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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s961 | supercontig | LSalAtl2s961:84758..119265 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012691 >EMLSAP00000012691 ID=EMLSAP00000012691|Name=EMLSAP00000012691|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1713bp
MYFLSYLFLALTLSESISSLKRNNPFKSRGASLLRDSKSFSSGFYNHNEE EEDAPSSNIRGGPRLLFRQIPSSVLPLRSSSFQHQLDPVAXIPSEPVRSV VHAPPRLISRLARRREYASAETRVSSHSSRLSRXSVSSTTARNKVSLTKE DENDPCSSEYHRIIANEPQRSFNHHLSIGEQLPICDRSLSIGWYRFESPA GNILATECPGGNYCGTQMPVWMKGHIPKVSEGIVDATGCVNQGRECCTQE LPMRVKNCSSHIVYHLQPTPGCHMGYCVVSVQLDKVHITQGALISDVVLF CNPVFKNVNSPSTVVAEIKWWXNERLTVEESFNLKDKKVSTLLPKFWKLG QKIRCSAEAKHEEADYKTDKKMSNTFVPGVQIFNSSLTMEEGGHPAAIKF FPTIPIMCDRHTFQSCCVEFQVDVGLSLRKCPNGEDKISFPDCSEGKYKI CQHDWNKTHEIPIAFNDNGLIKVEPMEFVTLKISTQSQSNVKWQNYHLSP VKIKLMNSDVSETCSLSGIDLNTFDGVQYKTKESGAFILYKHRNHPYEIV GVFQPCSLRENCLCSLVVKAYDSILTFDLCSKRHLIVGGKSNNPSKIPKG FDLLSVNDGREYKLYFPTGTWMSLDSYLLDVKIYASKADLNLVYGLCGNF DRNPTNEFGSHRSCPDKCKDFFYKWRATSVLTVLEYKHPKVESCSLTGPC MDTSSSRSVLKSIFKSGTPMVTFELSKEKTEYILATPPNNIITDVSTDGV ITPSSASTLCNDYIGGPHLDHLFSNCLNQNIRDEGVKRCSKDVLHSGEIW IPQIYVERFKSECRNTIFRNISLWERGHPPAHITNKLCINDCNGNGECYL GNCICKDEYTGRDCSINVEKGKPQLYFLENEGLCDVRTKPCRNVGIISSG LDRERNLICSFEIYKIRGVASKQLVNDGFFNKPAEFVSYQKFNCPIPKLD IHNPQSLANFDLKDNTDHTRLYIKISASYAGNGHKSAPLDLLLYDSSCWN CTTTECTAKKSDKCFFASXSSSIQVFRLGKSIATLKSTGHDEIVICTLPK NSGGCSNKIFRYYYNAIEQRCKLFVYGGCKGNGNNFLTERQCLLRCGEEG SLSQTEITTEVDTCSQKRDEGICPGNVPRFYFDKKAGRCLLFSYGGCGGN SNNFENQDECIARCGGPKGTIIVPSSLTNGSLKPRKLICSLQLSRGNCXA TLRRFYFDEKQGCKLFIFGGCQGNDNNFETMEDCIRNCGGPNEHGVSEFI NQLREQSLSSSSTNLALPDLKENSANVCSLPKDFGHCMTVTSRYYYDPKT DTCKKFRYSGCGGNTNNFRSGERCIETCGGLLEKDNRISALTLSPFTIIK ATTSSTSNTLHKSFHPSRTPESRVLHISTTKIITTTVHTSTTTTSTTPNT TTTTATATVVTTITTTTTTTTTSTTTKRTTPVASTSSAPLTSSNVLTEKN VPMDSEGVTEKRSTGTSSSNNRRVRVRVRHRKRIPDSRNNTRDTVVMTSX PTSTSPLPDPSIHPRSRKTSRFHSVETPAPLSSRPVGKIQAQILSTRSTT STXXTTTTAKALMSVARSRTRSGFLSFLHKMRHSASEKNERISGESSIPR SSRRISIEDEAKTEEISSSPSSSSLDASGLVVVRSFCRFPPFKTDLPRCR GENPLFYYNVTTASCVPFYDGYCGHSRNRFLSQESCLSSCIVQAQGFATN PSNRHFLRFNQHN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s961:84758..119265+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012691-708538 ID=EMLSAT00000012691-708538|Name=EMLSAT00000012691|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=34508bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s961:84758..119265+ (Lepeophtheirus salmonis) AAAAAAAAAAAAAATTAGGAAGTCATTGAAAAACACTTATAGAGTGATTA
ATATTTTGAACCAATGGCTTCGTGTGTTATTAAGAGTTCATTTTAAAAAA
AAAAAAAAAAACAACAANATAGMGAATCCCTCTCAGGATCTCATCCAATT
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AATCTTCCGACATATTTCTTCGTGCATATCGTACAACCGATCACATAAAC
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GGCTTTTAAGGTTCCACAGAATATGACGTTACTTTCTCAGTTTTTATCCT
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AATATACTTAGACAAATATTGAACGCATGATCTTTGTTTCACGGTATGAT
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AAGAGTCCCAACATAATATCTTATAACATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTCCCTCTCTCGCCCTCTTCAGCTTCCTTTTTAAAGACAACTCCTCCTAT
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ATGTCAATTTTAATGATAATACAATTTTTGACGTCAGTGAAAACGTTGTA
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TTATACACAGTCAAAAGCCCACCATGGTCAAAAAGTTCACTCCTAATATT
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AACGGATATTTAAGCTGAAGAACGAATTACTAAACACGCATCATTCAAAA
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CATGCCTTGTTAACTAAAGTTGTAAGGTAAATAGATCATGAAGCCAATGG
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TGATAGTATATAATATTAAACTTTTTTTAAATATATTCTATATTAAATAA
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TGACAGTCTCAAGCACTCCGAATTCAAATATCCACTATATATCCACGAAA
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ATTTCGTCACATTTGCTCACACCTTGTACCATCCATGGTTTTCTTTCTTT
ATGTATATATTTAGTAAGTAGACTTTATGGCATTGCTACGTCATTACATT
TGTCCTACTTGCAATGGCACAAAACTTGTGTAGGTAGATTGTATTTACAT
ATTATATCTACATCATTCTGTACATCATATCTCTGATAAGGAATATAATT
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TGAGTACTTTCATGGAATAACCACCTATTAGAGATACATTATCTACAGCT
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TAAAAATATTATATAAATTAAATTCTGGCATCAAAACTTAAAACATGATG
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TGCCACAGCTAATTATCTGGCGTCTGACATACGATAGAAGATGCACTTAT
TGAACTTTCGTGTGACCAAACACTAAAAAAAGATTTTGATTCTAAAACAC
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GTAGCTTTAGATTTACTTATACTATTTGGTCGAACCCCAGCACTAGCTTT
AACATATTATATATGTAACTTAGAGTGAATTATTTTTTGGTCACATCCCT
CAACAGAATATGAATTTCGGGAGAATTTTTTCACGTGGAGTTTTCATTAC
TTTAACTGTATACATATATATTATATTTATGACCTATAATTAGGAGTTAA
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ATAACTAACTAGCATAATATGTATAAAGCTTCATAGTTCAAATTAACATC
CAGTAAATTAAAACTCAAGTTTAAGATAGCCCCAAATTACCTATGTGTGC
GTGTGTCTTTTGGTCATTTTATTTCCTAAGAGTTCTATGTAGATAATAGG
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TTATAAGGTTATGAATATAATTATAACCATAGATGAAAAAAATATGATTA
TGGATCATCAACTACAAAAGCTTTTGTTGTTGCTACCTAAATAAGTGGGT
TTACTTTTCCAAAACTGTTATGATTATTATATTATTGCTGAAGAGAGAAC
ATATAAGTAAACAGTAATAACTAGTGTGTGAAAGACAAACATTAAAACTG
AGAATATATTGTGAAGTTGTAAGTGTAAGTCCATGTTGGACTCAGAGTAG
AATTAAGAATTGACATCGCGGTAATTACTGTCTATATAATTGAGATATAA
GGGATGTGAGGTTAGTGTTGTTGTTTTTTTCATATCAAAGATACTAATTT
GACAATGACACATCATGACAGCTAAGCTACTCTTCACAGAAACATTCTTC
AAACTGTCAAGGTGACCACATTAATTTTGGTTTCTTTTTTTTAACATACC
AGTGGATAATTTTTTTTTTCACCTATGAGTGTAATACTAAACATAAAGTA
CATAAAAATGTTATAGTTGAATCAAGGTTCTTTGTGAGAGTATCATCAAA
AGAAGAGTTGATCGTGGTTATTAGATTATAATCCTAAACGTATTTTTATA
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GGTTTTTTCACTGAATGTGCTATAAATCCAACTTCATGACCATTTATATT
ATCGCCTTCAACCGAATCCTTTCATAAATAATAATAATCAAATAGTATAA
TTCATGGATTTTTTTTTAATGATCAAATTAGGATTCTATCGTCTTTTGTT
CAATGTCAGGGATTTCTATGAAATAACCCCTGGGAGCATTTTTTTGTCCG
CATGAATACGTCACGAATAGTAGATCTGCATTTAAAAACTAATTATAAGT
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CAACTCAATATGTCCGGTTTTTTCTTAATTAAGGCGATTTTAATACAAAT
TAAATCAAAGCCAAATTAAGAATATAAAATATATATATATATATACGAAA
TAAATAGGAATCATAATTTATTAATATAATATCTATTCTTAAACCTTATT
CATGTACAAAAATTAAAAATCGATAGCGCCCACCATGYATACATCTAAAC
CATCTAAAACTGTCACTGATCCGGCCTCATCTCATTTTTTTATGGAAAAT
GAAATATGGTTACTTCTAGTTTATCGGTTCAAAATTTTGACGTTTCTTCC
TAATCCTTAAGTACGCTAAGTTCCTAAATTACTTCATCATAGATATGATC
CAATGAAGTTATTATCTTGACTCTATGGAGCGGTGTAGCTCTATGGACAA
CGACCTTTACATAAATTTTTATTTTAAACTCTATGTGTATAGATTTGATA
CTCAGTCGTTCCTTGAGAGGGAAATATACTCAACGTATTTGGACTTCAAA
GAAGATTCTTAGGTCAAATAGAGTAATTATAATACTATAATTTTTGATTA
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ATCATTCTTGGATATACTGGCGTTATGAACGTTCAGTATTTATAAGAATG
ATACATACTTTAATTAAGCTTAAACTATGTAAGAATAGTGTCAAACTATT
ATCGTTTATTGAAAATACTTGAGGTTTTACCGAAAAAAATTGATAGAAAT
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CTTTCACAGTGACAAGCTTAAAATGTTTTGTCTTGTGAACAAACAAGTCA
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GTTACGTGTTGATATCTCAGAGAACGTCATTGAGTAAAGAGTGTTCCATG
GGACGACTTTTGCGTTCAATTCAGTCTAATAAGTCTAGATCGGCTGMCAA
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TATGCTCATTTATTGTACGTGTACACTTGTATTTCAAACTTAAGGCTTAT
TTATCAATTGTAAAAATAATAACAAAGTATCTTAAGCATGGTGGATCAAG
GAAAGAAATAAGGTTTGAGGTCATTATACCCTTCAATTACATATGTGTCC
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ATCGAGAGTCTATGTTACTATGTTATGCAAAGATTAATTGAATTTGCATT
ATCATTTTTTTAGTTAGTTATTATCGTTGTAATAAAGCAAATTATCTATT
CCTTCCTAATATTGAATTTTATATTATCCTTAGATCCGCTGCTCAGCCGA
GGCCAAACATGAGGAAGCAGACTACAAAACAGATAAAAAAATGAGCAACA
CCTTTGTGCCTGGAGTTCAGATATTTAATTCATCTCTCACCATGGAGGAA
GGTGGACACCCCGCTGCCATCAAATTCTTTCCCACTATCCCCATCATGTG
TGATAGACATACTTTTCAAAGTTGTTGTGTAGAGTTTCAAGTGGATGTAG
GCCTCTCACTTAGAAAATGTCCCAATGGAGAGGATAAAATATCCTTTCCG
GATTGCTCTGAGGGAAAATATAAGATATGTCAACATGACTGGAATAAAAC
CCATGAAATTCCAATTGCTTTCAATGATAATGGACTAATAAAAGTTGAGC
CCATGGAATTTGTAACCCTCAAAATATCCACTCAATCCCAAAGTAATGTA
AAATGGCAAAATTATCATCTTTCCCCTGTTAAAATTAAGCTCATGAACAG
TGATGTCTCTGAAACGTGCTCCTTGAGTGGAATAGATTTGAATACCTTTG
ATGGTGTTCAGTATAAAACAAAGGAGAGTGGTGCATTCATACTCTACAAG
CATCGGAATCATCCTTATGAAATCGTTGGAGTGTTTCAGCCCTGTTCTCT
GAGAGAGAATTGTCTTTGTTCCTTAGTTGTAAAAGCTTACGATAGTATTC
TTACGTTTGATCTCTGCTCAAAAAGGCATCTCATTGTTGGAGGCAAGTCC
AATAATCCAAGCAAAATCCCTAAAGGATTTGATCTCCTCAGTGTCAATGA
CGGGAGGGAGTATAAGTTATATTTCCCAACTGGAACTTGGATGTCTTTAG
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TTAATTTACTTATTTTTTTATAAAATCATATAGCAAAGATGCAAGCTATT
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