EMLSAT00000002844, EMLSAT00000002844-698691 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002844
Unique NameEMLSAT00000002844-698691
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s163supercontigLSalAtl2s163:675517..692578 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002844 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002844EMLSAG00000002844-685610Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000012643EMLSAE00000012643-721571Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000012644EMLSAE00000012644-721572Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000012645EMLSAE00000012645-721573Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000012646EMLSAE00000012646-721574Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000012647EMLSAE00000012647-721575Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000012648EMLSAE00000012648-721576Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779276auto779276Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002844EMLSAP00000002844Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002844

>EMLSAP00000002844 ID=EMLSAP00000002844|Name=EMLSAP00000002844|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=293bp
MKVIFLKVVKPPTIDEELTSDSLIITEGQTALLNCSASGDPTPKIYWRRQ
NANQMIRGLNKVEHSVLVLKSVQKKDAGNYLCIAKNAYPPAVSHTVKLFV
HYKPRVTLAHSTNFQTGETEILCAIDAFPEVSKHGLMVGDEYVKPSHRKR
FGKMELKAKVKVYKTTRVVCHGQNXLDEXSTTIFISGVSIPDPDSITKTF
DYSDDEEEDENYNTSTSSNLETINDHGNYYNLNAPTSQNPPSTPNTRKTS
EQRKRKRDRRKNHHLFSSTSFTSQSIGYAYQIFLVGILLYLHL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s163:675517..692578-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002844-698691 ID=EMLSAT00000002844-698691|Name=EMLSAT00000002844|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17062bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s163:675517..692578- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAAAGTAAGCAGCTTGTATATATGTATGTATCTCTTTCTTTTTCTTTC CCTCTTTTTTTTGTTATTATTTTATGAAGAAAATAGTTGAAAAGGGTCTT CGTCTAAGGAAACAACAAATACAATCTCATAACACAACAAGAACAATATC AGCGTCGACTTAGGACTTAAAGTAGAAGCTCGACTGAACACACATTCAAA CAGTCCCTAATATCTAAATATTAATTATCAAAATAATTTGGTAAATAGTT ATTCGGGAATCTCAAAAAATTATCTATTTTATATTCGTATATCTATAACA CAAACCATATAAATAAAGAGAAGTATATATTAACATCCAGGTACATTTAA TCCACTTTTGGCCTCTACATATTGTTCATTTTATCTGTAGCATGCCATCG AGTTGGAAGAAATCCTTTCTACGTCATTTACTCCTCCTTGCTCTCAGATT TACATTCGTGACTATGAGTAAATTCTTATTCAATTTTTTGTCTTTCTATA CTTCATTAAGTGAATATAAAACACATTCTATTTTATATTCGTAAAAAGTA GAGCCTGGGCTCTTTTCCGTCTTTTCTGACGTCATCAAAATGGTGGTCAA ATCTCAAAAACGGATCTTCTTTTGAAAAAGTCTTACATAATATGTATTGT AAATACGGCTAAAGGACTCATTGCAACAGATTCTTCCTCCTGATTTATGT TGATTTACTTTTCATTTGTTGACAGGGTGGGTGCCGCAGTTATTAGGATT TATGGGTCATATATATTAAATATGTTTTTCATTTTAGTTTGTAGAAAGTT GGAGGGGGGGGGGGGAGGGGGGATTTTTTCTTCATGTTTCCTTGAATTTA TTGTCGCAAGGACTTAGTATGTCTACATTTTAATCCCTACACATAGATAT CCCCCATATTGGGTGTCAGATCCCTATTTCCCCATCGCTTATCAAAAAAT TCAACAAGATCTAGTCAGTAAAATTCATGATAAGTGTCAGATGTAACATT TTCAAATAGGCCCAATATGGTTGCTTTAATCTAAACCTCAATATCTCACC CTCAGCCTCAATAATGGTCACATGGGGTGATGTTATTGCGAAGGAGCCAA TTGACGGGAGTGCTTCATCCTAAAAGGGAAATAGGCTTCATGTATATCAA TCAATAATATTTTGTCTTATTTGTAATTCTGATTTGTCTAAAATTCGGTA TATGCCCTATTTTCATCTTTTGGGCATTTCATTGTATTCAATTCTTTTGA CTCAGATTCATTAAGTGTAATTTAATATAAGTAAACGCTTCAGACAATGT AATGTATTTTTCTTTAGAATAAACCAGAAAACAAACTATTAATTAAAACC ATAGTTCATAGTATCTTAAACATTATTATGCTCTAAAAAATTATGAAAGT TATTTTAAAACAAAAATACATAACCTCATCTACAAAGAGTATTAATATTC TATATTTTTGATCGAGGTTACTTGAATCCTGAACATAATTCATATACAAC GTTTTTGTTTACCTAATATTTCAACCATCTTATCTCCTCTTTCCTTTTTA GTCTCTTAACTTCCTCTTGGCAAGGGTCTACTACGTCTTAAGACGTCTCT TGTGATTGGACACCCCAGCCTGTTTCATAATGTTCGTTTGAAAGTTACCT TGCTAGGTGGAGTGCGGCTATTTTGATTCAGTTGTCTATCTCCATCGTCT CTGTGATTGTATTTGAACGAAATTGTATTCAAATAAAACACAATTTTATA CTTTTTAGCCATGGTAGAATAGTTAAAATTGACTGAGGCAGTCTCGAATT ATAGCTCTTTTAAAAATGAGCAAATAATTATATAACACCCAGTATTTTGA TTCTATGAGGGGGAGGTGCACTGTTTAAAACTGTTTGCTGCTACATAAAT CACTCCACATATTCTCCCACATAAAACACATAATTTATCTTCAATATATA TACAGGAGGTCTCCAAATAACGCGATTTCAAACACTGCAGATCTGTATAA TGCGGTGTTTGGAATTATTTTCACTATATATTCCCTTCATATCGCGTTTT TTTATATTATGATAATAAATTATAAAAGACTATATATTGAAGTAGACATG AATTTTTTTAGATGTTGATGAGTTCGTTCGTACTATGTCTATATAATAAA AGTGTATAATTTTACATAAGGGGTGGTTGTTCTATAAGTATTTGATTTCA TAGCTAGACTTAAAACTTTTTTTCATTATTTATTATACAAACTTGGATTT AAAAAAAAGGTTGCTGAAGAAATATTACTTAGTTCCGATTATTTAAACTT TACAGTATTGAAATGACCAGATTAAAAATCAAATAAATACCCCATTAGTA TTAAATTTTACAATTATCTTGTCCGGCACACCATATTTTTGATAATTTAT CACGGATTAAAATGTCTTTATTTTCCTAACCATACAAAAAAACAAAGAAG CAAATATAAAAAGTTGACTTATAAATTTTTTTCTCCCATATTAAGGTTTT TAGTACTAAAAAATTCCCTGTACAACCCAAATTTCATATAACATGGATTT TTCTTGTTCCCCAAAATAGTCATAACCTTTGTACATGTATTTTATTTAAA ACTCAATAAGGATAATCTGGACAGCTAGTTCTTAAAATAAGAATATTGAC GAAAAATATCCTCATATATAAACTAGAAATGGAAAATATGTTGAAAAAGT TTTGAGTAGCTCCTAAAGTTCCCATATTGCAAGTTATCTACTTTCTATCT TTTTTCAGGGACTGGACGGGCTGTAGCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAA AAATAAGTCAAGTTGGTAGTTATATAATATATATTATGAGTATGATTTTA AAGTTTGATTAACTACTTATTAGTTTGAAGAAAGTTTACGATAGCGATCT GGGGATTAGGAAGTAAGAATTTATAGAGAATATTTATTATGCAAGGATTT CTTATTTGAAAAGATTTCTCCTAAACATTTAAAAAAAAAAAAGAGTTACT TATGAAATAATACAATTCTGGATTCTATGTATTATAACCAGGACTGCCTA GTCGGAGTCGGTGACATTTTTGTTGGAGTGCGAGTCAGGAGTCGGGAAAT TTATAGCGACTCCGATTACAAAAATATTTTAATTTATATAAAGGAAACTG ATTATAATCTAAGATTTATATTGAGTATTCATATAGTTTTTTCCTTAATG GTCATAAATTATAGGCATTAAGTACTTTTAATTTATAAAACTTATTAAGT TAACTAATTTATAAATCTACTTCACAAATTTCCAACGTGCTTTATAGTCC AAACAATCACAATTTTCAAACACTTATAAAGTCTAAATTATTATGTTGGG TAGAGCAGAGCCATTGGCTGGGTTAGTTTATTAATTAGATTTATGAATAG CCAATGTCATCAGAGGAAAGAGTAACGTTACAGGTAGAGGTTATTTGAAT TGTGTATTATCCAAAACTTATAAATGTATGTATTAGGAATATATAGATTT TGATCCATTTCATTTCTTGTTCATCTAGTTAAATATCTTATATCCCAAAT ATGGATATATATCATAAATATTTATGTAGTGACACTCTTGAAGGGGTCTT CCCAGTTTTAGAATCCTAGCTAGTGATGGAAAGATTACTAAAAAAAAAAT TCTTAATCCCGATGCAATTCCAGTAAATATTTTTTATACCGATTCTGGGA CGTCCGCAGGATTATATGTATATATATTAATATTGTTTTTTTGGGGGGGT GGGGGTGGGAGAGCTGGGTTTTTGTAATTTTTTGACAAAAAATCCCAAAA 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TCAGTTTGTCTACAAGTAAAATACGTTCGCAAAATATTATTTTTATTGGA AAATGAGTCATTCTTGTAATGTACATATGCTAATGCAAATAGACCTTTAA AGGCAATTTTTGGCCTTTACATTCTTGAGTGGCACTATCATAATAATAAT TTATTTCCTTTTATGAGAAGGAAGCGCAATCCAACTTCCCACGAATAGTA TCAAAATTAATGACACATCCGTGTACGGTCGAAATGCAACACTTCGATGT CCTGTATTTGAGATTGGAGGCCATCGTGTAAGTGATCACTTTTCAGGGTC GTCTGCAGGATTATATATATATATTAGGGAGGGGTTGTAATTAAAAATTC TAAAAATTATACTTTATGGAAAAAATTATTTTGAAAAAAAAAATTTCAGA ATTAAATTTTTGAAAAAAAATGAAAATCCACAACTATTCACAAAAATTTC AAAATCTAGAGTTGTTCACATTAAATTAAATTTTTTGAAAAAAAATTCCA AAAATTCACTGTTATTCACAAAAAACGTCATAAATCTATTCCACTGTTCA CATAAAATGAAATTTTTGAATTTTTTTTTTCCAAGAACTCATAGAAAAGT TTTTGAAAAATTCACAGTTATTCACAAAAAAATTCAGAGCTCTTCACATA AAATTAAATTTTTTGGAAAAAAAATTGAAATATTAATTTTTCTAGTACAA ACTAAAATTTCTTAATTTTAGGTGGGGGGGGGGGGAGGCAKCAGCCCCRC CACCRCACKCCCCTGCGGACGCCCCCTTCCCTTAGGGGTTAAGAGAATTC TTTTTATATCTACCTGTAACTAACATATATTTGCCCATAGGTAGCGTGGA TGAGATATGACACAAGAACCATTCTATCCCTACATGGAGAGCTTGTAACT CAGTCCAATCGCTATGCGATTATCAACAAGGAAGAGGGCTCTTATGATCT 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ATAAGATGATTGAGATAACTACCCTCCTCCATGTATGATTGTCCCAAAAG GATATCAGGACGCATACTGGGGCCTCAAGGAAGATGTGGAAGACATTGTA AATTGTAATTTCTTTGCAATCAACAGCTAATTATATGTTCTAAATATTGC TCATAGGAAAATAATAAAAAATGAATCTTAACCTCTCAAAATTTGCATAA TTTGCCCGTTATTATTATACGTTCTAGCAATCATTTATTATTTTCTTCGA ATTTATCTTATTCAATACTAGCTACGAATGAAGAATATCTATAAGGATAG TTAGGAACGTAGGACGGAATGGCCGGGATATCTGTTCTTAAGACTGCTGA ATTGTAAAAAAGAGAGCTATATAATTTTAATTCTTGTTCTAGGCATAAAT ATACTACTTTAAACTTCAGATATCTTGTCCCTCGAAAGTGGTAATGTTGA ACAGCTAAAAGGACAATTCCTTGTAGTTACCATAAAACCCGATAAGGACC GGTCCTAGGGCTGACAAATTTTATTAGGACCGGACTGATAAGACTGCAGT CTTATTAGTTTTTTGATCAATCCAACAACAGGGATGATTGCAAAATAAAT TGGAACGCTTTATAAAATCATCGCCTTACCTTAAAAAAAAAAAAATGTTA AACGTCATAATAAAAATAATTTAGTCCTCTCCAAAAATAATTAACCTCTA AAATATTTCAATAATTTGAGTTTGTCTCTTTAAACGACAATTTATTTCTG TAATAATTGTCCAATAAGCCAAACAAATCAAAGAAAATCCTAGTCAAAGC CTTGTCTTCCTTCCAAAAAAAAACGCCAAAAAAACTGCAGATACCCCTGA ATATGGTCACCCTAATCAAGAGATTTTATGTGATTACCTATCTCCATAGA TTCAATTGAGTACCTACACGGTAATTTACATTCCAGGTAATTTTTCTCAA 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