EMLSAT00000013029, EMLSAT00000013029-708876 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000013029
Unique NameEMLSAT00000013029-708876
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s999supercontigLSalAtl2s999:61196..94625 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000013029 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000013029EMLSAG00000013029-695795Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000058538EMLSAE00000058538-767466Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058539EMLSAE00000058539-767467Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058540EMLSAE00000058540-767468Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058541EMLSAE00000058541-767469Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058542EMLSAE00000058542-767470Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058543EMLSAE00000058543-767471Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058544EMLSAE00000058544-767472Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771023auto771023Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000013029EMLSAP00000013029Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000013029

>EMLSAP00000013029 ID=EMLSAP00000013029|Name=EMLSAP00000013029|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=342bp
MNITKSNSMKLGYAGGGGESEGQTFVVHKDTNGYGLTLFGYRPVFVQTVK
AKGAADRAGIKERDIILQVNGINVTESSHDEVVDIIKGDKYVALTISRMK
NESHSQLSSCSTSSTTLPHYVPSSILSHSNTSIVTAPQPPNSEAVRILTD
EKYHTIQLMAEQERRNVDGLRQNLVTLQPESDESLKKQEELELALRRLIK
LEEQLEQMREKVQTPNRTVPRPSSSSDIPPPLPARNKNMTSPSLSSSSSV
PPPPTLPPRQVRTLPPLPPPIKPSTSFNFSRIESQQQHPPCKSPTMSNLS
DPPDSPRYETPPGTPPPPYALKGFSTTEKSPGGTTHFQSGFK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s999:61196..94625-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000013029-708876 ID=EMLSAT00000013029-708876|Name=EMLSAT00000013029|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=33430bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s999:61196..94625- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATATCACAAAATCTAATTCCATGAAACTGGGCTATGCTGGAGGAGG AGGAGAGAGGTGAGTGGATGTCAGAATCAGAATGGAACACGACGACTTCT TCCAAGTCCTTCCCTCAGTTACTTATCAGTTATCTCATTCCACCTTCTTT CTTTATTCCAGTGAAGGACAGACGTTTGTGGTGCATAAGGATACGAACGG ATATGGGCTGACCCTTTTTGGATATCGACCTGTATTTGTTCAAACCGTGA AGGCCAAAGGGGCAGCTGATCGAGCGGGTATCAAAGAAAGGGACATCATA CTTCAAGTCAATGGCATCAATGTGACTGAGTCCTCTCACGATGAAGTTGT TGATATTATTAAAGGTCTGAGCGCTTTCCTCTAAGGGTCCTTTATCACCT CCCATTTTCCTTTTAGGTGTCTTAACATCCTCTCAAATCACACACAGACA CACATCCCTGTCCCTTTCTTTTCTTTACATCAACTGAATTCCTTCTCCTA GAGTGTCTCAAATAAACACATGAAATCTTGAGTCAAATATTGAAAAACAA AATAGAAAGCTCGTTCCGTTTTCATACGTTTCCTTACACGACATTTAAAA AAATATATATAGTGTCTTCATAGCTAACTACCCTCTCCCTTCCACTTGCT CCACTTTGAACCAAAATAGTGCATTTCTACATCAAACTCCATGTATACAA AATCATTTATCATGAAATTTAGCAATATATACATGAATTGTTCACTCAAA TACATTCTGTGATAAGATGTTGTGCTTTGTGAACCCAAGGTCAAGAATTC AAAATAAGAATTCTTATATTTGAAACTAGAGTGACATAAAGTCATTCAAT CATGATACAATACAGCGTTTGATTATAACTATTATTATAATAATGAAAAT CTATAGTATGAGGGGAGGATTAGATTATGTCCTCCTCAGATTAGTTAAAT ATCAATTAAAGAATAACTCAAGTTTCTCTGTATGATGTAATGCTACATTT TTATAGTATGTGAATGATGATTATTCTTTTTTTATTGGGTAAGCAGGCAA AAATAAATTGGGAGTATTAAGTTGATCTCAATATGTGCTGCTTATCACTC ATTCCTTTCTGAATATAATTGTTATTTTCAATGAAATGTTTAAGAGCATA TTATGAGCCTACCGGACTTAACCATTGTGTTAGTCGTTTTTTTAGTCAAT TATTTTTTAAACATTTATTCGTCACATGCAGTTGATATTATCTAAGTCAT AAATATTAAAAGAGCTATAATTGACTCTGTGTTTAATAATTCATAGGTGT AAACATTACCCCTATACATAAATTATATTGAAATGAGTTCCCCTTATTTT TATTTTCAACACAAATTCTTGAAAAGGGGAATGGGTATGTGTGAAAATAT ACTCTTATAAGTAGTAAAGAAGAAGAAAAATGAAATTAATTGTTTTATTT ACTTTTCTTTTTTTGACAAGTGAACCCTCATGATTTACAAATAATTATTT AATTAAGTACTAGTGAGTATATTGTTAATTCACTTAAAATAAAGCACGAA GAAAGATGAAACMCCTTGTTTTSCTGCCTATAGCAACCGCGCCCAATTTT TTTCCCATAYGCAAACAATCTGTGCAAAWAACACCCCCCCCCCCCCATTC ATTGAAGTTAAGGAGTAATAGGTTTTGCATTCTTTTATATTACTTTTACC TTTAAAAAATAATGTTGCTACTACTTCTTAATGCGTAATAATATAAATAT TAATCTTAAACATGAACGTTGGTTCTTTTTCTGAAAATTAGTATAAACAG GAATGATTCAGTGTGTTAAATATGTTACATAATAAATATGCTGCAAAAAC TCTTCCATTTTGTTGGTCAGAATTTGTTTTGTTTTTATAAAAAAAGTTAC TTTATACACATATACCCAGATGCATATATATGCTTAATTTACTATTAATG TTATATACTTAAATTTGATTAAGGAAACTCTTACACCACGGTTGTTGTTC AAAAAGTATTTATATACAGGAACGATTCATTATGAATGCTTCTCTATGGT TGTTGTCCATGTTTACGCACTCCTTCATTTGATAATACAATCAGCTTTTA TAAAAAGAGACATGAAGGGATATTTTTCTAAAGAAGGGATTGGTGTTATA ATAAAAACAAGCAAATATATGTAATAATAAAGGGTTCTTGTGGTGGTAAT ACCCTTTATATTAAACGAGGATGGATGTAATTGTAATATCTGGTAATTTA ACTCAAAAACAATCTTAAACAAAAATCTAGAAAAGGAAAATGCCCAATTT ATTTTTTTACCTCATATATAAGTAATATATATATAGAAATATTTTGGTCT ATTATAGGCTCTGTATWCRAAKTTMTASGATAAATTGAGATCCCCAGGGA TAATAACTAAAGTTTAAAGCCTTCATTTGATAAATTAAACTTAATTTAGT CCTCAAATGACCTTTTCAAATAATATTCATTAATTATTTCATTGTGAAAA TAATTTTTTCTACTTTAAGTGCAATTTTCGGGGCCCCCAAAGAAAATAAT TAATTTATAGAAATCAACAACAATTTGTGCAAGAATTAAAATATAATTCA GACTCAATTTTGGGGAAAATCATTGTAGCTTGCTTTTGTATTGACAGGTC ACATGTTCCTTCTATTTATACAATTAATTACATTTCTGGAATGTGTTTTT AAATTTATATACTATTGCCGCTTCTAAACATATAATTTTTCTTGTATTTG ATCGTTGACAATCTCTCACATTGGTTCATTCAATGCATTAGGTTTTCTCG TTTCCTTGGAAACAAATTTTTCAATTGCGAGATCCCGTTAGTAAATAACA AATACTGTTAAACTTAAGTACTCTTTAAGAAGAAATAATAAATTTAAAAA AAGTCTGAACAAAATCAGTAATAGTGAATAGGTTGTTTTTTAGAGACCGC GGGTCTWGCTTTTTTGTACTTTCTTAACCCGATCCGACCYACACACANNN NCACACACAACAAAAAAAAAAAATAGTGATGAATGAGCTAATTTTTGGTG TATTATATATAATTAATGAGGGATTTCCCGGGAGTATCCTGTAGGTGAAA AATCCCAGGGTAACGGGATACCGAGAGAGAACCCTTACCATGTATTGAAT GACGCCTTTGATTCAAAAGAACTAACCAATATAAAACTAATGTTGTGCCT TTAACTCCTCAGTAGGACCATCTACATACAAACTCAAAAAATAAGATAGA TAAATACCAAGAAACATTAAAAAATATGAAATTGGATATAAATATATATT AGCATCCTTGCTTCTTTATATAGATACTTTAACTTATATCAGTATGTCTT AAAATAATATTTTTTGTAATATGAATTATTTATTTTTTTCATAACATAAT AATAATGTTAATAGATTTTCTTTATGCCATAACAAAGGTAAGAGGAAAAA GTAAATAAACAGCAATAATATATGCATTTCTTTATCGCAAATAGGGGACA CATGACCAGAAAAGTAAAATACTTGTACAAAGTCGCCAGAAGTAGAAAGT ACAAATATTTCCTAGTATAGAAGTGGTCTTAATTCTTCAATTAAACACAA TTTTTCCAACATTTATTATTTTCTTTCTGTGTGTATGTATGCGTCTTAAC TAACTAGCTAACATAAGTAAGGTCAAAAATAGCGCATTGCCAAAATATTA TTATTTTATTTACTTCTATAAATAAGTAAATCTAATCCAAAGTACATATT TGTTGGTAAAGGACGTATACCATATCTACTACTATCAAAAAAATAATATC ATTAATACTCTCTGATTTACGACTTTCAAAAAAAGAAATCCTGAAGAAAT GAAAAGYACTTTTAGTTATATAAATTTATATGTATGTATTTATACAATTA TAACCCGATGAAATGTTGCCAAAAAGGAACAGTGTGGACACCATTTCGTA GTCTCCTTACTTTGCAATTATATTCACTTTTAAGTGTTAATTAGATTTTT CTATTCGTAATAATATATTAGTAACAGAGTGCTTGGAGTGTGTTTCATAT TTAAAGCTTATAATAACTAAAATTTTATATATTATTATATCTGATAATTA TTGAAGTAATAATATTTTTTTAAACTCGTCAAACGAGTTATATTCAAACG TAGGAAATGTTTAATTTTTTTTCTCTATCTTAGCCCCCTGTATTTACCAA GCTACTTGATAACAAAGGTGTGCTAATAATAATAATAAGTATAGGACTCC TGGAATTTATTGGAAACATGAATTCGCATATTTCCACTAACTTTTATTCG CTACTGCTAAACAGCTACATAGCTAAAATTATTTCATAGTAGTGTTAGAT TGGAGTCAAATTTTGAAAGTTCGATTGAGTTCGCGTTACGGCAATATACC AATTTTCGAGTTCGACTTTTGGAGAATTTTCGCATAGATATGTAAAATGC TGGTTTCTCTTTTTTTTAATACATCAGCTCTTCTTTTAATAAGAAAGGAG TGTATATACATAGTTTGGTATCTGTCCTTATTTAGGACTACAGTCTCGTC CAGTTCAATCTCGGCCCGGTCCAGTTCAGTCCTACATATCAGTTCTAAAA CTCGGTCATTGATGACGTCACTCAACTTTTTTTTTTATCTGTTCTAGTAC TGAAAGTCCGAAGGTTTGATCCCAGGGACGTATAGGGACGGTCCTAAGAC TGGACTGAAGTGAATAAATTAGGACTGACAACAATATATGTACATAGTTT TTTACTGTCATTCTGAGTTGTGGTACTAGAAATTGTACTAATCATGACTT CGTATGTTTCATTTCGAACTAGCTCAATTAAAAGCGRCCTTCCTCCCCCC CCCCCCCTATAAATAGAATAAATACATATTTTGTGCAAGTTCGAGTAATT TTCAGAAAATTGTCAACTTAAGTAAAGTCGAGATTTGTTCGAKTATCCAA TACTACTTCTTAGTGATATTCTTAATTGTCCGATACAAACACATAATTTC TTCCTTCCTTACTATAGTATACGATGTCTTGTATATTTCTATGGCTCCSA TGCTCAATATTCTCGGGCTWCTCTCTGAAAATATTAATCATTTTTACTCC CCTCTCAAATGAATCATTTTGTTACCAATGACTATTTTTGAAATAAGGTT GTTATTTTGATTCTTTTTTTTTTTCATTTTAGGTGATAAGTATGTAGCTC TCACGATATCTAGAATGAAAAATGAATCTCACTCGCAACTCTCATCATGT TCAACCTCTTCAACTACCTTACCTCACTATGTACCATCTTCTATTTTGTC TCATTCAAATACGTCTATTGTCACAGCTCCACAACCACCTAACGTAAGTA CTTTTTTAAATTATCAAGTACTTCAAATTAAGTGTTTGCATAACTTAAAA TAAGAAATATATAAATAATAAGGTTTTTGAAATAATTAAAAGTTGTACAT GAAGAAAACTTTATCAAACCGGATGTGATCATTTATTTATACATATTTTA CACACATGAACTTTGTGATTAGAATGATTTTTGAAGTTAATTTATTTCAA ATACTATTTTGTGTACATAATCAACATACTGAATAACAACTGTAACCCTT TCGTTGTTTATAATGTGTTTTCTTTGGTCTTAAATACTTCAGAGCGAAGC TGTTCGAATATTGACTGATGAAAAGTATCACACGATACAATTAATGGCTG 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TTATAATGTTAGGTATTCATTTTATGAAAAATTAAATTGCCTATCTCTCT TCCTGCTATGATTATCTTTTTTCCCCTTCAAAAATATAAATGGTGATAGA AATCAATCAATCAATCGGTGAAGTGAAATGTTGCAGAGAATAGTAGATTA TATATATACGCCTTTCCAATTATTAATGTGTACTTCTTGATCGATAACAC ATATTCGACGTCGCTTTTTTTATACATCCTATGAAAAGACCTATAATCAA ATGTATGAATTTAATTGGCACGTCAACAATTTTCTATAAATATTCACTGG AGACCATGTAATTTTTTTTTGTTTTTTGAGTGTTTTTATTGGTTCATTCC TCTTTTTCTGTTGTTCCAATCTTTTTGGTCGCCAATATGTTAAAGATTTG TGTATATAGAACAAATATTACTTACATTAAAAAAAGATGAGGACCTGATA GAAAATGAAATCTAAATTAAAGATGTGAACTCAAAGAAAGTAATTTTTCA AAATCTTTAGATCAATTGGGGTGTGATTTAATTAGAAGGTGTGAATATCT GTGATTAACTATCTATTTTGTGATCATGAAAGATKGATACGTTTGATTAT GATTTTGCATGATGTGTTTCCATTCATAAATCCTTACTTCTCGTTGACTT TTTTTAACTATTTATAAAATGAGACTCGATCCTTTTCGTATTTTCAAATC ATAATTAACTTTGTGCACTGTTAACTATTTAGATATATTAGTATACCTCT TTGATTTGCTTGACCTGACCACTTTTGTCCATGCACATTTATAGGTTCAG ACTCCTAATAGGACGGTTCCTAGGCCATCTTCCAGCTCTGACATACCGCC GCCACTTCCAGCTCGCAATAAAAATATGACTTCTCCCTCCCTATCGTCCT CATCTTCTGTTCCTCCTCCCCCAACACTTCCTCCTCGACAAGTTCGAACA 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ATATTGATAATTTGAACAAAGGCTCGGTCCAGAGTGGAAGTATAGCAAGT GTACTTTATTGCACTAGGACATCTACTCCCTAGGTAATGTCTTTTTACTC ATAGACATGATATCCCCTTGGACAATTAACACCTCCCTCCTGCCCCTCTC CCCAATTCCCATATGAGTCTATTATTTCTAGTTAAATGAAAGTAGTTATT CAAATATTAGTTGAGAAAAAGGATTTATAATAAAAATTAAATGGCTCTGT GTATAATTTATCATTCACACAGAATAAATATAATATTTATGGTCAAAAAA TTTTGATATTTAAAGTTTTAACATGGTGGTCCTTGAAGATTTTGATATTT TCTTTGGTAAATTTTAGAACCACTCTCCTGGGGAATATATTNNNNNNNNG TGGGGTAGGGAAAGTATTTGTACTATATAGGGTTCCGTCAGATTATCAAA AAAAGTTCTGGAAAGTCATTGAACCGAATATCCAGGATTAAATCATTAGT CATTAATCACTGTACCATGTTGTATTATTGTTTCCAGACCCAATTTACCC TACATCTTTAGACTAGTGGGCTGTCATTCTTCTTTCTTATTTTTTATTTA AAAAAAAGAATTTTGAAAGGAATAGAATGTTTTAGTCAAATGAAATGGGT TCTGTCACAATAATGTGAATTTTACTGCATATTTATCTCGTGAATATTTC GTGAAAGCCATATTTTCCATTGTCTTTTTATAGTCATGATAATTGTTCTC ATCTTTTTCTACGTCTTGCTCTTTCTTTACTTTCCTTGACACTTAAATTC CAAAAATAGACTTAAAATATATATAAAATATGAAACTTTATTTATTCACA CAATTACTACAACCATCAAAAACGTAGACTGTTACTTAGAAAACTCATTA AGACTGGAGTTTTATATAATGTCATATTCATATAAGTACTTTGTATATGT 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