EMLSAT00000012808, EMLSAT00000012808-708655 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012808
Unique NameEMLSAT00000012808-708655
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s976supercontigLSalAtl2s976:19394..33922 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012808 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012808EMLSAG00000012808-695574Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000057511EMLSAE00000057511-766439Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057512EMLSAE00000057512-766440Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057513EMLSAE00000057513-766441Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769390auto769390Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012808EMLSAP00000012808Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012808

>EMLSAP00000012808 ID=EMLSAP00000012808|Name=EMLSAP00000012808|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=101bp
MAFYRRQVFLVEFHTKGGTKRYRKVLYNNIQAIKQPFIRRFDHVGGVKRT
NGRINEEKRGVLRVFLKNVILDVVIYTEYAEKNTLKFCPFQNYSLETGSV
A
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mRNA from alignment at LSalAtl2s976:19394..33922-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012808-708655 ID=EMLSAT00000012808-708655|Name=EMLSAT00000012808|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14529bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s976:19394..33922- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCATTCTATAGAAGACAAGTTTTCCTAGTGGAGTTTCATACAAGTAC TATATAGAAATAAGTGTGATTTTTTAAAACCCACTTGTAATAAGAAAATG ATACCTATAAACAGTCAATATATTAGTTCCGAAGAATTCAAGATTTTGTT AAATTTTTGGTGAAACTACAAAAATTACTCTCGAATTTTACATTGTACAT ACTCTGCTTGTATTGTCACAATGCAGGTAGTTGTACCTTAACACCTGCAT CTACTAAATAGTTTAAAGTAACGAGTATTTCTTTGCATCTTCATCACATA GCAGTTGCTATTGCATCTTTCAATCAATCATCGTTCAAAATAATACTACA AAATAATTGTTAATGTTTTGGGTATACCATTGCTTTTCAAATACATATAT TGTATTAAGCAAGAGGGTCATATGACATATTTTATTCGTATATTTAATCA TAAATACATAGACACAGTGGTACTATAGCATTTTTTTTTAAATATCCATG AAAATTTGTGTGAGTATGATATCGTCAATAGTATTGCTACAAATTAAAAA AATGAGACTTAAAAGCTAGTTTTTTGTCATTTTTTAGATAGAAATTATTT CACAATACAATTAACCTAATAAAATTATAAAGATCTATTTAACTAAAGTA ATATAATATGATATTACTTTTAATTTAAAGTAATATCTATGTAATATAAC TATTAGGCTGTTATAGTACGGGGTTGTACCACAATTTGGTTCAGTATGAA ACTTACAGCTCGTTAGATTTTTATTCTCGATGCGGTACTTATATATATAT TTGAATATTAAATTATAAAATTTTGGTTTTGATTATTTATTTAATTAATA GATTTAAATAGTGAGGTACGATTATAATCCATAAGTATCCTTTTATATAA GAAATAATTTATGTATTTGTCTATACAAAAAAGAGATAAAGACTCAAAAA 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CACTTATCTCATGTGACCATAAGATCAGGTTTGACTGTACATGTATTACT TTAGAAGGTAGTAAAAAGTAACTTAATAATCTACAAAGAAATATTTCCTA CCACTGAACCAATCAATATGTGATTTGATTGTATGAATCTGGCCTCTCCA TTTATGAATTAGTTCTGGCACTCCTGAGTACATATCTAATACAAGAAAAT GTAAGCTACGGCTATAAGTACTTGAATATTTAATTATTCAAAGTTAAATA TAGTTCAGANTCTCCTTTAATTGTTTATATAAAACATATTTATATTTATG TAATTCTACAAGAACATATTATGATGTGAAAAACAGATGTGTTTAATTTG ATACAGAACAGTAGATTTCCCGAGTAAATATACAATTTGAAAGCTAATTA AGAAAAATTATAAGGAGCACTATAAAGGCACTTAGTTATTTAAAAACTAA GTTTCCTTCTTTTTTAAGGAAGCAGGAGAAACAAAAAATATGCATATAGT ATTTTCCAAACTCTATACGTGAAATAAAGTTGTTTCATATTTTGTATTGA TGCTATAACCTTTAATGAATAAAAGTTTCAAGAATGCGGCATAAACATTT TAATTAAAGGTCTGTTTCAAGAACTTTTAAATTTAGCTCATATCTTACTA GATCCAAACTTTTTTTATAAAGTAAAATACAACCTCAAATGGAAAAACAA TGTTATTAGTTTTTTGTTTGTTTGAAATAGTATTTTCAATAGAGGAAATC GTATCTCTCAGAAGAAAAAAAATATACTACGACTTTGTACGATTGTTAAA AAAATTAAATTCACCATTAAGTTTTATCTATTTTATCAAATACAATCGAA ATGTATATATTTAATTCGAAAAGAAAATTCCAAACAACGTAAACATTTTT GTCTCTTGCAAAATTTTCTAGAAAAGGTTCATAAGATGGCATTAAAATCA TTAGTAGGTAGACCATTCTTCCAAACTATGGAATAATTAATCAATGGTTG TTGGGAATCGTTCACAGCTTAACGAAAGCTAATTTGAATGCAATAAATCA ATGTTCAGAATACTAATAAAAGGGTTCAGAAAAATCGACAACTGACAACA AATTTATGTGCAAATCTTTATGGTTGGGTCATTCCATGTCAAATAGACCA GGGAATATCAACCGTCTCTCTCAAATTTGGATAATTTTTGGCATACAAGC TAAAATTCATGAGTAAATTAATTATACCAAATTTCAGCAAATAATTCTGA ATTGTTTATGAGATATAGATACTCGTGCCAGTGCTCGTTGTGAGGATTCA AAAAATGAACTGAAAAGTAGATTATTTAAATGTATTTTTTCCTTAATTTT GATTTTTTTTTTTTAATGCAGAAAAAACTGACTAGTATGTGCAGGAATAA AAAAACTACCTAGTTCTTATGAAAATAAAACTTTGTTACCATATTTTAAT TATACAGGGATGTTACTATGCTACAAGTCAAGTTTACTTTTTTATCATAG TTTTATGTGTAGGATCTCAAATGTAAGTTACTTTTCAGCGGAAATTTCGT CAATTTTATGTACGTGTTTATATCTTGACTTAATCTACAACAATTCATAA TATTGGTTAGATGTTTACAAATTTCAAAAATTATAAGCAGGTATATCCCT TGTCTATAAAACTGTACATAATTTTAAAATAGTTTTTTCATCTTTTTTTA TTTTTTTATACTTGAAACTGTCACTCTTGTTGGTATTTATCCATTTCGAA AGTTTCTAGAAACAAAACTGATTACTGTTGAGGAGAAGGATACCATTATT ACGGTCAAACTATGAACCAAAAATAATAGAGCTGAATTAGATAACAGAGT AAAAACTTTAGAAGAATTTATTTAAATTGACCGTCTAGATTACTTAATAT 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CATAGTTGAAGCGACATGGACTTAGTTTCTACCCCTTTGGAGGCTGAAGA AGCCATCGTCGACTTTTTCATTCTTTCATTTTTTTGTTCGAGATTGTAAT TTTATTGCTCTGTCTTATTTTCCCTTCCTTTTTTTATTTACTGGGATTCT AAAATTAATTATTTATTTTAAAAGAACAACACAGAAATAATCTTGTATTT TATATCTATTTCTATATACAAATATTAAACTCTGTCGTCGTGATAGTAAT GGGTGAACGATGTTCTTTTTTTGTACAATTACTGCGTCATTTCGACGTCA ATTTGGTAGAGAGACACTTTTAATGGGACTTAACCCTAATAATAAGATAG ATTATAATTTTTTTACTGTAGAGGTAATTAATTACAAGGGTCCCCACATA AAGTGGTTTCAAATACTGTAAATTTCGCATAACGCATTGCTTGGAATTAT TCTGACTTTCCCTTTATATAACAAATTATACAAAAATATACATATATTGA GGTAAACAATAATTTGTATAGCTGTTGATGAATTAGTTCATCCTATGCCT ATATATTAATATGATAAAAGTGTACCATTTAGCATATCAGGAGGAGGAGA GAGTGTTCTCTAAGTATTTGATTTGGTACTTACACTTAAAACTTTTGGCT AATACTCATGATACAAACTTGCGATTAAAAAGGTTGCTGAATAAATATTG GTTAAATTCGATTGTTTTAAATTTTACAATACTGAAATGAATAGATTAGA AATCAAGTAAACACTCAATCAAGATTAAAATATAACAATAATTAATCCAG TATTTTGTTTGCCATACACTATTTAAAATAATTTATGATAAATAAAATGT TTTTATACCGTACTAAAAAACAAACAAATGAAAAATAGAATAAAGTGGAC TTTGAAGAATTATTTTTCCTATTTTACAGGTTTTTGTACTTAAAAAGTCC 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TTATTTTGCAATTAAGATAGAATTCCTTTACTTTAAGTATTAATTTATTT TTTATTAAATAGACGTCTAACAATACATGTCACTGCTAAAATATACTTCC TAAAATGAGAGCAATACTTTTGTGAAATACCATATTTTGATTGAAAGGAT CAAAGATAAATGTACCTAATCACGACACCAAATTGTGTTCAAATTCGTAA GAATTGATTCCATGATTTATAGATGAAATTAGCACTAAAATATAGGTGAT ACAAGCGTTAAACTCTCATGTAATGACATAGTATGTGTCGTAGTGATCTT GATATTAATTTTTTTTAACCTATGCCAAGCCAAAATATAATTAATGTATT ATTACTAGCTTTTTTCAAAAAAATTAAGGTTACTCAATTTTTTTTGCAAA AAAGTGAAGGGCCATACCCCTCCACCCCTCCCCATGACATCACGGTCGTT TAGTGCAAATTATTTATCGATTCATGGAATATATTAAAAAATATATAAAC AGAATAAGTACTCACATATATATATTATATGGGCAAATATGGCTACWCTT TCATATTTTTTTAAGGAAATAAATTTGATGTTGTTTCTCAGCCAAAGCTA TTTTTAATCTTTTTTAACTATAAAAATTAGCACTTTTTGTTTTTCTTAAA AAGATAAAAGTACAAGATTTCGTCTTGCTCNTTATTTATCTTCCCCTTAT ACAGATTTTGTTCTTAAAACTAGGAGTTGCACTTCTAACTGTTTTATAAT GTGCATTTTAAATTTCGGTTTTACTTTTATACATTTTTTCATATTCTTTA TTCATCAAACTTGAGGTTAACGCTGATTACAAAAGATACTTATTTAAAAG GAATACAATATTCAAAAGGAGAACAAAAATAAATCATGAACGGGCTGCTA ATTTGTAGATTGAAGTCATCCACTCAATACCGCAATAGGTACATACTTCC 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