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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s98 | supercontig | LSalAtl2s98:1276609..1284121 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012969 >EMLSAP00000012969 ID=EMLSAP00000012969|Name=EMLSAP00000012969|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=185bp
MEVEEREGSSSKSMEHHCNETISQEEQWSNNEDDDDFGDFGDFEEVKDNW
DCAPPPTTSAPLPTSSSNTTLSVQDIIHSLYDGKWKSRTLPSFMDTSTQL
LEPTKVEANASTNNKNSSEEDQTVLPVEFDWKDSCLTDPLENNQDPSSKV
NKNEKTVSIIDSFPLLNFMQSSTLIFPINGCDSKL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s98:1276609..1284121+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012969-708816 ID=EMLSAT00000012969-708816|Name=EMLSAT00000012969|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7513bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s98:1276609..1284121+ (Lepeophtheirus salmonis)
GAAATTTTTATTTCAGTGTATTTTTCCATCTTTTTTTTTGGGGGGGGGCA
CCTATAGCCCCCCTCCTGCGAAGACCTGCTAAATACTTGAATTATGAGGA
AGGAATAGTTGGGGATAGTCGGATAGGTTGTTATTTATTATTTGTGTTGT
TGTAACCAAGATACTTAAGTATTTTGGTTGTAACCTGCTTCGGTCTTGCC
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TTTATATACATATATATAAGAAGGGCTCTTTGAAGTCTGACGTCATCGAA
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AGGTAGAGCTGCAGCAGTAACAGGGAGCAGACTGAATGATTGTCGATAAT
AACACGCCTTAAAACAGCTCTACGTCAGTTTTTTCCCTGCTATCTATCAT
TCACTGTAGCTATAACAGATGGCTATGTGTTGTCAATTAATTAGGGAATT
AAATTGAGTTTATTAAAGCAACAACTATCCCTTGACTATTAGTATTTATT
ATGGAAGTGGAAGAAAGAGAAGGATCCTCCTCCAAGTCCATGGAGCATCA
TTGTAATGAGACCATATCTCAGGAAGAACAATGGTCTAACAATGAGGATG
ATGACGATTTTGGGGATTTTGGTGACTTTGAAGAAGTGAAGGATAATTGG
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TAATACCACACTATCCGTCCAAGATATTATACATTCCGTACGTTGGGAAA
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ATTTAAATCATGAAATAGTAGTTTTCAATTATATGTAATAGTGTGATTCA
ACTCATTATCTCCTAATTCTAATTATATTTATTCTGATCACAATTAAATA
TATTTGAATATAAAATTATAAATTGAATTGATTAAATTCTATTTCGTGTC
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TCATTTGTGTCTTACTGCATGTTTCTTGTCCTTCTATTTAAAATAAATAA
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TCTTCAATTTTCTATTTTTTTAGATGTTTATTTACCAAGAAAACATGAGT
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AGAACCATTTACTACACATCAAGTTTGTATTATGTACAAGTTAGGATTTG
TATATATTAAGCTTGTCAAATAGGTTGTACAATGATTACAACAACGGTCA
TGATCTTCAATTGATGAATTGATGTAATATTCTGTTAAAAATTGTATTAG
AATGTTGGAATTCTGAATAACGTTGTCACAGCATCGAAATTGGGATCAAT
ATTCTGATATTTTTTCAACTAATGTTGTATGAACAAAAAAGTGTACAAGG
GTGTTTGTAGGAATTTTAGGGGATCCAAAGTTTGGTGAAGTGTCTATATA
AAAGATAATTTACACTCAGCAATTTATCATTTATTTTAATTACTCAATCC
GCTGCAAACACCGATTTCAATACCAATTTGGTATACTACCGTTTAAAATC
AGTAACCCGGTACCCCCCATAATACCGAAAAACAATAATAGTTAATCGTG
CAACCTCTAACATTACTGATACAACTGTGGTTACATTGTATTTGTTTTAG
AATTGATTCTAACCAATTAAGTATAAACACATTTCTTAAATCAGTATTAA
AAATTGAAGATAATAAGTTAATTTTCATGATTTTTTTTCTTACTCAAAGG
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TTTCGAAAAATATAACGTTTCTTGACTTGTGCCTTCAATTTTTATGTATT
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TGAAATGATACTCTTAGTTTTTTAATAATAGCTGCTAATTAAATTGACTT
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ATTGCCTTTTAAATGATCAAATACAAATTTTAAAATATTTGCTAATATTT
TTCCAATTTTTTTACTCAATTTAAATTCAATATCAGGGTTATTTGCATTT
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ATTGTGGAGAATTGTTCACTGCACCTTAACTAGAGTTAATTCGAATTCAA
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TAACATTACAACTATATACATGCGTGTTAATTAAAAGACATAAACATCGT
AGATGTTATGACCCCAATAAATATGCAATAACATGCTCTTGTTATTTAGA
TTCGAGTATTATTTTAGGAATATTCCAATTGAAATGAGATGTTGTTTTTA
GACGATTTCCAATGCATACATTTTATGCATACGTCTAACTAAAGTACTTA
GAATTAAATATAGCATTTTAATCGTGTGTTACTTATTTCAAATGTAGTAT
AATAATGTCGTAGTTTKGTCCGACAAATAATATGAGGAAAATAAGAAGAA
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GCTGGGCTAAAGAGTTGGACCATTGTTGGATCGGTCATAGGAATGCTTCC
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GTCTTTTTTCTAATCGACCCCTTCTTTTTCACCATTCATCAGTCATAAGG
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AAAATTTCAACAGCTGAAATGACGTAGTTAAGAACTACGTAGCTTAAACT
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TATTAATCAGGATCGGACTTATAGAACTGCAGTCTTTGAGGGCGATCCAA
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TTGTGCATGAAAAAAGTGATTTAAGATGTGTTTAATTAATTAATTAATTA
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AATTGATTGTACCTACTACCTATTTCAGCTTCTTGAATGCTAATTTTAAC
AATTTTATAGTAATTACTTCTAATGTAGTTTTGGCCTCCTTAAATAAACA
AAATAAAGACATTGATTTGGACAGATAATGCATATTATAGAATATAGTGA
AATAATTTTTTGTACATATGTATATTGTATTAATTCTCGTACATCTGGAA
TTTGTTTTCTAACTCATAATTTTTCTATGATTTTCTTTTCAGATCCATCT
TCGAAGGTTAATAAAAACGAAAAAACAGTCAGCATAATCGACTCATTTCC
CCTATTGAACTTTATGCAATCCTCGACGTTAATTTTTCCTATCAATGGAT
GTGATTCTAAATTATGATAGCCATTAATAACGTCTAATAATGGATAYAKG
ATGATCTCAAAATCTTTCTGATTAAACGGACCTGTGGAGGTTGTGAGGAT
TGGAGGACTATATGTACATAGTACATGCATTTATTACATTATATAAAGAA
CACATTTTCCCGGGCTTATATTCGAATTGACTTCTTGACTAATAACTATT
ACAATAATATCAACGAGCAATCCTTGTCATATAATTTGAAAAATGACCAC
ATTACTATCAAATATTTCTATTACATAGAAGCGAATAAACAATACTATTA
CAATTTTTGACCTCTTTAACATTTAGTTGCGATTTCATCTTCCCTACTTT
TCCCTTTTAAAATTTTAAGAATTTAGCTTTTAGTAGATTACATAGTTTTT
GTTTGTAGATGTATCGATTTTTTTCTCTTTTATTTCATCTTTAGAAAAGT
TACGTGCATACGTGTTACCTACTATTAATTATAATTACATTATAGAATTC
ATTCTTATTACACATATTTATTATTACTAATTAGCAACCAACTGCTTTTA
TTTAAAAAAAAAAACAACCAACAACATGTAGTTGATATTTATTGCGTACC
TATTTCATATCACTTTGATAAAATTTTATTTCATAATATGAATAAAAGTA
TTAAAATATGTAC back to top
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