EMLSAT00000012988, EMLSAT00000012988-708835 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012988
Unique NameEMLSAT00000012988-708835
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s98supercontigLSalAtl2s98:416526..433921 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012988 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012988EMLSAG00000012988-695754Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000058333EMLSAE00000058333-767261Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058334EMLSAE00000058334-767262Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777467auto777467Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012988EMLSAP00000012988Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012988

>EMLSAP00000012988 ID=EMLSAP00000012988|Name=EMLSAP00000012988|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=353bp
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SMKVKSESKTPYSDATQTKKHKTNHIKRPMNAFMVWSQLERRKIIEVTPE
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NNSGSVILHSSANLSSSNISSPSLTTTQQSSSSVMNNNNNSSVNVSVKST
SISNAANHINNLSSHSNANLSQHHIRPFSASGASSSKTYHKTIIKKEAGT
STPNKIRILHTRHTVLPPPNITFNSNFRDIIDDEDDEDSIGNDKFLFFDR
FRSEDSPEPNLLDAWETRSSISSEGSSSSIFDFSGSESLLSDIGISDLDV
PNI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s98:416526..433921-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012988-708835 ID=EMLSAT00000012988-708835|Name=EMLSAT00000012988|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17396bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s98:416526..433921- (Lepeophtheirus salmonis)
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ATTCTTAGGATTTAGAACCTAACGAGATGTCAAAAGTTTGGGACAAATAC ATCTCCAGTATGCATACACATATTAACCTTAATGATCAAAGTTTTTTCCA CCATATAGTTATAGAGGGAGATAAATTCAAGGTCTCCCTGTGTGAGGAAT TAAACTTGTTTCTAGATAATATGATATTGATACACATATTTGTACGCAGT CAATTGAAGTTTAAATATATATATATTTGCTGTTGTTTAATGGAAGATTT ACATAATTCGTTAGTGAATTATTATTAATATGTACATATCTCGCAACCTT TCCTTCTCAAAAAATAGGTCAAACATCATTTGACAGCAATGAGACGGTTC TTCTTTACTCTGATGTTATTCTTGATTTAGAAGTATAAGTTCAACCCATC AACTTTCAGAACACAAATAAATGTTTTAAAAAAGACAGCTGACAAAAGTA CAATTTAATTTTCATATCACTGGGATTTTGTTACATCATGTACCTAGATA GATTAAACTTATGCAACTTCCCTTCAACTATTGATTAATTGAATTTCTTT ACTCAATTCTTAACTTCGATTCTGCTCTAGAGTTGTATTTAAAAATTATC AAAGTAGCGAGTTGAGAGTGTTTGTAGGTTGGACGAAGGTAACTAACTCA ATTTTGGAGGGATGGTTTTTTATATATTATTAAATATAATTATTCTTCAA TAATATGTAGTGGGGATTATTCAGAGCTTACCACCTCTAAGTGTTTATTG GAATTCAACACTTCAATGTTTAGAAAAACAACAATAATATGGGGGAGAGT TGTAGAAAAATCGACASCTGACACAAAAATACAATACATATATCAAATCC TTTCCTTGATCATCACACAACCGCTTTCTCAATGGCTTCTAGACATAACA AAAATAAGAGTGTTCTTTCAAACCAACCCCCTTTGACTCATCTCTCTAGG 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TTACATCTACTATTTTAAGTCATAATAAGTCCTTCTGTTAAGACTTTAAT TCATTTTTTTTTTTTACACTACTCTCTGTATTTATGTACATATATTGTGT TTCGACATACATATTCGTTAATGCTTCCAAGGTCTTTTCCGTCTCTATTC CCTTCCTCTATCGTCTTTATAATTATTATATAGAATTTGTAATCTACATA CTAGGGTTTCTGATTTCCCGGGAAATTGTATTTAAGTGGGATCCCGGGGA TTTTTTTATTTTTTATTACGGGAATATGTTAGTAAATAATATATACTTTA CTGTTGAAGTATTTCTTTTTATATTTAAAGATGAAATAATTAACTTTAAG CATGTCCAAGGACTACTAGAGAGAACGACTAGAGACGGAATTGAGTAATT TGACTGTAGTCAATAGCTGTCTCAATTCTGTCCACAGTTCTTCTCTCTGA TAGTCCTTGGCTAGTCTTATACCTAATATATATTTTTTCATATCTGATTT TCTTAATTTTTATCATTATGTGTAATAGGGATGTGAAAATTGTCGAAATC CTCGTGAGCATGTATTTAAAAAAAAATATATATATTCTGGTCATTTTAAA AGAAAGATATAATTTTCTTTCTGATGTACACTCCCCATGATTTCGACCAT TTTTACATACCCAATAGTACTCAGGTTTTGTTTTTTAGATCCTGTGGGTC CCGTTTTTGTTTTGTTTTTAATTCCTTATAAAAACTTGGTATAAAAACTG AAATAGCAGTTGATAAAAGAGCTAATCTTTGGTGGAGCTAGAGGCTGKAT AATTGTGAAGAGAGGACTTAGTGGATCTACTTGCTCCATGTTCTCACCTT ATTTTAGCGGAGCAGAAAACAGCAGGAAAGTTCTTAATAGCAAGTTCTTC AATGATGAAGTTGTGCTCGATCGAATCAAAAGCTTTCTCAAAATCGAGAC 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