EMLSAT00000012234, EMLSAT00000012234-708081 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012234
Unique NameEMLSAT00000012234-708081
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s88supercontigLSalAtl2s88:714578..730796 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012234 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012234EMLSAG00000012234-695000Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000054869EMLSAE00000054869-763797Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054870EMLSAE00000054870-763798Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054871EMLSAE00000054871-763799Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054872EMLSAE00000054872-763800Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054873EMLSAE00000054873-763801Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054874EMLSAE00000054874-763802Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054875EMLSAE00000054875-763803Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054876EMLSAE00000054876-763804Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054877EMLSAE00000054877-763805Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054878EMLSAE00000054878-763806Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054879EMLSAE00000054879-763807Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054880EMLSAE00000054880-763808Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054881EMLSAE00000054881-763809Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054882EMLSAE00000054882-763810Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054883EMLSAE00000054883-763811Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054884EMLSAE00000054884-763812Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779441auto779441Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012234EMLSAP00000012234Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012234

>EMLSAP00000012234 ID=EMLSAP00000012234|Name=EMLSAP00000012234|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=2535bp
MLQTDKDLTNYPNISMCTLLSILYLGKRQCLKKENKSGNSCHCVSNHSWS
RSTLDELDFERGAWNDALSGDLNKLRERILRNPDLTNALDSSGLTALHYA
SRSGHFNIVSFLVNEGGAKVNIASRSGGATPLHRAAYMGHIQIVSFLIDH
GGDPFIQDFDGNNSLHKSSEKKSSANKEVYNFLSLKFPSLASISNNRGLK
PVLLIKINNHLDNGECKSNLSLELFPSDDVLFGKKVDEEDDKVSSRFLSH
FKRTKSSSESEILPNSLPPTKRSKQIEESMRDERVKPYYLANWETIVRGV
LEECPDDANLFTVDEISLATKCFKSLSYDAQKLYVRLFQRKWTWISIKKI
SYAEIVNVENTLKELEEHFFINDHSSLKDISLIINLLPSPEVKKLCKSFN
INKSTKKDIILAFDKLIKQKSFFNKCGVNEVLQNKIIKKALDSLDPCFIL
SEEPRRLFNRILSLHSLTRFYEDRDNNNAGNSNLTVMLLANRGDLLFPIY
EISRKQSVFRSREGLLAYETALNFEAKISELSEIKDYREICDNIYPELRD
HFKTEILGKFSKEDAKLPDFLRKFTAGGIIVYCFSKCAEAFEKVRNYEAA
VSIYKYCLSKEQVYNKELSSGHWFERLTLDLEQWLKRREEAFFYAKEALE
NQHISPARKLTLCQRIVKMRKHLKEDLKNYHLQGWIDPTKCDELLRNVEI
QGSMLDKDLSGNNKSVFIFDTGEQDREKLYCSVEEFTIKYYQNEYPMGEG
SVINSIVFVLFWDVVYDCLVSDAFRGPYQSSPLDIGSLTFYESRKKIIES
RLESILKESYEKLHALLEKNWKLGQGTSSLVNWDLFSDFSSFKELIDCFT
KEQLCEISRRLLTRHRFFRSGFPDLTLWNPEKKSVRFVEVKGPGDRLSTK
QIIWLNFLNSIGLDAIVCYVXAIGSKILILFLSHINSTYENELFRRFNEK
DITKVQEQYSRYPYPFVDPKLEKTKKSIPINDGPFMLEINHFLYNGNGDL
GRNKIFRILIAGGGTGYSLLHYAYVFTAYKTEIVYLDFSKKSLEIARERA
KNFGYQNILFYHDSIYNIPNLKLGLFDFIDCYGVLHHLAEPDEGLRILKN
SLAPDGGIFLMLYAYYGRQGLYLMQELLKILNENRNLSYHEEVQRSRLCY
NNHLENSWIHMQGIFKEAESDVGFYDMYLHKQDLPFTLSELYEYIEQSEK
NELKVVDFYYPVQRNWMNQRPAYLNKLSKRKLQIVNEIIYGYENKHIFFV
SKKNDSVASLNNMDNIPIFQVEKISPIISVLTSHENINKLHIRITKHNQM
KDVFSLPVSKYTYLFFKLLSQRKFTIQEIIEDTVKLYQKKGKDAMKLQTK
IFNDFKKTLKVLILNGLILLRHKHYSNSEFVHHDFSIFDCSSLGSNVDFK
YSIQRTKVQIPSSSKNNFPKIIELICCQLAIYPQICREGYIEILEKFATQ
YKEELLNTFNNLDEKDVSPLHYAVRYTNIDIAQFLLDMGANPNVQGPDKM
TPLQYAARYGGKKRSRHWKKGSYRSFDEEEDEAEMFECEKVINVGETVAL
LINYYADVNAQDRYNLTALHHAAIRGNNDAASVLLSTSGIEKEPRDLQGS
TPLHLASTYNRLDTVKLLLANKANPKCIDIDERTPLHEACQEGNVEVVNA
IISESEANFSTDFVKELIQKKDGEGNTSLSIAVSSGSIKIVELLLEYGAN
VNSKNKHSVSVLHCAARTGQIESVELLVEHSAEVNVVNSLIQTPVYIAAS
NNNVKVIEYLVNNGCNPNIQDSNGFTPLHIACKEGNVEAXEVLIAFKTNV
DLLDYDDRSCLYIAALYNKPEVLKALLENDKCNGLISVNDLFDNLPLHVA
SKEGNVEIVHLLINAGSDIDKKNEDEMTALHLASLNGRVKVVEEILKSDR
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ASVGAYKCVELLLESGAQIDPLDRSKTTPLHLASEFGHEKTVRLLLSNGA
SLKMEDAFGRNALEIALLKKNKSVVKALIEYPDWKNAFRTCLTPLHKLRH
KVPETPLRLLIKTYPDLVETVLDSCITTVENPEKCGEKKVIMNYEFLDDA
YLWQPVEKEVKNVHGITYDVVFEYCQVDENAQCEPFLSTYHKNRRIVNQN
HPFMIMAEEKNRDLLRHPLCLALVRHKWRKFGRYVFYGRVFLYSLFLVFL
TSYLLLEVKHSQCFGSDIDPKTDPNELLPPQNMFKTFCHVGVLIGVILNI
LAEITEIIRTGIRYFSFDNLMDWVVCILSLYIISVDTIFVPEKDCSRWDV
AAILITLAWLNLXAXIXQLPYLGIYVIMFFDILLTFIKFALIFMVFVIAF
GLGFHFLHTSHDPFQTPGDSFLKTTVMMIGEYEYVDIFFPGNENDPKPGG
MSKVFFGIFVVVMSLIVMNLLVGLAVEDIKAVQDQAVLKRLVMQAELVLN
VERHLPNFLRRLFIKYNFNYYYLLPDISDILTQQRQTQEKISKIEKDIKT
LSSASEDIKNILIAIVEHNEIILPDEEYGFNTSVS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s88:714578..730796-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012234-708081 ID=EMLSAT00000012234-708081|Name=EMLSAT00000012234|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16219bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s88:714578..730796- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCTACAGACTGACAAAGATCTCACGAATTATCCGAACATTTCAAGTAA TGACTCTCTATATTCTTATATATTTTATACGATAATTATAATTGATTACC TAAGTATCAATATTTTTTTAGATTTAAGGATTTATAAGTCGTAAGAAGTA GGGAATATTAAACTTAAGCTATTCCTCCGTTTCAAATGCTCCTGTAGTAG TGCCTGATAATTTATCTGACTGCACATTGTAGTGTGTACTTTATTATCAA TTCTGTATTTGGGGAAGAGGCAATGTCTAAAAAAAGAAAATAAAAGCGGG AATTCTTGTCATTGTGTTTCCAATCACAGCTGGAGCCGAAGTACTCTTGA TGAGTTGGATTTCGAGCGTGGAGCATGGAATGACGCACTTTCTGGAGATT TGAACAAACTCAGAGAGCGTATATTAAGAAATCCAGATTTAACAAACGCC CTCGATTCTTCAGGACTAACGGCCCTACATTATGCATCCCGCTCTGGACA TTTTAATATCGTGTCCTTTTTAGTTAATGAAGGTGGAGCAAAAGTGAACA TTGCCTCGAGGTCTGGAGGAGCAACTCCTCTTCATCGAGCAGCTTACATG GGACATATTCAAATAGTTTCATTTTTAATAGGTCAATTCATAATTAGCGT ACAAATCTTTCTTACATATCTACTGTCATTTAATATGTAGGAGTAAATAT TTGTTATGCCATATTGATAATTAAGTATCTGACTAGTTTAATATTTGATT TTAGATCACGGTGGTGACCCATTCATTCAAGATTTTGATGGAAACAACTC CTTGCATAAATCATCTGAAAAGAAGAGCAGTGCTAACAAAGAAGTATACA ACTTCCTTTCACTTAAATTTCCTTCCTTAGCGAGCATATCCAATAATAGA GGCTTAAAGCCAGTTTTTTAAACTATCATCAGTCATTCAATAAATATATA GACAATGAGTTCCAAACTACAAACCCATGCAAGTTGTCCCGTATGTAACA AAAAGGTTCTCCTTATAAAAATTAATAACCACTTGGATAATGGTGAATGC AAATCCAATTTGTCTTTAGAACTGTTTCCTTCTGATGATGTTTTGTTTGG CAAAAAGGTTGATGAGGAAGATGACAAAGTATCTTCAAGATTTTTATCTC ATTTTAAACGAACGAAGAGCAGTTCTGAAAGTGAGATCTTGCCAAATAGT TTACCCCCTACAAAGCGCTCAAAACAAATTGAAGAGTCTATGAGAGATGA AAGAGTGAAGCCCTACTATTTAGCAAATTGGGAAACTATCGTACGTGGGG TATTAGAAGAGTGTCCGGATGATGCCAATCTCTTTACAGTAGATGAAATT TCGCTTGCTACTAAGTGCTTTAAATCGTTATCCTATGATGCTCAAAAGCT TTATGTGAGACTATTTCAAAGAAAGTGGACTTGGATTTCGATCAAAAAAA TATCCTATGCTGAAATTGTAAATGTAGAAAATACTCTTAAGGAGCTTGAA GAGCATTTCTTTATAAATGATCATTCTAGTTTAAAGGATATCTCCTTAAT AATCAATTTGCTTCCATCTCCAGAGGTGAAAAAATTGTGTAAAAGTTTCA ATATTAACAAATCTACAAAAAAGGATATCATCCTCGCTTTTGATAAACTC ATTAAACAAAAGTCATTCTTCAACAAATGTGGTGTAAATGAAGTCCTTCA AAATAAAATAATCAAAAAAGCATTAGATAGTCTAGATCCCTGTTTTATCC TTTCAGAAGAACCAAGGCGTTTATTTAACCGCATTCTATCTCTACATTCC CTTACTCGTTTTTATGAAGATCGTGACAACAACAATGCAGGAAACTCTAA TCTTACAGTAATGCTCCTAGCGAACCGAGGAGATCTTTTATTTCCCATCT 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