGTAACTACGTAATTTCAGCTGTTTTAGTTTCCATAAAGACCAA
TAAACACCTGTCCTAGGACTGATAAATTTGACTAGGAATGGACTGACAGT
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ATAAAAAGTGTACTTTATAGCACTCTCTACTTTGTTTATTTAGATATGTT
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AATAAGAAGAAAAAAATTACATATATCTTTAATGGGCAGACATCCAACTG
ATTTTATTTTTATTTATTTACATTACTTTATATTGACTTGACTTTCCAGG
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GTATATTAAACTAAAGGTATCAACATCGGAGTTATTCTTGTCAATGTTAC
TGTCTAGTTCCTTTCCCCCCTTTTCCCTCGTAACAGCTGATTTTAATGAA
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GGAAAACCATACTTTATTTTATAACAAAAAGTTAGTATAAATTGGAAAAT
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TGTCAACATTAAGACAACAGCTAAATATCTTTTTGAAGTTGTGTTTTTTC
TTTCCTCTCCAGTAGACTCATTCAGTATGAAACATGATGTAGTATCGATC
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TATTATAAGAACTTCTCGTTTAAAGTAGTTTTTATAACTGGGAGAAAACA
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TGAGTAAACGGTATTCTCTTTTAGTTTAATACAATAGTTATATATCCTTG
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TGACTTCAATAAATTTGATGCAGTTATTTTCATTTTCCATAGCTGTTATC
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ATCAGTGTGCTCATGAAAGGCAGAGAGTCGGATCTCATGCCCCATTCGAA
TCCACCTTACCCTGTACCATAAGTAGTTTCTAACTCTTTATCTATGTAAT
TCTAGATCTTATGACTTGTTCACAAACCCTTGAAACGGACGCGAGTCCTT
GGTGGATGTTGGATCTTCTTCAAGTCGTGGAAATCTCTGCTATAAGAATT
GTTTTAACGCATCATAATTTCGATCGCATAATGGTCGAGTCAATGGAGGT
ACGGATTGGGAACTCTTCCAATTATCAGGATAATCCTATATGTGCGTTCC
TTATACAGGACGATAAAGAAGTGAATGAAAATGATACAATCGTGATTCCG
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GTTTTTTATTGGTTTTGCTGTAACTGATATCATTTGAGTTTTTTGAATCT
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ATGTTCGTATGGTGTGTTAAATTTTGTAGTGTCCAAATTAAACCATTCCT
GAATAGTGGACCAAAGGCGGTCTTCCCTTTATTCCTAATATTTTTGTTAC
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TGTTATGAGCTTGTACACATAGTTTTCGGATTTTAAAAGAGATATAATAA
TTTTAATATAAATCATGTAAATGGAAAATAAGGATCAAATCCTTAGATAA
TTCAAAATCTGAACTCATTGTAATACAGTCATCGGATAGAATGAATAACT
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CTAACACCTTGAAATATTCTGTACAGAGGAAAATTGTAATTTGTTACACA
AGGGAACAACTAGAGGATTAAAATTTGTTCAAAAAAATTGAAGCCAATAT
TAGAATTTACCTTTGAGCGCAGAATTCACTACTAATCTTGTCCTTTCTCT
TTGAGTTATGAATTCTGAAATAAATGGAGTTGTAGTAATTTGGCTTCTTT
TTTTTTTCATTCAGAGTCATATTTTAAGTTTAAGACAACCAATAAATTGA
AAGTACGGCTATATCTATGAGAAATCTATGACCCTCTTTTGGTTGCAATG
TACCGATTTAGAAATATGTTACTATTTAGTTCAGAGCATAATAATAATAA
TATACATATGTTACAAAAATCTAAATATTTATACATATATATACAAACCA
AAATATTCGTGTAGGCTACTTTTTTTTATTTGAAACTAAAAAAAATTTAA
TGAGGAGGGCCACGAAATATCAAAATCTACGTTATGCAATAATCCCTTAT
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AATTTTTAAACATCTTAATCAAATAAAGGTTGCAAAGAATTTGGATATAT
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TTGCTACTATAGAAAGTTAATTTAAAAAAAAAATATTACCTTTATACACA
ATTTAGCATAAAATACAAAAAAAAAGATAGGAAAAGAAAATTTATAAAAA
AAATTTAATCATGTTCTGTTTTTTGTTTTTTTAAACCAGTGGAAGACAAA
TGATATAGGCTCAAATTTAGTTATATTTATGTTAATATTAAAACGTATTT
CCTTTTTTACAGAGGACGATATATATCTCTCAATAGCGTGAACACAGAGC
CACGCTTCCTAATTCTTTGTAAAGTCCTCATCCTTGTTGATCCCTCAAAG
TACATTCATCCCAGACAATGTTTATCCCCAAACGAAGGGTATTTACATCA
TCAACGTCTTACTCGATTCAAGGTCATAAATGGACGATGTGTCATTTGGA
GACGAGGGAAAGAAAGCTCTTTCCTTGAGGCTCGCAACTTTTGTGAAAKC
CGTGGTCTTCGRCTCCCACTCACATCCGTGGATCTTAACTACCATAATGT
ACGTTCCTCCATTCTGGTTAGATGGCTCTCACATCACTTTGAGTACAAAA
GCAGTCCTCGCTCCTATACATGGGTCTCCATATCCGGAACAAGAGAAAAG
TTCGAGGATGATGTTAATTCATCCACGACTACGAAAACTACGGAACTTAA
CGAAGAAGTTATGTTGGACTGTTGGGCTTTAGACACGGCAAATGCTTGGA
AATGGAATTTGAGGCCTTGTGAATCCAAGGCGCATGTTGTGTGTGTTAGT
GATCCCAAGACTTGTGTAAATCCAGAAGTGAATTTCGGGACAAGGATTAA
AAAACGTAAGTATTTGTATTTTTTAAGTAAGGTTGAAAGGGTTTCATGTT
TGCATTAGAAGTTTTTTTTTACAGAAGTTTGATTTCGTGTAACTAAAGTT
CCATGAAAAATATATTAATAAATAGTAAACAAGGCATTATCAAGAGTCAC
TAGTATTGGTTTTAATATGTAGATCGAAAGGAAAATAAGAATTTTTAAAA
GTCTGGGAATGTAAAATATTCCAATTCACTAAATGAGGCATATCCGAATA
AATACATTTTAAACCAATTACCAAACTAGTTTCCACAGATAAGAAACACT
GCCTTACAGTATCTTTAGTAAGCTTTACAGGTCTAATTTATTAGTTCTAC
TTAGACAGCTTAAATTTGGAAATAAATAAAATCCTGATAATTTTAATTGG
AAAAAAAAGTTGGGTACACCATTATCCTTTTCAACACATCCTAACGTTGA
ATGTGTGACTTCTTTTTTTGTGCACCTCTAAAAATATTGATAAATGGTTT
TTTTTTAATAATAATTTATCTTTATCTAAAGAATCTTTTTTTTTTTTTAT
AAAAAAATTTAGTTATACTTTACTTTTGAACTTTTTTTTATATCTTGTAT
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ATTAATTGAATTGAATTTATATTTGACCCCAGGTTAGAAAAAATAATTTT
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TGTACTGAATATCCTTAATGAAAAAGTTACCTAATGTATTCTTTAAGTAC
AACGATTTACTTTAAAAAAATTGTACGATTTTTTTTATATATATATTTTT
TTTGCGGGTATTTATAACCCCAAATACATTTTGGAAAGTGGAGAATTATC
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