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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s97 | supercontig | LSalAtl2s97:594712..603994 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012881 >EMLSAP00000012881 ID=EMLSAP00000012881|Name=EMLSAP00000012881|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1121bp
MRGEVLAFISFFSILHTSSAQDPFGFQEVIRKKPRFRLRGGPTPGVGFVQ
TDDIQSWSTVCLRENFGIDEANVLCRENGYGEAIHVGQSLHSAPFNLSKR
FINLIKYSTLRSIKCRGSEKRLSDCTIIPIQGSYEECKNSIINVVCSTPK
LTACEGNTTAAFRNRCYRVYYEEKSYKEAIKSCRSSIKDGNLIEVKDWAE
LNFITELLDPKFITTRVWTGGHLLRSEVEDDSPPFPFWYGSRAPITDYPD
LEYPTEGNELGLALDPKEPPFMASIPWSFLDPKQTYPFVCYSKMINIGCL
TDPTGSNYEGTASRTESGSSCIPWNAPGVPILFPGQENWNHNYCRNVGGE
DDSPTCFIDSQVTDFCSIPLCDEKDALRFLDSGEETSICQTPEPYCGPEH
FECEPGVCIFSRYVCDGMSDCQSGSDELNCMSYVEYFGKEEGFKLGHRDI
DSRYYNVTLNECGRICIQSKHCSCLSFSYRDSSQECIIGTKVSGTYSYDA
VLQESEWNYFTLKKAVEETGCHRFKRPAGTPIEGIRILKGDKIDIVEVKI
HSTWGGICDDGFGQTEADVLCRQLGYLAGSIKHEIGLGNKEDPISLYDLK
CFGNETSIADCDFKNHIVSPRPYCTGNERIGVKCRDDDRLDPSGTDMSNY
KCPIGEWKCVAKEECIDSSYLCDGVEDCSDASDEVDACETSSEDLTERLE
KETVRLSDEYFGVLEILREGRWSPLCDSDFKIPDAKVVCRMLGLNDGIYA
KIHSEPIRSFETGNEPLWISLNSDKQCTGDEYSLAECKDPSRWSHMHQCS
LSEEIKISCLKDGIKTTKLDPILPSPPFESASLLKDIQEELLYNSCGMVD
NNIIGPEEGMSARIVGGSVTRYGQHPWXASIRVQTRNSSFHWCGAVIIGK
RHLLTAGHCLKEFPMDAYLVRVGDHVMEIEEEAEAEYDIDEIIFHEHYNV
GPYLNNDIALIKLKSEKGLEYSKYVSAICLPAPYFVYRNLEYITISGWGR
TGQEIFGSLPKSHPLESGPIPRSLIAVSVPMIPKSRCKEKGIYGNSKLSV
GMFCAGHLDGKGDTCQGDSGGPAVAEVDGKNYLFGITSWGYGXGQKNKPG
XYTKVSNYIYWIHENLMKDQS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s97:594712..603994- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012881-708728 ID=EMLSAT00000012881-708728|Name=EMLSAT00000012881|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9283bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s97:594712..603994- (Lepeophtheirus salmonis)
AAAAAATACTTGTGTCCCTCAGTTCTAATCAAAATGAGGGGTGAAGTGCT
GGCATTTATCTCCTTCTTTTCAATTCTACATACATCAAGTGCCCAAGATC
CCTTTGGATTTCAAGAAGTTATTAGGAAGAAGCCCCGATTTCGATTAAGG
GGAGGCCCAACTCCAGGTGTAGGTTTTGTACAGACCGATGATATCCAGTC
TTGGTCAACGGTTTGTTTACGTGAGAACTTTGGAATTGACGAGGCAAACG
TTCTCTGTCGTGAGAATGGATATGGCGAGGCTATCCATGTTGGACAAAGT
CTTCATTCTGCTCCATTTAATTTATCTAAACGATTTATAAATCTCATAAA
GTATAGTACTCTCAGATCCATCAAATGTCGTGGATCTGAAAAAAGACTTA
GCGACTGTACCATAATACCAATCCAAGGATCCTATGAGGAATGCAAAAAC
TCCATCATAAATGTTGTCTGTTCAACTCCAAAGTTAACTGCTTGTGAAGG
GAATACTACAGCTGCTTTTAGAAATCGATGTTATCGTGTCTACTACGAGG
AAAAATCTTACAAGGAGGCAATTAAATCCTGCAGATCCTCAATTAAGGAT
GGAAATCTGATTGAAGTAAAGGATTGGGCTGAACTCAATTTCATTACAGA
GCTTTTGGATCCAAAATTTATAACTACTCGAGTCTGGACTGGAGGGCACC
TTCTCCGCTCAGAAGTTGAGGACGATTCTCCTCCTTTTCCATTTTGGTAT
GGGAGTCGAGCTCCAATAACTGATTATCCTGATTTAGAGTATCCCACAGA
AGGAAATGAACTGGGACTTGCTCTGGATCCAAAAGAGCCTCCTTTTATGG
CCTCAATCCCATGGAGCTTCTTAGATCCAAAACAGACCTATCCTTTTGTT
TGTTATTCAAAAATGATAAATATTGGATGTTTAACAGATCCTACTGGTTC
AAATTATGAAGGAACTGCCAGTAGAACTGAGAGTGGTTCATCATGCATCC
CATGGAATGCTCCAGGTGTTCCTATTTTGTTCCCAGGTCAAGAAAACTGG
AATCATAATTATTGTAGAAACGTAGGAGGAGAGGATGATTCTCCAACATG
TTTTATTGATAGTCAGGTGACTGACTTTTGCTCCATACCACTCTGTGACG
AAAAGGATGCTCTGCGATTTCTGGATTCTGGAGAAGAGACAAGTATATGT
CAAACACCCGAGCCATACTGTGGGCCTGAACATTTTGAATGTGAGCCAGG
TGTTTGTATATTCAGTCGATATGTCTGTGATGGAATGAGTGACTGTCAAT
CCGGTTCGGATGAATTGAATTGCATGAGCTATGTCGAGTACTTTGGAAAA
GAAGAAGGATTCAAGCTAGGGCATCGAGACATTGACTCAAGATACTATAA
TGTCACTTTGAATGAATGTGGGAGAATCTGTATTCAATCCAAGCACTGTT
CCTGTCTTTCATTTTCCTACAGAGATTCCTCACAAGAGTGTATCATTGGA
ACAAAGTAAGGCATTAACCAATACTTTTAACTTTTTTCTTATTGACATTT
TCTTTCAATAGAGTCTCGGGKACTTACTCATATGATGCAGTTCTTCAAGA
ATCCGAATGGAATTACTTTACTTTAAAAAAGGCTGTGGAGGAAACGGGGT
GTCATCGATTTAAACGCCCTGCGGGTACACCCATTGAAGGTAAATAATCA
AATAGTGAATGCAAAATAGCAGATACTTTCATTTTACGCTTTATTTGCAA
GGTATTCGAATACTAAAGGGAGATAAAATTGATATCGTGGAAGTAAAGAT
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CTGATGTTCTTTGTCGTCAGCTTGGATATCTCGCTGGATCAATTAAGGTA
AGAGTCAATTCATATTGTGTATATATGTATACTTTCGAGTACATGCAAGA
CTCTTTTTATTTGATTTCAAAATTTAATCTTTATGTTTGATAAGAGATTC
GAGCAGGAAAGTTCATTTATTGACTAATCTATTGATTTTCTTAATTAAAA
AATGATTGTAAACATATAAAAAAATATATTTATCAAAAGATAACATAGTT
TACCTGTGTGCTTCACTGTTTTTCTAAAGTAAAGCCTTTTTTCTTCATAA
GACGTAATATCTGAGCGTAAAGGAGCATTACTAAAATATTACGCGCCCAT
TTATAATTTTGTAATAAAAACCAGTTATAACAAAAATATATTATATTTAC
AATTGTGTATGATTTAACATGAGTTTACCTCTGCAATCTTATTTCGTAAC
GCTGCTAATTATCTATGGCAAAATAAAAAACCTATTTGGCCAAAAAACAT
AATAATTTATTTATATAATCATAATTTTTATTTGGCCTTTTGAAGGTTTT
GTACCAATTAGATTTATATTCGGAGACAAAAATTCATGTTATGTCGAGTT
CTAGTTTTTGAAAATTTTCACATATGTAGTTTGTCAACAAAGAAGCAAGC
TAGAATTATTTCTTTCAAAATTGTGTTTAGATAACATTTCTATTCTTGGG
GGAATTATTGTCAATTGCTTTCAACAAATTATTTTGGTTAACCCATTGGA
TGCATCACAAATTAAAATTAAAGTAGACAAAATTGATCATATCAATAAGA
TAATGATCAATTTTATTTAAAGAGGTCATATCGGGGCGGTATAATAATTT
TAAATCAAAGTTTAAATAAATTTTAAATCAAGTTTGGAAATTATAGTGGA
TATTTTTAGGTATCTTAACTCATCCCACAAATTAGAATATAAAGCCTATA
ACTGACTCAAATATGTCTATGAAATATTCAGCTGTAAATACATATGGAGT
AAATAAATAATTAGGGATTTTTTTCTTTCTTTGATTTTTGTTCAAGATTG
TTTTTAAGGTTGATGTAGCACATACAGAGCTGTAAAAAATATGACCTAAG
TCCAGTGTAGTTGTAACTTGAATAGTGTCTGTTATTTTCCAAAGATGTAG
TAATTAGTCTTTAATTTATGAAGAAAGTATCTACTTGTGTGTGTTCGTTA
TGATAGACGGAGAGKAACGCTAGAGATTTTTGGTGGAGCTATAAGTATAA
GTTCGGGTTGGAATAAGAGTAAAATTGAATATTGACCTGAGTTATTCCCG
TCTATGCCCTTTGTAAGATACGGAGTGGGATTTCTGTTTATTTTATTCAA
CTCACAGCTGCTCACAGCTTATAGAATGAAATGTATCGATAGTTATTCTG
CTCTCCTCTCAAAGACTATTCAAATGAAAGTACTTTATGTATAAAAATGA
ATATTAATTTAAATGAGGTTTAACAACAAACTATAATACTCCTTGAAAAA
ATCAAATTAGTGTTGGGTTATTCGTTATTTATTAGGTCCAGTCCTTTAGT
CTATTGGTCCTTCGGACTGTGAGTATCCATTTTAAGACTTATATGTAGGA
CTGAATTGCACCAGACCGAGACTGAACTCGACTGCAGTCTTCAGTCTTAA
ATATTGACTGACACAACATTATATTAAACATTTTTCCCTGGGCTGTTATT
TTTTTTTGTTCTGGAGGAGAGAACATCTAGGTATTGAGGAAGTACATGTG
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AATATTTATATAATTAAGTCAAAATATATCTGTTCGTCGTCACCTTAAAA
CTTTGGGTAATGCTGCGTACTACCACTAATTGTAAATCAATAGATCTGAA
AATTTATTAATAATTTATAACCTTTTGATCATCTCTATAACGTACAAGTT
TGATTTTTTTATATAAGCATACCAAGTGTATTGGTTTTCCATAAATGATG
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AACAATTCCCTTGATTCTTTCTTTGTTAATAAAGTCAATTAATTAAATAA
AATATTATTTTATTAAGTGTAAATGCTCTTTACGGGAAAAAACACTAATT
AATTGTTTGTTTTTTCATCATAAAATTGTACTACATCCAATTTAGTTCTA
CAGTTATTTAGCACTGCTATTTATGGGATGCAGTACAATTTTGTGATAAA
AAAAACAAACAATTAATTTGTGTTTTTTGCCGTAAATAACATTTGCAGTG
AATAAAATAATATGCTAACCATATACCCCATTAAAAACCAAACTAACTTA
TCTTATTTATGTAAGCTCCAACTCAATTTTAGAAACTAGTTGTAAAATAT
GAGTATCAACGCCTTATTCGAACTCGAAAATTTTAATTCGAATCCAATTC
TACACTTTTGTAATTGAAAATAAGTTGTTGCTATGATGTTTGCTAATAAA
AATTGGATTAATACTTCTCAAAGTCAGATCCTTTATTTTCAAATGCACAC
GGAATTATTTTCTACAGGAAAATAAGCTTTTGAAGATGAGTATATATAAT
TATTGTTTCAAATACTTATTTCCTGTAAATTGATATTTGATCTATATATT
GACATCCTTTTTTTTTGTTCAACAACAGAGTTGATCATGACAAGAAATCC
CGACAAAGTTGATCTCTTCCTTTAACTTCCAGTCTGAGTATAATTAAAAT
TAAATTTTGCTCCAATTTTCTGGTGCGTTAATAGAACAACAATCTTGAAC
AAAAATCAATCATCAATTTGTTGGTTTTACTTCATACGGTTCATTCAACG
GTGAATTACAACTTTGCGGAAAAAATTACTAAATATATTTGATGAGGATT
CATGGTGCACGACTATGTCATTATTAGTGTTGAACCTCGGTCCGGCACTG
AATTTTTTTTCGGTTCGATCTTAAGTGATTTTTTCTAGACCGATTTGGAG
CGATTTTTCTGTCTATACCGTGTACCAATTTTTTTAGTGTCATATATTTT
TTTTTTCTACATCAACCGTCATTGATTTTTTTTAAAATCTCAAAAGTACA
CAATATGTTCGGGAACAAATACTGTATACATATAAGAGACGGCAAGATCA
AAATTAATCCGAGCTAGCTCTGTTTAAACATCGTGTAACGTCATTGTACT
TGAAAAAACATATGATGTCATGTTATAAACAATTTATCTGTAAGATCGGT
GTAGACTGATTTTTTTTGCCACCGAACTACACTGAATTTTTCTTTTGGTC
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CGATCTGGACTTTTCCAGATACATAGGATTAGGATCTCCAACAAATTCCA
TTTAAATGATTGATTCATTCGCATTGTACATTGAACTTTACATTAATCGA
TTTATTGACTTTTTCTCTTCTTTAAATAACTTTTTTTCTAATTTATGTGT
TTAATTCATTTTTGGACTGTTATTATGATTTTCTTCTAATAGCAGTTTCG
AGCAACTGTTGAATCATCCTCATACAGAAATGAATCAATTATTAATCAAT
ACAAATTAAATCATTACAATTCCTGCCAAATAATCCAATATGTCATTTCT
TTAAATTGATTTAATATGAATGGGAATCATAACTACATATTGCACCATGA
ATTGTCATCAAACATATTTTTATTTATTTAGCCAAAGTGTCTGTTTGGGA
GAATGGCTTTCAGCAATAAGGTGTCCGCACACACAACATTTAGAAGACCT
GGGCACTGTACCATTTTTTTAATTGCGTGTCCGTATCTCCGTATAATTTT
TTTTAGAAAGTGGTTCGATATTACCTATATCTGCACCTCTGTATCATTTT
CCCCTAACATTACGTGAATGCATATTTATTAAACGTCTATTCTAAAACGT
TAGTTCAATAAATTTAAGAAGTTACTTATGTATTGGGGCAAAATAAACAA
CCTCAGACAAATTACCAGAGCTCAGGCGACTTGCTGGTAAGGGAGTTTAA
TAAATTTTCTTTTTAAATAATATTTATTTATTTTTTCACCTTCCGTGGGG
GGGGGGGGGCTGGGAAGGGGGRTGCTAGACGTCTTAAGAGAGTTTTAGGT
CAGAAACAAAACACAGTTTTGTACCCCCTCATTATTCCTAATTCCTCATC
TTGTCGGGATCCTCTGACCTAGACGGTGTCCTTAATAATCCACAGGTAAT
TTGTATAGTGGATTAACGTTATTTGATTGGTGTTAGAAGACCCATGAACC
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AGATTAGCCTTTAACGGACTAACAAAAAGTTGCCCACCTATGTTAGACTT
ACATTGTCCCCTTTCAAATATAATTTCTTCATTTCTCATTTTTTGATTAG
GTTGCCTCCAAACGGTGAATAAGAATAATTTGTTAATAGAAAATGAAAAT
TATATATTGAAAAATACATGTGAAATTCACAATTTATTTTGAGAGAAATC
ATTCTGACTAGCTTTGGTGTCGACGGGCAACATTTTTAATTGAAGTTCTT
AAATTTAAGTACATAATATTAGAAGTTATTATAGGATTTGATAGTGTTTG
GTACAAAAACTCAACTCAGAAAACATTTTGTTAGCAAATACTTTTTTTTT
GTAGAAAAAAAAAAAGATAATGTTCTATTCTTTTAATAAGACCAAGCTTC
CTTTTACCTCTTTGAAATAATTTTATCCATATTACAAAAAAAAAATGTTT
TTCTCTATAGTTAAAAGGACCTTTTTTAGAAAAAAAGGTAATCCTTTTTT
TATATTTCTGGTCTTTTTTAAATTTCTTCTTTGTGTACCTATTTATTTAC
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TTTACCCAGAGTGTAAGTAAAGCTTGTTAGTACTTTCTCACCAAATTTTT
GCAATTACATGCCCACTGTTTTAAATTAGCTCTTAATTGTGGTAGTCAAT
TTTTTCCTGCATATTTTTATGTTGATTCTCTGCATTCAAACGCTAGCATT
AGAACTTTTAGCCTAGCTTTTTAATAGTAGAAAGAAAAACCTTTTCAAAA
ACCTTGTTATACTTAAGTTTTATCATGCGTTATCATGTTTGTAGGATTAC
TCCTGGTCATATATTGTGGGCCAAATTTTTTGTTCGCTAAAATCATCCGT
TCATGAGATGTAAACACTTTTTTGGTTTTCTTTTACAGCAAATTATCTAA
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ATACATTTAATGCTTTTTCATTGCTTCTTGATACTTTTTGATGTAACTAC
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TAGACTAATTATTTTCAGATTAATCAAATTTCATGAAAATATTGTTCTAA
TTGTTTTTTCTTTTTCATTTCTGTCAGCACGAAATAGGCCTGGGCAATAA
AGAGGATCCAATTTCACTCTATGATCTCAAATGTTTCGGTAATGAAACAA
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TGCACTGGTAATGAGCGTATTGGAGTTAAATGCCGTGATGATGATAGGTT
GGACCCCTCTGGGACCGATATGAGTAATTATAAATGCCCTATCGGTGAAT
GGAAATGTGTTGCTAAAGAAGAGTGCATTGATAGTTCCTACTTGTGTGAT
GGAGTTGAGGATTGTAGCGATGCAAGTGATGAAGTGGACGCATGTGAGAC
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GTGATGAATACTTTGGAGTTTTGGAGATTTTGCGTGAGGGAAGATGGTCT
CCACTCTGTGATTCTGACTTCAAAATCCCTGATGCAAAAGTGGTCTGTCG
AATGTTGGGGCTCAATGATGGGATATATGCAAAGATTCATAGTGAACCTA
TTCGAAGCTTTGAAACAGGAAATGAGCCTCTTTGGATCTCCCTCAATAGT
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TATCTTGTTTAAAGGATGGAATTAAGACTACAAAACTAGATCCCATCCTT
CCATCTCCCCCCTTTGAGTCAGCTTCTCTCCTTAAGGATATTCAAGAGGA
GTTGTTATATAATTCCTGTGGAATGGTAGATAACAATATTATTGGCCCAG
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CAACATCCCTGGMAAGCCTCTATCAGAGTACAAACTAGAAATTCAAGTTT
CCATTGGTGTGGAGCAGTCATTATTGGAAAACGACATCTGTTAACTGCAG
GACACTGCCTCAAAGAATTTCCGATGGACGCTTATTTAGTTCGTGTTGGA
GATCATGTCATGGAGATTGAAGAGGAGGCTGAGGCAGAGTACGACATTGA
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ATATTGCATTAATCAAATTAAAGTATGTTCGTATGCCTATGTTTTAAGTT
ATATATATATTAATACTTTCTTTATTTTGTTGCAATAGATCGGAAAAAGG
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TTGTATATAGAAATCTGGAATATATCACGATATCCGGATGGGGACGTACT
GGCCAGGAAATCTTTGGAAGTCTCCCAAAGTCTCATCCACTCGAGAGCGG
ACCTATCCCTAGATCCCTCATAGCTGTTAGTGTACCCATGATTCCGAAAT
CAAGGTGCAAAGAAAAAGGAATTTATGGAAATAGCAAGCTTTCTGTGGGA
ATGTTCTGTGCAGGGCACTTGGATGGAAAAGGAGATACGTGTCAAGGAGA
TAGTGGAGGCCCTGCTGTAGCAGAAGTTGATGGAAAAAACTATTTATTTG
GTAAGATATAATACTTATTGTTTATGTAACGTTAATGTTTTTATTTCGTT
TACTTATCTACCTACAATAGGAATTACAAGCTGGGGCTATGGCTGKGGCC
AGAAAAACAAGCCTGGAGKCTACACTAAAGTATCCAATTATATCTATTGG
ATTCATGAAAATCTTATGAAAGATCAAAGTTAA back to top
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