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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s8 | supercontig | LSalAtl2s8:1525620..1538129 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012330 >EMLSAP00000012330 ID=EMLSAP00000012330|Name=EMLSAP00000012330|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=147bp
MIAHILLISVLAAWSSAQNIVLKAPSLRVNCNCQCDNYIFTDAYXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXDGAMSMLVEEQKKRKTQYKLTVMIAYIL
LISALAAWSSAQDIVLKAPSLRVNCNCQCDNYIFTDGYGVTQGNCRS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s8:1525620..1538129- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012330-708177 ID=EMLSAT00000012330-708177|Name=EMLSAT00000012330|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12510bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s8:1525620..1538129- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGATTGCACACATCCTCTTAATCTCCGTATTAGCTGCATGGAGCTCAGC
TCAGAACATCGTGCTGAAAGCTCCTTCCCTTCGTGTGAATTGCAATTGTC
AGTGTGATAACTACATTTTCACGGATGCTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTGTAGTTCAAAATGATAAATAGAAGATAGTGTTTTTTATATTTGGCATA
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TTGTATAAAAACTTGTTTTTTATCTATACAGTACTATGGATAACTTACTG
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ATGGTATTACATTTTCTTCATCTGACGTTAAAGAAGAAGTAAAACTAAGA
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TGTTGTAAACGATACAAATATTTTCGTTACTATACCGAAATTGAGAAATG
TATTACAATACTTTTTGGAATAAAAATGTTGGAACTATTTGGCAATTTGT
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TGGCTTCAAAAAGGGTGGAAGATTGGTCTTCCAAATTGACAAATTGCTCA
TTTTACTACTCTGTGAATTTGTAAACATTTTTTAGAGTTGGTGCAAAAAA
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ATACAAAGGCTGTTATCACCTTCTAAATATAGCAAGAGTGTATAAATACA
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ATATTTACCCAGGTATAGAAAATGGATAAAAATAGATGAAACATAATATT
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CTTTCTTTTTATATTTATGGACTCGATTCGCCTCAACTCAAGTGGACCAA
CACTAGTTGAAATTTGTCTGTACGTCGGGTTAAATACAGGGTATTAATGA
GCACTGTTATAACAGTAGATGAAAATACCATTACTACTTCAATGGAAGAG
AATCCGGCTTGTTCTAGTTGATACCTGAATATATGTTTATTTTTCTTTTT
CTGAAGCTACTCTTACCATTCTTCCATTCTTGAGGAGAGAACATATACGT
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AGAGTAACATTGAGGTGTTGTTGTTCTAAGTCCTAATGGGACTCGGAGAC
GAATTGAGGATAGAAATCGGAGTATTTCCTGCCTATATTATTATTAGATA
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CAAAAAAACCTTCAAGTTGTGAGGGTCATCCCACTAATTATATATGTACT
ATAATGGTTACTTATACTTCATTAGAGCAACTCCATCTGAACAATTAAAG
AAATATAAAAATAACAAATGCATTAGGAATATTTATTTTCAAGGACAAAC
ACACGTTTTTTACTACGACAAGATAGCAACAGACTGTCCTCCAAGAAAAC
TTTCGAACCTTGATGTTAGAATAAAKCCACGCCCACCCCGCTACAACTTC
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TTGAAATCCTTTAATGTCAGGGGTGTCCGGAGGATTACTTTTTGCCTTTT
TTTCGAAAAAAAAAATGAAAAATTATAATTTTTTAGAAAAAAGTTTTAAA
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GAAAAAAGTTAAAATTTTGGAAATTTTTTTTATTAATATTCACAAAAAAA
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GGGGGAAGGGGMACAGACCCRCCTGCCCATCCCTTGGGAACCTCCTACAG
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CGAAAAACAATTAAGGTGTATATTGATGTGTACTCCTTCTAAATAACCTT
TACTCATTTTTAATATCTTCTAATATTCATTAAAAAAAAAAACTACGTAT
GTAATCAAAATTCGTTCAAATATAGGGTTCCCTTTTCATTTTACTCTAGA
AAAACAGTCTTTTGTTACGTAATTGTTTTGATGAAAAAATATACTACTAT
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CATTTATTTGAAACTTAATACCAACGTAAAAAAATATATGATTTTATAAA
AGTACCAAATAGGGTTTTCATTTCTTGGATAAATATTCCTGGTWTTTTTT
TTTTTAAATAACTGTATCCATTAAGTTAATACTGTATTTTTTTAAATTTT
AATTATAAGTTTTAGGCCTGTCCAATACATTATTCTCAATGCTCTTTTTC
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GTCCAGCTTTTCAGAATTCAGTAACCTGATCAGACTTGAAGTAGAAATTA
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TGGAAGTTATACTTTTACATAACTAAATACAGGATATCCCGGTAAACACC
GGGGAAACAGGATTACGGAATTACGAGAGGTAACCCCTAATACCTAGATA
TTTAATTCATGCTTAATTATCTCTTTTCTTGATACCATAAAATTAAATTT
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GGAACATTCAAGAACGTTGGAGGGCCTCAAATATTGGGTATGGAAGTAGA
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ATAGCTCAAAAGTTTTATTCATGCAAAAATGTCTTAGGCAACTAAAGCTC
TAACATAATTCATGGATTTAATGACGATACAAATTTCCTCATTTATCCAT
TTAATCTAAAAAGACGAACCTCTTTAATGATTTGTATGAACTATTAGAAA
TATCTATTGAAGTTTGTTAATTAGAAAAATTGTCAATATTTGATATATGT
AGGTCATTTTTTATTCATTGTTATTGCTGAGAAGAATTTACACAGCTCCC
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CATTCAGGTAGTTGTATTATTTTGCCTCAAGAAACTCTCTGTTGCTTTGG
TGACTGACTAAACTAAGTAAATAACGCCTCATTAAAGTAGTTTTGTAAAA
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TTCTCAGAATTTGATGATAATATCTAGTATTATAAGTCTCAAGATTTTTG
ACATATAAAAAAATCTACATGGTAATCCTCATAATTTGAAGAATGTTTAG
GAGAGAACTGCTTATCTTCCATGGTGTCTATGAGCAACCATATAATGAAG
GACATAAAAACAAGTCACACTCCGTTTCAATTAATAAACATGCAGAAATT
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GATGGGCATTATCAGTACCACTATTTGGAACTAAATTGGGTCCTATGCCA
ATTGATAAATAATTTGAATAGTTAATGTCATATTGGAGTTATATAGATGT
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CGAAATTCCTACCTCCGAATCATAAATTACATAATAAATAGAACGTTTAA
GTTAATTTTTGATAATTATAAATAAGCTCAATAAAATAAAAGTCAGCATA
TTTGCAAAAATGTTGGTTGGGGCATTCAAAAGTATTTTAATTACTATCAC
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ATTCAATTAAGCCAATGTCATCACATTGAGCAGTAAAACGTGAACTAGAA
AGATAGATTTAGAAATATATATATAATTTTATATTTTCAATAATGGGCAA
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GCCACCTTAATTATCAATCACAGCCTTTACACTTTGCCATAAGGCAATGC
AGGAGTTGATGAAAAACTACTCCGACGAGTTGTCCCATGCAGCCTCTATG
GAGGACTTCAGTGAATTCACATTTGGGTGTGAGGCCCTCTTGGTTTCACT
CTTCAAAGTGCCCCATATAGAAAAGTCCAATGGGTTCAAATCTGGTGAGG
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TTGGCAGACGTGAGAGGGGGCCGTCCTCAGTCCACACATATTTACCCATC
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TGGAGAAGACCTCTCCAGGATGTCAGAAAGTGGAGGACATAATTTAATGA
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ATATCACTATTTTTAAGTGTGAGAATTCCAAAAATGAAGTCACAATTAGA
ATGTTTAAATGTCTCATGACTTCAACTTTGATTTTGAACAAAAGATCTGA
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ATTGCTTATTTTGAACGACTTAAGGTCAAGGAAAGAAAAAGGACACAGGT
GGAGTGTTACATGAATCTGTTGATTATTTCATTTGAATGTTTCATTTTGT
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TAAAATAGTTTTTTTCATTCTTTTTTAGACGTTGAGCTGCTTTTGTTATC
ACAATGGCGCCCATAACCCGTTTTTAGGGATTTAAAGCAATATTATGAAT
TACTATAGTTCAGTTTTCTTTTCCGAAACCCCCGAAATTTCTAGCATGGW
CCCTCGTGGACTTGCGGGGAATGACCTGGGCTGTTTTCTTTAACTCATCC
AGGTACAATTTGTACTTTTTGACATAACTCTTCTTTGGTGCAGGAAAAGG
CCAATCAACTGCTTTGAGTTTGCTTTGCAATGCATATCCGTCAATCACAT
TCAAGTGCTATTTTCTCGACTTTTATGTAAGCTAGAGAACTCATGTTTTT
CTTTGCTTGGTAACTAATTGGTTATACTTTAATATTTTAAAATATAAATT
ATTTCATTGCTTAACCTTTGTAAGTGATTGAATTAGTAAGTCTTTAGATT
TCACCCTGTACTAATCCCATATAATGCAAGGTAGTTCAAATAAATATTCC
TTCCAAAACTTTCACATAATTTCCAAAAAAAAACAAAAAAGATGCAAATA
TTCAAGTACTCCTGACCCACGCCTACTTTACATAACCATTAAACAATGGA
CACGGATCAAAAAAATGTCTAACATTATAATTACCAAGGGCGAATATGAG
TTTCCGTTTGAAATCAATTGAGAACACCTGGAATTATAGTTGGATCAGTC
TTTAAAAAAAAACTAAAAAGAGTGTAGTCTGTCTGGTGTTAACAAAATTT
GGTAGGTTCCTTATTGGTCTTTTATGGAAAGTATAACAGGTGAAATGACT
TAGTTACTAACTATGTCCTCCCATTTAACATAACCAAGAGTCAAGATACC
TGAGGTTTAAAATTGTATATGTATAGTTAGAACGTATAATAATCAAGTAT
TATACGTTCTAGTTATCATCCATGGTCCATGGCCAACAGAGGGTGAAATC
CTATTCTATGGAAAAACTTCAAGATTAGAATTAACATAATGTCAGCTGAG
AGGCTGAGCGTACTTGAGAAAATAATAAATGTAAATAACCTGGCAAAATA
TATTTATGACTTATCTCAACAAAGATTAAATTAAGTCCCAAGCCTAACTT
TACAAATAAATTAAAATGGGCGATTTATTTTTTGTATGAAAACTTCTTTT
TTGATACATGTGGTACTATTGATTATTAGCTACACTTATGGAGTTCACGA
TATGTTCTAAGGGCTAGGCATTTCTAATTAAATATTTTAAATAATTTATA
TTTAGTTCAAATATAGAATTCTTATCTAATAATGCAGGTAATCCCATCTA
TTTATATTTCAAGTAAAACAAGAATAAACTGGTTTTGAGAAATTCATCAC
CACAGTGCACAAACCATTTATTTTACACATTTTCTCCTGTAAATCTTTAC
GTATAAAAACACATGTTTTCACAAAAGCTCCAGTATTCTTATCCCAGTAT
TCAAAGGTTGAAGAACAAAAGAAAAGAAAAACTCAATATAAATTAACTGT
CATGATTGCATACATCCTTTTAATCTCTGCATTAGCTGCATGGAGCTCAG
CTCAGGATATCGTGCTTAAAGCACCTTCCCTTCGTGTGAATTGCAATTGT
CAGTGTGATAACTACATTTTCACGGATGGTTATGGTGTAACACAAGGAAA
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