EMLSAT00000012652, EMLSAT00000012652-708499 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012652
Unique NameEMLSAT00000012652-708499
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s959supercontigLSalAtl2s959:61035..88076 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012652 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012652EMLSAG00000012652-695418Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000056807EMLSAE00000056807-765735Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056808EMLSAE00000056808-765736Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056809EMLSAE00000056809-765737Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056810EMLSAE00000056810-765738Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056811EMLSAE00000056811-765739Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056812EMLSAE00000056812-765740Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056813EMLSAE00000056813-765741Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771021auto771021Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012652EMLSAP00000012652Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012652

>EMLSAP00000012652 ID=EMLSAP00000012652|Name=EMLSAP00000012652|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=503bp
MPWPKLDSANSSKATVSNVDSTMFQSKLRFQIRHEDFRQKIDNNDGDINA
ILKWYKVADAIFLTQLSSEIKLTNKSSVWRYLVAYKNLLKNLGIAVVYGI
RYYGQGNITEDNYIQFIRHDTLSSEYLNKSQNFVKEVRQDLNELKQKGNS
YKTWEKSRLEVMHRLSRKQASPFEAFRYYQATYRYTEGLRLVLKNLRRKI
NKIVGKNLYSANKQQVFGIVVLVLVLIISPVIILLVRNATLTIQVFSLSL
AKKAQELKLEKRKSDKLLYQMLPPTVAESLXANKPVTSETFESVTVYFSD
IVGFNELAAESTPMQVVTLLNSLYKLFDARIDRYDVYKVETINDSYMVAS
GLPVRNGDKHAAEIATMALDLLTRSSTFIIPHRQGEKLQLRIGIHTGPVV
AGVVGSKMPRYCLFGDTVNTASRMETNGEAMKIHISMETKLLLDTLGRYK
TERRGLVEIKGKGLLDTYWLLGRDDGLQDVVHINESYNTEEGPDYMEELK
AFR
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mRNA from alignment at LSalAtl2s959:61035..88076-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012652-708499 ID=EMLSAT00000012652-708499|Name=EMLSAT00000012652|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27042bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s959:61035..88076- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCCGTGGCCAAAATTGGATTCAGCTAATAGCAGCAAGGCCACGGTAAG TAATGTTGATTCAACGATGTTTCAATCCAAACTGAGATTTCAAATTAGAC ATGAAGATTTTCGCCAAAAGATTGATAATAATGACGGAGATATCAATGCT ATTCTTAAATGGTACAAAGTTGCTGATGCCATATTTTTGACTCAATTATC ATCTGAAATCAAATTAACTAATAAAAGTAGCGTTTGGAGGTAAGGATAAT ATAATTTAACTTTATAATAAAGCTTAGGTAAGCAACTTCGTTGACCTTCT AAGTTAAAAAAAAACCACAATATCCCTTCAATAGTTATAAAACTGCCGTC ACATTTGCCTCCCAGGATCGCCATTTCTGGACCTAACTTCGTTTACATAA TATAAATATATCACAAATAATCAACTTTTCATATAAAGCTGGCTCACAAG CTTTTACTTAAGGTTTTATATCAAGCCACGAATGAGAAGACCAATGTCAA ATTTGCTGACGCCGTCTAAAGAAAATTTTGTAGATTCTATAATTTTTAAA GGACTATTAGGGTTTTTATTTATTTCTATCTTTGAGCTTATCGGTTTATT TAGTATTCGTAAAGCAGAGGAGGACGCCCAAAAAAATTTCAAGTTTTATA TTCTTAAAATTTAAGGTCGGAGCAGAAAAAAATTCCATGTCTCTGCTAAA AAATTAAGCTAACCTCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAATCCTACGT ACGTCTCTGTTTCTCCAACTCATACTGATTATCATATGCAGTGATCAGAG AATTTACTACCCACATCTACGGCGAAATCAACATTTCTGAGACAAAAACT GCTGAAATAGTAAAAATACTTGTTTGGAATTGACTGGAAATTCATCATCT CTAGAGCTCATAACCAACTTGGAATCTCCGAAAGTCTAGTTAAAAACACA AAAAAATGTCCTTCATCAGCAGTTATGTTTGAATAATTTATCTTCAGACC AGTTGTCGATTAAGGATGTTTTTATTTAGTTTTTAATCTTGTATCTTTTG TAAGAAGTCTACATAATTAAGTTTTAATTTAAAAAAAATAGTATTTGAAT CTAGAACGTTAAGTTAAGTAGCAAAGTTGATTTTTTTTATTTTAAATAAA TTTATCAAGGTCAGTTGCTGAAATTTTTAAATTTCCGTTAAATGAATTAT CTCTCTCTATATATAATAGAGTTTGTGCGTGCCCTTTTTGCGTGCCCAGA TTCTTAGATTGAGGAAGTTGAAATTTTGCATGGGTGCCACTTTTGAACCA GGTGAGGATAAAATGGGGTATAGATTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGMAA TATAAGGCGGTTTTATCCTATACCCAAAACACAAAAACGGTTTTTGGTAG CTCATGCAGACTTGATAGGTTGGTGAACAAAAGATCAAATAGTGATAGGC ATCTCCAATATAACTATAAAATTATGTACTTTTTCTAAATTTATTCAAAA TTGAAAAAGTTAAAAGGGAAAAAACGAAATCGCTAAAATTTGTAGTTTAT TTTTTTAGGTGCACAAAAATGGATTTCCAATTTAATTAATGGATTTGTAC TCAATATGAAGTATACAGAAATTTGTCTGGAAATTCGTTTGCATATCAAT ATGGCACATTGATGTTTTACTGAAATATCTGTCATTTTTTTATTAATGTT TCAATTTTTTATTTTTTTTCAAAGTTATTATTCTATATAACTTTTTTGTT TTTGCAAGTACGAAAAAAATCTAGGTAGCTTTGTTTTTCTCTTTTCAATG ACAATAAATTCTATTAACTATTTTTTGTTCAAATTTATTGCAAAATAGTT TTTTGCAATTTCCTTTGCTAATTGTAATTTGGCACTTTTTTGAGTAATGA TAAAGATGTACTTTTCAATTAGACAAATTTTTTCATGCATATTTATTGGT ATTTTTAAAAAAGTTTATATGACAATTTTATATTATAAACAGGTGCTATA TTATTTTACTCGCCTTCATCTAAGGGATCTAAACATTCAGAAGAAATGAC ATTGACAATCGTCAATGTGATTTCCCGTTCCCTCCTTGGCCCCAGCGACG CTGGGTAACCCATTGTTATTTTGTATAAAAAAGGAAATGAAGCAGTCTAA ATATTAATAAGTATACAATTGAGCTTTTAAATACTATTTTATCTATCTCT TCTTTTTTCTTGCTTCTTTCTTTAATAAAGTTAAATTCACGTCGATATTG AACTAAATACTCTTTTGTAAATTAAATTATAATCATTAACGCTTCAAATA AGTTCCTTTTGTATAAAAACAATGGAAAAATTATTCTTTTTAATCAAAAG CTTTATAATATGGTGGGGTTTTTTAAACTTTAAATTGCCTTCCCGCAAGA TTAGATTATCATATATCAAACATATCCCCACATTTGAAATTAGCATAACA TTTTACAAAAGAAAAATTCATTTTTATGTTAAATATTAATATTTTATGTC TAAATTTTGTTATATAGTGTTATTATTGCGACTTTCAAATGCTAACTATA TTTTTAAACATTCTTTTTATTTTTTAAATAAAAAAAGGTATTTGGTTGCT TACAAAAATTTACTAAGTNGCAATAGAAAATTTGGGTATTGCAGTAGTTT ATGGAATTCGATATTATGGGCAAGGAAATATAACTGAAGACAATTACATT CAATTTATTCGTCATGATACTTTAAGTTCAGAATATCTAAATAAATCGCA AAATTTTGTAAAGGAAGTTCGTCAAGACCTTAATGAATTAAAGCAGAAGG GAAACTCTTACAAAACTTGGGAAAAATCTCGACTCGAAGTTATGCATAGG 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AAGCCAATCAGCCTAGTAAAAAACCTTGTTACGTCTATCATGGACTACTA AAGAGAAGGACTGGAGGTATAATTGAGATAGCTATTGACTGCAGTCCTCG AATTTAAATATTTTTTCAATCATTTTTCCTCATTCATTTGTTTGTTTCAC TTTTATAACTTCACAAATGTTAAGAATAAATTAGGTCGAAGGAATTCAGT CAACAGCTGTCTTAATTATATATTCAGTCCTTGGCTCGATATCTTTATTT CCCAATGATATTATACTAAATACAGAGGTGTATAAAATATATCCTAAAAA GCGGAACTGACTTTTTCTAGACAACAATTTAAACATATTTTTTTTATTTT CCAAAACTGTTGTCATTATTATTTAATTCTAGAATGCAAAACATCTAAAT ATAAAGTAATAACTAATGTGTGTGCTTATGAGCGAGAGAGTGTAACACTG GGGATTTGTTCGGGAATTTATAAGTTAGATTCATAGTAGAATCTAGGATA GATATTGAAATAATTCAAGTCTATATATTCTTGCTATATGCGGAGGGTAT TTGTGTTCCTTTCCCTCACGACTGATCGTAACTGATCTAATAAAACTTCA TGATAGCTGTGTAGTATTCACAGTGATGAATATTCTATGTCCCGCAAGTA TGTTAAAAAAAAGAAACCAAAAATTAATTTGGTAACCCTCATAATTCGAA GAATGTTTGAGAGTAGAGCAGCTTAGCTGTCATGACGTTTTATTAGATTA GCTGTGAGCAGTACTGAGAGAGATGGAAGGAAAGAAAGAAAACACAAATC ATACTCCATATATACATAGAAAAAAGTAAGGACATAGATAAAAACTACTC GAATGAATATCCTCAATTCAAATCTGAGTACAACGAGGACTAACATCTGT AATTCCAAAAAAGATTATCATTCTTACTCTGCTTCTTTCATAAGATCACG 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GGCATACCATCTTTGTAATCACGGAAGTATAGTTCCAGAAGTTGTTCAAA GTAGAACGACACAGTAGAACCCAAATTCAAGAAAGGAATTTGGAACTGTG TAAAAGTCATATAATTAATTCCAATAATCAACATTCCAATTTTGCAGAAG ATATGCCCAAAAATGATTGCATCCTTCAATATTCCTCCATATAGTTAATC ATCCAAANGTTGACCAARMTTTWTAAAAAAAACTTGAGGGGAAGGATATA TTTCTTGTATTGGACGAAACTACTGACATTTGACAGAAGTCCATGACTGC AGTGTTGGTTAATTTTTGGGTGGTCCTTATCTCATTAATTTGGAAGGTAT CAAATGATAACAAGTGTTGCNNNNNNNNNNNNTGGCAAGGTTCTTGTCTC TTATTTCAGAGGCGAAAGACTGAAGATTTTCGTTACCAATGGAGCTTCAT ATTGTATTAAAGTAACCCAAAAACCTTAAACAACATTTTCCAATTATGTT GCATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNGCTCATACGCTGAACAGAGTAGCAACGCTCTGACCTGATTTC TTTTAAAATACAAACACTATCATCTCTGAAGTGAATATATATTTTTTTAA TTCAAGTGATCCAAAAAAATTGACTACTACGCCAAGCACTTCAATTAAAG AGTATATGAATATTATGTATGGAAACAATGATGCAATCTATATAACAAAA GATGTTTTGAAGAATGATCAACTTTTGTAGGATATAATGTTTATTCAACA CAATTATAATCCAATCCAGGTAACCAATAAAGCTTTGAAAGAGAAATTAT CGCTACTCCCAAGTGTAACTTTCGTAGAAAATCTATTCCAAGWTWTTACG 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