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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1423 | supercontig | LSalAtl2s1423:3645..28779 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002232 >EMLSAP00000002232 ID=EMLSAP00000002232|Name=EMLSAP00000002232|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=219bp
MEVDRDWHYRLSLYYVKKEDSNVFTCKNPHGKMNSIRVVITDVECPKFEI SDVELESRLRSHKVGSIAAFSCPRGFKLVGPSSLLCLRNGSWSGTPPLCQ PIKCTALEILDSHLRVLSLNNSYLGTANFLCPFGYKLEGPETISCGHEGF WNGVVPRCKAIECASPLPPSNGRLLDNDKYLVGNTVQYVCDEGFVLIGEP IIRCTESGLWSHATPFCKN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1423:3645..28779+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002232-698079 ID=EMLSAT00000002232-698079|Name=EMLSAT00000002232|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=25135bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1423:3645..28779+ (Lepeophtheirus salmonis) ACTATATTGTAGTTCTATTGAACATTTGAATTGTAAACATACTTATATAC
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TGGCACTGTGTGTATTTATTACCATGAACGTTAGGGTGGTTTTTGTTTGC
TGTTATTTTAAAAGCACGAACTATTTCTCGCTCAACGGAGATGAATATTT
TGCATAAAACAATTTTGATAGACATTTGCCTAACCTATATAAAAAAAATT
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AAAAAAAAAAWTWAGCGCTATACGCAGATAATCTAAACTTATTAGATAAA
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ATCTGTAAGAAGCTAGAGGACACCTGGGATGTTGATACCACCATAAGAGG
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ATGAGAAAACAATAAGGGACTGTGTATCTGAGGATCTACTCAGCACCCTG
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TAGCACCAAGSCCAGCCTGATGGACTCCATCAAGGAGGTATTCGGTAACA
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GAGGCCATTNNNNNNTACCAACGGTGATTATATCGAATGAATGGCTACTC
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TTTTATAATTATACAAATATCTGTTGTTTTTTTTTGGTAGAATTAAAAGT
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CATTATTTAATAGGTCTTCGTTCTGTTAACTTTTCCCTATGAAGTAAGCC
TATCCTTGGTGTCAATTGTATTAAAAATTATACCAAAATGAATTCAAATA
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TACTATGAATATGTTATACTTGGAACATACTTGTTCTTTTCGCTAGCTGC
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AATGCATTACTTTTATACACATACATACATATATGCAAGTGAGTATTTTT
CTCAGATAACCGATATATGTATGTACATAACATACATTTATGGACATTTC
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TATATATTTATATCTTGATCATATATAAAAATGTCTTAGTCTATTGACTT
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ATTCTTCCATACTTATGTTTTCTAGGGAACTCCCTTCTTTTTAAAGATGC
AGTACCTTAAATTTATCTACGTATAGCGCGCTTGAAACAAGTTTTTAAAT
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AGATATGGTTATTTTGTAAACTTATTGTTTAATACCAGTAGTATCCGGTA
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TAGTGAGGTATCACCGTGTTATGTCTCTATCAATAAAGTATAATAACATA
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AACTTTTCAATTTGTTTAACTTATTCTCTTTTGTAACTAATAAATCATAA
AATGTCATAAGTCAAATATAAAGAAAAAGAGAAAAATATTGATGATGTGA
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TGCATTTGTTAAAAAGAATGTATGAATTTAATAAGTAATAGTTGTTTTCA
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TTTTTGTTATAAAAATCATATCAGATAGATGAGGTCCCCATTGTTGAATA
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ATTAAAACTTTGTACAAAATAAACTACATTTTTCAACGATTTTGTTATTA
TCTTTTTGGAGATTGACTAGCTACGTGTAGATCCCTTTTTATCTGGAACG
TCGATGATTTTTAATTTGAACGAAATAAACTACATTTTTCAATGCTTTTG
TAATTTTCGTTCTTGAAGTTGGAGTAGCTACGTGTAGATCCCTTTGTATC
TGAAACGTCGATGATTTTTAATTTACAATCAAATGGTATCAAGCAGAATG
TAACTTTTAAAATCGTGAATATAGGCAAACTCCTCATCATCACAACACCG
TTTTGCCCCAATTTTATCAACACTTAGTGGAATAAAGTGCTGTTAATATT
TGATTCCAGGAACAGCATCATCAATTCGGTCGTACTGATCTGCGTGAAGA
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ATATATAATTTTAAACAAATTTACTTTCAAAAGGATAATTTCTCTTCAAA
AATCTTTCAGAAATTATTTTGATTTTATCTCTTCAAGTGAAAATTTTGAG
TATATTTACACCTAATTAAAAATTGTTAATTTTGCATTTAATAGACATTT
CCCATAAACCGAAATTTCCATATAGTTAGTTTTGAGTATATAAAAAATAA
ATTTATCAAAAAAAAAAAAAAATAAGGGMGTTTTGAGATATATACTGCAG
AGGAGGGMGCGGTCGCCAAAACAGAAATATATAATTTTTGAAGCTAATAC
CTTCATTTATTGGTGTTCTAATGTGTTTGTTTTTTTAATGTTACATCCAA
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AATGTTACCTAAATTAGTTTTCGGATCCTTATCTGAACCAGCCCATATTT
GGAAATCTAGCCTGAACAAAGATATCAATAACTCAGGAACGCCTCATCGT
AAAGACTTCAAATTTTGGTAGGAGAGTTTTTACAGTAAGAGCTAAAACAT
AACTCAAAAAAGTAAGAAAATTTAAAATACTTGGTGTAAGGTCTTGGCTG
ATTTGACATGGAATGACTCTAATGTATGATAACGACTGACACTATTTACA
AGAAAACTTTATAATTTAGCTTCTAGAATGAAACCAACCCCAGCACGCTA
CAATTTATTCGGACTGATTACCAAGGTTAGTCCTACAGCCTACTTCTAAA
GTGTGCAAAATAAAATGGTGTCTCACGTGACAATTTCTCATCATACAATA
GTCTGAATAAAGTATAAATCTCAATTAAAATGCAATAGATTATCAAATTG
CTTGAAGTGTAATTGTATCCTAATCAAATCATTAATGAGCAAATTTCTTG
CCATAAATTATTTAACAATCATTTTACCTGACAATGTAAATTAACGTAAA
ATGTCTACTCTTTTGGAAATTTTAAAGATTACTTGGACATTTTGCACATT
CCTGTAACATATATACCAGGCCGTGCAAAATTATTTACCGATGATGTAAA
TATACTTTTTAAAAGGTTTTGTGGGAACCAATCTGATTGTTTCGTATTTT
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CACGTGAGACCATGTCCAATCAGGAAACAAAGAGGATCGAAATTGCAGCC
CTCCTCCGAGCGGGAGTGCCTCATAACAACATTAAGGAACAGGTTGGGGC
CTCGTTGAAGACAATTTACAACGTTTCCAAGCGCTTGGAGGCTGGGGGTG
ATCTCAAGCATTCCCCTGGGGCTGGCAGGAATCCCACTGTCTCCACAAGG
CAAGGAAAGGCAGTGTTCAAGAGGACTCCCAACAGGTCCATTGCCGACAT
GGCCAGAAAGATGGGAACATCGAGATCAACTGTTTCAAGGGCATTGAAAA
GGGTTGGAGGAAAGTCCCTGAGGCGTACTGAACGCCCTCTACTAACTGAA
CGTCAGCGAGAAGTCAGACTTGAGCGTGCCAAGAAAATCTTGAATGATAT
CAAGAGCTCATCTGGACGCATCATTATTTTTTTAGAAGAGAAAACTTTTA
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GATGTGCAAGATAAGCACTGCTATGTGGCAACAACAAAGCGCCCTGCTTC
GGTGATGATGTTGGGTCTSGTGGCTTCCAATGGGYAGGCCATYAAGCCGG
TATGGTTCCCAACTGGCTCAGATTAACAGTGGAGGATTATGTGAAGATTC
TGGCGTCCAAGGTCCTTCTGTGGATCAAATCCATAGTCGGCAACTCTCCT
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TTATTGTGTAGTTAAATTATAAAAATTATACATGATGGAGTTGCTTTTTT
CACCTTGGTTTTAAAGCTAAACACATAAATGTTTTCAAAATTTACCTTCA
AAAAATAAACATTAGTAGGAATACCCTTTCGATGG back to top
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