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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s868 | supercontig | LSalAtl2s868:259044..273007 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012106 >EMLSAP00000012106 ID=EMLSAP00000012106|Name=EMLSAP00000012106|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=266bp
MSEQEAKRQPISDILEAVVEVARILDIVKRPRSLVFKVANMKKNGEYLSK KAGSGRXNLKKDLEILSNLEKKIKDNPTKSMNHLVNNFFVAARTIRKAVK GDLGFFSYTRTPRHLLTKKKSNKTFFNTKVTDSALIEMTKLYQLSLFYFL SILHLVPAPVPRCSPFIIINKLAEFSNVLSDSNPYFPVPPCEYGGPGNAI RYGDYEXVFVLARPDLIPRHNFYELIWFMKYGASRFVRYIYSRLLAKNNF VELYLSNIYFTKGQFL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s868:259044..273007+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012106-707953 ID=EMLSAT00000012106-707953|Name=EMLSAT00000012106|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13964bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s868:259044..273007+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGAGTGAGCAGGAAGCCAAAAGGCAACCCATTTCAGATATCCTAGAAGC
TGTRGTTGAGGTGGCAAGGATTCTGGACATTGTAAAGCGTCCAAGGAGCC
TGGTTTTCAAGGTGGCCAATATGAAAAAAAATGGAGAATACCTCTCTAAA
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GAGTTTACGAAGCTGACCAAACCATTTACCATATTGCCAAGGCTTTCAAG
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ATCAGTGTTTATGATTGGTATCAAGCCACTTTTAATACGGATCTTAAGTC
TTACTTTTATTCTCCTGGATGGTATCTTCTTCAAGTATGACGTTAGTAAA
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TAAAATATCCTTGTAAACTATTCGTTTATCCTTTTTTTATATACCCTCCA
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TGATTTATATTATTGAACAAAATGGAAAGAAAAAAAACAAATTATGCGAA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTATGTTTCCTT
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AATTTTTACAGAGCACGTTCCATTCTAAATGTAGTATTTTGTCAGAAATA
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AAAAGCTAAGATCAATTTCGAAACAAATATTGTTATGTGTCACACAAATT
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TTTCAAACATTAAAGGAATCTTGTTTTTATTTACGATCATTATAAAATAC
GTCTGAAAAGCGGTCTATATTGTATTCAATTACTTAAAATTAACCTTGCT
CGTAAAAAATTTCACAAATATAGAAATAAGTTTTATTCGCCCTTGAAGTT
TCCTTCGAGACAATAAGTAAGGAACAACAAGTCATGATGCTGTGTAATGA
TTTTTTCTTGTACATAGACGTGATCAAGTCATAAAAATTCGACAATAGTT
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TTGGMATTTTTTTTCTGAAAAAAGTTTGGAGGATACAATAAATGTAACGA
AGTGATGGTCAAATACTTATTTGTCACTATTTGAATATTAAATTAGGCAA
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CATTCTTTATCAGTACAATCTTTTTTTTTTATTATTCATCGATTCTAAGA
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TCTCCACTCTTAGCAAGGATTGAAGAATATAAAAACAAAGAAAATAATTA
AGGAAAGCTAAATCGTAAAATACTTGAGTATCACATGTTCTAGCCACACA
CCTCCTACTTTAAGCTTAAGGTATCTTGTCTCTAAGAAAGAGGTTATGCC
CAAAAACTCAAATAATGTATATAGTACCCATGTTATTTGAGATCTTGCCC
GTATTGCAGTCTTTATGAATCTTTTTGAAAGAGTGATGTTTAAGTTTTCA
GAAAATGTAATATACTTTAAAAACTATTTAATATACTGTAAAAAAATGAA
ATGATTTTCGATTACAAGTCAAGGGGCCAGTTTTACCGTTCACTTCCTAG
TTCAGTCGCAAGTCTTTCATAATTTATTCAAGTTTGAGTTTCCAGTTTTC
TAAATATGGACTCAAGTCCCTATCTTTGGTTTTACTAAAACTTTATCCTA
TAATGTTTTCTTTTTATACCAATAGATAAATATCGATAGGACATAATTTT
TATTATTTCATTTCATGTCCAAATTGTATTTTTCAATAAAAGGACAAGCC
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GCCTGAGCCCGATATTTTTTCCCTGCTCAGTCTTAAATAAACACCAATAT
TTCGATTCAGACCATAGACCACAATTTACTTTGTTTTCAAAAGGTGGATC
CATTTTTTGAGTTGCAATATATGCAGACCCGTGCAAATAAATTTGGACCA
TGTATATGACTGTCAAATAATGATTTAATCAAGAAAATATTCAAAATTGT
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GATTTATGCAACATAATTAAACTTCATATGACATTAATACGCAATTTCGA
AGCAGACATAACGTCATTAAAAATTAATCCATAGCCTTTGTCTCGAAATT
TTTTTTAATGAGACGGATAACCACAAAAATTATCGTAATTATATAATTAT
AGAAATATCTTCCGTGAGAAAAAAAAAACTTGTGCAACAACATAATCAAT
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ATCAAATATTATACTAGACAAAATGGATATACCTTTACGGTCAAGGAATA
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AGCAATCAGACTCCTCTGTCATAATAGGACACGTGTTACCCTTGTTATAT
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TTATTGAGAGTTATTCACTACTTAAAAATAACTGCTTATAATGAATCGAC
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TATTTCACAAGTCATTACCCTTTTTGTATCATGCTACCTTTCACAAAAAA
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TTCGTATTGTTTCTCCAATTTGATTCCATAATGTTAAACTCCTACATAGT
ATTTTATTTGATACTGTATTGTATATTATAATTTTGCTTATTCATATTTT
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ACATTTTATGCCTCATAAGAGAATAAAGTCGACCCCTTCGTTGGAGTGGA
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AGTGAATCGAAGGAAGATACTTCTAATTTGCTTATTCATGTCAAGAGATG
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GTATATGTTGTTGGTGCCCTTTAGGGACAATAAATCCGAGCTTTAAGGGT
GATTAATTACTATAAATGATGCTTGGATACACNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TAAAAAGTGTATTTGAATGCGTTTTGCCGAACTTTTGCTACTGTCTCCGG
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TAAAAAATTAGACTAAATAACATAATCTTACGAATGACTAACCCATGTTC
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GGATTGCCYCCCCCCCCCCCTCCCATTATGTGTCAATTATTATTTTATGT
TATTAGTAATAAAAAGAGTAAAATAGGGGTTGAATATATTATTTTATATT
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TTTTTTTTAATACATATTTTAATTTCAACAACTTTTTTTATACAAAAAAA
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AATTATCAACTTAAAGTCTACCTAAATGAAAATTTTTGAACAAAACAACG
TAAGAATATAAAGGTTATAAAAGAAAATTTGTATCACGCAATCCTATCTT
TTGAAATATATTCACATAATGTATCGCTATCTTAAACAGCAAACACTTAA
ATATGTTTTGTGTGCAAAGTAAAATTGCAGACTTGACTTTGTATCAATCT
GGATACTAAGTTGCTTTAATAAAATTAGGGACTATTCCAGTCCATAAACA
ATGTAAAAAAATTTTTTTTTAATTTAGAGTTGTCAGTATAGAGKCGAAAA
GGCAAAGGGTATCTGATTGACTCCACGCCCAAGCGAGTATCGAGGAGATC
ATAGAGGTAGKAGGGTGCTCCTAGAGTATTGTTTACAAGATTAAAAGCAT
AATTGCTTCAGGTCAAAGCCTTGAGAGGTCCCCCGACATCGGTAGATGCG
GGAAAATCGGTCAAGTTGATTAGACAGCATACCAAGTTCATTAGACAGCA
TGTGAATGCTCTTAATATTGGTGATTAGACTGTGAAAAGGTATGCGAATG
ATTAGGGCAAGGCCTTTTATCTAAAACGAAATCGGCAGCTATAAAGCAAA
AAGAACCTAGGCCAACCGAGTAAGGAGAATCCACAAATTATTGAATTGGT
TTCAGCATACTGGTCGGCTGGGATATCCTCCTCTACAAACTGTTCCCTCC
TCGGCTATATCATTTAGGGCTTAGTCGATAAAAGAGCCTGTGCTACCCCT
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CATGTCCTAGGGATTCGTCCAGAAATGCTACAGCGCATTTAGACACAGGT
TATAGGACATGGTAGCAGACAAAAGAAATCATCTTGAAAAATAAAAGATA
TATTACAGAAAAAATCATGTATCCATGTTGAAAGTCTTTGTATTCTTACA
GAAGTTAACTCAATTTGTTCGTTATCAAAAAGTACACGATTTTACCTCGC
AAACTGTGCAGTGTAATTTTTTGTATTTGTGAAATAACGTCACAACAACT
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CGGGTATCTTGAATTCTTGAATTCCAAGACAGACAGAAATAAAAAAATAA
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TTTCATGTATCGAAGCAAAAAATAATTAAGTACATACCAACTCAATAAAT
TTAAGCACTTGACTTTAAGCATTTTTGTATACAACCTTGACTTTTATAAC
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AGGACAGGTAGGTCTACTTTATATCAAGAGGGAGCTCTTAATAGCACGTC
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TTGCAAGGAAATAATACAAATCCTACTGAAAATTAAGATAATTCCTCGGA
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CCAATTGCACTATGATCAAATCCGTTAGTGGACTAATTGCCGAAGGCCAT
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TGTTCCATTGTAGAAAAACACTCTTTTTAATGTTTTTTAGATTAACACTA
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CTTAAAGCATAAAAAATCAATTTTGCCAATCACAGATATAAGTTTTCCTT
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TGCTTATAACTTCTCCGTAATCAATTAATTCTCATCCGACGTGATGGATT
ATTAATATTGGAAAATACTCATTTATTGACAGGCAAACATAATATTAGGC
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