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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s205 | supercontig | LSalAtl2s205:188647..199998 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003791 >EMLSAP00000003791 ID=EMLSAP00000003791|Name=EMLSAP00000003791|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=333bp
MDPQINQYGEVNQLGGMFVNGRPLPNHIRVRIIELAQLGIRPCDISRQLR
VSHGCVSKILARYNETGSILPGAIGGSKPRVTTPKVVNFIKDLKQKDPGI
FAWEIRDKLLSDGVCDKYNVPSVSSISRILRNKIGTLNHLSGHTHYNSKQ
VSHSNNNNISSSDNNHTNSSGGLQPSQQQILPSPHSPGHQXHHAPIYPSF
YQPYPSHNNNSITSQEPXPPXPSNVSAPDDPLNKPMESKWHNTSSPTDLF
MTYCGIPPHNPISPPPSMKPIHHSNSSLSPAPPPPPPQTPMTFDPTFHHH
THHHHQNINYYIQQRRWGGTSPTTQWEFDPSSY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s205:188647..199998+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003791-699638 ID=EMLSAT00000003791-699638|Name=EMLSAT00000003791|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11352bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s205:188647..199998+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTTCCATTCAAGTGCATCTAACACTTTAATGTTTAATAGATTAATTATTT
TGTCAAGGATAATTACTCATCACAATTCGGAACTTCTTTATATGAGTGAT
TTCATGGTGAATTAGTACAGGCTTCATACTCATATCTCAGGAGCCACATC
AAACAACGGAGTAGGTGGCATAGAAATGGGTAAGTCCTCAAAAATTTCTT
AGATGTACACTTTTTAAAAAGTCATATTCCATATTATTGTTGTATCAAAA
TATTTAAATTTCTTCAAGCTTTCGAGTATACAATACCTATGTAGTTTATT
TTGACTATTAAGGAAGGCTTTAACCTCGAGGGCCCAAAAGTAGAAAATCT
ATTTATGAATAAATATTTTTCCATTTGAAAGTTTACATCTCATTAGCATA
TTTTTACTATTAACAAAGAAATGAAACTTCAGTGCACAGAGTTATGAAAA
AATAAAAAGTAGTTATTCAAACATTTCCCACTTTTTCATTCCATTTCTTT
TACAACAAAAAAGCCTCTCATTTGATATTTATAACTCTTTTATTACATAT
ATCTCTTATATATAACATATATGGAGGAAAAAAAAGTTCCCCCTGCCTTG
TTCACAAATTTGTATAAATTTAAAATTCATATTATTTTGTTAACAAAGAC
ANGATAATAAAAACAAACATATTTAAATGTTGTTGAATTCCATGTCTAAT
TAAAACTTTTTTTTTTAATTATAACAAAAACCTGAAGGTCAATAAATGAT
TAAATATTAGAGAAAGTCAATGGATATTTACTCTAAATTATATATAATTT
GTTAAAGTTTATTCATAACACTAGTCAACTGAATATCAACTTTGGAGTAG
GATGATGTGTGTTCTTGATTATTTTTCGCCAGCTGGTGTAACTTTATTCG
TAACAAATATAAATGTTTCATCATAATCAAACGCAAGAAAGCTTAGCAGA
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TAAAAATAAAGATAAAAACAAACAAAGAAGAATTAAAAATAAAATAATTT
ATTATTTTGTGAACTGAGGAATAAGTCTTTAACTTTGATGTACTTAAGTA
AGATTCAAGTCTGTTTAGTTATTTTTGCATGTGTTATTTGTTGACTTTTG
GTAATAATAAGAGTGTTGACTTTGCCTTCCCCCTTTCTACAATGGTATCC
TAAAAATTCATCTCTATCAGTGGTTGACCCGAAATTTTCGAGCAGTTCAT
ATGATATCCACTCCATAGTTTTTTTAAAAGACTACAATTTCAGTAGAGAT
AGTCAGTAGTTTCACTCACTAAATTGAAAAATAGGCAGCTACTCATCTGG
GCTTTAAAGAATTTGGCTCCAACCTACAGCAATCTCGAGAGTAAGCAGTA
TTTGAACAGGCTTTCGTCTTGAACAGCACCAAGGGGCTTTTCAACTCCCT
AGTGTATGTTCTTGATTGCTTTTACCTTTATAAACAGGGAAATGATCTTT
ATTATCTTAAGTTTCTGGTGTCCTGGTTTACAGACTGTACTTTTTGCGAA
GTATTTCTTACAACATCTACCTAAATGATTTAGTATTATCTTTTGCCTTG
ACATATCTAAATAAAAGGAAATAAAATAAAATATATAGATTTAATAATAT
GCGTCATATTTAAGTTGATACAGAAAATTATTCTTCAAACTTTATTAAAG
ACTAGTTTGTGAAGAGAGTTAGAACTAAATTCAGTTGATTTCCAGTGAAT
TTTAACTGAAATCTACATTTTTTATTCAGTCAGGCCTCTCTCAGCCTCAA
TGAGAGACTCCACCTTCTTTCTGAAGGCTGCGCAAACCTAACGGATTTAG
TCTTCTGAAAAGTCAGCCTTGATGGTGGACTTCAAATATCTCACAGGCTT
GTTGCAGGGGGTCCCTCGACCTTTGCCTAGATGGAATAATCCAAAAGATT
AAGGTCGAAGGAGCTGAGTGGTCACATGCTTTTGGACACATTTAAAAACT
ACTATGCTTTAGACAKCCTCTTCTCCTTTGTTGGCATCAAAATAAGATGT
ATCCTCCACCGTACTCATTATTTTACTCCCGAGTAATCTGTAATGACACT
TTATGATAGTTTAAAATCGGAGCATTTCTTTCAATGTCAAGTTCAATATG
ACGCAGGGCGTATGTACCTATTTTCAGATTCAAAAAACGTATTTATTTCA
GAATTTATATTTATAAAAAAATTAAATTAAAATTAATATTTTAATAGTTA
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GTTATTTATTTAAGCACTTATAAAATGGGATCTTTTTAATTCACAAAAAA
AAGCATAAAAACACACGATTAAAAATTGTGCCTTTAAAAAAAAGTATTTG
AATGAAAACTTGATTAGTTGTAGACAATGAATACATAAAAATTATCCTAA
GCCTCCGATCCTAAAGTTCTTTGCCTGAGCAATTTATCAAGGTTTGAAGG
ATTCCTAGACTTATTTGAACGTGTGAAGTAGAAAAATAGAGGGAATTGCT
TAGTTCGATTTTGTTGATGCTTTTATACAAAAGGGATGATGATATCACCA
GTTAATTAGTCATGGAGATCCATGTTTGAAACGAAGACTCCAAGAGCCCC
TATCCATGTTTACCTCGTGGCTTTGTAAGTTATAAAAGCAGACATTTTGA
CATTTTCATGTGTCTCGAAATAAAAGCTTTAGGAACACACCATCTCAATC
CTAGGGCATAAATTTGTTGACTAGTGTAATTAATAAGAGAGTCCCTTTTA
ATATATTGCATACAATTTTGAAAAAAAAGGATGCTAAAACTCAAGTTTAT
GTCTTTTTTCAGAAGAAGGTTTCAACTCATAACTTACAATTAGGATCGAC
ATACATATTATATCAAATAAAACTTTTCTCTTTATAAATTACTCATTCTA
ATTATATTTTTTTTCTTTTTAAGAAAATGATTAATATACATTTGAAAACT
CTTGAGAACTCTATAGACGAATTTCTATATGTAAAAAAAAAACCTTCATT
CTACAAGCAATAAATTTAATTTAATTTTTAATCATTTAACCATTATTCTT
TGACAAATAAATATATTTTTGAATGATCTACAAATAAGCAGATTGAATTG
AATTTTGAAGATGTTACTTCTAAAGACTTATAAGGAGAGGATGCTGGGAC
ATGTTTGTATATAAGGGGGGGGGGGGGAGGTCAATTTMCCTTTCCACACT
GACCTTNTTTCCTTTACATACATGAGTCTGCCTTATCCATCTTGCTGACA
TTTCAAAGAGGGGTAGTATTACTTTACATTTATAGCGATCATATGAGAGC
AGATGGGAGTGCTTGGAGGAAGGACAGTGCTTTGGATATATTCGTTAAGA
ATAAAATATATGTACATTAAACATACTAATGAGTAAAATTTATGCTGATG
CTTTCCGTTTGTCTTATAAGAAAGGGTCAATACTATATATTAATAGATGA
ATATTTCTGTTTAATGAAGATTAACTATGTGCAGAGTTCCACAATTAAAT
ATATATAATTTTGGCATCGCGGGGTTCCTTTGTTCAAAAACATAGATAGT
AGAGAGGTTTGTTTTTCAACTTTTTTCAAATTTCGATTACGGCTAYTGAG
AAAAWGGMGTGYTATTGGTATAAAAATTACCTATGCAAAATTGTTTTGTC
CTAAGAGGTCATTTTAGGTCAAACATTTCGAACAAATTATAAAAAAATAC
AAAAACTCTTTACTTAGTGAATATAGATACAAAAAATTCAATTTGTGTTA
TTTGGTATTAAATAATTTTTATAGACATTTTTTTAGCCTATAAAAAGTGT
TTTTTCTAAATTGTCCTATGGAACAAAAAAAGAAAAAAAAGGTAGGAAAG
TTTGACAAAAACACTTTACTTAGTAAATATAGATACTAAGAAGACATTTA
TTGATTCTATCAAAAAATATTTTTAATGGAATCTTTTTTAACATATAGAA
AGGGTTTATAGATTTTTTTTTCTTAAATTATCCTATGAAACAAAAAAAGA
GAAAAAAGTTAGGAAAATTTGAGGATCTACGTATACTTCATAAATGTTTT
TAATAGCTTAGACTAATGTCTATCATAATTAATTAATTCAAAATAATGAT
GAATGATGAATTTTAGTTTATTGACGAAATATATAACGTGTGTCTCCTTT
CAAAATTTGAACTAGATGTCCTACTWAAAGATGATATCATAGGGCACATG
AGAACTTTTCCGAARTAGCCGTAATTAGGATATTAGGAAAAAGTAAAAAT
ACAAACCTCATCTGTTTTTGATAGATTTAAGGCAATGATTCAATTTCATT
GGATGGMCAATATATTAATTATGTATCTAGTATTCTTATGAATGTGGTGT
TTAACCAGGGTGCACCCTAAGGAGATAGGCCTTGTATAAAGTGCCATCTA
ATTAAACAAGATATTTTTGTAAAGTTAATCTGGGGGAATGGATCTATTGA
AACTACAAAATTGGAAGTAACAAAGTTAGTACAAAACATAAGAATCACAG
CTGTAGCACATTATAAAGTTAAAATATTAAAAGCTCAATCAATCGTATTT
ACCAACATAATAAATGAGTAATTTTTAGAGATCAAAATGAAATGTTAGCA
TCAATTAGTTAGGATTTGTGCAATGGAATATGTGATGCGTCAACATAAAA
ACAATTTTTTCAAACAAAAATAAATAATAAGAGAAAATCCAATTTATTTG
TTTATTTCATATATATGCACATATTTCCTAGACAAAAGTGAGTCAATTAT
AGAATTTATAATCAAATTTCTGGGATGAATTCAGATACTCAAGAATGTTA
TCTGTAGTTTAAAACCTTTATTTGATTTAAGATGCTCATATTGATCCCGA
TTCTGTCTTATACATAAAATATTTCAATTTCTCATTTTTTAATTGTGACT
ATCCTATCTGCGATTTGTGGCACACCCAAAAGAATAAACGAAAATTTCTT
CATAGATAAAATGTCACGTGTAGAGTTTTGATGCAGTCACAAAAACAATA
TTGAACAATAATCAAGAGTAGGAGAAAATCCCAATTAATTTTTTTATTTT
ATATATACATACACGCATATCAATATTTGATTGGCATATTTGAGTCAATT
ATAGAGTTTGTTTCCCAATTTTTGGGATATATTAAGATACCCAAGGAATG
TAGCTATAGTTTAAAACTTTTATTACATTTAAGAAGCTTAGGTGGGCCCC
AATATGGCCGMTGAAACAAAGTCTGACAATTTTTTTATATTGTAACGATT
AACTACTTTAAATGTAATTTGCAGGACTTTCAAAGGGTTTATAATAATAA
TTTATGGATAGAAATTGACGAATATTTGTCGAAGAATACAAATGTATTCC
ACACTCCATTTTGAGAAAATGCTTTCTAGCTTATTTTTCTTTTGACAAAG
CGCATATATTGCTATGAAAAGAACAATATGGCAACTTGTCCAATCCTTTT
ATTCATACAATTACAATTTACAAATAGCACCGATTTGAAAATATCTGAAA
TGGTTTTTTTGCTTGAGGCAATGTTAATTAATGTTTTCGATTCTTCTTTT
TGTCGTTCAAAATAATTCATGATCTTACTAAGCARCCGCCATTCCTTCTC
ACTTCCTCTCATCCCCAACATATTGTACACAAAGAAATTAACCCCTTGTA
TTTCTAGGATTTAAATATACTTTCCATTTATGTATACATCATATTATAGA
GCTAAAGAAGGATTAGGGAATATATTTGGATCACAATAGAAGAAATCAAC
TAATGATCTCTAATCTTCCCAACCAGTCCCCCCCCCCCCTTCCTCTTCGT
AATGAACCATTTGATTAAGGGGTTGGTTCTATGAACATAAATTTGTACAG
ACTGGGATACAAAACTTACTTACAGTAGCATGACTTCATTAAGAAAAATG
TGATTTTTATTATACCAAGAGAAGACAACTCAAAACCAATGGGTAAATTG
TTTAAATACTACTTTTAGCTATATTTGTTATTCAATCATTCATCCTTCAC
AAGCAATAKCAGCCTCCACATAACGGTGAACAGATTAGCATCCAGGATCT
CATTCAAATTTGGATGAGAGGTATGGCAGACATTCTACTCCAAGACACTC
AAAACTGTAAGGCCTGGGGAGMTGAGGMCAGGGCCGGAGGAGGATCCCAT
GGAGGGAACCCAGACTTCAATTTCTGCTGAAGATATGGCTCTTTTTGGCT
GTATGGGGTTGTAATAAACTTTTTGATGTTATAGACAATCTGGATGGAGA
TGCCCAAGGTATCTGAAAGTTTATTGGCACTGACACTGGTACGGAGGAGA
TTGCACACCTGTTTTATTTCTGGTGTTGTTGATCCTATACTTTTACACTT
AGAGACATGGGACATACACAAAACTTACTAATTTTTCTTTCATCTGTCGT
TTGTTTACTGCATGCTTTGGATTCCCGCTCTATAGTAGTCTTGTTTCAGT
TCTTATTTATTTAGTCTAGTCCACTCTTAGGATCGGTACTATCAGTAGTT
TTTGAGACTGATCCTTAGGTCCGTCGGACTGTCAATACTATCACTGATTT
AAAAAAGAAGAAATAAAGTTAAATGACGCCATCAAGGACCGCAACTTATT
TGTTTTAGGACTAATATGAGTACTTAGTCCGAACAGACCGATACTGAACT
ACAGTCTTTACTCCTAAATATGGACCAATACCACACTACTCCGTACTATG
ATCTTACAAGAAATTTATTTCTGCAGTTTTACAAGAAAATTATTTACTTA
TTTGATCAATTTTATCAAAGTGAAAGCACTGCATTTATTTTGTATGTATA
TCGTTTGAACTGCCCGACACACTGATGGTATCTACATATGTGCATGCACT
GCTTCTCTGCATGGCTGTTAAATACACACACACATAATAACCTACCTCTA
AAAATATCATCATCATTATCAAAGACAAGCAGATGTGACCAAGGGAAGAT
GAACGACGAAAAAAAAATGTCGTTCATTTATTTTTATGTGTAGAATATAT
ACATGACTTTGAAGCCATCTCGGTTTTCTGTGTACATTTTTATACATACA
TAGATGTATCTTTGTAAAAAAAAAAAAGAAAGGAGAGAGAGAGAGAAAGA
AAGAGAGTCTCAGATTTCAAGAGACCGACATTATGAAGTTTAACATCAAT
AACAACAAAGTTACCTCCTTCTGTTTCTTAATTCTTTTTCTTATTTCAAA
ATATGCTACGACAAGGCGTGTGCTGCTGCGGTACGGCGAGTACATTCTAA
AGATAATTACATACTTACATTGAATCACCCCCCCCCCCCCCCTCTTTGTG
TCTTTTTTGAAGTAATAAACAATCTCCATTTTCCCCAGTTTTTTATTATT
TAAATTTAAAGTAAAATATTTCCCCTACTCTTCACATAGAAAGGTAATCA
TTTCTATCAATCCACACTCTACCGACAAAGTCAAATAGCTATTTAATTGG
AAAGGGTAAATAAGTATCTATTAGACATGGGCAGAAATATAAAAAAAATC
TGATCTAATATCCTTTAAAAATTATCGTCCGAGACAAATTTTGCCTGCTC
AGCACTCAGAAAACTTTTAAGTTTCACAAACTCAAAATTTTATAAACTCA
TTTGAAAAAAAAAATTTAAAAAATGAATCCGTATCTCATGGACAACGCAC
TTGGAAGAAGTTATTCTCTTAAACGCAATGTGTGTACGCTCGTGCCCAGG
TGATTCCTAGAGAAAGAAATATACTTTATGTATTATGATTTCACCAAAAG
ATTCCTAGGTTAGATGGAGTAAATGTAATTTTATTATAATGTTTACTTAT
ACTTAATCCGTGCAGCAGCTCCATTCAACCAATTAAAGAAACATTTAAAA
AAAATATTCTCATAAATTGTTGTAAAAATCACAGAGGCTGCATCGTKCTC
CATATGATCTCTATTAGAAACAATGSCAGCCTCAATACTATCCCTAAAGG
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GAGATGGTGGACTTCAGATCATACACTTTCGGTGTGGGGTTGCATTTGTG
ATGCCTCCATGGTGAATAACATAGAGTGCTTGAGGGAGTTCAAGTATAGG
ATGAAGGAGGTCACATGTGCTCGGGCTAGAAGTCAGCAAAGTTTTGTATG
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TTTACCTCTTGCTCACTCATTTGGTGTCCAATTCAAAATAAAACCTGTAT
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GATTAACTCAACCTCTACATTTTGTTTCTGCACCCTGTAGAAGATCCCTG
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CCTGCCTTCAAATATTGAAAAAAAAATTCATCCCATTTCCTTTTCTTTCT
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TGAGCGATATATCAGCCCACGTCTATTGCCTATGAATGTAAATAGGACTT
AAAGATATTAAAAAACCTTTATCCACAAAATATTTAAGTGACAACAACAT
GAAAAACTATTATCTAAACTGCAGATTTTACGTATAATAGGGTGGTTTGT
TTTACCAAAAATTTCAAATTATAATTACAGCTAGTGAGAAAAATTTGAGA
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AAAAAGCCCAAAACTCTTTAGTTAGTAAATATACATACTAAGAAGACATT
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AAAAAGTATCTATGAACTAAGCTACTGCTCCCGGCCACCCACATCGGTTG
CTGCTTGGATAATGAAAAAAGGAAAAACATAATTTTTCATTTTTTATTTT
TTTGTCTATTTTATAGAAATAGTTATTTAACATATGTAATATTTTCCATT
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TCTCATTTTGTATGCTTCATTTATTACAGATCCACAAATCAATCAATATG
GAGAAGTAAATCAACTTGGAGGCATGTTTGTAAACGGTCGACCCCTTCCC
AATCACATTCGTGTACGAATCATAGAGCTAGCACAACTTGGAATCCGTCC
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TACTTGCTCGTTATAATGAAACTGGGTCCATTCTACCTGGGGCGATAGGA
GGTTCCAAACCTCGGGTAACAACCCCGAAAGTTGTCAACTTCATTAAAGA
TTTAAAGCAAAAGGATCCAGGGATCTTTGCTTGGGAAATTCGTGATAAGT
TATTAAGTGATGGTGTTTGCGACAAATATAACGTTCCCTCTGTATCGTCC
ATTAGTAGAATTCTACGCAATAAAATCGGCACTCTGAACCATTTAAGTGG
GCATACTCATTACAACAGCAAACAGGTCTCTCACAGCAACAATAATAATA
TCAGTAGCAGCGACAACAATCACACTAATAGTAGTGGGGGCCTTCAACCC
AGCCAGCAACAAATTCTCCCATCTCCACACTCACCAGGACATCARCKCCA
TCATGCTCCCATTTATCCAAGTTTTTACCAGCCATACCCAAGTCATAACA
ACAACAGCATCACTAGTCAGGAACCARCCCCACCAATRCCCTCCAATGTA
TCTGCRCCTGACGATCCGTTGAACAAACCCATGGAGTCCAAATGGCATAA
CACATCATCCCCGACGGATCTTTTCATGACATACTGCGGTATTCCTCCGC
ACAACCCCATTTCCCCACCACCTTCCATGAAACCCATTCACCACAGCAAT
TCATCCCTTTCGCCAGCTCCACCACCCCCTCCTCCCCAAACGCCAATGAC
CTTTGACCCCACCTTCCATCATCACACACACCATCATCACCAAAACATCA
ACTACTATATGTATCTTCAGTCCCACCATCAACATCTTCTCAACAATGCC
GCCCAAGGATGCACTTTCCCCTCGGCTCTTGAAACAKCAGCCAGCTCACA
RCCGCAGCATCCATCCTCTTCTTCTTCATCGTCAGTCAACAACGAAGGTG
GGGCGGAACATCACCCACGACTCAGTGGGAGTTTGATCCCTCTTCATACT
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