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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s977 | supercontig | LSalAtl2s977:9979..21258 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012817 >EMLSAP00000012817 ID=EMLSAP00000012817|Name=EMLSAP00000012817|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1224bp
MNKVLFLLLQVTFSIWAFALPPVRRVEERIVNGGPTERGEIQYQLGLQGS
DFNHPFCGATLIGERIAITAAHCVVGRXKIIQELKLNQLATFIFIFRVPS
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SLLKTITMSLTGEIEFESIEFDLPFGRIVFLLYVFFIMLVLVNLLNGLAV
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SQMGAHTSSKGLLDPETIVLDVEILEAAKMRLMRKQEVSLIATNQRINKI
ERSLRLMSKQQNYIIDLLTQMSSK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s977:9979..21258+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012817-708664 ID=EMLSAT00000012817-708664|Name=EMLSAT00000012817|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11280bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s977:9979..21258+ (Lepeophtheirus salmonis)
TGTATAAGCATCTAACATTGTATCAATCATCTCAAAATGAATAAGGTGTT
GTTTCTTTTACTCCAAGTCACCTTTTCTATCTGGGCTTTCGCTCTCCCTC
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CGGCTGAGGATGTATTCATCTGTTATAGCGMCTCAGTTCTAGCTGACAGT
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ACATGCACACAAAAACTGTAGTCGAGGGACTTGAGGGGATTAGACTGGGC
TGTTTTCTTTAACTTCTCCAGGTCCAGTTTTGCCTTTTTGACAGAGTTCT
TATTCCACTCCAAATTTTCGGACATACTGATGTTATTTATGCTTTAATAT
ATTGAAATATGAATTTATTTCAATCACTCAGCCTCCATTAATTATTGAAC
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CATTGTAATTATCTTTTGTAATTAAATTTGACNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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ATTACGAAATAGCATTTGCAAGTCCAAAATAGAACAGAATGAATCAAATA
ATTATAATATAATTTTGATATGTTTTAAATATTGTCTTCAATCAAACAAC
TTATAATTAGCTCGTATGGCACACACGTAGTAATTTATTTATTTTTGTAA
AGATCCCAGATTTTCGAGAGAGTAATATTCTAATATGCTAGCAAGCAATT
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ACATTCAAATATTCAAAACAAAATCTACAGAAGTTAAGAAGTCACTTATA
TTTTTTAACATATAAACACTTAATAATTCCCAATCACTATTTTTAAGCAA
TAGCAGAATAGAATATGCTTTTCAGACAAAACTATACAAGAAAAGAGAGG
CACATTATNATAAGCTTGGAAATTGTAACAACATTCAAATATTCAAAACA
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TAATAATTCCCAATCACTATTTTTAAGCAATAGCAGAATAGAATATGCTT
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TGCTACTTCCAGTGTCCCAGATGTTTATTCCAAGATATCTGCTATAGATC
CTGGATTGATGAACAAATAAAACAGCTGATTGTGTTACGGATAATCTAAT
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GGGTTTAATTAGTTAAGCCGATGTAATAATTAAAATTATCGTCGTATTTA
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CTATGTTTTTATACCTGAATACCAAACAATATCATGATCTGCTTCTCAGT
TTTGAACACCTGTTGTTGAAGACTTATAATAATGATAATAAGGGAGTTTT
GAACACCTGTCAGAGGTACCCGCAGGATTACAATTTGAGGGCTTAGATTT
TGCAATTTCTTTGAAAAAAAATTATAAAAAAAAATCCATAGGTATTTACA
GAAAATAATATTTTTTGTAAAAAGTTTCCAATATTTAAATTTGAAATATT
AAATTTTTTGGAAAAAAAATTCAAAAATCTATATCTAATTCACCAAAAAC
TAAGTCTTGTGGAAAAAAAATTTATATGTTAAATTTTTTGCTCTGCTGCA
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ACCCCCCGATGACGCCCCTGCCTATTGTTGAAGAGTTATAATTATGATAA
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ATTGGAAGGAGAATTCTCAAAGAAATTCAAATACATTACATGAAAAAAAA
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GGTATCTATCAGAAATGTACACAAATAAGTGATTCATGATATTGGCTAAC
AAAATGAGAATTTAGCCGGCTATGTCAAGTTCAGGTTCAGCGGTTCTATC
GCTTCCGGTCTCGGTCCAGCTTTATCAGTCTCGGTTCTATTTTATACAGG
CTCAGTTTGGTAACAAGCACTTAAAATAAAGGGGCATCACTACAAAATTC
GGCCCAGGAAATGGTATTACATACAAACAAGGCCACGGCTACCTTATACG
TAAGGTTGATAATTTTGGTAAGAATACAAAGCGTGCTAGAAGAAGGGAAG
AAATACTTATGGCATCATTGATTAAATAATATACATTTTCTATCTGTGTA
GCATCCAGTAAGTATTTTCCAAATTCCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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CTCGCACGCTTTTGTATTCTTACCAAAATTCTCAACCTTAGCCATAAGTA
TTTCTTCCCTTCTCCTCGCACGCTTTTATATTCTTACCAAAATTATCAAC
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AAAATTAAGGTCATTTCCAATCAATAAATTTGAATCTAAAATTTTAAATT
ATATACATAATTTAAATTGAACTCCTTATTAGGAGGCCTATAATGGTAAA
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TTCTACAGAAGTACCAAATAACCACAAGGGATCAAAGTCATCCGAGTTCA
CCAATCTCCTTAGCCCCTGCCAATTATAATGTGAGTGGAAGAGACTGTGT
GATAACTGGTTGGGGGAAATTGCATTCTCCCGGAATGGAGCTTCCAGATA
AACTTCAAAAAGCTTTTGTAACAATAATGAGCAATGAGGGCTGTGCAAGT
ACTTTGAGCTCTTATCCATGGGATGGTCGATATATGCTCTGTGCAGGCTC
AGAAGCTACTGATGCATGTCAAGTAAATAATTATGATTAGGGGTCATATA
TTTATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA
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CCTTTACTTAAATAGGATGTAGTATTTTTGTAATTAATAAGCGACCAATT
TAATCGAATTAATATTTTTCTTGCAGTATTGGCTTCCMATGATTGGATAA
TGTTCTGGTACCCCTCAGGAGACCCTTTCACTCAGTTTCACTCCTCCAGT
AGTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACCTTCTTACTTTTTTAAATGGGAATAGG
CTCGATAATACACTTTGATCAATTTTATATTGTGCTTCCTTGTTCATTTT
GATACTATTTTGAAATAGAATTGGGTTGGCAGGAGGAAAAGCGCAATTGC
TTATAACGTAAAATATGACATGTAAATCCTTCATACTTCGGGTTTCATTG
ATTTTATGTACCAGGGATTTCCACCTAGAAGTTGTTGTCATATTGATATA
AGTGGTATGCATTTGTAAATAAAATATATATCGGTTATCTTGAAGACTAT
TGATATACAGAGTATAACTTAAAACACCGTGGATTTCGCATAACGCTATG
TTTGAAATTATTCTGACTCCCAGAAAAGTGCTGTATATTCCCCTCATATC
ACGGTATTTTATATTATGATAATAAATTATAAAAGACGATATATTGGGAT
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TAATCATAAAATAGAACAGTATAATTTTGCATAGGGGTTCTTGAGTATTT
GACTTGAATTATAACTTTTGGTTATGACTTAACGTACATACTTGCAATTA
AAAAGGTTGCTTAATAGATATAGATTAGGTTCCAATTATTAATATTTGTT
AGTAATGAAATGACCGAATTAGAAATCAAGTAAATTCCCTATTAAAAATA
AGTTTTACAATATCTTGTTCGGCATACATTATTTTAAATAAATTATCATA
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TAAAAAATTCTCTGTACAACGCAGTTTCCATATAATGTGGATTTTTTTTC
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CCGGACGTCATTATTGTGTGACCCGTTATTGCTTATATCAAACAATAAAT
TATTCATTTTTTTCGTAGGGGGATTCTGGTGGGCCTCTCGTATGTGAAGG
GAAATATTTAACTGGAATCGTTAGCTGGGGAATTGGATGTGCAACACCTG
GTATTCCTGGAGCCTACACGGATGTTCGAAAATACAGATCATGGATTGAT
TTGCATGTAGAACAATTGCTCAAATTAGATAATAATTAATAGCATTAACA
ATTGTAACAATGATTCTTTTGTACTTTTTTGTAAGAGAATAAATTAGATC
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TAAAATATGTTTTTAACCTCATATAACATAGTTTATTATACAGATTATGT
ATGTATACATGGGGAGGGATTACACCTGAAGTAAACAAATAATTTGGGGG
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AATCGTATCTATTTACTACTACTATTAAGGCAGGTTCCATTATTAAAAGG
CGTGTGAGAGTGTGTTACAMCAGCCGGAAGGAGAGGAGAAGAAGACTAGT
CACTGGTTCTACTAAAAAACATAGTTTTTCTTTTATTTTCATGTTATCAT
TTGACGAAGGGAAATATAAAAGCAAAGGAAACAAAACAGCAACCCAAATA
GTAGGAATCTCCTTGAAAATGTCTTTCGGGGGCAAAATGGGATGTGTTCC
CGATCATGGGATTGACCTTATCTCTGCCATGGATGAAGGAGACCTTCGTC
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ATATCCCCCACAAAATTGTTCGGTCCTTTCCTATACATTTGGCTGCCGAG
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TCGACTTTTCTGCAGTAGACCCTTTCAAAAAGGAAAATATTCTTCATAAG
ATTATTAAAAGAGAGTCAAAAGCTTACGTCAACTTTGAGGAAAGGAATTA
TGAAAAATGTCTTTCTTTGATTGTAGATGATGAAGCCAGCTTTAGATCCT
TGATTCAACCTACTATCAACGGTGCAGATCATCTTGGAAATACGCCCCTT
CACGTCGCAGCTCAGTTAGGTCAAGAAGACACTGTTCGAAAACTTTTGCG
CTGCTCAGCGAATATTGGTATTAAAAATTTAAGGGATGAAACGCCAATTC
TTCACATTAGCCCAGAAGTGATGGAAGAGTATTTGGATGATTGCCTACAA
GGAGAAGGATTGATTACTGATGAAAGATACAAAATTGTTTTTAGTTACTC
GTTCTTGGGACCTCCCTTAATTGACAAAAAATCCGAAAAAGCTTCGTTAC
TACGACCTGAACCAAGGGAAATGCCTAACATGGTTCCACAATACAACCTT
CCTGAGGCTGAACCCCTTTGGTACATGTCTCAGCTACCAGGTCATAGAGC
ACTGTTGACTCATCCTGTCATTACGAGTTTTCTGTGTATGAAGTGGAGGC
GTATGCGACATTACTTTTACATCAATCTACTCTTTTATCTACTATATGTT
GGATTTTTCACCACTTATCTCTTGTTGAAGAATTCAGAAATGGTACGCAT
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TTTGTTTGCATTTGTATTAAGTTAGAAAATTAATAAGAAAAGGAAGAGCA
CTATTACATAATAATAATTTTATTATGATTATTGAGTCAATTAAATTATA
TTTTTATTCTCTTAGGAAATAGCATCTGGAACTCTCAATACCATTCGAAT
CATCGTCATGGTTCTATTGGTTTTATTAACTATTAGAGAATTTCTTCAAG
CCTTTGTTTCTTTTCGGTTAGTAGTCATACATATTTTTAAAGCAACGTTG
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TATCTTAGAAATATCTTTGGTATCCCTTTCATTCTACATTTGCTTTACTG
AAAATTTAAAAACAGAATCTTCTCGATCAATATGTGTTGCAGCATTACTT
CTAACTTGGGCAGAAATGGTTTTGCTTTTTGGGCGTCATCCGAAAGCAAG
TACATTTGTTACTATGTTCAAACGGATATCTCAAAATTTTATACTTTTCC
TGACGTGGTCTATCAGCTTTATAATTGCATTTGCTTTGGCWTTTTATATC
ATGCTGAAAAAACCAGCCACAAAAGAAGGAGAACAACCCAATCCTTACTT
TACGACTGTTGAAAGATCCCTCCTTAAAACAATCACCATGAGTCTGACTG
GAGAAATTGAGTTTGAGAGCATTGAGTTTGACTTACCATTTGGCCGAATC
GTCTTCCTTCTTTATGTTTTTTTTATCATGCTAGTATTAGTGAATCTTTT
AAATGGTTTGGCTGTCAGTGACATATCTTCCATTCAAAAGGAAGCAGAAA
TTGTGAACCATGTTTCTCGAATTGAACTCATTTCCTATTTTGAATCTATG
CTCCTTGGAGATCCTTTTCATTTTTTCTCCAATTGGCCTCCATTCTCTTG
GGGACGCAAAGTGCCTGATTGTTCCTGCCTTCGTGGGGTCTTTCAAAGTA
GATTAATGAGTAAGCTCATCGGACTGACTCTTGGTTCAAAAAGGTTCTTG
CTATTTTCTGAGCGTCTAGCAGAGAAACAAGCTATTTTCTATCCTAATCG
CTCAAGAAGAGAAAAAAGTCAAATGGGAGCTCATACATCCTCAAAGGGCC
TCTTGGATCCAGAGACTATCGTTCTTGACGTTGAGATTTTAGAGGCAGCC
AAGATGAGATTAATGAGGAAGCAAGAGGTTTCATTAATTGCAACAAATCA
AAGAATAAACAAAATAGAAAGGTCTTTGAGGCTAATGAGTAAACAACAGA
ATTACATCATTGATTTGCTCACACAAATGTCTTCCAAGTAATATGTAACT
GAAGGATACCACTTTATTTTTTACATAGAAAATGAATAATTAATCAAGTT
TTATTCCTCCCAAAGTAATAGCAAAACCCTAATAACATAAATTGACTGTA
ATTTTATGCGCTTCTAACTGTAGATTTTAAATGGCAAGCTTTATTATATT
ATTATTTTTAATAAATCAATATCTTTAATTTTATTACCATATTATTCTTA
GTCTATTTATAAATAATATATAAAGAGTGTTTTATTGTTAATATCAGATA
TTGTAAGCACAACTATGAGTAATCAATAAA back to top
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