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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s975 | supercontig | LSalAtl2s975:43541..51448 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012805 >EMLSAP00000012805 ID=EMLSAP00000012805|Name=EMLSAP00000012805|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=999bp
MMKQGYEDYKRHKNDSIINNXPVTRLKHGIVQRIPSSKIEVGDVLQIHEG
DDFPADLILLSSSDPRGRAYIMTANLDGETNLKTVLSPKPTQNLKKAEDL
SDFSCRIECENPNSDLQKFVGRILVPGNTKEPLSQENLLLRGTSLKHTAY
VFGCVVYTGQDTKMSKNSKMTPIKFSTVELSLNRYLLFFVVLLLAEVFLA
SILRFTQGLDLELVGPVPWYLGPSVVVNIYQVIQDSLSFLVLFNYVVPIS
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DKTGTLTENVMLFKECSIDGLRFADSATSLLSLNETKSSEKSINHFLQSL
ALCHTVEVSINDSDLHYEASSPDEKALVDICRKYGTAFMGTFDTGDEQSE
EEILQLVIKDRPKEQLFKRMRILEFDSDRKCMSVIVQDEEGNIRLICKGA
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AGIKIWILTGDKRETALNISQSCGHYXPSTMHLLDLCKEGSQVSDAITDY
LYKTRVGDDRNCLVIDGKAVRSLFAFKDTIEPFLNLALRCRSVICCRMSP
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KKIANNALLDFKNFIIWFSAGVWHAIVIFFGFYLLCEDVDLSRVSFGLGI
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YGIVTDYWLPVDRLTYWEIYILMSRYQIWFGWLLLVVVCISLDLFVLTSK
KSAKDFETVFKMLKSKFGKKSFDLNSQRWEDTTAFTNMAFVISREDIKH back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s975:43541..51448+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012805-708652 ID=EMLSAT00000012805-708652|Name=EMLSAT00000012805|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7908bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s975:43541..51448+ (Lepeophtheirus salmonis)
CGCTGATATAAGCAGAAGGATTGAGTTGTAGAGGGGGGGAGGGATTTATA
TTTACAAGGCTCAGTCTGATTTATACATAATAATGTGTAACTTAATTTGA
TAAGGTTAAGAGATAATGCTAAAATGGAATCAACACTACTTGTGGACTTG
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AGATGCTCCTCCACCTCTTCTGGAAGAGGAAGTTGACGACTCTGTTCAAA
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GGAATTGAGCATTTATTTGACTACTTTAACTTTTTAGATAAACATAAAAT
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TTTTTAGCCGTAAAGTGGTTGAATTTTAAAAATATGMAACGCCTCTTTGG
AAATTACTTGCTAATCATTATGAAATAAGGGTTTTCCTATATGTTATAAG
GGGTTGAGTCATTGTTAGGCTGTTATTCATTATTTGCCTTAATAGATAGA
TAAGGTTAATTACATAAAAATAAAACAAATAAGATTAGCCAGTAGAATTT
TCTACAAGATCTAAAGTGCGTTGAATATTGGGAAAATATTTTTATTCTTC
TTAAAAAAATAAAAAAAATGGAATAAAATTAATGTGGTTTAAAAGAACAC
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TGACAATTTATACAGGATTGTTCAGGTAAATCTGGACAATCTTTAACTAC
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AAAGAGCACAGTCTACGACGTCTACTACCACTGGAAGGAGGAGGGCATAT
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TATGCTTACAGACTAAATGAAGGCCACCCAGGCTTCCCAATGAAGAAAAA
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TCTTTGACCCAAAGGATAGGGTGTGCCCCAACAGGTACTGTACTCTGAAC
TCCTGTTTGGCCAAGTGATGCTTTGGATGCAAGCGGAAGCCAATGGTGTC
CAGTTATTCTTTCAACAATATTCGGCCCTTCTCACAAGTCCTGTAAGACC
CAAAACTTGTTGAAAGAAGAGAAGGTGCTATTTTTGGACTCCCAGACCTG
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TGGCCAAGGCCTGTAAATACTTTAGGGCTCGAATCAAACGAATGATTGTC
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CTAGTCATGGAATAATAAGAGTAAATTAAATACACTGCCCTATAATATAT
AAAAACTAAATTCATCCCTTTCTACATCCGTTTTTATGTTTGATTAATGT
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CTATGTGATATTACATAACTTGATCAGGAAACAATTACGTAGTCAAATGT
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TGAGTTTTTGAAAAATATTATTTTTACCAAAAATCCAATAAGTCAACAAA
GAGTAATTTATAATAAAAAACTATTTTAGATGAATAAAATATTAAATATA
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AGGGTTTTTAAAGTTCAAAAGTGCATATTTCATTGAATCAGCATTTTTGA
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AATGTACATATTAATATGTACTAATATGTATAAATTAATGTATTAATTAT
TAATGACTTGAGCTAACAACCACAGAATTAAACAATTCAATATTTTCTAG
CGTAATGAATAATTATGAATGTCTGCTCATTGCTATATAACTCGACTATT
ATTATATATGTAACTAAAAATAGCAAAATATTTCTTGAAAATCAGATGTA
ACAAGTTTTAATTGATGATTCAATTTAAATTGTTCATCCATAAATTAAGA
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GGTAGTTGCTAATTAGAAATCTCTTTGTACTTACAGCAATTTATTTTTTC
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GTTTGTTGTTCTTGTCACTATGATGAAGCAAGGCTATGAGGATTACAAAC
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AGGTACATATATTATTATCATTATGATATCTTTGTCATCATTATTTAATT
TATACTTATATATATATTTATAAATTATTTAGATAGAAGTCGGTGATGTA
CTACAAATCCATGAAGGAGATGATTTTCCAGCGGATTTGATATTGCTCTC
CTCATCGGATCCTCGTGGAAGAGCCTATATAATGACTGCTAATTTAGACG
GGGAAACAAATCTTAAAACTGTGTTATCACCAAAACCCACACAAAATTTA
AAGAAGGCTGAAGATTTATCAGACTTTTCATGTCGTATTGAATGTGAGAA
TCCAAACTCGGACCTTCAAAAATTTGTTGGTAGAATATTAGTTCCTGGAA
ATACAAAAGAGCCACTAAGTCAAGAAAATCTTCTACTAAGGGGAACATCC
TTAAAACATACAGCATACGTTTTTGGCTGTGTCGTCTACACAGGTCAAGA
TACAAAAATGTCGAAAAACTCGAAAATGACTCCAATTAAATTTTCTACCG
TTGAACTGTCTCTGAATCGATATTTATTATTTTTTGTGGTTCTGCTACTA
GCTGAGGTATTTCTAGCATCTATTTTAAGATTCACTCAAGGATTAGATTT
AGAACTAGTAGGACCTGTTCCTTGGTATTTGGGGCCATCTGTGGTTGTTA
ATATTTATCAAGTTATACAAGATTCACTTTCCTTCTTAGTTTTGTTCAAC
TATGTGGTGCCTATATCCTTATATGTCACCCTAGAATTCCAGAAATTTGT
TGGCAGTTTCTTCTTGTTATGGGATGAGAAACTTATAGATCCCGATACAG
GAAATCCACCGATCTGCAATTCTTCTGATTTAAATGAAGAATTGGGGCAA
GTGGAATATCTCTTTTCAGATAAAACAGGAACACTCACAGAAAATGTGAT
GCTCTTCAAGGAATGTTCTATTGATGGATTGAGGTTTGCAGATTCTGCAA
CTAGTCTCCTCTCGTTGAATGAAACAAAATCATCGGAAAAGTCAATAAAT
CATTTTTTACAAAGCCTGGCCCTTTGCCATACTGTTGAAGTATCAATTAA
TGACTCTGATCTTCACTATGAAGCTTCAAGTCCTGATGAAAAAGCTTTAG
TAGATATCTGTCGAAAATATGGCACAGCGTTTATGGGTACTTTTGATACT
GGAGATGAACAATCTGAAGAAGAAATTTTACAGTTAGTTATAAAGGATCG
GCCTAAAGAACAATTGTTTAAGAGAATGAGAATCCTAGAATTTGACTCGG
ATCGAAAGTGTATGTCTGTGATTGTTCAAGATGAAGAGGGGAATATTCGA
TTAATTTGCAAGGGAGCAGAATCCTCAGTTTTGCCAAATTGTATCTCAGG
AGAAATTGAAATAACAAAGGAACATGTAGATATATATGGTACTGTGGGCC
TCAGAACATTGGTTGTTTGTGAAAAGCAATTGACGGAGTCTGAACTAGAT
CAATATTTGGTGAAACTAAAGGAGGCGTCAATTTCATTAGTGAATAGATC
GGAAAAGTTAAAAGATGTTTATCGGGAAATTGAAAAAGATTTACATGTGT
TGGGAGCTGTTGCTATTGAGGATAAATTACAAGATGGAGTGAAAGAGACA
CTTATTCGACTTGGTCAAGCTGGAATTAAAATTTGGATTCTTACTGGAGA
CAAAAGAGAGACTGCTCTGAATATTTCACAATCATGTGGACACTATGMCC
CATCCACAATGCATTTACTTGACTTATGTAAAGAAGGAAGTCAAGTATCC
GATGCAATTACAGACTACCTTTATAAAACTAGAGTTGGAGACGATCGTAA
TTGTTTGGTGATTGATGGGAAAGCTGTTAGATCCTTATTTGCATTTAAGG
ATACAATTGAACCTTTTCTTAATCTTGCTTTGCGATGCAGATCCGTCATT
TGCTGCCGAATGTCTCCTCTTCAAAAAGCAGAAATCGTCAAATTAATCAA
AAACTCTCCAGAATCTCCCATTACTRCATCAATTGGTGATGGAGGTAACG
ACGTTTCTATGATTCAAGAAGCTCATGTTGGATTTGGCATAATGGGCAAA
GAAGGACGTGCAGCCGTACGATCATCAGACTTTGCCTTTGGTAAATTTAG
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TAAAAACTTTATAATATGGTTCTCGGCTGGTGTTTGGCACGCAATTGTGA
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AGTTTTGGCCTTGGAATATACCAAACTTCCCTTATTGTAGTGAGCGTCCG
TCTATTAGTTCAATCACGGTACTGGAATATGTATCTCATTGGAAGCGTAT
TTGTATCCTTGGCAGGGTTTGTCATATTTACATTTATATTTCATTCACTT
CGCATCCCATCCTCCTTTTACGGAATCGTTACGGATTATTGGCTTCCTGT
TGATAGATTAACGTATTGGGAGATATACATATTAATGTCAAGGTATCAAA
TCTGGTTTGGATGGTTGCTCCTTGTCGTGGTTTGTATTTCACTAGACTTA
TTTGTTTTGACATCCAAAAAAAGTGCAAAGGATTTTGAAACTGTATTTAA
GATGTTGAAGTCAAAATTCGGAAAAAAGAGCTTTGACCTCAATAGTCAAC
GTTGGGAGGACACAACTGCTTTTACAAACATGGCCTTTGTGATTAGTCGT
GAGGATATAAAACATTAGTGCATTATAATTATATTCATACATCAGTATTC
ATTTTTTTTTTAATAATTATTTCTATACAAACAACACACGTCTTTACGTA
ATTTTTAAACATCTTCATCCTATATTTCGTTTTACAATCAAAATATATAC
ATTATTTATTAAGAGCTTAAAATGTACGAAAATGCTTTTCTGAAAAAAAA
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ATCAGGAAGCGAATCTCCTGTTTCGGGGAGTAGAAGTGCCAAGCCAGCAG
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TTAGATAAGGGGCCCATCGTAGTTGCTAATATACCTCCGATTCTTGCAAC
AAAGGAAGAGGCGCCAAGTGCTCCATTTCTATAAAAAGTGTATAATATTA
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