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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s178 | supercontig | LSalAtl2s178:595722..610138 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003251 >EMLSAP00000003251 ID=EMLSAP00000003251|Name=EMLSAP00000003251|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=342bp
MKYLYCLVLACIIPLIQSETGKVEDDINAISLIQSKSSYSASERLDNQIS
YLIQRLPGLISTARDKINGAQSGEELRFKVYGVTVILASFKEIVADFLIS
DRNIINFGGSDTIYTYGFLFFYGLGFGFGSIWAVGPYSDLPCGPSDFKQL
INEYGLQNGVVPYLNGYDNPLSLSTRVCEFEILAYMKLNCVLSGENDHIE
AAEALSQAMYGFGYVGPFYLELEEARXDCGLSDFDNALREYAYVTDFSTT
YGHSYTGSSDTDPHLLTYYVIKMKHALKRSIYCITSRKGSNQEAVITNSL
IDLYAKLATERLSLTDGILSTSNNVENPTYQGASQSQYFFNK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s178:595722..610138+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003251-699098 ID=EMLSAT00000003251-699098|Name=EMLSAT00000003251|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14417bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s178:595722..610138+ (Lepeophtheirus salmonis)
CGCGAAACCAAAAGTCGCAGTCCAGTTTTATTTCTTTGAGAAACCATCAT
TTATTTTGTTTTGAAATTTCAACGTGTGCATTCCATCAAAATATTTATCC
TTAAGGATTTAATATAAGAAATCTGTTGGTTACTTCTCTTTCATTTCTCA
GTTTATAAGAATATAATATATAGGTAAGAGTGTTTATTTTCCCCCTTCTT
TCTGCTTTACTGATGTCACGATACCAATATTTTGTTATCAGTTCGAGTGT
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ATATAGAGCATAAATGTTGGTAAGAGCAATTCAGAAGTAGGATTTTTGTT
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GAAAAAAGGACCTTTCTTTATAACTATTTTGTTTTATTTTTAATCGAAGG
ATATTTCATTTTATTTTTTGATAACCTGTTTTGAAAAAGGTCACATCTTA
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GGTGGAATGGCCATTAGGGGGGGGGGGGGGGATCAATAACTTTTGTGAGA
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TTCAACAATCAACTACTCTACGGTCCGTTGATTTAACTTTATTTATTTTG
AATTGTTTATTATTTTAGTCATAAACCTTCAAAGTAAGCATATTTGTTTG
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AAACCATTATAACATTTGATGAGTTGCATTCAAATACTGGAAAAATACTC
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GGTGGGTATCCCACAAATAATAGAATTTGAAATTAATGCTTTAAATTAAG
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CCCTTTGTAAAATCTTAACCACTAGGTGGCCCTCACATATTAAAAAACTT
TAAAAACTGATTTTATAGTTATACTTATGATAAAAGTATGGTTTTGCTAT
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GCATATCTTTGGCGCCCAATTTGAGGATGAAGGATTGCACCATTTTTTTT
TAAAGGCCCATATCTCGCTAACCACTTGTCCGATTTTGAGATTATTTTTT
TAGGTGATCATATTTATTGAGATTCTATGCTACACCGTAGTTAAAATAAA
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GGAAATTACCCATAATATATTACAAAATATATAGACGAGTATATTGGAAG
GAATTCAAACAGTTTAACATAAGAATTTTAAATTAAAAAGGCTTGGAAAT
TTCAGCTTGTGATATTGGGAGCGTACATTGGTATTTTTATCGTGTGAATA
TTTTTTATACTTTTTTGGGATATTTTGAGGTATTTGTATGTTGGAAGATG
TTTTTTTTTAAAGAATAAATAATTCTAAATAGAATATTTAATAATCAAGT
TTACTCTGAGAAAAGGTAAAATTTATATTACTCTTATTTATTAATATGGT
ATTCAAATCCAAAAAAATATTTAAGATTGAAGGAGAAAAACCAATTTTTT
GAAATGAGNAACAAATATATTTTCCCTCAAATTGTGAATTGGTAAAATAT
TGAAAATAAACTTATATTAGTGCAAGACTATACTCGGATGCAATCTTTAA
ATCGATTGAATCATTAAGTGATATGGGTGCTCTTAAAATATGGGTTTTCT
CAGTCAAACCAGCTCCAAGTAATTACCCCAAAACAAATGTAAGCACTTTT
GACATATAAGAAAAAAACGACCAAAATTAAAATGTTAATCTGACAATTTG
GAGGAAAGCGGCTAAGATTGTCCTGTCGTTGCATAAATTAATCCCACTTT
GTACCTAGAAAAGAAATAGGCAAAATAGACTCTGATCTCGATCGTCAATT
CTACGTATAACTCCTTAACAATTCCTCAGCATTACTCTCCGTCAATCAGG
AGCATCTTCACTCGAGGTTCAACTTTATGCATAGATGTTATCTCTTTAAG
AAGGAAACAATAATGATGACAGCTTTAGATGAAGAAAAACCCTCTTCAAA
TTATCAACAACTACAAAAATCCCACCCTAAATAGATGCTTAGGAATTACA
GCCCTAATTATATTGAACAATTTGGCTTAAACAATTTTATTTAAATATTC
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GTAAACAAAAATAAATAAACGAGTTTGAGAAACTATACATAAATGAACTC
TTAATGTTTCATAAGATATTTCTGATGTAAGCTCAGAAGTTTGAAGACAC
ATTTTATTGAGAACAATTTTWWTTTTTAAGCTTGCTCATTAATGNNNGGG
GGGRTTACGCATATTTTTTAAAATTTTAATGGCGTTACAAGTACCATTTT
CGCCCATTTTATTTTGATTTCTTAGTACAGCTTGAATTGCGTCAGTATCC
CAGTAGTACCACTACAATACCGGTTGACCGAATATCACTAGTATCTATAT
ATATCTTTCTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCTTCGA
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TTCAAACAGAAGTTGAACATAATCAGCAAAAATGATAACAGTCTCAGGTT
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TTTAATCATAGGCCGTATAATAATAATCTATTTTTTCCAATTGAATTGCA
TGATTATAAGTCGTATACATATATTGTACAAATAACCCGTAATTTAAAAT
ATTTATGCCTTGATTAGGAATAGAGCAATATCGTAAATTAATGGTTTTTT
TTACTATACATACACATTGATTTTGGACCGCATATTCTTCATGCTTGTCA
TTTTTCTTTCACAAATTACTAGCCTGCTCAGGTGAATATGATAAAGAAGC
GAGCCATAATATGACATATCTCTTTATAGAATAATATAATACTCGTGAAG
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ATTAATTCATTTACTTTAAAGATCATACAAAAATTTAACAACGAGAAAAT
AAGCAAACCTTTAGCATGTCTATCTTAATTACTAGTTCCATAAACTTATT
ATAGAGATTTAGACATGGTAAACCCTGTTTTGTTCTTCATATCATGATTC
GACTTTATTTTTCAAATTTCTTTAAATAGTCATAAATACTTCTATATAAT
TAGTAATAAGAAATATTATTTATCGTTTAAAAAGTTTTTAAATTCTCAAA
AAGTGGGCAGCTAAAATATTTTTATCTAGCAGATATTTAGAAAAGGATTA
TTCTTTGCTATTTGCCAAGTTCTGTAAACATAAAAAGAACGACCAAGAAC
TTGTATAAAATCTAAAATATTTCATAATCAAAACAAAGAGTTATAAATCA
TTTGAAGCTTATTTTTTTTGTAGTTCAATGATTAATTATGATTTATTTGT
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ATCAGGCATAGTTTTGCTTTGTTCTGACGAAAAAATTACATAATTTCAAC
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TCCTGATGAACACCAGACTCTAATATATTCATACGATAATTAAATAACTA
TCACTTNNNNNATATTTTATGTTTGACTCCTCATTAGKACGAATAAAATA
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TCATAATTAATTATATAATATAATAATAGCTGTCCCTTCAATTCTTACAA
CTATATAATTAATTGAAGAAACAACTTTTTTTTGCTACTTCTCCCATTAT
TAAAATTGGACATTACATGAATTTATAATAAAGAATAATGATGTAAAAAG
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CTTGATATTATAAAATAATCATAGCCAATCTTAGACCATTTTCCATTTTG
GTTTTAATCAATACAAAATGGCTAATCTAATAGTCATCACAATCATTTGT
ATAAATGTATGATGTAGATGATTGTAAACATTGCAATTGAACACAATTTG
GATAAGTAAAATTTTATTTTAGACAACTTTCCGTAACTTTATTTAAATGA
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TATTATTTTATTCCCCTTAAAATGTGTCTATCATCAAAGAAAGCTTTCAT
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TCGTCTTGGCATGCATAATTCCTTTAATTCAATCTGAAACAGGTAAGATT
AGAATCATTTTTTAATTGTTATGTATTTAGGAAGTGTTAATATACTAAGG
AGTACTAATTACCATAAATATGATAGGAGAATAAGTTCGAACTTTGTTGG
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ATTTCCATGTAATGTGTTAAGGGGGGTGGGGCAACACTAGAGAAGCGGGA
AATTTGAAATCTTAACTATTATGCCTGGAAATATGCTCTTTAATATACTT
TACAATAGCTCCTAAAAAAGGACCTAAACAAAATTTCTATGATAAGTAGA
GTTGAAAAGGATTTTTTTTCTTCTTTAATTTCGAATTCCCCACTTCATTT
CTTACGTACAAAAGATCGTTTAGTAGTATTTACTTTTTTAAAGACAAAGA
TAATGAGTTAAGATAATTCAAAAAATCCTTTTCAATCTGATATATTTCCA
GGCAAAGTTGAAGATGATATAAATGCAATTTCCTTGATACAGTCAAAATC
AAGCTATTCTGCTTCGGAGCGATTAGACAATCAGATTTCTTATTTAATCC
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GGCTTCATTTAAAGAAATAGTTGCTGATTTTTTGATTTCTGATCGAAATA
TTATAAACTTCGGAGGTTCCGACACTATATATACCTATGGGTTTCTATTT
TTTTATGGTCTTGGTTTTGGGTTTGGTAGTATATGGGCTGTTGGTCCATA
TTCGGATCTTCCTTGCGGCCCTTCTGATTTTAAACAATTAATCAATGAAT
ACGGACTTCAAAATGGTGTTGTTCCATATCTCAATGGTTATGATAATCCT
TTAAGTTTATCCACTAGGGTTTGTGAGTTTGAAATCCTCGCTTATATGAA
ACTTAACTGTGTTCTCTCTGGAGAAAATGATCATATCGAAGCAGCTGAGG
TTCTATTTTCTCTCGAACAACTAATTGAAGCTATGAAAATCCGCATTGAC
TGGGAAACAAAATAATAGGCAACAAGTATTGTTTTAAATACTATTATCCA
TTTTATTAGCATAGCATCGCCGAGTGTTTCTATAACATTTATAGGATCAT
ATTATCAAAATTGGATTGTTACAACTAGAATATTTTAAATAAAAATATTT
TTTGAATATGACTTTGTATCCTATTTCATATATTATAGAATAATTTCATG
AATAAATTATCTGAATCTAATAATACTTATGACTTTTATTTAATTATTTT
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TATTGTTTCACTCTTTTTCAGTTTTCACTCATCGTTCATCGAGGTACAAT
GCTCAGTCCCTTCATTCTGCTGCATCAAGTATAGACGAAAGAATGCAAGG
GATACTTGGTCAAATACGTAGCACTATTCCTTCATCGATTTCGAGCATAG
AATCCGATATAGCGGTTTTAAATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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AAAACAACTTTCCTTTGGAGATCAGCTCAATGTATGTCGACTAGTTATTT
TACTCCTTACTTTAACATTGTAGTTAAAAGATATGTTATATTCTTTAATC
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ATTTTATTTGGAACTGGAAGAGGCTCGMCYAGATTGTGGRCTTAGCGATT
TTGACAATGCCTTAAGAGAATACGCATATGTTACGGACTTCTCCACGACT
TATGGTCATTCATATACTGGATCAAGTGATACAGATCCACATCTTTTAAC
TTACTATGTTATTAAAATGAAACATGCTCTCAAGAGGTCCATTTATTGTA
TAGTAAGTCCTGCATCATATTCTGGTATTTAAGTATATATATCATTTGTT
TCATCTTTTTCTAGACAAGTCGGAAAGGAAGCAATCAAGAGGCTGTTATT
ACCAACTCATTAATTGATCTATACGCAAAGCTGGCCACTGAAAGACTCTC
ATTGACTGACGGAATTTTATCAACATCTAATAATGTTGAAAATCCCACAT
ATCAAGGTGCATCTCAATCCCAATATTTCTTTAATAAATAAAGTTTGTAC
AAAGTTGTGAAGATCTTTAGTTACATATTATTTACGCAAATGTTACAATT
GTACATAGATCATTTCTTTCATAAAGAAATGTACCTCTCCTAGAACGATT
ATAAAGGTTCCTCAAAATGTTTAGCCACGTTTTTTTTCCTTATGATTTAA
AAATATCTATTTTGTAATTTATATTTAAACAATACGTGCTTTTATAAAGT
GATATTATATTTTTAAAACACTAATATATAATATAGCGAATCTAAATCCT
TGAAAACAAATTTAAAC back to top
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