EMLSAT00000012833, EMLSAT00000012833-708680 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012833
Unique NameEMLSAT00000012833-708680
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s97supercontigLSalAtl2s97:1339866..1354690 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012833 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012833EMLSAG00000012833-695599Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000057626EMLSAE00000057626-766554Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057627EMLSAE00000057627-766555Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057628EMLSAE00000057628-766556Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057629EMLSAE00000057629-766557Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057630EMLSAE00000057630-766558Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057631EMLSAE00000057631-766559Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057632EMLSAE00000057632-766560Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057633EMLSAE00000057633-766561Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057634EMLSAE00000057634-766562Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057635EMLSAE00000057635-766563Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057636EMLSAE00000057636-766564Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057637EMLSAE00000057637-766565Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780672auto780672Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012833EMLSAP00000012833Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012833

>EMLSAP00000012833 ID=EMLSAP00000012833|Name=EMLSAP00000012833|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=719bp
MTDTEADRVVTTNGHHESDDEEEDMSNLRPVDIEQDVREMERRKRVEAIM
HSKLFREELERVVTDSLRDNGGEGLSSILSNVMNVRGCSSGLRSYSALPV
NDIRGLEGMVYTKQEKLLRCKLAAVYRLIDLQGWAQGIYNHITVRISQDT
EHFLLQPYGMLYNEVTASSLVKVDMQGNVVEPGTTNFGVSIAGFVLHSAI
HAARPDIKCIIHVHMPNIIAISALKCGLLPLCQEACLLGDVSYHNYTGIM
VDASVKDSIAKDLGIHNKVMLLRNHGAVCCGKTVEEAFFYLQNLVLACDT
QVKMMPYGLDNLVVIDEESRTAAFEVSQRGGGGVDSKSETDPDGNREKTI
ESRKWGVGEMEFEALMRMLDNAGYRTGYLYRYPLIKEEPSRPKSDVEVPP
AVSSLXYLXEEENLYKDGPLRAILGTLTKAQKGAERSKWMNSPNVYQRVE
VIETGTPDPKKITKMKEGRRAGGITAGPESKVLEGQTWEEARDMQDKSYA
VHSGEHVDFKVGAASKGIIQRDFQHHATVYGSAYAKNPFDNVTHEELAEY
QRVVDCKSRGENPYSPSPAMNEYSTIDSTAASTAAANAGEILSSSAHPSS
SDQPVASSQATDPSVLSPVLSPISPSDTEHDGEKPALPPKPTINTAKLIA
QKKGDHTFNGDETDGNRTFSEGEADTSRATDPESVLSPKKEKKKRSGLRT
PSFLKKRTRARRRTKKKPN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s97:1339866..1354690+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012833-708680 ID=EMLSAT00000012833-708680|Name=EMLSAT00000012833|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14825bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s97:1339866..1354690+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAAAAAGATAACTCCACTACCATGTATCCCCAAGCAACTTTGTTTTAAAG CCTTACAGTAAGTTAGTAAGAGAAATAGAGCTTTTTTGTAACGCGTACGC CATTTTGATTTTTGTTTTCTTATCGAGAAAGCGGAGCAAGGCTATTTAGG CTGTACTATCGGGTCTTATATTTGTCTTCCTCTTTCTTCTTTCCAGGATT GCTGAGAGAAGGAAACAAGAAAAAAAAAAAAAGAAGAGACTCGTTACATT ACATTTATACTTTTTTTACACTTCCCCTCTATATTTATTTATTTTTTTAT GTTTTGCTGGAGCTGCTAAGATTCCCTTGGTGCAAATCTAAACTCCGGTC TCCGAAGTCACTTCCAACGAGGAGGGAAAGAAGTTTCTCGATACAAGGTA AGAAATAGTTTTGTTGTTAGTCATTTCCCTTGATTTATGGAATGGTATTA GAAGTGGTTCATTCTTAGAATTACATAGAATCACTTGGTGATGAAATCTA TTTTTGGGGCGCGGTTCTTCTTTTTTCCTTCTTTTTCTTCTGCTCTTCTT CTTTTCCARTTTTTTTACTACTCGTTATGAGATCAGTGWGTCMCTTCTTT TCTTCTCARTCTTTTTTCTCCCTCTCTCTCTCNNNNNNNCCCCCCTGCTC GTTTCTGTCCCTGAGTGAGTCCGGACTCGCTCTTAATTCTCCTTTAAATC CACTTCCTCTCGCTCAACACAATCCCTCTTTTGTCCTTCTTCACGTTACC TCATTCATTCTAATTGCTCATTCAGGTACAATCTTGAAGCATATCGCTCT TGTCAGAAATAGGAAGGGGAAGAAGGGACGAAATTGTTTATTTCTCTCAA AAGTGAGTTACCGGCTCAGAATGGCCCATCCTTCATTTCTAAGGCAGTGA GTTCTCGATATTCTACTAGATGACATGAGGCCCATTGCGTTACTTTGATA AAATAGTGATTGTTTAGAGAGAGCTTCCGATTTTTTTTAGCACATAGACC ACTAATCCGTTTATTTTACGAATACCCTTATAACTTCAAATGTTTTTGAC TGCTCACACTTTGATAGAGGTCTTTTTAAATTGGACAATTCCATTAAAAA AAAATACAAGTCATTTAAAAAACATAAAATCCAGTACATATTAAGGAAGA ATGATAAAAATTCGAAACATAACATTACAAGAAGATAATGAATTAATCAC TAATTGGAAGGTTGATTTGATAACAATTTGGCTTTAAATTAGTAGATTTT AATCTCAAGTCTCTTTATGTTACAAATAACAAATTTGTAATCGATTTAGT TTTTCATAAGAAGATTGGCAACCGCACCAAATCCCCTTTCACCGAGGTAT GAAGATGGAAAAACTATCAATAACTTTCTTGCAATAGACCATAAAGTAGG ATAAGAGAAAGGGATTTCTTTTTGAAGCCTAAAATGTTGATACCTCTTAC TGAACTGCACCTTAAGTTCTTCGTTACAGCGTATTCCGATCAGTTCTTAT TGTAGCGTCACTTGATTCTTCAATTTCATCGTATGATAGTATATCCATAG TCAAAACATCACCAAACCGGGTTTTAAAAACTGTATTAAGGGCGTACATC AAAATTCATTTATTACCCCCAAATTATTATCTTTCTTTGAGACCTTTAAT AACTCTCTATCGCATCTTTAAGGGTCATTATAGACTATTTTGGGAACCAG TGCTCTTAAACAATGGAGTTATCAGCTCGGAAGAGCCCATCTTTCATATT TAAGGTAGTAAATTATCTTTGTTCTACTAGATTACATTGATCTATGATGA TATGAGGTCCACTGTATTCCTTTGTAAAGTAGTGATATATTAGGGACATG AAATGCCTGGTTTGACCAGATGGTGAAGGAGTGGACGGGGTTGGAATGAA GTTTTGTTGTAGGGTAAAGAAAAGGATTTTAATTTCTGATAACACTCGGT ATTTGAGGGCGAGCGTCGTTTTCTTCCTCTTTTCCATTCCTTTTACAGCA GCTGAATGTATTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTACCTCCCTCCCTCCT CCCTCTCTAGTGGCTGMTTGTATATTGAATGTGCTCCCTTTGAGCCGCTC CCKGAAAAGCTTGTAAGAGACTTAGTTGAGAGMTCTAAGTTTTTAGTTTG TGGAGTGAGTTCGTTACTTCTGTCACCGTATCGGCTTRTTCAAATTGTGT TGTGAAGACTTGAGTCATTCCAGTATTGTTTTTTATTGTTCATAGCTTCC GCCTTCCACAGTTAAAATAATAAGTCATTACGTTAAGTGATCAGTGACTG CCTAAGTAGTGTTTCATGTTTGAATGACCAGCTTTACATCATCATCACCT ACATCAAAGATCCTTGGATAGTCGCTCATTCTTCTCCCCAGCTTACTTGA GGTGATTCATTTCTTAATTGTCATTTGGGGTCCGTATCCAGCACATCAGA ACACATAAATTACAGAACAGTGTAATTCGTTGTCAGCTTCTGCTTCTTTT TTTTTTAATCAGTGTTCTGAACGTTGATTGGTTGAAGTAGAACTAACTCT TGTTTAACCGAAGAATTGGCTAACCACTAACTGATTTTGGGTCCTTTTTG GGGTTTATTTTCTTATCAAAGGTTACGACGTGAGCAGTCTTAAAGTTTCA GTACTACGAAATCCAGATTCGAAGAAGTTGGATCATTCTTCTTCTCTAAT CAGGACTTTGGTCTTGCACTTATCTACATGATGACCTCATCAATTCCCAT TTTTTAAAGTTAAAAATAGGCGATTGCATAGACATATATGTACTGTAGCT ATCATTCACATTGCTGCGTTAGAAGAGCATAGAGATAACATTTTAATAAT CAATTGAAAAAAAAAAAGAGACTTGTAGCGCAATTTGTTGCTTAATTCAC TTAAAATTATGTATTACTTGATTTGTATGGAGAGGGATGTGTGTGTATAT GTACTATATAAGCATGTAACTACTAAAGCATTATTGTACATCAATTATTT GAGGCAAACTCACTCCAAACACTCATTTAAAAAAAATGAATTCTATTCTT TATAAAAGATATGAATTCAAATTAGAGGTGCAACTGGATTGTTATTACAC ATTTTAAGTAATATTTAAAGATCAAGTGAGTTGATGTTTTTCCTATGGAG TCTGGTATTTATTTTTTCACCGGCTAACTATTTAAAAATAGTTAATAAAA AGAGTTTTACACCTAGAAAGGTGAGATTCTTATTATACCCTCCCCCCCCC CCCCCCCCCCTGCTCCCTCAAATAAACAAAAACGTGGCCCAATTCACTAC AACTTACTTTGACGATTTATACATTCATTTGAATGTTGCCTGTTTACAAG AAATTGAGCACGCCCATTTGTAAGAAAATTGGCACAGGATATTACATTAT TATCATACAAGTAGAAAGGTTTCCATCTTTTTTTTCTTTTTGCATAGGTA TATAAAGCTTTTCATCTGTTCATATCAAATAATGACGAACACTCAATTCA AATACTTGAAATTTTCTTTTAATATTGATAGAAAGTATTTGGATGTATTT TGGTCAGATACATTGATATACCTATGTACATATTAATATTTTCCCTTGTA ACCAAAATACTTGTGAAAACGAGTTATACTACTTTTACTAAGTATTTAGT ATTAAAAAATGCAATAAAAACCTGCTTAACGATTCTCTCGTATGCGCTTC ACAAAGTATAGTTTTTTTGTCAATAACAATAGAGATATGGTTAACAACTG CTTAATTGAATCTATTGAAATATTTCATCTAGAAATTATTTTAATATATT AGATTTAATCATTAAGGCGGGTTGTTTGTCAACTTAAATGAATTTTGATT ACGGATGGTTCGAGAAAGTAGGCATGTAGTAAGAAAATAACTACTGTAAA ATGTGATTGTTCTACAATGTCATCTATAGGTCTGACATATCCGTCAAAGT TTGAAAAAAACCTTGGTTTTGCGTATTGTGTGCTTCATTTTTTTACATTT TCGAAAATGAAGGATCAAAATAAAAATTCAAATTTGGTAGTCTCCCTTTT TGCTCCATAGCGCAACTATTGAAAAATAACTATTAATATTATTTATAGGT TAAAAATAATGATTTTGTGCTTTAAAATTTTTAATCTTTATTGACTAAAC ATAGATTTTTTTCTCCTTTTCTAACTTTAATCGATGTGTGCGACCTTAAG ATGGCATCTTGGAATAATGAAGTTATTTGTTCGTACGAGTTTTTTTTTGG TTGTTGGTAACCTGAAGAGTGTTTCTTATTTTCTAAAGCTATTATCATTT GTCTTATTCTTCATGACKCCACGAGTATGTGTGTGCTCATGAWTAGCCGA GAGTAACGCTGAGAGTTTAAGGTAGGGATTTGAAAATTGTTGATATTCAT GAGCATACATTTAAATAAAGTATATGCTGGTAACCTGCAAGATAAAATTG CTCTTATCAAGTATATCTTTCTATTTTAAAAATTAAAACATAATAGAGTT TTACCGGCGTTGCCCGGGACATAAAGAAATTAATATTAATTTCTCTTCTT CTTTATATAAAACAAAAAATAAAGGCCTTAAAATAATCAGAATTATTCTC ACTGCATGTTGGTTTGTATCTTCACATACTTCTTTTAAAAGAGATGATAA GCTTTAGAGATATATAGATTAGCGAGCCAGGAGCACTTGTGTGTTATCTG TCAGTGGATATGTTGTCTATTAAAGTAGCCAACATATAATTTTCTTTTCA TTTTATACTTATGAGGATTTACACCATTTTCAAGTATTAGTCGGTATTGG ACTGAGAGTATAATTGAGGATCGATAAAGGAGTAATTTCTGCATTTTCCC TTGTTAGATACAAAGCGGGAATTGGGTTAATTTCCCATCATCTCACAGCT GCTAGCAGGTAATTTAATGAATCGCCATGCCAGCTAAGCAGGTCTCCTCT CAAACATTTCTAAAATATTGTCTGCATCACAATGTCTTTTTGTTTTTTTT TGAAAAAAATTTACATACTACAAATGCTTGCAATTTACAACCCAAGTCGT TATTAGAGTATTTTCTTTGTCATATTTCTTTTAAAAAAAAAACAACTTCA CGTTTATGAATACCTCATTTAGTAGAGGGTGAGGGGGTGAAGTTCTATTT CAAAAAAAATAAATACTATAAACACTATAAATAAACTGGTTTTCTTAGTT TTAAATCATATACATATGATTAATATATGACAATATTAATAACTAACTGT TACTGAACAAGTTATTTTATTTAATGAGAACGACTAACTAGATTGTTTGT ATGTAACACGCACTACAGCACATGTTAACATGGGGAGAAAATCTCTTATC TGGGATATTTTTCTTCTTCGAGAAGGCTAGGGTTTATTATGTTATGCTAA GCGTTGTGGGATATATATATATATATTGTATACATAACTTCATTTTATGT TTAAAAATACTGCATATATGATTGGCATTTAAAAATTGTGGTAAAAGTTC TAAAGTTGAAAATATTTTGAGAAATTATATCTATATAATATGTATTAATA GCCTATTTTAATAATCAAATAATGTCATTTACACTCGGAGTAGATGGAAT GAAGTGCCTATGACTTCATGAATAAGCGATTTAAAACGATCTTTCTAATA ATAACAATAAGATGTATTCAGTGAGAGCACACATAAATTTGTTTATACAC 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TGTATCAATATATGAAGTAAAAAAATAAATTTGGATTTTCTACTTTTCTT GATTTTTGTTAAAGATTGTCTTTACCACCGACTTATATAATAGCTTTTAA ATAGGTTGTTATATAGGTCGGTAGTTGACACATACATAATTGAGTAATTT AAACTACTACAGCTGTTATAGGTAGATCCCCACCATTCGTGATAATTTCA TTTAAATATGAGATGTAGCTTTGATGTAAGGATATTAATTTAATTACATC CAATTTCAAATTAGAAGTTATGTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTAAC TTCCTAACTWTTTTATCTGTGTGTTATACGCTGTGGTTTTTCATGACTGC AATAATATTATAACAATAATACATGTTTTATTATTTCACAATTAGCATGT GTTATCTGCAAATAATATTCCATTTGTACAAAGGATTAATTGTTCTATTA AGTAGACCATCCTAATTAGAAGGTTTATGTATTGTCTGAAGAGTCGTCCT ATATGGGAAATATACTTACTTGTATTGAAGAGAGATGAAGGTCACTTTTA TTTTTTCTCCAGCAATAGTTGTTACATTTTATAATTTTCTACACAACTAA GTTAACTATTACTTCAATAATTATTAAATTGATTTGGGTCTCTGTGTTTG GATGACTGATACTGTAGGCCTTCCCCTCGACATGAACCCAAAAGGTGTAG TAAAGTGGTTTGGGATCAGGGCTATAGGGAGGCCAAAAGTGTAAAAAAGA ATTCATGAGATTCTTACAATGCAGGATATGGGGTTCTTTCATTGCTGGTC TCAAAAGTGGCCTCTCCACCCTTACAAGGCTCTTTCAACCCACTTTTTGA TAGCTTTCTGGACAGTCTGGTGTGGAACCCAGTGTTCTCTTTCATGACCC TTATGGACTATAGGGGATTTCCATGAGCTGTTTTCTTTATTATTCTTTAT 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