EMLSAT00000012479, EMLSAT00000012479-708326 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012479
Unique NameEMLSAT00000012479-708326
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s91supercontigLSalAtl2s91:257012..272746 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012479 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012479EMLSAG00000012479-695245Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000056046EMLSAE00000056046-764974Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056047EMLSAE00000056047-764975Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775421auto775421Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012479EMLSAP00000012479Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012479

>EMLSAP00000012479 ID=EMLSAP00000012479|Name=EMLSAP00000012479|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=281bp
MKAKVIEGGEVESPALPALQEKEDEVFEVDNEEFDSDMEDDEVESDEADG
EEEDEISDDADDEGDGEENTQKSGWADAMAKVLNSAKASEPSKVVLSKAR
KDYEVKNKTIMKKSDDTEESKNEAEKEPATKTFKLKQSSLRSQKLAVESV
SRTKPQVVRDKAKEKSLNKIATKGVVQLFNAVKKQQVDLKKDLNSVGKSI
RKRERVYQSIDKNSFLENVLGAKTTSSKEVAPSKVPINKKTEESMDVDGE
GSYPKSWCVLRDDFMMGAKMKDWDKQSDSEG
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mRNA from alignment at LSalAtl2s91:257012..272746-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012479-708326 ID=EMLSAT00000012479-708326|Name=EMLSAT00000012479|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15735bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s91:257012..272746- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAAGGCTAAAGGTATGTTTGAATCCTTTTTATATATATTTTAATTAAT AATAATGTTACACACAGACCCTCGGAGCCTAGGTTTTACTTTATGGCTTT GGATATTAGTTTAGATAATATATTGTATCTTGGGGTTTTCGTATATAATA AGCTAAAAAAGAACCATTTCTTAACTATGTTATTTTGTTGAACGTTTTCA CTTGACGTCAGTGTTGTTAATGTCGGCATTTGGGGGCCTAAACATCCAAG TTAAATAACAATAATCTAATAGTATTAAGAAAAATAGTTAACTATTGGAT GTTGTCAAAACGGTACGAATAAATAGAGGGACTTGAATTTTACTGTCCAA TTAATAATATGTTCATCTACTGCATAGTTAAATTATATTTCTGACCCTAA AATGTATTAAGGTATGTAATTACATCGTTATACAATCTGATTGCTATGTT GTAGATACAAATTAACTAATATAATGGAAATAATGAGATATTTTCCTCTA ATTATACGACTTTTAGCGTCCCTAATTGATCCAAAATAATACTAATTGTG CAAATCTAACCATTTTTAGGTATTTTCTTGGATTTAATTCTAATATCACG GTTTATCCTTTACTTCACGTAGTATTTCAAGCAGATATTAAGTCTTTTTT TATTCATAAAGCTATTTGATGGAGTTTTATCAAGATATATAGGAAATGTG TCCATTTTATGTAGTAAAAATATCAACTTTGAGCCTTCAAAATGGCGCCT CCTTCAATTACAATGCAATTTAAGACGTCAGTGAAAACCTTCTATTTACC TATTTGATTCAAGTGTATATGCTAGTGGATACAGTCTTMTGCTGTATGTT ACATACAAGTTTGAAACCATTTTAAACGTGTATATTATAACCCATTGCAA TTCTGCGAACGGAACTTTCAAAACGTTAAGCTCCCCATTACCCCGAATCA 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AACAAAAAGTTTGATGATATGTGAATCATTATATTTCCGTTCAATAACAA TATTTTATCATTTTTAGCTTGATTATAAGTAGCAAAAAATCTGATCAGTA GTACTAATAGTAAAAAAAACAAAGTTCATAGAGTTAAGTATAAAAAAGAT TGTTGAAAAAGAGTGTGTGTTTTAGTAAAAGAAGTAAGTAACTTGTTGAA AAATAAGGCAGTTCTGAAAGTTGGACAAATTGATGGACACAGTAATAATA ATAATAATAAATAATAGTGATAGTTTAACTAGGAATGTATTATTTTCACT CATAATGAACTTTTTGAAGAATGAATCCATTCTTCATTTTCAGTTGTATG AGGTNGAATACTTTTTAATAAGAAGTTAAATAATGTTCACAATATTCAAT CAACGTCATTTTTATCTATCGGCCTTGACACATCATCGTCCTCATCTTCC TCCGGAATAGCAAGAGTCGGAGTTGTTTCATTGTCCATATTATTACTATT ATTATTAATTTTCGTACTATAAGCAGCAACTTCAGAGATTTTTTTAGCGG GAAGGGTAGCGTATTTTTCTGAATTTCGAATAAAGTTAGTCGTAGATGAA GTTGGCTTGAGTGTGGATGATTTATTTTTATAGAAATTAAAGTCTGGCAT TCGATATACCCAATGCTCAGAGCCTCCTGAAGACGTTGTATTGTTATTAT ATGAAGAGGGTGGCACGGAAGAAGTAGTCCGTCTTTGATAAAATAAAATA TAAGCATCCTTCGTGACAACCTCATTTTTGGATAAAGACTTTGTGCGTAC ATCATCGAAACTGTACCATATTCCGTCTGTGGGGTTTCTGCAAGTTGCAG TATAGTGTCCACCCTGAAGATCACTACCGTGATGATTACAAACAGCGTAT AAGTCGTACATGTAATTGTCTTCTTGAGTCAGGACAGTTGAGCGGGCTAA 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TTCTTTTAACTCTATTAGGAAAAGAGTGTCTTCGTCTATTCCCGTATCTT TGGACAAACACTTTTTTAAACCACCTATTGTCTCATTTTCTTCCACAATG AGCCCTATTTTAACGTGCCTTGGCGTTTGGTCTAAATAAAGGACGTACAC ATATATGGGAACATACTTTTTAGTAGGAGGTATTGGAAGGGAGACGCATA GAAATGGATCAAATGTATTGGAAACACGATCGCATGTCCTACATGTGAGA CTAGATCGAAATTGAGCTTGAAAGACATCCATAACAAAGCTGGAGTTGGA ACGAGCGTAATTATAGAGTGCCTCATGAGCAAGAAATTCTTCCTCAGAGA TGAAAGTCGGTGTTTTCCGCTTTAACTTGTTGGATGAGCAATTCAGATCC TCATGTACACGGTCTAGAAGCCAGAGAAGGAATTCTTGAGCATCTTGTTG TGAGTTGCCTTTATATTGAGGTCCACCATATTTTTCAATGAGGGCCTTGA ATTTGACAGATATTTCTGGCGTGTACTCCAAGGACCAAAGCGACTTGAGG ACTGTGGCGAGCTGTTCAGTGATTTCTCCGTCCCCGACATTTTTTCTTCT ATTGGAAAACTGTAAGAAATAAAGAATAGGGTTCTTAGTGGGGAATGAGT GTTGGACGAGTAGAGCTCGTGATCCGCGATTGCTTCGCATCATTACCTTT TTCTTCTTTTTTTTCCTTTTGAGGTCATGTTTATAATTGTCGAGTACGAG ATATTCGGCGAGGGCTTCTGTGTAGCTCAAGCATTGTAGAACAGCATTGA TGAAGCATGTGTTCCCATGATTCCGTATTCCCATAACACCCGGAACGCGA CTCTCGAAACGTCTTTTCCACTCTTTGATGAGAAAAGAGGAAGAATCATT GTTTTCCTCGGATCCTGGAGTTCCGTTCTTCCCCAATTTGGACAAAAGGT TGAGCACGGAACTCTTGGATCGCTCCCCGAATCGTGCCAATGCAGACATC CCCAAGACTTCACTTATTTTTATTCGATTCAAGCTCCTTCCTTCCTTCAT ATAATATCCATCCACGACTCCTCCCCTTTTTCCTTCTCTTCTTGATTCTT CTGCTTCTTTCCAGCTTCCTCTTTCCAGCTCTAGCTAGCTGCAGATCATA TTCAATTCTCTCTCTTTCTCTCTCTTTACATGTTCATTTAATAATCGCAG GCATGACGAGCTGTTGCCCACTCACTCCCTTTTTAGCTCCTTAAATATTC TCAAATTTACAGAAGTAATGAAATCTCAGCTCCAAACCGATATGTATGAT TCTATAACTATGTATTTCTTCATAAATTCCTTCTATTTATAGGCGTAGAA AACTATATCCCATATTTTCATTTCTTATTTCGCAATATGGCGATCCCCAT TTCCTAACGCCCATCTACTCAAGATTACTCAACCAATACTAAATATAATT TGGTCACTCTGTATTTTAAAGCGCCCTCTCTCTAGGAACACTACCCAAAA AATGAACGCCATCTGTTTATGTAATGATGACGTCGATTGAATCCTCTCGA CATGTTGTTAACGTAATATTTTATTTTTCTTATCTGTCATGTCCCTTTAA ACAACACGGCATTTTTATTTATTATGAATATAAACCTGTTTGAAACATTT GTTTTTGTTTTGTCATCATCATACCTCATGATGACTCACTTTTACTTCCC ATGAAGTTACACCTGTGCATCCATTTAAGCAAGTGGATGGTTGCGTTTAT TTATAGATTTCTGACCAAATGTACATAGTTTGATTCATTCATTTCTAGGA CTTCAAAAGTCCTAGTTCATATTATATCGGGTGCTACGTTGAAATCGGAA CAATAAATAATTTTAAAGAGATACATTGTTTTAGCCATTAGAAATGTGCA ACAAATATTTGGAGAACTGGTGGCGTATTCCAAAGGGTTGTCCTAAGGTG AATACAGGGACCATATTTATTTTAACCATAAATTGACCTTCTTTGAGTAG CTTTGACAATTTGAGCAGGAGTGTCGTCTTATTTCAAGACCACACTGTCA TCTGGGAAGTAGGCCCGACCCCACGGGAGGAAGTGAGTCTCCAGTTTTTA TTTGCTGCATTAAGAAGCGGGCGTATTTTCACGCGAGTGTAACCTTCAGA CCCCATTTTCTTGATAACTTAAAAGAAAAGAAAAACAAATCAAATTTCTA CAGAATGTTATGAAATGTTCAACGTGCCTCACTTTAAATGCCCGTCTTTG AAAAACTCACCAGAACTTAGCAATTTGCAAATAAGCTAGTGTTCAGATTT CAGCGTCGTATCCGGTACTAACATTCATAATAACGGGCTCTCAAGTTTTG AAATCAGTTCCGTGTGAGATTTTTAATCTTACTACGTGACGTTACTACAA TAGTATAATGCCGACATTCAACTGTGCTCTGCAACTTTTAAATAATTTCT GATAAATGAACACTTCGGATTCAACATCAAAGAGCACATCTGGCATGTTT TGAGGCCCTTATTACTGAGATGGGGAGAGCGGGAGGCTTCCATTTGAAAC ATTGTGTGTCTAAATCGGCCATTTTGAACTCTTTTGATGATAGTGCAAAA AGGCGTGATCAATAGAGTGTAAGGTGTGATGTCGTGAGATTAGGTGGAAA TGTGTGAATCTCATCTAGGCGTACCAAAAGTAACCTTCATAAAAAGTAAC CTTCATAAAAAATAACACTTTTCAAATAGAACGTTTTCACTGACATCATA AATTTTATCTTAATTGAAGGAGACGCCATTTTGGGGGCTCAAAGTTGATA TTTTTACTCCCTAAAATGGACAAATTTCCAATAAATCTTGCTAACACTTC ATCAAATGGTTTTAAGAACAAGAAAACAAACATTTAATATCTACATTGAC TACTACTTGATGATAATGATAATTTGAATTAAATCAAAGTAATATGCACT AAAAATGGCTAGACTTGTACTTTTTTTTGGATCGATTAAGGACAAGAAAA GTAGGATAATAGAGAAAAATATCTTATTATTTCCATTCTTATACTTCATT TTTATCTTAAAAAATGAAAATAAGATCGTATAACGATGTAATACGATATT TTTAATACATTTTAAAGTAAAATATATGGTATAGTAAAACTAGGCAAAAT AGTGATTACATTTTTATAGAGAGTAAGACGTAAGTCCTTTTATTTGTTAG TCCCATTATGACATTTCATTAATTCTCTATTTTCCTTAATATTGATGGAC AATTGATTTTCATTGTTATAGAACATAGTTGTTAAGGCCCCCAAAATGGC CAATATTAACAAATAAGGTGCAAATGCTCACTCTATAAATAAAAAATATG AATAGACGGGTCTATCCCTCTGGTTTTGACTGAAAGAGGTATATATTGTG TAAAACTTTTTTATCATGTCAATAATATCATTTTTTTATTTCATATATTA AGTTAAGATCTGTTAAAACAGTGTAGTTTAAAATAATAATTGTAGGACCA TCCCCTCTCTTGGAGAGCGTTGGGCCCCCTCAATATTTGCTAACATAATT GATTAACCTATGAATCATGTTAAATAACATTAGTGAGGGAAAAGTACAAG TTTATTTTCTTCAATGCCACTCAAATAGAACATGGCATACCAACAAATAT ATTGTAGATGCAATTAAACTGAAAAGCACTACAGGAAAGCCTATTTTGAA GAAGTCCCAAAAATATATCTTATAGCCATGTTGCTCTGCAATCCAAGCAG CGACCAGATTGGCTGATGCTCCAACCAGTGTTCCATTCCCTCCTAGACAT GCCCCTAGGGACAATGCCCAAATCATGGGTTCGAGAGGAACCCCTAGATT TGTTATAGACTTTATAACGGGTATCATCATCGTTGTAAAAGGGATGTTAT CCACAAAGGAGCTCATGAGGCCCGATACCCAAAGTATGAGTACTATGGAT GCCACTAATCTTTTATCCGGTTCTAAGGATTGAATGATGACTATGACAGT ATTTCCCATGGCCTCCAAAACGCCCAATGACTCCAATGTGCCCATGATAA CGAATAAACATGCGAAAAATATCAAAGTACTCCATTCTACTTTCGATAAA ACGGACTCAATTCGGTGTACATCAGCCAGAATGATAAGTGAGATGGCTCC AGAAAGAGATATCCAACTCATGGATATCTCAATATGTAAAACATTATTTA AACAGAATAACAAGATCATTGCACTTAAAACAGTCAATGTCTTTAGGAGA AGTAGTGGATTTTGGATTTGACAATCTTTTTGTTGGATTTCGTATTCCAA TGAGGATTTTGTTTCTCGTGAATGATGACTACTCTGGAGGCGCATGATCT CTATATTCAAATCCGCTACTTTGAATCTGGTTAAAGTCTTGACTTTTCGC TCTTGTTTTGTGAGTGTAGGCAGGTGATTATAGATTCTTATTGTTTAACA ATAGGATATATAATTAAGTAAATGAATATTTTATGGGTGTTTGTATATTA TGCACCGCTTTCAGGACACTTATTTGAAAAAAATGACTCTATGTAATTTC TTTCTTTCTTAGACCCATGAAATTATAATTTAAAACAAGGCGCACTAATA ATAATTTTTACTAATAAATCAAATACTCATTGCATTGTTTGGGAACAAGT GCCTGTACAAGGTCCACTTTTTACAATATTTCTTTATGTTTTTCAGTATG GTTAGGCAATAAAAACATTTTATTCATCATTAATTATTTAAAGTAATGTA TCCCAGACAAGATGCTTGTAAAATAATTGTAAAATTTAATCTTCATCGGG TATTTACTTGATTTTTAATCTCGTCATTTCAATACTGCATTATTTAAATA ATCGGAACTTAACTAATATTTATTCAGCAACCTTTTTAATTTTTAAACTG TAAGTTTGTAAAATAAGTAATAACCATTATAGTTTTTTATATTTATTATC ATACTGAATTTATATAACTCTATACGAAGGAATTATACCAAACTGTACGG GGGGTCGGAATAAATCCAAACTTCGCGTTATGCAATATCAGCAGTGTTTG AAACTGCATTATGCGGGGACTTCCTGTACTTAAAATATAGCATTTTTAAC TCATATAATCATATTTGAGGATGGTAGAAGACGTTTAAAAATGGCAAATT TTGACACAACAATCACAATTTTGCAAATAAATATTGTTTGTACGTGAGAC TGGGTTAATATGAGACGCTTTTTCAAAATTACCATTATTTTTTAATCTAT TATAGTCATGAAGTTATACCTTTCACAGTTGATGTATACCTTCATTTTCT GCATTAAAAATTAAACTTAAATCTCTTGCACTCAAAAATATTTAAAGTTA GAGCTCTTTTTGAACAACTCCAAAAACCCATATTACCCCATACTCTGGGT AATATGGGCTTTAGTTGCATTAGTATATTTGAAACTAAATTGTTATTATT TAGTTGCTATTTCGGTTGTTATACATAAACAGTATTATATGATTGATGAA GTAACCTAGACTATATATATACGCTTTGCAAGAAGTGTTTGTTTGCCTTT ATATAGGTTCCACCTCCTACTTTGTAAAGTTTGACAAATCTATACCAAAA TTCAAATTTGTACAAGCCCTGAATGAACCTCCTACATATGTAGGATTTGG AAGGCTAATACCAATATCAGAAACATCTACAAAGCTGTGCCCAATATTAC 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