EMLSAT00000012092, EMLSAT00000012092-707939 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012092
Unique NameEMLSAT00000012092-707939
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s866supercontigLSalAtl2s866:245705..267916 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012092 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012092EMLSAG00000012092-694858Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000054123EMLSAE00000054123-763051Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054124EMLSAE00000054124-763052Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054125EMLSAE00000054125-763053Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054126EMLSAE00000054126-763054Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054127EMLSAE00000054127-763055Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775213auto775213Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012092EMLSAP00000012092Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012092

>EMLSAP00000012092 ID=EMLSAP00000012092|Name=EMLSAP00000012092|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=298bp
MQSQISSQNLHQTLIIEEFEPDVFRQLIEYIHTGCVTLQPRTLLGILTLS
HWKIHVCNEIISGLMNAADYYGLEELKRACSGFIQCCVNVDTVCALLATA
ERYIQYKCTKCLVQKVLEFVDENGNEVLNLGSFALLPQHVVRLIMAREEL
KADEFSKFQAVLMWSKKYCDSANSKLSEVLGTFLEYINFHMIPANVLMKE
IHPLGIIPYHIIMNALAYQADPNSVDPLKLSPVKTTKKSKGRSMSVQSGG
LDPYGSITTLSSSTSSAGFEKETLSVDGRSNTSRHSPSRCSSISRYSN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s866:245705..267916-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012092-707939 ID=EMLSAT00000012092-707939|Name=EMLSAT00000012092|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22212bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s866:245705..267916- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCAATCCCAAATAGTGAGTACTGCTGAAAATACAATATGTTGTTCTTA TAAAATAAATCGATTATAACCATTAGAGTTCTCAAAATCTACATCAAACT TTGATTATCGAAGAATTTGAACCCGACGTATTTCGACAGTTGATTGAGTA TATTCATACAGGATGTGTTACTCTACAGCCTAGAACTCTATTGGGTATAT TAACTTTATCTCATTGGAAAATACATGTTTGTAATGAAATTATATCAGGT TTAATGAACGCAGCTGACTATTACGGCTTAGAAGAACTGAAGAGAGCGTG TTCTGGTTTTATTCAGTGTTGTGTTAATGTGGATACTGTATGTGCATTAC TAGCAACAGCAGAGAGATATATTCAATATAAATGCACAAAATGTCTAGTA CAAAAAGTATTAGAGTTTGTTGATGAAAATGGAAATGAAGTTCTCAATTT GGGATCGTTTGCGTTACTACCTCAGCATGTGGTACGTTTAATTATGGCTC GTGAAGAACTTAAAGCTGACGAATTTTCCAAATTTCAAGTAATTTATAAT AAATTAATTTGCTACAACAAGAATTATATACTTTAGTAATTTTTTTTTAT CGTTCAAAAAAAAATTCACAGTATAAAATTTAATGAGAATTAAATTTTAT ACTGAAATACTAATACTAATTTCAACGAAATTGAATTCATTAAATTAAGG AAAAATAAGTTTTTTCTCTAAAAAGTTAATTTTTTTTTTTCTTTAATTTA TCGTGATACTAAACATATTAAAAGGTGGGCTCATTGACGGGTTTACACAC ACATACTTCCTCTATTCTATTATTATTACACAAGTAATAATTAGAAGGGG AAATTTTTTCAAATGAATTAAAGATAATAATTGTATTTATGTTTAATTGC AAAATCCAAAACTGATCTCCGTTTTTCTCCAAGTGGTCTAAATTCTGAAA TATATGGGATTATAGACATTTGAGACTATTGTCGTTCAAAGTCATTTTTT ACCCCTAGAATAATCACCAAGTTAAATTTTCAATTAATAAAACTTATGCA AAGTGTTTGTTATGACTACAAAAGTGTTTTATTGAATCTGTATCTTGTTC TAAACTTGATAATGAATTTCCTTTTTCTTTTTGCTGAAACATGATGAAAA TCAAAACTCTTCTTTAGATTTTTATAAATAATTAAAATTATAGATCTTAC CTATTAACTCAAAATTTAGTTACTAAAAAGAATTTACGAAATGTCAGACG TTACATCTTTTAACAAATGATAAAATAGATATGTTGATTTGGTAAATGTC AAGTCATAAGTTATTACCATAAAATTACTATAAATATATATATAAAACAC ACATTTAGAAAATTCAAGCATTCTAAGAAAGACATAAATGATATTTAAAT GTGCTCTAAATTTATAGTTGCCAGATCATTCTTTCAATCATTAAGAAAGG AACAAGTTGACTTCTATGAGGAATAAAAGGATGAAAACTCATCCAAATAA AACTACCAGACCTCATACGGGAGTAGAGTGGACTCATTCCTTGGGAATGA TATACTAATCGAAACAATGAAGATATTTATTGACAATGAGTTGGTAATTT TAATATTTCAAATACAATTTATTATTTTTAATTTTTTATTAGAATTTGTG TAAAGTACAAGGTTATGTTATGATATTTGTTATTATTATTTATAATGGGA AATTACCTCATGCAATTGACATTGAAATTGTAAACAATATTATGATAATG TTGCATTTTTGCTAGTACACTCCCATGAATAATATAAGCAGTTAAGAAAT AAATAATTGAAATTGGAGATAGATATGTTTTAAATAAATCTTTTTTTAAA TTAGAGATTGGATATTTTTCTATATTATAAGCTATAATATTACTTATGAC TGTTAATGATGAATTAGTTGTAATAATCAAAATAAGAGCGTCGTTTTTCA TCATTTTTAAATATAAAAAAGGAAATATATCAAGTTCAGAACACAATACA AAATAAATAAAATCCTTTTTACATAAGTTTTATGAATCGTATCGTGACTT TGAACGATAATAGTCCATAATTAATATGATCACAGATATTTCTTGAGGGC CTACTGAAGAAATTGGTCTTTTTTAAAATATTTATCCCCCAAAGCAAAAA AAAATGAAAAAACTTATAAAAATAAGTAGAAAGAAGATGTAGACGAAATT GGGCATGAGCGTTGTTTATATTAGTTTGTAAATAAGGCGACAGTGTTTGG TGCCGTATCGTGATAAAATAATACATTTTCCTGAATGATAATTATCATTT TTACGAAGAGGAAAAAAACATCCCTCTCAAGCAGTCCATACTTATATTAG TACATGCTACAGAAAGTCACACCCCTTGCGGATAATATATATTTTTTTAA TTTGCTCATGCCCTATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTA TCCCTGTTGAAAATTCATTCAAATATTCTTCATGGAATGAATCATTTGAT ATTAAAATATTAGACCCTGTTTTTAATAACAAATACAATTCATTATATGA ATAAAATTCTTTTAATACAAGAATATGATTTATTAATTAAAATATAAATT TTTTCGTTATTAAAAAATGTATATAGTTTTTTATTCACTTGTATTGTATA TAATTCATATTGAATTAGATGGATATTATTGGAGAAGTACCCCATTTTAT GATAACGTTTTACAGTTTATAATATTTTAAGCAATACTTTTTTATGAAAT TTTTTCTTTATAATTACTTGATAAATAAAATTGTATAATTTTTTGTAATT AAAAAGATAAATTAATATAACCATGAGTGTCTATTCAAAGATGACTTTTA TGTTTTTCCTTAGATAATGACGAAAAGATTCCTTCAAGTCTCGGCAAAGA ATCATAATTTAATTTACTATAATCCAGGAATGTTTTTGTTTCCCTTCAAT GTTAACTATATGACGTAATTTTAATTAATTCTCTATGATTATATGGTGTA AACACTGATTCGAACTTTCAAAACGTTGAAACCATTTCAATATTATCTGC ACCTTCTTTTAACTTCTAATTTTTATTCGCTTTTCATTTTTTTCAATATA CAAGAAATTACTGAAATAGAAGAGATTTTGTGCATAGAAGAAGCTATTGT ATTAAAGTTGGAATGAAGGACTATAATAATAAAAAAAAAGAAAATACGGG CGTGTAAGTATATTCAGCAATTCACCTTCACACATACGATGAGTTGATCT CGGGATTACATTAATTAGGTGTATTAATTTTTATGAATCAATTACTCATA AAAAGATATTAAATCTGTTGTGTATGATATTGAACTACCTTAGTTAACAA TAATACGCATAACATATTTTAAAATGTCTAAGATGCTTAAATTCGATAGA TATGAACATTCTCAATTGATTAATTATTCATAACCCGTAAAGTAATTTAT AACAAAACAATTTTAGCAATTTGTAAAATCTAATTGGTGTATATATCGTG TAAAACTTGAAATTTTGTTCAATTTGTAATTTATTCTTTGATTAAGGCCC TGAGGTTGTTTATGTACTTACACACGCATTTCACACACATATATTGTGAA TTAACACGACAGTAAAGTAGATGGATTTTTTCTCAAATTGAGTGTAGGAT GAGATGGCATTTTTCAATCATTTATCTTCCATTTCCATTAATACAATATT CTGATTTACCTTGTAGAGTAAAATATCCAAAAGTTTTGAATTTATTTCAT ATTTCTCTATTTTTGTCCCTTTTTTCCGAATAGTTTCCAATATTTGTAAT GAGTGTTCTGAATTCCTTCAATTCAATTTCTGCTCCAACCTTTGACACAT CTTATTATTTATTATTGAAAGGAATATGAATGACAATCTAGGTATGATAC ATATGGCTCTTTATTGAAAGAGGAAGYCGGCGATTCCTTTGTTCTAAGCA TGGAATAAGTATCTAAGTATTTCTTGTTGAAGCTGAGAGAATTTTTCTGC ATTCATAATTTTCTTGATGCTCTGAATATTGGATACATCATTAAACTATA TATACATGCTCGCACCGGGCGATCAATAATCCACCACGATACATTGGAAA AGATGAAGAGTAGCTTATTGAAGATGAGAGAAAATGGTTACAGTTAGAAT CCTTATGTTTAATCTGTATTATAATATTCTTTGCAAGTTACTTTAATACT CATTATTATCTAATATTAATATTAATCTACATCACAGTTGTTCACCATCT TTAATGAATAAATATATACGTTCTAAAAAGAGGGCTTTTGTTTATGTTGA ACAAATATCAGGATGTCACCTAAAATGAAATGTCAAATTACCGGTTGCCA AGCGACGATTAAACATGGGTCTAAGGCTGCAGRTATAGTAATGTATAACA GCCACAATGTGAACTACAATCAATTTGGAGGAGAATCTATCAAAACTTGT GTATAACGACTAGAGAGGCCGTCGATAGGTCTACATACGTCGGAAGAAAC TTGGATAAGCTTCAATATCGGATGGGYTCTGTTAAAGCAAAATACACGAT TGAAAAAGAGTGGGATCATTCCAAAATTGTTTCAATGCTGCAAAGAATCA CTGGGTGATGTTTTTGGTAAAGAAAGATCCAACGATTTTGTCACAATGCG AGGATAAAGTTTTAGAATCAATCTGTAAACTAGCTGTAATTCCGGTGTCA TTATGTATCAAATGAGCCGGGCTACTGAATATAATTCAATCCACTTGTGA GACGGTCATGAAATTCTTTGACCATAAGTGTCCTTCCTTGCACTTTACTC CCACAACGGCGATCATGTCAGAGTTTAAACTGTCCTGCATGTCCTGTCAA TGAATGTGGCAACAAATGCAGCTTTAGGATTGTTTGACTTATTCACAGAT ATAGGTAGAAATCGAAGTAAGCGACCACATAAAATATGTCTAGAATACTG GCAAAAGGAGGGGACGATGTCAAAGACAGAAAATATAAACACTCCAAACT GATCATCAAATGAGACAAACCCCTTGGTACTGAACATGAGCGTATCGATA CTATCATATACTAMTTATAAAATCATCACAGCTTCCATACCACACCTAAC ATKCTCMGGGCACACTTGAAAAAGTGWAAAGCCAYAAAACTARCCTKCAG CCACAGTGTCAATATCGAATAAAAAGTAGAAATATGAAGAAATAGAAGCA AAGGNATCCTCGAATTTCCCCATTCTCATATGATAGTGGTGACCGACACA GGGGCTCAGTCTTGTCTTTGGCCAAAAAAAGAATTATTTAGGTCTGGATT CCATGATTCTGACCTCATCACAGTCAAATGTGATACGTTAACCGCAAATG GGAGTAAACTTGAAATAGATGGAACTAGTGCAGTCAATTACATCCTGAGA ATGTTACCTTACATTCTTTTGTAATTTTCTATTTTCTAATAGTGAGCCCA GTAAAAGATTTTGATATTATTTTATACTGATCGAACTACTTCTACAAGTA 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TAATTGACTATAGTTGCCGCACATTCGCCAGCTTCTTGTGGGGTTTGGAA CGAAGTGAATAGAGGAAGAAAAGTTAGAAGAAGACGTTTGTAGGATTCTG TTCTTCAACAATTCGTTATTTTGGTCTTGCATAAATCCAACTAATCCAAC TTGCGTAATTTTGTAAAGCAAGAAGGACTTTTCTTCTCGATATGGTGTTC AACTTCGTGAGCTGGATTTGTTTCAGTTAATCTTTAATTATCAAAGAAAC CATTATACTTCGATTTGATTTATTGAGTCTTTGATAGTTCTGTAATGAAG CACGGTTAATCTTGGAATAACTTTTTATTGAAGATATCAATTCTAAATCT GAAATTATATAAAAAATCTACACTCTAAATTGGACGATCACTTTGTACCA CAATAAATTTCCATTGGAAATATCCTAGATTTTTTAGATTGAGAGTTAAA GTTGTTATACAAATAACATCAATGAGGCTCCTCTATATCCAATAATAGGG GAGAGTTTTTCTCGAATACGACTTATATTTTGTAAATGGCATAACTGAGA CTTGGGCTTATGAATCTACCAGAAAGTTAATCAAATTTGAATTCTCTTTG ATGAAAAAGAAGTTTGATGGTTTATTTACAACCTCAGTCCCGTGCAACCG AGGGAAATTTTGTTTTTTGAAACAAGTATGTAAAATTCAACTTGTTCCTG AACTAGTAGTTGCGTTCATTCCAAATTTAGAATGATAATAGCAGATATCT TTTTTTTTCCATAGATTTAGTAAATTTGGACATATTATGAAGAGGTTTTT TGAAACATGATTGATAGGAGGCGAAGTGGACGACTCTTCAAGAATGGAAA TATGTGTATCGTTAAATTGTTTGGCTGCAAAACTAATTTACTTCAACTCT TCAATCGAATAGCACTGTGCTCTAAAGTATCCTTGCTGGCCTTTACGTAC ATTTGTGATGAGGGCCTCCCTAAGTAAAGATGACGCAAATCATGGATGTA TTCCTCATTAAAGAGACGCTCAACTTTACTTATAACTTCCCCAGGAGAAA ATCCCGATGAATTGCACAGAATTTCAGAATTTTTTTAAATTCTGTTTAAT GGAGAGAGACTATATTTCTGTAAAATTGCCTTTTTTGCACCATCATACAT GATACCTTCCTTCTTTATAAGGATAGACTTAAAAACTACACCAGGTAATG CTGAAGTTATTAAACAAAATTAGGTTGGATCTTGATTGATCTTCCTCATA AAAAAATCCAGCGTAATTCTTCGAAACCAATTTTTCGGATCCATCACTGA GAATTTTGGAAGACGTAATTCTGCAACAGCAAGAGTTAAATTGTTGATCT CTTCTGCCACGTACTTTTGTTCGATCAGAGGGACATTGTCCGAATGGTTT TGACCATCAGAATGAGATTTTTTAGGAGGCAGGATATGACGCCTGGGTCC CCAATGTTAAGATTTAAATATCTTTACTTAAACTGAGTAAAATGATCATT CCTTTTTACGAAAATCAAAAGGAAAAACAAGAAAAGGAATACAACGTACT ATGAAGAATAATTAATATCATCTATACAAGTCGAATTCCTACATGTATTA TAATATTGCTTCGTAATATATTATTAGAAGCGTACGATAATANCAACGAA TGATTAACAAGTAATTGTATTTTTGGAAACGGAGCATAAGTATTGTTTAT CTTATTATTTCGTTTATTTATCAAGAAGAAAAAATTATTTAATAGCTATG ATGTATCAATTTAGAGCAGGGAATCGATAGCTAACAACAAAATACAAAAG GTATTTTTGTGTTAGTGAGGTTTTCTTTGATATGTCCTTGCACACTTTTC TTAAAAGGAGATTACAAGGTTTAGAGGGGGGGGGGATATTCAAGCGCCCA CCATTGAACTTTTGTTCGCCCAACCATATCATACCATAAACCTGTAAGCA AAGGTTTAAGTAAGCTCGCTACCAATGGTGTAAATAAACTGAGAAATTAC TACAATGCCATAATTTAAGTTTAAAAGGCAATTTGTCGATTATTTGTCAT ATTTATTAGATTTAAACATCACACATATACCTATATAAAAAATTAGGCCT CTGAAAATAATAGATTCCGGTTTTTATGAAATTATTTAGTTCCAATATCA AGCCTATGACATGGCTCCTTTTTAGGTATAGATAGTTAATTAGATATTAT AACAAAAAACATGATTGAAATGTTAACATCTTCAATTTAATAAGCTACGA ACTCATGGTTTGATTGAATGATATATCCAAAATCTTATTTTTGAGTAGTA CTTATATCTAACACAAATATGAAATAAGTCTGACTTTTTTTTAAAATTGA TCATTGAATGACGCTAAGTTTTTTTAATTAGAATTTGTATCCATAACATA ACAGCTATCGATTCCCTGCTCTAAATTGATACATCATAGCTATTAAATAA TTTTTTCTTCTTGATAAATAAACGAAATAAGTTACACTTTAACATCCAAT TCGAAAAATTAAATTGAACATTCTCTAGGCAATATGTTTGATGATTAGTT GGAACTTAAATTGATTATGTCCTTAAGTTGTTATCATATATATTAGTATT CAAATTTACCTAATGTATAACAAAAATTCATATTCTTTTTGTAAAATGAA ATCAATCAACATGCGTGGATATCTTTTCTTATATATTATCTGATTAAAAT GCATAATTATTCATGTAAATATTGGTTATATAGGCAGTCTTGATGTGGAG TAAAAAGTATTGTGATTCTGCAAATTCAAAACTTTCTGAAGTTTTAGGAA CTTTTCTGGAGTATATCAATTTCCATATGATTCCTGCTAACGTGCTGATG 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CAGAAAATGGCGCTTCTGAAGGAACACGACATTTTCTGCCTCTGGTGATC CTGCATATCTAACGCAATTTCAACTGGAATTAAGAAACTCCCAGGTTGTG AAGTTAAATATCCTCCCATGAAGCCTAACTAATTGAGTAAAGTGTGATTT ATTGTTATTGCCAAACTAATAATACAAAACTAATCAACTGAATAACTGTA CGACATACCAAAACTAATGAATTGCATCATATATACCTGTGTTTCTCATG TGCTCCTCTGCTTAGAACTCCATTGCTGACACTGATTTATCCTCAGGTTC ATGTGGACTTATCAATATGATATGAACTATAGACATCTGTATATTGAGTA CTTCAGGAGTTATTTTTATTTACAGAATTAACATTACATAATCAATCAAA TTTTTGCCTTTCCTCACACTGGACTTATATTTTTGAGAGGTGAAGGCCGT AGCTATTGATGTTCATATTTATTCACTCTTTATCGTTGCCATTTTAGCAA AATCTACGTGTTTATTATCATATTTCCTCTTTAATGATCTTTTAGTGGTG TTGTTGTCATTGGCTGATATTTTATTGCTCAAGGGTCTTGCCCGGGACTT ATTTTTTAGTCACGCCAGGGGTAAATGATCAGAACTGTCGTAGATTTAAC ACTGCATAGATGACCCATGCTTTATGACTTTAAGCATTTTAAACATACAT TTTTGGACCGACATAAATTTGCACCTCTTTATATGTTATGGCTAGTGCTT CCAGTCATCTCCATGTGATGTGATCATTCTCGCATAAAGAGAAAAATGGT TCCCTTCTTTCTGCTATTACGAAGATGTTAGCCGTAGCTATCTTTTCACT CATGTCTGTGCAGGGGATCTGAACTTTATACAATCTAAGCCAGTTATTGA AGGACTCCAAATTTTCAATCCTTCCAGTGGCCCCGGGGCCTTGGGATGCT 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