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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s41 | supercontig | LSalAtl2s41:164202..216377 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007374 >EMLSAP00000007374 ID=EMLSAP00000007374|Name=EMLSAP00000007374|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=937bp
MXLPLLIALLLSIHLPGATPLEEKGIMSIIFIHPPQFTKMRILLLLLCIV LWKNPSPVEASSLGGIKSHHFRFNSQPHGKICIGTKGRMSVPNNREHHYR NLRDRYTNCTYVDGNLELTWLQDENLDLSFLQHIREVTGYVLISHVDVRK IVLPSLQIIRGRTLFKLSVRDDKFSLMVTLSKMHYLEMPALRDILEGSVG ILNNYNLCHIKTIEWEEIITGPRGKYVYVYNFNEPERDCTPCHESCQSGC WGEGPSNCQKFSKINCSPQCHKGRCFGELPRECCHLFCAGGCTGPKQSDC LACRNFFDDGVXKXECPPMQRYNPIKYRWEKNPEGKYAYGATCVKECPKH LLKDNGACVRICPPKKKTVNGECVPCDGPCPKTCHFNEVMHAGNIDSFQN CTVIEGSITILDSTFNGFQEXYENYTFGNRYPAMDPKKLEVFTTLKEVTG YINIQGHHPNFKNLNAFRNLEVIGGRTLTEYFSALYIVKTALTSLGLKSL RKIRSGAVSILENKDLCYAQEINWQKIMKSPSHNTLLQNNKNPQECIRQD HMCDPQCSAEGCWGPGNNSCLSCKKFQTQGKLEPLAGKAICRPCHSLCKK CNGYGFHDDVCQECVHFSQDQQCVPECDGDYYKDSTKCKPCSEECRGCYG MGPDKCLACKNYKVYLTGEFPEDDNVDSMPNPSTSTLQHNNSHKSTLPLG STSNVNSNNTLSRRQVNGLRLNLPMDDEEYLVPSPHSPHSAAAAAQQSNT TPNNNINNNTNAYMDLISDPKNPTMFPYPPPQGYFLTDNPPNYGRVPDFV DSSSTSSGNPNLTGRIGDYHTLGIPFIPNSPSSSQGGPPSIAGSTASYPM PPPVSTASLVVAAGSSAXSTPPATQQQPSSAGLNGVINGYCRSSNPPRSS GEESDDHDYYNDFERLNRELQPLHPRNTLPSKHETTV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s41:164202..216377- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007374-703221 ID=EMLSAT00000007374-703221|Name=EMLSAT00000007374|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=52176bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s41:164202..216377- (Lepeophtheirus salmonis) ATGNCCCTGCCTCTATTAATTGCCCTACTCCTCTCCATACATTTGCCGGG
TGCAACACCCTTAGAGGAAAAAGGTAAGCGTGGGAATTGATTATTATATT
ATTTTCTTCGTTTTTGTCAGGTGCAGGAATCATAAAAATAACAGCAAACG
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TCCCTTCATGTTTCTTCTATGCGAAGTATTTTTTGTAGTAAAAATTTAGT
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TGATTCCTCTATGCAATTCTGTCACCATCGGCTGTCAATAGTGTGACAGT
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CTACATGTATTTTACTCAACTACAATAAGAGGGAATCATTAAGAGGATTA
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CTTAATTAAAAAATAATAAATATTTGCTGACATTTTCTATGTAKCAAAGG
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GTATGAGTGTGTTCAGTATTAGTTTCCACCCGATATATTATGTACAAAGG
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TTACTAAGGCCTTAACTTAGGGAGCAATGTTGATAAAATTCGAGACAAGT
ATCCATCTCATTTTGGATTCTGAAAGTTTGCGTACCTGAAATTTAATAGA
ATATTTTAGTATAAAGTTCATAACCAACCCGAATCCGAGACAATATTGGT
CCTATAACTGAATTCCTAATCAGTTTTTTCCCAGGACTGCGGATTCGGAG
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TTATGTAAATAAAACGGATTTATAATCTAAGGCTTAGATTGATTGTATAT
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TTATGAAACTTGAAAGTTAACTCATTTATAAGTGTACTTCACTAAGTTTC
ATCTAAATTATTATGCAGGGTAGGGCATACCCCCTTGCCATGCAAGTTTA
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TAACATTCCAATGAGAGGTGATTCGTATTGTTGTTCCTGGGTGTCGAGTG
TATCAAGTATACTTAGAAATATAGTCTCTAGATTCAAATGACTCAATAGT
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AGTGGGTGACATTCAAAATACTTGAGTCGGAGTTGGGCATTTTATGTACC
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ATAATACTAATTATTATTATTTTGTTTCGTTCTCCCTTCCACAAAAAATA
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GGCATTCCCCGAAGTAGTCAGGCAGTAAGGAACTGGCACACTTTTCTATA
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TCGGGTTTATTCTACGTTTTTCATGAGCAACCTCACTCGTAGTTTCACTT
TATACTTCTATAATATCTCCTTAAGAATGAAATAATAACGGTAACAGCTT
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ATTGAGTTGTGTATCTCAATTTGTTCCAAAGTTATGGTCAATCATGTATT
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GTATCTAAAGCTGTAACTTTTAATCCTGCTGACTAACAAAGAAATAAAAC
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GCAACAACAGCAAAAACTCACACGCTAAAAAATGTTGAACATTTACAACT
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GACTCGATAATTGAATGTAGATATCGTTGTAATTTATGCTATATTTGGTG
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ACCTACTTTTCATGAACTATTATGTCGAATCTTTTTTGCTTAGTGTCCTA
ATATTTTTTTATTGTCTCCTCAGTGATCAAAAGAACCTCATAATAATTCT
GATTCATCAGAAAATTGCCTAGAAAGGATAGTGCCACGAAAATCACGCAA
AACATAAAAGGCTTAGTGGATAAAACCATTAGGACAACTCAATACAACTA
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TTTAATAGTGTTGTGTCGAATCGAAACAACACTAATTATATTTGATTTTT
ATTCTTATTTGAAAGAGATTCCTCTTAATTTAGCACCCCTTATTTCAATT
TATCTTTGTACATGTTGCTTAAAAAATCTAACCCATTACTCCTTAGTGAT
TCTCGCAGTTGTTAAATTAATAGTATGTTTTTATATAAACACACTTCAGC
CCATGATGTGAGATAGATAAACTTGCATGATTTATCTATTATTACATGTA
TTTTTATATTCATACAGTGCTGATGATTCAACTTGTGTCAAGATATGTAT
TCATTTGTATCATTCATAACGACAAAATTATTAATGTAATTAGCTGCTTG
CAACAATGTAGCCACCCTTAGCGACAATCATGGTATCCAGGCGGAGGCAG
AAGGCTCGGCACTGGCTGSAGATGTAATCCTATGTCATGTCGTCCTAGTG
CTGGCTGATGGTAGCTTTGAGGGCCTCGGTGTTTGGATGACGACCACTGG
AGGCCTTCCCCTCAATATTTACCTAATGTGGTCGAAGGGTTGGCATCAAG
GGTGTACGTATAGTTAAAAATAACACAAAAGACTCATTCAAAAGAGTCTT
ACGACGGAAGAGATGGGTTCTTTCATTGCTGGTGTCAAAAGTGGCCTCTC
CACTTTCTAAAGGCTCTTTCCACCCACTTTTTATAGCTCTTTGGAGATGT
GAGACCCTGAGGTCTCTTGCATTTGCAATATTCCATCACAAAATGTATGG
TTTTATCCAGAAAAAAAATCTGATACACTCTGTAGTATCTACTGTCAGTG
ATGCTATAGGGTTTCATAAGCCGATCCAGTGAGAGGCTACTTATCTTKGT
GCCCTCGGAGGKCAAAATTAAAAGCATTGAATACCCTCTTTGAGAAAGGT
ATTTAGGTATGGGCCAATTCTCACTTAAAGGAGGACCTTTCAATAAGATG
TTGATCATTCTCATGTGTCTACTGTAATTTCTGGAAAAATATATCATTTT
TAATATATATATTTTTTTCAACTTGTATTGATATCATATCCACTAGTATC
TTTTCAAAATTTTAGGCTTCTAATTATAAAAAGAAAAAAGTTAAATACAA
TTACTCATTGTACAGTATTTAGACACCCCTGTATGTATATTAGGAATTAT
GTACTTACATATATTTAAAGTATGGTGATGAAACGAGGATTAAGTCAATT
GTGCATTACATATGATCATTCTAGGAAAGGCATTTCACTACAGTCATGTG
GAACAAATGATATACTCGTAATAACAACAGTTAATTTATTATATTATTAA
CTAGTACTAACACGCAATTGCTTCTTATTCGGGAACAAACAATCACTTTC
TCAATTTGATTTTTTGGGAGGAGCTCAGATGATTGGGATATGAAGGCTAT
TATTTCAAGTGATATAACTGATATTCTGGGCTTTGTACGCACTAATACGC
ATTCACAACCCCGATTGACAAAAGGGAAAGGAAATATTTGCTCGATTGCC
TTCTGTATTTTTTTTATTGCTCACTGTTGATAATATTAATTATTTCGATA
TAATCATAGAGACATATTACCTTATCTATGGATATTACATATATACACAA
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TTGACGTTGAATTCAATAACGGCTTCGATTCAGGTCCTGAACCTTTTGCC
ACCCCCGAAAACTAGAGCCCGATCTAAATTATTGTATTCCAGGACAAARG
AGCCGATCAGGGACTTCTTGGTGGTGTGAAGACCTCTCTTGAACTTTGAC
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AGGAGGTCTAATATTATTGTATACTCAGTCATAGCAGTGATCCTGGAGCC
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TGTGCAGTTATGTCATAATATATCCCGGAAAAATTCTAACAATTCGGAAA
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