EMLSAT00000013021, EMLSAT00000013021-708868 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000013021
Unique NameEMLSAT00000013021-708868
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s995supercontigLSalAtl2s995:68039..91655 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000013021 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000013021EMLSAG00000013021-695787Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000058515EMLSAE00000058515-767443Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058516EMLSAE00000058516-767444Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058517EMLSAE00000058517-767445Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771253auto771253Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000013021EMLSAP00000013021Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000013021

>EMLSAP00000013021 ID=EMLSAP00000013021|Name=EMLSAP00000013021|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=557bp
MAVDSKIETLESKDIIKKTTRFRHVRLSSVEDFSPGWVNKVIRSFYENNG
VSDPPPIKNYHVELLADGLEFSRSESIESNSTETNEDLQQEDEPGGIYST
LSQSFRLVVEMDLESLKGGGGGVAGVGDAICTGERSPPALMAAKMHNLFV
KVPLAKKAKFERIVKRNRTLSHEVQVYSGFIKDLQKFVKSRVGNIISLNI
PQIYYGSVDEPEGDVLIIQDLSKKGYASRDWFKHRLTHDEVKSAVYELAK
FHACGLAYRMSLNEEIEEKYTYLDDDLYTSNMAKELLAKYLDSYFHFLSV
LPGIQEHVLKLRKISADVFSLLVKLRRPSDPLGKVFNTVCHGDMWMGNLM
YNDNECMLVDFHSCQYLSPATDLAHLLLTSTDRTYRKKYWNEIIQYYYDT
FNRTLAEFGLILRHLGTSYNDFLYEVKRALRGQFLCVAFIIPIVIYCGPG
EWRIEKRRGSSVDRKNTVRHLMQMMSISEESALCHSHPGSPVEETSIPPE
FVDLYNDEPLRNTLIDLIKTAADLDILDFQEFCKHIDTPRPMWTKTQATT
GKHIPVY
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mRNA from alignment at LSalAtl2s995:68039..91655-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000013021-708868 ID=EMLSAT00000013021-708868|Name=EMLSAT00000013021|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23617bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s995:68039..91655- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCCGTTGACTCGAAAATAGAAACCCTTGAGAGCAAAGATATTATTAA AAAAACTACACGATTTCGTCATGTGAGACTCAGCAGTGTGGAAGATTTCT CTCCAGGATGGGTAAATAAAGTCATTCGTTCTTTTTATGAGAACAACGGA GTCTCGGATCCACCGCCAATTAAGAATTATCATGTGGAATTACTTGCTGA TGGGTTAGAGTTCTCTCGGTCTGAAAGTATCGAGAGTAATTCCACAGAGA CAAATGAGGATTTGCAACAGGAGGATGAGCCTGGGTATGTTTTACTTAAA TTTCTTTAGTAGTCATTAGATTACATTATATTACTCAACACCTTATTTAA TTACAACACATATTTAGTCAATGTAATTACCAACTATTCATTGATGTTTT CATTTCATTACAATCAATGTGTATTTGTACGTAAGTTAACTGTGAGCATT TGAATTTGAAAGTGAGCCACAATATATTAAAATAATCCATTTGTAATTTC CATCAAATTAATCAAAAAATTACATCATTAATATATCAAAGCCTACTTTA AACTTTTCATTTATAATAATTATTATTCTCCTTTTTTTGGGTGCTACTTG GATAAGTTACTACTTTTACATAACATAGCATAAGGCGTTTTCACTGACGT CATAAATTGCATCATAATTAAAGGAAACGCCGTCTTGGGGGCTCAAATCT TAGGGGCTTTTACTGCATAAAAAAAAAGTAATTTCCAAAAGATATTGATG AAACTTCATCAAATGGCTTTAAGTATTAAAAAAAAGACTTTACATCTATA TGGAAGACCACTTGATGTTAGTGATCAACACTGATATTTTAATAATAATC TAAGTAATATCTACTGAAAATCCCTATTTTTGTTGGCTTAAGGACAGAAA AAGTGAGACATTTCCTGGAAAGAAAGATGTCCTATTATTTCCATAATAAT CGTTAATTTTTATCTACACTATGGAAATAAGATTGTCTAACGATGTATTA ACATATTTTTAATACATTTGAGCGTCAGATAATATAAAATAAAACTATGC AATTGAGAGATAAAATTTTTGATAGACAGTAAAGTTTAAGCCCTTACTTT TATTGGTCCCTTTTTGATATTTTGACTATTTTCCTTAGTATTGATGAAAA AAGGGTGTTCATTGTTATAAAACTTGGTTGTTTAAGCCCCAAAAATGACC CACATTAACAAGGATGACGTCACATGAAAATATTCTTTATGTAGTCTGGA AATTATGGTGACGATTTACATTATTTGCATTTAGTCTCATTGTGTTATCT TTATAGCACACTTGTCTATCTATACTTAACACTTATTATCATCTATGATT AGTCATGAAATTCAAGAGAATTTGATTTATGTTATAGTCACTACATTTTA GACATAGATATACAATTATTATGTGCTTGCGCTGATATTGAATCAGTATG TATATATTCCGACTATTATTAACAATATGTTTTGTTCCACAAAATATTTC TTGATCTTACTGGAAATTTGAATTTACAATTGTGCATCTCTTGTAAACAT ATAATATTCAATATACTGTCATTCCCTCCGCTCCGCCCCCCCCCCCCCAA TCACACTTATGTAAGTAGAGTTGTAAAAATATGACCTAAAACAAGTGTGA GACTTTTGTTGTTACAGCCGGATCCGCGTTTTTTTTGTTTATTCTCCTAG TATCTAGTAATGACTCCGATATAGATCCTCAATTCTATTCCTAGTCCAAC AAGGACTTTCACTTGTAACTCCGTAACAAATCATCAGTGTTACGGTTCGT CTTTCACGAATCAATGATTGCATTTATACTTATTTTTCTCTCTTCAAGAA TAGTTATAAGAGCTTTGGGAAATAAAAGTCATTCAGACAGACAGCAACTA 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ATTTTTTATAACTCTACTTATAAGTTGTATAGCGTATCTATGAATGACTC CAAATTGTTAAAATATAATTCAAAGTTCAGTAGAGTTCCTTGAATGATTG ACCTATTTTTTTTTTCACCATTGACATTCAGGGACTGTCATATGCATGAA GTGAAAAGTGTGTTTGTTGTCCCTAATGAAACTCTATTTTTCAACATTCC TTTTATATTATTTCGTGCATTCCTTATTCATGATTTGCAGTAGTGAAGGA CAAATTGACTTAAAATGAGTTCATTGTTATTATGAAGTTATTAAAAAAAA CCGCCTTGTAAATCTATTGTGTAGGAATGCATAAAGTCTCCATCTTAGCT CAATATTTGTGTATTTCTCTTCATACCTTATCATTCATAATTGTCTTATG AACTCTTATATATGTAGATAAAGGATTGATATGATATGAAAAATTGATAT GAACAAAAGTTGGCATGAGATAAAAATCAATGTGCCCTGATCAAACTGAA AGAAATATACATAATATTTGCAAGGTGGTGTGACATTCTGTAGCTTGGGG TTTCATATAATTTTTAGATAGCGCCCTCCATGCGAATGACATAAGTATAT TTTATACTAGTAGTAGTACCCGAATTTGCCTGGAGTTTATAGGTGTCGAC GAACAAATCCTCAATGTTACTCTCTACTTTTCATGAGCACACTCATACCT AACTATTCAATACATAGATGATAGATTGTGATGAAAAATAATGTGGTCCT TGGGAATGTTTAAAAAAAAAAGTGAAAATGAACAAAAAAAATTTGCTTGG AGAGCAACTTAGTTCATGACATTTCATTAGCTCATCTGTGTCTAGGGCGG AGGGGAGAAATATATATTCCAAGACATAGATAAGAGTTACTCCGATGTCG ATACTCAATTCTACTATGAGTCTAACAAGGACTTACAATTTTGACTCTGC AACGAATCCTCAAGATAACTCTCCGTATTTTATGAGCACGCACTTATGTT CAATCAAGTTTTGAACATAATTGAATGTAGTTGGAAAGGAAGTTCACTCC TCAGGAGTTGAATAATAACGACAACGGCTGAGAAAAAGAAAATTCATTCT CCCGATTACCAATTTAAAAAATAAAAAAAAACGGGCCAGCTAAAAATTAC ACAGGATTTACAGCAGTAATGATAGATGTTATCTTCTCACTAATAAAAGA ATAAGGTTATGGAAAAGAAAAAAAAAAATATGACGTGATGAGCCATTTAG TGCCCTACCTCGTTGCTAACCCTCATATTAAGTCACATTCTTTTATACGT ATAAAGTATTTCCTGATTATTAAAATATGAGTTGATCTAAACTCCTCCAA GATTTCAGATACCGTCGTTATACAACTTGAACATGTACACTTGTTTTTGT TAATATGACGTGCACCCTCGATTGTATTGTTATTTCTTAGATCTCCACTC AAAAATGACTTACTTTCTGCATAGATACAATACATGGATACATGGATATA TACAGATAGACTTTGCTTAATTAATATAGATAGAAAATGAAATAATATTA TCATTCCGGGAGTTGTATTATTTTGCTGCAAGGTGGTGTCAGTCAATGGC GTTTAGTTTAAAAACTAATGTAAGTAAACAACCACGTCTCGCTTTTTGAA ATCAACAAATATTTTGCGATTAGATTGAGGGCAGACAATAGAATGCCCTC AAATATCAAGCAGCACTTCATGCTTTCAGCTGTTTTCATAAGTTGATTCT TGTATGATTTAAAGCAGTACGTATTATGAGCTCAAAAAAGGTATTATATA GGATTGGATTTTAGATTACTTTATATCAGTCTAGAATTTAAGAATTCTTG TCATTTCATACTTTCTCATTAATCCTAATTGTGATAAAATTATCAATTCA 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ACTACATTAATACTTTGAGATACGAGTGGCACAAAATGTGTAGTTTTTTT TTGTTTTTTTTAGATATAAGTTGGACTCTGAGCAAAAACTTACATTGACA TATGAGTGAGAGTTACTTGAAAGGCGATTTTATAGGAATTTCTTTCCGAA TAAATTGTTTTCCCTTACAAATTCCGTCCAGGAACGAATTTTGCTCGTAT GTCAAGGTATTACTGTATATTCGTTCTTTCTATACTTTTATGAATTCTAT GTATGAATCAGTATCAGTTGAAATTTGTTTAAAAAAAAAATATTTCCCAA ATTAAAAAAAGTTTAAATATAGAAAAATAAGCCAATATTGGTAAAGTTGG GATATACTTAGTCCATTTTTGTTTTTGTTATTTCATGGTGTATTAAACAA TTTTTTTCATTGTGTGGGCTCTATAGAGCCTCTAAAACTATCTCAACACG TCCTTAGGATGTTACTTTAAAGGGGGCGGGGGGCTTGATTTTTTTGTAAA ACTTTTCCTCTGTACCTGAATGGACCAAAGAAAAGCGATCATTTTTTCCT AATATATAAAAAAAARCCTCGATTTGAGGGAGATTTTAGCCAATCCAGCC TACCGTGCTCTTATTTTCCTTACAAAAATGTCAACTCTAGTTGTAATACT GTGGAGGCCCCTTTATCTGTGCCGATAATTTGGTCCAATGCGCGGTCTCA AATTATGGACCCTTATCTTTTTATGAAAAAGGTCATGCGCAACAAATTTT CTCTCTTTTATAATTAAAAAGGAGTGAATTCTTACTAAGACCGACCAATA CCGATTTCTAAAGGCCAAGTTTTTATTATGAGGTTGGCCCACYCCATAGG TGATACTAAGAATTTTATAATTTACCTAGATTTCCATCTAAAAACCCCAA GAATCAACATTGAAATCCCAAGAAAATAATAATAGCGTACAGAATATCAA TACAATTTTTTCACTTTGGATCAGTCATATATGTATTTCATATTCTTCTT CKCCTTCGATAATATCTGCCGATAATTGTATGAAATCATTTGATTTATGC GTTGAAAGCCTAACTTTGTATTGTTGATGGAATTCCCCTGTTTCGTTATT AAGGCTATAGGAGGCTGGCAATTCGAATATGTTCGACTGTTCTTAATACT TTATATTGTATAACAGTACTTAAAATCAGACGAAAAACGAACGAGTTGAA AACGAATAAACGAGCAGTAAATTATTAACGCTTTAGATCAACAAATTTTG AAGATATAATTAATATAATCAAACGAACGAAATCAATTATCGTTGCATGT ATAATTAAAATAAATAGATTTCAAAATTTTGATTGAAATAATCCCTAATT TAACATCGATATCCCAAGATTTTTGGATAAATCCGAAGTATGGCATCTCT GGTCCACACAGAACTTGTTGAACAAAATGATAAAGGCTTCAGGCCGGMCT AGTATTTCTGCACCGAACCCAACACTAATATTTATTCAGATAATTGACTT TTCGACCCTGCTTTATCGATTTTATTAATTCTTTGCAAATGATCCCATTG TGATTTTGTGCTACATGCATTTATTGTTGCATATTCATGGTACATCAATT TATTTGAGAGCAAGCGAGCAATTAAATAGTCACTTTAGATCAATATGTAC TCATCACTTGTCTCCAATAATGCATTGAATCTCTCTTCAATTGTTGCTGT CTTGTTAACGGCTTRAACACTTTATATAAAAAAAAATAGTTATTTCACAT TTTCCATATATTTTTTATTACTTAAATTAAATTTGCATAACTTTCCTAAG AATGTTGATCTTTTACACTTTATCCAAAAAAATATCTTTTATCATATTCA TACTATCTTATAATATAATACATACCTATATAAGTCAATAGATTAGGTAA AATCTTGCATAAGCTATCATTATTAATATTTATATCTATTGTCATATATT AACTTTAATTAGTTCGCAATAAGGATTTAATAACATAATCAGCAGAGATA ATCAGCTACTTGCAATTATAAATAAAACTAAGTGCATTTTATATATGTCT TACTAGAATTATTGGATTTTTTTAAATCCAGGTAGTGCTCTGGTATTTAT TAGGAAGGAAGAAAGAAAGGTTTAGAAACTCTGTTTTTATTTAATACCGA TATTTAATGAATGAAAAGTATAATGTTGACAACCATAGGTATATAACTAT AAGTTTTTAACTTTCACAAGTTGTACAGGAATATTCATGTATTTACAGTA TATACGTATATTTAAACTCTTAATAACCTCCAACTGTATCTTTGAGCCCT ACTCACATATATTATCTGAGCATCTCGCTGTCACAAACAAGGTTATTTCT TGTGGGAATGTACATATTTTCTGTTCTTTATGTGTATTCCTTCTTTAAAA CATTTATATGCGCAATAGCTTTCTTAGTTTAGTGAGAATAATCATACAGG AATTCTATTTTTAATCTCTGCTCAGAATTGCAATGGAAAAAGAACAATTA CATCTTCCAATGCGATATACTTTTTTTTGTTAGTCTAATCTATTACTGTT ATCCTCAACAAAGTCTAAGGATATTATTAAATGAAGTCATGATATGAAAA GACCGAGAGAGAGAAAAAGATAAATTACACAAAGTTATGAGATTCGCTAT CAAAAATAGTAAGTCATATATACATGACCCTGCATGACTACATATCATAT AACAAGCTCAATTTTCAGTCATTGTTGGCAAACGAGGTTAGTGTTGTGTG AGTCCTTACTTATTCGGTCCAGTCCAGTCTTACAATCGGTCCTATCAGTC CATGGTAGCTAGCAATCCTTAATACTGTCAGTACTAGAACTGATTAAATA 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AATCAACTATTATTTTTTTCTTAGAATACTTCTATCAAATATTCTTATCC GCTTGATGGTGTAGTATACAAATTTATTGTCTATTTTGGATATTAAAATT ATATTGGTGCCTAAAAAATAAGAAATAAAAAAAATATTTACCAAAAAATT GAAGATCACAAATTTTAAAAGAAGAATTCAATTATTTATTTTATCCTTGA AAGGCCAGTCCCTCTTCCATTTCAAAATCTAAGTATAACTCCTANNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNCTTTGTAATAAATATATTGTTAGTTTTTTATATTT TGCGTAGTTTTTACACACATATTTACATATGTGTGTAAAATAATCCATGA AATTATTTATTTTTTTTAAATAAAACTACATAGACTAAGGATAATGTTTC CATGTTTTGTATTTTTATAGTTTCGAATCTTTAAACTGATCTCATTTTTT ACATTTGTAATCTACACATTTTGTAGACGTATTATGTACATACTTTTATA ACATATCATATTCAAGGTAAAAGCTTTTGTTATGGCAATAATGTGGTTAT GATTTAAAATTTATATTAGTAGGGAAGACCAGGGGAGTTTAACTTTTTTT TTTTTGGTTCCCGATTATGAGGGCACAAGTTACATAGAAAAAGTATACGT TATCTGACAAGCTAGATGTTTTATGCAAAAACTCTTCAAACCCCCTCAAA ACAAAATTATTGACAATTGGCCAGAGAGCAAGAAGGGAGGAGGCAAAGAA TGGTGGCCTTTTCCCATTCCCACGTGAGCAAAAAGAGGAACATAGTGAAG GCCTGGGGGGATGCCAATTATGCTGGTATCTCTTATGTGTGGTAACAGGA CGGTGTCCCTGGACAGAAGAACAAGGATACCTAAGATTGGGTAACAGAGA ATCTCCAGGWTTTCTGGCCAGCATCAATKTAGCCTCTATCCTCACCAGAT 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