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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s8 | supercontig | LSalAtl2s8:1586487..1596977 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012331 >EMLSAP00000012331 ID=EMLSAP00000012331|Name=EMLSAP00000012331|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=270bp
MNNSSQNIANSTYICSGTTEEEFQMFTRCNWWIDGLGQLLLCSIGLTGNT
IAIPLLCSRFYELDASEYKDSLNQTRIGIKPTPLRLNDNYIVYYHHYTRL
IVTGIVPFCSLAVCNFKIYRAVMQRKKNQNGGRSSDNDTDNRQAILLILI
VLMFLVCNTPRIFLTLKETFSAKQWKEDYLHGCKGLPLWLLFMGSISHLL
LTFNSSLNFFLYCVMSSSFRNVIKSCFVCRRRIKSVCSSETRVLQMCVSK
TRGNYLHTEMNQDGVLMTSL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s8:1586487..1596977- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012331-708178 ID=EMLSAT00000012331-708178|Name=EMLSAT00000012331|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10491bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s8:1586487..1596977- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATAACTCATCTCAAAATATCGCCAATTCTACCTACATTTGTAGCGG
AACCACAGAAGAAGAGTTTCAAATGTTTACCAGATGTAATTGGTGGATAG
ATGGTCTTGGGCAATTACTTCTTTGCTCAATAGGACTTACTGGAAACACT
ATTGCGATCCCTTTACTCTGCTCACGCGTAAGTTGATTGCAAAAAAGTAG
ATTAATTAAGCCATATTGATTTTTCTATGCTTCAATGTAATTTTGAATCG
TTCTATTTTGTATTAGAATATAAATTTAATGAGTTAATCATGGCCCTGAT
AAAGAAACAAATTCTTCAATACATAAATATATTATATGCTTTTATCAAAA
TATATTTTTTTGTAAATATCTATATAACTATTGATTCCAGAGCTTTAACG
GAAAAAGTACCAACAATTTTGATTATTTCCGTAATAATTTAAGGCCATAC
AAAATATCTTAAAAGGCACAAGATAATCAAAAATATTATTATATACATAA
TATATAAATATATATATAATATATAAATATATATATAATACAAATTCATT
GTAGGAAGCACAAAAATAAGTTTGAACCCCCTTTTCTTTTTTTTACTCAA
TTACTCCGAGTTGCTTTCAGACAAGGCAAAATTTATCACAATATATGTTT
ACTATTGATTGAATTTATTTGGAAAACTGACTGAATTATTATTAGAAAAA
AAGTCACTCAATTGTAATATAATTATTGCCCCTCAAAATGTTTTTTTTAT
CAAATATTTGAATGGAAAGTTGATATAATGTATTGATTGTTCTTCAGAAA
AATCTTTGCAAAGATAGTGGCAGTTTTTTTTAACTGTTCCTGGTCCTTCC
TTCAATTTATTGCAATCATAAGGTAATAACTATTATGACCTAATTGAAAC
TATTAAGTGTTTTGTGTACTAGTTAAATATACTACTCTGATAAAAAACCT
GTTAATTTCTTATTTCTAATTCTATTCTGATTCGATTAACAAATTATTTT
TTTTATTATGTTGGTACAACGTTTGCATTGCTGTTTTTTTTTTGATTTTG
GACAGGTAAAAAGATTAAACGTTTTTTGTTGCAGCTATTTTCTACTATTG
AAAAGGGGAGCGGGGGGAATCCAAACCCTTTAAGCTAAACTTCAAATATT
AAATTTTTGGGATTTTTTTTTGAGGAATTAGTTTATTTTGGAAATTGTAA
TATTTTGGGAGGGGGGGGGGGGCTACAACTCCTCCAACCCACCCCCTGTG
AAGGTTTTTCTATTTATGAATTGATAGATCTTAAAATTGCAGAAGCAAAT
ATAATTTTAAGTGTACATAAAGGCTATTTTTATTTGTCAAAATAAATTTG
AATTTTTTTATATATCATATATGAATGACTTAATTATTTAAATACATTCT
TTTTTTAAAGAAATTAAACTCTGTGTTCTATCGACTCCTTGTTTGTTTGG
CTCTGTTTGATAATGCATATCTCATATGCTCTCTTCTTGAGTCTCTTCGA
TCCCACATGACACTCCCTTGGGACATGAATAATCATACGCTCATGTATAT
ATACATTCTGTATCCAATTCATAATATCGTACTATGTTGCTCCATTTACA
TCACAGCTGCAATTGCATTTGAAAGGTATATTCATAGTTCTAGCTGCTGG
TGACGTGTCGGTCCTTATTTAGGATTGAATACTGCTGTTCTGTCTACTTC
AGTCCTGCATATCAGTTCGGTCCTTGATGGCATCTCTCAAATTTTATTCT
TTAAAAAAAAGTCTGAAAGGACCGAAGTGTGGAAGAGCCAGTCCCCAGGA
TTAAAAGGATCGGTTCTAAGACTGGGCAGGAGTAGATTGAATTAAATTTA
GACTGATACAACACTACAAAGAAACATGTACCCTTGCTCATTACCTATTT
TTTGTAGATGCTACGCAGTATGCAGACCAGTTGAATATCGGAATCGAATA
CTGACCGATAGACACTCATCATGGATCCGTGTTCTGATTACTTATTTTTT
ACCGGTGATTGGATTTTGTATTATATTCAATATTCCAAAGTTTTATGAAT
TGGATGCAAGTGAATACAAGGACTCCTTAAATCAAACCAGAGTAAGTGTC
ATTCAAATAATCCAATTTGATAATAATAATACTTTTTTTGCCTACAGATT
GGTATAAAACCTACACCACTACGGCTCAATGACAATTACATTGTGTATTA
TCATCACTACACTCGGCTCATTGTAACTGGAATAGTACCGTTTTGCTCTC
TTGCAGTGTGTAACTTTAAGATCTATAGAGCGGTGATGCAACGGAAGAAA
AGTAAGTTAATTTAATTATCCTGGATACTCAAAATGTTTGACAAAAATGG
GTCTTCAAAAGGGGTACCACTCAAAGTTGTATAATATCCCTTTCAGTCCC
TTGACTGAAATACTTGCTAAAGAATACTTCATGCAATGATATCTGAAAAA
CTTCTTGACCCGTTTCTTCATTCAATTTACATTAATATGTAAATATAAAC
AAGAAAAAAAGGAAACGAATGAATCGATACATTCTTGTTCTATTTAATTT
ATAAAAAACAAAAGAAATATTTTTAATTATAACTGTACCTTTAAAATTAA
TCAGTACTTGTATAAAAAATTAATCAGTACTTGTATAAAAAATTAATCAT
TACTTTGTTAGTTAACAATGTAAATTTAAAATATTTGGGTGAAAAAGTAA
TTTCATATTTCTTTGTTTTATTTTAATGATTTATATAAATTGTTACAATC
ATCCGATTTTAGCTTAATATGACCAATTCTGTTTGAAAACTTGTTGCTCA
CGATAATTCAACTTTATAATGGCCTTCTCATAGAGGCCCTTGTCCCTATT
GGCTAAACACTTGAACAACCAATTGTCACAGACCTCGATTTAGGCAAAAT
TTGTACCCCCAAGGTCGTTGGCCATAGACAGGAACATGTTTTAGTCACTT
GGTCCAGGTCCGGATTGTAGGATGGATCCATAAGAACTTTCCATCCAAGC
TCCTCGAGCTTCTGGTACGTCATCAAAGATGTATGCTGTCTGGTACTGGC
TTAATCATATCTTGTTGCCTGCTATTCMCCAATGYTAGCCACTTCTGTTC
AGTCTCCAGCTTGAAATGCTCGATTTGTTCACAGCAGAGGGCAGAATTGA
ATGGAGGGGAAAAACTTTCGAACCTCTATTGTGCAATACGAACCGGAAGA
GGATCAGTCCCGTATACATGACAAATTTACTTGGTCGCTTAAGACGTGCT
TTTCTTTTCAGGTATTAAATATTTAAAATAAGAAGAATTTCTTCCTTTGA
GACCTCCATACTCGACTCACGATAATTCACGACTGAACCAATCAAGCGCT
ACAAGCGTTTGTAGTATATATTCACAACTTTACAATGCTATATCGTATGA
CCAACTGCGGCCATTAATACACTAAATATATTTAGTTTAAAAAAGGGGGT
AGGAAATACGAAATTACTTTTTCCCAAGCCTAATATATTTTATCACAAAC
TTCAAACGTTATTTTATGTTTTATTTTTGAAAAGGGTGTATTTTGACCCT
TCAGACAACGGCTGTGCATAAAAAGTAAAGACCACACGAGGTATACATGT
CTATAACCTTGAATACGACATATTTCATGACAAAGATCACAATTGTGTGC
TTGATACTCGCCAATACGTTTTTATTTTCAAAATAAGGAGATAAAATTAA
GGAGAACAATAACGTTATTATTTTTTTTTAATGTACACTCCTGCGGATTT
GGATAGTTTCCACATTTCTAATCATAATACTAAAGGAAAAACAGAAGTGA
GCAAAAAAAAACCTTTATGCTCACATCGGCAAAATGACTAAACTTTATAA
AATAATCTTTTAGCAACTAATAACAAAAAAAAAAGAAGAATGTGCTTCAC
CATTCATTAAAATGGAATTAATTCTTTAAAGTGTATGTAAATACATACTG
TAGAGTTTTATGAATACTTTTTATACTTTATTATTATTATTTTTATTTTT
TTTGTTGCAACTGCAATGCAGCAAAATACTACTTTTGTTCTTCTCCTCAA
GTTGAAATGACGAAAAAAAAATGAGTAACATCTCATTTGTGAATGATTAA
AACACTGCAAAATGAAAATAATTTAGAGCTCTACTTTTGATATATTTTCC
CCGTTATAGACTAAACTTGTCATTTGTTTATATTATTGTAAGATCCCATG
ATCTTATTGATAACGGTATAAAGTGTACCTATCAATGCAACGTGTCTTAT
CGAATCGTGATTGGTAGAGCAATATAAACAAAATTCTTAATTAGACCAAG
GGCAACTGAGATGGAGGCCTACAGAAAATCGTGTGTGGGCGATTCTTGAC
ACAAGAATGAGTTACCGTCTCCTGCTTCAAGAGTTTCATTATCTAGATTA
AAAAGATGAAAGACGATAAAAACAGCCTTGAGAGGCCACATTTGGTTAAA
AAAAAATAATTCAAGAGTGGTCTGAAGACAACTTGGAAAATTTATGACCC
CGGTCAAAATGGTCTCTAACTTCACTGGTATTCAACTTTCTTGAGTCAGA
GAACCAGGGAACCATTGAGAGGAAAGCCTGTGCACTAAATGGTGGTCATA
GCTGCTGGGCAGAAGKCAAAGCCGTTTGAGGAGAGGTCAAACTAAAAGCA
TCGCCAATTACATATGGAGCCTTGTAGGAGTCTTTTTAATTACCTTAAAC
ATCATTTACTCCCCTGATGAATAACTTATGGACTTTATAGTAACTTGACA
AATGAATAATTTATATAATTCATAATATCCATGTATGGCAGTTTGTTGTA
CATATGTATAAGATATGTTCGGAATTGTTGTTGTTTCTTGCTTGCTTGTT
TTAAAATAACAGGAAAGGTTGGGAACCACTGCTATAAAATGTGGTGTAGA
AAGGAGTTGCTTGATATTTTAGAGAAATACACGGARAAAACTCGATATAT
TCCATGATTTTATTGTCATTTTCGACGACAAGCCTGCCGGTCAATGGTGC
ATCATTCACCTGCACACCAGAACGAAATCCCTCGAATCACTGTTATGCAA
CACAAGCTGAAATAGTATCAACCCTGTATACATCGTGCATTTTCTTGGTC
GCTTTCGACCCATTTTTCCCTTTCAGGAAATAGAAAAGTAAAATATGGCG
AAATTCTTCCTTGAATTCCCGCCAAAAAAGGAATTTATCTTTGAGCGAAA
AATCCAAAACTGATCAAAAATGACTCTCAGCCATTTTAATTCTAAAATAT
CTGGGATTATAGTAATTCCGTACTATTATCGTTCAGAGTCATTTTTGACA
ATTAAAACAATTACCAAATTAAAAGTAGGATTAATATCACTTATGTAAAA
GTGTTTTAGTGATTCTGCATCTTGTTCTGAACTCGATATATTTCCATTTG
AAGGCTGGAAATGATGAATAACAACACTTTTCTTTACACCCCAAAAAAAT
TAAATTATTATATAATTAAAAAATATGCGTCTAAAAATATTTTTAACTAT
ATATTTTTATAATAATTTAAGCTTTTTGGGGTGTAATGAAAAGTGTCGTT
ATTGCTCTTGGAATTGGAATCAGTATTCGAACATCTTTTGAGATGAATGA
TCAAGTTCCAACTATTTTCCTTCAATTACCTTGACCTTCTTTTTAGGAGG
CATGCCGTCATCAAATTGACATTGAAATAGGTGGGAAAATATGATGATAA
TATTTGTCTATTTGCTAGTAAACTAAAAAAATTATTGTCTTCAATTAATT
TGTATGAAATTCCCCCCTCTTAATTGTTCCCCTCTGTAATTAGTCTTTTA
TCTAAAAAGAGTATTTGATTCCAGCGGATATAGTAAATTTATATTTTTTT
TGTATGTAGAAATTAGGCAAAATGAATTTGTTGAAAATATTTCCCAACAG
TTCAAGAAGCGGGGCTTGACTTCGAATGTAAAAGTTCCAAGGCAAATGTC
AAGAAACACTATTATATAGAATTGGCCAATTGTTAACTTTTTAAAATATA
TGGGCAAAAATTGAGCCTTTAGAATTGGCCAAGTCTACAAGTGATGTAGT
GACAGGTATTTGGCTGGTATTATCCACAAATGATACTAATGGTCTATACA
TCCAGCTACAGTATCAGTTTTTGGGGGGTTATTTCTTCAAATCAATTATA
TGTTGTTTATTTTTTTTGCTTTGCCATCTTTACTCTATTTGGGACAGTGA
TCTACGATTTCAAAGCATAAAGCCTATGAAGTTMTAAWAAATAAKTANTT
AATTTAAACCGCCATTAAACGAGTATAAAATGCACACACTATATATAAAA
ACACAAATAGATAAGCTATATAGTTTTACCATTTTTTAAAGATACAGTTG
TGTACACTGAATAACGATACTTTGTTACATCATTTTTTTTTATGATTTAT
TATAAGTAAAATACAAAAATAACTGTAAAAAGTTTTTTAAGTTAAAAAAG
CGCTTTCGTTAGCACAAAAACATGAAAAACAAACTTATATATCTGTAGAT
TGTATTTTCAATATGAAGATATTAAAATAAAAGGAAGAAAAGCACATGAA
TAAAAAAGTTGTATTTGGAGACAAATGATGATGAATAATTATTTTTTTTC
TTTTCATTCTTTTGAAACATCTCAAAAATGTACATTTTCACAAAAAATGG
TTTTTTTTAATTTGAATGGTTCTATATTTTTTATACAATTATCTGCAGGT
TTCTATTTGTTTTACTCAACAATTAAATGAATAAAAAAAATTATAATACC
TTTAAAATATTTTAATTGTAAAATATACAACTTCAATGTGGAAGTAAATT
TAATTTTATTATATTCGTTTTCTAGTACATAAATGCCATATTCTGATTAG
ATAATAATTTAATNCTCATTTCAAAGTTAATATTTCGTTACTTTTCTTGG
GTTTTTGAAATCCTCATTTTTTTAAGTCTATATTTTCATATTTCTATTGT
TATGAATTTCATTATTCTTTAATATCTAGATTTACCTGGCTTTTTCTCCC
AAATACTGACGTCATATCTAGCATTATAAATTAAAAAAAAGTCATTTTAT
GGCTGAAAGTTGATATTTTTACTACAAAAATGACAAATTTCCACTAAATC
TTCTTAAAACTCCATCAAATGGCTTTATGAATAAATTAATTTTTTTCCTG
TATTGAATACTATTTGATACCCAGGATAAACAGCGATGTTTGAATTCACT
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TACGACAAAAAATTACATTCAAAAGCTTAAAAAAGTACTCAATCATGTCA
CATAGTCTACTCCAGCTCGGATAACGTCGTAGCAATGGTTCTCCAACTCC
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GTGATCTACATGATTATAACAATCGTTATCGTAGAGAAGATGCTGTCCGA
GAAGAACCAGGACTCGTTCTGTACAAACTGGTGGGATTCCAAAAACTACT
TGCCTTGGCCCTGGAAGGGCTTAATCAGGCCCTACACACCTTCTCTTGCT
CATTCTGTTGGGGTGAGAGAAAGATGGACTACCCACACGCTGAGGAGATT
TTGAAGCGGAGATCATCAGTTCTAAAAACCGCTTTGGGTGGTAAGGAAAG
CTTCACTGATACCTCTGGAACGCTCATTTGGGGTTTGTTCTTTACCAAGT
CCTTGACTTGGGCGATTTTGTTGGGTGTCCTGGTCTCCCATGGAGGTCCT
GATGAGAAACCTTTCTGGAGCTTAAAAGTGCCATCCTGGATCTCACCAGT
CCACCGAAAGTTGGTTGCACAACTAGGCCAGGCATCAGGGTAAATGATAG
TGAGATTGTTGTAGATCTCAGACACTGTTTTGCCCTGTTTGTTATGTATC
AAAAAGTAGGAGCTAAAATTGTGGGTATCCATCTTCAGTGACGCATGTAG
AACAATGTGCTAATTTGGTATGTTTGGTATGTGCTATTTAGTCTCTTAAT
AACTATGTTATGTATTTCCACCATAAACTAATGAGAAAAAAGATGGTATT
GGTGGAATTTTGTAGCTTTAAACGAACATGTCTCAATCATTTAGGAACAG
GATAATATTTATCTACAACACGGAACTAAGACTATAGAACGATGTAGTAA
CATATTTTGGAGTAAGATATATTTTAAAACTAGGCAAAAGAGGCAACCAG
TTTTTATATACAGTAAAGCTTAAGTCCTTATATTTGTGGGTTTCATTTTG
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CACTACTGGCGCCTATCAAAGTTATGATGAATTAGTAGCATCTCTGGGAA
GAACTCCGACCAATTTTCAGCCAGATTGGGAAAAAAAATTGAAAAATTAT
TTTTTTTTCATAAAATAATTTCAAATATAAATATTTTTTAGCAAAAAATA
TTTATATTAAAAAGTTCAAAATTCAAAATCATTATTTTCTAAAAACTAAA
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GGAAAAAAAATCAAAAAATGAAATTTAAATTTTAAATATTTGTGAAAAAA
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ATCTCATAAATTATTTGAATAGAAGCCCTACAATGGAACCAAATATATCT
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TTTAGTTTGCAATTCCGATTCTTATTCACTACTGGTTTTGAACTATTTAA
TTCTTTTCTCAGTTATGAAAAAAAAAATAGCCCCCACCCCCTCCCCACAT
GAAGGAATTTTTGCATTTTATTAGAAAATATAATATTTGAATTTTTCTTT
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TGTATTTTTTTGAATTTTTCTTTTAAATATTTAAAATTTGAATTTTTTTT
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ATTGGGTTTTTTAATAGAGTTGCATTGGAATTGGCATTTGGATTTTTTTT
TCGAATTGTCCATCAGAAGTATATATGAAGTAAAAAAAAAAAATATTTTT
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TCGTCAAGCCATCCTCCTTATCCTAATAGTCCTCATGTTCCTCGTTTGCA
ATACACCACGCATATTCCTCACTCTCAAAGAAACGTTCAGTGCGAAGCAG
TGGAAGGAAGACTATCTCCATGGATGCAAGGGKCTTCCTCTTTGGCTTCT
CTTCATGGGCTCCATCTCACACCTTCTTCTTACATTCAATTCATCGCTCA
ACTTCTTTCTCTATTGTGTGATGTCCAGCTCTTTTCGGAATGTCATCAAA
TCTTGCTTCGTGTGTCGTCGACGGATCAAGAGTGTTTGTAGTTCGGAAAC
ACGGGTTCTACAAATGTGTGTATCAAAAACTAGAGGCAATTACCTTCATA
CGGAGATGAATCAGGATGGTGTTCTTATGACTTCTTTGTAA back to top
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