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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s975 | supercontig | LSalAtl2s975:2088..12576 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012803 >EMLSAP00000012803 ID=EMLSAP00000012803|Name=EMLSAP00000012803|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=329bp
MRNNHMVSDKDSPWTKRISMLLRKYLWEGQSLHKSVKVSVEENDSWRKKM
MILHRRVIGIAIPFFICQITWWCLAIKHDYFSLFPDRYIMTLTMILGATV
AGMTSEGGGAVAFPVMTLALKIDPKVARDFSLMIQSVGMTCASFTIFWMK
IKLEYHSIIFCTLGSSFGMVFGKVSEKISTPTSVVLMAANSIVGTFWRNF
MMDGGAEIEAKNYMAVCVVVVTFFAPLGSILSSHFHRHILASLIYILDTI
ALVSALVIIPMTQTHIILCVSILLLGFIFFYVLSFLGSKLLERXIQRXNE
EXAILPIASSIENNDPSIHYSNATLSSIL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s975:2088..12576+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012803-708650 ID=EMLSAT00000012803-708650|Name=EMLSAT00000012803|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10489bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s975:2088..12576+ (Lepeophtheirus salmonis)
CATTGACATCACGAGGGATCGATTTTTCCTTCTTTAAGGAACGACAAGTT
GGACTGAATTGGACCGGACTGAACTGCAGTCCCCAATCCTAAATAAGGAC
CGACACAACAGAAGCTGAAGCTCCTCCAGTCCACCCTTACGGACGCCCCT
GATAATGCGGGTACGAAGTGTTTATTAGGCTTTACATCGACTACAACTCC
TATTTTATTTTGACAAAGCTATTCCTAAATTCAATGTTGTCCCAGCTCAG
GATGTACTTCCTACAAATTGAGGATGGTTAATCCTTATTACGACTGAATT
CTCCAGATTGTATTCTATGTTTACTAATGGAACATTAGACATTTTTATAC
AAATGCGTTTAATCTTTGTTTGCAAAATATGTTTAATCCACAAATAATTG
TGCAATTAAAAAATCTTTGGAAAAATTGGTTGAATAAACAAAGATGAAAT
ATTATGTCATTTATTGTCAAATGTCAATATTAGAGTGTCTCATATTTAGT
GATGTAAATCATGTGTATATTTTAGCTGGCCCGGTTTTTTTTAAGTTGGT
GATCTGAAGAATTAATTTTCTTTTCCTCACCTGTTGTCTTTATTATTTAA
TTCCTAAGTAGTAAAATTTCTTTTCTTCTACATTTAAAATTGAGGGGTAA
TTTTTTTTTCTTTGACAATTCTGCACAAAGAATTCCCTATCGTGTTAGCC
CAAAACCCCGACAGTTTCAATTTTATTACGAACTTTTGACATATCGTAAC
CGATACATCAGCACATGAAGGCAAATACTCATCTTTACGTTTTTTAACAT
AATTATTAGGGGGTTTGATCCCACGATATCTAATTACAAGATTTAGAATT
TTAGAGCGAGTTTTTTTAGTGCAAATGAGCATTGCAATACATTTATCTAT
TAAATGGGTTTTTAATTAGATCAATATTTTCAAATGAAAACTTGTCATGT
TCATTCTTCAACCTTAACAAAAAATTGAAGGTATATACTAAAACTGACTA
GCTAAACACCTTCTTCCTTCATTGACCTAATTCCCTTTTTTAATTCGTAT
TTATTAAACATTCTCCTTTTTGCCGTTAGTACAATAATTCGTTTTTTGGA
TTTTTAATTTTTTGGGTGCATTTTTGAATCGATTAACCATATCCTTAAAA
AACTTTAAGACGCGGGGAATCCATTTTTTTTATGAAAAAAAAAAAAATAT
ATATATATACTAGCAAAAAAAATAAATTGCCCAATGAAACAGAGCGTGTC
TTAAGTCAGTATTTGTATCTGTTTTTGAAGTTTTTACAAGCGGGAAGAAT
GGAAATTATTTTTATTTTAATACTATGTTGGATAATTTTGTCGATGTGGT
CTGATTTGGTTGGAAATTCATAAATATATATATATATATTAATAATAAAC
TTTCTTTCTTTCAGAATAATCATATGGTATCTGACAAGGATAGTCCCTGG
ACCAAAAGAATAAGTATGTTACTGAGGAAATATCTGTGGGAAGGACAATC
TCTTCATAAAAGTGTCAAAGTATCTGTGGAAGAAAATGATTCATGGCGGA
AAAAAATGATGATCCTTCATCGCAGAGTCATTGGGATTGCAATACCTTTT
TTCATCTGTCAAATTACTTGGTGGTGTCTCGCCATAAAACATGACTATTT
TTCCCTCTTCCCTGATCGATATATCATGACTCTTACCATGATACTTGGAG
CAACGGTAGCTGGTAAATTGTTATTTATAGAGTTGTAAGAAATATGACAC
AATGCAGGGGGTCCGCAGGATTATATATATATATTATTATTATTTTTTTA
TTTTTTTTGGGGGGGGGGGGTCTTTGTTTTTGAAATTTATTTTGTAGGAA
AACAAAATAGATTTCAAATAATATATTTCTCCGAAATATATTTAAAAAAT
CTAGAGCTATTTACCGAAAATCAATTTTTTTGGAAAGTATAATTAGAAGA
ATAAAAAATTTCAAGTATTTTACTCATGAGTAAACACATCCCTGGTTACA
CTTGATCGTTAACTCGTATAATGTATAACAATGTTCTCTCCTCGAGATTC
AAATAATAATTTCCATTACACAAAGTATTATTTTCATCTATGCTTATAAC
TTAAGAGACTAAAAAGAAAAGAGGTGACAAGATGATTAAAATAAAAAAGC
AAACAAAAACAATGTATATGAATTAAGTTCAGGATTCACGTTACCTCAAT
CAATAAATATAGAATTTAAATACCCTTCCTAAATGATTAGGCTTATGTAT
TTTTTTGTTTAAAATAACTTTTATAATTTTTTAGAGTATAATTATGATTC
AAATACTATGAACTAAGGTTTTAATTAATAGTTTATGTTTCTAGTTAAAT
CTAAAGTAAAATACATAACCTCGTCCGAAACGTTGACTTCTATTAAATTA
CATTAGGTGAATCTTAGTCAAAAGAAGTGTAATTGTTTAATTGAGCATCA
AGGTGCCATTATTAATTTTTGTTTTGTTTTTGAAAGTGTAACCTTTGAAT
AGATTCAAACAATACCAGACATATATTGTTAGATTAAAATTTGACGTCTA
TCGTTAAAAACAACAAAGTTTAATGGTAACATTTTTAAAGAATGTTCGCC
CCCAATATTTCAAAGTAAAAAAATATTCTAATGTACTTGCACAAGCGTCC
ACGAGGCCTGGGCTGGAGGGTCTGTACACCTCCCTCCCCAATTTAAAGGA
GTGTTTACTTTTTACTTGAAACTTTTTTGCTCCAGATGAAAATATTTTGC
GCGAAAATAAGGGTGAATTTTTTTCCCCCCTAAATTTAATTTTTTTTGTG
AATAACTGTGTATTTTTTTTGAAAATTTTTCCCAAAAAATTTTATTTTTT
GTTAACATTTGTAGATTTTGGAAAAAATTTTAATATCAAGAAATTAAATT
TTATAATTTTTTTCCAAAAAAATTTATTTTTGAAATATTTTTTTAATAGT
AATGGACTTTAATTCCATTTTAATTTGGGATTTTTGAATTTTTTTGAAAA
AAAACATAAAAACTAAAAAGTCTCCCTTCCTAAAAAAATATATAATTCTG
CGGACGCCCCTGACTTGTTATGTTCTCTATTGACAGCATATAATAGTAGT
TTAATATTATCGCATTTTAGGAATGACATCTGAAGGAGGCGGTGCAGTTG
CCTTCCCAGTCATGACTTTGGCGTTAAAAATAGATCCNNNNNNNNNNNNN
CTACCCTCCTAAAAAAATATATAATCTGCGGACGCCCTGACTTGTTATGT
TCTCTATTGACAGCATATAATAGTAGTTTAATATTATCGCATTTTAGGAA
TGACATCTGAAGGAGGCGGTGCAGTTGCCTTCCCAGTCATGACTTTGGCG
TTAAAAATAGATCCAAAAGTTGCAAGAGACTTTTCGCTCATGATTCAGTC
AGTCGGTGAGTAGACGWCATCCTGCTCCATTAATCTATGATGAATACATG
CTTATTATTTTTAGGGATGACATGTGCTTCATTTACGATTTTTTGGATGA
AGATTAAACTAGAATATCATTCCATTATTTTTTGCACGCTGGGKTCCTCT
TTTGGAATGGTTTTTGGTAAGTTCTGCAGAAATATCGTCGGAAGGTCTCA
AACATTTGAAAGGAGCCTGAAGAAGCGTTTAAATATAAGAGGCTTGAAAA
TTGAGTAGGAAATGAGCGTTGTTTATCTATTCCGATCATTTAAGAGCGCT
TGAACAGGAAAAGGTCTTTTGAATGACATTTCTTAGCACCTTTTTAGATT
TGTCCAAAAGACCCCAGAACCAAAACTAAAGCCTAGTGGCTAKACCAATA
CTTTTTGTCAACCAGTACTATGAATCACTCTACAGGGTGTGATCAACTCC
TCGAAATCTAGTTTGGCCTTTTTGACAGAGCCTTTCTTCCTCTCCAACGG
TTCAGACTTGCTGTCATAGTAGATGGGAGTCCTGGAGACGCCTAACTGCT
TGGAAATTCGTCGATCACGTTCAAAGCTCATATTTTTGACTTTTCCGTAT
GCTAGAGAGCTTAAACTTATTTTGTTTTGAAACTAAAGTGTATGCTTTAA
TTTATAGAAATATGAATTAATTTCAATCGCTCAAACTTAATGAATTATTG
AATTTATAAGTATTCAGATTTCAATGGACCATCTAGAGTGTAATAATCTA
ATTGAATCTAAGTAGAAGGTGTTACATAGCTAGGAATGGGCATTTCGTAG
AGCGCAAGGCTAAGGTGAGAGCAAGAGCCATGGTAATACTGAATTAAGAT
ACTTGTTATAATTAGTTGCCTGTTACAACATGATGTGGGGGGGGGGGGGA
TTTATTTTATAAAGAGGAGAATATTCAAGTTTTTACAGTAGTGCATTATG
GCGCACCCTGTATATATAATTGAATTATATGAATAATTGGATTTTTACAT
TTTCAGGTTTAGAAGTTTTTGATTCAATGTTGAGTCCTCCAGTCAAGAAA
TTGGGGTTTGTCTGTATTTGGTTCAGTTTTGCTTTTGCTCTATTTCTACT
CAACATGTAAGGAGTTTTTGCATCAATTTTTTTTTTTATTATTATGTATA
TATATGTGGTGTGCTAACATAAAAAACATCTGGACCAAAATAAGACAAAA
GGAGAAAATCTCAATTTATTATTTTTCTTTACAAATCTATACACATACAG
CACAATACTTCATTGAAATATTTGAATCAATTATAAGTTTAGTATTCAAA
TTACTGGTATGAGTTATGATACTCAAGACTTTTAAATATAGTTAATAACC
TTTATTTGATTTAAGAGACTTATATTGGGCCCGATATGGTACTTTTCACC
TATCACATATCTCAATTTCTCATTCTTTTGTTGTAACGATGAAATTTTGG
CAAATTTGAGTGCAATTTGTGGCCCACCCAAAAGGTTGATAGGGATAGTT
AGTTGACATTTTGTATTTTTTAAGTGATCCCATTTTGAAATATTAAAATT
ATCTACTCATCGTGAATGGATCGCTTTATTGTTTCCATTCTGGTCTCTCA
TTCCCGAGGAAGGAATCCACTCTACTCCATTATGAGGTCTGGTAGTTTTC
CTCCAATAATTCAACTCCCATCTTCCCTCATGGAAGTTGGAATTCGAATT
GCAACAGCTTTTCAGATGGATGATCAAGTTAGTATCTTCCTTAGATTGCC
TCGATCTTCCTCTTACAAGGCATACCGTCATGAAATGAGTATTGAAATTG
TAAAAAATATGATGATAACATTGACTATTTCCCATTTATCAAAAATGGGA
TCACTACAAAAAGGAATAAAAATTCTTGGAGATGCATATTGTTTAGATTT
TTGCAAAACATCTTTTTTTAAATTATTCATTGAATATTTTTCTATGATTT
AAGCTTTACTTTTTTTCAATTTGTCATTTGAAAAAAAAAAAATGAATAGA
GAAATGTAATATTTAAAAATGGAATCACTTAAAAAATACAAAATGTAACC
AACATCCTTGGAGACGCATATTTTGTAAATAGATCCTTGTTTTTAAATTA
TACATTGAATATTTTTTATAATATAAGATATTATCTTCTTCATCACTATC
TATTATGAATAAGTTATAAGGGTATCAAGAATAGTGTCGTTTTAAAAAAA
AATTTAACCTAAAAATAGAAATATATCGAATTCAGAATAAGGTACAGAAT
CAATAAAAACAATTTATAATAAAATAAAAAAATACTTTTACCTAAGATTT
ATTCATCCTACTTTTAATTTGGGATTGTTTTAAGGGTAAAAAATGTCTCT
GAAGGATAATAGTCCCGAATTACTATGATCCCAGATATTTCAGAATTCAG
ATGACTGAGAGAAAGGCTGAGCTGAGTTTTTGATTCTGCGCTCATAGATA
AATTCGATTATTGTCTTCAATTCATTTGTACAAAATTCCACACACCCTAT
TTGTTCCCCTGTGTATTATAAAACTCTTTTTTTTTTTCTCAGAAATCACA
AAAGAAAAACCTATAATGCCATTCCCAACTTTGGGATTTGGCAAGCATGT
GTTTTGACCGTGGTTGGCTTCTTTGGTGGTATATTTAGTGCAATCGCTGG
AAGTGGAGTTGACATATGTTCCTTTTCCATACTCTCGTTGCTCTTCAGGT
AAGTTCATTCATTACCTTCCCCATTCAAGGAATATGCTATACATGAAACG
CGTWCTCTTTTTCACCTTCCTTTTTTTTTTTTGACCAACTAAGGGCCATT
TTTGTTAGGAAAAAGTAGTTATGAAATGAAAGATGCAACTAAATTGTACT
AATCATCGAATTCATGTTTTAAGGAATTAATATTTTTTGATCAAAATTAT
CATGAATACAAAAATATAAAAGTGTAGTAAACAGAAATCCATTATTTTTC
TAATAAATGGCTTTAGTAATGTGTATCTCGAGTTGTATAACTGCAATTGG
TTTAGAGTTTGGATTTTTTTGAGTCATTATTATTTGTGTAAGTCTCAAAA
ATGGACAACAGCAAACAGAAAATAAGCTATATTTTACAGTTTGTTTGTTT
TTTTAAAACGCTAAAAGTAAATTTTTGTACAAAATAAATTTCAAGCATTA
ATTTTTTTGGAATTTTTTTGATAAACTATTTCAAAAAATTCAATTTTTTG
GAAAAAAAAATTTCAAATATTAAATTGTCGGACAAAATTTATGTGAAAAA
CAAATATTAGCTTTGTTTGAAAAAAATTTCAAAAATTCTCAGTTGTTAAT
ATAAAATGAAAATTTTTCGGAAAAAATTTCAAAAATCCATTGATATACTG
AAAAAGTTATTTTTTTTGAAAATAAATTTCAAAAATTCACAGATTTTTAA
AAAAAGTTAATTTGTTTGGACAAAAAATTTCAAATATGATATTTTTAGGA
AAATTATTTAAAAAATCCTCAGTTGTTGACAAAAAAAAAAAAATCCAACA
GTAAAATTTAAAAAAAAAAATTTTTTTTGTAGAATATTCATTTTTTTGAA
TAAAAAATGAATTTATGTCAAAATCTGTGGATGGTTGAAATTTATTTTTC
AATAAAATGCTTCACCAAAAATCGACCTAATATAACGCAGCCATTCTAAT
AATAACTAATCGTTATGTTTTAATAGTAATAACGTTAGGATATTTATTGT
TTCGGCATGAGTAGTCAGTAAAAATATATTCTTATTCCTGAACCAATTTT
ATTTAGGTTTGAACTTCTGAAAAAATGCTTCGAGACATGCATCCCTATAA
TTTTGGTTCCGGATCTGGATCCAACCCCCTAGTATTTAGATTTAGTGATC
CGAACTGATTCATTCATTTCCGAGAAAATATGATCTGTAAATCTTAACCG
TCATGTATGCATTGTTTTGATTGCATCTGAGATAAAGAGTCAGCAAAAAA
AAAAACACATCTTTTTACTAGGAACAAAAGTGGTCGTGTATATTGTATTG
AGTGTTCCTTGGACTCGAGTGAACTGTCCAATATTACTTACATAATTTTT
ATTTCATCAGGGTGAGTGAAAAAATTTCAACTCCAACTTCCGTGGTACTC
ATGGCAGCAAATTCAATAGTGGGMACATTCTGGCGGAACTTTATGATGGA
TGGCGGMGCAGAGATTGAGGCAAAGAATTATATGGCCGTCTGTGTGGTCG
TAGTCACTTTCTTTGCTCCTTTGGGATCTATCCTTTCCTCACACTTTCAT
CGACATATTCTTGCATCTCTTATTTATATTTTAGACACCATTGCTCTGGT
AAAACTCTCAACTTGGTACTTTGAATACAATAAATTCTAAATATTATCTT
CTACAGGTTTCTGCTCTTGTCATCATTCCCATGACACAGACCCATATTAT
ACTATGTGTGTCTATATTGTTACTTGGGTTTATCTTTTTCTACGTACTCA
GTTTCTTGGGAAGTAAACTTCTAGAGAGGKAAATTCAAAGAYAAAACGAG
GAASCAGCCATTCTGCCCATAGCATCATCCATAGAGAACAACGATCCATC
TATTCATTACTCCAATGCTACATTGTCCTCCATCTTATGACCATAATGAC
ATCATTTTCATTTTAATACGTCATGTACATAAAAATATAAATACATATTC
TGACCAAGGAAAGGTTTCGAGTATCTTTTGGGGTGAGGGGTTATTGATTT
ACATGATATTATGTAACTGGCGGGGTTATTTTTAAAAACTAGACATTTTA
ATTTGGAATTTCAACCATTTTAATTTTAGAAACTACATTAGCAAAACTTT
GACCGGATGCTGGTCCATGTGTTGCCATTTCTAATTTTTAAAATTACCTC
AGAGAAAAAACTTACTTTAAAAGTTACAAAAGGAAATACATTTAGTATTT
TTCTTTTTTATATATAATTTATGATAATTCCATTTTAGAGCATTCTGTTT
TAAGCATCTACCTCTATTTAAATATACAGTGTTGGGCAGCAAAACGTGGA
TCGTTCATTAAGGTTAATTTTTTCATTAATATAAGAAGGTTTAATGATTA
TTTTGATATTCTGGTTCAGCCATTTTTGTGCATAAATAAACAAAAATAAA
CATTTCGTAATCTCGTTATCATGAGTGAGCAAAATGCCGAAGTTGAAGGA
TTATGGACATTTTGATGTACTCCAGGAGCCTGGTTTTCAAGGTGGCCACG
ATAAAGAAGGATAAGGAAGACCTCTTCAGGAGAGGAAGAAATCTAGGGCG
CACTTTAAAGAGGGAACCATAGTTCCTGTCCAGCTTGATCATCAGACCAT
CGAAAGGGGGGATTGTTCTCATATAAGAGGATCCCATACAACTTTCTGAC
AGAGTTTATGAAGTCCAGGGGGCTCAAGAGATAAAAAGACAAAGATATGT
GGCCCCTTAATTTCCAGATTTGAACCCATTCGACTTTGATGTGTGATATA
CTTGGAGAGGGAAACCAACAAAACGCAAATGCCCCACTATAAGCTCTGAG
GTGTGATAGTAATATAATTACGGATCATGGAGTTCCAATACTCATCAACA
AAAACCTTGAGGGCTTTGAGATTCAGTGCTTTTGTCCGGAAAACTCTGGT
TTTGACATGTGGACAAAGGGAAAAGTCGAGCAGGGTGACATGAGGCGAGC
ATGGTGTTCATATTGTTTTCGGCCAGAATGAAATATTGGTCTCCAAAAAG
GAATATGTAACCATAACTGTGTGTGGTGATGCAACATCCTGTTGAAGCTT
GTCTCGATGTCAATACCTTCCTTTATAGCCTTGTTGACATTGTAAATAGT
ATGCTTGCTTGTCCAAGTCAAGTTGCAGACCTATGAGTTCTTTACGTAAA
GTAAAGCAGTAATCTCGATTATTTTGTCTCTCTAGGAGGCCATTATTCGA
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GTTGTAAAAGTTCTCCAGTAAAGATTTGAAGTCTTCATCGTCCGGGTATA
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ATAAAATTTTCGATCCCATCAAATATCTGGCACGACCTTGCCATATACCC
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CCAAATGACATTCGTCCAAATGGAAGAGCCCAGGACATATAGTAAAAAAT
CGCAGAACACACAAAATACTTCTGACCATTTTGCCTCTCACAAACAAACT
AAACATATGATATAGTTTTAAAGAATAAATATATCTTATTTTTTAATGTA
TTAACATAAAAAAAATAAAAAATCCACCTTACTGTTTGAACATACCCCGT
ATACATATTTGTCCCATAACAGCACTGATTGTAAAAAGCTGATAATTGTT
TGGGCCGCATTTGAAAGTTCAGTGGCAAGCACAATCCTGGTAATTAAAAA
GGTTGAGAATCCCACTTTCCTATACAAAATTTAATCCTATTCAAAATGTC
CACTGTCGAAAATCAAGAAGTCTCTCTTTTAGCTAGCAAGGTATTTTGGG
GAATTAATACAAAAAAACATTACAAATTACTTCAAAGGGAGGGAGACCCA
TTTTAAAACTTAAATTATATGTGAGAAGATATATTTTTGCCAATATATAT
ATATGAGGGCGAAAAATCCTAGAACATGTATACAGGGTGCTCCCTGATGT
CAATTATGTAAATATTTTTTATATAAGAAATAATAATGTAGTCGTATTAA
TGAAATATTTCAGGCATGTGCAATGTATTCCAAGATCATTATTTCTGTTG
TTGTTTTTGGTCTCTTATGTGTAAGATAAAGAAAGATGG back to top
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