EMLSAT00000012821, EMLSAT00000012821-708668 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012821
Unique NameEMLSAT00000012821-708668
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s978supercontigLSalAtl2s978:206803..231512 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012821 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012821EMLSAG00000012821-695587Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000057563EMLSAE00000057563-766491Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057564EMLSAE00000057564-766492Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057565EMLSAE00000057565-766493Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057566EMLSAE00000057566-766494Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057567EMLSAE00000057567-766495Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057568EMLSAE00000057568-766496Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057569EMLSAE00000057569-766497Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057570EMLSAE00000057570-766498Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057571EMLSAE00000057571-766499Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057572EMLSAE00000057572-766500Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057573EMLSAE00000057573-766501Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057574EMLSAE00000057574-766502Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057575EMLSAE00000057575-766503Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057576EMLSAE00000057576-766504Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057577EMLSAE00000057577-766505Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057578EMLSAE00000057578-766506Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057579EMLSAE00000057579-766507Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto774516auto774516Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012821EMLSAP00000012821Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012821

>EMLSAP00000012821 ID=EMLSAP00000012821|Name=EMLSAP00000012821|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1782bp
MNSDDPLKWLVSMAKRKYTCLLSEIYLCDEAPYLQPGGDLIDFQLFENTP
PNSVVYTLRGYDPEFGVEGLTYTISGDYFSINQKTGVISLKKKVDREIKE
FIRVVVTIQDKGNNLIPFSREIVILDENDNAPNFEREPYNFSINETTPVD
TVVYSSILVSDKDSFENAKVKLECVPYDLDDKSCEVFMIQTEEYKAGSYF
GTITLKKELNYETKSSYKIKIRAKDLGQPRYLSSATEVFIQLIDVQDQPP
FFINSPYFSTIKENIASDTKIFDIQVRDGDIGTPQKIFLDIVGDLEHFFV
LENQYLNEHSISSATLKTAKNVTIDREMRTVIEAGGIYTFQIRAREILDI
KQNYGDETYTNVTVIITDEDDSIPIFNKNFLTIAVPEDVRYDTPLPDLNI
IVQDNDSSMNAAFELALNRPGPFSVHPKKAIGKTPVILRVSNPELLDYES
PGKNNYKIQINAIQNQSILSNCTINIIVTDSNDNAPTFSKDFYQFSVEEN
APAGKSIGFITAFDLDSGSFGQVKYNLKGFGADKFRVNDESGELFINTCM
TDTQFWRESCLDYETQEFYFLTYTGTDGGNQALDADGISQGGGKVFYSII
SINTDVTLFAIDAVSGELYLLQPIPYIYDCILPLEGQYQLVIRATDSGKP
ALYSDAKVTIKINTKSNLKPLLQFSNYEASVSENAVKGTEVIRISALSND
GIASNVSFKMYSGAKDNFIIDPITGIIRISQDANLDIQENGDNYEIIISA
SNYELPYSQIVKINVSISIIDVNDKVPIFDQNSYTKYLTEQMIVGTEAIQ
VSATDADRNAALKYGIIKPVIAIDKAGNLLSNKAKYDFTTTFKINEDNGI
IYLNNSLSYNSAAVIILTVEVIDTNAEVNTISETDEHDCFNNQKVNSEVT
FYIQPYKIDYPQFESPWTPSSPSLYYHIKEGLKPRTLLFTVNAHDPISKK
SNIIFKKSELSDPKDLINLNTNTGEVYNNEIFDFDMNTKEITFTVHAISM
TNSTKISEAFVHIEVEDINDNAPEFNQSFYMADLNESALPLTIVLRVKAI
DKDSGNFGKIQYSLFGEGSEVFTIHPTEGTLMVKKGPDGRSLIDREKIDR
YNLKIICKDMPTGGIDQKVASVEAIINILDSNDESPIFKKTSYSTVIPEN
SPIGSLVVKINAFDNDLGAAGTVMYHFVDNSLINKIFQINESNGEITTSS
LLTGKGRKDPYILYARAADKGEPQLFSDVEVYVTIGDVSDNDGIPTFIKP
MIDEIAYVFEVLFIKNASIGTRVFQAEAEDPDDKNTANGKIIYSLPHDGS
IINQLFQIHPESGLLTTIDKLDREERGXYTLILEAKDLGTPSQHTSRTLL
VVVKDIDDHKPRFQRQNNYFPNEIEIQEHTNIGTEIMVVKAQDLDEAENA
IVDYSIAEGNEGNFFEIFRTDENEGIIFISKEIDREISANFTLIVQCFHP
HRNKTEDSENYDRLRVKIIISDIDDNNPKFLKMNLSYGVRVNSAIYTEVA
KVKAIDIDVTADPISYQIINITYSRPKTGLFDIIDNELFIIDERTGVIHT
NRTLGRFIDGQFVVYVRAINGINRFDIEKLILYVLQDTELLQFVFDQDPA
SVRQLLPRLKKDIENVFINPLVFNIYDTEFYNKRDGSLDFGRTGSCFQVL
NNGKGVDLSSYESLIKNNNELENIYKKYNIIMIEHCAKIDSSKENMNWIE
ITFMLMGVLIGFLSILSTHRHHMYRNSPVKIIEATVRTFVHSNLPPGSTI
NGGGIPSVTESDNININDIFLQQNFFSADNRY
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mRNA from alignment at LSalAtl2s978:206803..231512-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012821-708668 ID=EMLSAT00000012821-708668|Name=EMLSAT00000012821|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=24710bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s978:206803..231512- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATTCTGATGACCCATTAAAATGGTTAGTTTCTATGGCGTATTTTTT TTTTTTGTTTTTTAAAGAAAAAGAAAGTATACCTGTTTATTGAGGTAAAG TAATATCTTACTTAAGTATAGTAGTCTAAAGGGATGCATTCTATAGTATG AAAATGGAACAATCATATTTGTTAATAATAACATTATTTTCGTTAAGTGA GATTTATCTATGTGATGAGGCTCCTTACCTTCAGCCTGGAGGAGATTTAA TAGACTTTCAACTTTTTGAAAATACACCGCCAAACTCAGTAGTTTATACT TTGAGGGGATATGATCCTGAGTTTGGTGTGGAAGGATTGACTTATACTAT TTCTGGTGATTACTTCAGTATAAATCAAAAAACAGGTGTGATATCGCTGA AGAAAAAAGTTGATAGAGAGATTAAAGAGTTTATAAGAGTGGTTGTTACA ATACAGGATAAAGGAAATAATTTAATCCCTTTTAGGTAAGTACATCCTTT TTTTTGTTGTTATTTAATCATTTTTTCTAGATTGGTTCATTTCTAATTAG TCGGGAAATTGTTATATTAGATGAAAATGATAACGCACCTAACTTTGAAA GAGAGCCCTATAATTTTAGTATTAATGAAACCACCCCTGTAGACACAGTT GTGTATTCATCTATTTTAGTATCTGATAAAGATAGTTTTGAGAATGCAAA AGTGAAATTGGAATGCGTTCCATATGATTTAGATGATAAATCATGCGAAG TATTTATGATCCAGACTGAAGAATATAAAGCAGGCTCTTATTTCGGAACT ATAACTCTTAAGAAAGAGCTTAATTATGAAACAAAATCTAGTTATAAAAT AAAGATACGAGCAAAAGATCTAGGTCAACCAAGGTATCTTTCATCGGCAA CAGAAGTATTTATTCAACTTATTGATGTCCAAGATCAACCTCCATTTTTT ATTAATTCTCCTTACTTTTCAACAATAAAAGAAAACATTGCATCAGTAAG TTTTACGAATAAATATATAAGAATTATATATATACAGTTTCATCCTCGTT TGAAAATAGGACACAAAAATTTTTGATATACAAGTGCGAGATGGTGACAT TGGAACACCTCAAAAAATTTTTTTAGATATTGTTGGGGATTTAGAACATT TCTTTGTTCTTGAAAATCAGTACCTCAATGAGCATTCGATTAGTTCAGCA ACTCTTAAGACTGCAAAAAATGTCACTATTGATCGGGAAATGAGAACAGT CATTGAAGCTGGGGGCATTTATACTTTTCAAATTCGTGCAAGAGAAATAC TTGACATCAAGCAGAATTATGGAGATGAGACATATACAAATGTTACTGTC ATAATAACGGATGAAGATGATTCTATTCCAATTTTTAATAAGAATTTCTT GACAATAGCTGTCCCAGAAGATGTTCGATACGATACACCTTTACCAGATT TGAATATTATTGTGCAAGACAATGATTCATCGATGAATGCAGCATTCGAA TTAGCCTTAAATAGGCCGGGGCCTTTTTCTGTGCATCCCAAAAAAGCTAT TGGAAAGTTAGTTGTATGTAAAATTAATGGTAAATAAAATTATAATTTTT ATGTCTAGGACACCAGTTATTCTCAGAGTATCCAATCCAGAATTGCTCGA TTATGAATCGCCTGGTAAAAACAACTATAAGATACAAATCAATGCCATAC AAAGTAAATATTTATTTTATTTTCGCATAGCTTTTCATAATTATTTTTTT ATTTTAGATCAGTCTATATTATCCAATTGTACAATTAATATAATTGTCAC TGATTCAAATGACAATGCTCCTACATTTAGTAAAGATTTTTACCAATTTA GTGTCGAAGAAAATGCTCCAGCTGGTAAGAGCATAGGCTTTATCACAGCA 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TTATAGTAATTATTAACCTAATCGACTAATGCTTGATTCATTAATGTATG CCCATAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATTATTGACCCCATAACGG GAATAATCCGTATATCACAAGATGCAAATTTAGATATTCAAGAAAATGGG GATAATTATGAAATAATCGTAAGTTATATTTATTATTTATAGTAATTATT AACCTAATCGACTAATGCTTGATTCATTAATGTATGCCCATAAGAAAAAA GACAATTATTACTATTACACTAGTTTCATCTATTTTATAAAAATATATCT AATCACGGACTACTAGAGAGCAAAAGTGAAAAAAAAAAAAAAAAATAGAA TKAGACGTTGAGMGSGAGMCAAAATTTATTTATTTATCTAATATCTATAA ATAGTTTTGTAAAATCATATAAAGTTAATGGATAAATTAATTTTATACAA CACCTTAATAAGTATTAGTAGCATTGCAGTATTTTGTTTTATGAAATTTA TAATTTTCTATTAACTTATTAAAAAATCTAAGTACTACAAACACTTTCTA TTTATAAAAAGGTAGAATCTTCTAAAAACCAAAGGAAAAAAATAGAGTGA AAATAGTAATGATAATCAAGTAACTAAATAAAACAACATTCTTATTTTTA AACTGAAATTGTAATGATTAATTTAGCTTGTGGACAGTAGTGAGAGATTA TTATTTTCCGGGTATTGTTACTTTTATAAAATAGCATTATGTAAGATGTA TAAATACATTTATATGTATATAATCAAACCCTTTGTAAGAATCAATCGGT GCACATAGAAATAGCAATAATATAGCTGGTTGCATAAAATCTCAATCGGA TACACTAACAAAGAATGGAACAGCCAAAATAAAAATTACATTAGTCGTCA TAATAAATAAAGTTACGCACACTAAATAAATCATATAATTTTATTAAAGA ATTGTATATTTTGAAAACTTTTTGAGAAAGTATATGAATAAGTATCGTAA TTATGCCGTCTAAATGAGTTTTTAAGCACTACAGTAAAACCAGATTAAGT AACTAAGTATGAAAGCATCACAGTTGATGTTGTGTGTTCTTCTTGCCCTG AAAGAGACATCCCCCACTGATTTTCTGGTTTGATTTTCTACTGATAGTCA AGGTTTTTTCCNCCTCTTCCATTCTCTCTTTCTGATCCTCCGAGCACAAC AATTTTTCGATAAGTTTTACATGTATACCAAGGAGACTTCGTAATAGTAG ATATCACAATGTTCACCACCTACTTCCTCTGGCACTTGAGTTAGTCCAAT TGAAACAGTACATGAGTGATTGATCTTCATTTTGAATCAATAGGGAAAGT ACACTCCAACGACACATTGCAGATTCCTCATATTCTCTTTTTTTAGTCCG TCCATTGAGCCCCAAAGCTTAAGAAGTCTATTTCTCAGTCGTGTGTCAAA GGATTTGATTCACAGGTCCTATATCTATTAAAGCTATCCTTTCAGAAAGT CCCTGATTTCACAGACAGTTTGATATCCATAGTACTGATGAGTTAAAAAA TCTTTAATNNNNNTTGTCTGAAAAATTTATTGAAGGTAGGCCAACAGATA TCTGGGGAAATTTTTGAATTTATATCAAACTCTTTAACAAAATCAAGAAA CTTTCCTATTGGCTAAGATAATTTATTATCTGACATAGTAGACCCATCAT GGGMAACAATAAGACGACGTATTAGAAGTTCACCAGTGTGTAAGTTGCAC ACTAACCATACTTTCTTCCAATCTATAGTTCTGGTTTACGTATAACTCCA GCTTTCACCCTGTGTTGACTTTTTTCGAATTTCTTTCAGTGGACCACAAG GTCTAATAGAAATTCTTTTAACAAACAAAACATAACCTAAGCAATATTTT CTAAATGTAATTCCCCTTTACTAATTTTTTTGGGGTGAAGTTGAACAGAT AATTGCTGCCTAGGTCACTAATCGTGTCATGGTGTATATTTAAGGGATGT TAACAGAACAACTGAATCTCAATATGGTAGCCCTGATAATTTGAAGAACG TTTTGGAGGAAAACAGCTTAGCTGTCATGACGTTTCATTAGATTAGCTAC AATCAGCTATGATGAGGTAGAAGGGAGATAATTAAATAAACAATTCATGG GCAAAAATTACTCTAATGTCCTTCCTCAATTCCAAAAAGAACTTACAATT ATAGCTCAACAACAAATCCTCAAGGTAACTCTCCGTCTTTTATGAGCACA CACGAATGTTCCCCTATGAGTTGTACAATCTTTATCTTTTACTGCTAATA ATCTTACACCCGGTTATTTTTACGATTAATGATTTAAAATTATGGATTAA CAACTGTGCCTATCAAAAAATGTATAGACTTGCAAATTAGCAGAATTAGT AATGCGAGCGTATATCTTTAGAAGATTGTCCTTAGCTAATTAATATTTTT CCTTACATCAAATGAAGATGACATATTTTTTTTATAATCAAAAAATTATT TTGGTGTCATTCCTTGTAAAGTAGAAACGACTTGTTTCAGCACATAAATA TGTCTAAGTGTTTCCCATAGAATGATTGCTGATGTATGATGTAGCGTATG AATAGAGCACCCGTAATTTGCAAATCATTCAACTGAGTCCTGATATGTTC CACCAGAAGCATTTTGCACTTCCATAAAAATGTATTTTACAGTTGTTGTT CAATGTATGCTGCAAACTGCTGCCAACTCTTGCGTCATTTGAAAGTTCAA AATGACGCCCTGAATGAATACGACAAGTTGTGACGTACTCGAACTAACCC AGTGCCAGAGAATATCACAAAAAGTTCCTAGTTTTTTGTGTATTGATCGC ACTATGGTCTCTAATTTTTTTCTGTTCTCCGTACAACTGAACTTGCCAAA AGGCTAATACTTCCAAAATAATCGGCATTCCCAAGACACAAGTCATTTTC TGCTTTTATCATACACTCTTTGATGAGGTTGCAATCAATTAAGAGTTTTC CTCGTTCTGCATTCTTATATACTATTTTGTAACTTGTGAGAGTGACAAAC TCATTTCAGCAAACTTTCTGGAAAAGAGTTTTCTAAACTACATTCCGTTG ACTCATATTTCTCATAGCATAACTTTCAAAAGAACTTTAAGTATGTTCAT AGATTTTTTTGTTTTATAGTGTCCCTGAAGTTTTTACTCTGCTAAAACTG CCACACTTTGCTTGCATGTTACACTAACAAGATTTCTGATCCTACTTTGC CACAAAAAAAAAAAGCTCATGTAGGCGCTACATATACACTGAATATATAT TTCTCAAATACATGGATTTACAAAGTAATATCCATAAAATACTCTACAAC AATAGTAAATTTAAGGCAAATAGCAAACAGAATCTTCCAGTATTATAAAC ATAATTTTCCAATAAATTTTTTTTCGCAAAGTTTCGTGTTCCATACATTT TATCAAGCAAATTCAAGGATAGTCAGTGGGTTCGATAAACTGACGTTGTA CGCTGGATATGAATCGCTTGCGMAGTTTGGTGACCCCCGTTCTAGGTACA TACATGAGCATGATTTAATGATGAACACTCTGCAAAGAAATTATTCTATT TCTATTAAGCTAATTAGTGAGACGATAAAACTATCATCGATTATGATAGA CTGAATTATCTTTACAATCTCTTCTGTGTAAATAAAATTGTTTGTATATA TGGAAGGATCAGATATCGTGGATTCCTGCTAAGTTTTTGTTATAAGTTGA GAGGTCATAATATTTCTTTGAACAAGGTGGAAATTCTCGATTTAATAAGT 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AATTTTGACCAAATTCAAGGATTTTACAAGGTATGGCCTCCTTTAGAGTA CGGTGCTCTCTCTCAATTAATCCATTACCTTGTGGATGATATGAAATGGT TTTGATGTTAATGATGCTAAACTTTTGGCTCATTTTTTCCCACATTATTG ACATAAATTGTCCTTTAAGATCAAGTATAATAATTTTAGGATAATCGTAT CAAGAAAACTAACCACTCTCTAATTGTGACAAAATTATATCCGTGTTGGC AGAGGAAATTCATGCCATTTTGTTCACCTGTCTGTTAGGGTATTGTTTTG CAATAAATATTTAAATCTAAATTTAAATGATAACTTTTTTTGTCTGGTGA TTTGATTAGTTCTTTGACAGAGTGGGGTTGTTGAAATGGGTTTAAATCAG AAATAGGTTTAATACCCTGGGGAGAAACGGTAAAACCTAGACAATCAACC TTTTTTTTTTTACAAAATTCTCCTTTGCTGAGGGTATAGCTTAGACTTTG TCTTGTAAAGTTTTTAAAACTGTAGATATTAATTATCCGTTCAACTATAC AAAAGTATGTCGTCAAATGAATAAATCCACAAGGCGTCGATATAGCTGTT TTTACTTTATCGTTTATATCCATGGGAATCTGATAATAGGCTTTTAAAAG ATGGATTGTACTAAAATACTTCTGACGCCTAATTTTTCTCCAAATGTCTG AATGCTAGGCATTGGGTACTTATCTATTATAGTATTATTATTTAATAACT CATAATCTCCAACCAGAGACCAAATATCCATTTTAACTTTTTAACAAGGC AGATATTAGAGGACAGCTAAATTTAGAGTTGTCAACAATTCAGGAATCTC GGAGTTTTTTAAACTTTTTTTTTTCTTCCGACAATCTCTATCTTTTCAGG AGTGAATCTCTTTGGGGGGTTGTAACAACTTGCATACTGGTTGTTTCAAT 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AATATTTTTAAGGGTTGAATTACTGGAATAATTATTTGTAGAACTAATAT ATTAGTATTAATAGTTTTTACTTTGAGTACAACGCTCATCTAAAAGAAAT TTAATCTCAAAAGAAAGAAGTCGAAGGCAATCATGGGGTTGATTAGATCC AAACGAGTTCACACCAATTTTTTTATAAAAAAAACTAAGTTATCTTAAAA CAATCTTGGAAAAGTATGAAGTAGTAAAAATTCCTTTTTCCTGTTGTGTC TTGACGAGGGAGAGACACAAACTTATTTATAGCTGGAGAGATCCAGGATG ACCGAGAGACAAATGAGAAGAAGAAATCCCGTGGAGGAATAATATAGCAC TTATTTATAAGATCATGTGTATTCTTTATAATACAAAACCATACTCTAAT TTATTTACAAAATACACGACCATTTATACTATGTAAAATACAGTACTTTA ATACATAAAAGAAAATACAAGAAGATAGGAACATGAAAGGAAATATGAAA TACATAACATTCCTGACCAGATAGATATCCTCTTCCTATTTGTTGTCGAG GTGTACGTTGTCATTCAAAATACTGGCGTGCACTACACTCTCCTCAGTCA TGGTATTGTTGATGAAGTCATCATATTTAGAATTTATTATTAAAAATATT AAAAAAACATTTTTGCCTTTAACAGGCTTGCCTTGTACGTATTCGCCTTT TGACAATTTCGCCTTGAAGCGGTTCCCCTTTTACTGTTTGGCCTTACGAC GTTTTTGCTTAGATACTTTTTTACCTTAGATAATGAAAGAGGATACAAGT TCGTCTTAGTTATATATTTCTTTGGAGTTTTTTCTGTTGTATTCTAGCTT TGAGAAATTAGAAACAGAAATGTAAACAAGTTAGACATTGAAAATTCTTC AGACCTTAAGTAATTATATATAAATAGTACGTAGGTTTTTTAAGATACAG 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