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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s91 | supercontig | LSalAtl2s91:257012..272746 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012479 >EMLSAP00000012479 ID=EMLSAP00000012479|Name=EMLSAP00000012479|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=281bp
MKAKVIEGGEVESPALPALQEKEDEVFEVDNEEFDSDMEDDEVESDEADG EEEDEISDDADDEGDGEENTQKSGWADAMAKVLNSAKASEPSKVVLSKAR KDYEVKNKTIMKKSDDTEESKNEAEKEPATKTFKLKQSSLRSQKLAVESV SRTKPQVVRDKAKEKSLNKIATKGVVQLFNAVKKQQVDLKKDLNSVGKSI RKRERVYQSIDKNSFLENVLGAKTTSSKEVAPSKVPINKKTEESMDVDGE GSYPKSWCVLRDDFMMGAKMKDWDKQSDSEG back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s91:257012..272746- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012479-708326 ID=EMLSAT00000012479-708326|Name=EMLSAT00000012479|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15735bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s91:257012..272746- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAAGGCTAAAGGTATGTTTGAATCCTTTTTATATATATTTTAATTAAT
AATAATGTTACACACAGACCCTCGGAGCCTAGGTTTTACTTTATGGCTTT
GGATATTAGTTTAGATAATATATTGTATCTTGGGGTTTTCGTATATAATA
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ATTATACGACTTTTAGCGTCCCTAATTGATCCAAAATAATACTAATTGTG
CAAATCTAACCATTTTTAGGTATTTTCTTGGATTTAATTCTAATATCACG
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CCTTCAATTACAATGCAATTTAAGACGTCAGTGAAAACCTTCTATTTACC
TATTTGATTCAAGTGTATATGCTAGTGGATACAGTCTTMTGCTGTATGTT
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TGACAAATTTCKCTCCCTTGCCACGTTTATTAGCCTCTGTTGATGAACCA
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GTGCACTGGCAAAACGGCTTATCACAAGAAATAATAATGACTACATAACA
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ATCATCGAAACTGTACCATATTCCGTCTGTGGGGTTTCTGCAAGTTGCAG
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GATGAATTCGTTGATGATGAACGACTCACGTTTGGTGTCATATCGAATCC
ATCTAACGGAAAATCGATCAGAGTCAACAACTTGTCTGTGCTTAGTGAAC
ATTGACGGAAGCGTTTGAGATGTATGACAAGTACATCTGGAACGGACCAA
AGCCCCATTTTTTTGACTACTTCTCTTTTACGATCACATTCTGGACAAAA
CCAGGCATCACCCTGTCCGAGTTTTTCTTCAGATGTATATAGGGAAAAAC
ATTCTTGAAGACTCACTGAGGAAGCCTCTTTGGGATAAGACTCTTCTTCA
GCTGCAGCAACGGTCGAGTGGATTTCTACAGGGGCTGAATCGTCATTTAT
AATTTGAGATTTGGCGAGCGCGTCCCACTCTAAGACTAGTTTGATAACAG
AACCCAGCTTAGTAGCTCTCTCCATGATATCCGTACACATGGGTAGCTCA
GCCTCTGGATTCAAGTATGATGACGACGATGATGACGGAGATTTACTACT
ACTCTCATCTTCGTTATTATCGTCCATTAGGACCTTCATCTTGAAAATAG
GAATGTTTTGTTCTCCCACAAGGACATTACTGTGAAGGATAGGACTCATC
TCCTTGAGTAAGAGTTTTTGAAGATCGCAATAGAGCGTCTCTCGGGACAC
TTGAATTGCATAGGGTGTACCAAATCTTTTCTTTACTTTATCATTTATTT
TTAGGATGTTGATCCATGATAAACATGAATTCACCTTCATCTTCTTCAGT
AGAGCTGGGGTGAACGAGGGATTTCAACACAATATAAATCAGCCTCAGAG
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TTCTTTTAACTCTATTAGGAAAAGAGTGTCTTCGTCTATTCCCGTATCTT
TGGACAAACACTTTTTTAAACCACCTATTGTCTCATTTTCTTCCACAATG
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ACGAGCGTAATTATAGAGTGCCTCATGAGCAAGAAATTCTTCCTCAGAGA
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TCATGTACACGGTCTAGAAGCCAGAGAAGGAATTCTTGAGCATCTTGTTG
TGAGTTGCCTTTATATTGAGGTCCACCATATTTTTCAATGAGGGCCTTGA
ATTTGACAGATATTTCTGGCGTGTACTCCAAGGACCAAAGCGACTTGAGG
ACTGTGGCGAGCTGTTCAGTGATTTCTCCGTCCCCGACATTTTTTCTTCT
ATTGGAAAACTGTAAGAAATAAAGAATAGGGTTCTTAGTGGGGAATGAGT
GTTGGACGAGTAGAGCTCGTGATCCGCGATTGCTTCGCATCATTACCTTT
TTCTTCTTTTTTTTCCTTTTGAGGTCATGTTTATAATTGTCGAGTACGAG
ATATTCGGCGAGGGCTTCTGTGTAGCTCAAGCATTGTAGAACAGCATTGA
TGAAGCATGTGTTCCCATGATTCCGTATTCCCATAACACCCGGAACGCGA
CTCTCGAAACGTCTTTTCCACTCTTTGATGAGAAAAGAGGAAGAATCATT
GTTTTCCTCGGATCCTGGAGTTCCGTTCTTCCCCAATTTGGACAAAAGGT
TGAGCACGGAACTCTTGGATCGCTCCCCGAATCGTGCCAATGCAGACATC
CCCAAGACTTCACTTATTTTTATTCGATTCAAGCTCCTTCCTTCCTTCAT
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CTGCTTCTTTCCAGCTTCCTCTTTCCAGCTCTAGCTAGCTGCAGATCATA
TTCAATTCTCTCTCTTTCTCTCTCTTTACATGTTCATTTAATAATCGCAG
GCATGACGAGCTGTTGCCCACTCACTCCCTTTTTAGCTCCTTAAATATTC
TCAAATTTACAGAAGTAATGAAATCTCAGCTCCAAACCGATATGTATGAT
TCTATAACTATGTATTTCTTCATAAATTCCTTCTATTTATAGGCGTAGAA
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TTCCTAACGCCCATCTACTCAAGATTACTCAACCAATACTAAATATAATT
TGGTCACTCTGTATTTTAAAGCGCCCTCTCTCTAGGAACACTACCCAAAA
AATGAACGCCATCTGTTTATGTAATGATGACGTCGATTGAATCCTCTCGA
CATGTTGTTAACGTAATATTTTATTTTTCTTATCTGTCATGTCCCTTTAA
ACAACACGGCATTTTTATTTATTATGAATATAAACCTGTTTGAAACATTT
GTTTTTGTTTTGTCATCATCATACCTCATGATGACTCACTTTTACTTCCC
ATGAAGTTACACCTGTGCATCCATTTAAGCAAGTGGATGGTTGCGTTTAT
TTATAGATTTCTGACCAAATGTACATAGTTTGATTCATTCATTTCTAGGA
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ACAAATATTTGGAGAACTGGTGGCGTATTCCAAAGGGTTGTCCTAAGGTG
AATACAGGGACCATATTTATTTTAACCATAAATTGACCTTCTTTGAGTAG
CTTTGACAATTTGAGCAGGAGTGTCGTCTTATTTCAAGACCACACTGTCA
TCTGGGAAGTAGGCCCGACCCCACGGGAGGAAGTGAGTCTCCAGTTTTTA
TTTGCTGCATTAAGAAGCGGGCGTATTTTCACGCGAGTGTAACCTTCAGA
CCCCATTTTCTTGATAACTTAAAAGAAAAGAAAAACAAATCAAATTTCTA
CAGAATGTTATGAAATGTTCAACGTGCCTCACTTTAAATGCCCGTCTTTG
AAAAACTCACCAGAACTTAGCAATTTGCAAATAAGCTAGTGTTCAGATTT
CAGCGTCGTATCCGGTACTAACATTCATAATAACGGGCTCTCAAGTTTTG
AAATCAGTTCCGTGTGAGATTTTTAATCTTACTACGTGACGTTACTACAA
TAGTATAATGCCGACATTCAACTGTGCTCTGCAACTTTTAAATAATTTCT
GATAAATGAACACTTCGGATTCAACATCAAAGAGCACATCTGGCATGTTT
TGAGGCCCTTATTACTGAGATGGGGAGAGCGGGAGGCTTCCATTTGAAAC
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TGTGTGAATCTCATCTAGGCGTACCAAAAGTAACCTTCATAAAAAGTAAC
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AATTTTATCTTAATTGAAGGAGACGCCATTTTGGGGGCTCAAAGTTGATA
TTTTTACTCCCTAAAATGGACAAATTTCCAATAAATCTTGCTAACACTTC
ATCAAATGGTTTTAAGAACAAGAAAACAAACATTTAATATCTACATTGAC
TACTACTTGATGATAATGATAATTTGAATTAAATCAAAGTAATATGCACT
AAAAATGGCTAGACTTGTACTTTTTTTTGGATCGATTAAGGACAAGAAAA
GTAGGATAATAGAGAAAAATATCTTATTATTTCCATTCTTATACTTCATT
TTTATCTTAAAAAATGAAAATAAGATCGTATAACGATGTAATACGATATT
TTTAATACATTTTAAAGTAAAATATATGGTATAGTAAAACTAGGCAAAAT
AGTGATTACATTTTTATAGAGAGTAAGACGTAAGTCCTTTTATTTGTTAG
TCCCATTATGACATTTCATTAATTCTCTATTTTCCTTAATATTGATGGAC
AATTGATTTTCATTGTTATAGAACATAGTTGTTAAGGCCCCCAAAATGGC
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AATAGACGGGTCTATCCCTCTGGTTTTGACTGAAAGAGGTATATATTGTG
TAAAACTTTTTTATCATGTCAATAATATCATTTTTTTATTTCATATATTA
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TCCCCTCTCTTGGAGAGCGTTGGGCCCCCTCAATATTTGCTAACATAATT
GATTAACCTATGAATCATGTTAAATAACATTAGTGAGGGAAAAGTACAAG
TTTATTTTCTTCAATGCCACTCAAATAGAACATGGCATACCAACAAATAT
ATTGTAGATGCAATTAAACTGAAAAGCACTACAGGAAAGCCTATTTTGAA
GAAGTCCCAAAAATATATCTTATAGCCATGTTGCTCTGCAATCCAAGCAG
CGACCAGATTGGCTGATGCTCCAACCAGTGTTCCATTCCCTCCTAGACAT
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TGTTATAGACTTTATAACGGGTATCATCATCGTTGTAAAAGGGATGTTAT
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ATTTCCCATGGCCTCCAAAACGCCCAATGACTCCAATGTGCCCATGATAA
CGAATAAACATGCGAAAAATATCAAAGTACTCCATTCTACTTTCGATAAA
ACGGACTCAATTCGGTGTACATCAGCCAGAATGATAAGTGAGATGGCTCC
AGAAAGAGATATCCAACTCATGGATATCTCAATATGTAAAACATTATTTA
AACAGAATAACAAGATCATTGCACTTAAAACAGTCAATGTCTTTAGGAGA
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TGAGGATTTTGTTTCTCGTGAATGATGACTACTCTGGAGGCGCATGATCT
CTATATTCAAATCCGCTACTTTGAATCTGGTTAAAGTCTTGACTTTTCGC
TCTTGTTTTGTGAGTGTAGGCAGGTGATTATAGATTCTTATTGTTTAACA
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TGCACCGCTTTCAGGACACTTATTTGAAAAAAATGACTCTATGTAATTTC
TTTCTTTCTTAGACCCATGAAATTATAATTTAAAACAAGGCGCACTAATA
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GCCTGTACAAGGTCCACTTTTTACAATATTTCTTTATGTTTTTCAGTATG
GTTAGGCAATAAAAACATTTTATTCATCATTAATTATTTAAAGTAATGTA
TCCCAGACAAGATGCTTGTAAAATAATTGTAAAATTTAATCTTCATCGGG
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ATCGGAACTTAACTAATATTTATTCAGCAACCTTTTTAATTTTTAAACTG
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GGGGTCGGAATAAATCCAAACTTCGCGTTATGCAATATCAGCAGTGTTTG
AAACTGCATTATGCGGGGACTTCCTGTACTTAAAATATAGCATTTTTAAC
TCATATAATCATATTTGAGGATGGTAGAAGACGTTTAAAAATGGCAAATT
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GCATTAAAAATTAAACTTAAATCTCTTGCACTCAAAAATATTTAAAGTTA
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AATATGGGCTTTAGTTGCATTAGTATATTTGAAACTAAATTGTTATTATT
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ATATAGGTTCCACCTCCTACTTTGTAAAGTTTGACAAATCTATACCAAAA
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TGGATATCTCCTCTTTTAGTCTCCTCATGGTTGAACCAGTCTGGTCTAAG
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TCTCCACATCCAACCAAGACATTAAGTGATTGAATGTGGGTCTGGCATTG
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CGATCGATGCACAAACTCTCCAATGATCAGTATATATAGTCCGATTAAGC
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GATTTGTAGAGTCGTGTCAAATGGGTTATGTCCATTCAGGTTGAGAACAA
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TAATATTTTGGAATGAAGGATATGCTGACATTTTGAAAAATTTTAGAGTC
TTCTTCTCTGTCATGAAGAAGAATAACTAATTCTTCATATTCCTCAGTTT
TTTGATGAGTTATTTCATCAAATGATCCTCCTAATGTGAGGTGAAATGTA
TTTGGATGAGGATTATTCATAAATATGTCAACTGGAAGTTCAATGGGTTT
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ACCTGTAAAAAAAGATAACTTTGAGTCTTAAATCCTTTAGTAGTAAATTG
CAGAAACATCCACAATTCCATGCATATTTAATTCAGGAATATATATATTA
TATTGATGTAAGGGAGATGGCGACAGTTTGAAAAATATGGGAAAATAGAA
CGATTAACACGGCGTTACTTCACTTTATGTTTATGTTTCTACATCTTTTC
TCCTAGTTAGTGTTCTGAACGTTGATTGGTTGAATTAGAATGAGTTCATT
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AAGCAACAGAAAAAAAGAAGACCAAAATCAGTTTGTCGTTGTCCAATTTT
TCCCAACAATTAATTATCATTCAATAATTAATTGTTGGGAGTTGTTCACA
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TTTACGTCATCTGCGAGCATCGAAAGCGACATCTCACGAGGAAAAACATT
TTTTTCATAGCCAACTAAATTTGATCAAAAATTAATCACATGGTAATAGA
TTTAAAAAAAAATGAACGGTTAGATATTCATGATTCAAATTTTTCAGAAA
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ACTTTCTGCTTCTGACTCAATTACTATAAGCTCAAAAATCATTCCTCAAT
AACTGTTATTTAGTTTAATTTCTAACTCAAATTCGATGTATCAAGTTCGA
GATTCGAGTATCGCAAGGGTCGCCCTGAATAGTTGCAATATTGGGCAAGT
CATTATCAAATGCAATTTGTGAAAAACTACTAGTCAGGGTCGTAATCACC
GGTGGCTTGGGCCCCAATAATTTTTTCAGTAGTAGTATTTATAAGTTATG
CGAGGATGCAAAAAAAATCCCGATGCCGATTCTAATTCGTAATATTTTAA
ATAATAGTTAAAAAATACCATTGTGTTATCAGGGGCGTCCACAAAATTAT
AATTTAGGGGGTTTGGTTTTTTGAATTCTTTTGAGAAAAAAAAAAAATCC
AAAAATTAAATTTCAAATATTACATTTTTGTAATTTTTTTTTCAAATTTA
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TTAAATTATTTGGGAAAAAATTGCAAAAATCCACAGCTGTTAACAAAAAT
ATTCAAAAATATACAACTATTTACAAAAATGGAAAAAAAAAATCAAAAAT
CCCCTGCAGTTCTCAAAAACATAATTTTTTTTGAAAAAAATTTCAAAAAT
TACATTTCTAATATATAATTTTTCGGAGAAAAATTTCAAAAATACATAGT
TATTCATAGATAATTAAANNNNNCAAAAATATACAACTATTTACAAAAAT
AGGAAAAAAAAAATCAAAAATCCCCTGCAGTTCTACAAAAACATAATTTT
TTTAGAAAAAAATTTCAAAAATTACATTTCTAATATATAATTTTTCGGAG
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATTATTTAATTGGGGGCTATTTTTTTTCA
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CATGCCGATCCCAATTCTATAAAAAAACCAACACTCGATTCTCCGATTCC
GATTAATCGTCCCATCACTAGTANNNNNNNNNNNNNNNTAGTTACTCCAG
MCAGCCCCGCCCCTAATAAAAAAACCCTGATTATGGCACTGCTATTCCAA
TCTATGAAGAGACAAAAGCAAAAACTGTTGCAACTGACCTCCCCACCGTC
TTTCCTACATCAATATTTTGAATATGAATAAAAATCATGTTTCACAAGTT
ATGACTTGTGAGTTGTCTGCGCGGAATTGTTAGTCTACCAAATTGTAATT
CATGCCTTAATAACTCGACCCCACGACCAGGGACTATCATCCTCTTTTTT
TCCTTCCTTGTTGCATTCACTTTCTTCGAGTAGAAGAATACGTTCCTCTA
AGGATCCAGCTTTATTGAAAATACAGGCTCCATAGGGCATTGTTGGAAGA
TGTATGTATTTTGTTTAGCTGAATAATTACTAATAAATTATTACAAAAAC
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TTTATTAGTTGGTAANTAATTAAGTCTACAAGGTTATTTTTTCAAGCCCC
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WCCGGACCACCTTTTACTGCATCCTGATCAATAAGGGAAGCAAGTAGATG
TTTGAAATTTTAATTACTGGCCAACTGTTATTATTTACTCATCCTCATTA
TGCAAATTTTGTGAAGTTAACAGTCATTTTTTGCAATTTTCCTATGAGCA
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TAGTCGACAACATGAGCACACAATACGAGAAGAGGATTGTGATAGCAGCA
CTCCTTTTTCGATGGATTGTCTCAGAAGGCTATCTGGGAGGAGACTGGGT
CCTCGAGGAAGACGATTTACAATGACTCCAACATGCTAGGATCGTGGCCG
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CATCTGTCGTTGTGGGTATTGTGGGATTTGTTTCTCATCCGAATAAAAGA
TGATTCGGTTACCATGGGACTTCAAATCGTGCAGCTATTTTCTTCAGTGG
GCAAACCGAGTATCCTTCATTTTGTGTGTAAGGATATGTTTATTATAGAG
GCGGKATGATTTTATYCTCAAGTTAGGGKCTATTGCCCTGAGAACTGTTG
CACTGTTTAGTTGGTGGTTCTGGCAAAAACGTTAATGTGAGTCCCAGGAG
GAGATACCTTCACGGACGTTTTCAGGCCTATCAGGAATATGGGAGTGTGT
TTTTTTATCATTCCGGGACTTAAAGGTTTTTCTCCTATATGCTATCTCCT
CCTTACAGCGGTTGTAGACGTCGTATACTGCACTCTTTGGAACCCAGAGC
ATCTTCTTGGTGTAGGCTGGGAGGKGTCCCTTGCAAACCAATTCAAAATG
TTTGTTTGAATTGAAAGTTGTGCAAATAACTTAAAGCCAACGCTCAATCT
CCCCCTATGAAATTGAAATAACAGAGTTAAATGTTTTCCTTATTGCTCAG
GGTGTAGTTGAAGATAGTCTGGATTTGGCTGAACGATCCTGTAGTACGGG
TTCTTATCCTTTTGTGGGGAATTTACAACTTTGATCGCTTTGTCATCCAG
ATCCCTTCTATCCTATACCGAGTGTAAATTTAATGATGACTTTTTAAAAA
TGATTGTTGTAGAGGTATAATGAATCTCAAGACAAAAATTCCATGAATAA
AAATGAGTTTGCTGAAGTTGTCATGCGTTTTCAAATATCTCAAAGATTTT
TGTGATGACAAACGAAATTTGTTTTAGGATTTAAATGTAACTTGGTCAAC
TATAGATTAAATCAAACGATTTTTTTAATGGGAAAATATTACCTTTGTTT
GGTGTCAGGCCTTCCATTGCCGCCTGGAAACGATCATTGCCGGTTAGGAG
GTTAAATTAATGATTAAGAGAGCTCAGACACACATCTATTTATTGTATTA
ATTTTGGAGAAATTTTATTGTTATTTAATTAATTATATCTGGATGAAGTT
TAAAATTCAAAATGTTCAGATTTTTATGGACCATTCGGTATAACATTTCT
AAACGAATATTTGGGGTAACTATTAAAATAGCAAAATTTACTTTTGGCAG
TTAAGAAACCCTGTACTATAGTATGAACTGCTTACTCAGTCAAATTAACT
ATTTTTGATGGTACTTAGCCTATATTCATGTGTTTTCATATATTACTAAT
TAATTAATACACAATTATTTTGTTTTGATCAATGATATATTTAATTTTTC
AGTTATAGAAGGCGGTGAAGTTGAGAGTCCAGCATTGCCTGCTCTCCAAG
AAAAGGAGGATGAAGTCTTTGAAGTGGACAATGAAGAATTCGATTCCGAT
ATGGAAGATGACGAAGTTGAATCAGATGAGGCTGATGGCGAGGAGGAGGA
TGAAATTAGTGACGATGCAGATGACGAAGGAGATGGGGAAGAAAATACTC
AAAAATCCGGTTGGGCAGATGCCATGGCCAAAGTATTAAACTCTGCCAAA
GCATCTGAGCCTTCCAAGGTTGTGCTCTCCAAAGCAAGGAAGGACTATGA
AGTAAAGAATAAAACAATCATGAAAAAAAGCGATGATACGGAAGAATCCA
AAAATGAGGCTGAAAAGGAACCTGCAACAAAGACTTTCAAACTTAAACAG
TCTTCCTTACGCTCTCAAAAATTAGCGGTGGAAAGTGTGTCACGAACAAA
GCCTCAGGTTGTTCGCGATAAAGCAAAGGAAAAAAGCCTAAATAAAATCG
CCACAAAGGGTGTCGTACAGCTCTTTAATGCAGTTAAGAAACAACAGGTC
GACCTTAAAAAGGATCTCAACTCTGTGGGAAAATCCATTAGAAAAAGGGA
GAGAGTCTATCAGAGTATCGATAAAAATTCATTTTTGGAGAATGTTTTGG
GCGCTAAGACGACATCCTCTAAAGAAGTTGCGCCATCCAAAGTACCTATA
AATAAAAAGACGGAAGAGTCCATGGATGTTGATGGTGAGGGGAGCTATCC
AAAGAGTTGGTGCGTGCTTCGTGATGATTTCATGATGGGAGCCAAAATGA
AGGATTGGGATAAACAATCTGATAGTGAAGGATGA back to top
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