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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s164 | supercontig | LSalAtl2s164:613034..620556 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002859 >EMLSAP00000002859 ID=EMLSAP00000002859|Name=EMLSAP00000002859|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=404bp
MSKMIPVAGPKYDPLAELDIDELVDRLSPGEIQRLLDECDPDDPNIPPSM
RTNYKCEKNSTGPLDRKKLLDYINEQALNTPDVVDPVPYVPGCVRGKKWM
APPKPVPARSSNEETIELDIDFGDEYEMALNXATTDEIVDLAGILGLHSM
MNQDQFHSAQSDKWADKPDPSIGWNGITKATPLKQYPAEKPNTTNPSEVI
SRLKESDAEMKSANLNNVVVSESQFLEMFDALRHNDSLTELSLSNTTLGD
FATANLACSLKQNKTLEKLNIESNNISPPTLIKIFEAMNESQTLTEIKAS
NQQAQFLGNKVEMAITKHIEGNKTIMRVGLHFEFGDCRNRVAVQLQKNLD
RIRLKRVANKVKAQQEQKKPTPGSKTGETYITTTPQSERESQVNAIIVFL
FSFV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s164:613034..620556+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002859-698706 ID=EMLSAT00000002859-698706|Name=EMLSAT00000002859|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7523bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s164:613034..620556+ (Lepeophtheirus salmonis)
TGTGAACGTACATGCTCCTAGTTCTCACTCCTCGTAATATTATCATTTTA
TATATTTATTTGAGCAGTATATGCACATCAGTTGTCGTTAATTCTAGTTT
CATAAAAGGTGGGGACTCTCTTCGACATCTTCCGACCAGAGCTATTTGCA
CAAGTTTCTCTTTTTAAACTACATCCATCTCTTTAGATCCCATAGTATTG
TGTGTGTGAGTGACTATTCATTTATATATATTAGTATGTATTTTTGGCAC
ATCGGGATTGAGCTGAGAAAGGTGGACGTTGAATAGGATATACATTGTTA
TTATTGCTACATAGGTAAAGACGGGATCTTGCTCTTCTTCACTTGCCTCC
TTCTCTTATTTTCTCTTTGATTCCTTCAGATATTTTTTGTTTGTTTTTAT
TTTTATGCTTTGTGTGTTGCGTTTAAGGGCCTATGCTACATTAGATGCTT
CCTTCCTTCCTCTTTTTGTACAACATGGAGAGGGGAGTGGTGAGTGGTGG
ACACAAAACACTGCTCACAAGTCTCTCCTCTTCTCTTTGAGTCTCCGTTT
TCTAGTGAGATTAAAACAACTCTCCTTATTAGCTCAGATGTGTCTCTTTT
GGGGGCTCAAACTTGATACTTCGAAATCATCAAATGAACACATTTACAAT
TAATCTTGTTAAAACGCTTTATGAATAAAAAAAGACTTAACTCATGCATT
GAATACTACTCAATGCCAATTATCAACACTGATATTTCAATATAATTAAT
GTAACATTTAATGAAAAACTCTTTAATAGAGATAGATTTGTGCAATTTTT
GTTTTATTTCATTGATTAAGAGCGAGTAAAGTAAGATATTGGAAGAAATG
TAATTTTTCTTTCCATTATAATAGCTAATTTTTATCTACAACACGAAAAT
AAGAAAGTAATGTAATAATATATTTTAGGGTCAGATATATAATAAAACTA
GGGAATAGAGGGAAACAATTTTGATAGACGTTAAGGTTTATGTCCTATTT
GTCGGTTCATTCTGACATCCAATAATTCACTATTTTCCTTAATATTAATG
ACAAAAGGGTTTTCATTGTTATAAAATTGGTTGTTTAGACCCCTAAAATG
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TTCTTTTTGAGGGATAGCATTCACTCTTTTTTGCATTTTTGGTTAAATAA
GTCTTTAAGTTTATATGTGTGGTGTAGCAGAGACAAGTCATCCCCCATTT
CAAAGAATTGTATATATAGCAACTACATTAAAACAACACCCCAATCTATG
AAGCTTACATTTTCAAAATATTTTAGTTTATTATTTAATAATAAAGTGAC
CCATATGTAACTCAAATATGTGTATATACGTACTTCTAATGTATTAATAT
ATGCTATCTTTGCCAGATAGTCATGGAATTTTGATGAATATAGTAGATTA
TTATTATGGATAMAGCTTAATAATTGGAGCTTAATTCTATCCCACATGTT
GTGGTGTGAGTGCCAAATCATCGTCACTCAAATATTTACTTTACAGAATT
AAGTTGGGAAACTCCATTCTTTCATTATGAATAATGGCATTTTCATGTTT
CGACAATAAAATGAATGGGATAAATTCATTTTAATAGTTGGAATTTTTCT
GTTTTTAAATATTAGACTTCTAGGTTGACATATAAGCAATACCACTAATA
TTTGTTATTTTTGAGTTACGGCACTTTGGTACTCATCCCTAGATGTTGAA
TTGGATGCTTTTTATTGAAATTCAAATAAAACATTTAATTTCTAAAGTTT
GAGATGTAAATATATAATAGTCCTGTTAAGGTTGAAAAAATATAATCAAA
AACGTACTTTATAATATGTGGAACCTATTAATAAGTAATTTTCATTGTGT
TAATGGTGGSTATAGGKAATTTGAATAGAGGAAATAATGTATATGAGTAA
TAACATTATTTCAATTGTTCCTATGAAATCTAATCTACTCCCAAGTTTTA
TATCCTAGTACATACCTTTAATAGATGTATGCTTATTCTGAAAGGATACA
TTTTCAATTTACAAAGGCAGTCTCATTAAAAGAAATATTTGGTTAGTTCT
TCACAAATTAGTTATATATTTCTTATTTTTTTTAAAGAAGGAAATATATT
TATTTCATTTATTCATTCTGTGATGTAAGGAGATTTGTAAATACGTTTGA
ATGAAAGTTTATTTGCGGATATATTTTGCTTTGTCAAATTCTTGGCAGAT
TTGACAATTATCTCTTGAAGTATCCATATATATATATATTACATTATTCT
ACAAAGTTTTTAATCGATTATATTTTTGAATACATAATAAAAGTCTACAG
ACAGTAATTAAGCAGATAGAGTTGAGTCTTTTACTAATTTTTCTTTAAGA
CAAGTCCAGACTTGCTATTCATCCTCAGACGGATGAAAAACCAATGTATG
TTCATTCAAATGTACCTGTAAAACACATGTAATTATTACAAGCCCCAAAC
GATTCATCTTATATAGCTCCCTTTATTGCTCCGTTCAACACATACTATAA
TAAAAACGTCATTATGAAATGATTTAGTCTCACATTCATCTTTTAATTAT
GTTATTTTATAATAACACTTTTTCATAACTTATTATTAGAATAAAACTGT
AATTTATGATTCCTTTTATATAATATATATATCATTCAAGGTATTCTCAT
TATATAAATCTTGGCTTAATAGGCTTCTGTTTTTGACACTAAAATTAAAA
ATGTAATAAATCTTGCAATTTTTCTGTGTTTATATTTATACTTATTGACT
ACATTTTTCGATCTTATATAACTTAATCCTTAATTAGGAGCTAATTTTGC
GAGAGGGTATTTGCTTTTATAAATAGAAACATCCGATTTCATCTTGGCTG
CAATTCAGAAGTAATTCTCTAACTGTTCTTTTTGACTACGAAAGAGCAAA
AATAATTTTTCTCAAATGATTACCGAATGAAGAATCTGTTAGTTATTGAT
AACATAATTGTATTCCTTACAAACAAATCAAAGTCTATAATTATTCAAAT
ATACTAATAAGGCCCAATGATTCAACATTTATAGAATAATTTATATTCCT
TTTAACGTTTATAATAATAGTAGTAGTATTCTCCATATTGCCCATCTTGA
CTTTGAGTGTTTATAATTAAATAATGGCCTTACCTTTTTTTTATCTCCAT
GAATATTTATTTGAGTAACTTTAAAAAAATATATATATATATACGAGTAT
ATAGATTAATACTAACTACGATGGCTGCTGTACTTTGAAGTTAATTATGT
TATCACTTTAAAAAGACGTTAAAATGTATTTGAGTGCCTTTAATGAATAT
ATACTGCTTGATAAAACTAGATGATTAGTAACCGTTATTAGGAATCATGA
TTATTTGTTTTCTTTACTTAGTTGTCTAGTAGGTACTTCTTCATCATCAA
AATACTGATGATTTAATTATTATAATCCAAGGTGATACTATACATATATA
ATTATTCTATCCTTAAAGACCTGATTGTTGTATTTATGTGTGTTTCTTTT
TTAACTTTTATTTATTCGATAATGCAAGAATTAATCTTGAGTTGATGGTT
GGTTTTGTTTTTAATGGTTCATTCAATAACTTGTACTCGCTTGGCCTCTG
ATGGATAAAAAAATTGAACATATATCTTATGCCACTTATGATTTGGAAAT
AGTATAAGTGACTTGCTATAGTCACACTTAAGTTTAAATAACAGACCATA
TTGATCCATTTTGTAACGGATCGATAGACAATTAATTTCTAAGAACTATG
CAAACCTTGGCGATTCCTCTTTTCAAAATAAAGTGGTTCTATGTAGTGTT
GTGTCGGTCCTCATTTATTCGATCTAGCTCAGTCCAGTCTTAAGACCATC
GTTATTTCGTACTGTGAGTACCAGAACTGACATTAAAAAAAATTTGAATG
AGGTCATCAAGGACCTAAGTATTTAGGACTGTTGTCTAGGACGGAACCGG
ACATACACTGAACTGGACGAAACTACGGTCTTCCGTCTTAAATATGGACC
GACAACACAATTCCATGAACAAAAACGTTTGCTACGATAAATCTGTAATT
TTTGCAATATAATAATAATAAAAAAAATCAAAATCATTTGGTTTATGTAT
GTATACTTCGTGGCATTTTTCCTTCGATAATGAAGGGATCTTTTAATTTT
GAAAAAAAGATATTGAGTTTAGAAGAAAGTAAATAAATAAAAAATAATTT
ATTATAATTAAATTGTCTTTTGATCCGTTCCAAATATATGTGCAAATTCA
TCTTATAACTTGAACTCTATAGACTTTTCAAAGATACTTTTTGTCGCTCT
TTGTCACGTCCCCTTAGCATCTTTTGAACTCTTTAACTTTCACATTTTCT
TGGAAGGATTTTTTCACTTTTTTTGTTGATGTAGAATATTTTATGACTCA
TTCAATGGTATTCAAGACTGAAATTCTTCCTTTTCACTCATTTAATGTGT
GTATGTAGGTATTTTGCAATACTCAAAGGTAGGTTATATTTTTTTGCGAG
TAAGTGTGATTCACTCATCTTCATACATCTTTAGTATTTTACTTATACTT
ATATAAGGTGCGTCAAACGGGTTTAATGGTTTCAGTCCTTTAACACACTT
TTGTGTAACCATTGTGTAAGTCTATAGAACATGCATTAGATTGGTTCTTG
AATATTATATGCATGTATTGCTTTTTTTTGCAATGTCATTCAAAATAACT
CCTGGGTTCAAGGACGTCAAGGTGGAGAGAAGGATGAGTACATCAATTTG
TAACGGTTAACTCTTGTATGGAATATCATATACTATTAGCTAACAGATAT
TAATCATTATCATCTTCGTGTAAAGAGTTTGCCTATTTCATGATTCATAG
AAATAGATTTAGCAACCCTACTTTTTTATATACCTTTGTCTAGTTATTGC
AGGCTTATTTTTCCATCATTATTAAGCCAATTATGATCCTCATTCACGTT
AATAACAATGGATGTCATTCTTATTTTTCAGTATAACATTTCAAGATGAG
TAAAATGATTCCAGTTGCTGGTCCAAAATACGATCCGCTAGCGGAACTGG
ATATTGATGAGCTAGTCGATCGATTAAGTCCTGGAGAAATTCAAAGACTC
TTGGATGAGTGTGACCCAGATGATCCAAACATTCCACCTTCCATGCGAAC
AAACTATAAATGCGAAAAGAATTCTACTGGTCCTTTGGATAGAAAGAAGC
TATTAGATTATATCAATGAGCAAGCTCTGAATACACCTGATGTTGTAGAT
CCAGTTCCTTATGTTCCCGGTTGTGTTAGAGGCAAAAAATGGATGGCTCC
TCCTAAACCTGTGCCTGCTCGTTCATCCAATGAAGAAACAATTGAATTAG
ATATCGACTTTGGAGATGAATATGAAATGGCTCTTAATMCTGCCACTACT
GATGAAATAGTTGATCTTGCTGGCATCTTAGGTTTACATTCCATGATGAA
CCAAGATCAGTTTCATTCTGCACAGTCTGATAAATGGGCGGATAAACCGG
ACCCATCAATTGGTTGGAATGGAATAACTAAGGCAACTCCTTTGAAGCAA
TATCCAGCGGAGAAACCCAATACAACGAATCCTTCAGAGGTCATTTCTCG
TCTGAAAGAGTCTGACGCTGAAATGAAGAGTGCTAATTTGAATAATGTGG
TTGTATCAGAGAGTCAATTTTTGGAAATGTTTGACGCTCTTAGACATAAT
GATTCTCTTACTGAATTGAGTTTGTCCAATACCACTCTTGGAGATTTCGC
AACAGCTAATTTGGCTTGTAGTTTGAAGCAAAACAAGACTCTCGAGAAAC
TCAACATTGAATCAAACAATATCTCACCACCTACTCTCATCAAAATTTTT
GAGGTGAGTAAAATCTTTTTAATTTCCTTTGAATTTTCTCAATATACTAA
CTTATGCTTATATTATGCAGGCTATGAATGAAAGTCAAACATTAACAGAG
ATAAAAGCTAGTAATCAACAAGCTCAGTTTCTCGGAAATAAGGTGGAAAT
GGCCATTACTAAACACATTGAGGGTAATAAAACAATCATGAGAGTTGGAC
TGCATTTTGAATTTGGAGATTGCAGGTAAAGACAAAAGGGACTTTCCATT
ATGTTGTGTCACTGACGTTTTTTTTTGTTTTTGTATGTGTCAGAAATCGT
GTTGCCGTACAGTTACAAAAGAACTTGGACAGAATCCGTTTGAAGCGAGT
CGCCAATAAAGTAAAGGCACAACAAGAGCAGAAGAAACCTACGCCTGGCA
GTAAAACTGGAGGTTATCTAGGCGCACTCCCAGGTCAGTTAACTACGATT
CCACGACAGAAGTCTACTTCCCCTGATGGCGATGACGATGAATATGAATA
CTACGATGATGAGGATGAAGAACAAACCAGATAAATCAATATTTATCAGT
CATAATCATCATGAGAAGGGTTAAACCAAAGATTTATTTAGTTGGAATAA
ATTTAAAAAAAAAAGAAGAAGATCCCTTCGACTATATAAACAAACAACGT
GTTGTCTTCACCTTAATTCTCATAAGTAATCCATTATTATCACTTCATGT
TACGAAAACATGTTCATAGTCCTCTGTCTCTCTTACCAGCTGTTTTATAT
GCTTTTTATTTTGCTGGGGTTATAATTATTTAGGCTTTTTCACTCTTTGA
ATTCACTGAAWCATTACCCGCATTAAAAAAAAATATTTGTTTCTTTGNNN
NNNNNNNNNNACGAAAAAAAAATAAMAAMAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAARRAGATWAAAAAMACAWACATGGGTTTWTTTTAATTYTGAAATAT
TCTATATTACATCTATTGAATCCCAGATCTAATATACTCTTATATTTTGG
TTTACTTATAATCAATATTTACAGAAACATACATAACTACTACACCACAA
TCGGAAAGAGAGTCTCAAGTCAATGCTATTATCGTGTTTTTATTTTCTTT
TGTTTGAATTTATTTATTCATTTAAACAAAAATTAATTATACCTATTTAT
TCTGCCGGATTTATATTTTTTATAATTTTTGTGCTTGTTAAGATTTTATC
TCTCTCTATACATAAATATCTTCATACATACTCATTGTCATTTGCTAACA
ACGAATTAATAATTAATCTGTGAGGGAATTAACAACCATTCTATTCTATT
CTGGTGAGGGAAGCCTTCATCTTAGATTTTCTCAATCAATTTGAATCAAT
GCATTAGTACTACTATTATTAAATAACAGTTGGTGAAGTCCTAAAGTCCC
TTTGGCCACACTGTGTGTGTATTCATATCGTATATATTTTTTTCCAACCT
TCATAAGGTTCTTTAGAAAGAACAAGCGAAACTGTATCTTCTTCCCTTGC
CGCCTTTTGTGTAGTATTTATGATAGATGCCATTTATTGTTTTTTTATAT
TTTATGTTATGCATTAATTCACTATTATTATCATTTGAAATACATAGGTA
AATATTTAATTATTATAATATAT back to top
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