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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s170 | supercontig | LSalAtl2s170:60680..79972 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003000 >EMLSAP00000003000 ID=EMLSAP00000003000|Name=EMLSAP00000003000|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=384bp
MNMFLVLSFLFLYTTFVSANWQEWWXYDGISGPWYWGVINPSWAMCAKGR KQSPINIDPRALLYDPGLKYFNVDKRSLDGTLENTGQFLVFKVESDRMSK MPVNITGGPLAYRYQFEKMIFHWGNDMGRDLTEEDESESNEEDEEGRHAD PSHGGSQVRRGYRLVPGSEHSIDGKAFPAEIQLYGFNAHIFKNLSEAVHH PHGVVGVSILVQEAERGASPGLRPITSQLEEVTYKGQNIPITNLNLAEIM PDTDNYMTYEGSTTYPGCWETVTWILMXKPIYVTRSELLAFRQLMRGDRA SPKAPLGNNIRTLQGLNARNIRTNLNFDVSTDMVPSKKGSRFFHNKKNKG EKSKHRQPSMPVSCPDVLNGVRFQTSSWVKSMSP back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s170:60680..79972- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003000-698847 ID=EMLSAT00000003000-698847|Name=EMLSAT00000003000|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19293bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s170:60680..79972- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAACATGTTTCTTGTCCTTAGTTTCTTATTTCTATATACAACATTTGT
GAGCGCAAATTGGCAGGAATGGTGGRCCTATGACGGAATTTCAGGCCCAT
GGTACTGGGGAGTCATTAATCCCTCTTGGGCCATGTGTGCCAAGGGACGA
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ATGCCTGTGAATATTACGGGAGGACCTCTTGCCTACAGGTAAGGATCGTA
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TCTCACATTGAATCGGTGATATGTTCTTCCTCACCTTCAATAACATCTTC
TGATAAGTGTATACAATCATTTGTAAGTGTTTAAGCCTATCGTTGATACG
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TAACATGGTCCAATGTTTTTTTTCTAATATATTATTTAGCCGCAGTTAAA
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ATTATCTCTATTTATTATGAATCGACTCGTCTTTTWTTCATAAAAATACA
TGTGTATAAAGATATCGCTGGATGATAGAGGGAATTATGAATCCTTTGGT
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GTTTCTTTTCCAATCGAATGAATTATTCATTTTTAAGTTATACTTATTCA
AGTTCCTTCTTGTAATGTGTGAAGGATCCCTGCTTCTTGACATTACGATA
CATTGTTTGTTCTAGTATTGTTTCGTAGACTAGTACTCTAGTGGTAAAAG
GGTACGGAAGCCTAGAATGTTGACAATAGTTATAATGAATAAGCTCAAGA
AGATAATATGCTCATAGATGGAAATAATTAATGATGAAAATCAGCTGTAT
TTTTTAGCTTTGCCCGTTTTTTTTTCTTCAGCTTTTGTTATTTAACTCTT
GAGTAGTGAGCTTCCTTTTCTAGTATATTCAATGAGTTAGCCAACCTGGT
GTAACATTCGTGTACGCTTATAAAAGACAGAGAGTTACCCTGAGGATTCG
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TATTCTTGGATTTGTCCTTTTTTTATTTCATTCCTCCCCTTCTCACAGCC
ATGTCAACTCAGCTGTTGTACTCTACAAACCTTACAAACCCAATAAAAAA
GGACCCTGGATATTTATATTTGCTCAAAATAAGGCTGATCCGGATTACAC
CATTTACTTGATAAAGCTTGCAACTGTTTTCGTAGACAGGGACGACTGCA
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ATGTATAGTCCATGTTGGATCGGTCATAGCACACGTTGTTACCTGCATTC
TATTAGGCAGACTTTCCCCAAAAAGAAATAGAGTATACACCAGAGTTGGG
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GAAAATGTCGATTTATATTATCTCCGAAATTTTTATAATTTTACTTATAG
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AGAAGAACTGGAGAAAATTTCAGCCAGAAAGACTGATAGAATAATCTTTA
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TTATAACTGGTATACACTATAGACTGTTGTATTAGCGAGGTAACGCCGTG
AGGACTCCACTCAGTCTCTTTTCTAATTGGTCCTGTTTATTTCACCATGC
ATCACTGTAAAGTTGGGGATATGATTGAGCCAAAGAGAGGGCGTGAGCGA
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TTACAATTTTGGAGGATAGAATATGACACGTTTCTGCTTTACAAATGAGA
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AAACCCACACGAAACAACCTTTTTTTCTAATCTCAAAACTGTTATTTATC
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TCATTTGCTTACAAAATATTTTGTAATTTGATAAAACATGGTAGTTATTA
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GAGTATTAGAGAACAAATAAATAAATTTTGAAAATAAATATTGCCAAAAA
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TGAGTTTGTAGTGTTGCGATTTATGAAAATCCGTGACTTGCTTCAATTTC
TAATATGCAAAAACAATTTTTAAATTTCTTTTCATAATTTAAAACTTGTA
AAACTATTTTAAGGCAAATAACTTTACTACTAATAATTGTAAAGATCCAA
AATTGGTGCCGTCAGATAAAGTGTTATGTTCAAATGAAGTAATTAAAACC
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GTCGTCAGATCTAAATATCATAATTTATTTATAATTTCTTTTATAAAACA
ATTTTCAGTTGATGAAATATACTTACATTAATATTATATTTGTTAAAAGA
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AATCACATGTATCGTATTAAATCCAGATTTAAAAGACTTTCAATCAAGAC
CATCTATATAATAAAGGATTTCCCATAAAAAACTTTAAGATATTGTTCAT
AATACCTATTTAAAAAAAAAAAATTGGTACTTTTATTATTTTCACCTTAG
TTGAACACAAAATCGTAAAAATTGCGGTGGCAATAAAATATGTCTCTATC
TTTTGGCTTATCTTAGATTTATTATAACTGAGTCACAGATGACAGAAATT
CATTGATCAATTACTTATTTTGAAATCAAAGAATTGGATCTTTTTTCTAT
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CAAAAATGTACAATTTGAAGAATGTTTAGGAGAAGAGTAGATTAGAAACA
TGACGTTTTATCCACTTAATTTTGAGCAGCTTTGAGATCAACAAAATATA
AACAAGTCGAACTTTATATCTTTTACCTGTTGTCATTATTATTATTTAAC
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CTGATTAAAAATTCATTTCTGTTCATAAAAGAAGCAGGAAAATCCTGAGG
CTTTGTTTTGGAGTAATAATTGTAAGTCCTTGTTGGACTCAGACTATAAT
TGAGGATCGACATCGGAGTAATTCTTGCCAGTGCCCTTGTTTATTTCCTT
CTCTCCCTCCTTCCTTATGACAGCTTATTGTAGCTAATCTCCTCAAAAAT
ATTATCAGGGTTACCATGTTGATTTTGGGTTTCTTAACTTGGGGGAGTTA
TTAGGCCTCGACAAACAAACAAAATTTACTAAAAATTACAAAAATAACAC
TCCAATCAATCCTCAGTGTTACTCTCCGTTTTTTATGAGTACACTCTCAC
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AAATCTTAAGGAAATAAGTAACATTGCTCAGGTGGCCAAAAAACTCTCTT
GCTAAAATTCCTCAGAATTTACAACACTAATTATATGTACTCCGCCCTTT
CTTTCTTTTTAAATATGAGGCGTTAAGTTTTTTATCAATACACCCTCGTT
GCTACACCTCATATAAAGTCACATCCACTTTTCTTTTCTTTTTTAATTTC
CTGAACGAAGATAAAACTACACAGGCTCGTTGTTAATAAATAGTCATCCT
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AGAATAACAAAAAGAGTTTGAAAAAATAAAAAAAGAAACATTATTTCGAT
TGCCGACAACCTCAAAGAAACTCCCAGTTTAAAATGCTTAGGATTTACAA
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ACTTTGCTTTATTAATGTCAAAAGTTAACCTTTTAGTCTACGTTGTTCAT
GAGCAGACTCGCACGTAGTTACTCAAACCTTATATATCTTCTCCTGAAGA
ATGAAAAAATAGTGATAAAAGTTTTATAAGATAAAAATAAGATATTCTTC
AGGTTGCGGACAGCAACAACAAAACTTGCATGCTAAAAATGCTTAATATT
TACAATACTATATAAAGTTATTCCTATTTTTTTCCTTGCTTTAATATGAT
GCACTGAGCTATAGCTAATAAAGAGTCCTCATCAGACAGTCAAATAAACT
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AAACGTTACTCTCAATCATTCATAAGCAAAAACATTCCTGGTGACACTTT
ATTCTTAAGCGTTATTCCCTGACGAATAAAAGAATAATGAAAACAACTAG
AAAAAAACTCACACACTAAAAAATGCCTAGGATTTACATCCCTAATCATA
ATCATAAGAAAATTTTACTTTTTGAAAATAAAATTAATTCCATATGCAAT
TATAATAGTACTTAAGGCGGTTGATCACAAATCTGTAATTAGCTTTTCTG
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GTAATTCATTTGCTGTCTTTTCATTCCTTGTAAATTAAGTCCCCGCAAAA
TTCATCCCCGGATGTTCCTAGTAAATTAATTCACTTCAATATTTATTCCC
AAACATTTCATTCTTATTCTGGTGAGGGATATTTAGTGACGTCATACAGT
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AAAAAGTAAAACAATAAATTTAGATATAGGTAAATAATAGTGTCGAAACT
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GGCCGATTTGGACCAATTTTTTGTTCCAAACAGGGGGCTTAGACCATGGA
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TTATCAATCTTTATTGATTTTTTTTAAGAAAATTTTAAAAATACACCATA
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CTGTTAATTTGTCCATAAAATAGGTCTAGACTCAAATTTTCCGTTGGACC
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GAGGAGAGATGAGAGTATACAAGGACATTGAAAAGAATTATTATTAACTC
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AATACACAAATTTTATATCAAGTTATTCAATAATTCAAATAGAAAAATCC
GTTGTTGATTGAATTCATGACTTAATTACATAAATTTCCATGATAATTAG
GGTGGATCTAATTAACCTCTTACCAATTTTGAAATTGTTTCCATAGATGA
CAATTCTGCATCATATTAGAGCATCATATATTATGTAGATCAACCCATAG
TCATAAAGTTATACAATTTTCAAATATACCTAATTATGTAATATCTGCAC
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ATTATAATTTAAGGAGACGTCATTTAGGGGTTCAATCATGATATTTTTAC
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CAGGTGTTTGATAAAGAGAAACAATAATCGAAGAAAATACCCAGTGAGGA
ACAAAGAGAGTTATCATTAGTGATGTAAATCGTGTGAATTTTTTACCTTA
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTAATTGGTAATCTGAACAATAAATT
TCATTATCCTTAGCGGTTGGCATCATTACTTTATTCCTGAGTAGTGACCT
TCATTTTCGAAATAGATTGATTCATTTATATTCAAATCCTGATTGAAAAT
TCGTGTGTTCTCATAAAAGAAATCTAGGATGTGTTGCAGAGTTCTAATTA
TAAGTTCTGGTTGGACTCGGAGTAAAATCGAGAATCGATATTGGAGTCAT
TCTTGGCAATGTTTATGTTTATTTCCTTTTTCCTCTCATTATTTTTAGCG
GATCTATTGAAGCGTCATTACAGCTTTTTCAAATTGTCAAGMTATCCATA
TTGATTTACAGTTTCGTCTTTTTTAACATGTCCCAAAATGCACACGATTT
TCATCACTACTCAACATATTTAACGTCATATTGCTTATCTTTTTCTCATA
CTGCTATTATCATTCTCTTTTAATATTTAGGAAAGAACATCTATGTATTG
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TTTTTTTATTCGGTTACTTCAAATTAATACATATATATGAACAAAAAAGA
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AAATTTTGTCTGTTTGACGACGCCTATGTCTGGAACTATCGCTAGTATAT
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TCATATTATTACAGTAATATATTATTAACTCTTCGTTGTACAATTGGGAT
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AAAAAAAAAATATCCTGTTTTCATGACTTAATTTTGACAAACTGCATCAA
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GTTGTATCACCTCAAGTCAAAAAAAAAATTATATTGGATCCTTTATAGTA
TTTTTTCGAATATATTTAATTTTTCAATTTTTGTATGGATGTAGAGGGAG
TTTTATGGCTCTACGAGCCCTGCCTGGTCATTCTAGTCCGCCCAGTTTGT
GCTACATATCTCTCTTCACTCTTCGTATTAAACTTTTATCCAAATAAGCT
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CCCCCCCCCCCAACCTCTTTCCCCCTCCGACTCTTCATGACAGCAAAATA
CAAAAATAATATCAAGGCTCCTCCTTCTATTTAAAAATGAGTATAACTTT
CTCTCTTCAATAAAAATCGGAATTGTCAAAAAAAAAAAACTCTCTCTTTT
GCAATTTTTACATTAAAACATGTTTTCCATCATGTTTTAAAACTTATTAN
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GGGAAGGGGCGGTGGATAAAATTTAACTTGTCTTTGGGCCATCAGTTTAC
CTGACAACCCGTGGGCTGGAGTGTGTACTATAGAATATAGGAAGGGTTCC
TTGTTGACTAGAAACATGGGGGTTGTAGAGTTAAAGTCGGTCCAGTATTT
CACCTGTACAACCTGAAACCGGGGTGTATTTTGGGATATTAAGAGGTTTC
CTTCATGCTCAAAGAAGTGGCTAMGAGACTGCAATTTCGGTGTCTGCCCC
AGAATAAAGCATCTACTTCCTCATGGCTTGAAAGAAGAGGGGCGCCTTTA
TTTTAGTATTCTCATCCTCATAAAAACAACATGAGAATATTTTTTTTTAA
TTTTCATCTCTTCATTTTTTGTTTCGAAATGTGCAAAAGTGTTCTTAATT
AATATTAATTTTTTAATATTCCGGGTAACGTCAGGCAAACTTATTTCAGT
TATTTTTATATGAAAACTATTGCAGAATGTCAATATGGGGCCTGGAAATT
AAAGGAGTTAAACCTGACTGTCTATCAAAAAAATATCTCTTTAACTCGTA
GTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTACAT
CGTTATTTAAATTTATTTATCTATTGTAGAGGATAGTCAACAAATACAAT
GAACAGAATAGGATCATTTTCTCATATTATCCCACTAATTGATCCAAAAA
ATTAAATGACTGTACAAATCTAGCCATTTTGAGGGATTTTAAGTCTCTCT
TTTTTTTGTTCCTTTTTAATCATTCTTGTGTGTCTTAACAGCACCCTCTA
AAAGAAGAATTATCGTTTATCTTTGGTGTAAATTTGTTTTAAAAATGACT
AATAAAATAAGTATATGTCAATTTCGATACAATTATAATACTTTCTCTGG
AGTAATGTTATTTTAAATGTAGAAGGTTCTCCTTATCATTGTAAAGGGTG
ATTCAAAACGAGCGGTTTTTGGATTGTAGAAATAAAACACAAAAATAATA
TATTATGGTCAAAACTTAAGTATGAACCGAAAAAACCATCCTTAACAATT
ATTTCTAGAAAATAATCCCCTTCATATCTTGGCCGCAACTGGCATTTAAA
TGGTCCATTCTTTTGCGCCAATTTTCGATGACTCGTTCGAGCATTGTGAC
CGGAATTCGTTGCCTTGTAAAATGTTATTTTATGTCTGTATGGTAAGCTG
TGATAAATATTTAACTAACAACAGCGGAATATGTTTTATGCGTAACTGAT
TATATGGCAAAGCAACGTGGCAAATATTGGTTCAATTTGTGTAGAATATT
TCACTTTTAACAAGGGGGGCGAGACATCCCAGGAAAGTATGTACGTGAGG
AATTTGAAAATTTATTTCATGTCGTATAAGCATATTTCCATACTTATAAT
AACGGAATGAAATATATAAAAAACAACAGTCGTGTCTAGTGACGAAAATT
ATGTGTATTTTGTCAATACAAACAGAAACTAAAAATCATTATGGTAACCC
TGACAATTTCAAAAATGTATTGAAAGAGAGCAGATACAATAATATACTAT
GACAAAATAGGAGGTGGAAAAGTAAATTTCCAAGATCATTGAATTTCTCC
GATGAGATCAACAACTGATTTCTTATAACTCTGCTATAAATCTTCTGTGT
TACACTCTGTCTATCCCTCACTAGTGATTGCTTTAGACATAAATGTTCTT
TCTTAAAGAATATCATAATAATACTAACACCATAGAAGCTGGGGTCCCGT
TTTATTATAATATTGTATAGAAAGATATGTATGTGTTTTTACCATGTTAT
ACATTTAGTATTTCCATAGCGAAAGCAATAAATTAACTATTACAATGGAG
GGAATAATATATTTTGTTTCTAATTATCCTACTTTAATTGTCCCTGATCG
GTAAAACAGATATGTAAAAATAGAGCCAGTTTATTTTCAATACATTTTAT
TAGTTCGATTACATTCAAATATCAGTCCTTATAATAGAGATCAAGTAGGA
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TTCATCAAGATTAGCTCTGAGAGCTCAAGATATACTTTTTGTTCTGGGCT
CAATATCTCAGAGTTGGATTGATGTAAACGCGTCAAATTGACAATCAAGA
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ACAACAAATATTGAATGACGGCTGGAACCTCCGTTTCGTCCATTTTCACA
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