EMLSAT00000012376, EMLSAT00000012376-708223 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012376
Unique NameEMLSAT00000012376-708223
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s906supercontigLSalAtl2s906:63861..86606 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012376 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012376EMLSAG00000012376-695142Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000055532EMLSAE00000055532-764460Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055533EMLSAE00000055533-764461Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055534EMLSAE00000055534-764462Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055535EMLSAE00000055535-764463Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055536EMLSAE00000055536-764464Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000055537EMLSAE00000055537-764465Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771128auto771128Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012376EMLSAP00000012376Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012376

>EMLSAP00000012376 ID=EMLSAP00000012376|Name=EMLSAP00000012376|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=348bp
MLSFERNEVCETWSDEDVFSTGSFHRVEKRSSYLPPIDCTSPHERGAMNS
KASCRPRPRVIRLPWPNSTEVNHMIPSHVIVDRCDGSCHHRKQSCLPRKV
IKKSFPVMFAHCTIHDKTCGKICSQVQVDEHLECGCECKIKRHHCNAKQV
YRKELCSCQCKDLSEVQACYNSGRVWDPSKCIPEETNELEAGERIERSHE
SPKTVKDAIFRWEIVAIACLTLLVLCLFVALIFVSQRRDHHRAVMIRRHD
DIVEGRFGGRYRRYSIEQDKALTEAMMPPTPGVKKFEYSSGGSIYTEDTR
SXASPLPAPNSEQVTIVFRKGDQTVELQCNLNPEENARLYVAESPIQD
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mRNA from alignment at LSalAtl2s906:63861..86606-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012376-708223 ID=EMLSAT00000012376-708223|Name=EMLSAT00000012376|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22746bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s906:63861..86606- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCTGTCATTTGAGCGAAATGAAGTATGTGAAACTTGGAGTGATGAAGA CGTATTCTCAACAGGGAGTTTTCATCGTGTTGAAAAACGGAGTAGTTATT TACCTCCAATCGACTGCACAAGTCCTCATGAAAGAGGAGCCATGAATTCC AAAGCATCTTGCCGTCCACGTCCTCGTGTAATACGATTACCATGGCCGAA CAGCACTGAAGTGAATCATGTAAGTCCTTCAATCTCTAGATTATTATAAG TSGAGCCATACTCTAAATCAGTGGTTCTCAACCTGACACCTTTGCCAAGG GATCATTAATTGATTTTGAGCCGAATGTGTATACTATACTAAACACGGTT GAAAACATATCAATACAGTTATATCGATTCATATTATGAAACTAAATTTA AAAGTAACTCAACACAACGTCTGAGCCAGGATTGACCATGTTTGGTTGCT GTTCCCCCACTGCTGTCACTCCTCCCACCAGAGTTGCCCAATTAGCTGCT TTCTGGCTATTTTTAATCAAATTTGGCAGCATCTATTTAAAAAAAAAGTT GGAAGTTAAGTAATATTGCCGTGTCAATGGTGCTCAAGGCTAATGGTAGG AAGTCAATGAGATTTGATGAGAGATCATTCTTGACTCAAAAGCATCAACA ACTCCATATTATAACCCGCAAACATTATAGCGACCATGGGATCCTCTAAT GAAAAAGGAACAGAGTGTATAGTTACTTTACGAATACATAATCTATAATT GATAATAAATGGCAGATTTATTAATTAAAATAATAGTTATATAGGTATTA AATATTTTAAGAATTGGGATATTTTCCTAATTGTCTATTCTAAAATGGGT CACTATATATTTGAAAGGTGGGGAACCACTGGTTAAATATATAGACCATG TACTCTTTTTTTTAATATATATTTTTTTTGAGCAGCTAAAGAAGTATTTT TTTTTTAAATAGAATGGCCATGAAATGACAGAGATAATGCAATTAAAACT ATTTTGTAATAAATATCTTACGGAATATCAATATATTTTTGGACTATTTT ATATTATCACAATAATGATTAATACATACTATTCTTTAAATTCGTTAACC CTTAACCATGATGTAATTTTTTGGTTCTTGTATTTAGGCATCAATGTTAG GGAGAATTTGACACTCGAAATATATTGATAGATTATTATTACTGACCACT GGTACTTTATGGTATCAAAATAAAAACATTCATAGATTTGATGTTCAATG ATGTACCCAAGATGTTACAATTATTCAAATTTCAACTAACATTAATTCTA GCTTCTGAATACAGACTGAAATTTCATTTCCAGTTAACTAACTAATCTAT TTAATTATATATATTATAAGATCTTCTTATTCGGACACAAACTTATAGTT AAATTTAATAAAAATAATGTGACCACTACTACTGAAAGGGGTTATAAGTG ACTAAGGATGGGTAAAATGTAGATAAAAATGACCTTTTTAAGATTAGAAA AGTAAAAGAAGCTGATACTACCTTTTTTTTTGTTTTGTTTATTGTTTAAT ACATCGTCGTTGTGTTAGTTTCTAGGTCTGAATGATGAATTCTTACCTAC ATTTGGTGTAATTTAAAAAAGTGAAATAAAAATAACATATATATTAGTAA TGTGCTGCTAGCTAAAATTTGTCTGCTAGAGTATTTTTGAATTTCTAAAT CAGGCTCTAGGAATAATGAGCTAACCCCCTTACTCACCCTTACACTTTTT CCTCCCTCACAAACTAATCAGTCAAAAAATAATATATTTTGAAGAATTAT TGACAACGTCATGAGAGCTAAGCTGTTCTCTCCCATTCTCTACCCCATTT TTTGGAGTAGTTTTATATATATATATACCAGTGTTTCATATTATTTGAAT CTCTGGTGATAATAATATTCCTAATAGGGACAAATTTCCCTAAAGAAATA CAAGAATATCTAGAAAAATGTTGTTTTAAGGTCTTGTTTTTGTTTACTTA ATAAAACGCGAGTACCAATTGACGAGATTTGTTTGTGACCCATCACTAAT ATATATATATATTCANTTCTCCTTTCTATAGAATGAACACATTTTCTTCA AAATCACATAACAGGCAGCTGAATGTTAACAAGTGTTTTACTCCAATAAC ATCATACGTATCACTCCCAATTTCTTCTGACACTCTACAAAATGCCCATA CCTAGGTATTCTATTCATTAAACGATTATTCTAATTCAATTCTCTCCTTC ATATCATCGTTATTCTACTAATAAAAAGCCTTATTTAAGCCGAAAGATAG GAAGGGAAAACAAGGGTGTATCTTGTTCCATGTATTGTATTCATTGGATT TGAAGTACAGCTGCAATTTGTTTTCTCTCATTCATTTGCTGTTATTTTTT GCTCTTTCTTTTACCCACTTTTTGATAAATAAATAAATTGGGCATACTGT ACTTAGTTTAGTACAAATAACGAGGAACCCAGATATTATTCTGTGTGGTT CCTTTTTTGTGTGTTATTGTCTGTGTTAGTTGTTATATTCTCCTAAATAT AATGAAAACATATCATTTATTTATATATGTATATTCAATGCAAATCTATT GTACATATATTATATATATATATTTGGTAAAATAATCAACATCTTTCCAT TCTTATTTTATTTTTATAAATATGAGTGTTTATACGGATTTGTAAAGGTT ATTGATGTCATAGAAATGAGTATATAACTTTGGAGTTCTAAGTATACGCG TAGGAAATTACATTTTCCTAGAAGGACAATTTTAATGTCCACAAATATTA ATAGTAATTTCAATATTTTTTTGATGTGGATTTTTAAAGACTTCATTTGA 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TTCAAATGACTGAATATTTTTTTTAGAAATATTAATGACTGGGTCTCTAT GATAAGGCTTTGCTTTTACAGATACATGAAGAAACTATGTGTGACTATGA ATTACATAGATAGTATACATTATTTCTTTTAAAAGTTTCTTTTTTGACAC CATGTTGGAGGCGTAACCTCAACCAACCAACTTATTTGTTTTTTCTTAGT CATGAAACCCAAAAATGATGGGAATATAATGATAATGATATGTACATACA TATATTTTAAAATAAGGTGCCCATTCTGTACACTCAATGTACATATTTTG GGATTTTTTCTTTTATACTACTTCTCATAAAAATATATGAAATTCTTGAA ATCCGTTAGGACGGGAGGAATAAAGATCACAATCAAGATGGAAAGTAAGT GAGGGTTCGAGTATGTGTTGCTATATTTATTTCACTGCCACCCCTGCGAA GAAAAGCATTTCTGTTGGAGAAGGAAAATAAAATAAAACAAAATTATACA AATCCACGTGAATTGTATTGAATTCCAACTGGTAATGAAGATGGTATCAG AAAGAATCATTCTATATGTGTGATTTTTAAGTGATTATAAATGCATTTTC CCCTTTCCTCCTTATGGGGTCAAAAAACCGCTGCCTTTATATATACCTAA ATATTAGGATTGTTACGGTACTTAATATAAGGCTTAAAGCTTCTAATATA GTGAAAATCTTCGAACCAGCTCGGTCCAGACCCCAAAAAAAGAACTGTAG ATATAATCGAACTAGAATCTATTTATTTGTATTGTATTTGTCACAACATA TGACTGCTGTTGGTACATGAAAAACGTTTATCATTTTAAAGTGTCCTCTA TATTGGCTCATTTTCACCAATATTATTGCAGAGTAATTCAATTTATAAAC TGAATTACTTTAGTAAAGCTCTAAGTATCTTTCATGTACTAGATAATTTT 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GTATGTATGTATCCCAAGATAGGATAGACTGGCTTACCCCCCCCCCTCCC TGACTTAAACTAATTCAATACTAGGCAGATGTAGTTTAATTACAATAGCG TTTACATTCAATGCGACTAACTTTTTATGAAGGAAAGGAAAAGGTAAAGT CAAATGAATAGTAACTCGATATTTAGATGCGCTGGTGGTAGAAGGCTAAA TAAAAGCCTTTGTAATGAATAGACTGATTAAATATTATGCTTACATGACT TATATGAGCGTACATATACATGTATATATATATATGTATAGAGTCCTCAG TGATTTGTGACGGTTTACATGTGGACATCGTACAATGCACATATTATGAG GGTGACATTATACATATAACCAAAACCGTTTACTGGTTTGTGGTCGGTTT AATAACATCACGTTATGCAAATGAGTGCATCACCTTGCACATTTACATAT TTATGAAGATATCATATGTATTAGTGTTGTGTATCGGTCTGAAAATCTTA GATCGGTCAAAGATCTTTAAAATTTTTCTCTTAATGGATCATATTTAATA TTGGGTTTTGAAATGTTGATGTCATCGTGTGTATGACTCAATTATGACAT ATTACTCAATTAATGTACATAATTTTAGAAGTACTTTAAAGATTTTCAAG GTAGCTAGATTTTTCGAACGATATATAATCTGCCTATCTTATGAAACCCT AAAATAAATCCATCGAGTAAATATTGGTCAAAATTGCTCGAGAAAAAAAT CCCCAAGTCTCATCACTAATAGATAAACATCTTGAAGAATATCCAACTCA TTGCCTCCTTATTATTCATACTATAATTGAAGTCCCTCACGTTTGTATTT ATATAATAATAGTATATAAGACGTTCAAGAGGTACCTTGTATAAGTAACC AAGACAAGACATTGCTTTGTCGTCTTAATTTGTTCAAAAGTGTAGGACAG ATGTCATTTCCATTTTTGTAAGTTTTTTTAATTCTATTGTTTAACTTCAT TCCATATCCATTTTCATTTGTAAAATGGAGGGATATCAAGAGGTAATAGT CAAAAAATACTTGGGTTATCTTAAAACAGATTTATTTTTTAATAATAATA AAGATAATTATTTAGGGGAAAAGGAAAGGGGGTTGGTTATATTAAAAATA AAGTTCATTTTATGAGAAGCCAGTCTCTCTTTTTTTATCATTAGGAAATG ACGTATGTGTGGAGTTGTGAATCATATGACCACACGGTGTTTTTAAAAAA AGCCCCGAATATGAGCAATTTAATTAGAAGGATTTTTAGGCCGAGAGCAG CTTCGCTGTTATTGCGTTTTATTAGATAAGCTGCAAGCAGCTTAAAAAGG AAGGCAATAATAACGAATCCCACTTTGTATTTTACTGGTAAAATGAAAAA ACCTCCTACGTCGATCCTCAATTCCACTATGAGTCCAACAAGGACTTATA ACTCCCCAACAAACTATCTGTGTATTTTATGAGTAAACGGATATATATTG CATGCGATTTAGATCATATTTTCTACAACTCTACTTATGAGAATGATCTT TTTCCTTCTTCTTTTTTTCTCTCTCTCTCTTTTGGCTAATTACTGAGAAG TATGTGTTTCTTTTTCAGTTGTAACTAGTATGTAATTATTTAGTCGTTGT TTCTTAAAAGTCGTTCTTTTTTTTAAGTCAAAAGAGGGGGAAAATGTCAA TAGAATTTTACAATTTATTGTATGTATGTTGTCACCGCCCTCAGTTTCGA GGTTCGTTGTTCTTTTGAGCCAAAATAATAATCTGGCCTTTGGTTCTTCT CCTACATACTTGTTTTACAACTAGTTTTTCCCCTCTTCTTTTTGTTAAAG CAAGGATATCAAATTGGAAATCTTACTTTTTTTCTTCGTCTATTTTTACA 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GTAAAAATAAACTCTACCGTTCAATGCTGTTATTATTTTAGTATTGACAA ATTACATTAAAACTTACTCACTTGGGAATTTTCCATTGATTTAATTCTTT AAAATCAGGTGTGACCCATTTTAGTTTTTCAGGTACCCCAGGGCCAGACA GATTACTATTTTCATGTCCTTGGACAAATAGCTTTTTCAAATAGATTTCC ACTCCATTCCCTTTGCTAAACGAAGAAAAATGACTTAACAGAGCAATGAT AATTTAGTCCATAATGATTCGTTCCACTTTTTGCCATTAATATTGATCAG TATATAAAAAAATCATGGAATGACAACACTCCAGGAATGTCATTATTATT ATTATTTTTCACCCCACACACAGGATATTTTTCATGTACCTTTTAAAATT ACTCGGAATTGAAAAACAAGCATTTCGTTCCGCCTAATTTTTCACCATCT TAAAAATGATTTGGAGGGGGAAGAAAAAAAAAAAGGAACAACACTATGTG ACTATTAAAACTCCATTACATGAATGGATGGTGCTTAAAAAGTTGTCTCC AAAAGCACAAATATGTAGACAGACAGACATCTTTCAATCATAATAATACT ATGACTCCTTCATCTTTATCTTATCACCTAAGAGTTTTAAAATGAAAGAA AGAACGAACTGTTTTGACTTATTATTATTCTTTAATTATATAATTAATAC CTACTCATAACATATGTTTTATATTTTTCAGATGATTCCTAGCCATGTCA TTGTGGACCGCTGCGATGGAAGCTGTCATCATCGAAAACAATCCTGTCTT CCTAGAAAAGTTATTAAAAAATCATTTCCCGTAAGTGTCTTATGGCTTCT TTATTTAAACGAAAAGTATTTTATAGTCTAGGGACTATTTTTGACTCATA TATCATATGTACTTTTAATAATACATAGATATATGTGTATAAACATACGT ATATGTTCTTGCATTTGAAGGTTGTTCTAATCAAACACAGTTGTCCTATT TCCATAGGGTTTCATTATTCTCTGAGCTACAAACATACTTTGTGTATATA GTACTTTATGAATCATAAGTTTGCAATGTTCCCCTTTTTTAAACTGATGT TATACGTAAATTGTTTTAGGACTGTTGTATATTGGATAACGATAGAAACA TGTTCGTTTTATCTTCTCCGAACTATTTTCTTCTTTTATAAATTTATAAA ATTGCCATATGTTAGAGTGATATAAGAAGTTCAAGATCGAGTTATAATTA ATAAAAGTGAAATTAAAAATAAAGAAATTGACTAAGAATCCAACGTACCT TCCGAAAAAATAATATCAATTTTTATTCTTTAATTTTATTTGTCACGGAA CCTTCTTAAGTTCATCAACTTTTTCGGGAAACTTCAAATTCGTACAGTTT TATTCATTTATATATCATATTCGGGACAAGTTTTTAAGGACTTATATTTA GATCTACGAAATCCTTCCTTTTAATAGAGAGAAGTTTTCTCTAGAGCATA ATATAATTTAATATAAATGTTCTTCTTCTTTTTTATTGTTTTTTTTATTT TTAAATTGAAAGCATAGCTTTTTCAAAATCATTTTCTTTGCTGAATGAGA AAAAATTAAAATTTTCTCAGTGAATAATTAATTCACAATWCCTTTTTTTT TTTTTAATTTAAAGAATTGACTTTAAGATCAAAATAATGAAATTCCTCAT AATTATGTCCTTAAAATAGTTTCCTAAAGTATTTAATTAATTACGACAAT ACACTCTAGAAGTAAATTGGAGTAAGAAAACTTACTATGAATATTCCTTG TTATGATCCTAATTGAAAACAAACACTCGGATAATCTCTTTCAATCCGAG GTATTACTGTGCGCATTAAAGATGTGAGAATTTTCCACATGATTTGTTAT TTCCATATGTTGACCAATGTTAATGCCGTAATTTTTGGGGGAGTTTTTAT TTCTCTTCTTCAGAGTAACAACCCCATTAGTTGAGTAGCTTTATAATAAT AATTATTATTATAAACTTTTTCTAGTGTGAAAATAAATACGTCACTATTT TCTTACTTTTTTAAACGTCTTAATGTTTATTTATATATATATATTATTTT TTTTACCAAAATGTTACTGCATAGCGTCAATCACACAAAACTAATGATTT TCCCCCAATCTATTTTTTGTTTCTTATCTTGAGAGACGACTTCCGTACAC CTCCTCTCCTTCTATTACTTAAAACGATTAAGATGCTTTTATTTATTTAT CATCCTTTAATTATATGTATAATTTTCTTAGAAGGTGTAACTTTAAACAT TTTATTCTCGACGTCTTTTTTAGGTAACTTAAAGCCTCAATCATTTCGTT TTGGATTATTTTTCTTCATCAAATAAGTGTTTATTTATTTTTATATGAAG AAAAACAGAACTAGTGTTGTGTCGAATTGAGGCGATTCGAGTCAAGTCAA TAAGCACTTTGTTAACATTGTTGTATCTCACAACCTCTCTTTAGAAAAGA AACTGGAAAGGAAGGCCCAAAATCAATTGATAGTTTGTCAATTCTTATAA AGTTAATATTCAATTAGCATTGGGGATTGTTCACAACTTAACAAGATATA ATCTTAATTCATTTAACAAGCCTTCAGAACACCGATTTGAGGAATAGAAT CTGGAACATCTACAGCTGCAGACAACAAAAGATAGTCTTAAATTATTATT TTTTTTTTTTGCCTTATGAGCACTAACGAGTTAATATGTTTGAGTAATTG TGAGGTTGTGCAATTTGCTACAATTCCGAAGTACATGTGATATTCTGTCA TCTGAGGGATTAGAAGAACCCTATTAGAAATTGTGAATAAATATAWAACA 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