EMLSAT00000012073, EMLSAT00000012073-707920 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012073
Unique NameEMLSAT00000012073-707920
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s862supercontigLSalAtl2s862:201351..234761 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012073 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012073EMLSAG00000012073-694839Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000054004EMLSAE00000054004-762932Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054005EMLSAE00000054005-762933Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054006EMLSAE00000054006-762934Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054007EMLSAE00000054007-762935Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054008EMLSAE00000054008-762936Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054009EMLSAE00000054009-762937Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054010EMLSAE00000054010-762938Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054011EMLSAE00000054011-762939Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054012EMLSAE00000054012-762940Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054013EMLSAE00000054013-762941Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto774448auto774448Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012073EMLSAP00000012073Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012073

>EMLSAP00000012073 ID=EMLSAP00000012073|Name=EMLSAP00000012073|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=647bp
MDDPELLRISLEDLTQGEIIGRGSFGTVIRALWNEEEVAVKFFQPDKELL
DAFAVEANQLSRVNHRNIIRLFGASFQPPHVFLVMEYADSGSLYKVLHTS
KVPYHSGHAIHWLLQTAKGVEYLHNLKPTPIAHRDLKSPNLLLVNGGMNL
KLCDFGTACGVQTYMTNNKGSAAWMAPEXFEGNKYTEKCDIYSHGILTWE
VLTRRLPFDEIKGNNCRILWAIHQGKRPPLISGCPVVLEDLMTKCWDKNP
SVRPNMTKIVEQLSFIQKFFPSIENDPLQIEKFSSLKDEEELKEETGSYV
SALTSLPSKSEGFYTPPELVDSDTDVIPPLPSMDPISLLNAPQELMKGIN
LWVDEDSGPIPSDIEVVRDRSSEDIVSPHPPSKDTFQFFEPPYRPNLYPY
HGSHRYPLSDFRPSVIGVGASNLLSPPSGDPPETLSNHDSWHNNMPYESL
SGRNYPSPSYFGKVSPQNLSSPHSMRRNNSKTTVTKDINGLFSVREDATE
KSHRRASSYGSSGKSVAQGPPESNDHHQQYQQGTRGGRGGSYYDHHHQHP
SDLRRSYSDLSTPCSNMYDYYERDSIIDRAVELIEPDLRPVPPQPNCPQS
MQIYHDHRQLASEYVKVKTELERLRDYKDSLEKQFHDEEIDEIPYDL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s862:201351..234761+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012073-707920 ID=EMLSAT00000012073-707920|Name=EMLSAT00000012073|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=33411bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s862:201351..234761+ (Lepeophtheirus salmonis)
TGCGAGTCTCTTGTTTGTATTATTTTGCATGTATAGCGTGTGAGTAGTAT TACGTTTTTTTTTGTATGACAGCAAATACTTTGGCATAAAGTAGAATAGA CTTGAGTAGTGAGAATGGTCGGACGACGTGTACTATTTGTTCATCCTGAT TTGGGGATCGGAGGGGCAGAAAGACTCGTTGTTGACGCTGCCCTTGCATT AAAAACCAAAGGACATCAAGTTACCTTTCTGACAGCTCATCACGACCCTG ACCACTGCTTCCCAGAGACAAGGGACGGATCTCTCTCAGGTAACTAATAT TGAATTCAATAATTATTTATTCCCTTGGTTTTTAATGATTATTTCATCTT TCCATAGTCAAATGTGTTGGAGACTGGCTTYCACGGAATCTATTTKGACG ATTCTTCGCTCTTTKTGCCTACCTTCGCATGTTTTTCCTCTCAATCTATG CCTTAATATTCTATCGATCCTCCATAGACGTTATATTCTTGGATCAAGTC TCAGCTCCTATCCCCATTTTTAAATCCTTCTTTCCTGTCATATTTTATTG TCATTTCCCAGATCTCTTACTAACAGACCGAAGTTCATTGTTTAAATCTC TGTATCGATATCCCATCGACTTACTTGAAACTTGGACAACAGGGAAAGCG GATCTCATTCTCGTCAATTCTCGCTTTACTAGAGAGATTTTTCACAAAAC GTTTAAATCCCTTAAACATGCTCATCCAGAAGTTTTATATCCATCCCTCA ATACCTTTGACTTTGATTCATTCGATGATAAAATAGAATATCAAGTCCGT GATGATGATGAATTTGTATTTCTCTCATTGAATCGATTTGAACGAAAGAA GCAAGTGGATCTTGCTATTCGAGCCTTAGGTGAGGCTTGATTCTAATAAA TTAATTATAACTCTTAATATGGTTTATTTCATTTCCAGCCTTGGTCTTAA AATCTGAGGACGTGAGCNTCTAAATACAAAAAGATTAAGCTAATTATAGC TGGGGGCTATGATAACCGAGTCACGGAGAATGTGGAATACGAAAGAGAGC TTAGAGACCTTGCGGAGTATGAAGGCGTCAGTGATCATGTCTCATTCCTC CGCTCCATCAGTAATGAAAAAAAGATGAGTTTGCTCAAAGTACAAGCCTC CAGCCTTATTTATACCCCTTCCTTTGAACATTTTGGCATTGTACCTATAG AGGCTATGTATTGTCAGGMCCCTGTTATTGCTGTAGATAATGGGGGGCCC AAAGAGMCTATATCCAATGAGTCGACTGGCTACTTAGTCCCAGCTACTCC CGAGTATTTTGCAGAAGCAATGAAAAAGCTTCTACTCGGTGGAAATAAGT TAAAGTCACGCCTGGGAGCAGAGGGACGAAAAAGAGTGGAAGAGCACTTT TCATTCTCAAATTTTACGAATAAATTAGATTTTTTTGTGTCCAAAGTTTA AAAATATTTGTTAAAAAAAAAGTTTTTACTCTGTTAATGTTTTAAAGATA ATTTTTTATATTAGTACCACAACTATGAATTACTACTTTCCTTTAATGAG AGTTGTATAAGCTTTGCTTACTTTTTTGGTTCCTTGAGTGGCAATACTAC TGAGGAAGAGCTGTATACAAAATGACAAATGAAGTGAAAGCTGATTGTAT TTGAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGGCATTTATAT TTTATTGTAAGTAAATGCCGTAAGAGCGTGTGAGTGGGGAACAAGAAAAA TTATGATGGAGTTGACGTTGGGAATGATTTGACTCAGTGATTTCTTGGGT CTATTTTGAAGAGAGTGTGTAGTTGATATATGGCCCCTCTACAAGAAAAC ATCCTAGAATAATTTTCTCAGAATTGAGTGTGAATTACATATTTATCCCT TAAAAAATTTAAACTACAAACACTTCTGATGAATCCTTTGGAGACGTCGA AAATTGGATTTAAATACCCTAAATTAATGTTCGCAATAAAAGAATGAGAT ATGGACATATTTGATTTAAAGGGGGTCATATATGAGGCAATTTAAGTCTC TTAAATTAGATAAAGGTTCTAAACTCTTGGATATCAATGCTTATCCAAAA AAATAAAATACAATTCCTATTATTATTAACTTGTTCGATTACAAATTATA TAACGAAATAATTTTCTTTATGATTGTTCAATATTCTTTTCGTGTTGACG CACCACGTAGGTAGGGAGACAAGAGAGAGAGAGAGAGGTCGGTGTCCTGT TATTGTTGAACACAGGGTAAGATGGAGAGCAGCTGAGTCGTTGACGTCAG AGAGGAGGTTGAGTGAAGTTATCTCTATATTCGTATTTGTGTGTGTCCTT ACTACTATTAGAAGTAGTAGTACAAAGATGACGGATTAGGGATTCTCTAT TAGTTATTCTACTTGTCATGGATGATCCCGAACTGCTTAGAATATCCTTG GAAGACTTGACTCAGGGAGAGGTAAGGAGATTTGATGTGCATATTTTCTG CTTACCCATTGTTTTCCCCATAGATTATAGGTCGAGGTTCCTTCGGAACG GTAATTCGAGCACTCTGGAATGAAGAAGAAGTTGCCGTGAAATTCTTCCA ACCGGATAAGGAGCTCCTGGACGCATTTGCAGTGGAGGCTAATCAGCTAA GTCGCGTAAACCACCGCAACATAATCCGTTTATTCGGAGCCTCCTTCCAG CCGCCTCATGTGTTCCTCGTGATGGAGTACGCGGACAGTGGCTCATTGTA CAAAGTGCTGCATACGTCCAAAGTGCCGTATCACTCTGGACATGCCATAC ACTGGCTCTTGCAAACTGCCAAAGGTGTGGAGTATCTACACAATTTAAAG CCAACTCCCATTGCTCATCGAGATCTGAAATCCCCCAATCTACTTCTGGT CAACGGAGGAATGAATCTAAAGCTCTGTGATTTTGGTACGGCATGTGGTG TTCAGACTTACATGACGAATAATAAAGGCTCTGCGGCCTGGATGGCTCCK GAGGMGTTTGAAGGAAATAAATACACAGAAAAATGCGATATTTATTCCCA TGGGATACTCACATGGGAAGTCCTCACTCGGAGACTTCCCTTTGATGAAA TCAAAGGCAATAATTGTAGAATTCTGTGGGCTATTCATCAAGGGAAGAGA CCGCCTTTAATTAGTGGTTGTCCTGTTGTTTTAGAGGATCTCATGACCAA GTGCTGGGATAAAAACCCTTCAGTGCGGCCTAATATGACTAAAATTGTTG AACAATTATCCTTTATTCAAAAGTTCTTTCCCTCAATAGAGAACGATCCT CTACAAATTGAGAAATGTAAGCTTGTATTATTATTTTTTATATGATTTTG TACATTTCTCTGGCACAATACATATTAATTATCTATCTTATTATATCAGT TTCTTCTCTAAAAGATGAAGAGGAACTCAAAGAAGAGACTGGAAGTTATG TTTCTGCTCTAACGTCCCTACCATCAAAAAGTGAGGTAAAAAAGCAACTG ATTTCTAGTTCTGAAGAATATCCTGAAAAKCTCCCTACCGTCATTAACAC TTATNTTCTGAAGAATATCCTGAAAAACTCCCTACCGTCATTAACACTTA TCACAATCATCCTCCAATTAAAAAGGTTTGCTGTGCCATTAATTCTACTA ATAATATCTAATTACATCTATATTTAAACCATCTCCATTAATTTCTGTTA TAATTATTATAAAAATCATATTTCTTAGGTGCAATTCATAAGAAGTCCCT TTCGCAGGACTTTTGATTTAGCATTTTACCCCAGACGTACAGTCAAGGAA TGAAGATCAATTCCATATTTTTAGCCTTTGAATAAGCACTAATATTCATG TGTTTTGACAGTGTATTTTTTATTTTTTTTAACACTTGCATGTTTGTAGT AATACCTGGCGTGTTCTTAACTTGAGTCCTTTTTATGACCTTGTCTAATG TTTCAATCGAGAGTAATTTAACTTTCGTCCGAAAATTGATTACTATTTTT GAATGGATCAAAGCGTCTAATGAACTTATACATTAGATTTTTGTTTTTAT TTTTAGGGATTCTACACACCACCTGAATTGGTGGACAGTGACACGGATGT TATCCCTCCTTTACCATCAATGGATCCTATTTCCTTATTGAATGCCCCCC AAGAATTAATGAAAGGAATAAATCTCTGGGTGGATGAAGACAGTGGTCCT ATTCCTTCGGATATTGAAGTTGTTCGAGACCGAAGTAGTGAAGACATCGT GTCTCCTCATCCTCCATCCAAGGATACTTTTCAATTTTTTGAGCCTCCAT ACCGGCCTAATCTCTACCCCTACCATGGTTCACACCGATACCCTCTATCA GATTTTCGACCTAGTGTTATTGGTGTTGGGGCCTCTAATCTTCTCTCTCC ACCCTCTGGAGATCCACCAGAGACTCTATCGAATCATGATTCATGGCATA ATAACATGCCATATGAATCTCTCAGTGGACGAAATTATCCAAGTCCTTCC TATTTTGGAAAAGTCAGTCCTCAGAACCTTTCCTCTCCTCACTCAATGAG AAGAAATAACTCTAAAACTACAGTTACTAAAGATATTAACGGTCTTTTCT CCGTTCGTGAAGATGCGACAGAAAAGAGTGAATCATTCAAAAAAGGCAAG TAGCTCCTATATTTTTCTTTATTACGCCAAATTTGGGCAATTCTCCAAAT TTGTTTTACACACATACATATATTAGATAATAATGTCACGGCATGTGGGA 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AATATATCATGATCATAGACAAGTAAGTGGTGATCTTCATCATCCTTCAA AATGCTTAGATATTTACAAATAATATATTTTCCACACATCACACAGTTGG CCTCAGAGTATGTTAAAGTCAAAACGGAGCTTGAAAGACTAAGGGACTAC AAGGACTCTTTGGAGAAGCAGTTCCATGATGAAGAAATAGATGAGAGTGA GGGAGAGGGSCCACTGCCTGAGTTCGYTAACCAAGAAGAAGTTGAAAACT ATGTCAGAAAGCAGTCAGAACGGGTATGTACATATTATAGTATATGGGCC GCCGTCAACACAAAAAGCAAGCATCCTGAATCATGTGTCCCAAACAAAAT TGAGTCTGCCTTATATTTTAATTAATCCTTTGCACCTAAAGTAGAAAAAA TTCATTGTTACAATTAAATAATTAGAAATGTGTTTGAAAGTACATATGAT TGGGGCAAATTAAGTAATTTAAAAGAAATGCAGTTTCTATTAAACTATAG TTAACATTCTTCTTGGGTATCTCAAATAATAAATACCTCAGAAATCTGAA TATATAGTCTATAATAATTGACAGAAATATTGGGCTCTTCTTGGCATTTA CGAAGAAAAAAACAAACAAATTGGTGAATTAACCATTTTCTTGATGCTTC CTAGGGATTGTTTTTGTGTTGAGGCAGCATATATATAACATAATATATTA GGTTGGGCAAAAAGTAATTTAGTATTTTTCGCTTTATTTCAATGCTTAAT AAGAAGTGTTACAATCATTCGATTTAAGCTAAGTATGCCCGTTCTGTTTG ATATCTTGTTGCCAACGAGAATCCAACTTCATAATGCCCTTTTCATAGAA GCCCTTCCCCCTATTGGCAAAAAACTGTGATAATTAATTTCCACATTTGA GGCCAAATTTGTAAGTGCGTTGGTAATACGACAGGGAAAGGGGGTAGTCA 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ATGTGTGCAACAACACAATCTATTGTGATACACGACACAAAGCCTTACTT AGACAGATTTTTATTTTTTAGCTACTATTTATTATATTGTTACATTATTT ATATAAAATATATATTTGCATAGATATTATTTATTCACAGTACAGAATAA TGTTGTGCCTTCTCTCTCTTCTTTAAATCGATCATTAATTAATTATTGTT ATTTGTTATGGCAAATTCCCAATGACGTAGCCAAAGTCAAAAAKGGCGAT ACATAAACAGGGGCGKCCGCTGGGGGTGGGATGTAGCCCCCCCCCCCCCA AAGGAATTTTTGCTTATTACTATATTATTTAATATTTGAAAAAAAAATCC ACAAATGTAACATTTAAAATTTAATTTTTCAACTTTTTTTCAAAAAAATT TAATTTTCTGTGAACAGTTGTAAATTTTTGTATTTTTTTTTTAAGGAATA GCAATCAATTTGTGGATTTTTTTTTCCCAAAAAAGGGAATATTTTGTGAA TAGCTGTGGATTTTTGGGTTTTTTTCCCAAAAATTTGAAACTTTAATTTT AACTTTTGAAATTTTTTTGTAAACAGCTGTAGATTTTTGAAATCTTTTCA TAAAGTTTTAATTTTTAGATTTATTTGAAAAGAAATTTCAAAAACCAAAC AAAAACCTCCCAATATAATCCTTTTGACGCCTTGGTAATTATAGATTACT TTCTAAATTAACCGTAACTGTACGCTATTGGTATACAAGTGAAAATGTGT GTATTTTTATGCTTGTGATGATATAATTGTAATATCTACAACTTGTAATG TTGTAGAAGCAAATTGTATTCTCAAATGCTTAAGAATGCATGGATTTCCA CTTCACCAGCTATTGGTAATGTGTACTTATTCTGGTGTTGAGACTCGGTC CGAGACGGTTTGGTCTTAAGTACTGTTGGATCGTTCCATCAAAAAGTCAG 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AAAGAATATAAATAACATTTTTATTATAAATGATTCACATGACGTAAAAT TAATACTTCACCCCGAAAATTTATTTTAATTCATGATTAATTAGACATTC CCTCTTTCATWAAATAATWTTGTACTTATATAAAAACAGCCATAATTATA TTTTGTGTCATCCAAAAAATAATTAATTGAAAAAAAGTTATTTTATTTCA TTAAGACATTCTTTCACGTAATTCTACTATTAAACAAAATACCCTTAAGT TGGTCAAATGAAAGGAAAGGAGGAAAAGAGTGCCCGTACGTTATATTGGG TATTTTTTCCTTGGCCTAATTTACATACTATTTCATTGATTGTTCTAAAT TTTATTTTTATTTGCCAAGAATTGATGTATTTAGAAAATAATATTATTAT TAAAAAAGTCCCTCTCCCAACAAGCACCTCTGTATTTTTTTTCACTGCCT CATTTATAACTAGTAATAGTGAATCAAATGAATTTTTTATGAGATTTAAT CAATTATTTTGTATAAAAATTGTTAACTCATGACTCAGAGAAAAAAAATA AAATAACCCCTCCATTTATTTTCTTATCAAATGAAAATAAATAAAATTCT TAGGATGTTCAAATTGAGTATGTGGGTCTTTGCTACTATTTCAATCGTTT AGGAAATGTTTTGATGCGTGGGACAGCATAAAAAAATTCAAGGAAATGCT AAATTCCTTATTAATTTATGAACTTGGTAAATTAAATCTAGGAATGGGAT TGTTTTATATGGATTATCTAATCGTGATTCGATACAGTAGTTTTTAGTTA GTTCCTACTTATATTATTTGTAGCAGCAATTAGCGTCGTGTTAGTCTTTC ATTATTTGGTCCAGTCATAGAATCGCTGGTCCTTTAGACCATCTGTACTA TAACTAGAGTTGATAGTTTTTTAATGAAAAAACTAACATTTTTTAATTAC 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