EMLSAT00000000251, EMLSAT00000000251-696098 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000251
Unique NameEMLSAT00000000251-696098
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1037supercontigLSalAtl2s1037:112468..132413 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000251 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000251EMLSAG00000000251-683017Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000001145EMLSAE00000001145-710073Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001146EMLSAE00000001146-710074Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001147EMLSAE00000001147-710075Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001148EMLSAE00000001148-710076Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001149EMLSAE00000001149-710077Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001150EMLSAE00000001150-710078Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001151EMLSAE00000001151-710079Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001152EMLSAE00000001152-710080Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001153EMLSAE00000001153-710081Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001154EMLSAE00000001154-710082Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001155EMLSAE00000001155-710083Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772458auto772458Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000251EMLSAP00000000251Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000251

>EMLSAP00000000251 ID=EMLSAP00000000251|Name=EMLSAP00000000251|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=760bp
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GTVAKYTCDRGFELLGPTRRLCGENGTWIPQGIPFCVLNVAAGKAPMQXS
VANGGXPQKAIDGSTSKFFDASTCTKTEVERSPWWYVNLLEPYMVQLVRV
XFGESCCENDTPATIVIRVGNNRPDLGINPVCNRFIGKIEEGRPLFLPCN
PPMPGAFVSLHFESPIGVSFSICETFVYTDQALPIERCPSFRDQPPGSTA
TYNGKCYIFYNQQPENFERALSFCESRGGSLVDESNPALQGFLSWELWRR
HKGDANGQYWNGAVRDREDSNNWKWINGKQVSVSFWNLPGGVENCARFDG
TKGWLWSDTNCALRLNYICQHSPTTCGKPEQPPDSSLSSSGYNIGDIINY
SCDVGNLLVGPSSRKCLSTGFYSEFPPICRFIQCGXPAEIPNSLITLQNR
SFVFDSKIKYECKRGYILAGRXILTCDVDGRRXGPPPHCEPVYCQEPPPT
RQGGVTLSTNSTRFGTVATYYCVNPRLQLNGGKSLYCREDGSWEGTVPRC
IMAPIVTRKEDNFLERLPMPSNDRPIPFMSKYPPIKKRMEPRPLESNTLS
GPMSNEIPDSANVIASRNPNVNLLNPIKVNKESLNANINWGGIIALAVFG
GFVFVAAIVTTIVILIRSYGGIEKRHSRGESPQSSSTPHTQSNRSSSRPT
HHHHHVHGQHRRQCRKSTSSSSRDSHPHFSSSSDCLSDETDSFKDILKKT
LEDNKYRLVK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1037:112468..132413+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000251-696098 ID=EMLSAT00000000251-696098|Name=EMLSAT00000000251|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19946bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1037:112468..132413+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTTCAGTTGGTTTAAATCCTCTTTTAGTGAACCAGTGAAAATATATAATA TCCATGATATGGTGACAGAAAAGTTTTGATACGTTCTAAGAGAAAATCAT AATTTTTAATTCATTTGTAATTAGTAGAAAAATAAGATTATTTAGACATT TATCAACACAATGATCCGTATACCAAAGATATCCTATAATTCCTCATATA TACTTCTTCTCTTCACGCTTCAATATGTCATTTCAGGTAAGAATATATAT TGAGTGTATGAATATTTAGATACATTTAAATGAGTCTATGGTATCAAAAT TAAAAAAAAATCAATTTCTAATATAAACCTTTAGTTAATGTTGGATCAGT GTAAAACACTACAGTACTATAAGTCCCGTCCTAATACTTATCAGTCCTAA GACGGGCCCTCCTGGACTTTTATGGTAACTTCAACAACTGAAATGAGGTA TTTACTAACTACGTCATTTCACCTCTTGAAGTTTTATCATTACCTCTGTC AAAAGGACAAGTTTATAGTAGGAGGTGTGTGGCTAAAAATTATTATTATA TACATTTTAGCTATCACTTATTATGTTTTTCTTTTTTACATTCTTCAATT CTAGTATAGAGTGAAAAAGATCGTACTGATAAAAAAATGACGAGGGGGGG GGGGGAAGACCCATTGAGACAACAGTCCTAAGAGCGATCTATCAACTCTT GGTTGATGAGGGATTCACTCCTTCAGTTCCAGTAGATAAATTATTTATTG ATAATTAACAACGTTCAATACAACACGCATAGTTTATTTTGATGAATTAT TTTATTCTTTAAAGTAAATAAATCATTGCTCAAAATCAGGTGCAATAATT TAATTTTGTAGGGAAGGAAAGGGGCACTAAACCGTACAAATTTAGATACT AATTCTCATGTTTTTTAGATTGAATTAATTAAATTATGTTTCCTGAAGAG 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ATACCGTCATGCCACCTTGCGGATTTTTTATTTATTTTGGTCATGTTGTA TAGACTATATTGCTGAAGGAAATTGGAGGATTGATTAAATAATTAGCTTC CTTTTTAGATTTATTATATATATAATATATAAGGTGAATACACTCTGAAA ATAACAAAAGAAATCATTATGGGAATCCATCAAAAAAAGTAATTAAAGGA GTATTAAATATTTTCTAAAAACAAAAGTTCGTGTGTGTCACACTAAACAA CTTTTCCCTTTCAATTCTTAGGAATGTCCCAATGAGTATTTTCTATTGTT TTCCCATATCATATTATATTGATAATAATCATTTTAGCGTGAATTATTAT TTTTGTTTTTTGGAAATGTGGGAGACAAAACAAAAGTGACGTTAGATACT CTGTAAAAAACAAAAAAAGAACTCTTATAAAAGTGTATTTTTCTTTTAGT TCATGTAAATTGTATTAGCGATTTCTCTTTTGATTATATTTTAAAGAAAT CCTTTGATATAAGAATACATACAGCCATAAATTCAACGTCATCATGCAAC AAGATTCTTTAAAAAAAGAATATTTTCACTTTCCCTATTTTTTGAAGAAC ATACTGTAAATTATGAACTATTTAATTGTGTCTTTTTTTTTTATCATTAA TAAATTGGAAACTTTTTTTTCTTCCTTATTACTTCAAGGCAGATTCATAC TTAATTATTTTCCTTACATCAAAAAATAAAAAGTGAGAGTGTTGAAAAGA GGAGAACTTTCTTTCTGTTCTGCATAGTGAGTATAATCTATAGAAAGAAA TACGTCATAACATGTACGAATTTTAAAAGGGTGTAAGTTAGAATGGTTCT AATTTATGTATGTTCAATATTGTGCCGACTATTTGTCTATAGAAAAAAAA CAAAAAACTCGTCAATTTTCGAAATTCCGTTAGTTTTGTAGCACTATAAA 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TTATGCCCTCTATAAGTGTTTATATGGATATTTTATAACCGCATATAAGG CGCCTTTATCGCAGGATGACCATCAGAGGGAAGTAACAGAACTTATTGTG ACATGTTCTCTTTGAAATTTCAGAAAACTTTGATAATTATAGAAATATAT TTAATGACATGGATTTCATAAGAACTTTCATGGACGGTTACAGATGAATT ATTACTATTAAGAGCGTCATTTATTACAGCGAGGCATGCTGTTCTCAATG TAAAAGAATTGCTATTTCCAAATTGATTTAATCATTTCTACTAGTTATTA ATTCACAAACTTTGAAAATGATGAAATTGCTTTGATCCCTAGTTTATTCT ATATAAATTTCTTTTTGTTTCCGCTTTGTATATATGTTTGTATTTCTAAG CTTTTTGCATTGAAAAAAAAAAATTTTTTTTTTTTGATGTTTTTTCAAGT GTGTCGTTGTTGTATAATTTTCATAGTGTTTGATTTAAATCTTTCTTGCA CATTTCCAAGGAAAAAGAAGTTGTTATATTAGTTTGTTAGTAAATTAGAG ATTTTTTGTTGTTGGTATGTGTATGCAAATTTCGATCTTTTACCTATGTT TTAAATAATATATAAAATAAAAAACTTGATTAAATACCATTTCATAATAG AAATTTAGACGCCAATCACCAATAATTTATTAGTTATTTTTTATATGAGA TAAATGTTTTCGTGGACTTTAATTGGTATTATTTTGTGAGAGTATAATTA AAATTTACATTTAGTTAGAAGTTAATCATATTAGCAGGTATATGATCAAG TTACTATATTGTCATGGTATATTTAAATTGGAGTATTTTAGGACCTCAAT ATGTTCAATCAAATTTATGTTATTGTTTAAAGATGTTGACATATAATGTA CATATTCTTTGAACACATAATTATGGACTGCTTATACTAATTATAATTAA 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CTGAGCTCTCTTAATCATTAATGTAGCCATCCTTAGTGGAAGAGATGGGA CCCAGGCGCGGCAAAAGGCTTGACACCCCCTGTGGATATAATTTTTGTCC AAATTGACTATTTTTTGCCCATTAGGGTTGCACATTGAAAAAAATCAGTT CCAATATTTCTTTTCTAAAAGTTTTTAATTGGGGGGGGGGGGGGCTAAAG YCCCTACAGCCAACCCCATGTAAATGCCCCTGAATATCTTCTTTTGACTG TTTGTGTATCATAATCCCTTTCAAACCAATTTTTTGAACTATATGAGTTT TTGTTCAAGATAATAAACGGTTGATTTAATCTGACAATAATAAATTGATC TTTACCTATTCATTTTAAAGATAAATTTAATTTATAATGACATAAATTAT ATATATTTAATTACTTCTTTTTGGCAGAATAGAGAGGAGTAAAATATATT ACCTCAATATTTCAAAAGCATTTATAAAAGGCCTTAAAAAATTGAATGAT GCACAAAAAATATACATAAAGGAACCATTGGCTCGTCTGCATTAAATATT TTATGTAGTAAAGCATATAGAACAAAGATATCTTTAATAGAATATCTAAC GAAATTTATSAACTGGAAAGAACGACTTACTTTAATAAAATTACAACATC AAATCTTTTCATTTCTTTGANAAAATAATAATATGTTAAATGAAAATAAA GACATACAATAACTTTTATAATTTTTATATTTAGTTTGCCTACAAAAAAC AAAAACATATTTATGCCAGACAAACAACTATGTACAATAATATATTATAA ATATTAAAAAAAAAATAGGAATGTATAACAAAAATGTTCCAATCAATTGA ATATAATTTTTGAAAGACAATCTTGAACAAAGATCAAGAAAAGGAAAATA TCAACACCTATTTTTTTTACTTCATATATATATTTTCTTTTAAAATAATC 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