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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s874 | supercontig | LSalAtl2s874:125171..154112 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012135 >EMLSAP00000012135 ID=EMLSAP00000012135|Name=EMLSAP00000012135|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=466bp
MSQKSRIDKSMGSCRTILLLIITKMFLMSNFSNLAVKAQSSPTTTTGVAS PQNSPDESFSPIVEATCRAGIMTVKVQTLHNFEGVVHSRDYRKPKCSGYG EKTKVTLLRINMLAEENDDDYCGIFSGGSEDKSIAIAVRAHKTLELVGDK NQTSLVTLNLLSNNRKVEHAVYGREYVLKAFSSKPDGKFGMLVKRCFSFS DTDNQVLMVDDKGCSNNEIMSEFEYNDNEGEATAYIYSMFKFPESNRVHF QCDILVCPDICPKESCDKVNSTSFSKSQSNSFLQASDDGALMASYSIFVV EPGTPIESVCDSCDDPSYKWFHHLCIVFGVLFLIMLIINIFLCSAMTCSC TKADEEEKEASMIEEFDPYTRSWHGSQYGSRXSLNRVSGSTLKPIPPPLI SVDTVNSLSSNASDYGMPAVYGIPVHSRPSSRVSNRSGPKHRPGMHASSS SGSTHYSKYSNGRLIK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s874:125171..154112+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012135-707982 ID=EMLSAT00000012135-707982|Name=EMLSAT00000012135|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=28942bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s874:125171..154112+ (Lepeophtheirus salmonis) TTAGTTCATAATATGTAGATAGAGTAGTACTATGGGATGTATTTTATTCC
AAAGAATGCAAAACAGGTACTAGGCACGGATTGAGGCGAGCCTTAGCCGG
GTAAGAGGGTGCGCTTACATTTTATGTAGAATACCGATAATGGTTCTTCA
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ACATCGATCCCTCAGTCATTGAGTGTGTCTCAGTGAGAGTTGAGTGTGAT
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CCTTATACATACTATAATAATAAGGGAGGAGGGATTTGTAGGTCTAAGGG
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ATAAATAGGTCATTCAGGTTAATATCATCAAAAGGATCCCTTTTTTGTTT
ATCTAAATTAAAAGTAAAAGTACTTGTAAATTTGGTATACATCATTCAAA
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AATATAATAACTCGTAGATTTATTATAGGTATTACAATTAAGAAAAATCT
CATATTTATTCAAAAATCCTGAGATATCATCAAAAGAAAAGCATCTAGTA
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TCAACAGAGTATGCATGTCTTTAACCATTATAACATAATACCATGATAAT
ATAATATTAATATTAGATTATTTTTCCCTMCTCCATTTAATTGTATTATA
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GTCGTGCAGGAATCATGACTGTTAAAGTTCAAACTTTACATAACTTTGAG
GGTGTTGTGCATTCAAGAGATTATCGAAAGCCTAAATGCTCAGGATACGG
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ATGACGATGACTACTGTGGAATCTTTTCGGTAATGTACTAATAACATATT
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CAGGAGKTACATTAAATGCAAGTTTTGATGACACAAATTTGTTTAAGAAA
GTAACAGTTTCATTTGGGGGAGTGTTGTTTTTTTCTATTTGGAAGAAGAA
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CGTATGTAATTGTAAGGTCAGTGAGATATTATTATGTAGTTATATTTCTA
AGTACATTGATATAGGTTATCATATATTATGTACGTGAAAACGAACAGGA
TTTTTTCAAGGGCAGACCATATTTTTTTGTGTTTCTTTTAAACATACCTT
TGTTATCTGTACTTACATATATGAAGAAACATTTCTTTTCCTTGTTCCAC
AATTATCATAAACAATTTGCCTAGTATTTATACTAAATATTAATATATTA
AATTTTTATAGGGTGGTTCGGAGGACAAGAGTATTGCCATTGCTGTGAGA
GCCCATAAAACACTAGAACTTGTAGGAGACAAGTTCTACATGATTACGTG
TGGAAAGGCCGGATATCAAAATACCAAGTAAGTTTCAAGTTATTTATTTT
TTATTCACTGTTACTTTTATACGTACAAAGCAAATACGTAAATAAATATG
CATAAATAAACTTTATAGTTGAAAGTTATTGCTTTATTTAAGAGCTTTTA
AAAATTTCGATCAAAGAGGCCAGTTGAAAAATAAAAACACGAAATAGCAA
GCAGTGTATTCTAGTGGGGGAAGTTAAGTGTCATTCATTTAAAATTTAGA
GAATGAAGCTTATGAATAATAATAATAATTAAAACAAACAAAAAAACAAG
TCCATAATTGTTAATATATAAAAATAATTGAAACCAAAATAAATACCAGG
CATCAAGAGTCCGGGTTAGAAATTCAAAAACTTCTGAGAATTCACTTTAG
TAGCTTCTTATGTTGGAGTGATACCCATGGATAGAATTTCACTTCTTTTG
CCGCCGGGATCCAGGAAGTGCCATCAGCATTGGGGATTTTCAAGGAAAGG
GTGATATATCTAGCAGTGGATGCCATAAAAATTGCTCAAAGTTCGTAAGG
GTATATTGGCTCATAGGATGTAAGCTTTCCAGCAATTAATGCCTAGGAGT
TTAATAAAGCTAAATCCATTGCTTTAGACTTCTGTGGAGACTGTTGTTTC
TTCCTTTGAAATATTCCAAAGAGTATAAAAGCTTTGATTAAATTCAAAGG
CCCATTTTCCAGACCATTAATGTTGATGGCGACGTATCTCTGCTGAACTT
TTACAGCCCTGCAATCCAGAAAGGTATGTAGTAAGTATATTGTTAAAAAA
ATTCCCACAATCTTCGTATGGTTTATAAAATTTGATACAATTGACAGAGA
TCTGAAATGGTGCGCCGCTATATTGCCTAAAATCCCAAATATATATATCA
GGGAAGATAAAATTCCTTCTCTTCAATTTTCTCGAAGTCCTAACAAATTT
AAATAGATTTGAGCTTCGTCTGTTAGTTTAATAAAAGTAATTTTATGATG
CCAGGGTCTAGGAATTATAACATATTTTGTCATTTTTTTTAAAGGGAAGT
AAAAACGACCATCACAAAAGGGGTTTACGCCTTTAGGCCATTAAAGGTTG
GAATACTTTTTTCCCAGGGTTTCTTCCTCTAATTTCTTTTGAGTTTTAAA
ATTCCGAAAGAAGACATGCTTCTTAACTTTGCATCGGATTATATCCAGAA
TAGAATCCCCATCGAATAAAGAAATAGCAGACCAAATAATGAGTTGAGCT
GCAGTCTATACCGGGGAGTGAGCAACAATTTCCTCGTTGGTGAGGTAGAT
ACCAATCATGAGCCTATGGTAGAACTCGCTGAATGAAACCTGTCTCCTCC
ATTCAACGTCACGTTTCCTGGACGTTTCGATAAAAATCTTGATAAATATT
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GGGCCTTTTTATGGGGGTCAAATATCATTGGTGGAATAGCTTTTTCAGCA
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GATTTGTATATAACTAGGGGAACTACTTGGGTGTTATATATATTAATTCT
TCCCTAAAGATTCAAGTTATCTTATCATTGTATTTGAATGCATGCAATCT
TGCAAGGCGAATGAATGGTGAGAAAAATGATTGGCGCTCACCATGGAGCA
ATTGCTTGACTCAGTGCATCAAGTATTAGGGTTAAGGATTTGTCGTCTAA
CGGTAATTGTTAAATACCAGTTTGTTTCTTTGTTTGACTTATATTTGAGA
GAAGGAAGGTACTACCTACCTACCTACCTAATATCTGATATCATAATATA
TTATGGGGTAATAACTAGTAGGAGACCTGTTTTTTGGTTTGTTTTGTTTC
TTAAAAAGCATCCGTGTTGATGTGTTATATAATAGAAATAATATCCTATA
GTGCTTAAATGTTTCCTTCTTGTAACATATAAATATCCTATAATTACTTG
AATGAAATATATGTATACTCCCAAGAAATATGGGAAGATTGATAGCAAAT
ATGAGATCGAATATATATGTACTTCCCATTTACTCTCAGAGATACATAAA
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GAATAGAACAACRATCATTTGTTCTTCTTGTTGAACTCCTAATCCGTATC
TTTGTAATTAAACCAATTATAATATGTGAAATAAGATAAATATCTTTATG
TAACAATTGTATTTATAAATTAGACACAATATTGTACAATAATTCTACAT
TTGTAGGTGCGTATTTTTATTTTATATACAAAATAGATAATACATACTTC
CTTCCTCAATTAAAATTTAACTCTGAGTCCTTTAAAACAGCATTATCCGA
GTATGTAACATAAAAATATTTAGATTGTATTATTTTGTTAGTTGTCGAAT
TTTACAATTCATGCATCTTAATTTTAGTAGAGTTGTTAATTCTAATCACC
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AAGAACGTTTAAGAGAAGAGCCCCTCAGCTGTCATAACGTTCATTTAGAT
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GATTTACACTGATATCTCCCAATCAAAGTGAGCCAAACATGGAATAGATC
AATTCAAATTTGGTTATTTTAAGAGATGTGAGCAATACCTTAGTATAAGA
CTACATAAAATGAATATTAGTCACATACTTGGGAATTACACTTATATTGT
AATTGATTAACAGCTCTAACTTAATTATTGGCCTCTTTTATTTACTTTTT
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CCCAACATTTTATAGTAATAATCGTGATTTCTTCCAAAAGAAGCAGAGCT
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TCAGACCACTGCTAATGAGCAAACTGAGTAGTGAAAAAATTGATAGTTGA
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TATGTATATATACATATTCATACAGTAGAACCTGACGTCAACGCATATTA
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AGTAAATAATGAGGATCTTCGTTTAAAGTGGATTCATCTAGCTACGATAG
ATTTTGTTATAATGGATATATACATAGCTAGTTCAGTTATTATAACCACA
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GCCATGACGCACGCCAAATATATCATAGAAATTATTCTTTGATATAATAG
TTATTAAGAATTTCACCTCCATTTGCTGAATTGTGGCAGCATCAAATAAA
GATTGATTGCTTCCTGAATTTATTATTAAGATTCAAAGGCAATGGTATTT
CCGAATGTCTTCATATAAAATGCTTACAAATTAAACTATTATATATAACA
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GATGATTATACCAAATGTATGTCTGGGTACCGCAATGCATGTATATCACT
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GTTCTGAATGCTGATTGGTTGAATACGAGTTAGCTCTTATTGGGCTGTGA
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TTGAGAATATCATTTTCTTTTCATAATACGAATAATATGTGTACAAACAA
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ATTACTTCACTAACATAAACAATCAGTGTATTTTGCTGCCAGCTGTCGAT
TTCTATATTTCTGTTTCTCTTGTCAGTGCTCAGAACGTTGATTGGTTGAA
TTCAAATTAGCAAATGTTAAGAAGTATACAACGAAGATCGATATATTAAT
GTCTCTTATGCATATATAAACATAGATTAATACCTAAATTATTTTAAGGG
ACTTTTCTCTCTTAAAATTTATTTAATTTTTNNTAAAATTTATTAATTTT
TAGTTTTAATTTGTTACAAGTTGCCAGATTGTTGTATTGCCCAAGGATGT
AATACAGGTCATATATTTTATCAAAAAAATTGAGAATATATTATATTCAC
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TGCTGAAATCCTTCAAATATCTTATAGAGGTGGATGGTCGGCATTTCTGC
ATAATCAGAAATGTTGTATATAGTAGTTTTATTTGTCAGCAATTTCTATA
AAGACATTTGGAAAAACCATATTCTCAGAAAATTGATTATAAATTTTGAA
AGAAATCAATCTTTGTTATCTGCTGTTACTACTCAGCAATTGGAAGACTG
AATAAATAACATATGAAAGAAAAATGCAGATATGGGCATTTGTATGGATT
CCCTTACCCAAAACAAACATAATTTATTGGAATTCATGGGAAATTTTGCT
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TACTACTGATCAAAGATACATAATATCAAATTTGAAGAACGTTAGGATGG
AGAACAGCTTGTTACTCTTCCCCTTTCATGAGCACAGGCACTAGTTATTA
CTTTATATTTGTATGTTCCCTTCTCAAGAAATAAATAATAATGATTAAGA
AATAATAAAAAATCATGTTGAAGGTGCAACTACAAAAAGTCGCTCCCGTT
TTCTAGAACATATTTAATACATATTTATGTATACTTCAAGTTTAAAATTA
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TTTTGTGTAATGAGTGCATATATATAATTCTTACAATCTGTAGACTTAAA
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ATCCTTGAATTCCCTTCCCTTCCCTCTTCTMCCCTCCCCACCGTATGTAC
ATAGTATAAAAAAAGATACATACCTATCCTTCATTTTATCTTTCTTTATG
ACAGTTTGGAATCAAGGACAATTGACATCCTCTGACATCGCTTCATTACA
TACATCTCCTTTAAATAAGATGGATTAAAAGCTATTTAAAAAATAGAGGA
GACTTGAGATCCCTCCCCAATTTCAAAAATTACCACTGAATTTGCATAAT
CGTCTTTCTAGGATACTTATCTCGTGGACAACTACACCTCTTCCGAAATT
ACGATGATCTAGTGTAACAGAATGCTAAAATTTCATTTTTAGCTTTCAAC
GTTCAAAAAATAAATTTTAAAAAATCCGTTCATTGCACACACGTTCGATG
TAACGCCGTTCAATTTTATGTTCTGTTCACAATCCTGCTCATATCCAATG
GTAACTTATTACTCAAGCAAATTCAAAGTAAATAATTGAAAAAAGCATAT
TCAAGTTGACCCCATTTGGGAAAAAGTTTACCTGGATTGGAAAAATAAAG
AAAATAAAAATCTCCAGGGATTAATCGCGAAAGTCAGGCATTAAAACAAA
ATATTTGTGGAATGATCTATATGCGAGGACGAACTTCTTGGAGTTAATGA
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TGTTATCACCAAATTTAATGGTGTTGTAGGGGAATTTGAAGTTCAAGATG
GAGTTATGTGTATCGTGAGAGACTGATAAAATCTCAAAGCTGTACATACA
CCTATTGAAGGGGTGATTAAAATCAGATCAGAAACAGATTTACCTTTTTT
GAAGGAGATAATAGCAGAACATGGAGAAATTGTTAGTGAAATAGAAGATT
TTCCTCTCTCACTAGAACCTGAGAATGAAGAGGAAGCTAAATATTAGGAA
AAATTAAGTAAAATGGTGTCAGGTAAACTAAAATTAAAAATAAAACCAAA
GAAAATGCTTCCAGCAAAAACTCCGCTTATGGGCATGAAAGTAGAGCTAA
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ACAAAATCAAAGTGCCCAGCCATTAACAAAACAAAAGATRCAGAATAGGA
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TGGGAAGATTATAGAAGAAAATGAGGTGTAAATAATCACAGGAGATGAGG
AAACCATTAATGGAGCAGATTACTATGTAACAAAATTAAGGTCTTGGAAT
GCCTCCAGGCCAAACACCCCAATTATTATTGTTATTTAAGCCGTAGAACA
CAAAAATGACTATTAAAACTTTCAAGCTATAAAGGGTTGCCCTTTTATGC
CTTTAAAATAAATCAAGTTTTCAGGGTATAGGTACGATTCAGTACCATAT
TCCGACATGAAAGAACTATATAGATGAAAATCAAAGTAAATAACAAATTG
TATCAGCATTTGAAATATTACTTTATCCTGATTACAATTAATAAAAAATG
TATATAACCACTAAATTGAGCAATTTTTTCTTCAAGTGCTTTATATCCTT
GGTGAAGTTATAGAATAGACTTTACATTTCAATTTCAAAAATAAATGTAT
TTAAAAAAGGTTTGATTTTGATTGATTTTTGGTCAATTCAGTTTTTAATA
TTTATTAAAAAAATTCTATAAAATAAGCTGGTTAGGTTGCATGAATATAT
ATTACATTAATATTCCCGAGAAAAAAATTAAATCAATCAATTTTTTTGAA
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GCTGTGGTCTAACTTTTAACCCTTCCAAGACAGTGGCCACAGTCTTGACA
AGTAAAATGAAACATTTACTTTCMCCTCGACCAAGCCATTTTTGCCAAGC
AAAATTGTTCAAAGACAAGAAGCTTCTCCGTACAATAGAAGGACTTATTG
GACAAACCATGGGCCTTGCTCCACAACAATCACTCTGGGCTTACCTTAGT
GTGGCCAAACCTTCCTTGACCTATGGAGCTCTGATTTGGGCATACAATAT
TACGTCAGGGTAGCAAACTCTTCTAGACAAAAATATAGAGACTAGGATTG
CTTGGTCTCAGTCATCCTTTGCGTTCGACGCCGATAGGGGTTGGAGGTAT
TCTTTGGAATTATCCCTCCTTTTCTTAAAGGCTTGCAACGATGTCTCGTC
TGCGCATCGTTAATACCTACGATATGAGCTTTAATAAGTGGCATCATATA
AAAACAAAGAGTGTTCCATCTAGTTTTGCAAACAACAGAATTAGTTTCAA
TCTATTTCCTAACTTCCAAAAAACAAAATAAATCGAACGAAAATATGGAA
ATGTGACTTATTTGGCAAGAAGACTGAAAACCAGACTCATATATTCTCAG
ATAGATCCAAGAGCGACCTGAGGCGGGRGTTTGGGTTTTGTAATCACTAA
AGGTGATCAAGTAGTGAGGGAAGCCTCTATATCCTTAACTCCTCAAAAAA
CTGTTTTCCAAGCCAAGGTGCTTGCTATAAAAGAGGTTTTTTCTTGAATT
AAAAACAATCGTAAGAAATGGGGTCCTAGGGGATTTTGTATCTTGTCAGA
CTCTCAAGTAGCAATTGGAGCATTGCGGTCGATAGAGACAAAGAGTTATC
TTGCCCGAGATACGAAAACTCTTTTGAGGTTGTTAGCTAGTGAGGTCCTT
CTCTCCCTCTCCTGGGTAAGAGGTTACAGTAATGTCACTGGAAATGAGGT
GGCTGATATGCTAGCTAAAACTGGAGCTGTGGATCAACCTCCGACCCAAA
TTTTTGGTATCCCTCGGCCATATTCCGAGGCGTCTGTTTCAGCAGTCATC
AATTCTTCCTGAACAGCCAGAACTGAGCTGTCAATTTCTTCTTTTAGCTT
AACGAGTGCACCATTCGGTTTGTTTTCCATCGTAAAATGCGTAACATTTA
TTAAAGGTCTAACCTTTTCAGAAAAAATTATGACCCATTTTGAGTAATGA
GCAAACATTTCAGTTACTCGTCGTAATGTAGGAGTATTTTTCGGAAATGG
AGTATTCAAAAGTTGACATATTCTATCTAGATCCGGCTGAATGGACCCAA
TTTCAATTATGCAACCTAGTGGGGTTATTTTAGTAAGAGAATATCTACTT
TTATTCTCGTTAATCAGTAGTCCATACTTCTGGATAGCTTTTTTGAATTT
TACCAAGTTAACATCATGTTCTTTTTGGTGTTCATCTATCATCTATGTAG
GCATAATTACTTTTCAATTTTTCATTTGAGATTATAAAATCAATTACTCG
TTGGAAACTCAATCGGGATTCTTGTGAATTGATAAAGCTTACCACACGCC
TCAAATACTGAGAATGTCTCCACTTTTCCTTCTTTTTTGCATGTAACATA
TAGTGTTATTAAGCTGAGTAAAAAACAAGGACGATTTTTTGAAGCCAAAC
GTTAGTTTACCAAAACAATGAAAAAAAATAGATATTTATACATCAATCAC
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CCATAAAAATTATAATCAAATGTGAAATACAGTGAGTATCAAACTTAAGA
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