EMLSAT00000012106, EMLSAT00000012106-707953 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012106
Unique NameEMLSAT00000012106-707953
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s868supercontigLSalAtl2s868:259044..273007 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012106 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012106EMLSAG00000012106-694872Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000054217EMLSAE00000054217-763145Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054218EMLSAE00000054218-763146Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775448auto775448Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012106EMLSAP00000012106Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012106

>EMLSAP00000012106 ID=EMLSAP00000012106|Name=EMLSAP00000012106|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=266bp
MSEQEAKRQPISDILEAVVEVARILDIVKRPRSLVFKVANMKKNGEYLSK
KAGSGRXNLKKDLEILSNLEKKIKDNPTKSMNHLVNNFFVAARTIRKAVK
GDLGFFSYTRTPRHLLTKKKSNKTFFNTKVTDSALIEMTKLYQLSLFYFL
SILHLVPAPVPRCSPFIIINKLAEFSNVLSDSNPYFPVPPCEYGGPGNAI
RYGDYEXVFVLARPDLIPRHNFYELIWFMKYGASRFVRYIYSRLLAKNNF
VELYLSNIYFTKGQFL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s868:259044..273007+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012106-707953 ID=EMLSAT00000012106-707953|Name=EMLSAT00000012106|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13964bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s868:259044..273007+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAGTGAGCAGGAAGCCAAAAGGCAACCCATTTCAGATATCCTAGAAGC TGTRGTTGAGGTGGCAAGGATTCTGGACATTGTAAAGCGTCCAAGGAGCC TGGTTTTCAAGGTGGCCAATATGAAAAAAAATGGAGAATACCTCTCTAAA AAAGCAGGAAGTGGAAGGKACAATTTAAAGAAGGATCTGGAGATCCTGTC CAACTTGGAGAAGAAAATCAAGGACAACCCCACCAAATCGATGAATCACC TCGTCAATAACTTCTTCGTGGCTGCTAGGACCATTAGGAAGGCCGTGAAG GGKGACTTGGGATTTTTTTCATACACGAGGACCCCACGACACCTTCTGAC AAAGGTCATCTCAGCTAGGAGGCTGGAGAGTCAATGTTTTGCTGTCCAAT TCAGTTCATTGTTTGTTCTATAATTTTGAATATCAATCTAGAAAACAAAA TATCGAGGAATTGGATAATCAAATCCAAKCAATGATTTTTTTCATTTAGT TATTATTGACATCCTGTAATATTTCTATTTGTAAATAATCTTAAATATCA TTTATGACTATGTTATACATATATATATATATATATCTATTATTAAATGA CTATTCTTCACCCTTAGAAATAAAGTGTTACCATACATTTAATTTTTCAA AGTCCTTCAATTCCCATAACTCAAAGAAATTTTTTCAATATTATTTTAAT AAAAATTTTATGGACATATATTTGGTGTTTTATTTAAACCTTCTTACNCA GATCAAATATGGAAATAGAATAAAGGAGTGGATARNTTTKWAGKTCCTTK AAGTAAAAAMAWTTATGTTTYACAACAAAAAAGTACAGTGTGTCACATAG CGAACATAAATTAACTCTGTGTGGTAAGAATTTACTTGAAATTTCTATCA ATTTATTTATATTATATTAAATCACGTTGCAAACTTTCTTCTGAAAATAT ATATTTAAAAAAAAGGCTCGAAATCATTTGATAGTTAGCCAAATAAGTCA CTTGTACCAACTGCTATTTATTTCATCCATCAGCTTAACATCATTGTCAC ATTATTGATCCCCCATTTTTAAAATGAATTATATTTATCTACTATAATAT AATTTTAGAGTTGATGTAAGTTTGTATGTCCGCTAATAAAAAGGCATGAC CAGGGTATTTATTTCACAAAGGGAGACAGATACAGGCTTTAAACATAACA TAAAAATTGTTTAGAATTCTGAGTGACGCGCCTAAGACTAATTTTCGTTT TGATCAGACCACATTTCCAAGCTATAGAGGCCAAGTTTGTTTGTTTTTTA AATAAGTTGATTTTTTTCATTAAACAAGACCGATTCCCCGAGTCTCAAAG TTTCTTTTAAGATATGATTTCTAGATTCGAAAATGCACAAAAAAAATCCA AAAAACGAAAAAAAGGACATTAGGAAGAGGATGGGTGAGTTTCTCTTAGT ATGTGCATACTAAAATATATAATACGTTAAGGTCCTAGTATAAATATAAT ACTTATATTAAAATCCTACATTCCTCTATATATGCAAATATTTTATTTTA ATATCGAAATCCTACATGGAACATTATTTGTATATGGAACTGTATTATAA TGCTCCTAATTAATATTTCATTAAAAGGGCAGCTACATATAAGTATATGA TAGACAAAGTTTATTCAAATAAATAATGAAATGGCCAAGAACCGGGGTGT AGATTTTAAATCCGGAACAAGTTTAGATCTCAATACCTTGTTAACATTGA CATCTTTGCTTATGAAAGGGTGTTCATCAAATTTCATTCATAAAACTGTA TAAGATAAAATACAAAATCCTTAAGATGTCCTCCAAATTTGAACACACTG CGGCAATTATCGTGTACCTCCGTTCTGGGCGCACGCTCAAGGTGATTATA GAGTTTACGAAGCTGACCAAACCATTTACCATATTGCCAAGGCTTTCAAG GATTCTGCTGCGTTAGGAAGACTTTCAAGGAAGAATTATAATCGTTTTAA GCTAATAACTTATAAAAAATTAATAGAAAAAACGATTGAAATGTATGGGC ATGGTGCCTTTTTGCTTGCCGGCTCTGAATCTCAAAGACTACTTTGTTTG TGTCAAGATATTTAATTTTGGAAAGAAAGAGTCCAATAGATGTGCACATA ACACATTTGACTCCTTGCCTGCTTTCATTCTCGATTCAGTGGCCAACATG TATAAGAAGTCCCACATCAAGGCCAAATATTAGCCCCCAAAATGCCATTT ACTTCAATTATGACTAAAAATCGAACCGTTTGTAGGGATTTTAAGTAGAT ATTACTTTAATACAATTCAAATATCAGTGTGTAACCATGACATTATGTAG GACTCAATGCTCCTGTTTAATCTTTTTTTATTTATAAAGCCATTTGATGG AGTTTCATCAAGATTTCTGTGAAAGTTCCTCATTTTATATTGTAAAAATA CCAAATATGCACCCCAAAAATGGCGTTTTGTTCAAGTATAACTAAAAATC TAGATGTTTGTAGGGATTTTGATTTGATAGGGCAGAAATAAACTAAAACA CATATATTAACCGCCTGAAACTTAACTTAACTTTTTGAAAAACATACTTC CTTCCAATTAATCTCTGTCCAGAAGGAATAGCTTGCGTCTTCAGGATAGA ATTGTAACCATTCTGAAGGAATTAACTACAAATCTCTCATACTTGTCAGA GCAAAACATCACAAATAAAATTAATACTGGCCCAACCAGCTGGATTTTTA CAGACAATAATTAAAAATATTTTATGGGTTTATTTTTTTCCCAATAAGTT TCATCAGCTTAAAGAAAAAAATATTGATAAAGTCATAAGCATTGACGAAA TGACGAAAAAGTATTTTTTTCTAAACATTTTCTTGCCAATGTATATATCT ATATATTTGTTTTTTGCTGAAAAAAATCAAAAAATAAATTTTTTTTGGGA AAAAGTTCAAAAAATTATAATTTGTTGGAAAAAATTTCAAAATTCCATAT TTATTCTCTAAAAAATAAATTTTTTGAAATTATTTTCAAAAATCTACTTC TGTTTTACAAAAAAAAAATTTCAAATATTACAACTTTTGCAGACAAATTT CAAAATTCATAGAAAGTTTAATATGTGAGAAAAATTTATGAAAAATTAAA GTAATACTCAAATATTAAATTCTATGACAAAGTTTGAAACATTAAATTAA TTCGTATAAAGGAAAATTCCTTTTTTTGGAGGGGGCTACAGTCCATCCAA CCCACCCCTGAGTAGATCTTTAATAAATATCACTCATGACCTATTCAAAT ATCAGTGTTTATGATTGGTATCAAGCCACTTTTAATACGGATCTTAAGTC TTACTTTTATTCTCCTGGATGGTATCTTCTTCAAGTATGACGTTAGTAAA TCCTCTCTACGTGTTTACAGTACATGCAAAGGTTAATTACATTCAAAAAC ACTCCATTATAATTTTTTATGAATGAAGATATTTTGATTCATTATAATCT TAAAATATCCTTGTAAACTATTCGTTTATCCTTTTTTTATATACCCTCCA ATAAATACAACAACAACACATCCTTAAACATATTTAATGATGATCGACTG CCTTTATTTATTCAAATATCAAATGCTCACTAACTCCACCAATTTATATT TCCTATACTAATATATATGAAAAAGTACATATGTGATACGTCAACATAAT AATAATCTTAATCAAAATTGAAGAAAATGTCAAAACCCTACTTTTTTTTC TAAATAAAGAGGTCTGATCAAAAAGAAACTGTTATTTTCGAACCTTGAAT TCAATTTTCATTTGATTCTCTAACTTATTTATTTTTGTTATGTTGGTATG TATTTTCAGAACATTTGCAGTCCTAATTTGTTTTTGACATATAAAATGGT TGATTTATATTATTGAACAAAATGGAAAGAAAAAAAACAAATTATGCGAA AATTCTTTTATTTTTTTTAATGTTCCTTTAATTGGTCAGATAGAGTTACA CTGATTAAGTATAAGTAAATATTATAGTATTATAATTGCTCATAGANNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTATGTTTCCTT TTCTATGAATGACCGAGACGCAAACTTACCCAAATTGAGTTTAAGAGAAT AATTTTTACAGAGCACGTTCCATTCTAAATGTAGTATTTTGTCAGAAATA ACTATTTAGGAAAATAAATTATCTTTCTAAAGATTTCAATCAATTTCTTT CTAAATTGATTTTTCTGTTATATTTTTTTAACAACATCCCCCCCCCCCCC TTTATATGCAAAAYAAAAKAAACAGTCCATGTTTCGATGCTCAAACCTGG TTAAATTAAAAAAAAAGTAATAGTAATTTTAGGCGTCATTATAATAATGA AGACATTCAAAGGGTTCATCAATACTTTTAGCGGTCGAAATTAGCCTAAA AGCTAAGATCAATTGCGAAACAAATAACTTTTAGCGGTCGAAATTAGCCT AAAAGCTAAGATCAATTTCGAAACAAATATTGTTATGTGTCACACAAATT 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TTCGATTCAGACCATAGACCACAATTTACTTTGTTTTCAAAAGGTGGATC CATTTTTTGAGTTGCAATATATGCAGACCCGTGCAAATAAATTTGGACCA TGTATATGACTGTCAAATAATGATTTAATCAAGAAAATATTCAAAATTGT CTCATCTTCATGGTTTGTTAAATAAAGTATTCTCCAGAACCATTCATTAT GGATCTCAGTGGCCTTAGCATTGATCCAAATTTATTTGCAAGACCCGTTA GATTTATGCAACATAATTAAACTTCATATGACATTAATACGCAATTTCGA AGCAGACATAACGTCATTAAAAATTAATCCATAGCCTTTGTCTCGAAATT TTTTTTAATGAGACGGATAACCACAAAAATTATCGTAATTATATAATTAT AGAAATATCTTCCGTGAGAAAAAAAAAACTTGTGCAACAACATAATCAAT GTTTATCAATAATCGTCAATATGCTCTTTGTAACTTTTTGGTAATAAATA ATCAAATATTATACTAGACAAAATGGATATACCTTTACGGTCAAGGAATA TTTTTTTTAATATTTTGCGAAACTCTTACAATTATTTAAAAAAAATTACA AATATTTATATTGAATGAATTTTGCATAATGATCATTTCCGGGTTTTATT AAATAAACATATGAAAAATTATCTGATTTCCATCTTTTTTGTTATAAATC TGCCCTCCGGGACCAAATATAAATCTACAAGTCACTTATTGCGTTGCTTG AGCAATCAGACTCCTCTGTCATAATAGGACACGTGTTACCCTTGTTATAT CTCACAACTTTTCCTCCTAAAAGAAACTGAAGAAATGAGCCAAAATCAGT TTGTTTGAAGTTAGTCAATTTTTCCTAACGTTTGAGTTATTATTTAATAC TTATTGAGAGTTATTCACTACTTAAAAATAACTGCTTATAATGAATCGAC 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