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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s9 | supercontig | LSalAtl2s9:868318..874523 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000013076 >EMLSAP00000013076 ID=EMLSAP00000013076|Name=EMLSAP00000013076|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=275bp
MSKIGGGTAGSTLAGRLSEKKDLRILLVESGGEQSIKLKIPWFHSLLYGS
PHSWHYLSEDQEHNQALLGYDGKKSIWWRGRVIGGTGAINTMIYMRGNRH
DYDHWALLGNEGWSFSDVLPFFRKLENVKGTDLEKDVQFHGTEGPMKIEY
GSQVTPLQKGFLNAGKLLGYPISDPNSYNQFGFSKILFTIKDGQRWTSSD
AYLHPENPNLKVSINSHVLKIIIKHKKAMGIDMIKNGKIHRIYAKKEDPY
HPLLELKGMHLFIQNMGIVRGLIYK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s9:868318..874523+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000013076-708923 ID=EMLSAT00000013076-708923|Name=EMLSAT00000013076|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=6206bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s9:868318..874523+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTCAAAAAGTAATATTTTTTACTTAACTACATAAGGCAAATAATAAGA
TATTTAATTGGAGTGTCTGATAGATGTCATGTGTTGGTGTTACCATAGAC
AACCATTATCCATCGTTGTTAGTTGTTACTATAAAAAATCAATATCAGCA
ACTCCTCTAACTAAGCTTTATTTTTTAGGGGTAATTCATAATTATTGTTA
AAAATAAAGGATATGAGACAAACACAAATTGAAGAGATGAGACTGAAATT
TGTGTTAGATTGAAAATTTAAGTAATCTTGTTATAATTTACTTATAATGT
AAGTAATGATGTAACAAACTTACTTTTCAATTAAATAATCCTATGGTATA
AGTATTATGTAATATTTCCCAACATTGCCTGCGATTACAATTAAATAATA
TTTATTTAATGACTAATATGTCCTTTCCCGTTTTGGGGTGGATATTTTTT
ACCCACTGTACTACTACAGACATGTAAACAAGTGACTTTGATGAAGTTAA
AGTGCTCTAAAGCCATTTTAATTTGAGAAGAACGATTTTGGGGCTTAACA
TCCTCTCGTATCGTCCCAAACATGAAGATATGCGTCAAAAATAGTAAATT
GTATATATTTTAGAATTTTATTTATTAATAAAAAAAACCACTGTACTTAA
TAATTTAAGATTTGCTCAATGATTGGGGGTTTCCCTGTTGTGTTTTATCA
AACACAACAGCGCTAAATTCAACCCTAATTGAAATTATTGCTGTTGAACA
AAGAGGGTAAACATTGTCTTTCAAATCTTATAAGTACAATTTTTGACTAG
TAGCATCATCTTATTAGGGACGATACAAGAGGATAAAAATAGAGATGCAC
TGATACTAAAATTTCAGCCGACTCTGATTCCGATGCTATTTGTATGGAAT
ACGATACGGAATACGATACAATATTATATATAAAGACAGTACATAAATAA
ATAATAAAAGGACTTACTTTTTTATTTTTTATAGATTGGGGTTAAGTCAA
GAAAATACATCCATATTTCAGTCATAATTATGATTATAAATATTTATTAA
TAATTTTTAATAAATACTTACAAATGTCAATTAATTCCTGGTTGTCTAAT
ATATCATAATTCAAATAGTCTTTCACTTATGATAAGTATTTACAAGTAAT
TTCCCAGCAACTCTTTGTTCTATTTTTATTTAATTTAATTCTGACACCCT
TATAGAAGCAGTCTTAGAAAACAAAATCAAGTACATTGAGAGAGGTATTT
GCAGGGCTCTCAAGTGTTAATTTCATCTATATTTGAATTATAATAGTCTA
TTATACATCTTTCAAGTACTCTAATGTTATTGATCAATCGTGGCCTCAAA
TTTTGACAAAGTGTGCATTTTTTATTGTCCACCCTCCCCCAACCTAAAAA
ACATATATATATATATATATATAAATATTTATATTAACACGTCTACAGTC
TAATTGTACTAATTGTCTAATCGGCATTGTAATATTCGATACATAAGGTG
TGTGTCAGGACTGCGAACTAACATGACATTATTTTTGCCTGTAAAAGTGT
GGATTTTATTAAAAAGATTATAAATGGAAAAAAAAAACTTCTACAAGGAA
ATTCAGACTGTATTTCTTAAAAATGAATGTTAATTGAAGGGGCTAACAAG
TTGCATTAAATGGTGCTACAATTCGAAATTAATTTTCCAGATAAAAGATT
AATCATCTCTCTTACCTGTAAATAGTTGCTATTTTATGATCAACATGATC
AGTGTACAACATTTTTTTGGTATATTTTCAAAAATGTATTTGCTTGGACG
ATTATATACAATACTCATTTTTCATCCACATTCAACAATGTCGTTACAAA
GGATTTAAGCAATACTTATGACTTTATTATAGGTATGCGATTAATTATGT
TATATATGTATAATGCATATTTTGTTATTGATTTCTTTAGTCGGAGGTGG
GACTGCAGGATCAACATTGGCTGGRAGGCTATCTGAGAAAAAGGACCTTA
GAATTTTACTCGTGGAATCTGGAGGKGAACAATCCATCAAATTGAAAATT
CCATGGTTCCATTCTTTACTCTATGGATCACCTCACTCATGGCATTATCT
AAGTGAGGATCAAGAACATAATCAAGCTCTTCTGGGATATGATGGAAAAG
TTAGTCTGGTGCATATTTTAGCGAATTAATTCATGTTTATTTTCTATTCC
CTAGAAGTCAATTTGGTGGCGTGGGAGAGTTATCGGAGGAACAGGAGCAA
TCAACACCATGATTTATATGCGAGGAAATAGACATGACTATGATCATTGG
GCATTATTGGGCAATGAAGGATGGTCATTTTCGGACGTTCTTCCTTTCTT
TAGGAAGCTGGAGAACGTTAAGGGAACAGACCTAGAAAAAGATGGTAACT
TGAACATGATTTATAGTCCTTTTTTGAAATATTATATTTTCTTAACTATA
TTTTCAGTACAATTTCATGGAACTGAAGGTCCAATGAAAATTGAGTATGG
TTCTCAAGTAACCCCTCTCCAAAAAGGATTTCTAAATGCAGGAAAGCTAT
TAGGATATCCCATCTCCGATCCGAACTCTTACAATCAATTTGGATTTTCA
AAAATATTATTTACTATAAAGGATGGACAACGTTGGACCTCTTCCGATGC
GTATCTGCATCCAGAGAATCCCAATTTAAAAGTGTCTATTAATTCACATG
TATTGAAAATCATTATTAAACATAAAAAAGCTATGGGAATAGACATGATC
AAAAATGGAAAGATACATCGGATTTATGCCAAGAAAGAGGTCATTCTATC
TGCTGGAGTCCTAGAATCTCCAAGACTACTGATGCTATCCGGAATTGGTC
CTCAAAAGCATCTAGAACGTCACAAGGTATGCATATACATATATAGTACA
CTAGGCTGAATCCTGAGAGGACTCCATTTTCTGGATCATTATGCTTAAAA
TAAGAACGTTTACTATTATGACTTTTCATTTGGTTGTAAGCATTTACATT
CAGTGACTCGCCAATACCTTTTATATAGTAAAAGAACATGGGGTTTGCCT
GTAGTGAAATACAAAGTTACTCATATTTCCTTTATTTGTTGACTGATTAA
TAAAGTTTAAAATTGAGCAAAAACTTAAAATCAAACTAAATTATCATTTT
ATTTTATACGAGAACTTAATCAGACAAACATTTTTAAATCAAAATTTATT
TGTATGTTAGTTATTTAAATTGTAAAAATAACTCTCTGACGAAATTATTT
TATAAAATAACGACTATTCAACTTGAACTAAGGAGTTTTTACACGATTTA
GAATTTTAATTTAGTTAAGAAATAAATAAAACATGAGCACTTCTATATTT
CGTATAAAAATTGGCATATATTTTGTTATAAGCTGTCGATTTTTCTCCTT
ATCAGTATGTTGAGCGTTGATTGGTTGAATTTGAAGGAGCTCTTGTTAAG
CTGTGAACATTTATCAACAATCGTTGTATAGTTATTCCACATTTGGGAAG
AATTCCCCACCAACTACCAACTGAGTTTGCGTCAATTTTTTTATGTTCTT
TTATGGAGGAAAGGTTACGAGATAATTATGACGATGTGTTCGCTCCATAC
AATCCTCGTTTAGATGAATCATGCTCTGAAAATACAACTAATTTTTAAGT
ATAATAAATCTTAAAATGGTGTCTTTATCATTTTATTACAATGATGTATT
TTGGGAAATAAATTACTCTAATCACCCTTTGGGTGCGTCGCAAATTACAC
TTTAAATTGTCAAAGTTGAGTGTTACAATAGAAGAAGAATAAATTGATGT
ATTATATTTAAAAGGAGCCATATCGAGACCAATATAAGTCTCTTAAATTA
AATGAAGGTCCTAAACTATAGCCAAAATTCTTGGGTATCTCAACTTCTCC
CACAAATTTGAATACAAAGCCTCTATAACTGGCTCAAATATGTTTATGAC
ATATTTAGCTGTATGTATTATGATGTAAAGCAGTAAATAGGGCTCCCTTT
CGTGATTTTTGTGCACGGTTGTTTTTATGTTGACGTGATGCATATACAGA
CATATAAATCTAATCATTTCATATAGATCAAAGTTAATAAGGATTTACCT
GGTGTTGGACAAAATCTACAAGATCACATCGCTAGCTATGGTCTGATCTG
GCTCACAAAAACTGGGGCTGCCTACAGTCCCTTTCGATACACACTCAGCA
TGTCAACCTATATAAATTGGAAGCTTTATAGTAGAGGTAATATGATTTTA
TTTAATCTTATGTACCTACTTATGTAATTCATTTCCAGGACCCCTATCAT
CCCCTATTGGAGTTGAAGGGAATGCATTTGTTCATACAAAATATGGGAAT
AGTTCGTGGCCTGATTTACAAATGACTTTTTTGTCTGTGCATCCAGGATA
TGATGGAGGGACTTTATATAAGAATTTTCTAGGACTATCAGATGAAGTAT
GTCAGGATTTTATTGCTCGTATCTATATATAATATATAAACTTGTAAATC
GTATGCACTTTGGCTATGTAAAGTAACCGAAACTTAACATGGTAACCTTG
ACAATTTGAAGAATGTTTTGGATGATACCAGCATAGCTCTCATGACTTTT
TATTTAGATCTGCTGCAGGCTCTTGNTTATTGTAGTGTTGTATCGGTCTT
TATTTATTCGGTCCAGTTTAGTCTTAGGGCTGGTCCTTAATCTCAGTCCT
TGGAATTTTCCCTTAACAATGTCGATGGTTTTTTAAGCCAAATAAGATAT
GTATTCAGTACATATCTTGTAAGACATATTTATTACTGATTTTTCTTAGT
CGTATAATTTATTATATTATAAAACAGAATAATAAAAAGGGGGAACCCCT
CAATGACGTCATGAGGGATCCATTTTACCTTCTTTAAGAACCAACGGTTG
AGGCTGGRCTGGATTGGACTGCGGKTCTCAGTCCTAAATAAGGACTGATA
CAGTGCTAGCTTTGAGAATAAAGAAATAAGCATAAATCCCACTCTGTATC
TAGCAAGGACATATAAATGAATTATTCTGATGCCAATCCTCAAATCTACT
CTTAGTCCAACAAAGATTTGCACTAATAACTTCGCATTTAATTATTACTC
TTAGTGTCACTATCGTTCATGAGCACGTAGTTACTTCGCACTTAGATGTT
CTCTCCTAAAGAATTAAAGTAAAATAATTACAGTATCAGAAAATAAGGAA
AACAATTTGTTCAGGTTGTCAACTACAGCAAAACTCGCACACTAAAAAAT
GCTACGGATTTTCAATCCTAATACTATATATTTTGATAAATTAGTTTATC
TTTATTTTTCAATACTTTATTTCCAGATATACTCATCCTACTTTGCGGAT
ACTGCCTTCAAGGAAGGATACACCATTTATCCTATATTAAACCGACCAAA
ATCTCGAGGTTATGTGGAACTCCAATCCTCTAATCCCTTTGATAGTGTAA
AAATTCAGCCCAATTATCTATCAAATAAATCAGATTTACAAACTCTTGTT
GAAGGTATTAATTAGACTCGGGGACGGTTTTAATGTGAGAGGGGCATGGG
GCAAAGATAAATGAGCGTACTCTTTCCCTTCTGTTCTTTTATAAAATTTG
ATTTTTTACAAAAATATTTTACTTATTTAGAATACAAATAGAGTCCTTTT
TTTAAATTAAATTAGACCTACTGAACTTCCTAACTTATATTTAAACAAGA
ATATATTATTCTATTTTTAAAATAACCTTTAAAAAAAAGGTGAATTCTTT
TTATATTTTGATGGTAATGGTTTTATGGTGTGAATATTTAAAGTTAACAA
AATTTATCCAGTACGAGATCCCTGTCAAGAGTGGAGCCTAGAATCAGTGC
CTTTCCCCTAAAACCACCCCTGAATACACAACATAACTTATAGTTTGTCT
TTATCATGTTGGAATGTTTCATCAATTAATTAATTTACTTGTCCTAGGAA
TGAAAATAGCTCGTAAAATAGGTGATAGTCCAGCATTCAAAAAGTATGGC
TCAAAGTTCTATTCGAAGCCTTTTCCACCTTGTTTGAGCTACAAGTATGA
ATCAGATCCCTACTGGGAATGTTGGATTCGTCACTTGGCTACAACTGATC
ACCATCCCGTTGGAACCTGCAAAATGGGGCCCTTACACGATCCTTTAGCT
GTGGTTGATAATGAACTAAGAGTCTATGGAATAGAAGGACTTCGAGTTGT
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