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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s95 | supercontig | LSalAtl2s95:1052970..1062187 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012656 >EMLSAP00000012656 ID=EMLSAP00000012656|Name=EMLSAP00000012656|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1120bp
MDPMERLNDVSVQFMEDRKEIEDRIEKLSLELKATGKKKKNFLSKSLREM
KLGTINALQAKLRTKLFEMEEFQSRILEILSLNPPNKEKKLHLEIDIFSK
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MGSYTLKKYVFHKLKKLRNDLNIKISINSAERGITNFFEIDISLEKGSIS
TWCHPENESIVVPSVKSLLNTALEEVLNEKMNIPLDEKSNLLVIGASGRG
IYHFNSKSYSSFKIVHKNESDKVELPIKQIEELMTNNGIDFDFLKRKDEP
CFSFKQSQVGIQARSLVLEHYSDVLKFLAMPSKKCSSVNVRVNVPSYDIG
QKIFQNNRDFASLENGEYMSSTLCVKQVFVIPTRAVHLIKMQFKAYERNM
LFRDSGDDTIISVLDTHFSNHSSSVGLLSNTKFLQSIQVLSVMDIKSAIS
SSESVKKIFYEKCQKYYLLSSGIKSCPKSECDAFFQVSENNEASICCKTC
SSIICSECWVLKYLCDCCAF back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s95:1052970..1062187- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012656-708503 ID=EMLSAT00000012656-708503|Name=EMLSAT00000012656|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9218bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s95:1052970..1062187- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGATCCTATGGAGAGACTCAACGATGTGTCAGTTCAGTTTATGGAGGA
TAGAAAAGAAATCGAAGATCGTATTGAAAAGCTAAGTTTGGAGCTTAAAG
CCACAGGGAAAAAGAAAAAGAACTTTTTATCTAAATCATTGAGAGAGATG
AAATTGGGCACAATTAATGCTCTTCAAGCCAAGTTGAGGACGAAACTATT
TGAAATGGAAGAGTTTCAATCTCGCATTCTTGAAATTTTGTCTTTGAATC
CCCCAAATAAGGAAAAAAAGGTACATTTCTTGTACTTGATTTTTATGATT
TCTTGACTATTGTCTACTTTTATTAGTTACATTTAGAAATTGATATTTTT
TCGAAGCATCTACCAATTTACCGATTTAGGAGTACAATTTTAGAATCCAT
TGAAAAAAATGACGTAACGATACTTGTTGCTGAAACGGGTTCTGGGAAAT
CGACGCTCGTAACTCAATTTTTGCATACAAATGATGAAGATATTGTAATA
TATTGTTGTCAGCCACGAAAATTAGCAGCAAATGGATTAATGGAGTACAC
AAATACTTGTCTTGGTAAAATATCTGTCCACCACGTACAGAAGGTCCTTC
CATAACGCACTTTTTAAGAACATGAAAATTCTGTTTTATATGAAATCCGG
GACTATATTAGTACAAACCCCGTAACATGGGATATTTAAAAAAAATAAAG
TCTACTCTTGAAAACCCTTTAATGGATTTTTCAGCATATTTAGGGCAATA
AAAGTACTTACGTACGTAATCAACGAAGATTATTTTCTAACCCATCAAAA
TTAAAAAAATATGTCTGAATATTGTTTTTGACAGAAGAAAACACGTTATG
AGAGGAGTACATCCCACTATGAGAGAGCCGCAGTTTGCTTAATTTATGTT
ATTTGATACTTCGTTATGTGGGGGCCCCTGTACGCCTATGCTATTTTTTT
GTTTAATCGTAACCTAGATTTGGACCCAGAGGAAGCAATTGTTGCTTTTG
ATTTCAACAATTGGGATACTAATTATATTCCTGGACGGTCAAAAATTATA
TTTACAACCAATAATGGCCTTTTATCAAGGTGGCGAGAAGATAATTCCTT
GAAGGGAATAGATGTAGTGATCATAGATGAAACCCATGAGAGAACTTTAT
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TTTCTATTCCTGGAAAAACATTCCCTGTTCAAGTTATTTATGATAATACT
CCTTTATCAAATCAGCCGAAGGACTACGTTTCACGAACAACTTCAAAAAT
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CGACACCACCTGAAATTGAAGAGGCTGTTGATATTCTTCAAGAAGAGTTA
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GATAAAGGACCAACGAAAGTTGTTTTCCAAGGATGGTGTCTTAAAAAATG
AACAAAGAGTGATAATTTCTACCAATATTGCAGAAACTTCTGTAACTTTG
CCAGATATAACATGTGTGATTGATTCTGGTCGACATAAGGAGTTTTCATT
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GCTCTGCTCTTCAAAGAAAAGGAAGAGCTGGAAGGACTGGACCTGGAACT
TGCTACAGACTCTATACTAAAAATGATTATGATAATTTCATTTCTTCTTC
TTCACCGGAAATATTGTGTTTGCCTATGGATCAAGCATTACTCACATTGT
TTCATCTTGGATTTTCTAATCCTGAAACTTTTGACTTCATTGATCCGCCA
TCAAAAGAAGCAATTTCTTTTGGAATAGATTCACTTTCTTCCCTCGGGGC
CATAAAAACTCAATGTACTACTAATAAAAATTACTTGATGACTGAAATTG
GTCATAAAATGACAAGACTCAATGTTATTCCCAAATTGGCTCATTTGATT
GTTAACACATTAAGTTTGCATAAGGATTTGATATTAGACGTTTTGATCAT
ATGTGGGGTTGTCACTAGAGGATATAGTATATTTTATCGTAGTGAAGACT
TAGATGAAGCCAAACTTAAAAAGTTAAGATTTTGTAATGGTAAAGGAGAT
TTCATAACAATGATTGATGCCTTTAAATTGTGGTATGAAGTTCCCAAGAA
AGATCGGGGCAAGTGGGCTCTCAGAAATATGATCAGTAATAGAACAATGA
ATGATACATTAAAATTTGTTAGTAAAAATGTCAGAATTGTTGAAACTAAG
TTTCATCATCGAATTCGTCGAAATGGAGAAGAAATACAATTCGGTTGCAG
TAAAGCTAAGTATGATGATATTTTGAATTTAATTTATTCGTCATTCAAGA
AGTCAATTGCTGTTTTTGCTGGACATCCAAAAGCAGGATATATCAACAGT
ATAAATGGTGATGTCATGAAACTGCATCCCAGTAGTAGTATTAACTGTTT
GGAGAGTAGTTTGAAGTATGTTTGCTATGATAAAATTTTGAAAACATCAC
AAAAGTTTATATTTCACGTGTCCATGGTGAAAAATGAATGGTTGGATGAA
GACGATATTTTTATCAACGATCATATTAAGTTGAAGACTGTAAGAAAGTA
TGAAGGATATTCAATGATGGGGTCCTATACTCTAAAGAAATATGTGTTCC
ATAAGTTGAAAAAGTTAAGAAATGATTTAAATATTAAAATCTCAATCAAT
TCTGCTGAAAGAGGAATCACAAATTTTTTTGAAATAGATATATCACTCGA
AAAAGGATCTATTTCGACATGGTGCCATCCAGAAAACGAATCTATTGTCG
TACCCTCCGTAAAAAGCTTGTTAAATACTGCTTTAGAAGAGGTTTTAAAT
GAAAAAATGAATATACCATTGGATGAAAAATCAAATTTACTTGTGATTGG
TGCTTCAGGACGTGGAATTTATCATTTTAATTCAAAATCTTATTCAAGTT
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CAAATTGAAGAATTAATGACCAACAATGGCATCGATTTTGATTTTTTAAA
GCGTAAAGATGAACCATGTTTTTCATTTAAACAAAGTCAAGTAGGCATTC
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TGGAATTCAACGAGCTCAAATCAAACTAGTGTATGGATCAATTTTAATTT
TAGAAGTTATGGCTCTACTGATGAAGTGGTGGAAGCATTTCAGAAAAAAT
TGACCTGGATATGAATATTGCAAGTCTTTAAAAAAAGTTAATTACTTAAA
NNNNNNNNNNCAAGAGTTTTGGCGATGCCTAGCAAGAAATGCTCAAGTGT
GAATGTTAGAGTCAACGTTCCTTCTTATGATATTGGTCAAAAGATATTCC
AAAATAATAGGGATTTTGCATCATTAGAAAATGGGGAATATATGTCTTCG
ACTTTATGTGTAAAGCAAGTTTTTGTGATTCCTACACGGGCAGTTCATTT
AATAAAAATGCAATTCAAAGCTTACGAAAGGTTAATATTTACACACATTC
ACTACMTAAWTGACATTRTTTAAATTTTCAGGAACATGCTCTTTCGTGAT
AGCGGTGATGATACAATCATTTCTGTATTAGATACTCACTTTTCAAATCA
TTCTTCAAGCGTCGGTTTGTTGAGTAATACAAAATTTCTTCAATCAATTC
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GGGGGGGGGGTAGAGCTGTTACCTATAGAAAATTAGGGTTGGTCTTAGCA
ATTGAGGGGTCCTATGCGAAACAGATTGCACTAGGCCTAAAACCTAATTG
GATAAGGGTAAGGATGATTGAAAGATTGAGTTAAAAAAAAAGTTACTTTT
TTATAAAGAAAAGTGCGTAGCCTTTTTTTTAATGATGAATATTTCTTTGT
AGCTTTAATAATCTATGGTAGGTAATTACAAATTATGATAAGGATAATGT
AGTATTATATCTAAAATTATTAGATTGTCAATCATTTATAGTTATAATTT
TAGAATTTTCTAGATATTAAAGTAACATGTGGCCCATAATTTGTAGATTG
TACACTACGTATGTATATATAGATGATCCATTGACCCATGTATTATTATG
CATAATTTGAAATTATATACCTCTAACTCAATCCAAATCTGAGCTCTTTC
TCATGAAAATTTGATCAAAAGTTGTTATGAAAACCTTTGCTTTTGGGATT
GTAGTTGGTAAAATTACTTCATTGATAGATATATATAATAAATAATTGAA
ATTTTTGGGATTATGTCATTAATAATTTATTTTTTGATTCTTTTATGTAA
AGAAATATGCTTTATCTTGAAAAATCTTATAAAAATACCTTATTTTTTTC
AAAAACGGCAAAATATACGTTTTTAGTTGGATCTTTGTATTTTAATCAAT
AAATATAGTATTTTGAGCAAGTTTGAAGGTGTTCGAACGAACTAAATACC
ATATTTGAAGCTTTTTCGGCAGAATTTTGATTTTGTTTAATCTTTTTAAA
AATTGTATTGTTGCAAAGTCATGGAATAATGAGTAATGGTGTGATAAATA
AAAATCCTTATTTCATATATATATAGTATTTTTTGTAATTTGATTATATT
TTACTATATTAGAGTATGTTTGATGAATCCTTACTTTCTTTTTTACTATA
TTTATTAAGTTATGGTTTTTATAAGCCACCATCAATCCATTACATTAACC
CTACATTCAAAAAAATATTTAAAATAGTTTTATCTTTAGATGGTTAAAAT
TTCAAAAAAATTGAGGACCAACTTTCTTAAAATATTTAATGTCAAATACT
TAAGTAGTTATTAACTTTTTCAATATATTAAAATATAATAATATTAAAAA
AATGTCACATAAGTTTTTTGATCTATTTAATTGCTTTTCAATTATGTATT
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TAAGAATCCAATATTTAATTGTAGTGAGAGATTTATCAATAAAACCACTT
ATCAAACTTGGGTCCAATCCGTTTCCTCGTAGAATGACCCATATCAGGAG
TGTCTTCAAGGGGGGAATGAAAATTATGCAGTGGAGAAATGGAGAAAAAA
ATTTCAAAAACCAAGTACCCGCCTCACACACTCAAAAAAATAAAATGAAT
ATATATATATATATGTAATCTTGCAGACACCCCTGCATATGTATTAATAA
TCTACGTCACATTTTAATTTATTTTATTAGATCATCAGTCATTTTAGTTA
TCATTTATATATTGAAAGCCATCATTTCATTTTAATGTATTTAAACTGCA
TATACTTGATATATTTACGAGTAAATCGTATATAATSTSCCTCTTCGWAA
GGCAAGCTNAAGTRCCKCCCTCTAKCCGCCACTGTTAATATTTTAATTAG
GACTCAAATATGATAATCTCACAATCTGTAACCGTATAGGGATTAAAGTT
ATACTGGAGAAGTTCAGCTCCTCATTTGATATGAACCATCANTTTTGAAC
ACATTAAAAAATTAGAAGATATAAATCATGTTGCTATTGTGAAAGAAAAA
AATGTATCCTGTCTTAGCTTTACAATTTTTGGAGGATCATTGTCAGTGCA
GCATGCAAAGAAAGCTTTAATATCGTAAGCATTTATAATAAACTTAACCC
TTAAAATACCAACATTTCACCCATTCTTTAAATTTCTTTACTTGTCCTAT
TTGTCCGAATCTCCCATAATTTTGTGACTTTGTTTGTAGTTCTAGATATT
AAATGAACCACAAGTTTCTTATTTCCTCAGTCTAATATTATCATCTGTGT
ATATATATATATATAATACAGTTTGTATTCGTGTCTTTTATGGTTGACCA
CACCGTTGGGCATAGGAGCTGAAACTTTGCATTGATGCCTCTCATAAGTC
ATGCTAAGATGGGGCTGTCCATTTTGGGGGAATATAAGGGGCTTATTCTC
TACCCAAAATACAAAAATTGGGTTTTGGAGCTCAAGGAGACTAGATAGTG
GCTTTTGTTGTATATCAAAAAGTGACTGGGCTCTAAAAAATACATATACG
AATAGAAACGTTTTCTAAATAAAATTGAAAATCTAAAAAGTTATGGGCAA
AAAAATAAATCGGTGAAAATTGCACTTGAGTTTTTTTTTTTTTTTCAGGT
ACAAAAAAATGGGTTTTGAATAGAATATTTAATTCGTATATAAAATAAAG
TTTATAGAAATTTGTTTGTATATAAATTTGACTCATAAAAATTGATGTTT
AATCGAAATATCTTGTCAGAAAAGTCTAAATAATTTTTCATTTTTTTTTT
CTCATGAAACGTCAATTTTCAATTTTTAAAAAGAATGCCACAAAACGATA
CACTTTGTTGGTAACGTTTTAAACCTTAACAGTATAACATTTTAGTATTT
TTAAATTTCAGAACATTTTCTTACTTTCAAAAATTAAACAGTTATCAAGG
GTTATTTTTTCTTCGACGTGATTATTCATATTTTTTTTTGGCATTGCAAA
TTATATTTTTTTTGTTAGGTTTGTATTCCTCTTTACAGTGCTAATCAATG
CTATTAACTACTTTTTTTTTGCAAAATTAGTATAAAATAGTTTTTCGCAT
TTTTCTTCGTTAATTTCCATTTGGGAATTTTTTGACAAAAATAAAAGACG
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TGAAGTTTATAACAAATTAAAAAAAAATCCATAATAATACATTTAATACA
GGCTCTATTAAAAGTTATAATGCTCGCCCGCACCGAAGGGGTCAAAACAT
TAAGAAGAAATCACATTGTCCATTTTCAAAGACAATATGATTTCCCCCTT
AGAGATACAATGGATTCAGTGATGATCTGAATAAGCAGTTGACAGCATCA
AAAAGGAAGGAATAGTTGACCAAACATTCGAATTGTAATTGTTAGGTATG
TTAAAAACATAGAGGGCGCTTCAATATTTTTATTTTTTTTAGTTGTTTAT
TGTAATATATTTATTTACCACCATAATTGTTTTATTTTATAGATATCATT
TGGTTAATAATGTATTTTTAAACATATCCTTTTATAGTGTACATTGATCT
TTTATTGCAATTTTTAAATTTAAACATAATTTTATTTAGCCTTTACAAAT
ATTAATGATTGATTTGTGTGAGTATTCTGACTATTACTCAATTCGAGAAT
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GTTGCATGATTGATCAAAATCTGCCTATTTTGTCCAGCAGTCTCAATAAT
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TCTATTACCCTTGCACAGTATCATCACTCAATGTATTTTATCTATATGGG
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TGATTTTTTTTCAAAAACTTTCATATTTGAAATTTAATTTTCCCAATTTT
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TTGTCATGGATGTTTACAAATGTTAGTCACTTCCTCTAAAATTCCTATCA
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TCTAGTGAATCAGTTAAAAAAATCTTTTATGAAAAGTGTCAAAAATATTA
TTTATTGTCATCTGGAATAAAATCATGTCCTAAGAGTGAGTGTGATGCTT
TTTTTCAAGTGTCCGAGAATAATGAGGCTTCTATTTGCTGTAAAACTTGT
TCTTCTATTATATGCTCTGAGTAAGGAGGTTCTTATATAATTAATCAATT
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GACTGCTGTGCTTTTTAG back to top
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