EMLSAT00000012800, EMLSAT00000012800-708647 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012800
Unique NameEMLSAT00000012800-708647
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s973supercontigLSalAtl2s973:67943..101633 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012800 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012800EMLSAG00000012800-695566Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000057478EMLSAE00000057478-766406Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057479EMLSAE00000057479-766407Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057480EMLSAE00000057480-766408Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772141auto772141Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012800EMLSAP00000012800Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012800

>EMLSAP00000012800 ID=EMLSAP00000012800|Name=EMLSAP00000012800|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=104bp
MSIFISHSIIIFILSKLTLIHSLRIQDLSFPEYVMLGQTVTMYCEYYLGD
GEYVDSIKWYKDNHEFYRIVPQMIGPNKVRTFDMDGVKIDLENSGLDVKK
SEKS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s973:67943..101633+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012800-708647 ID=EMLSAT00000012800-708647|Name=EMLSAT00000012800|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=33691bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s973:67943..101633+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAATGATATGAAGCAAAGGATTTTGGTTTATTTATTACTTCATTTTTTAG AATATTATAGTGGGCATCACTTATTAACGAAGGAAGAAAAGCTTATCAAA AAGAAAAGGAAATAAACTAATACTGTAGATAAAAGAAGGAATGTCAATAC AAGGGGTTCAGATCAAGTTACTGACTGACCAGCAGCAACAATCACTATAC AAAATGGTTATGGGACGAATGAAAATTTTATTTTACAAGATCATCAAAAT TTTTGAGCTGGTTCATCCATTCTTCTGATAGGGTATAGCTCCCCAATCCA TCATACCAAACAAAAAAAACCTGAAAACGCTCCTGTAAGTACATTTGAAT TGCCCTTAATAAAAAAAAATGTATCCTAAAAACTATCAAAATATCAATAC AAATTTTAAACCTCCTTTATTCTTTTCTTTTTATGAACACCCTTTGTCTT AAGGATCAAATTGGTAACTGACAGTTCATCACTGATAAATTTAAAATTGT TTAAAGTTTGCCGATTTAAGAATGATATTATTCTTAATAATATTTCATAT TGTGATAAAATAGTATGTATGTAGAATAGACGGTTTTTTTAAATTAATAT TTTTCTCCCCTGCACGAAGACAATTTCTGCTTGAAGCGATAAAAAAAACT GACTTGGTAAAATATGAGGCCTCTKAAGCCATTTTTGGCAAGATAAATGC CCTTGTCGTTGGGAAAATGGTATTTTTGCCTCAGGATTGGGTATTTTAAG ACTTCTTGAACTGCCCCAAATATGATACTTTATTATTCACTTAAAAATGG TAAATTTTAACACAAAAATACAATTTCTTCCAAATTAAAATGATCGAAGA GGTTTTAAAAATTGTCAAACTAAGTTTTTTAATTATCTCCTGCAGAAGCG TCTTTGTGCAGGAGTAGAAAACTATTATCCCGAAATCGGAACAGTCTAAT 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