EMLSAT00000002232, EMLSAT00000002232-698079 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002232
Unique NameEMLSAT00000002232-698079
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1423supercontigLSalAtl2s1423:3645..28779 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002232 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002232EMLSAG00000002232-684998Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000009853EMLSAE00000009853-718781Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009854EMLSAE00000009854-718782Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009855EMLSAE00000009855-718783Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009856EMLSAE00000009856-718784Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000009857EMLSAE00000009857-718785Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769494auto769494Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002232EMLSAP00000002232Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002232

>EMLSAP00000002232 ID=EMLSAP00000002232|Name=EMLSAP00000002232|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=219bp
MEVDRDWHYRLSLYYVKKEDSNVFTCKNPHGKMNSIRVVITDVECPKFEI
SDVELESRLRSHKVGSIAAFSCPRGFKLVGPSSLLCLRNGSWSGTPPLCQ
PIKCTALEILDSHLRVLSLNNSYLGTANFLCPFGYKLEGPETISCGHEGF
WNGVVPRCKAIECASPLPPSNGRLLDNDKYLVGNTVQYVCDEGFVLIGEP
IIRCTESGLWSHATPFCKN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1423:3645..28779+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002232-698079 ID=EMLSAT00000002232-698079|Name=EMLSAT00000002232|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=25135bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1423:3645..28779+ (Lepeophtheirus salmonis)
ACTATATTGTAGTTCTATTGAACATTTGAATTGTAAACATACTTATATAC AGTTTTGATTTGAAGTTTACCTGCATTATTTGGAAGTTGAATTTGGCTTC AATTTATTTTTTAATCCCTTCAATTTCTCTTTTTCAGTTAAGTCAAAGCA CAGTCTTCCCTGATGGTGACATTGTGGAATTTAGATGTTTTGGGAGTCCT GGGGATTATTTCATTGAAGGAAACTCATCCCTAACTTGTCATAACGGTAT CTGGGACTCTCGAATCCCCTTTTGTCGAAAAACATCCTCACGAGCAAACT TTTCTGAAGATGAGCCACCCAGACTTGTGGTTCATTCCTCAGTCAATGGA GTCAATAATGAAGAAGAGGATCGAATCATCACAGGTCCATCCGGTGAAGT CCTAATTTATCCTGGCTCTATACTTCACATCGACTGTGTTTATTCTCGTA AGAAAGGGAATCCTCAATGGTCCTGGTCTCGTCATGTCAAAGTGTATCCA ACAGGTACTTGATTCGTTTTTTTTGTTTTTTTGTGTTTAATGAATAACAA GTGAAAAAGGTTGCTGAATAAATCAAATAGGAGTTTATGGCTTTTTCTGC ATGAATTTGGTTATAAAATACATAAGAATTCAATATGAACATAAATATAT TATATTTTGAATGTAGTACTAGAAGTTTATGTTAAAGTTGAAATTTTACT TAAAGATAAATACAATAACAGGTTATTAGACAATTCAATTTACTTATGAT ACTCAATAAAAAAAAAAATATATATATATAAATAGACATATTACATTATT ACTAAAGGCTACCGACTGAGAACCCTAAGCTTGCAGAAGTANNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACAAACATAAAT CAGTTTGTTTTTATCTCATGTCTCTAACTGTATAAATGTGCAATCTCCTC TGCACCGGTGTTAGTTCAGAAAAGGCTTTAAAGACCGTTGGCATCTCCAT TCGGACTCCTTATACCATAAATAAGTCCATTACTGGCCCATACAACTAAG AAAAACAATAAGAAGATATTCTATGGACACGGCCTTCTTCGTCAAGKCCA GCCAATTTGTTCACTAGCTTCACAAGCTCTTATTGCTTGTGAAAGAGGAT ATGTTGAATAAACAATATGAGCAAATAAAGTCCTTTTTTTAAAATTGGTA TTATCTTGTCTTTTCTTGATTCCATTAAAATAAAGTTTTTTGTTATTGAA CCATGCGACTGCAAGTTTAAAGTCCCCAAACTGTATATCAATTTTAAGTA AAAATCGATTTGTTGTGTAGAAGCCGGATAACTTAAAATTGAAGAGACCA GACATTTGCGTTCGAGTTATGAAAAATAAAAAAAGCTTCAATTTTTTTGT CAAGTGTCCGTGTACTTTCTATAATTAATTTAATAAATTGAGATATTTAA ACACAAAAATTGTATTTTTGAATAAAAACCATCATCCAAATACTAGCAGA AGGCCTATAAAGTCTTGAATGATCTAATTAAAACCAGAGATATAAAAAAG AATACTTAAAGAAATGTTTTTATCAATAATATACAGAAGCACAAGAATAA CTATATTATAATTTAAGTTTATTAATGTCTGTTAGTTAACCAAAAATAAT GTTTTTCTCTATGAAGCCAGATGAAAGATACTCCAAAAATTTGCACCTCT GGTTTAAAAAATAAAAAATAACCTTATCAATGATTTAAAATTTATCCACT AATAAGGATTATGAATCGAATTTTGATCTAAGATTGTTAATATTAGAAAT GTGAAATGGAACATTTTTTAGTCTCTGTAATAACCACACCTAAGATAACG TAATTAAAATATTGTAGCTCTCAGAGACATCAAATCAGCTAATCAATTTA 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ATACATCACGATAACAAATTAAGAAGTAATTCTCCGTTAGATGGTTATTT TATCACATTTTATTGTTGCAAATATTATTATATATTAAAACAACTCATTT TTCTATAATGGCATAGTCAATACATATATGTATTTATTCTATGATAATTG AGAAATAATTATGTAAAATTTGAAAGTGTAAGTAATCGACGTTGGCATAT AGAAAAACTTCTTTTCAAATCTCTAGGGATAGTACTTTTAAGGACTACTG ATGTATGAAAAAGGGAAACCGAAAAATGATATGGTAACCCGGACAATTTG GAGAGTAGCCTAGCCATSAATGCGTTTTATTATATACAAAAAAACAGCTA TTTTAAAATGAAATAAATTAACACAAATCCCAATTCGTATCTAGCAAATA TATATACTGCAATTATTTTGGTTTTAATATTCAATTCTACTCTAAGCCCA ACAATGACTTAAATATACAATCCCACCCAACACACCCAAAAAAAAAGTAT TACACTTTGTCGTTTATAAGCAAATGAACTTTATACGTAGATGCTATCCC TGAAAAAATTAAAGAATAACAACAGCTTTGGAAAATATACAAACACTGTT CAGTTTGCCAATTTTAAAAAATATCACACGCATAGAAATGCATAAAATTT ATAACTTTATTTATAGTAGTCACTCTCAGCAAAACCATATTTTTATGACA TTTTCTCAAAAGTGGTTGTCATCAGATGTGTAGATTGCAAGACTCTTTAT ATCTCTAGTCATGCAAAAAGAGTATGCTAAGCTTTTTTAATAGTGTTTTG TGTTGTTGGTAAACTGACAGGTATTTTTAATTTTTATTTTCTAAAACTGT AATCATTTTTTTCCCCCACTCATAAGGAAATCACAATGGAGTGAGTATAA AGTGTAATTATGAGTGCATGTGCTCATGAATTATGGAGAGGAAGACTGAG GATTTGTTACGGAGTTATAAAAGTAAGCCCCTGTCAGACTCAAAGCGGAA TTGCAATCAAAACCAAAGTAATTCGAGCCTTTGACCTTGCGTGATACAGA GTGGAACTTTGTGTGGAAGTGTTTATTTCCTTGTAATTATATTTGCTCTT ATAAAACATCTTGAATGGTAACTGCTTTTCTCTAAAACATTCTTCAAATT CTCAGAGTTACCATAGCAAAAACATTTAAAAATGGTAAATTAAATGCCTT TCTTCTTTAATTTAAAAAAAAAAGTCCCCTAGAATGTTAAACACATTTTC ATTATCTTTAGTAGATTTTGAAAATGATGTACACAGCATTAAGGAAAATA AATACTCAAAGAAAAAGCGTTTTACTTACACATAATATTAGGAATGTACC AATACCAAAATTTCAGCTGATTTCAATACCATCCTTTTCAACAATTCCGA TTTTTTATTAATATTCACGTATGTATTACATCAAATTACATCAAAAAATA AAGAAATAATTTATTTTTTTAATGTTTCAACTTTTATCAATTAGAGAATG AAAAAAAAGAAGAAAATAATATATCAATTATAATTATAATTAGTAGTAAA TAATTTGAAATTAAAATTATTCAAAATGTTAGTTCTTCTCCGTGCTCAAG AGTCAATTTATTACCGGTTGGCTCATGTATATACCCTTCAATACTAAATA GACATTCATTTTTAATGGATGTACTTGAATTTTGTTATGCAGGTCAATTA TTATTATTGTACATTTTATATGTTAAATAAAAATTAAGGAAAAATTATTT TTATCCGTTTTTTTTATTTTTTTATATTCAACTTTATTTTACTTAACACA CAAATTGGTACAAAAATAGGTAATAATTATTACTATTTACTAAATAGAGC CTCAAAGATTGAAATTTAAACAATACACCATACAAGTTATCATTGAAAAA 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GYGGRCAGCCGTAGTCATGACATTGGTTAATAATTGAGGGAAAATCTACA ATTCAACGATTGTTTCAACCTTAGGAGTGAATTTACGGACTGTTCAGCGT ATCTGTAAGAAGCTAGAGGACACCTGGGATGTTGATACCACCATAAGAGG CACCAAGGAGGAGGGCGCTNAAGGCCGATGGCGAGGGAGTCTGGGCTGCC ATGAGAAAACAATAAGGGACTGTGTATCTGAGGATCTACTCAGCACCCTG TCATGTGTCCAAAATCTCCATGTAGTGGTTAACCGAGAACTGTTATGACG TCGTTACCAAGGATTTGTGGCCTCCTAACTCTCCCGACCTTAATCCTTTG GACTATTTTGTCTGGGGCTATGTCGATAAACATACCAACNNNNNNNNCCA TAGCACCAAGSCCAGCCTGATGGACTCCATCAAGGAGGTATTCGGTAACA TGGACAATGAGATGGTCAGAAGAGCCTGCGSCCGGTTCTGAGGCCGTATT GAGGCCATTNNNNNNTACCAACGGTGATTATATCGAATGAATGGCTACTC TATACCTATATGCTTGTGATAGTTTTAATTTTCAATAAAAAAGTTAAAAA ATGTATATTTTGTGTTGTTTTTTGTAGAAAAATATTTTGGCGACAATTTG ATCCCCGCTCCCTGTATATAAATGTACGACCTAGAGATGATTGTGTTGAG CATTAAATTTTGCATGGATTATTTGGTTACCACATGATAATTTTTACACA CTATCCGTTATCAAAATTGAAAAAAGTTGAAAAACAAGCCCCCCTAAAAT ACACAATATATGCCACTATGCATTTTGAATATACTTATCTTGGTTAGGCG GTTGGTTTTAGAAGACGTAGTAGATAAATCATTCTAATTGTGATATAATT TACTCATATGTCAAAATGCACTTATTCAACGAAATGAAATAGACTCTCAT AAATTATATGGTTTAAATAATTCAATTTTATCAATACGTTTTTATGAATA CCTTGGATAATATATGCATATATAAGCTAACTATACTTTTATGCCTAATA TAATATGCAGTGTATAAAAATACTAATATTTGAACCTAAAAGAACAATGT TTTTATAATTATACAAATATCTGTTGTTTTTTTTTGGTAGAATTAAAAGT TACTTTATGCCAAAAAGTCAAATTATAAAATAAAGATATAAATTTCTGAA TTGCAACAATGAAAGACCAAAAATAATTATTTATTGTATTACCATCATTT TAATGTTATTTTGATTGGTCAGATGAAGTTGTACTGATTAAGTAAAAGTA CACATTATAGTATAACTAAATAAGGGATTTCTGTAAAGAAAAAGTTATGT TTAGCGATTAGAAAAGGAAAAAAAGGGCTATTACGTTTGCTTTTGTTTTT CATTATTTAATAGGTCTTCGTTCTGTTAACTTTTCCCTATGAAGTAAGCC TATCCTTGGTGTCAATTGTATTAAAAATTATACCAAAATGAATTCAAATA TAATTATAATATTTTCTCTGTACTTATACTATTTTAAATCAAGAAGGTTG TCCCAAAGAATCTCAACATGGAGTGAAGATGTGTAATAATGTCATGTTTG TACTATGAATATGTTATACTTGGAACATACTTGTTCTTTTCGCTAGCTGC AACACAAAGGGTTCCTTGGAAAGTTAAAATGATCATTTATTATCTAAAGT AAGATAATGTAAATAAAATTCATGCAGTTATCGTAGGTCAATACGGGATC AATGCATTACTTTTATACACATACATACATATATGCAAGTGAGTATTTTT CTCAGATAACCGATATATGTATGTACATAACATACATTTATGGACATTTC TATCATTTATTTATATATTTCATAGAAACTATAAATTAAATAGAGATTAT 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GATATATTTACGATATAATCAAATATACTGGAATAGGTTTGGCACTGTAA AATTTTACGTTCTTTATTTTGTTTTATATTAAGCAAAAGAGTTCTTAATT AATTTTAATTTCTTTATGCTCTGGGCAACACCTTGCAAACTTACTCTATT ATAGTCGATATATTATATGTTGTAAAAATATATCCATTATTTTTTGTTTT CATTAATCGTGATTTTATCCACATTTTCGATAATTGGCCTTACATCTTTG ACATATACATTACCAAAAAGGAATTTACATAACCAAAAATGAGAAAGATA GGCTGTTACACTAAAAGGATCATAAATGCTAATAACATTTTCAACCGCCT GCCTGACGTTTTGGCCGTTACTTTAANTCGATATATTATATGTTGTAAAA ATATATCCATTATTTTTGTTTTCATTAATCGTGATTTTATCCACATTTTC GATAATTGGCCTTACATCTTTGACATATACATTACCAAAAAGGAATTTAC ATAACCAAAAATGAGAAAGATAGGCTGMTACACTAAAAGGATCATAAATG CTAATAACATTTTCAACCGCCTGCCTGACGTTTTGGCCGTTATTTAAGAA GAACTATAAAATACGGTATATTTTCATTTTGCTGGTGTCAATCCTATATA GCACAATCAAACAATACAGAAACAAACAATTATAAAACTGTCCCTGAAGT TTTTTAGTACAAAATCTTATCTCTCTAACGCCATCCACCATAAACCAATA ACACTTAAATGAACGAGATAACCATTACTGAAGCCATCTATTGAAAACAT AATTTTTTTCTTTTTCCTATCCTTGTTTTTTTTAAAATAAAGTTTACTGA TTTCTAAAAATGCTTTAGATAATACAGTCGTTCTCAGACTTTTACAGTGT GTGTACAAAATATCAAAATCTCCAAGTATCACACTTAAGACCAAACTTAA 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