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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s97 | supercontig | LSalAtl2s97:1339866..1354690 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012833 >EMLSAP00000012833 ID=EMLSAP00000012833|Name=EMLSAP00000012833|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=719bp
MTDTEADRVVTTNGHHESDDEEEDMSNLRPVDIEQDVREMERRKRVEAIM HSKLFREELERVVTDSLRDNGGEGLSSILSNVMNVRGCSSGLRSYSALPV NDIRGLEGMVYTKQEKLLRCKLAAVYRLIDLQGWAQGIYNHITVRISQDT EHFLLQPYGMLYNEVTASSLVKVDMQGNVVEPGTTNFGVSIAGFVLHSAI HAARPDIKCIIHVHMPNIIAISALKCGLLPLCQEACLLGDVSYHNYTGIM VDASVKDSIAKDLGIHNKVMLLRNHGAVCCGKTVEEAFFYLQNLVLACDT QVKMMPYGLDNLVVIDEESRTAAFEVSQRGGGGVDSKSETDPDGNREKTI ESRKWGVGEMEFEALMRMLDNAGYRTGYLYRYPLIKEEPSRPKSDVEVPP AVSSLXYLXEEENLYKDGPLRAILGTLTKAQKGAERSKWMNSPNVYQRVE VIETGTPDPKKITKMKEGRRAGGITAGPESKVLEGQTWEEARDMQDKSYA VHSGEHVDFKVGAASKGIIQRDFQHHATVYGSAYAKNPFDNVTHEELAEY QRVVDCKSRGENPYSPSPAMNEYSTIDSTAASTAAANAGEILSSSAHPSS SDQPVASSQATDPSVLSPVLSPISPSDTEHDGEKPALPPKPTINTAKLIA QKKGDHTFNGDETDGNRTFSEGEADTSRATDPESVLSPKKEKKKRSGLRT PSFLKKRTRARRRTKKKPN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s97:1339866..1354690+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012833-708680 ID=EMLSAT00000012833-708680|Name=EMLSAT00000012833|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14825bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s97:1339866..1354690+ (Lepeophtheirus salmonis) AAAAAAGATAACTCCACTACCATGTATCCCCAAGCAACTTTGTTTTAAAG
CCTTACAGTAAGTTAGTAAGAGAAATAGAGCTTTTTTGTAACGCGTACGC
CATTTTGATTTTTGTTTTCTTATCGAGAAAGCGGAGCAAGGCTATTTAGG
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ATTTTAAGTAATATTTAAAGATCAAGTGAGTTGATGTTTTTCCTATGGAG
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GAGCATACATTTAAATAAAGTATATGCTGGTAACCTGCAAGATAAAATTG
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TTACCGGCGTTGCCCGGGACATAAAGAAATTAATATTAATTTCTCTTCTT
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TATTAGAGTATTTTCTTTGTCATATTTCTTTTAAAAAAAAAACAACTTCA
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TTAAAAATACTGCATATATGATTGGCATTTAAAAATTGTGGTAAAAGTTC
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GAAGTGCCTATGACTTCATGAATAAGCGATTTAAAACGATCTTTCTAATA
ATAACAATAAGATGTATTCAGTGAGAGCACACATAAATTTGTTTATACAC
TAAACACATAATGTATTTTTGAAAAAATTGTTTATTTTGATGAATGCTTT
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TTTATTCAAAGGGAAGAGTGAGAAACTTTAGATTTGTTATGTATACATAT
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GAATCTGTACATGTAGCGCGTCAACAGTCAAAAAGTCAAACTAGAAAGAT
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CTCAATTTCTATCAACAAATCGTTCTTATTGATTCTTTAAAAGTGCCCTA
AATTGKAAATAAAGTAGCCAATATTAAGTCACAAAAAAATAATTGACTAA
TGTCATTTGGAAGCTGCCATATCGGGGCCATACTAAATCTTAAAACGAAG
GTTCTTAACTATAGCTAAAATTCTTGGTTATCCTAACTCATTCCACAAAT
TTGAAGACAAACTCTATAATCGACTCAAATATGTCTATGAAATATTGGGC
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ATAGGTTGTTATATAGGTCGGTAGTTGACACATACATAATTGAGTAATTT
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GTTATCTGCAAATAATATTCCATTTGTACAAAGGATTAATTGTTCTATTA
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TTATGGACTATAGGGGATTTCCATGAGCTGTTTTCTTTATTATTCTTTAT
TTTCTGGTCCAGTTTGGCTCTTTTGACAGAGCCTTTCTTCTTCTCCTACG
TTTCAGACTTGCAGAGGACGCCCAACTGCTTGGAGTGACCAAATGGAAAT
TCGTCGATCACGTTCAAGTGTCATTCTCTCGACTTTTACGTAAGTTAGAG
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GAAATATGAATTAATTTTTATCACTCATCCTTCATTAATTATAGAATTAG
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AACCTTGGTTGGTTTATCGTTGGTTGTAGTAATATTCATAAGTAGGGATG
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ACATACTAGGTTGGGTTGAGTAGGATATAATATGACATGATAATATAATA
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GTGAGTGTAGTCCAACCTAAACTACTACAATGCCGTTTTCTTGTGAATGA
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TTTTGTTCATTTTTTGAAATATTATTTTACATACTTACTTTAAAAAAAAA
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CCAGTGTAAAAGATTCCATTGCCAAGGATCTCGGAATTCATAATAAGGTT
ATGCTCTTGAGGAATCACGGTGCAGTTTGCTGTGGAAAAACAGTAGAAGA
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CATTAGGTTAAAATGATGCCTTATGGTCTTGATAATCTGGTAGTTATTGA
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ATCGAAAGTAGGAAGTGGGGTGTCGGTGAAATGGAATTCGAGGCTTTGAT
GAGGATGCTAGATAACGCTGTATGTGTATTTCTATCAAGAGTTGAAACTT
ATTAATTTGTTAATTTATTTTAGGGGTATCGCACCGGATACCTATACCGA
TATCCATTAATTAAAGAAGAACCATCTAGACCGAAAAGTGATGTCGAAGT
TCCACCGGCTGTTTCATCTCTTKGCTATCTTTTWGAAGAAGAAAATCTAT
ATAAAGATGGGTAAGCTGTCATTTGCTTCTTTGCTTTTTCTTCATAGCCT
AACATATGCTTTTTAGACCTTTAAGAGCTATATTAGGAACATTGACCAAG
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CCAAAGAGTCGAAGTAATTGAAACTGGTACTCCAGATCCTAAGAAAATTA
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GTTCTGCAGTTTTTATTTGTAACATTTAGCTTGGGCATTCACGTGAATTA
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CCTATTATCCTCCCTGTTGAGCCCACATCAAAAGAGACAGCTTCAATTTA
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CGATTTTAATAACTAATTTTAAATCCAAATATTGATTTTGTTGTTTTATA
CGTTAAAATAATTATCATTATTATGACGATGATGATATATTGATTATCAG
GTCCATTATGATCAACTTGCTAAAATATTTTAACATTACTATGAGCTTTA
AAAAAAAAATCCTTTTAATGTTTGTTTTAAAAGAAATTGCATGGCGTTAT
CGATGATATATTTCMCTTTATCTGYAAWTAAATTCCATATATATATATGC
AGATAATATCCCAAAATAATTTACTTACCATTTTTCTAGATCATAACATA
TTTTTTGTTTAACTAATGTAGTCTATAAATATTTAANNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAATATTTGATT
CCTATTTTTTAAGGGGAAAAACCAGCGTTACCACCAAAGCCAACCATCAA
TACTGCGAAACTTATAGCGCAGAAAAAGGGTAACATTAGACAATTTTTTT
CCAGAGTTTTAGTTGAAATGTCTAACAGTTGACTTGTATGAGTGGTACAT
TAACTTAATTTAATTTGTGCAAATACTTAACAATAATCAATTCAAGTATT
TTAGTGTTTTATTTAATTCCATAATATCGTTATAGAACAAGGTTATACAA
AATATTATAAAAAGGTATAAGTGCGTGGTCTGGTACTAACTACTTGCATA
CATCATTAAGTTATCAGATAGTTTTGTATCGTATCTTTGTTTGCACTAAT
ATCATTTGAGTCATTATTTATACATATTTTAATTCAGCATAATTAGATCT
TTAATAATATATTATTTTTCATAGTTTTATAGTCCATATTTTGCCATTTT
CGGGGTTGTTTTATCATTAATTTTTGTCATTCGTCTATTTCAAATTTGTG
TAATGTTGTTGAATCATTTACTAATTTAAAAAAAATGTTTTTATGAAGGT
GATCACACATTCAACGGTGATGAAACTGATGGTAACCGAACATTTTCTGA
AGGAGAGGCCGACACATCTAGAGCAACCGATCCTGAATCCGTGCTATCAC
CGAAGAAAGAAAAGAAAAAGAGATCCGGATTAAGGACTCCATCTTTCTTA
AAAAAGAGAACAAGGGCAAGAAGAAGGACAAAGAAAAAGCCTAATTAATT
CCCCCTCATCATTTTGCATTCGGAGAAATAATTATGACCTAACGAATAAA
TTCAAGATAAATATTTATATATATA back to top
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