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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s88 | supercontig | LSalAtl2s88:100472..114520 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012221 >EMLSAP00000012221 ID=EMLSAP00000012221|Name=EMLSAP00000012221|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=469bp
ITSKEPFFKNESTTEETTDVLPLFPSSLSKPIIAATSQSVLLRTGFFVLA XGFVYLTQQSFTQESDLGLRSRKLLQFEGDEELDTFENDTDTLPKDVVPP IPAETDDDGLLPDDLFTAEQLKNGAVVLHMIGVIYMFYALALVCDEYFVP SLDIISEKLGISPDVAGATFMAXGGSAPELFTSIIGVLIAKNDVGIGTII GSAVFNILFVIAACAFAAKEALSLSAWPLIRDVFFYSLSLTLLVVFFLDN SIAWWESLILFVVYILYVSFMAINEKVEDGLRSLFRLSKVDRDANEKGIV LRKAQNRKGLYHLMNETINRDILGIMIMSNQAGSETGISLSGTGSTGNMD GXGGGGIAQLKNELQNSKGNISTPPYPELADLEKSGNNRNKLVPRVYFFD GHNKPNDVPSESQGLTREASTANEEEEEEKPIDMSFPIDQGWKKILVYIV SFPIMGPLYLTLPDTKDPK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s88:100472..114520- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012221-708068 ID=EMLSAT00000012221-708068|Name=EMLSAT00000012221|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14049bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s88:100472..114520- (Lepeophtheirus salmonis) ATAACATCAAAGGAACCATTCTTCAAAAACGAATCCACAACAGAGGAAAC
CACGGACGTCTTGCCCCTATTCCCTTCCTCTTTGTCCAAACCCATCATCG
CAGCGACGGTGTCGTCACCTAACCACCCTTCTCAAGCCCCATTTCCTCCT
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ATTTGGTTGAAATTGAAAGAAAAATGATGAGATGTCAATGGAAAAAACTA
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TTAAATTTTGAGATTGATACACTGATCTTCAAACAAACTTAAAGTATAAT
GTACACTGTATAATGATTGGGAGCCACCATGTACATACGTCACCGTAAGG
AAGTGTCTCCTACACAAAGACTCAAATTGACGTCTCTAGTAATCATGTAT
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GGAACAATTTGTAATGTGCATATTTATTATATAGTAGGACCTATGGATTA
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TCATGTGGGATTTTCTATTAATTGTGCATATACTTGTAATCTCTCACTTT
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ATGGCCTATTACCTGATGATTTGTTCACTGCAGAACAGCTCAAGAATGGA
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TCTTGTTTGCGATGAATACTTTGTACCTTCCCTTGACATAATAAGTGAAA
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TCTGCCGTTTTTAATATTCTTTTTGTTATAGCAGCATGCGCCTTTGCTGC
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CCGTGACGTATTCTTTTACTCCCTTTCTCTTACTCTCTTGGTCGTATTTT
TCCTAGATAATAGCATTGCCTGGTGGGAGTCACTGATTTTGTTCGTGGTG
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TTTTACATTCCAACGTTGCATATTTTATACAATTCTTAACGTATACTGTC
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AATATATTTAATGTATATTTTACATCTCTTTTTTACACGGTATAGGTATA
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AATGCGTTTCTGATAGACATCAGAGAGTGTACCATGCATAAACGCTTTAT
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TTTTTTGTTCATTATTTAGTACGTCGTCCTTGGGTTTGCATCTCCCTCGT
AAAGGAGAAGTATCGCCTGTCATTAGTGCAACTTGTCTTAAAAATCCATA
ATAAAGTAAATATATATGTACAATAGTTTTCCTCCACAAATGTTATTTTA
AATGTAGAAGGTTAACATTTTTATAGCAGTAATTCATTTTCTCACTCCCA
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GCATATATGTCCGTCCCACCTCCTTCTCTCACTCTTTTTACATTACAAAT
ACATCAGCTCTATACATGATATACATCAGGGAGCACAATATACAGTGCAA
CCTGTATTCACTCTCGATGCAGCATGCCAAACAATTCCAAAATTTCATCA
ATATGACTTCGTTGTTATTTGTAGCTCAAATATGCCTATTTTTCAAACAT
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TTATTCGAATAAATTAGGTGGATAATAAATATAGAACGTAGATATAAATT
ACATATGTAGTATTTTATGTAAAAAAGGTTCTATAAATGAAAGATGATCA
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TCAAATGGGCTGAGATTTGTCTTTACAAATCATTTATTTCTAAAAGCCTT
TCTATATCTTCATATCTATCTACGTAGATATATATATTCATATGAGTACA
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GAAAAAAAGGAGAACATGCCTTTTACATAATCTGAATCCAACTTCAACCG
GATCTTTCGCCAAGCACATTTTGATACTTAAGAGCCACCAAAATTGAAAG
GGGATTATAATAGCGTAATCCTTGGAAATACTTATAAATATAAGCCCACG
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AGTTGTAAAAATATGTCCTTACCTTTKTGTCAAATTATTTGTAGTTAGCA
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AAGTGCCCGTTTTTATGAAAGATGGAGAGTGAGACGAAGGAATTGTTGGG
AAGCTATAAGTGGAAGTCCTTATCCAAGGGTGTCCTCAGGACATATTTTA
GGGGAGTGCCTTGGTTTTTGGATATTCAAAAATACAACATTGGAGAAAAG
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TCATAAAAAAAAATTCAAAAATCCGTAGCTATTCACAAAAAGTTGAATTT
TTATAAATAAAAAATTTAAATAATCCAAAGCTATTCACAAAAAAAGGAAT
TTTTTTGAAAAAAAAATTCAAAAATTAAATTTAAAGTATTAAATATTTTG
GAAAAAAAATTCAAAAATCCAAAGTAATTTACAAAAAATTAGTTTTTGGA
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GTTTGTATTTGGTAGGATAATGAAACTTTATTAGAGTATGAGGGATTATT
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TTTTATATTCAATAAACGGATGCTTATATAAAAAAGATTTTCTCCCATAA
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TTAGACTGATGATAAATGATTATATTCTAGGATAGAGATGCAAATGAAAA
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ATTTTTTTTAAATTTATTTTTTTGTTGCTCATATATTTTTTTTCTCTGAT
CTTTTATATCATTTATTTTTGGTGTTTCTTTTTAATTTTTTTTTATTTTA
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ATTTTTTTTATCTATCTTCATGCCATAATTTTTAGGACTCACTTTATTTT
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GGGGGGGGATAGGTTAGCCCCAAAAATTATCAACACACCTATTTAAATAT
AAAATATCATAGGAGCATAAATGAGTACCTATATTAGTGTCAAGCAGCTA
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ACAATGAGGACTAATGACTATAACTTCCTAACAAATCTTATGTGTTACAT
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GTAGCTTGTGGGCATTATGTATTATCGATACATATCTCCGTTATTTGCAT
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GCAGTCTTTTTAGATCATATTTTTTACAACTCTAGAAATGTTCAATCTGA
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ATTACTTTAATTATCACCATCAAAACTTTTATATCTTAAACGGAGGGTAG
ACCTTAAAATATTGAGAGACCTTCAAATTATACCTTAAGAAATGTTTTTA
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GAACTTCAGAATTCAAAAGGAAATATATCCACTCCACCTTATCCCGAACT
GGCTGATTTGGAAAAGAGCGGCAACAACCGGAATAAGGTATATTCTTAGT
TCTAAAATAAATAAAAAAGCAATTGTTTTTCTTTAAATACCTGTAACTCC
TCCCCACATGATCTCACCATCAACTACTTGACAAAAATCCAGTCCTAATT
TGTTCTCACTTTTACAGCTGGTTCCAAGGGTTTATTTCTTTGATGGGCAT
AATAAACCTAATGATGTGCCCTCTGAGTCTCAAGTAAATCATATTTTGTT
TTCCTATTCAGCTCAAAAGGAGGGTCATTCCTGTTTTCAATGACTTTATT
CCTGTTGCTTATTGGGGATCACTTAACACACTCATTTATTCATCACAGTT
TTGCACTGGGGAATTTATAAAAATAAAATGTTCATTGTTTTGTTTCCGTT
TTTTTTTTTTACAATGATTTTAGGGCATTCATTTTTTTATGAGATTTTTT
AAGTGTGAAATCTTTATATGAACTTTTTTCGATTTTTTTATTATGGTCAA
GGGTCGTGTTATATCGTCGTAATAGTAATTATTAGTGTATATGTGTGCAT
GAAAATTACTCTTGTCTTTGCTTATTCTTAGGGTCTTACCAGAGAAGCCT
CAACCGCCAACGAAGAAGAGGAGGAAGAGAAGCCCATTGACATGAGTTTC
CCTATAGATCAGGGTTGGAAGAAGATTCTTGTCTACATAGTATCCTTCCC
CATCATGGGTCCTCTCTATCTTACTCTTCCAGATACAAAGGACCCAAAG back to top
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