EMLSAT00000000323, EMLSAT00000000323-696170 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000323
Unique NameEMLSAT00000000323-696170
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1049supercontigLSalAtl2s1049:76194..90926 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000323 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000323EMLSAG00000000323-683089Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000001495EMLSAE00000001495-710423Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001496EMLSAE00000001496-710424Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001497EMLSAE00000001497-710425Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001498EMLSAE00000001498-710426Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001499EMLSAE00000001499-710427Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001500EMLSAE00000001500-710428Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771479auto771479Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000323EMLSAP00000000323Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000323

>EMLSAP00000000323 ID=EMLSAP00000000323|Name=EMLSAP00000000323|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=383bp
MCLFFCYTDPFPSPGRFKLILIMNRDEYFDRTTSPAEWEDGILCGRDTFC
EIHGGGTWCGMNKKGRIGILTNIFEGQGAKHLASRGSLVTDYLKFQGFKS
PMDYMKDIXSSGXLXKPYNLILMEQNAKTGSYELFYCAQGLNATRDGPRK
LTNNHSCLGNHFLRRPFLKTMAMDEEIMEFIEEHNTVQNKENIIRNLYDI
FGTRYSYFPDPEIEKLKYSDDFLMKNDKYIACPYITHSNYKGRSYGTRSQ
TIILINYYDEVSYYETTRHFNPQTKEEHYSKLNVRYHFSKPKHWAKQSVL
SRVEGCERVENRIYHGDPVERRNFSWMGDSGGGLFVDQNLVGLISFGTYL
ETYPHCRGKFPTFYTKVYLYAQWIDSILASNSD
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1049:76194..90926+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000323-696170 ID=EMLSAT00000000323-696170|Name=EMLSAT00000000323|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14733bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1049:76194..90926+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTGTTTATTTTTTTGCTACACGGACCCATTTCCTTCTCCTGGACGATT CAAATTAATACTCATCATGAATCGAGATGAATACTTTGATCGAACCACTA GTCCCGCAGAATGGGAGGATGGGATTCTTTGTGGTCGAGATACATTTTGT GAAATCCATGGAGGAGGAACTTGGTGCGGGATGAATAAGAAAGGACGAAT TGGGATTTTGACGAATATTTTTGAAGGACAAGGGGCTAAACATCTCGCAA GTCGAGGGAGTCTAGTTACAGACTATTTGAAGGTGACAACTTTTTTTTAA TTCTTCCTTAAATTTAATTTTCAGTTCCAGGGGTTTAAATCACCCATGGA CTATATGAAAGATATTMCCTCCAGTGGGMCTCTCTAMAAGCCGTACAATC TGATCCTCATGGAGCAAAATGCCAAAACCGGTTCCTATGAATTGTTTTAT TGTGCACAAGGACTCAATGGTAAAAATATAGTTGATATTGTTATGCTTTT ATAGAGATGGGGATTCGGACTCAAGACTTGCAATTCGACTTGAGTTCATA TTTTGAAGACTTGTGAGTAGACAGTTTTTAAAAATTTGGTCATCAATACA ATAGGTACTCTTTTTAACATATTTTTTTTTGTGGACTGGGACTAAAAGGT AGAAATAATCAGGATAAGCTTCTTTCGATATACATAATATCTGTTTTTAA ATCTAGGATTAATTATTCAATAATACTTTAAACTTTTTAAGATCGAAAAA ATCCCTTGGATCCTTTTTATGGTCTGGAAAATTTTGAGTACCCGTAGCCG GTTTAGGTCTCAGATCTTTCTGGATAATAAAATTTAACTTACACTATACC TGGATCCAAGGCCCGTCCTTTCTCTACCTGGGCTTGTGAGCAAAGACTTG AGACTAGACTTGAAGTAGGTGGTCATACATTTATGAAGTCCGGAAATAAG TACAATTTTTGACCCCTGTTCCCCCTTGTCTCTGTTTGTCCAAAACTTGA TACCTCCAACCCTCCACAAATTGGATGTCCTAAATTTTTACTCTAAGTGG TCAGTTCTCACTGTAGTGGACCCTGAAATATCACATGCAATCCAAAAAAA TCTTTAAATTGCTACCCCCTGTCAACTGGACGTCATAATTGTATGACCCT TTGGAGGACTTTTCCCCATTTCTGTAATTTAAAATATATAATATGCAATG AACTAAATATCTACTTATTTAGTACAGATAGATTGCTAGCAACTAGAGAC GGTCCTAGAAAGCTTACGAATAATCACTCTTGCCTCGGTAATCATTTTCT ACGACGTCCTTTCCTAAAAACAATGGCCATGGATGAAGAAATAATGGAAT TCATCGAGGAGCACAATACCGTACAGAACAAGGAGAATATTATAAGAAAT TTATATGATATTTTCGGAACTAGATACTCATATTTTCCAGACCCTGAAAT TGAGAAATTGAAATATAGCGATGACTTCCTCATGAAGAACGATAAATATA TCGCGTGCCCCTATATTACTCATTCTAATTATAAGGGTAGAAGCTATGGA ACTCGTTCTCAAACCATTATATTGATTAATTATTACGATGAAGTGAGCTA TTATGAAACAACAAGGCATTTTAATCCTCAAACAAAGGAAGAACATTATT CTAAAGTCATTGAAGAATTTAAACTATTGTAAATTAATTATAAAACCATT TATGATAAGAAATATATCCGTAGTTATTTGAGTGTTGACCACAAGACCAT CATTTTTAAAAACAAATAGTATGGAAGATTGTGGGCAGCTGTAACACTTT TTTTTGTGTGGTGGAAGTCAAACATTAGTCGTACAAGCGTTATTGTATAA CCTTGCTATGTTGGATATGTGTGACTGGTGATGAAAATCCCATTAATTTT AAGCATGCTAAAAAAACAAAAACAATAATCAACAAGGTAACTCTAATAAT TTAGATAATATTTTGAGAAAAACAGCTTGGCTGTCATGACGTTTCATTAG AYCAGCCACAAAAATTGATTTAAGGTAATATAATAACTATATTAATAAAG CAAAGTTTGTCGTTCTGTATCTATGAATGTATGAAAACGAGTTACCGGGA TCATTGTATAAAGTGCTCCATGGTGTATATCATAGACATGGTTTGAACTA AGACATAATAATAGTCTTCAAGCGTACATTGTATAAGTTTACCCACAGTC TGCACTTCATACTTTCTCTGTCTATCTCGAAATCGGAGAATTCGACGGTG GATAGTTAACACCCTAGTATACGCTTTAATATTCATTCTAGAGTTTATTA TTTTTCACATGTGAGAAGAAATGACGTCATCTTACAATCATACTAAATTC CTCCTAATTGTTGAACCTATTAGAAGATGGTATATATATATGGTTTTCTC TCTCGTCATTTTATTGCACTTGATAATGTATTAAATTGGTTGTGCAAATC CAGATTAAATAGTAATTATAAAATACAATGTAGAGAAATATGTGGTAATA CGCATTAGTTACTAAACTGATAAATGTTTTGTAACATAATAAATATATCT CTTAGCCGAAATTTGTGACGCACAAAATAACGATGGGAGAGGATGAGATG CAGGTAAACTTTTTTTTTTAATGAAAATGGGTAGAAAACTACCAGTCATC WAAACAARAAGCCGTAAGCTCTGTAGACGTCTCTGAAATTTCCAAATCCC CCATTTGTAGGAGGTGCAGCCAGAGTGTGCAAAATTTTGAATTTTTGCAA TGATTTCAGGGGTGTCCTGAGGATTTTATTTTTTTGGGGGGTGGGCTTGA TTTTTGGACTTTTTTAGTAAAAAAAAATCAGATTTATCAATACAAAAATT TAATTTGCATCGTAGAAGGTGTAGGAATTTATTAATAATATTATCTTTTT AATGCATTATTACGTAATAAGCAGCTAAATAAAAACAATAAACCTATTTA GTTTCATTTATACTAATGCAAATTTGGTAGTCCATATCACCAAGAGCATG GGCCCTCATGGACTTCAGGGGATTGGCTAGGATTGTTTTGTTTYAATCTT CCMGGTCCAGTATGGCCTTTTTKACAGAGCCCTTCTTCCTCTCCAATGTT TCAGACTTGCTGACGGCATCTTGGAGACAACAACTGCTTGAATTGTGCGA AAGGAAATTTGTCAATCACGTTCAAGTGTCATTTTCTTGACTTGTACTTA AGCCAGAGAGCTCGGGTTATTTCGTTTTATAAGTAATTGTTTATGTTCTA ATTTACCGAAATATGAACTAATTTTAATCACTCAACCTTAATTATTGATT GAATTAGTAAGTGTTCAGAGTTCAATGGACCACCTGGTACCGTACACGTT CAAATGATTGTCTGTTCCTACATGGAAACTTATTCCAGCAATTGTGATCG ATTGAGTCCACATTTATCTCCTCCTAATCAAATAATATATTCTTTGCTTA GTAAAGTTATTTCCTTATTATTAAAGGGTTGCGATAATATAATTTCAACT ATCACGTGTCCCTTTCTCGGCTTTCGAAAAAGTACAAGCTGCTGACAATC TTCTACAATGTATCCTTCTTCAGTTCTAAATAATGGCCGACACAACACTA CGCTCGTTAGTACCTTCAAAGTAACATTACTTCAAAGGACCAAGGGATTT ACATATATTTATAATTAATAGACTCTTTTACTTCTGAAACCGACTTAAGT TACTTACTTTTCATTTTTTTATATTTTAGGTAAGTTAAATGTAAGATACC ACTTTTCCAAGCCAAAGCATTGGGCAAAACAGAGTGTTCTATCTAGTAAG GTAATAAAAAATAGATCAATAACTTCATAATACGTATTATCTCAACTTAG GAGTTGAAGGATGTGAAAGGGTGGAAAATAGGATCTACCATGGGGATCCA GTGGAGCGTAGAAATTTTTCCTGGATGGTGAACATACATACCAGAATATC CCAGTTGATCACATGTTCTGGATCCCTCATAACTTTAAATTGGGTCATAA CATCAGGGCATTGTGTTTGCGATTCCAAGCCCAGTGCCATCTCAGGTGGG GTTAAAATTACAGAACTATTTCTATTTTAAGTATTGTGTGGACTCCAACA ATTATCGACTCAGTTCGAAACGAGTTGTCTCCATGATTTTTCAACTCCAC TCAAAGAGGGGTNGACAGATTATAATTATTTATAACTAGAGAGGTTTAAA ACATATCCAAGAAGGGGGAGTGGCTTTTTCTAGTGAGTAGTTTGAGCATA ATTTTTTATTATTTTAGGCCCAAAATGCCCAAAGTACAAATGGAAAGTAT TTCATTGAATATCCATAATAATAAAGCAAACTTGGGTTGTGTGTATTTTG GCGTCATTTTTGAGTGTGGGCTTAACATATGGAAATTTGTGACTAACAGA AAAATAACAATGTAGCAACGAGCGTGTGTAGCTCAGTACGTCACATAAAG AAATAAAATAAAAGGGGAGTACTATATTACGTTCAAAACTCAGACTGTAG ACCGAAATTTAATTGCCTTCAAATCGTTGACATTTCCTAATTTATAAGTT GTACATATAGGCCTTATAAACCACATTTGACTCCATTTGGAGTTATTTTA GATCAATGTTCACAATTTTCAAACACACTCTGGATCAACAATTACTCTAT AGAATCCGTCTAGTCCGAATTTTAAATGAGGCTTATCCGGACTGATTTTT TTGTTAGACCAATTTTTTATTGAGGACCAATCTAGACTGAATTTTTCTAT AAAACCGGTCCGGACCGAATAGTTCAATCTACTAAAAATCATAACTATCT AAGACTGGCTTATGTTTTTCAAACGGAAATCTAACAATAGTTTTTATTAA GGCAAGTTTGTCAGTATTTTTGTCTGTTTGTCGATGTTTAATAACTTTGA GCAATTGATACATCTTCAATGTATATCATCAAACTGTTCTTATTAAGCCT TTGAGTGTGACACATATTACACTTTAAGTACACACAATTGATCATCACAA TAAAATAATGAGAAATTGATAAATTATATGTATTTGAAAGGAGCAATATA AGGCTCTTAAATCTAATTAAGCTTCTAAAATATATGATACCATTCTTTGG TAGCTCATCATATCATAGAAATTTGAATACAAAGGATATACTTGACTCAA ATATATCTATGAAATTTGAGCTGTACGAAGAAAAAAAGTATATTAGAATT TTCTTGTTATTTATTCAGATTTTTTTTAATATGTTGACACACAAAGTAGG TATAAAAATTACTTTTTTTCTTTTTAAAAAACAAAAAAATAAAAACTCCA TTATTATGCAAGAATTGATAAATTTTTAACAACTAACAGATTTTGGGCCT TCCCCCCTTTCTTTTCGGATGAGAGGTTTTGGAGATTCAATAAAGATAAT GAACTATTTTTTACGTAACTCTAAGCTTATTTTGAATATCTATATTTCAA TTTCAGTTTATGCATCAGACATTGACTTGTGTAAAGAAGATATCTTCGAG GATGTGAGTAGGTACAGGGTGAGGACCCAAAACTTGCAGTATCATGACTA AATTACAAAAAAAAACCAAAAATCTTTTATGGAATCAAGAAAAGACAACT CAAAATCTATTTGTGATATGTTCAAATACTACGGGGCAAACTTTTATTAT TTACTTATATTTATTATGCAAATTTTAAGAGGTCCAGAGTCATTTTTTTA 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CTTTGTGAAGGGATTCAGCCTGACTCTCATGTTCTTAAATAAGTTTTAAA AATACCAGAGATCTGAAATAATCACGTAGAAAATTTATGTCCACATGTGG AGAATATGAAAGGAGTACGGGACAGATTTTTTAATTTTGAAAAGTTTAAT CGGCCGGCCAGAAATGGACTAAATGACCTCTTTAAAAGAAAAAATAATAA TTTCGACCCGTTTTCCCATTTACCACATTCTTGCAAAGTGATAATTTTCT GGTTAATCKCATAATTTTTTCCCTGGAGGGGGGGGGGGTACTCAAGTCCC TCGGCCCACTGATTGGCAAGAGGAGAAATAAAGGAAAACAAACTTAATTT AATCCATGATAATTCCATAGGCTTAGAATTCTATAGTTCTGACATTATAA TACTTATTATAATAAAATTAAAGGCTTAAGCGGNNNNNNNNATAAATGGG TTGTAAGAACTGATAAATTACTACAATGAGATAAAATAATTTCATAATCC CATTTTATCTACTATTTGTCATATTTTTATGAAAAAAAACCCACATTTAT TATCTTCAAATAGTCGAATGCATAACTTTCAGTATAAAAGAGGACCATCA TAGGCTTGATATTAGAATGACAGAATTTAAAAAAAAAATGTGATTTATGA ATCTCACAGGGCAGATTTTTTATATAGGTATATGTTTGACTATTTAAAAA TAATGAATAGTTCTTTTTTTCATAAAAATATCACAAATTTGTTGACCATT TGTCATACTTTTTTGTTGAAAAGGTTGTTTCTTTTTGACAATTTTGACAA AAAAGTTTTTTTTTTTCTAAATACCAAATTTGACAAATAATTATTTTTGA AATAGACAAAAAATTCCCTTAAATGTAAGAGTTTATTTATTTTAAAAGAA ATTAAATATGAACGAATAACCCTTTTTTTAAGTAAAAGCATATTGATTTT TTTCTGGGGAATGATGACATTTAAAATTTCACAGATAGGAGAATAATTCT GCAAAAATTTGGGGAGGAGCAATGCTTGACTTCACGCTAATTGCATAAGA CTTGAGAGCCTTGGACTAAATTTATACTAATTGGTTTTCCAATCTATTAG GCCCTGGAATTAAGCTTCCTTGTATAAGTAATGAGGTAAAGTTCCAAAAT TATTGATCGATAAAATATGTATCTTAAACAGGGGTGTCCACAGAGGGTTG GTTAGGGGGCTGTAGTCCCCTCCCAAATTAAGGAATTTTTGTTTATTATA TTATTTTTTTCTCTCAAAAAAATGTAATATTTGAAATCTAACTTAATTTT TAAAATTTTTTTCGCAAAAATTAATTTTGTGTGAATTATTATAGACTTTT GAATTTTATTTCCAAAAAGTGGAATATTTGGAAAATATTTTTAAAATTTT TTTCCTAAAAATTGAAACTTTTTTTCAAAATAATATTTAATTATGTTTTT TCCCAAATTATTTAATATTTGAAATTGAAAAAAAAAAATTAAATCAGTTG ATTTTTTTTACAAAAAATTCCAAAACCCAAAAACCTGCGGACGCCCCTGT TAAAACAACACGACTTTCTTTTCACCTGAAAATAAGATGATTCATAATGA CCCATCCAGAAAAAGTAAGTTGATATATTAATTGTTACTTCATAAAAAAT TATTACTACTTTCATAAATAGTTGAAATTCTTGGATTTGGAATCACGGAG TCGGATGAATTCAGTATGTAATTATTATCTTTAATTCTAATAAAAAAAGA TTACTATCCATGTGTACAAGACCATGCCTTAACTGAGACCAAGACTGAGA GTTAGATCATGAACAAGTCGGAAAAAAGAACCTTTTTTCTTTTCTTTTTT TTAAAGAAAAGGACAAATTTTAATCTTTAATTATTTCATTCCCAGTAAAT TCATTCATTCACTGTCCAGCTTTGGGGTTTTAGTTTTTTAGATTAAAATT ACAAAATTCATAATTATTTACAGTAAATTAAATTTTTTGAAAAAAACTTT CAAAAATTAAATTTCAAATATTATATATTTTGGGAAAAAAAATTGTAAAA AATTCATAGTTATTCACAAAAAAATCAAAAACTAATTCTTAACAAAAAAT TACATTTTAGGTAAAAAAAAATTATAATATAAACTGTTTGGGAAAAAAAT TTAAACTTTTTGGAACTAAAATTCGCAAAATAAAATTTCAAATATTATAT TTTTTTCCCTGCTGCATAATTTACTTGAATGAAATTTGTGGGGGGGGGGG GGGGCTAAAGACTCATCAACTGTCTTTTCATTCCTAGTAATTTCATTCTC TGTAAAATTCATCCTTGGACTTTCTACACCCTCCATCTACACACCTACAG AAAAACTACTACTTAGTTTAGAAACATAAATCTATGACATCACTTAATAT CCCTCTTCAAAGTGGGATTAAAATGTCAGGGAACAATATTATTTAGTACC ATTGTAGCCACAAATAGTGTTGTCGAAAAAGAGGGATATCTGACGAGCAC CGATCTCAACAAAATCGGGTGAGTTTGTAACCTACAATCTCTTAGTACTT TTTTAAGCAGACACAGTGTTGTCTCAACATTAGAAGGCTCTGACGTAATC AGAGGTGATGCTGCTCAGCATAGTTCTCTTACCATTTTTTGACATCAAAA ACCCAACAAAAAGTATGCGATACTAAATAATATCTTTGTCTGGAGCTGGG ATTAAAACAACAAATTAATATTAGTGTTGGATCCGTCCTACAACTGTGTT CTGATAAGTCAGTCATACAGTCCTAGTTATCTTTATAATTTCTTCACTCC TACTTAGGAATTAAGGAAATAAAAACGAATAAATTAATTAGGGATAGCTA 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TCATCAAGGAAAATTACCTTGTGTTATCTGGCTTCATATTTAGGGGTTTT TTGGCGTATAGCATGGTTCAAATCGGCCGATTGTTGTTGGTAGCGATCAC CATGAACGGTTTGATTGGGTTGTAGAAGGTCAGACCATCTTCAAACTTTT TTGGTGGCTGGCCGCACTCTTCATTTCTCACGTCAAAATCACCACTTTGG AATTTTTCAAACCACCTGAAGCACTGTGCTCTGCTTAGAACATCTCCACG GTAACCTTCCACAAGCATTTTATGGGCTTGATAAGCGTTTTCTTTCCAAT TGGTAACGGAAAATTAATGATGTCCACATATTGTTGTTTGTAGGTATAAA ACTGTTGACTGAAACTATACAAACAATTAATTAAATATTGTTGACACATG CCAAAATAAGCATTTAGATTTTTGTACCGGTTTATAATGTCTAACTGGCG ACACCTAGGTACCAATTGCCGAAAGTCTCATTTTATAGGCACATACCTAG CATATCAAAGTTTTGGAGGAATCGGGGCTTGCCCAGAATCTTTTTTTTTT TGCGACAACTGTAGACTTAGTACAATTATAGACGGCTAGTTCAGGATTTT GAAGAGTCTATATTCTTCTATGCTGTCTTTTACAAGAATATCCTTTCTTT TTCCAGATTGTAGATTGAATCGAGCAACGCTGAGTCATATTAAGAATGGA ACAGAGTGCTTTAGTTCTATACAAGAGACAGTGAGTTTACAAATATGTAA AATTCGTCTAAAGACTATCGGTCCCAAAATTTTAAAAACCCTTCCAAAAT TCTAAGGATACATCTTCTGGGACGTTAAAGCAGCCCATAAAACAACCTTT GGGAAATGACGTAATCAGATATCATTATGACAAAGCTATGTAATTTACGT GTTTTAAAGATAGTCAAAGTTTTACTTTACTAAATTGATGTACTTTACTA 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