EMLSAT00000012922, EMLSAT00000012922-708769 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012922
Unique NameEMLSAT00000012922-708769
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s986supercontigLSalAtl2s986:56775..76679 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012922 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012922EMLSAG00000012922-695688Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000058035EMLSAE00000058035-766963Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058036EMLSAE00000058036-766964Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058037EMLSAE00000058037-766965Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770877auto770877Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012922EMLSAP00000012922Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012922

>EMLSAP00000012922 ID=EMLSAP00000012922|Name=EMLSAP00000012922|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=167bp
MEFQLYKYIEFSNDFFSLVRIVVMGLGIIIIILATLACCFTAKGIVPLLY
IYSSLLMVIFCIQVLVFVIGYVYRDKISSGFYDGLDRGLDNYGKDTGLTQ
AIDGIQTTLHCCGLSNHSDWSNTPWGTGHRGKLPHSCCLYTEEAVCASDR
DTAFVHRQXKXFYFQVL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s986:56775..76679+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012922-708769 ID=EMLSAT00000012922-708769|Name=EMLSAT00000012922|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19905bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s986:56775..76679+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTCAGTGGACTTGTCATTCTCTTTCTCGGAATTTGGATGGAGTTTCAACT CTATAAATATATTGAATTCTCCAATGACTTTTTCTCACTCGTTCGAATTG TGGTAATGGGACTTGGAATTATCATAATCATTTTAGCAACGCTTGCCTGT TGTTTCACAGCCAAGGGAATTGTTCCTCTTCTCTACATTGTAAGTTTCTA TTGCTCATTCCATATATTATTTCATTATCATTCTGTAAAGAGATTATTAC ATATTATAGGAGATATCTTAATTACCACTCCATATGTATATATAGCTCTA AATAAATAAGTAAAGGGAGTTTAAAGGCAGATAATTCTATAAGTGCTTTT GTCTTCTTCTTCTTCATCATTAGATGATAACAATAGAATAAATAATGTTT TGGCTATACTAGTAAATAAAAAATATCTTTAATTAAAGTTTGTATTAATC ATTCACTTAACGAAAATACAACAAAAAAACCTTTAATCATATAATTGAAT ATAACATTTGAATAATCCCTTATCAGTGTACTATTCATACAAATTTCGAA ATGTTTTATCTCCCTATATCAATAAAGAGATGGGTACAATTCAATGATAA TAATCTCTAAATGTATAATATTACAGGCTGGAGTATCACCAATGCACTAA TGTATATATACTAATCTTGCACCTCCTTTTAGGTCTTATTTTGAGCAAAG CAGATTCAGAAGATAACATATAATTTTATCAAGACTTTGATGATATAATT TATTCTCAAATCATTGAAGGTGAGATTGAGGAAGATATAACTAATGATGA AAATACAATAGAGCAACCATCTAAGGATTTTAATCTTCCTTAAATTTTGT GATAATGAAGGATTTATTCATGTTGCTGGATATGTGGCCAAATCGTTACA TCAAAAATTTTCCACTCTGGCGTGTAATACTTCCAGCATCCAAGTTCCTC CAAGTACATGGCTTAAAAATTGTCAAGAGGGGTGGGGGGCTGATTCAAAC ATCAGAATATTTTTGGAAGTTTGCAAAAAAAAAAAAAGGAGAAGCATTTC ATTAAGTTTCATGGAATTTTTTTTTGATATCGAAACATATGTGACGGATC GAATCATCAGCTTAATTATGGAAAAGTATCCTAAGGAAGAATATAAAGTT ATAAAAATACTTATTCGCACTCGTACGTTCATTTGTATATTAATATTGTA AACAAATGTAGCATACAAAGAAAAAGAGCAAGTAAAAACGGCTCCTTTCA TTTGTTAAAAAATATAGACGGATATTATATAATTTTTTTTTGAGGCTCAT CATTTAAAAGCAATTCCTTGGAAATTGGGTGGCTAGGTTTTAATTCAATG ATGGGTCCAAAAGTATGACTAACTGTTGTTTGATATTTCCCTTTCGCCAT GAGTCTTGGTCCAATATGACGTATTTCAAGTACAATTCCAATTCAAGTAA GACTCGAGTCCGAATAATTTCAGACAAGAAGGCAATTTTATCTAAAACGG TGTCTGTTCTGAGAAGGCTACAGACACCGTTTGCATCTCCATCCGGACTG CTTACAACTTCAAGAAGTCCATTAGGGCTGCCAAGATGCCACGCCACCCC TTCCCACGGAGCCAAGAAAAAGCAAAATTCCTGCAGAAAAAATATGGCTA ACTACTGGCCTGTCTCCATTTAGCCCTCATCCAACCCTTACCACAACCTG CTGTATTTTGCAGTTTGAGGTGTCTTGGAGAAATTTTTTTGTGTCACCTA TCATCTAAATTTGGATTCGCTTTGATCTGCCATCATGACAATGTGTTACC CCATGGACACGATCTTCATCCTCAAGAGCGTGAGGAGGCGTGTCGAGGCT GTTATTATATGTGAAGGAAGACATGTAAAATAAAAATTATAGATAGACAT AGTATGCTATCAGTTTGCTACGCATTCTAATAGGGTACATTCTTGTTTTG TATTCTAATATCTTCGACATTGATATCATAGGTGTCTTGAGTGTCTTTTA AGAATCCTCGTTTCTTTAAAACTTGTCTTCTGGCTGCTGCGGCTTCCATT CCTTTCTTCTTCAATACTGATCCTAAAAGACGACTCTAAATTTTTTGTTA AAGTCATAGAAGGTGTATAAAGNAGGTGTCTTGAGTGTCTTTTAAGAATC CTCGTTTCTTTAAAACTTGTCTTCTGGCTGCTGCGGCTTCCATTCCTTTC TTCTTCAATACTGATCTAAAAGACGACTCAATTTTTTMTAAAGTCATAGA AGGTGTATAAAGACCTTCAACAAGTTTTTTAATCGTTTTATCAATGATAT TTTCTGTTTTTCTAACGAGTCAACGCATCCTCGAAGAGATAAACATTCAA TTTCCTACTTGACTTATAAGCTCTACTTGAGTAAAGGAAAGAGGCATGGA GTGGAGAGTGGTCCAAAATGCATTCCGATATTACTTTGAATTCTGCGAGA GTTAAAGCAATAAATACAAAATGTAGAATTTAATCACGATGACACCCCTT GACAGGCATAAAACAAGGTTAGAAGCTTTAGGAATGAATTGAATACGAAT ACTTGGAAACGTATATTCAATGGATTTTATATTTGTCCGTCTCGTATCTA CTAAAAAATTATGTATGGACTTTTTACGTATTGAAATATTTTTTTGGGTC CTTTTTGGATTCCCCATAGGGTTGAGGTTGAGGGTAGGATAGAATTGATG ATTGTATTTTATTTTTCAGGAGTATTGTTTTCTCTTGATTTTTTTTTCCA AAGAGTTTTCTCGAGGAGATGAGGAGGATCTCTTCCCGTGTTTCCTTTTA ATTTTATATTTCTTGCCAGGGACTTTTGGTTTCTTCCGTAATTCCATTGC 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AAATTTTGATTATGAGTTTTAAGTTTTAAAACTTTTGATAACTTTATACT TTGAAAGGCAAGGATGCCTCACTTTTTGAGAGTGAGTTCGTCAAAATTAA TTCTCTGAAAGGATTGGACGTAGACTTGGATTGAATACAGTGGATGRCGK CCTTGAAACTTAATAAACTCATCTACTAGTGAAAATGCTGAAAAAATCCT TCAAAAATATAACTTTAAATCAAGAATGAACCGAGGAGATCCATATAACA TTTCTAATTCGAGAATGAGGAGCTACAAAAAGAAGATTTTACGTATAAGT TTATGGAAGCAACAAAGAAGCAAGACAGAGTTATTCACTACATAAAGTCC GTCTGAGAATCATATTCGTAGTTATATAGTAGTGTCGGGGGTTTCCTTTA CAGGGAAAGTCTTTAGAGACTCACATTCTATTTGTGCAGAATGCAACACA CACAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCAAACCCTTTTTAAAATAGTTTACGAA TTTTGATTAATATCCTGGAATACTTCTGGAACGGGATAAGGTAGAGGATT AGAAGGAGTCCCTCTCTACACGACCTCCTATATGTACAGTTTTGAGGAAC CAGTGAAATACTTTGTGTGGCCTCTAGAGTAATTATTCGACTGCAAACAT TGATCTTCATGGCACGATATAATAATGTTTACCCTTCCACTTAAATTAGA AAGGGGCAGCTCTTAGCGAGTTAGAATTATATAACAACAGGCAATTTTAT CTGTATGGACTTCAACTATTACTCTGTGATATCGTTTCCTTGTTTTTTCT GTTTCTGTTTGTCATTTTTTTCTTTTCCTTTTTTCCCCAAGGGTATTTTT TGTTTCTTATATTATCAGGTTTGCCTCTGTTGTGTTTGTGTGTCTGTCCA TGTATTTTTTATTTGTGTTTATTATTTATCATCTATTCGATGAGCTCTAT 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