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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s973 | supercontig | LSalAtl2s973:67943..101633 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012800 >EMLSAP00000012800 ID=EMLSAP00000012800|Name=EMLSAP00000012800|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=104bp
MSIFISHSIIIFILSKLTLIHSLRIQDLSFPEYVMLGQTVTMYCEYYLGD GEYVDSIKWYKDNHEFYRIVPQMIGPNKVRTFDMDGVKIDLENSGLDVKK SEKS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s973:67943..101633+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012800-708647 ID=EMLSAT00000012800-708647|Name=EMLSAT00000012800|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=33691bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s973:67943..101633+ (Lepeophtheirus salmonis) AAATGATATGAAGCAAAGGATTTTGGTTTATTTATTACTTCATTTTTTAG
AATATTATAGTGGGCATCACTTATTAACGAAGGAAGAAAAGCTTATCAAA
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ATTATTTACGTATTAAATAACTTTTGTTTACTGGCTTCAAAATAAACGAC
AAAAACTTTGTGGTACTGTTTTTTCTACAAAAGCATTATTATTAATAATA
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AAAATAAATAATATAACCATTATAGCACTAAAACTGATAAAATCACAACT
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TACTCACTCTCTCTAGACCATTTACAAACATTTAAATACCTCCATATAAA
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GTGAGCTAGTCGTTAAAAAACTCTAAAAAAATTTAGGAATTACACTGATC
CATTTTTTTTTTGCAACATTCCGGTGAAATAAATAACATATATTAAAAAT
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TGGAACCATCGGTTTGCGTTTACATTCGATACTCTATTGAGTTCATAAAC
AGGACAATTTGTTTTTCCCACCTGCTCTTCTTTTCTCCTTGGGCGTAGTG
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TGTAACACACAACTGACTTCAGTTAACCTAAAACTGTAAATACACTTTTT
TTAAGAATACGCTTAACTTTGGAGTATACTATAAGTTGTTTTTTTTATGC
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GCTTAACAAAGAAAACACGGATTTAATTCGTTACAAATTGTTTTAAAAAA
AAAATATTATTATAATTTAGTTATTTTTGATAGGGTGTATGGAGCGGAGT
CTCCATAACACTTTTCCAGGCATCGCTTAGCTTGAATGGTATTTTTTCCC
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TTTAATAAAAAACAAAAGTAGTGTTACACCAATAACTCATAATCTAAAGA
ATAAATTGTTATAAAATTTTGACAAATGTCATTTTAAGGTTGGTATTTAC
TGAAAATGAGGTAAATTTAAAAAAAAATTGAGCCATGTATATGTGAAATC
CTTAACTTTTCAGCCTATACCTTTTTTATACCACCCAATATTTGATAAAC
CTATTTGAGTCAATTTAAGACATTGTATTCAAATTTGTGGGATGAGTTTA
GATACTCAATAATGTTAATTATAGTTAAATAATTTGATTTGATTTAAGAG
CGGCCCCGATATGACCCCTTTATTTATTTTATTTTGACAATCCATTTTGA
CTCCTTTTATTATAATTTGTAGCACCTCCAATGGACGATAATTCTTCAAA
AATATAAATGTAATCCACACTTGGCGCAGAAAAAAATCATTCTAGCTTGC
TTTTGAGTTAACGGGCTACGTATATCCATATTTACTTTTTGGACAAAATG
TATGAAATTTTGGAAATTTAAGTGACACAAAGCTATAAAATTGACATTTT
ATTATTTTTAATGTGTTCAATAATTTTTTGGTAAGAAAATATAAATACCA
TTTTTCATTTCTTTAAAAACTGATTTTATCATTTTTGTCACTTTTTCCAA
AATAGTAACACTTCATGTTAAATATTAATAGTAAATTTGACAAATGTGAT
CATTTGATCCATACATTATCAAAAAAAGATAACACTTGTTTGGTAAGAAA
CAAAAAGTCAGGTTCACCCTAACGTCTATGTATATATTATATGCATATTC
AAAAAAGAAGGAAAGAAGATGAATTGAATTTTCTTTACAATTCAAATTAA
ATTAATTGCAGTCTTTAAATTTATGTCTATGCTATAATTGAAAAGTTATA
TAAATCATTCAAAGTTCCCTTCATATATTATATACGTAAATTTATATATC
ATTTATGTATTTGTATATGTATGTATGTACTATATATATATAGCAGTCAC
TTGTTTCAAATTAGTTGTTATTTCATATATATATATTAGAGTAAACTTGT
AAATAATTTATGTAATTTTTTTTTAAATTAATGTCCAAAATAAGTGGATT
TTTTTCTTCTTTTTTATAAAACACCCGTAAGTACATTTATGAAAACTATA
GAAAGAATACATTGAACGCCATTAAATATCTCGTAAATAATCAGTATACA
TATTAATAAAATTTATAGTATGTCAATAAATGCTAACTTTAATTATTCAC
ATAGTATAATGTCATCCAAACATATTCTATGTAATTTAGAAAAATTAATA
TGTTCTTTAATCATAATTTCCAACAGTTTATGTTTATATCATTAGAGATA
TGAAACAAAGTAACTTTCTCAATGAGTAGGACGCAATCCCTTGGGGGCAC
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TATTGTCCTGCCTACTTCTAATACCGTGCGGATTTGAACTTTGTTGATCA
ATTTTAAAACCACGAAATGAATGACGTAGCTCAGTGGACAATGCGTTCTT
AAGAAATTGTTCTTTTTAACTGAATTTGCGTAGTTTTGATTCACGCTTAC
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TCAGACAACTAAAATTATTAGTTAAATAAATGTTATTAATAAAAAATTGA
TATGTTTTGATCATAATGAATAAATTCATCTCAAAAACTGATCTCTATTC
AAGGTATACATACATAAATGGTATACTTCATATTTACATGTTGATATTCC
TGCTTGATATTACATCACTAATCATCCACTTTACCGATTAGCTGGTTATT
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GTTTGGATTTACAACTGTACTGGTTAATACTTAAAAACAACTACCTAATC
AAATAAAAAAAATATATATTCATTTATCTAATATATAAGAGAATGGAGGA
TGAAATTCATAACAAACGTAAGAAGGTACTTTTCAAGAGAATGGGACAAG
TTTTGGGTAAGGCATATCGGGTGTCATATTTTTAGTGATGGAGTTGAGGT
GTATTTTGGGTATGTTAAAAAAAGAAGCCGTAAATCAACATGTAACCCTG
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ACATATATATATATAATTTAATTAAGGATTGACATTGGAATAATTCTTGC
CTGAGTCTAACATGGACTAACAACCATAACTCTGCAACAAATCTTCAAGA
GTACACTCTGTCTTTTTGAGCTCACACAAATGTTCAATCAGATTTAGAAT
ATATTGAATTTAGTAGAAGAGAAAGTTCAATCCTTAGGAATTAAATACTA
ATGACAACAGTTAGTGAAAAGTAAAGTAAATTTACTCTTTAGTTAGCAAA
AAAAAAATGGGTGGCCTAAAAAATACACCAGATTTTCATCAGTATATATT
ACATTTTTCTATTCTGATAAGTAACTTTATAAGGCACTATGTACAGATGG
GTCAGCTGGATTATTCTATAATATTCGTCATATTGCATCATTAAAAAGTG
ATATTGTCTAGATTAGTGGGTTCCTAGCTTGAAGACMCTCTCCCTTGGGG
GGGGGGGGTAAATTTGCAAGAATATTTGTAAATGTATACAACTAAAGAAG
AAGAAAATGTTAAAATGGTTGGGTGTATGTGGAATGGGGTTAAAGGGCAA
TGCATTTGTCATTGAGTTGTTTTCATCAGCTGACTCTTTTATTCATAAAA
GCATCTGTCTCTACATTTTTTCCTTTTCTTTTTTGAAAGTCGAGATTTTT
AATTTGGACTTATCTAATAATGGACTGCATTTTATGCTCATATGATGACT
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ACGCATGGACTGCGAATGATTATTTTACTAATTCTACATGTAATATGTAA
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ATGAATTATAGTTTGTAGATACATATTCCAGATTCAACAAATGTTCTCAC
AATATTTACTCAATTAAAATAAATTTATTTTAAGTACAAAAAAATGACTA
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AATTACTCAAACCGTAGTTTAAATATGTATAACAAATAGCATCTTAAAAA
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TTGAAGTAAGAGCAATAAGTAACACTCAATCCAAGGGAAAACTATGGATG
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TCTCTTTACCTCTTWTGACAAAATTCCTAAGATTTTTTTCATATATATAT
ATACCTATATAAAAACTACAGTATGAGTTAAACATAGCCTGTCACTAAGA
AATGTCTAATTGATTTTTTTGCTCTATACATTTCTCATCATCTCTAGGCA
GAGTTGTATTCGAGTTCCACCTTTTCCTGAGTTCAATACACATGTAGTAC
ACGAGTTCGGAATTTGACTCGAGTCATGTTTTTATTAACTTGTATTCAAA
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GACAAAATGTGGGTCCTTTTTTCGTACAATGAATGGATAACTTGTTTTTT
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CTCTCATACATCTTTGTATATGATTCTGATTCCGAATACAGTTCAAATCT
TTATAGTTTCTAGTTTGATAAAGTCTAAGTCCATATGGTTTTGAGACATG
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ATTGGGAATAATTTATTCTAAATATTTGAAGATTTACAGATGCATCGTAA
TTACATACATACATTAAATGGCGATCAATAATTTCTGAGTAATTATTTTC
AGCAGAGCCCTTTTCGGTGAGATCCAAATTTACCTTATTTCCTTCAACTT
TCATGGATAGATCAAAAAAATGAATGCCTAAACTTTCATTTTATCTATTT
CACCATGCATTAGTTCCATTTCTATTCAAATTATTCAGTATTTTGTTCTT
ATTATAGATTAATATCAATATGATCCGTTCAAAATCATTTTAACTTCCGT
TGTGTTCGTAACTTTAAAAAATATATAAAAATAAAGTTCTAAGTCCTTGA
GGAAGTTTGCATAAAATGTAGTTTTGTTATGAATTATGATATTTAGATCA
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ATGCTACTTTGCCTAGAAGAAGCAATATAAAATGAGAAGCTCCTTGCCAA
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ATATGTATATACAAACGCACTTTTATTGCTGTAGTCAATAAACCTAGATG
AATGAGCTTTATCTGAGCTCATTTTCGAATGAATTTACAAAAAAATACTA
AAAATATTTCTAATGAGTATTTATTTATTTCCTTTCTTCAATGATTGTAG
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CTTTTGTTAGGGAACTGGGATTTTATGCATCCCAATTTTGAGAAAATAGC
TTTATTTCTGTTTAAAATGAATCTATTTATATGCACCTGAAACATCATTC
AGAACAATTTCAACTTTTTGTTGTTGCAAAAATGATTTGTCTTGGAACTA
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TTTTTCCCCCATTTTTTTCTATTTAAGGTATAAACGTTGCTAAAAATTTA
ATTCATATATCATACTTAATCTCATCAAAGTTAATGTGTACATTTTTAGT
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AATGAAAATATAATATTTCAACTATAATAATCTCAAATTATATCTTCTCG
ATGCCCAAATCAAATGTTGTTGTTATGATGAAGTAGATTAATTTTGAGTC
CATGTCAACCGTATATCAAGAAATAAAATTCACTTTATATTTAAGTTAAG
GTTTAACCCAAGTTCATTAACTACGTACAAAAAAAAAAATGACATTGACT
AAGGGAGCAATAATAAATCAAGAAATGACGTAGGTACTGATGTCGAGTTT
CGGACAAGATTGGTTTTCCAGTTCGGTCTTTAAAACATTTTTTCTTGACA
GTCTTGGACGACTAATATTTTGGTTCACACTGCCATCTTCTACTATAAAT
TTAACATAAATTTAATATTTTTCTAATCGTAAATAGATTTTTTCAATCCC
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CAATGTTCAGTACCTTGAAGTACACAAAATACGTTTATATAATATTTTTA
GACCCAAATACCTACGCAAGCAGATATATTTGGACCTAGATGTAAAGGTT
GTTTTTTTTTAATCATAAAATTTAATAAGAACACATAGTTTTCATTAAAA
TCCCTAATTTGCTGGGTAAAAACCCTGTCTTTACTTATAAAAAATGAGAC
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AAACAAATTACAAATTGCAAACGAAAATGTATTTTAATTTTTTGATCCCC
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ATTTTTGCATAAAAATATTATCAATATTTGCATAAAACTTGCAAATCTTC
TCAAAACATTTAACTTACTTAGAAAGTTATGCCATTGGACATTAGGTAAT
TATTTTTTTTCTCGTTCAGAATCATCTTTTTTATTATCATTCTCTATTTT
TTTATTTGTTTTACGGAACAGGCATACTTTTCAATCGATTGCTTAACCCT
AAAAATTCCAAGAAATTATTGAATTTTTTTTTCCAATGATATATTTAAAT
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AGCAATTTGTGTGTTAAGTAAAATAACATTTAATAATTCTAATCATAAGA
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ACATCAATTCATTTAGAAGTATTTGCTTAATATATACTAGCTATATGTAC
ATACATAACTATGTTTACTAACTTGTTATCCATGATTGATGATTTTATTT
TTAACTCGTAATAGTATTTTTTGATATTGGAATACATTTTTAAGTCATCA
TCAGTCAATGTACAAATATATGTTAACATTAAATAATACGATTTTTTGAT
ATTTTTTTGAAAAATTAAATAATTTTTTCTCATTAACTGTAGGGTAAATA
CATAAATCACGTCATTAAATACCAGTTCGATTCATTTTTGCTTTCTATGT
ATATTTTTTTCCAAAATCTACAGTTATGCAAACCGACAAATGCTGATTGC
AAATGTATCATAAAAATATATATTTTTTATTAAGGTAAAACTGGGTTATT
ATATATTCTTTTAAGTATAATTATTACTTGTCAACATAGGCATGAGATAA
AGGAGAATAAATTGAGTAAAAAGATATTTTTTTCAAACTATGTTACATCA
AAAGACAGGTCATTATAAATCTTTATATCAACAAACCTATTATGATTGCT
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TGCTTTTTTTCCCTGAAAATAATTTTATCTAGTGAAAAATGTTTGTCACA
AGTAATTTAAAAGAAAAAAAGGAATTTCTGATTTTTTTTTCCAAAATACT
AATTTATATACTCATTGAGCGCTTTTTTTAATGTAAAGTTATACTAATAT
CTACTCTCATTTACTAACAAGGTTGTTTTAGTTGTAATATACGTTGCAAT
TTAAGGTAAATATTATATCAAATGGTGTTTTTTTAGTATTTTACTTATGT
GTAGCAAAAATCATTAAAGAGCTATTTTATATATTTCAATATATGTAAAT
GTCAACATAAAATCAGCCTTGGATACAAAAGAGAAAAATTGTATTTGTAT
TTTTTTATCTTTTTTGTTTATTATTTTAACGTTAGAAATAATTCACTCTT
AGCTTTGTTGTATTTTTAAGACAATGCATGATAAAATATATAATAGAAAC
ATTATAATATAACTATAATACTTTTCCTGCACTAATGAAGTTTTAAATAT
TAAGGTTCTCATATTTATAGTAGTAATTAAGTTTATCTTCCCCCCTAAAA
AACTTGTGATGTTTACTAGATTATTAATTCACTAATTCCATAAATCTCGC
TCCCGCTTTTTCCTCGCACTCTATAAAGCTCCAATCCGTAGTGATAACAC
ATTGAATGGTCAGGGTTCAAAACAACTTAGAAGGTTTAGTTATTTAGAAA
AATGACATATTCAAATCTTTATAATTTATAATTCTAACTCGAACCTGGTT
GTAGGGTCAGTTGCAACATTTTTCAAGTCGAACTCAAATGCAGGTTGTGA
AAAAAAACAAAAAAAAAACTACAGTCTGTTTCAATTTCCATATATATTCA
AATACTACCAGACATATAAACTTATTGCAATTCTCATTGATTTTGTAATA
CTTAATAAATCTATATGGTGCATAAACAATTAATCCATGCGATTAAGGAG
AAAAGAAAACAATTAATTAAAATATAGAATTTGAATTGCCATTTTGTATT
CCTATGAAATAGTAAAATGTTGTTTATAAGGTATAACAAAAAATATTATG
AAATATATAAACATATATCTTTTAAAAAATGTCATTAACATCTGTTACTA
GTGAATGCATTTTCTTATTCTTTCTTTTACATTATTTGCACTATCGTATA
TTTCATGGATTCTAGTACATACATTGATAAATACGATTATTAATTAATAT
TGTGTCACATATATATTTGAGATCAATTAATTAGTTTGTTTACTGTGTTT
AACTTAAATGAAAGTAAAACAATTTATAATAATAAATTAATGGTATAGGT
TGATATATGTAGCATATGCGGCCTTCTAAACACAATATCGAGTATTTTTT
TTAAATCGAGTCTGGATTAAATTTGTATTCCTCATATAATTATAAATTAT
ATATTTATCTTCCTTTTTCCTCATGTGYCCTGCCAATAAATATGCTTTTC
TTAAAATATTAATTCAAAAAGGAGCTTATTTCTTGAAATATTGGGATAGT
TTTTTCTCAAATGGACAAAAATAAAGAACATTTTTGAAATAGTTCTCTTT
TTTTAAATTATAGTTGAGATTCTCAGCTATCGAATCCTATTTTTTAGACT
TTTTGGACTTATTTTTCTTGGAACTATCAGCTTCTGAATAAATACTCCCA
TTTTCAACTTTCAACATAAATAAAAATTGGAAAATAATTATGGTATCTTT
TAACATTTGTCTTAAAATATATCTTAAAAATAGTAAGATATTATGTTTCT
TTCTCAAGGCCCTGAGGCTATTAGAGAAAAATTAAGGCCACGCTTGAAAT
TTAGGAATCAAACTCTACTAAGTTGAGTATGTTTCGATCTTATAAAATAT
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