type 4 fimbrial biogenesis protein, maker-scaffold494_size155699-snap-gene-0.19 (gene) Tigriopus kingsejongensis

Overview
Nametype 4 fimbrial biogenesis protein
Unique Namemaker-scaffold494_size155699-snap-gene-0.19
Typegene
OrganismTigriopus kingsejongensis (Tigriopus kingsejongensis)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of type 4 fimbrial biogenesis protein vs. L. salmonis genes
Analysis Date: 2018-04-19 (T. kinsejongensis vs L. Salmonis peptides)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of type 4 fimbrial biogenesis protein vs. SwissProt
Analysis Date: 2018-04-19 (T. kingejongensis peptided Blastp vs. SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of type 4 fimbrial biogenesis protein vs. nr
Analysis Date: 2018-05-15 (T. kingsejongensis proteins Blastp vs. NR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold494_size155699supercontigscaffold494_size155699:37580..46551 +
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
maker2018-02-12 .496401
T. kinsejongensis vs L. Salmonis peptides2018-04-19
T. kingejongensis peptided Blastp vs. SwissProt2018-04-19
T. kingsejongensis proteins Blastp vs. NR2018-05-15
Properties
Property NameValue
Note-
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
maker-scaffold494_size155699-snap-gene-0.19-mRNA-1maker-scaffold494_size155699-snap-gene-0.19-mRNA-1Tigriopus kingsejongensismRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold494_size155699:37580..46551+

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>maker-scaffold494_size155699-snap-gene-0.19 ID=maker-scaffold494_size155699-snap-gene-0.19|Name=type 4 fimbrial biogenesis protein|organism=Tigriopus kingsejongensis|type=gene|length=8972bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold494_size155699:37580..46551+ (Tigriopus kingsejongensis)
ATGCAGCGGCGAAGTGGAACTCGCGGGTCCACTTGGGCAAGACAAGGGAT GCTTCACGTTGCCAGGGAAGAAAGGAGATTCACGAAGGCGTGGTTCTTGG GGATGGCCCACAGGTAAGGGGATTTGGGCCAGAATGCCCTCCATCCATCC ACGGGGGCGTGGATAAAGACCCAGCAGGGTACACATTTGGTCGGGCTAAA CACGGAGTTTAACGCAAAGAGACACCGAACACTGTCCCTCGTCACTCCAC CACTAATAAGGTAGAGGACGAGGGATAGCTATTCAAGGAGTAGGACACCT CCTAACCTCCTCGACACCTCCTAACTCGGCGAAAGGCAGACGTCGAGTAT GCCAATACATCCACTTGCCACACTTATAAATCCTAATGGAACAGTTGTAA CTGCACCAAATCCTGTGTCTAAGCTACCTGCAGCGCAATTTTGCAGATAT CACACTGATGATGAATTACAGTACATTCAAGTTGAGTTGTAAGGTTTTAT GAAGTATTTTATATTTTTGGTAAAGTGTTTCATAATGTCTCTTTTCCTAA TTAAGTTCCTTCAAAATATCATTTGTTCGATTTAGGCGATAAATTAAATC TAAATCAGTTTTTGTGTTGTTTTTATTTTCTAATAATGGCTATAGCGCTT GCGCGGTGTAGCTTGGTGCAGAAGCCTTTAACATATAGGTTTCTTCTTTT TCAAGTGCCATTTTACGTTTATAACTATTGTGTTTAACTAATGTTGTGAA AAAATCTGCCTGCCGCCGCATATTCAAACAGTTTAAATACAATTAAGTAC AACTTATGTACAAACATATGCAACTTGTATACACCCCGATTAAATTCATA TAAAAGTTTTATTCATTTAAATAAAATTTCCTTACTTTGTTTTACATTTT GTAACAAAGTTTCTCAAATAAATAAAATGCTAGCCTGAAATTGTGAAATT 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CGTCTTTTTTCCTTGGGGAAATCGAAGCCGAAGAGGCCAAGAAAAGGTGC AAGGTGGAAGAGGTCGCAGAGATGGATGCCAAGATCAAAAAAATGCGCGA GGACTACAAGCGCATGTGCCAGTTCGACGAACAGCTCAAGACACTGCAGA ATAACCTCTGGAAAACCAGACTGTCACCCATGGATGCGACGAATGCAGTC CAGAAATGCTTTCAAGATGCCAAAGAGTAGACTGGGGACACCAAAAATGA TTGGTTTAGGAAGTTTAGCGTCGGCTCCTTCGCTCTTATTGGTGAGATCG TGGAGCATTTCAAAGCCCATGACGCAGAGTAATAGCCAAGCATTTTCAGA TTCCCCCGTTCTCTTTGCCGTCCTGTACATGTGCAAATAAAATGCTTAAA TAAACGTCTTTTTGTACAACCA
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Synonyms
The feature 'type 4 fimbrial biogenesis protein' has the following synonyms
Synonym
Tk10271
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