EMLSAT00000012875, EMLSAT00000012875-708722 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012875
Unique NameEMLSAT00000012875-708722
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s97supercontigLSalAtl2s97:3013984..3060502 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012875 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012875EMLSAG00000012875-695641Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000057798EMLSAE00000057798-766726Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057799EMLSAE00000057799-766727Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057800EMLSAE00000057800-766728Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057801EMLSAE00000057801-766729Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057802EMLSAE00000057802-766730Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057803EMLSAE00000057803-766731Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000057804EMLSAE00000057804-766732Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780989auto780989Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012875EMLSAP00000012875Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012875

>EMLSAP00000012875 ID=EMLSAP00000012875|Name=EMLSAP00000012875|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=734bp
MEIPVITVKPPASLKKSNKLDKISLDCFVTGTPHPLVFWTIESANSDGKE
VLLFSDSLGGDKRISVLRDGSLIIKDPQVKDTGHYVCSSLNSVGSALSRS
YLTVYDPSSSSIEKEKGNSTLNLPREIIKLEEARLVLLEETFSDITAVSE
SPTSIKLEWKLASTISSINGIRLHYRKNGNKSFVSKVIPLDRDTSYLLQD
LQEFTEYEIFIRPYYESVSGRPSRLVQIITLPTVPDQAPKILKIKILNAT
AIFIAWDYVDREHHNGNIKGYQIHIQGNNSEILNSALPSERLESILNVPK
LLTIDKANVSIALINHVGVGPFSDSEEILLPSLSEFDMAVYHHRGSGESY
AWLLALIGSFTFMLAFASGLTLYYRRRRVLHKSNVYEYSSGGGVVGSFTP
SSSQMGNNGNNMGQQPLWIDRRWNGGDYEKDSNSSEKKLLNQNGTASHLQ
ENEYAYIDRNKLFSTFGNRGCSNYESPSFLQSPYATTDILRAAQQGKAGH
HLGPRLFPLSVTPMLHPRNNFLHRSSXATSSCLFXNHKNHYYASKIMSRD
ARSCDDITERISSGGGSTYARSHHVYPSRLLNESNCNPHNSSLLSQQHYS
ELSTPPPRVQLYDPYPPRFSRIYPSSIANGVGLESNKPPPLISNNSSSLC
QPSLPLGNELHPEENTEEAITRFDDAVESYMSQAVLESDTDSYLSHGGGE
SLSEGSQFSDDVVRKDLDKEKLDHDDDNTALQHS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s97:3013984..3060502+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012875-708722 ID=EMLSAT00000012875-708722|Name=EMLSAT00000012875|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=46519bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s97:3013984..3060502+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTACACTTGAGGTATGACATGTCACATTTATTCCTGTAGAATTTCTTCCA AGTACTCTCAAAGACTGCATATAATAACCATGTGACAGGGTATAAAGTTA ATTTTTCATAAAAAAGTGAAGTGACTTGACAAAAAAATAAATACGTTTGC CAAAACAAGTTTTTCTCCCAGGACTTTTCACACAACCATGGGATCCATCT ATGTCACTTTTATATGGGTGGTTTGGATCAATTTAAGCCAATTGGTGTAT GGTGAGGAAACAATATTTGTACAATAAATGTTTTGTCTTTTTTGCAATAT ACCTAAGTACTCGTCAAAAGCTGTAGCATGATGCAGCATAGGTAGTACAT TATAGACTCCTGCATACTTTTCTACCTAATATAAATTAATTAATGTTAAA TAAGAGGCCTGAAATATTTTTTTTCTCCTTAAAAAAAATAATTGTATTTC ATTTTAAAATACACAAAAGAATTGACAGGTTTATTTTGTCATTTATTGTA CATTTGTACAATTATATATTTACAAACTATACTCGATATGTAAGCAACTT AGATTGTCTTTAAAATACAGAATTAATATTTAAAATCAAGAATACTACAT ATTTATTGAGAAACAGTCATTATTCATAAAAGCTTTATCAGACATATAGT TCCAGAAATTAGTATAACATATTGCCATTCGAAATGTATCGGTATTTTGT TACAGAATTACTTGTCCGATTGAGTTTGGTTATAAAATGTCAATTATCTA ACTTTTATCAAATATGATTATGCAATACTGGAGATACGAGGGGCTGATAA ATCATTGAAATGTAAATAATAAAGTGATGACTCCAAGTAACGGAGTTTGG ATGTTTTGAATTTATTTTTAAGTGTTCCAAAAGACATCTAATTTCTTGCA ATTCTGTTATGAGGTGACTTTTTTCTTGTAAATAAGATTGAACCCTTTAA ATTTTTAAAAATAATAGGAGCATTTTCAAAAATAATTTAGTTAAATTCCA ATTGAATGACTTTTTTTTTCATGAATATATATTTTTTTAATGACCTTTCT TTTGACATTTTCAAAATCCCTTTTTTAGACTGTCTTTTTTCTGTAAAATT TATACATATTTTTTTTTAAAAGGCCTTCATTTCTACTTCTTTAAAAGTTA TTACATAAATAAACAAAAATTCCTAGTGATATCCGATCATGTATTGGAGA AAAGGGTGCCATCCTTGTTGCAACGACCTTAATTACACCCTTTTCTGTCT CGTGATGCTTAAAATAAAAACTTCTTCTATACGAAACTTCGTTTTGTTAT ATTGTCAAGAAACAATTCACCAAAACGTCTTTGGAGTAAAATACAGAACT TACCTATTTTTCGTTAATTTATTCACCGATTATCAAAATTCAAATCGAAA TAAAACTTTTAACCAAACTAAAAGTTTGAATGCTGATTTTAATGAACTAG AATTTTTTAATCATTTTATTATTCGTGAGTAATTTATCTTATTTTATAAA TGTTTTAATATTAATATATTCCTATTATTTGAGTGCCAGAATAAATTAAT GCTGTTTTTCCTTTATAAATAAAACGTATCGATAGTTGAAATATATATTA ATTTTGTTGTTAAAATACTTTTCCATACTCAAACCCCACTTCAGTGTTTT ACATTGGTGCAACGTTGAGCAGGTACTGTAATTTCAAAAAATCATATTTT TTTAATGAAATATGATAATTGTAAATTCTTATAAAGAGGTAGGTAGGCTT TGACTACCTATCATCTGATTAAGATTTTATTATGGTAAGAATATCTACTT TCTACGAAATTTTGAAATTTAGTAATTAATTTACTAATAAATAAAGTATG ACTACTTTTGCATATAGCTCAAAATAAATTCTGAACTTTTACTACATAAA AGTATTTAAATATTGATTTGTGGAAATATAACTTAGTGTCGTAATCAGGC CCGGTGTCGTAGTAAGGTGTTTGTGTGTTGGACGGAGGGGAGACATCCCT CGAATTATTGAAGGTGAAAAAAATGGTATGCTAGTAGGAAAATGCTTGAT TATTTATGCAATGACTGAAAATTTCTTTAAAATGTTAATTCATATTTAAG TCGAATATAGTAATTACTAAGAATGCCTTTCTTGAATAAAATATTTTTTT TTCACCAAAAAACCTATTCGTTAAGAAATTTTAGCTGTACAAAATAAAAA AATCAATAAATGGGATAATTTAGTTTATCAAAATTCCCTAAAAAGTTTTT TTTTTTCGTTTAAATCGTTTTTTCATAAAATAAAATATAATATACATTTC TAAAAAAAATCGTGGATAAATATTATTTTATTCATATGAAAGGCCATATA TTTTATTTGAAAAAAGGTCCTTGTATTTATGAGTTGAAAAAGATGATTTA TTAGTTGCAAATTTAAAAAAAATAAACAAAAACAAAGTCAACCCCCACCC CCCTCTCTTGAAAGAAAAATATTGGAACCTACCCTTCCTGTAATCACAGT TTTGTATTTAAAAGTCTGGTTGGAGTGACTCGGAATCACTCACTACCTAC AACTGAAAACATTATTGGTGGACCAGTTTCTCTTGGCCAAGAAATTGATG ATTACGACACTGCAACTTAATGGGAAGTCAATACTTTAAGCCTTCAATCA GAAAATACATTTTAGAAGCAATCTGAAATATATACAAGTCCATAATTGTT AAAGGATATAAAAAAATTGTGGCTCATATTTCAATTAATATATTATATTC ATTTACATTGTTACAACATCTTTGATAATAATTGAACATATCTTTAAAAA GCCCCACATAAAGAAACTACTTCTATGCTCATGTTACACAGTGAGGCACT TTATTTATTTTGATATGTGAGTTACAACACGAGAAAGTATTAGAGACAGA TATACTAAGAATAGAGTTGATACTAATGTGTAAATTTATCATGTAAATCT CTGAATACATTCGTTGGGGGGGGGGGGGGCTATGGTTCTTCTACGATATT ATTTTTTTTGAGAGATGTTTCAAATCCATCCATATGTTAACGGTTTGTTA AGACCACAAGACTAAGAAGATTCACATAATTGTCTTCCTTCAACAATATT TCAAAAATATGTTCAGGGATAAAATTTTTTGGATATATTTTGGATCTCTG TAGTAAAAATATATATTAATATGAAGTTTATTACAAGCTCGTTCATTTAA TATATAAATACGATTAATGAATATTTATCGATATAGAGTGTGCTACCTTG TAAAAATAGAGGTCACCATAGTAGGGCCATTTTTCGATAGAATTCTGAAA GAAAAAATATAGATTGAATAAGTATATTTATCATAGATATTAGTATTGTT TGCTATATTGGATAMTGACGCATTTAAAACGTTATAACAGTAGAACCTGT ATTTATAGTGTCATTATGTTATTTTCTTTCAAACTTTTCATTAAGTTATT TCCACAAAACCATTCATCAAAACGTACCTATATAGTAAAGTACAGAGTTG TATAAAGAAAAATGGAAAACTGCACAATTCTTTTCGTGAATTTACATATT TGACAATTATTTTAAACTTTATGTACATTTTACTATTAAGATATTGCCTT TATTTGAGTACCAGAATTAATTAATTCTGTTATTTTTTTATTGCACAGTA TATACATAAAACAGAAATAGATGAAAGTTGTCGTTGTTGGAGTTCAGACA AGGGATTCAAAATATTAAAGAGAGCATTTCTTAACGGTTTGTAACCCGTA TACAGTAGTATATCGGGTACAATATCCATGCATTTAAACGCTATTATACT AAATTGATAGTATAACTGGTACTAGTGTCATTAAGTGATAACTATGTTAT GTTGAAACGTCGATGACGTATCACTGCCTCCCCCCTCCCTCCCAATGGTC TTTATACAAAAATCACAATAATGAAGATTTCTTATCTTACAGACATAATC CCCATCATAAAATTATATATCAAAGTTATTTAAGGGATGGCCTAGTTCTT CAATTAACGAAAGACTCTTGCTTATTACGTTATTTTATTTTAAATGGTTC TTTGTTCAACTGTATCCTTATTTTGAATTGTCCTATTTGTACCATTGTTT TTGACCTGAACTTTTTCTTTTTCTTCTTGTTTGTTAGTATTGAACATCTG TGTTGTATGCTGTTTTTGGCTTTAGATTATGTCTAGATATTTATATTTGT AGGGAATAAAGTTACGCCAGCTGGCGAAAAAAAAAATTATTTTATATAAA AATACAATAATGAAAATTGTCTTTAATTAAAAATAAGTCTTCAAATTTCT GAGCTTGCAACAGCCCTCCTTCTCCCTTCCAGCAACAAAAACCCCTGGTA GTGCANNNNNNNNTTGTTATGTGTTTTTTTGTCAAAAAGTATAGATTAAA ATATTTATAACACTTTTTGTACATTATGCCGTAAGGAAGTATTTTGTTTC GGAGCAAAACTACAAATCTTACGTTACATGTTGCTCCGATTTTGAAAAGC AACATTTTTTTAAAAGTTATTTGTGACAATTGATCTATCGTCGTTGATTC AATTTTATGTATTATGATGTTTATATATCCCTGCTTTAAGTATCAAAAAT GTGTCCTATTAGTCAAGTTTTAATAAATTTGTATTTACAATGTGTGTAAA GAAGATTAACATCAACTTAATCAAGAACAGAATGCACCGAGTATCAAGAG TATTTTATAATTATAACTATGCCTTGTAAAAATAACAATTATTCCAAAAA 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GCTATCCATGGGGCCTGAGTTGTATTTGTATTTTATGATAATGCCAATGA ATAAATAGTTTCAAAATGTATGCATATTGGTAGTTCATTCCTAATTTAGC ATATTGAATATTAAATGTGGTTAGAACATAAATGGTTTTTAAAGTTCGGA ACTGGAGAATAATTAAACTTAATCACCGTGATTTATCAAATGGTTAAGTC TCATTGGCAGTAAAGATGAACTACCACATCTATCATGATTATACACGCAA TTTATCCTTAAGGACTTTGCTTATTATAATCTACAAACTTCAACTATTCT TCCATTCAAAATACCGAGGCTCTGTGTTTTAAAATATTTTCGTTTAGGAC ATTTCATAATTGTTTCGCAAAGACAAACTCTGCATCTTCTTTTTTCTCTA AGGCATATGTGATAACTAGTAAATTAAGATAAGTCATTTTTACATTGATA AAAGCAACACATATACGATTAATAAAAATAATTCCGGTGACAAGCTGAAC ATGAAGAGAGATGTAATAACTTTATGTTTTCAATTTGATCAAACAGGGCA TTTTTGTTGCAAAAATAGGGTCTAGATTGCACAATAATAAGTTAAAAAAG TACGTATGTGACCCTTTAAATTATAAGCAAACTTTTTTGTCAAATTTGAG AGGATTACATTTGCATATATATAAACGACTTATCTTCAATTTCTATCACA CTTATTCTTCTTAACCCTTTGGATGTGTAGCTAACTTCTCTTCAGGCCTA CAATTGAATCAAATATGTCCATGAAGTTTTGGGATAATTGTCTAAATATT TTTTACATATTAAAAGATATGTATTCAAATTTGTTCAATGAGGGTAAATA CCCAAGAATTTTACCTATACGCAASTTATAACTAGTATTTGAATTAAGAA ACATATGTCTATTTATAATTTAGTTCCCTGCCTGTAAGGATGATACTTTG CTGCTTTAAGTGCAACTTGTGGCACCTTCAAAGGATGAATTCGTTGATAG CTATGGAATTGAATTTATGCCGACAGGCCACTGTTTTTTAAATTTTTAAA TAAATGAATGTATTTTTTAAAAGACTGAATAGTAGAATACAACATTAGTA TTCATCACCAATGAATAGTAGAATACAACATTAGTATTCATCACCAATGA ATATTCGTCAATTTCTATTAACAAATTATTCTTATTAACCCTCTTGAGTG TCTCGCAAATTGCACTTATAGGAGCTGAAATTGATCCTCATAATAAAATA ATGAGAAATTAATCGTTTTTCTTTGAAAGGTTATATTAGAGTGAATATAA GTATTTAAGCCAAATAAAGGTTTCAAACTATGAATATCCCTTTTATGTAC CTTTACATGTCTTAGAAGTTTTAACTCCAGACCTATAATTGACTTTAATA AAATATTGTGCTCTGTGTATTTATCAAGTATAAAATAAATTGTTATGATT TTTGTAAGAGCTTGATGCTATTAGCAGTTACTGTTTTTTTTCTATTTAAT CAAATTACATGTAATATACAAATATATGTATGTCATGTTTAGACATTGTC AATTAAAGTTAGATCATTTATTTTTTTCAAGTTACAAAATATACATAAAT ATCTTTTTAGTATGTGAATCTGTCACTTTTCATTGAACTTTCTGTTACTC ACTTTTTGACGTATATTGTTATTTCATCTACATAATATTTATATATTAAT ATTCAATTACACAGCACGGTGTACATATGTAGAGGTTTTGTTCGGTCTAC CTCTGCATATGTTTATGCATATTGGGGTACAAATCAAAATCAAATCATAC CATTCTAAATGGATATTGGAAATAGTAATACCCAGAGGTCCTATACTGCA AGTCAAAGTAGATTTTTTTAGTCCTTTCTCATAAGTCCAACTATAGTAAA 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AATGAAAAAAAAAAAAAAATCAAATACTTGGTTCATTTTACTAACACTCC AACAAAAAATGTTGGGCTGTCTCCAGTAATTGCTTACAAAAGAAACATTT TCTTTCTTCTGATATAAACTACCTAAGATTAGTAAGATGGTTACCATTCT GTGCTTTAACCAACATAAGGAATAGTTTATCATCCTATTAAGCCCTCTGA CTATATCCTGCCAACCGTATCTTTCTTCTTCTTATCTGATCTAAAATTTG ATAGCTTATATATTTACTAACTAAAATCCTTCTCAGTCGATTGTTTCCCC GTTATTTTGGTAGTATTAAAAAAACTATCCCTTGAGCCAATTTCTCTTCT CTTTAAGACAAATTTATTTTCAAATTATTTCCTTTGCCGTAAACTCATAA TTTTTATTAAAACCTCTCTTACAAACGATAATATGATTTTATAGATGTCA TTATGCACACTTATATCAGAAGAATATTATTTCTTATTATTGGGTTATTA TAAATAAGTCTATGATCTTTTATGTGATTCTACTCATGTAAAATTTAAGG GATTACAATAACAGTTTTTAATCAGAGTAATATATTTCTATGTTTCATAT TGTATGTTTAATTTTGATCATTCGCCATATAGGAGTTTAAACTGTGGCTT CTACCCAAAACCTTTGTTTWTATCTTTTAAAAAGTAAAACTTAATTGATA ATCTTTTAGCTTACTGATTGATTTTCACAAAAGCTGTTCTATCCTTCTTC TATGGGATATATTAGTTTCCCTGCATTTTCTTTCAATCTCAAAATTGGAG ACAGCTATAGCAGATGGCCGAAATTCAACCTTTTAATACTGAAAGATATA ACATCACATTAAGTAAACCCTACCGGATTTTCTTGTAACTACCAAGAGCC AATACAGTTTAATTACGAGATGAACATAATCAGTAACCTGGAGAGGAACT 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