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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s362 | supercontig | LSalAtl2s362:268152..296741 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006590 >EMLSAP00000006590 ID=EMLSAP00000006590|Name=EMLSAP00000006590|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=323bp
MQEQEAFNTPEQPARTPLRELTKVTTGPRAQFSSTLHSSSSHITSSRRQP YSSLKASLRKGFHSSVKSATPDPEGPGIAAFLLTALSFLLIVITVPFSLC LCIKVVAEYERAVIFRLGRLRKGGSKGPGIFTVIPCIDTYRCVDLRTVSF DVPPQEMLSRDSVTVTVDAVVFFNIIDAEQALCIVDDFRRENFLGHFIAT TKKILSRDSVXVAVDGVVYYRVSNPTICISNVENFSKDVRLPVQLQRAMA XEXEAAREARAKVIAAEGEQKASRALKEAADVIQESPSALQLRYLQTLNS IAAEHNSTIIFPMPINLTSYMSK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s362:268152..296741- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006590-702437 ID=EMLSAT00000006590-702437|Name=EMLSAT00000006590|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=28590bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s362:268152..296741- (Lepeophtheirus salmonis) ATGCAAGAACAGGAAGCCTTCAACACRCCGGAACAGCCAGCAAGGACCCC
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CTGATGGAGTAATTGTAATAGTATAATGTTAACTCATACTTAATCAGTGC
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AATATTTTGATTTATTTTATTGCTCCAAAATGGATTTCTTCTTTCACTTC
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ATGCMCTTCCKGCGGAGGCCTCTGTAGTTCATGTTGTTTAATTCATTCAC
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TTTGGGTAATTTAGACCTGCTCCCCAACCACTGTTCTTCAATGTGTCCCA
GCGAATCGTGAATGAAACTTTGGAAAGGGTTCGTTGACTAACTAAATAAT
TTACCGATTTCTTCCCGAACTACTAACTAGTTGAACAATATAAACAATCA
ATTTTTATAAACAAATTTTTTCCTCAAAACAAGGAGAACGGAGATGGATG
CCAAAATAATTCGTCAGTGGTTCATGAAAATGCAATGGGATATGACGAGA
TCTCGTGTTTCGTCCCTTGATCAAGTATCTCATTACCATGATAAAAAAGT
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TGTTACTTTATTAGATTTTTTTTTGTTCAGGATAAAGACAATTTACGTTT
AAATAAGGTTAAAAGTTTTTTCACTCTGCAAATTATGCAACGGAGCAAAA
AATTTCATAAATGATTTTTTTTTTGGATAGCTTAAGATTCTTGAAATTTG
TTTTCAAAAAATTTAATTTTTGAAATTGGTTCCTAAAGCATTTAATTTTA
GTTGAGTAGCTATGGATTTGTTAAATTTTTAATATTTGAAATTTTTGTTC
CAATAAATTTAATTCCAAAAACTAGTCCAAAGAAAATAAATATATATATA
TATAAATAATCCTGCTGGTCCCTCTACTGATCAATGTGGCCTCCGTACTC
AATAGACTGTAACCTTTTTGACTATGGGATCGAAGGCACCTCCAGAAGTA
GGCCTCTGACACCTCCTTCGGGAATGTGTATCCCTTAAAGGCCACGATAG
AAAAGAGGTGGGTTAACCTGTTGGCGGAATACGTGAAGAAGATCTAAAAT
ACCTTTGGGCATAGGATTGAAGGCCTAGTAGAGGCTAAGGGTGCCCACTT
TGACATTTAATTCTTTACATAAAATAAAATAAATATATAAAGTCTCATTG
TCCTTACTATTTACTGGAAAATTCGTTCACGATTCGCAGGGACACATTGT
AAATACTTCTAAAAATTACAAGATTTCGATTTTGGCTAATTTTAGTTTAA
GGATGTAATGGAATATTTATTTTAGAATTGCCCCCCAACAAACTCCATTT
TCAGATCACTATGAAATAGTCAACAAAAGAAATTGATGATTCACGCATTA
TGGAAAATTCATTGCTAACCTTTGAAAATATCTCTAAAAAAACACACACA
CTTTTTGCTTGGTCCAAATCAAATTGAATCATATTAGTTATCATTGGGGG
ATAATTGGGGATTTATGTAATTATTTGAAAATAGCTAAGTTGCCTTCTCA
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TTTCAATTTCAAATGTATTTATTATGGCTGAAAGACTTAGTCTAAACTAT
TATTGTAATTCTGAAAGATGGAACATTTATATTTCAAATGGACACCTTCA
TAATATTTCATTTCGAAAATAGTGATAACTTTCATATATACGTCTTACCT
ACACTTAAATTCAAGTTCTTATACTTTTTTAAATTCTTATCTTTAATTTT
ACAAATTTAGGTTGTTGCAGAATATGAAAGAGCAGTTATTTTTCGTCTTG
GACGATTACGAAAAGGTGGATCCAAAGGACCCGGTATCTTCACTGTAATC
CCTTGCATTGACACATATCGGTGTGTGGATCTAAGAACGGTTTCGTTTGA
TGTTCCCCCTCAAGAGGTAAGTGATTTTGTGGTTAGGGAGCCTTGACGCC
ATAGCAATAATGCCTCATCAGATTAATAATAATGCTTTTATTATACGGTA
ATAGCTACCAAACCAGTAACATTGGAGTATGTTCGGTAATTTTAACGTAA
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TCGTACGATGATCAAGAGGAATTTAATTATAAATTGAAAGATTTCCTAAT
TTTGGAGAAATACTTAAATACACTTTTCCAAAGTGTATTTAAATATTAAT
AGAGGAGTTCAATATTCAATGACGTTAATTGGACTATTATACAAATGAAT
CAAAATATTGTTTCGGTCTTAATTTAGAAACTATAGCTGCAATTCTATAA
AAGCTTGGTACAGTCCCACAAATCCGTCTCAAATGTAAAATAATACCAGC
CCCTTATAATGAATTGAATCGTGCTGTTTTGCTGTCTATATCAAAGTAAA
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ACACTCTCCTTTTTTCCTACCAAGGGCAACTTATCTATTTTACTATTAGT
ATAGTTGTTATGAAATGAAAGATTGGATCGAATTACAACAATTGTGCATT
GAATGTCTTAAAAATATAAAGAATTATAAATATAAAAATTATTATTCTCA
TTATTTGAAGTAAATACATAAAAAATATAATATTTTCTTGAGACATTTAT
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ATAATATTCCTTGACAGGAGAATACTACAGTGTGTTCCAGGAAATCGTTG
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GTAGATGATATAATTCTTTCGATTTTTGTAGCGAATAGAAATAACTTTTA
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AATCTTTGTCTGAGGAAGTTTTGAAGTATTTAATCTGCTAAATTAATTTA
GCTAGTGATATTGTAACATAATAGTCACAATAAACATATTAAGTACTTGC
TCAGTTTAAATCCAAATTTGGACCAATAGTTATTATCTCTGACACAAGTT
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TTTTTTTAGGAAGAGTTGAAATATATAAGTATCTATTTTGGAAAAACATA
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CAACAAATTTATAAATATATGAATCTAATTAGGTATTTAATAAAAAGTAT
AAGATATCTACTACCCAAAGATACTATGGGAATTGGGTTAGTTGGATATT
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ATTCAGTCACTGTAACTGTGGATGCTGTCGTTTTTTTCAACATTATTGAT
GCTGAACAAGCTCTCTGTATTGTCGATGACTTCAGGTATATAAATTTGTA
GCAGCATACTTCTGTTGTCTTGAAAGTGAATGTAGATTATTTTTCATATA
TTCTTATTATATTGAAAAACAACCAAACGAAATAAACTTTAAAGATCAAA
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ATGATTATATATCTTATATAACTATAGTTAATAAGTTATACTATATAATA
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TTTTTCACGTTTCATAGTGTTTTCAGTCATAATTATCATTTAAAACCATA
TGTGGTCTTACCTAAATAATAGTGCCTTGCATCAGTTGACAAGACGTGTT
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TTTTGACCAATTATAAGGGTTTTTTTAATGTAGAATTGTTATTAAATAAA
TGAGAATATTGAATTAAAACAAACGTTTAATGTATGATTTCCAAAATGGT
AAGTGGACCCCAAATGGTACACATCTGGTTTGAAAACCTCATGTAATACA
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TTTTTGAGTGTGCGTTTATTATTTTAAAAACTACGTCAAACTGCGGTCAA
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TGTGATTAATATGAGTTTTCAAGGACCTCAGAGAAGTAACAGAGGTTTTT
AATTGAAATTTCTATGTTAAATTTAACTTTATTAGATACAAGCACAATGC
AGTGCATAACTTTCTTTTTCAATCAATAATCATATCCTGGTTGTTCCTCT
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AATATACTATGCAATTTCATGTTGTGCGATTATTTTTACTATTATTGTTC
TATGCAAAAGTTAAAAAAAGACAGAAAAGGATGAATCATTTTATTATTTT
TTTCTTCATCCAACTCCCTATAAAACGTACATTGAACTCACGATGAGTTG
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TTTGTGTAGACATATCTGAGATTGCTGACGGTGACTCTTCTCAGAAAAGT
GCACAGTTAGATCAAGCTATTTGGACGAAGAACTTGCTATGTAATACAAC
ACTCAATAAGTCATCGGTAACATTATTGGCATACCTACGTAACTTCCGGT
TAGTATTAACCCTCAAACAGTAAAGTTTATTTGTATCCTGACCGTTAGCT
TAGAGGTTACAGTCTTTTTAGTGACCCCAAAATTGTAAACAACTTTTACC
GACCGCTCCCAACTCAATAAACAATTTTCTTGATTTAGGCGTGTCGTTTT
GGATCCGCTTATAATCAATTTTTAAATAAGGATGCATGAAATTCTATTTA
TTTTGCTGGAAATAGCTCGAAACAGCGCTTTGAATTGTCGATGTTTGTTG
ACCCTGTGCGAACAAATGACATACGCACTTCAAAATAAACTTGTATTTGC
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ATGTCTTCTATCTCACGCAACTTCATTTTATTGCATTTTAAAACTATTTT
GGAGATACTTTTTTGATGTTTTGTGAAACAACTGCCGATTTATGTAAAAC
AGAGTATTTAGCATTATCGGTACCTTCACATTTAAATTAATCACACAGTT
CAATAATAGTTGATATCCCTGCTAAAGAGATTCTATAATGCTTATCATGC
CATTGTTTGGCTTCAACAGTATATTTCCACATCAAAAATATACAAACGAA
GATCTTTTCTATACATTTTTTTGAAAATTACAAAAATGGATTCCCWAAAA
CGACAMTAGCCTCTAAACAGACGATCAAAATACAATGAATTTTTAAGACA
TATAGTTTAAAATTTAGTACCAACCGGAAATTACTATGGGTTGTCTACAA
TATTCCCATATATGTATCAGACAAGACTTATTGAGTGATGTGATTATGCA
GTAAAAGTTGGATAACTTAGAATAAATTGGAGGGACTATACGATTTTTGT
TCGAGATACAGAAAATGAAAGACAAAAATAATGGACAATACTTTTGGTTT
TCTATAATATTTCCAAATAATGCTTTCAAAAATTAGTTTTATCAATTGGA
AAATTTATAGAAAACATTAGTGGTACTCACTATTGAAACATTACTTTGCT
TTCAAATCTTTGGATTGAATATATATCAACTTGTAAAAACAATCTAACAG
CGTTTCATAGTTTCTTATTGAGACTCTATCGATGTATCGGGTACACGATT
CAATCGACCGGTTTAGGCAATTTAAAATTAATTGAGAGTCAGCAGAAGCT
CCCTTTTTTCGCTAATAAAAAAATATAAAACGAAACAAAAATATGAAGAT
ATTAATTTTGGTTAAAAATTCTACACATTATGCCCATTCCCGAAAGTTCA
TTGAGTTTCACCTTCATTGAATATTAGGTTAAGTAAAAAGTTCTGAGCGC
CTTACGCTAGATGTGTACGATTAATACATTACATTAAAAATGTTTATGTT
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ATGCTTTAATAACACTATGACCACGGTGAAAAGGAAGGGGAAGCCGGCAA
AATTGTGACGTTTATGGACCCAATATAGTATCGAATGCAACAGCAAACGA
TTCCCTTCTGGTAATATGGACGTAGAAAATGTCGATAAAATTATGAAAAT
CGTCGAGCTGCAACGTCATAAGAGCACTTATTCCATTGGCCAGGAACTGA
AGATTAGAGAGAAAACCTTTTGGAACTATCTAAATCGAATAATTCTAACT
ATTTTAATTGTCAAAATAAGGGGGAAAAAACGCTCAGAACTATTTACTTC
ACCTATTAAGGTTTATGGAGAGGATCATCATTATAATTCACCCCTTTTAT
CCCTTGATATTTCGAAATTAATGTATGGAACCCATTCTTCCCACACTCTA
TGACTCATTGTAGCTCCATGGACTTTGGCAAAAAACGCGCATCATTATAT
ATATTCTTTATTTTTTTCCTACTTAAAAAAATATTTGTTTCATTTCCAAT
TTATTTTATTATTATTACACTTTTTATTTCAAGATATTGACGCGGGACTG
CGTCACGATCAGCGTGGATGCTGTAATCTACTGGCGTACCTCTCATTCAG
ATAGGGTTATATGCGTTGTAGACAATATAAAGTAAGGAAATATCTCTCTC
TCTATCTCTACTGTAGTTTAAAAGAATATTATTTGCTAATGTCAACCCCT
GTTATGCGCTTATATCCTTTTAGGTATTAAGGGCTCGTTTTCATTTTTTT
AGCTCTGTGTTGTTTTTTTGAAACTACATCATAAATAAAATTTTAAGGAG
TCCTTTTGATTTTTTTGATACTTTTTTTATTTAAAGAGACTATTAAAAGA
AAAAAACCTATTCTAAACACATTAATCGTATGGCTCATCAATCCAAGTCA
ACTCCGAACACATGAACATCACTCTATAATCCCAAAATTGAAAAACAGAG
AAAATAACGTCTAACAATGATTAACTCGTAAATCATAGTGGTTTTATAGA
CATAAGCCTCTTATTTGCAGCCCTTCTCTGATTTAAATTTCTATACGTTG
TAATAAATCTTACTGACTGTGGGGTTTCGCCAATTAGTATATAATTTGGG
AATGTTAGAAAGAAACCCTTAAAATGATTATATATGTGATGCTTCCATCT
TCATTACTTTCATAGCAGTGACGTTATATGCTAACTTTTTAAATAGTGTA
GGATTTGTTTACTTGGTCCAATCCATTATAAATAACGTCATAAATCATAA
GCTTACCCTTTCTCTCATGAATTAAAAATAAGTGAAATTTAAAATTTTCT
ATAACTTTTTTACAATATTTTGACTATAAGAAACATACTCCAAGGAAAAA
CATAAAATAATTAAATTTTTATTTCATATTAACACAATATTAGAATGTAA
CAATAATGATCTATAAAGTTTAAGCTCAAAATTTATTTATTACTAACTAA
GAATGCTACCAAGAATTTCATTTAATAAAACACAATTTTTATTATTATTC
TAATAATAAATAATTTAATTAAAGTTTCATAGACTTAATTATTAAAGTTT
ATTGTAACTGAAAGGAATAAAACAATCGTGAAACAGGTAAACTCAAGTAT
TTCCAATGCTAAAATGCATGAATATTTATCCCTAAACAATATTAACCCAA
TAATTCTTGCAAGTCATCCTTTTTTTTATATTTTGTTGATAATAGAGACA
ATTTTCTGAAGTGTTGCTCATGGCAACGTTATGAGAGAAAGGTTTAAAAA
AAATACTGTCATTGGCACGATAATAATGAATGTGTAAATAAATTTCCGAT
TATCCAAGTAGTGATGTATTAATCCTTATTTGAGAGTACCGCTAGCTGTC
CAGTCCATTCCCACTTATTGGTCCTTTTTGAAGGCAAAATCGATCTCCTG
TGCTATCATTCAAAGTGTTCTTCCTTTTTCTAACTATTCTGTGTATTAAT
AGAATAAACTATATTAATAAATTATATGTTCGTTTTATATTGCGTTAAAG
TGATACAAGTTATATTTTTGCAAGATATGCACTTGCAAAAATTGTATGCC
CTTAATACATATCTCATATATCTTATTTGATTTGATGAACCATCTATATT
ATTAGGGAAAATTTTAACGACTAATAGTTAAGGAAAGGTTCCAAGGAAGC
GACGGACATGACTCTTTCAAATATTGGACTGTATCAAATAAATAGGGACC
AAGGCAACACTATCTCTAAGTATTATCTTAATTTTATCAACTCGAGAAAG
CAATATTCATCATTTAAGGCCAATTTGTTCAATCATGTCCCTACTAATAT
TTCAATGCTCAACGCTAAATTATAGTTAACCATGTATGCCGCCATGCTAA
AGACTAGTTTATTGATATTTACATACATGCTAGTGTTAAACCCTTAGCCC
TAAATCTATTAAAAGAATTCTAGCGTACAAATTACAAGGAATAAATCACT
AATTAGATACTAACAGTTGAATGTTGGACATTTTTACAATATAATTGTAA
AAAAACCAAAAAAACTCATCGGTAAATAGCGCTAACATTTAGTTGTAAAA
ACACTAATTAATTCTACCAAATGACATTGTCCTGCTATCTAATTCAAATT
ATTGAGAAAAATGTTTTACAGCTACATCAGCTACCTTAAAAAGTTATTGA
TTACAACGCGGTTGGAGAAGGGCTTCAATTAAGTGATCATATCTTATGAT
AGGACACACTTAGTGAGTTGAAAATTAGCACATATTCATTTCTTATAAAT
AAGAGAGAATGTTTCAAAAACAAAATATCCAATTCTGTTATAGTCGAGTG
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AGTAGTGTTGGATCGGTCCAAAAAACAAAACAAAAAAGACTACTGTCCTA
TCAGTCCGGCCAAACGAAATTGTTTGTCGTAGAATCGGTCCTTTTGGGTC
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GATAACTATTGGAGGACTCTTGAACTCCATAACATTATGAAGTCATATGT
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TCTTATCTATGAAGTACTAATTTCCAACTTTATCTTTGCAGTTGAGGTAT
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