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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s976 | supercontig | LSalAtl2s976:19394..33922 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012808 >EMLSAP00000012808 ID=EMLSAP00000012808|Name=EMLSAP00000012808|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=101bp
MAFYRRQVFLVEFHTKGGTKRYRKVLYNNIQAIKQPFIRRFDHVGGVKRT NGRINEEKRGVLRVFLKNVILDVVIYTEYAEKNTLKFCPFQNYSLETGSV A back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s976:19394..33922- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012808-708655 ID=EMLSAT00000012808-708655|Name=EMLSAT00000012808|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14529bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s976:19394..33922- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGCATTCTATAGAAGACAAGTTTTCCTAGTGGAGTTTCATACAAGTAC
TATATAGAAATAAGTGTGATTTTTTAAAACCCACTTGTAATAAGAAAATG
ATACCTATAAACAGTCAATATATTAGTTCCGAAGAATTCAAGATTTTGTT
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TATTAGGCTGTTATAGTACGGGGTTGTACCACAATTTGGTTCAGTATGAA
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GATATTGTGCCTGCTAATCGATCTTGTTTTTTAAAAGAAAATGTAGACAA
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GTCTTACCAAAGAGTGGGCTAGCGTATTATCCAACCCATAATAACTACAT
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TTTATGAATTAGTTCTGGCACTCCTGAGTACATATCTAATACAAGAAAAT
GTAAGCTACGGCTATAAGTACTTGAATATTTAATTATTCAAAGTTAAATA
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GTTTCCTTCTTTTTTAAGGAAGCAGGAGAAACAAAAAATATGCATATAGT
ATTTTCCAAACTCTATACGTGAAATAAAGTTGTTTCATATTTTGTATTGA
TGCTATAACCTTTAATGAATAAAAGTTTCAAGAATGCGGCATAAACATTT
TAATTAAAGGTCTGTTTCAAGAACTTTTAAATTTAGCTCATATCTTACTA
GATCCAAACTTTTTTTATAAAGTAAAATACAACCTCAAATGGAAAAACAA
TGTTATTAGTTTTTTGTTTGTTTGAAATAGTATTTTCAATAGAGGAAATC
GTATCTCTCAGAAGAAAAAAAATATACTACGACTTTGTACGATTGTTAAA
AAAATTAAATTCACCATTAAGTTTTATCTATTTTATCAAATACAATCGAA
ATGTATATATTTAATTCGAAAAGAAAATTCCAAACAACGTAAACATTTTT
GTCTCTTGCAAAATTTTCTAGAAAAGGTTCATAAGATGGCATTAAAATCA
TTAGTAGGTAGACCATTCTTCCAAACTATGGAATAATTAATCAATGGTTG
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ATGTTCAGAATACTAATAAAAGGGTTCAGAAAAATCGACAACTGACAACA
AATTTATGTGCAAATCTTTATGGTTGGGTCATTCCATGTCAAATAGACCA
GGGAATATCAACCGTCTCTCTCAAATTTGGATAATTTTTGGCATACAAGC
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AAAAATGAACTGAAAAGTAGATTATTTAAATGTATTTTTTCCTTAATTTT
GATTTTTTTTTTTTAATGCAGAAAAAACTGACTAGTATGTGCAGGAATAA
AAAAACTACCTAGTTCTTATGAAAATAAAACTTTGTTACCATATTTTAAT
TATACAGGGATGTTACTATGCTACAAGTCAAGTTTACTTTTTTATCATAG
TTTTATGTGTAGGATCTCAAATGTAAGTTACTTTTCAGCGGAAATTTCGT
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TGTCTATAAAACTGTACATAATTTTAAAATAGTTTTTTCATCTTTTTTTA
TTTTTTTATACTTGAAACTGTCACTCTTGTTGGTATTTATCCATTTCGAA
AGTTTCTAGAAACAAAACTGATTACTGTTGAGGAGAAGGATACCATTATT
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AAAAACTTTAGAAGAATTTATTTAAATTGACCGTCTAGATTACTTAATAT
TTATTCAGCAACCTTTTGAATTACAACTTTGTATAATAATAACAAAAAGT
TTTAGGGATTATATCATCCCCCTCTGCTAAATTAGACACTGCTATATATG
AATATATAAACATAGTATCAACTAACTCATCAACAACTATAAAGATTATT
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AACCCGATATAAGGGGAATACTTATMCCAGACTATAATATAGGGAGTCAA
AATAATTCCAGACATTCCGTAATAGGAAATAGGCAGTGTTTGAAACCATA
ATTATTGGAGCCTCATATTTTTTTGAAATTTGTCAACTTTTAATTAATAT
TATGAATTACTGGAGTTCAGTTTTATTTTCAAGTCTATTTAGATCATAAA
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AAGTTTCATTTTTATAAGAGTTGGGCTATATTTTTATTCTCGATAAGGTA
CTTGTCAGTGTATTTCAGAATTATTTTTTTAAACCAAAATTGAGGTAACA
AGGCATTTAAATATTTCTACTTTTGTCTTAATTTTTGAAATCCTCACACT
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GAAACAGTAGTGTTCGGTAATAAGACATTCAAACGACGCTGAAAATTGTG
ATACAAAAAGGGACTTGGACGAGTATCTATATCTCATGAACTACAAATAG
TTATCTTCTGAAATTTGGCACAGTTGATCAACTCATTAATTGAAGCTTGT
ATTCTAAAAATCATTTAATTCTAAGATGGTCGGAAAACATGTCCGATCCA
ATTTAACATTGAATGACCCGGTAGTGAAATTATCCCTTCAACAGGATTTA
ATTAGATCTTAATTATATATCTCAGGTCCAACTTATTTTTCTTCCCCATT
TCCATGATATTTCATCTAATTTTTGGACTATTCTTTATTTAGAAATATAG
ATATGTTCACCTTTTAACAAAAATAAATCGATTTCAGTAGATACAACATT
TAGTACACAATTAATTAATTAATCAAAGATGTCAAGAGAAAGCTTTGTCT
AGTATTTTTCAAAACTATGGTAGAGAGAATGGTATAAAAACCATTAAGCC
TGTTAATTATCATTTCAACTGATATACTTTCCTGTTTTCAATATTAAAAA
ATGTTCAGACTAAAGATGATGTGACTATTTTGGCGCGTTGTCTCAAAGCA
ACTAAGCTTTATTGAATTTGAACAAATTACTGAGAATATAAGATACAAAG
TCATTTTCCAAATGTGTATATTTTTAAATACTTTCACTGCTAAGGATGTA
ATTTAGAAGATTTTAACTATTTAAAAATGTCATAACATTCCTATTTAATC
AAATAAATTATCCCTGTAATAAATTAAGAATAAAGGAAGCTCTTAAAAAT
TGAAATGTATAATGCAACTTAAATGGGCTCTTTTCACATAACTACAACCA
TAACAAGGAGCTAAAGGTCCACACCTTTAAAAAAATAGACATGAAAATTT
GATTTTGCGGAGCTAACTTTAGTTTCTAACGTTGATTACCTGAACTTGAT
TTATATATACTAATAATTAAATTATGTGAAGCACTTTTTTACGTAATTTT
AATACTTTTTTATTTTATTTCTGGAGGGACATTTAGAAAAAGAAATGAAA
ACTATTTCTATGAGCTTTCTTGCCAATTTATCATATAAATAACTTATATT
CCCCAAAAAATTCTTAAATCCTATTTCAAATAAGTAATTATATCATACTT
ATATCTTTATTTAAACTAAAATTATGTACCATAACGATAATTTAATATGT
TAAAGCCTATACACTATAATTTCAAATGGAGCCTACCTGATCTTTTTTTT
TTTTAAATAATGTGGACTGTTGCTGTAAGCAATATAAAAAATAATGAGAT
TTATGTTTACACTTAATGTATGATTCTCGAACAATTTATTGAAAATTTTA
AATTAAGTATAATAGTTAGACGTTACATATTTTGATTCAGTTTTCAATAG
ATTATATCAAATAACTTTAGGATAAATTCTTAGTAACATCGAAAGTTCCT
TTGAGATTAATGTTGGGCAGAAAATTAGAACTGAATTTGATTTTCTCATA
AATCTTGATGTGGATCAAAATTGAAACTAAAATTTTAATTTAATGAGTTA
TTTATCTGACTATCCTCCAAAGAGTCATCCCAATTCATTAGATATACAAT
CTTTCTATTTTTATTTCTTTAAATTATCGTAACAACATATTTTGGTGTCT
TCTGAACTTAATAAATCTGTTTTCATAATACATAGTGAAGATTAGGTGCA
CTCTTTATTATAACTGCTCAATACTTCCAGTTGAGCTTTATTTTCCAAAA
AGCTTTTACCTCACTTTTTCAGCTGTTTTTTTCTTCCTTAGTGGTCTTTT
TTTTATTATTAGTGCTTGAATCTACATAGTTTAAAATACTTTCAATATTA
AATTGGGTATTGTCCAATATTTAAAAAGATGATTAATTAGCTAAATTGCA
AATATATTTTGATAGCTATTTTAATTTTTTTAAGACAAGCTGAGATATNT
GTTAAGAATAAAAGTATCCTTTTCCCTTTGAGATATGGCTTAACAAAAAA
TCTATCTTTATGTAGTTTTAAATTTCTAACTACACTTATATTTATAAACT
AGAATATATAGATATATACTTCATGCTTCTGGTACAAGGGGAAAAACTAT
AGACAAAATATACATGCAAAAACAACAACGATTTGGAACATTAAAAACAA
TAATCAATTTGTTATATAATCAAATCCAGATTAAGGAAATTGCTATTTTT
TTAGATTAAAATTTACTATATCCAAGTATTGAAAAACCACAATTTTTGAA
CACTTTTGTAGATAAGTAGTTTTGGAAAATTCTACTTCGAGGAAAACCAT
GTTTCATTAGAACCTGTTTTTGAGAGATCATCGAGGATTTTTTGTTTATC
TTTTAGCGAAAGTGTTATTCATTAAATATATACGTATTGATTGAAAAACA
ATGTGAAATTAATTCAAAAAGAAACAAAACACACCAAAAATGTTAGCCCC
ACCTTAGGATTTGTACCTATAAGAAGGAAAAATCATCATGGAAATTGGTC
CATGAATTATGCATTCCTTTGAAGTTGATACAAAAAAAAGAGGGAAGCTT
ACTATAAGCTGATTTTTTTACTTTGTGTTTCTTCTATCCAAAGTATTTTA
TCTTATGATAAAATTGTATCCGAGAAAACGGTGACTATTAACGTATTTTT
ATTGTATCTGAATTTATTATATCCAAATTTGACACAAAATTGATATATTT
GCTATTTAAAAAATTGAAATTGTAATAGCCATGAAATTACAAATTAAACA
AATTACACCGAATTTGTAAAATTGACCTGTTTGGAGGTATTTAAATGAAC
ACACCGAGAAAAGTATTAAAGATCTTAAAGAAGGAGGTACAAAGCGTTAT
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AGCCATCGTCGACTTTTTCATTCTTTCATTTTTTTGTTCGAGATTGTAAT
TTTATTGCTCTGTCTTATTTTCCCTTCCTTTTTTTATTTACTGGGATTCT
AAAATTAATTATTTATTTTAAAAGAACAACACAGAAATAATCTTGTATTT
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GGGTGAACGATGTTCTTTTTTTGTACAATTACTGCGTCATTTCGACGTCA
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ATTATAATTTTTTTACTGTAGAGGTAATTAATTACAAGGGTCCCCACATA
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AATACTCATGATACAAACTTGCGATTAAAAAGGTTGCTGAATAAATATTG
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AATCAAGTAAACACTCAATCAAGATTAAAATATAACAATAATTAATCCAG
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TTTTATACCGTACTAAAAAACAAACAAATGAAAAATAGAATAAAGTGGAC
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GGTTCAATGCGGACTTTTTTTAGTCCCACAAACTGGAATAACCAATAATT
AATAATAAATTGAATAATTGTTTGTAAATGCATATAAATATACAAAATTA
TTTTTATTTTGCACTCAAAATTTATTCAACTCAAAGAAAGCAAATAAATA
AAAGTTTATATTATTTGAAAAATATACGTATGTTTGTTATATATAACATA
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TATTCTTTTTTTTTCGTTTACATTGATGAGAAAAGGAGAACAAAAAAATA
TTTTTTGTACAAAAAACTTTATTTTCTATAAATGAACATAAATTTGTTCA
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CCTCCAAAACATTCTTCAAATTGTTCGGATTATTATATTATTTTTCTGTT
TCTTTTTTTTTTTTACATGCTCATTCCACACCGGATTACCACCTTTGATT
ATATCATAAAAAATTGTCCCATTGATGACGTAATCCCCAATGTTTTGAAC
TAGAAGGTTTAATTTATAAAACAAAGGAAAAATTAAAATTTCTTTCATAA
CGGTATGCTGAAAATGATACAAGGGAACAGAAATTTCGCAGATATTATTT
TATAAATGCTCTCTAGCAGAATATACCATATTGCAGTCTAAAATAATTAC
CCCAAATACGGTACACTCTTATATATAATCAAATACTTCGAATTTTAGCA
ATTTTACATCATCAATCTCACACCATTTTTCGTGGTACTAGCCAAATTAG
GGGGGGGGGGKATTTTAAGAAAAGGAGAAAAAAAAATATTTTTTCAACTC
TGAGTGCGTGATAAGAAATAAGAAAACACTCACGAATGCACAGGATGGAC
AAGGTAAATCCGGAATGGAGTGACGATGGAAACCTTCAAGGCCACAATTG
AGGCATGATTATTCTTGCGAGCGATCCTCTACACCCTGCCTCACAAGTAA
GAGTCACATGGATTGAGGTCCAGGATGTTGGCTGGCCAATAGAATGGAGG
CCAAAAATCCTGCATATTTTGTCCCAATAATTCTTGGGCAATCTTTGCCT
TATGAGAAGGTTCTGGGTCGTGCTGGAATGTATATGGCTTCCCATCAGTT
ACCTCGTTCTTCCATGGGATGACCACGTCCTTGAGAACGTCCTTATAGAC
CTCCTTGGTGACTTTCTTGCCCTTTTGGAAGAAGGGGGGGGGGACATAGC
ATGTCCTTTCGTGCTGATGACTGCCAGGACCATAAACATAACAGAAGCTG
GATTCTTTGTTTTCATGACTGGCTGGRCTTCATCAGGGKCTAAACAGACC
CATGTATCGTTTCTACGGTTATGGTTGGCGTCAATGGGGAAGATTTTCTC
GTCTGAAAAAAAACGGACGTAACCATCTTTATAATTCATTTGGTTAATAA
GAAAATTTTACCTTTGCGGATTCTGCTCTGTTAGCATATACTTACAGGCT
CTGGCCCTCGTCAACTAACCCAGGTCAATCCTGATGGCGTTTTTGATGGT
CCCTTTGCTCACGTTACGTTCCTTGGCCAGCTTAGCAATTGACGTGTCTG
GATAATTATCAATTGATCGTTTCAAGCCAGCTACGAACCTTTTAGTCCGG
GTTTTACCATATCTTGTTGAATGAGCTCTTCTTTAAGTCTTTCCCTCCTC
ATCAAATGCCTTATCACGTCATAAGCTGTTGATTTGGGATATTTGAAGAA
GGAAACTATCTCCTGAGCAGAGTGTCCCTTCCGGCAAGATTCGATGATGG
AAATTCTCCTGACTTTTTCCATGCTTTAACGACGAGATACTCAAAAACCT
TGTTATTAAATTCGATAGCTAACACATTTAGCTTGTAATAAGCATTTAAA
TTTTTATGATGTAACCTATACAAGTCTCATAATCAGCCATTAAAGTTATT
CCAGATTTACCTTGTCCACCCTGTAGTGATAATTAAAGCCCTTTTATACT
TGAAGTAATAGCTTTCTTAATATTTAAACTAATAAAGTATAGTTTTAAGG
TCATATTAATATCAAAGGTCACAAAAAGTTCAACTTCTTCAACAAAAAAA
AGTTATCTGTTAATTTGATCTTCTGTTGTATATTGATCAAAAAGATATGT
TTGAAAAGATTTAGTCTTCAAAGGCCGCTTTTGAGAAGTTAATAGACATT
TGAATGAGACTTTTTTAACAAAATTATCTATTTGTAAAGTTATGATGCTG
AAGTTCAACTGTTTCATCAAGTGATATAGAGGTATATATCCTGATATTAA
ATAAGAAACAAATTATAGGGACACAAACTAATTTGGATACTAAAACGATC
AAAAAACAATGTACTGACCTCCAAATCAAATATAATAAGTCTTAGAGCTC
AGTCCAAAATGTTATTGCAAGTGGCTGAAGTAATATATATCTATTAATGT
GGAGTATTAAAATCAAATGTATACATGATTAACAATGGATCTTAAGGGAA
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ATGATTTGAAGTGTATCAAACTCCTATCCAAAAATCATAACAAGTATTTT
TAATATTATTTATTTGTATTTTGTATATCTTTGGATTGATGTAACTATGT
ATAAAGTCATTTCCTAGATGGCGTCCAGATTAATTATGAGTAAAGGTGTA
CAATGTGCATAGGTTGGCGTTAAAAAACACCTTTCTATAGTATAATATAA
AAAATATGTCTAATTTAGACTTTATTTTTAAAAGAAACTGTATTTATCAT
TGGAAGTGAATTGCTTAATTTCATAAAATATATAACTTAAGTCATCATTC
AGAATGATGTATTGGTTCCAGTTGATTTATATTTAGCTTTTAATGTCCAT
GAGAAAGATAGTGTCAAACAAAAGTTGTCATTTTATGTTAGTTTCCACTA
TATAGTTATCACTACCTTTGACATTGAATTTGATGATGCTTCAATCACTT
TGCCTAAGGAATTATTAACTCAATTTAAACTTATTTTTGTTTAATATGAT
CAATCTGCTGATTGCAAAATCCTAAAATCCAAGGACATATTTCCTTTCTC
AAAGAAATCCTTCGGTCAGCTTGACTAAAACAATAACTTATGCAAATATG
TTTTAATTAATTGAAAGGCTGACTATCTATGATATTTCTAGGATTTAAAT
TTATTTTGCAATTAAGATAGAATTCCTTTACTTTAAGTATTAATTTATTT
TTTATTAAATAGACGTCTAACAATACATGTCACTGCTAAAATATACTTCC
TAAAATGAGAGCAATACTTTTGTGAAATACCATATTTTGATTGAAAGGAT
CAAAGATAAATGTACCTAATCACGACACCAAATTGTGTTCAAATTCGTAA
GAATTGATTCCATGATTTATAGATGAAATTAGCACTAAAATATAGGTGAT
ACAAGCGTTAAACTCTCATGTAATGACATAGTATGTGTCGTAGTGATCTT
GATATTAATTTTTTTTAACCTATGCCAAGCCAAAATATAATTAATGTATT
ATTACTAGCTTTTTTCAAAAAAATTAAGGTTACTCAATTTTTTTTGCAAA
AAAGTGAAGGGCCATACCCCTCCACCCCTCCCCATGACATCACGGTCGTT
TAGTGCAAATTATTTATCGATTCATGGAATATATTAAAAAATATATAAAC
AGAATAAGTACTCACATATATATATTATATGGGCAAATATGGCTACWCTT
TCATATTTTTTTAAGGAAATAAATTTGATGTTGTTTCTCAGCCAAAGCTA
TTTTTAATCTTTTTTAACTATAAAAATTAGCACTTTTTGTTTTTCTTAAA
AAGATAAAAGTACAAGATTTCGTCTTGCTCNTTATTTATCTTCCCCTTAT
ACAGATTTTGTTCTTAAAACTAGGAGTTGCACTTCTAACTGTTTTATAAT
GTGCATTTTAAATTTCGGTTTTACTTTTATACATTTTTTCATATTCTTTA
TTCATCAAACTTGAGGTTAACGCTGATTACAAAAGATACTTATTTAAAAG
GAATACAATATTCAAAAGGAGAACAAAAATAAATCATGAACGGGCTGCTA
ATTTGTAGATTGAAGTCATCCACTCAATACCGCAATAGGTACATACTTCC
CCCTAAGAAGCACTTTGTCTTAAGATTGAAATTAATATAGATTTGTGCTG
GAATTATAATTTCTTTTTGTAATTCACATACATAAAACTTTGTATGGGCC
TGAATAGAAAGGGTCAATACATTTCCTTATAGATAGTTTCAAAATATAGA
CTTCGTCACAGTTTACCAGACTTTTTAGCTTTGGGTCACTCTTTAATTCT
CTCTTCTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTATAGTTTTGCCCATTTCAAAATT
ACTCCTTGGAGACCGGATCTGTTGCCTAA back to top
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