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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s896 | supercontig | LSalAtl2s896:556005..569330 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012271 >EMLSAP00000012271 ID=EMLSAP00000012271|Name=EMLSAP00000012271|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=696bp
MKMRTFILMVGWLLRXGQCSEYYSDEKIRQLRSSVKEMFQTSYDHYLNHA
YPYDELMPISCSGSDTLGGYSLTLIDSLDTLAIMGNFTEFRRIYSFVSKV
KDMDINANVSVFETNIRIVGGLLSAHLYAKSAGIDVADSWPCDGPLLHLA
AKVATRLLPAFDTDTGMPYGTVNLRHGVPFEETPVSCVAGVGTFIVEFSV
LSQLTGDPIYEEKAKGALNGLWKHRSKLDLVGNHVNVQTGKWTAVDAGIG
AGVDSYFEYLVKGSVLNNDENLLFMFRTYHEAIKKKMMNSDWYFWVSMFN
GNVTLPVFQSLEAFWPGVLSMIGEDEIGLKSIHNYRTILKQYGFLPEFYD
VYAGKPVKNKEGYPLRPELIESLVYLYQTTKDPYLLEMGEMVLSTIKHSA
KTTCGYATVKDVRDHLIEDRMESFFLAETTKYLYLLFDPTNPVHGTLTKA
QIVHKGTDHECIIDVGGTIFNTEAHPMDPSIANCCQKQNASKKEHFPYHC
FKSKGPSKFFQNHNYDSERTNLLKKQLRKTFSMDDFDKCNNFQRFSSKGL
YCDSYPHHYRYLTKGEITFSAISEVSKSIRDSYAYNKLKEAVISAFEKSK
SQLFDELIASKRLVGRPSLYLKDLRDTSQRIEVSEDXIRHKLISACPSEI
VPALASRSQYSLEVLGKLTDQLYEMLKLRSGSSVLSKRENQLSIEF back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s896:556005..569330- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012271-708118 ID=EMLSAT00000012271-708118|Name=EMLSAT00000012271|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13326bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s896:556005..569330- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAAAATGAGGACTTTTATCTTGATGGTTGGATGGCTACTCCGCCWAGG
CCAATGCTCGGAGTACTACTCAGATGAAAAAATCCGTCAACTCAGGTAAA
TGATTATAATGAGAATTTTATATTTAATTGACAATTTAATTTTTTACTTA
CAGGTCTTCAGTTAAGGAAATGTTTCAAACCTCCTACGATCATTACTTGA
ACCATGCTTATCCGTATGACGAATTAATGCCGATAAGCTGTTCGGGTAGT
GATACATTAGGTGGATACTCCCTTACCTTGATCGATTCTCTTGATACATT
GGCCATCATGGGTAACTTTACTGAGTTCAGACGAATATATAGTTTCGTAT
CAAAGGTCAAGGATATGGATATAAATGCTAATGTGTCTGTATTTGAAACA
AATATCAGAATAGTTGGAGGTTTATTAAGTGCCCATTTGTATGCAAAGAG
GTATACCATATAAATACTGACTTTATGTTTGTTAAATTGATTTTGTTAAA
GTGCTGGTATTGATGTTGCAGACAGTTGGCCTTGTGATGGACCTCTTCTG
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CACGGGAATGCCTTATGGAACTGTATGCTTCTCAGATCATACATATATTA
ATTCAAATAATATACCCTTTTCCAATAATAAATAGGTTAACTTAAGACAT
GGTGTGCCATTTGAAGAAACTCCAGTGTCTTGCGTTGCTGGTGTAGGGAC
ATTCATCGTCGAATTTTCAGTTTTATCGCAATTAACAGGGGATCCAATAT
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GGCCGTAGATGCTGGTATAGGTGCTGGAGTTGATTCCTACTTTGAATATC
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AGAACATATCATGAGGCAATTAAAAAGAAAATGATGAATAGTGACTGGTA
CTTTTGGGTATCAATGTTTAATGGCAATGTGACTCTTCCTGTGTTTCAAT
CACTAGAAGCGTTCTGGCCAGGTGTTCTTTCTATGATTGGAGAAGATGAA
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ATTTTTACCTGAATTTTATGATGTTTATGCAGGTAAACCAGTTAAAAACA
AAGAAGGCTATCCATTAAGGCCTGAGCTTATTGAGTCTTTAGTATATTTA
TATCAAACTACAAAGGACCCGTACTTACTCGAAATGGGAGAGATGGTTTT
AAGTACAATCAAAGTAAGATCTTTTGTTTTTTGTGTCATAAGTCATTTTC
TGTTTTATACGTTATATATAGCATTCGGCAAAGACTACCTGCGGATATGC
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TTTTCCTAGCTGAAACGACCAAATATCTGTATCTATTATTTGATCCTACA
AATCCTGTTCATGGTACTTTGACAAAAGCTCAAATCGTCCACAAAGGTAC
AGACCATGAATGTATCATCGATGTGGGAGGAACAATTTTTAATACGGAAG
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CAATAGATTAGTAACTAAATCTGCTATTTTAATCATGTTTTTTTCTGAAT
AATCATGTTTTTGAAGTGGAAAGACTATAATGTTCGATAATCTTTAAATA
ACCTATAATAAATCGTCGTCATTTATAGCAGGGGTTTCCAAACTTTTCAG
CCTGTGACCCCCAAAATAACGGTGCCGGAGATCGTGGCTTATAATGCTGT
GCACGCCACGCACCTGCACTATGCGTGCGAGCATGGTTGTCTGTTCTCCC
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TGAGATCAGAGATCATTTAGTTCTGCACCTTGTCCCAGAGTTTATAATGG
TGGCAGACCATATTTCCTTAGGAAATTTGATGACTTTGGTATGCTTTGAT
CCCAGTTCATTACACAGAGAGGCAATCAGTCAAATATTAAGGTGACTTTT
TTTAAATATAGTTAACAATTTTAATTGCAGTGTCGTGAACCTGTTTAAGG
TATGGCRCGAGCGGTTTGCTGATAAGCGATTCCCTGTAAACCACGCAGTG
TGTGTGAAATTGATGTGCGGTGCCAGTTGTAATACTCTTGCTTTCAGTCC
TTTTTTTCCCCTATCACTCAAGCTTCGTTCGTACACACACCGATGCGATT
TTCCAAATAAATTTTTCTCTTCTCTTAGTTTGCTGTCAAGCTTTTCAAAA
AAAAAAGCCTCACCTGTGTACGTCCTTCCAGCAGGGAGCAAAACAGCATG
TCCTAATTTAGTTGTCCGCCAAAACTGTATCTGACAAAAACAAGTAGCTG
GGCAGAGTTGGATATTTCTGTCGATTCATCTAGTTSAAAAGCGTATTTTT
TCTTCCGTTTAATCTGTCCACCAGCTGGCACATTATGTCGTGGGCCAAGT
GTGTGATACGCAAGACAATAGTCCYGTTTGACATGCATGACCCGATCATA
GCTATAGCAGAAGGTTTGATTAAGATTTCGCCAAGTTTGTGTGGCTTTTT
AGCCTGCGCAATTAAATATGCCACCTCATATGATGCCCTTTGAGGTTTGG
CTGGGACTCTTGTTTGGTCGGTAAGGAATTGCTTTTGACGTCTTACTTCT
CGCTCCTTTCTGCAGAAAAAATCTGATGGCTTATCAGTCAGTGATGGATG
TTTGGTTTTCAAGTGTCGGGGCATTTTTGCCAGCTTGAGGCTCTCMTGTG
CCAGTACTTCAGTGCATTGGGGATGTTGTCATTCTTTGATCATGAAAAGT
GTAAATGCATACGGGATAAATTGTTCTCAATATTTTGGATCCTTGGTGGT
CAGACTGGTGAKGGATATTGCCACGGAGGTCTCCACTTCTGCCGAATATA
GACGTATTTTAAGACGGGGATGCTTGTCTGCTCTTTMCCTCGACTGACTT
CTCCTGCTGCGCCTGCATCTCAAGCTCTACTGATCTCTCCTTCTCTGCTA
GCTTGTCAAGCTCAGGTAGCATCTCATTTTCTGCTAGCTTGTCCATTACC
TGTGGCCTCCTCAATTTGRTTGGTATTGCCCTGATGCCAACTCCCTCAAC
TACACCTTTGGGGCGCACGTCGAGGGGAAAAACTGCAGTGTCCGTCATTC
AAATGCAGAGGCTCTCAAAGCCACTGTCAGCCAGTGCTGGGACGCCATTA
CASAGGAGTACATCCCCAATGGGCGCCAGATCTTCTGCCTGGAAGGCATC
TTTTCCGTTAAGAGCGGCTACACTAATGACTAAGATGGCTTAGACACACA
TCTATTTATACTATTTATTTTGTTCTAATTCTATTGTGAATTAATAAATT
ACATCTATTTGAAGTTTAAAATTCAAAGTGTTCAGATTTTAATGGACCCC
TCGATAAATACATGTTAATTAACATTCTCTTTAGAAATGATTAAATAACA
GCATTTTCTGATTATTGAAGAGTTATTATAGAAGGATTTGCATGAGATAA
GAGGTACTTCATTCCCTCTTAGGATTTTTTTTTGTTCCATTCGGAACAAG
CATTTGAAGAAATTCATTTATTTTTTTTCCCAAATACTGAAAAAATAGAA
CCCAAAATCTTGCCGATAAAGTTAGATAAACTCGTCTCAACGAAATATTC
CTTGGATCGATCAAAACTTTGTTCTACAAAACCTTTTTTTGGGTACATTA
GATTTTTGTATGGAAATATTTTATCCACCATTGCCTGTTTGTCTTTTACT
GTCACATAATCTGATAAATAAGGAAGGGAGGGGGGATGAATTACTGATAT
AAAGAGGAGAAGCTTCTTTATAATTCTAGTTCAATTATATTTATTTTATT
ATGCATTTTAAAAACAATATGAGGCAATAATATAGGAAATCATGCTTACT
TCAGAGGAATAAATTAGCACTACGATGACCTATTAAAAAAAATAGCACAG
GAACAATCGTTTTTTCTTTTCTAATTTTTAAAAGTAGTTTTTTCATTAAA
AACTATTCAACTCTTGTAATTGCTTTATATGCATGGATGAAAATAATATG
ATAATAGAAAATGGAACGGTTTTTTGTAGTTTCTACCTGAATAGATGTTT
ATATATTCCAAAGTTGTTATCATTATTATTTTATTCTTTTTGAATTACCA
CTACGAGAATTTAGACCGGGGATAAAACTTTGTCTAGATTGCTAAGAAAA
ATTGCACTAGTTACCACTATGAGTACACAGTGGCATGGGAGACATTGTAA
ATCATCTTTTTTGAAGCCCCAGTCTGCTCCCCGATGGCTTTATGTGACAA
TCCTGCTCAGAGGAGCGCTGCTATCTCAATCTTCTTCTCGTACTGTGTGA
TCATGGTGGCAACTAGGACAATGTTTTTCTTAGCAATCGACAGCTAATTA
TCTTTTCTACAACATTGCTTATAGGAAAGTTTAAAAAAAGAAAGTGACTC
TTAACCTCTCAAAATTTTTATAATAGAAATGAGTAAATAATAATGGTTGG
KCCAGTATAATTTTYGCAGCAAGTTATATCAAAATCGATCTATAACTTTA
ACCGTAATCCTGGTGACCAACAGACAGACAAACATTCACAAAAAAGTAAC
CTCCTTTCAACTTTGTTGGCAGAGGTAAAAATAAACAATCACTCTTCACA
TTGCAACTATAAAAAGTCACGCGCTCGTTCAATGTGATATTTTTTACAAC
AATAGATATTATGGTATGTATGAACAATTAAGCTTTTATTCCCAATAGTA
GAAAAAGAAATAAGTGTACTTATACTTGAGTTTTAATTGACAATGAATGG
GTTATTACTCACTATTATGTAGGGTTTAGAAAAATATCTATGTGGGTCAA
AGCACTATTTTCTAAAAAAATTCATAAATAAAGTAAACATTTTAAATGCT
TGAAATTTTATAGAAAAATATTTCTTAAAAATTACCTCATTATTTATTTA
TGTMTCTATGTAACTTTAGAATAATAACAATTTGCAATTGTATATCTCCA
GGAATTCTTTCTAATAATAACTAGTGGTGTATAATATGTCCTGCCAGTAT
GTAAAATTAAAATAATCCAAAAATGTACGTGGTAATCCTGTCAATTTGAA
AAATGTTTGAGAGGAGAGCAACTTAGCTGGCATGAATTTTTATTAGATCA
GCTGCAAGCCCCCATAACAGGAGGAAAAAGATCACAAATCCGTCTCCTTA
CTTTTCTCTAATTCAATTTGATTGTAAAGAAATGGGTTGGAGTTTTTTCA
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TCAGCTGTCACAATTCTAAGCAGACCTAGGATTTCCTCCGTGCTGAGACT
CCTTTTTTTTTTTTTGACAAAGGTTTTTGGCCTCTACATAGACCAACATC
CCCCCTCCAGACTTTGGTATTTTTGGGGCAACTCAAGGGGAAGTTTTTGG
AAGTCTCATAAAAACAAAGGATCAACTAAAAGCCGCCATAACCACTGCTT
GAGCCAACCTAGAACAGAGCTTTATTAAGAACTGGTGYGCAGAGTTCCAC
ACCAGGGTGGAACTGGCTATTAAGGCAAAATGCGGCTATATTGATTGGGA
ATGTACATAAGGKTTCTCTTCAAAATCTAATTTATACTACATATACCTAT
GTTCTCTATGATACCTGCATACCTACTATCAGAAGATGAATTGCTTTGAC
TTTTTTTAGCTGCTCGTCTTCCGACCAGATTAAGACATTTTATTAACTAT
AATGCGTACTCTGTAGAGCACAAAACCTTCGCCTGAAATCAAAATGAGTG
ATATATCTCAATTTCCTGCAAAGTTATGGTCGATTGTGCAATTTTTTGAC
GTTTTGTGTTACCTTTGACCTTGACCTCTCAAAATGTAATGCCCACTTAC
TATGATGGAATATCATCTTCGTACCAAGTTTGATCCCAATTGATTTTTAA
CTTTTACCGTACTCCTTGAGATTAATTGTTTTAAAAATACAGTATAAAAT
AACTAAATATGAATTAAATGTAATACAATATTTTTCTTGAACAAATGCTA
TTTTAAATGTTGAAAGCTTAAGATTTCTTTGTAGTGTTTGGTTACTAGGA
AGAGGATTTCCTTGATTTAGAAGCATTTGATAGTCACAAGTACAACTAGT
AAATCTTAAATAAAGTGAATTTTTGATAGATTTATTAGACCAAAAGCGGA
TTTTGGAATGTGAAGACTTGCATCTTAAAAATTTTATATGGCTTGAATTA
AATACCRAAGATGACCATATWATTCTGCAGCCCGAATTTCGACATATTTG
TCCTTCAACTTCTTCTTTAATTCTTTTATTTCTGTTTCATATACTCCAAG
TTGGATTTGTTGTTGGTATTAATATCCTTTGTATGTTTTACCTTAGTAGA
AAAATTTTTAATACATATAAAGCAATGATTATTTTTTGAAGATAAATTAA
CTAATACATAAACAAAATTATCATTATAAGAAGTTTCATGTTCTATTGTT
GATGAAATTAGATTCATGTCCACTTAGTCTATTTCTCCATTTGCGAAAGT
AAGAGGTTCCAAATAAGTAGTAAAGTATGTATGATTCTAAAATTTTGGAG
ATCTTTTTTTACGAGAAATTTGATCAAAAAAAGTTGCTTGAGATTTCCTT
AATTATTAAATTTACTTTACATAACCATTGTTCTCCAGAATAAAAATGGG
TTAGTTAGAGTTTTTGGAGAGGCTTGGAACTTTAGGTTTAAGATGTTTAA
AAATTTTTATTTCCCTTGGAATTCCCTATGAATTGATTTTCTTCAAAATG
TGTGAGCACAATCGAGAATTATCTGAAGGTTTCCAAAGATTTCTTTTCAT
TTTTAAGACCCATTGCCTTCCAAGGAATTAGTCCCTTGGAAATTAAAAAA
AGTGTCATACGCTCAGCTTCAGAGAGATTCCTACAACCCACATCACTACA
AGAGAGCATACTTTGAGTATTTTATCAAAATATATCGCCTTTGTAGTGTT
CTTCACCTAAATTATAGTATTACATTTTGTATGTTTTTGGCCGTGACTCA
AACACATGAGGAAGTCAGCTATTGTCAAAGCRGATAGCCTGGTGACGTAA
CTTTACTTACAGAGCTCTCCCTCCAAAATTATATACATCGGATATTAACC
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GCTAATTTTTCATTACAAACTTCTCAACTCTAAATATTAGGAGCAGTCAG
GGGCGCTGCTATCTTTCAGCATTAGCAGGGAGCATTTGTGAACAACTTCA
CAAAACAGGGAATATATTGTAAAATGAAAAAGTCTAATCAATATCAATTC
TGAGCAAAAAAGMTCAGCTTAAAATTATGTTCAATATCTTTCATAAAACT
GTTTGACATTTTTTTGTAAGYAATTATTTTTCTTTCGAAGGTTATTAAGT
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TTTCCTTCTGTGTAAAGTTATATTTGTCTTTTTTTATGTTTGGAACATTG
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GAGACAAATAAAGATTTGTTTTCTCTTCTTAATTAAAAGAGTTTTGAGCT
TTCGTTTGAAGGTGAAAAAATACAATTCTAACTTGGAATTACAAGGACAA
AGAGGAAGAAGAAGGAGTAATGAAATGTAAAGAGTTAAAGTGTGTTATAT
CATAATTTACATTGCGTATATACACATACCCACTTGAAAATTAAGGCAAT
AGGGAAATATCCCTCCCTTAAAATTAAATAAGCATATCTTAATTACTTAT
TTTTCTTTTAAAAAAAGTTACCTAAATCTCTACAAAAGACTTAATCAGTT
AAAAAAACAACCTGACCAAAAAATTTAAATGATATCGTATAAAAAACAAA
TGTCATTCCCTACGTCAGACAGTGCTTTATTTTTCCAAAAAAGGGGCCAC
AACTATATTTATTGATTTGTACCATTCCAGTAATAAATGGTATGGCTTAT
ATAACTTATTTGTCAAATATATATTAGCTTCGACGGATTTCATATGATTT
TTAGTGCATTGATTTTCATATTTATTAAAGTAATTTAAATGTAAATATTT
GTTTATACAAATAAACAAAAAAATAAGTTTAATCTATTTAATATATTAAA
GTACAAAACATCTCATTTTTGTTGATCTTGTTAGAAATRCAATAAACTGC
TGCATTATGAAGGGCAAATCTTTTTTAGAAGTCTACTTCWAACGGAACGT
TCAGCAGCCRTAACTAAAACATTTTCATCTATGTCTGAGAAGGAGCACCT
CAATTTTTTTTGGACCTTACTGACATATCAACCCCTTGTACAGAGGGACG
GCCATTCTTCTTTATAAAAATGGTATTGTATGTATATTCTTATACATATA
ATATACCCGTGAATTAATTTATTAAAAAAAATATTACTATTCTGTAAATT
GTTTTTTCATGTCTGAACAAAAAAAAAATAGAAACATTTTTAATAGATGT
ACAAATAATAATAATAATAATAACCTAATTCAACAATATTAATATTTAGG
ACTTTGGTCGTTTATTCTCTTAGATCAAGTACGGTGCAACAGTGGTTCCT
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ACAGGACAAGATTAATATAAATACAAGGTTATACCATAACGCTTTTCCTA
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CTCTTACCAAGAGTAGCTATATATCGCCTTCCTTGACTAACAGCTGTTAG
AGTATTGCTGTTATACTCTATGACGTCATATCTGTCGGTCTTGCTCAGCA
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TAGAAGTATTTTACTGAAAAGATCTTCATGGCTTTTATCAACTTGTTTAT
TCCTTACTGCAAAAATGAAACTAACTTGCAACCATTTTATTTTTTGTAGC
TCTGAGCAAAAATAGCTAATTCCTTCTCTAGAACTTTTGCTGAAGAAGAA
TATTTATTTTTATATTCCAATTTTATCATCCCATCGTTCTTCTCTTCTTC
TTCTTTTTTGTGCTACATGGTTATTTCTATTGTTAACATTTTTGTAAGGA
AAATAAAGCGCGAGGAGAAGGCGAGTAGTGAGGCATATGGTATCACTAAA
GCTGGGCTGTTTGGTCAAATAAATGACTGTTTTGAGATTAGAAAAAGAAA
ACAGTTTGTAGAATTTCCCTTTTTTTCTTATTTATTCATTCTTTCTCGAA
TTATTGTTGTGTTAACATCTCCTTAAAGAATCTATTGTATGCTGAGTACC
TTTGAGTTTGTACAATAAAATTAGTCAAATGCCGAAAAAAATGTCTCACA
ACGCCTGGATTGAAATTAATGGAAGCCATGAAATTTAGAGCTACCTACCA
GAAGACAAAAAATATTTTGTCGAATATGTAAGTACTCTGAGTGGGGTGGG
GGTAAGTTCTCTCGGAGTCCATTCGTTGACTGAGAGAGGAGGCTAGAGGA
GATCATATCTAAATATCTTAGGCATTACTACGACTTTCTCTTATATCTAC
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TAGTGTGCAAATTAATAAAAATTACAAAGTAACAAAATAGAGATCCCTTC
TATTATGGACAATCAAGAAACTTCATATACTCTCCCATCACAAGAAATTA
ATATGATAGTTGCAGTCAAAGCTCCCAAATTTAATGCAAATGATCCGTGT
ATATTCTTCAAAATTTTGGAATGATAATTCCATTTAGTAAAAGTAGTGTC
ATATACTACTAATTTTTACTACACTCTAACAAGATTACCTTCAGTGCGAT
TTCTGAAGTTAGTAAGTCAATAAGAGATTCCTATGCGTATAATAAATTAA
AAGAAGCTGTGATTTCCGCGTTTGAAAAATCAAAATCGCAACTTTTCGAT
GAACTTATCGCTTCTAAAAGACTTGTTGGTCGTCCATCTTTATACTTAAA
GGATCTTAGAGATACATCACAACGAATCGAAGTTTCTGAAGACATSATTC
GTCATAAGTTGATCAGTGCCTGTCCTTCTGAAATCGTACCCGCACTAGCA
TCTCGTAGTCAATACTCTTTGGAAGTTCTGGGTAAATTGACTGATCAATT
ATACGAAATGTTAAAGCTTAGATCGGGTTCAAGCGTATTATCTAAACGCG
AAAATCAATTGAGCATTGAATTTTAA back to top
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