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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s106 | supercontig | LSalAtl2s106:137270..173657 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000447 >EMLSAP00000000447 ID=EMLSAP00000000447|Name=EMLSAP00000000447|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=315bp
MALPGGGIVSVPLQDNSRLDSPGGGDPSVTSASAPTSGGSGGLPASDVLT VNAGEPVTHFNLDQLLEIVQSFQLDATMAGHEEGGSSRDLQALVEPSLLG VCGRCCDVLTSGTTTNLTSCDNRISRTATNSSVEGGVGGGEKTLGETSNL REIHSCPSSPTETDCSSGFSTLRRRSVTLTEKIRTNRDGSKTQVLRQYGX NXSSVAXATQXVSYQQNSFVYINGSDGKRTGVDTSTTGSKSSRSFPSLXP IXSSAAPSMSNVSVLPSSATTLPRSTQPSASSTGASCNSQYRGHIVRLNS IEPNTVMFSTKDYPL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s106:137270..173657+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000447-696294 ID=EMLSAT00000000447-696294|Name=EMLSAT00000000447|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=36388bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s106:137270..173657+ (Lepeophtheirus salmonis) GTGGATGAAAGCCTTCTAAGCTCTGATACAGGCGGRGAGGATCCTCCTCT
CCCACCACCCCCTTCCTATCCTTGGGTACAAATGGCTCTACCAGGAGGGG
GCATTGTCTCCGTACCCCTTCAAGACAACTCACGCCTCGACTCTCCGGGT
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ATACATCTTAGTAACATAATTAATCCANCATAATTAATCCATTAGGGTAC
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GTCCACTTAGACACTCCGTTACATGTTACTTATTTTTAGGGGCGTCCGCA
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AAAGCCCTAGTCAATTCTCAAGAATTTGCTCACAAAGCTCAAGTCCTTGA
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AACCGGCCCTTCCGACTGTCGGMTCTTCGGACTGTCCGTACTAGAACTGA
TTTTTTTTACTGATATGCAGGACTGAACTGGAATTTACCGAGAGTGAACT
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TACAGAGTATTTTACCTTCAGTAGAAAATAGAAATCACTTTCTTGTCCAT
GTCAAGTCTCGAGTCTTTCATACTGTGATCAAGTTGAGCCAAGCTGCAAG
TCCCTCCCTTTGGAACTTATTTAAAAGACCAAATCAATTTGTTGTTTCAA
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CATAATGTTGATGGGGTTCTATGTACTTCTCATAAACAACAATTGTAGAA
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GGGCATTTAATATAGTAGGTTCGTATGTATATATTATTTTGTGGAATGAA
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GTAGACTCACTATGAAAAGTGTTTATTTATAAAAGTGCTTAGAATCAGCA
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ATATCCTAATTTATAAATGTCTTAAATCCAGTTAATTACAAAAAGTAAGA
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TTGTACCCAATGTGCGTAGGATTGCATCTTGGTCATTCCTAGAAAAGGAA
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GTCACTGTAATACAATATATGTTTACTTATACTTAATGTGTGCAACTTCA
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ATCTTTATTAAACCTACATAAGAACATCTATTCGAGCTTTATACCTACAT
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TCTAAATAGAAACAGACAAAAGGCCTAAAATCAGTTGATAGTTAACCAAT
ATTTCTCAAATATGTAATTATTATTCAAAATCTAATTTATATTCAACCAA
GTTCGGAATGAGTGGTAAAGAATTGAAAAAATTTATGTTTGTGAGGTAAC
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GTTATATCCTTTTAGAGTGAAAATATTAGTACATTCCCATAGTCCAAAGC
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GGTATTTTATCTAAAGATTGAGATTAAACATCTTCCAGCACTAATTTATA
CATATATGCAGATTTTTATCCCACCATCGAAACAAGTGTTRTAATGTGCA
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CAACCTGAACAGTTTTATTTATTTTTTCCGAAGCTGTTATTATTATTATT
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GGTGTTAGGCCACAGAGTAGAATAAGGATTAACAGACAGAATAATTTCTG
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TTATTTCAACCGTCTTGTATTTTCTTTACTGCAAGTCTCCTAAGGTAAAA
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AGGAAATTAGAACTATCTTATAAATTGTATAGGTAGTTTTCATGTTTTTC
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CTCCGACATAGGTGGCAAGTCTGAAGGGAACGTCTCGTAAGACCATCTAA
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TAAAATGTATAATTAAAAAATGGCAGGCTATTTTTTTTCTTTCCAAATGT
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TTTAATTTTTTTTTTTTTTTAATTCTAAAATTAATTTTTCTGAAAAAATT
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ATTACAGCAATTCCCAACAAATTAAATTTTTTGAAAAAATAATTTAAAAG
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ATTCACAAAATATTTATAATATTAAATTTTTTGTAAAAAAAATTCATATT
TATTCACAAAATATTTATAATATTAAATTTTTTGGAGAAAAATTTCTAAA
ATCCATACCTATTCACAGAAAATTAAATTTTTTGGTAAAAAAATTGAAAA
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TGGAATTTGGAGTGTATTTGTTAATATGAAAAGAGTTAGACATGATATTA
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ATACTGCCCCTAAAGGATTTGCATCTCCTGATGACTTCCGTGGAATCGAC
AATGGATCGTAATGGAGCCCTTCAGGGCCGCGATGCTCTTGTGGCTGACC
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GAGGTTGGGGGAGTTGGAGGGCCAGGTGTTGCGATCCCAGAAAGTGATGT
CGTGGGAGTTGAAGAGGTTAGTGGTCCTCATGGCGATGTGTGTGGGCGCT
GAGTCTTGCTGGAATATGAKCTCCCTCCCAGTGGCCGTATCCTTTATCTA
GAGGATGATGAACTCCTCCATGAGTTCGCAGTAACTTATTGCGTTAACCC
TTTCCTTGGGATGGAAGAAGAAAGGAGGCATCACCTCACCGGTGCTACAG
ATGACAGGGTCATCGCAGAGGCCGGGAACTTTGTGGTGAAGKCCGCAGGG
KCCTTTTCTCTCTCRTTGGCAAGCCKCCTGTCATTCTGGACGTTGTAACC
TCTGGACGGAGAAGAAGATGATCCTTCCTCCATGGCTCTTCAGGTCATTG
AGGAGACGCTTACCGTTGGTGAGCCTGGTGGCTTTCATGGATGTTGTGAG
GATGTGTTGTTTTTCCATTCGGTATGACCTGTACCCGAGGTCCTCATTCA
CAGCCTTGGAGACCAGCTGCTTGCTCACTCCKCGGTTATTGGCCAACCRG
GAAAAGGAAGTCCCTGGCGAAGCCTTGATATTTTCTAAGAGCTATTTTCT
TTATGTAAAAGTAAATCTTGCTTTTGTTTAAGATTTTTATAGTTATAAAT
CAAATTTCTTCACATTCATTCAAGGAATTTTAGAACATTGTAAACAAATA
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GTATGTTAGCATACAATTATACAAGACTTTTTAAAAACATCAATCGAAAC
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AGTTGAATGTTAGTTTGCACGAATTACATATACTATCACTATTGTTAGAA
TTTCTTTCATTAAACGTCATATTCTTATATTTTACTCTTTGCTTTATGAT
AGGCATAAAATTTGTCAAAATATGAAATTTTTGTACAAATAAATTTAGTA
AAATCTCAGATTGAGCAATTTTCTCATCAAAATCGATAAAATTTCTTGTA
AATAATTCACTTTTACTATTGGTTGAAATCTCTTCACACAATAATGAAAA
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GAGCTAATATGTTTTGGTGTATGGACTCTATTTGAGATAAAGATGGCTTG
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TGTCTAAATTGTCATTGAAAAGAGTTTAAGCATTTGAACATCGTAGAACT
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AGTCAGTTTTACTAAATCTATTGGCGAMGTATAAGAAGCAGAAGACCCTT
GTTGGCCGAATTCAATTCAAACTTTATCAAAATCAAATAGATAAACAAAT
TAAATTACATAATCAATATTTTTATAGTTATAAATTGAATTGCGTAGAAA
GGAAATTTGTATATGAAGAGAGCACAAAAATTGAGTAGTATTACTTGAAC
TATCTATACTTTCAAACATTCCAAACACATGCATGCATGTTAGAAACACA
GGTGTATTCCATACAGATTCACAATACAGACAGCCTCCTTGTAAGTTAAC
TCATAAGAAGGCCCAATTGTACCCTTAACATGGTCTCCATTAATAGTAAT
TTATATTTCATTTCCCTCTCGCTGGCTTGGAAAGTCAATTAATTTACTTT
CAAAATAATAATTCAATTTACAAACGAACAATTGCTTGAAGTCTTTAACT
GCAACAAAACAAGTTCTTTAATGTTGCCATTATTCACAAAGAGTGAATCC
GTTCCCATCCTCCAATTGTCAGTATTCCAACCCATATTTGATAGTTGCAT
ATTTTTTTATGTGCAACATGTCTATGACGAGTGATACCCAACCATTTGTT
AAAATATGAATTAAAATTGTCTGTACCCCAAAAATGTTGCAATTTTAGAG
CTTCAATATTAAAAAACTTGATTACTTCGGGAGAGTATTCTATAACCTTT
TAACTTTTAACTACAAATTTAATTGAATCAATTAAGGTTCCTTGATTTAA
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GAAGAACGGAGTCTTGGGTTTTTTTGAAAGGAAAATTATTCTTATACAAC
TTAAGTTTTTCTCTTCAAATCGTGAATAAAAGTAACTTTGGTCCTTATTT
TCTTCTTAAAAAATAGTATTTCTACGTTTCGGGACCCAATACGTTTATGG
TACGTGTGATCACTCATAATGATAATGCCTCAAATGACAATTGCCAATGC
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AAGTATTTTTGAATAAAAAAACACGATGTTGATAGTGTATTTATTCCAAA
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AAGTTAGAATAAATTATGAAATAGCCATGACGTATGAAGTGAGACGATGG
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