EMLSAT00000012650, EMLSAT00000012650-708497 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012650
Unique NameEMLSAT00000012650-708497
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s959supercontigLSalAtl2s959:26354..41641 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012650 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012650EMLSAG00000012650-695416Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000056797EMLSAE00000056797-765725Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056798EMLSAE00000056798-765726Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056799EMLSAE00000056799-765727Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056800EMLSAE00000056800-765728Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056801EMLSAE00000056801-765729Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056802EMLSAE00000056802-765730Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056803EMLSAE00000056803-765731Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056804EMLSAE00000056804-765732Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769733auto769733Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012650EMLSAP00000012650Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012650

>EMLSAP00000012650 ID=EMLSAP00000012650|Name=EMLSAP00000012650|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=438bp
MRTPSMRWKKPGIKGVVYCWILCCLVWCVSWYGSLGSPGYDLKALRRVGV
YKESQLHSWSSRAPVVASGEDPGEMGQGVVLAPELDPKKKELFKINQFNL
LASDRIPLNRSLQDVRLPSCRGKVYPALLPSTSVVIVFHNEAWSTLLRTI
YSIINRSPHELLEEIILVDDASEHNHLKDKLENYISSLGVLIHLYRTGKR
SGLIRARLLGAKHARGSVITFLDAHCECTEGWLEPMLSEIANNRKAVVCP
IIDVISDDTFEYRVPQREMNRRGGDRSLPVQTPAMAGGXFSIDKDYFYEI
GTYDEGMDIWGGENLEMSFRVWQCGGILLITPCSHVGHVFRDKSPYTFPG
GVAKIVNKNAARVADVWMDEWRDFYYSMNPGARNVDAGDISERLSLRRSH
NCLDTMGRKSGERLGLGYCHGLGGNQDLFISNILSVRH
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mRNA from alignment at LSalAtl2s959:26354..41641+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012650-708497 ID=EMLSAT00000012650-708497|Name=EMLSAT00000012650|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15288bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s959:26354..41641+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTCTACTCCAGATATTAATAGACAATGTCCTTTCACTTTCTGTTTTCTTT TTTCCTTTTGCCTCTTTCCTCTTTTTTTACTCTATGCATGTGATTGTGAT TTTACGAGGAGTATGAAGATATATGAGGTAGATGAAAAATACTGAGTCGA AAAAGATTGTTGATTAAACAATTGTCAATAGCGTTGACTGTTGTTTTTTG TATGTTTAGTTAAAAGAGTGTTCTTTGGTGTGAGGCAGTGTGTGGGTGTT GCGGGTTGTTGATGCGAACACCAAGTATGCGTTGGAAGAAACCCGGGATT AAAGGTGTTGTGTACTGTTGGATTCTTTGTTGCCTTGTGTGGTGTGTGAG TTGGTATGGATCCCTGGGATCCCCTGGATACGACCTCAAAGCCTTAAGGA GAGTGGGTGTTTACAAGGAGTCGCAACTTCACTCTTGGAGCAGTCGTGCT CCAGTTGTGGCAAGTGGAGAGGATCCTGGCGAAATGGGGCAAGGAGTTGT CCTCGCTCCAGAACTGGATCCAAAGAAAAAGGAACTCTTTAAAATCAATC AATTCAACCTCTTGGCCTCGGATCGCATTCCCTTGAACCGCTCTCTCCAG GACGTGCGCCTCCCTAGGTAGAGTGCTTTTTTTTTCTCTAGCTTGCGAGG TTGTTGAGCAACTCAGGTGGCGTGAGCAGTAGAGCTCGCCTCACTGCATC ACTTGCCATCTCATGTCCGCTCATCTTTTAAGCTGAACCAGTGGGTTTTG GAATTACCTCACATTTTTATTATTATAAATCAAATTGTCTTATTTCAAAT TTAATCCTGTTATACAAATCCCTCAGATGTCGAAATCTTAACGACTAGGA GTTAAATTTTAGTTATATATGCAGATTTTGCACTTCAGTTTTGGGAATAA AATAAGTGCAGATGTAAAGGTGGGACTACAATTTGAAATTTACAAGCTCA ATTTGGTTTGAAACTTATTCCTGGCAATTTCAGGTCTAATTCTTTCAACT TTTTTGCTATAATTTTTATTTTTGTATGTAGTTTTTATCTAAGAATCTAT TTCTTAGTTATATAAGTAAGGTTTTATTATTGCATTTCAATTATTTTCTG AAGTATATTTTAAATTACCATTTTTTAAATCATTGGTGTTTTTTAATTCT CTCTTAATATAATAATCAGCCATTATTTAGCAGTGATGTGTCTCAACGGT TCTCTTAATGTAATACCCAAGTTAAATTTTGTGATTAGAAGTTCTCAAAA ACTATTATATACAGTCAAACCTGGTCTATCAACCACCTGTTTTAAGCATC ATATTAATTTTTCAATTGTTACTAAAAGGAAACTTGATTCAAAAAGCCAA CTGCACCAAGCGGCTAGTTTTTCCCTTAACTAAGTGCTTAATACAGGGTT GCCTATAACAAAAATCAAACACCCTTTACTGCTGTTTAATGAAAAAAAAT AAAACCTAATTGAACCTAATAAACAGAATTGATTGAAACCAAATCCATAA ATTTTTGAATGACCGAATCTAGTATGACAACTACATAGTATTTTATCTTC GACAAATTTTTATAAACCACCTAAATTCGTTAATTAAATTTCAATTACTA CTTGTTACCTCCTAAATCAATGTCAATGCAAATCTTTTTAAGTACAAACC CTTGTAACCAGTACACATCAAAATATTTTAAAATTTTATTTTACCTTAGA AAATATAGTATAATATTAACTTGTTTTAATATAAAATGCATTTACTCCCT TATGATAATAACGTTAACCTCTTCATCGACTTAATTAAATGTTTCAGAAA TTCAGGATGATTTTTTTAAATTTCCAATAACAATAAATAAAGGCTTCATT CTATTCTTAAGATAATGAAATTCGAGTGGGTAAGGAATAATGTCAGATGG ACTCATAAGAAATGGGGATATGTTGTAATTTTTTTTTTGGGAGGGGAGGG GGTAAAAATATGTTCAATTTAGATTATCCCGACAGCTTTTCAATTTTTGG ATGGTCTATACAAATAATTATTTCTTTCAGCGGAGCATTCCTACTTTAAA AGAAAAAAAGAGGAGTTGCAACAACAAAACAAAAATATATTGAGTTGGCC TTGCCAAGTTTCAGACTTTAACCCAATGGAAAATCTGTAGAGAATTTTGT TAAGAAAAAAGTTTATAGCAACCAAAGGCAATTAAATCTTAAGGAAAGCA GTTACCAATATTAGAATGAAATTTCCTTGGCTTCCTGAATAATTTAATTG AATCAATGCTAAAGAGATCTAAAGAAGTATTACAATACAAAAAGATTAAA TGTAATAGTTGAATTTTTGGAGTTTGGTACATAAAAAAATTATTCACTTA TCTTTTTTTATTTATACCACCTTTTAAAAACATTACTACATAAAAAAGTA TTAATCGGCCAAAATTGCTTAAAACCAAATATCCATAATAGTTAATTAAT TTATACATCGTATATTAACGTATAGATTAATGGGTGCAGTTTGTACGGAA TTATAATCACATTTGGAGTGTCGTTAAGATTATTTCCACCACTTAATTGT ACATTTCTAATTTTTTAAATTTATTTAAATAATAGTGGTAGTACTCGGCA TTGCCCGGAGTTATTAGGCATGGACGAACATACAAAATATGCTTGAATAA TATAGAATATAACTGGTTTTACTCTCCGTTTTTCATGAGTACACTTAATG TTTACCTACTCACTCAATACTTAGACGTTTTCTTCTCAAGAATAGAAAGG ATTAACAGGTTGAGAAAAAAGTATATTTGATGAGCCAGAGAGTACTTTAG CTCGTTGCTAAACCTCATCGAAAGTCGCATTCATTCTTTTAAATTTTAGA TGAAGTACTTTCCTTTTTTTATTTTTTAATATAAGTTGAACTGAACGCAT GTTATATTTCACATCGTTTAATACAGTTCTCCTTGTATATTATACTCGTT TTTGTCTTTATACTGTATTGGTATATGATATACATGAGGGAGCACTATAT ACAATGCATTTTATGACTCTTTTTTTTTTTAAATACATTCATACATACTT AGGTGTATAAATATAGATCACCATATATTCAGGAGATATTTTTAATTCAT TGTATGTAAAACTTATAAATATTTGTCATCTTAAGTTTCTATATCCAAGA GTACTGTTGTGTTCGTCTTTATTTGTGACTGATAACTGCATTCCTTTGAA GTTCAGTCTCAGTCCTAAAAACTCTGAAAGTTATGTCCTTGATACTATTT GATTTCTCCATCGTTCAAACATTTATATTACTGACAGTCCGAAGACTGGA TTGAACTGTACCGAATAAATAAGGAATGTCACAACACTAACTGAGCTGCT ATCGACCTCACTATCACCTTAGTAAATTGATTCAAGTTTATCATTTTTAT TCAAATTTTTTATAAGATATCTAAAAAATAAGTAATTTATGGAAAATTGA AGATTATCAACACTTAATAGATATTTTCAATAAGGGAACAAAAGAAATAG AAATCAAGCAACAATTTAGTTTTCGATTCATTCTAAATAATTGACAAAAT ATTGTGTTGTCTATGGTCTATGTACATTTGATGCGAGTTATAGACAAATA AAATCGGAAATCCCATAATCATGGCATAAAAACATGGATCACTTAGATAA GAAAAATTACATCTTCAGATTCATAATAAAATACCTGATGCACTTGTAAA TCGTCGGTAACAAGATGGTTCAGTAACTATTACTTAAATATTTCTCTATG TATTTAAAAAAATTATACGATTATTTTGACTTGTAAGATTTTAATAAGTT TTTCCGTGAGTTACGAGAAAAACTATGTATTTATCGTTTTTTTTGGGGGG GGGGGGCGAAAAATGTGAAATATTTAATTCAATTTCTGATTAAATTTTAC TGGGACGCGAACACGTCACTACTACATAGTAATGTATTGTAATGTCCCAA CAACGAATATTTTCTTCACTGTAAATCGTGCTAGAATATTAGTATTTAGA ATGATTCATGTTTACATTTTTTATTACAATTTTCTCTCTTAGTTGTCGTG GTAAAGTTTATCCAGCACTCCTTCCTTCGACAAGTGTTGTGATAGTATTT CATAATGAAGCCTGGTCAACTCTTCTTCGCACAATATATTCAATTATCAA CCGTTCTCCACATGAATTACTTGAGGAAATCATACTTGTCGATGATGCTT CCGAGCACAATCACCTGAAAGATAAACTTGAAAATTACATCTCGAGTCTT GGTGTATTAATTCATTTATACCGAACAGGAAAGCGATCTGGATTAATCAG AGCTCGACTTTTGGGAGCCAAACATGCAAGAGGTTCTGTCATAACATTTT TAGATGCACATTGTGAATGTACTGAGGGATGGTTAGAACCTATGCTGTCA GAAATCGCTAATAATAGAAAAGCTGTTGTTTGTCCTATAATTGATGTAAT ATCTGATGATACTTTTGAGTATATTACTGCTTCAGATATGACTTGGGGTG GATTTAATTGGAAATTAAATTTTAGATGGTGAGGTTAAAGAAAAAGCACA GCAATTTGATTTCAATGCTAATTTTGTGTAAGGTATCGTGTTCCTCAACG AGAAATGAATCGACGTGGGGGGGACCGTTCTCTTCCAGTTCAAACTCCAG CTATGGCGGGKGGGSTCTTTTCTATTGATAAAGACTATTTTTACGAAATT GGAACTTATGATGAAGGAATGGATATATGGGGCGGTGAAAATCTTGAAAT 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GCTTATTTATATTAGTTTTTTAATTTTGTTATAAAAAAATAATTAACCTT AACCTAAGTTTTAGATCTTATTTTCAATATTTCAAGGTTGAGTGCTCTGA GTTCTTTTAAATTCATCGGGATACTTAACATTATTTTTTGAACAAATTAG TAGGGTGGGAGAAATAAGTTAGTTTTTGCCTATCTACTTCTTTTTTTTCA ATTTAACTTTTGATTATCTTATGGAATATTAAATTAATAAGAATTTTTTT TTTTTTTGTCAAAAGTTCCGAAATTAATTATAATTAAGTCGAATAGATGT GTTACATCTAATCAATAAAATACATAGGATATGAAACATACTTAAATTGC TGTTATATTTCTGCCTCTAAAATATTAATTACTTATTATAATTTGTCAAA TAATCGACTAAGATATATGTTATTTCGTAAAAAATTCACGCAACCTTACA TATATTTTTATTAATCCAATCACTACTATATATAAATGGACTTCAACCAA AATATAACCTGTACATTTGGGAACACCACTACGAAAGCGATGTATAAGTA TAAAAGCGTCCAAATATCACTCATTTATCTACATTTTAATAAAATGAAAT TTCACTTAGTTAAAATTATGAAAATACTCGATAAATGCACCTAAAGCTTT GGACAACTTCCTAAGAATTAATCAAAATAGATATGTATTTCAATGCTTAA TTAATATCATGGAACCAATTTCTTCTCAGATCTCTACTTTTTTATCTTAT CCGGAATATTGATTCAGGGTAATCATTCTTAGCATAAAATTCAAGACCAT AAGTGGTAATTTCCTGGAACAAGGCATCTGCTATCTTGACTTTGGTTTTT CTGGATCAAATAACAGAAATAACTTTTTCACACTATCACAAGGGTTTATG CGTATCCAATTTGCTGTTCCAAAGCTCTTAATTGTACATTATTTTTTTTT GCCGATTATCTATCAAGCAATTATGCAACTGGCTCAGAACCATCAGGTGT TCTTGCTTCTACAACTTGTTAGAATATTTTTCTCATAATTTTATTATCTT GTTTTGATAAAAGGCAGCAGTGCAATCCTGTCTTCACGTTTGTTAGTTAT GCTCTTGATCATCACACAGAGCAAAGAGTAGCATCTCCATGTTCAATGAC GTTAAATTTTCGTCTTGCATACTCACTAACTTTTGCACTAAAATGAAAAA TATATCCATCTACTTACTTTTTTATCGGTCTCCATTCCATAGATTATCAA TGCAATGGTGACGACAGAGTTATCTTGCCACTGCGTCATATTGATTTCGT TGTTCCTAGAGCATGATGTAACCATTTCCATAGATCCTCTCCATTTTAAT AACTTTTTTTTGTAATGGAAAGTTTTTACACAAACGATTGACTCTCATGG TGCCTGTCCCATTATATCCTCGCTTTTGTAGTTTATCAAGTAGGGGTAAA GTATTGAACAGATTCTCAAACATGATGTGATGTGGCAATTTTTTTTATCA ATACTAAGTCCATTCAGGAGGTGTAGAACAAATGAAGCGCTTTTTCTATA ACATATTACTAAATTTTGATTTTCAAAACTAGATTTACCCTGGTAAGGTT CGAAGTTAACACAGTATCCGAAATCAGAATTTAGACACCAAATTTTAAAT CCGAATCGGATTGGCTTATGTCGTATAGCCTGCTTGCATCCATGTTGGCC AAAATATTGAACCATGGATTCATCATGTGACAAATTTTTGTTGGGATACG TTTTACGCAATTTTTTTTAAAGTGTTCGACAATAGGGCGAATTTTTGAGA ATCGATCTGTTTTTACGAGATAATTATTTATTTTGATATGCTAATCTTTC ATGGTTGGGATTTTCAATGTCAGCTTCAGCCATCAACGGATTTTTATTGA 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CTAAAAAGTTTAACGTATGGTAAATTTATTATTAACCAATTCTAGGAAAT TTAATATAATTTATAGTAAGTTATATTATATAATGTGATAATTTCTTTAA TTTTCGCCAATTTCTTTGTTTTTTTGCACATTTAGACTATTAATAAGTTC CTTAATTCTAATAAAGTTTCTTAGTCGAGCATATTTCATTGTGACATCCT GAAGGAAATTTGGAACTGACAATTTGAGAACGGATATTCATGACTCAATA AATTTATCAAAGATTGCCTCGAATTGTTTTGTTTTAGTAATAAATGAACT TTTTGACTTGGTCAACCATCCTCTGGATAAAGTTGATATCCATGGTGTTA AATCACCAATTCCTTGAATACCACAGTCCAAGGTGGAAAAGGAAGAATCT GTTAATACTTCTTGTTCCAAAATAGGATTTAAGGCTAATCCAGGTGCTAA TAGTAACGCATCATCATATTCTTCATAATCAATTTTTGGTTCATTCACTT CTTGTTTCAAGTCCTTTATTAAACAACCAAGGAAGTTGTTGTTTTCTTTA CCTTAAATTTGATCTGCTGATGATCCAGTATGCGTCCTATCAGCTTGACC AAAGATAACTAATCGGAGTCCATTTATACAATCAACACTAGTTGGATGGC CATTCGAGACTCCAAGGACCCTCAAACGCGAGAAAAAGTATTGCAAGCAA TCCTGATTCAATCACGAAGTAAGGATGTAATTTATTCCAGATGATTCCCT GAAATCTTCGAATCTTCAAAACAGTTATTCTMAAAATTATAGSGGTTGAA ACATTTAATAAAYCCTGCCTATGGCAGGSTTGAATCAATTTGTAATGGAT ATTGTCATTTTTAGGAAATCGATGTTAAGAATATTCCGGATCTGAATCAA TGTGATAGGTTAAGCAGGTAGCCACAGCACAAGTCTTCTTTTACGAGTAT CTATTTTACAGGTAAGAAATTCTGGATATTTTCCGATGAGGAAAATGTAT GGATATCCAATTCTAAGGTTAAGAGACAACTTAAGATAGAGAAGTGTCAA TTAAGTGTAACCAAATACATAGGAGCTCCATTATTTATGTACGATTGGTT CATGCGCAATGTCCATTGAATCTCAATCAATGTTGGATTTATTGACTTTT TCTCTTCTTTTAATATTTTTTCTCTTTCTAATTTATTTGTTTAATTAATT CATGATGTTTATTCTAATAGCGGTTGGAGCCAACTGTTGAAGCATCCTTA TAACCAAATGAACCAACTATGATTAAATGAACATTACTTAAAGTAATTTT TTGTGAGTAATTAAATTATTTTTCTTTTAAAATTGGTTGACATGAATGGG AATCAATTTTTTTATTTTTTTGTAAGATTTGGTTTTACCATGTTAAAAAT ATGAAAAATTCAACCTCGAAATAATGATAATTTCAATAAAATATAAGTAT GTATGTAAAAAAATCAGAAGTTATCTTGTATGAAAGAAAATCATACAATA TTTTGTTAAGTTAAATTATATTTATTACTAGTGGAGGGGGTTCCCGTTCC AAGCTAAATTAAGCATATATTTTTTCTTATTAAGAGAGGGTGAGGATGGT GGGATCTAGAAAAACTCAACTACGAAAAATTTGTATTGGGAAAGTTTGTC CTGGGATTACTCCCACTGGAAAAATTTATATAGGATAAAGCTCGCCGGGC AAACGACTCGCCTCACTTTATTAAATGTAAATAATAATCTCACTTAGTTA TGTAATGACTTATGTGTTTGAACCGGGGACAAAATAAGTAAAATTATTAA ATAGAAGATTAAAGAAAAATAAACTAACAAAACAGCAATTAGAATGGATG AAATGCTAATTACTTAATAATTCGTAATTAATAAATATTATTAGAGAGCC 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CTCACTTCACACGATATTATGTGTTTCCCCCCCCCTAATGTTATAATTAT TACTATTTAGATTAAAAATGAAGGATCTCACAATTGCTTAGACACCATGG GACGAAAAAGTGGAGAAAGATTAGGCTTAGGTTATTGCCATGGTCTTGGA GGCAATCAAGTAAATATATTTTTGAAGAAAAAAAAATTATGTTACATTTA TCAACGTTTATCTATCTTTGCAGGTTTTTTCTTATACTAAAAGACAGCAG ATAATGTCGGATGATAATTGTTNTGGACGCCTCTGGTACAGTGGGTATTG TGAAACTTGTACGTTGTCACGGAATGGAAGGAAATCAAGCATGGAGATTT ATTACTGATGTAAATATTGTAACTATAATTTTAGTAGGAACATTTCATAA AATTTATCTTCTTAAGAACTATTTGTTGAGAATTTTTTATATAATGGGTC GAATTCCTAAGTTGTCAAAAAAATTGCAGCAGCTTGTGATTTTCATTATC ATTTATTTACTTTTTTTAAGGACCTTTTTATATCGAACATCTTGAGTGTT AGGCATTAAGTCATACAAGGGAGAAAAAAAATTGGGTTGAGTTGAAAGGC TCATGTTCAGTTTCGATAAAGTAAGTTGTCAGATTATTAGATATAAAAAA AGAATAATAATAATATCTAAAAGGAGATAGAAAACCGCAAAAAATGCGTG CAGTTGTMCCCGCCTTAACCAACATTTTTCATAATACTTAACTTGTTAAG AGTATATAAAAGTTTATGTATACATGCAATATGCTTGCGAGATCAAATTA ATATGACTATGTTGTTGTTTCTTAAATCAAATATATGAATATAAACATAG ATGAAATTAATACTTGCCCTGACAATTTGGAGAAGAGCAGCTTTTGTCAT GAAGTTTCATTAAATTAGCTGCAAGCAGTTATGAGAAGAAAGAAATAAAC ACAAACCCCACTCCGTATCTAAGAATGATATACGCAGGAATTAGTCAGTT TTCGAATCTCATTACTGAAAGTCCAATTAGGAAAAAAA
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