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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s469 | supercontig | LSalAtl2s469:434205..476826 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007945 >EMLSAP00000007945 ID=EMLSAP00000007945|Name=EMLSAP00000007945|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=239bp
MMASVPGNLLXPSLMPTLAGLIPLNQGSGALSVLHSLQQNRLLFQTPVVA AXAPGPSHXPPPQVPPEVTLGNGLFTSSGPIEIPSSSSNHHHHIMSMSPP ARSLSSSSSPPVGVDSGILFSTEESTELIKELQKEKESLESISAENKNHT LKLIDQEIQRLQSGLKGGGSGLKDSIKYVDVYRERPIRLTVRVLVPVREH PKVVQFCGETSWTERKLYEAFTGRNDVKNGGIGXGXHAG back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s469:434205..476826- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007945-703792 ID=EMLSAT00000007945-703792|Name=EMLSAT00000007945|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=42622bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s469:434205..476826- (Lepeophtheirus salmonis) ATGATGGCATCCGTGCCTGGAAATCTCCTTCKCCCCTCCTTAATGCCAAC
ATTAGCGGGTCTCATACCCCTTAACCAAGGCTCTGGAGCACTCTCTGTCC
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GCACGATCCTTGTCATCCTCGTCGAGTCCTCCGGTTGGAGTAGACTCGGG
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TTTTTATTTACTTATAATTTTGTTTTTCTTATTCACTGTGACTGAAATAT
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TACCCCCAATTTTCCTATGTATATTCAAACTTTTTGTTATTTGGAGTAGC
TGTCACTATGATTCCCAAAACTTCACTATGTTGGTGTATATAACTATTTT
TTGCCGTCCAAAAAAAGATGAGCCATCAAACAACTACCTCATCATAAGAA
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CTTCTTGTCAGATAATCCCCATTAATTAGCTTCTTTTCTTTTTTGCATTT
AAAATAATTGTGTGAATTTTCTTCTTTCAATATTTTTTTCTTAGAGTTTT
GTTTTTAGAATGAATAAATGTTTTGTTCAAGAGTAATTAGTCAACAAGAC
AGTCGATTAATCAGCACTAAAAGAATAGCAAAATAAACCTTATTCTACAT
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GAAGGATAGAAACGACTTAACTTTACATAGATAGGAATGGATTTTGAGGG
CCATGGGAAATCTAAAGATGAGACTACGGAGATAATGAAGGAGTTGAAGC
TTATTCCTTGATAGTGAATCATTTACTGACTATTACTTGTAAAGAATTAT
GCATTAATGGGGTTCTGTTCTCAAAGTAACTTTGTAGGCAGGAAATTAAA
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CAATAATTGAATATTTCATGGTTAATATTAGGTTAATTTTTGGTGAAACA
ACAGGAAAAGTAGAACATAGTTTTACTTTACCTGTTACTCTACTTAAAAT
TAGCCTAAACTGTATTTTTGACATTTTTTATTTATCAGTATTAAGTAGTA
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TAAATATAAGTAATGTTCATAAATAAAAATAAGACGATTGTGTCAATGTA
TGTATAGTTGGTAGTTTATGATATAAATCCCATTATGTAAATCTGTAGTC
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AAAAATCAATGGAATTGACAGTATTTTTTAGGTTTTTCTAATCAAAATTT
TGTGTTTTTGGTTAGAAATTGAGAATTTTTTTTTCAAACTAACTCTTTGA
CTGTTTTTGCTGATGTTTGTAAAAAATGAACAATATTTCTTTTTATAAAC
TCTCTAAAATAAGATCTTAAATGTTCAACAAAAACGTGCTCTTAGCACTT
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AACCACATTTTTTACAATTTAATGATCCATTAATGGTATATTTACAATTG
CATCTATCTTATTTTTGAGCCTAAGAATTTACAAACTGCTCAAATGGTAG
ATTTCAAAACTCAAGTAGTTGAGTTAAACTGACGAATGCTGCAATTAAAA
TAAAGTTTAATAGGGCATTTAAATTTTAACTTGTACAATCTCATTATACA
AGTCCAAGAAATACCATATGGTTTCAGATTATGTAGTTATGTGATTACTA
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ACATCTATTTAAATTGTAACAATATAGTTGAATTGCAAAAAGGATAATCA
ATAATGACGGGATCTATTTATACTTTCCAAGAAACCAATATCCATAAATT
CCATTCCTATTCAACTGTAATAACTTATGATAATGTAAATAGCCCCATCA
CAAGTAATCTCCAGTGCAAATCCCTCCATGCACAAATTTCATATAAACTA
GCTACTATTTTAGGTATAATAACCATATGACGTTACTAAAAATACATCCT
CGGAAGTCGAATTAATTTTTCTAGGAATATACTTACCCATCACGAAATAT
AATATATGCCATTGATTATATCTCTGGTTTTTTCTCTTTAATCAATTATA
TTTAAAATTAACTTCATTGAAAGAAATGACAAAATTAATTATTGTTTTAA
CAAATTTAATTTCTTTTTTTTTAACTTACATATTATATAATTATATTTTC
TTAATATTTATTAAGTTATCTTCTGTATGAAGAAAAGAGAGAGAAGGAAA
AACAATCTATTTGAAATTTTTTCTTCTTCATTTAAAAAATAAAGTTTTTA
ATTTGGANATCTTATCAATTTAATTAAAAGTAATTAATTTGTGTTTTAAA
ATCTTTTTATTTGATTTTGTACAAGGTTAGATTGTATGTAGACAAGTATA
ATACATATAACAAATGTATTTTTCCGTGAAACAAAAGCATACACTTTTTA
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GATGGAGAAGGAAACAATGACATGGGCAAGAATTACTCCAATGGAAATCC
TGAACTCTACTCTTAGTCCAATAAGGACTTACAATTATTTTTAGTATTGT
GTCAGTCCTTAATTATTCCATCCAGTCTTAGGGTAATACTAAAACTGATT
TAAAAAAGAAGAAATAAAGTTGATTGACAACTTTATAAGTTTTAGAACTG
AATTGGACTGGACAAAAACTGAACTGAACACAGCACTAATCATGTTCCCA
CAATATATCGTTTATGAGTTCATCCGAATACTCAATCTGTTTTTGAATAT
AATTTGAATGTCGTAGATAAGGAAGTTAAAATATTATAATGACAAAAGCT
AAGGAAAAGAAAATTCATTTTTCCGATTACCAATTTCAAAAAATATGCAA
TGATTTCCATCACTACTTATATAGTTATGACATATACATATATAATTTCC
ATGAAATATAAACATAAAAAAGTTTATAATTTTGATCGAAAACTCCAAAC
GTTGCTCCTTTCTTTCATTTATTCATTAAGGTTTTTACTTTCTCATATAT
ATTTATTATCTGTGAATACCAGTTAAGTATCTTGAATATGTATGTACGAA
CATTACGAAAGCTTTTTGTTAGTTTGTTCTTTGTACCATATTTATTTAAA
TTATTATGGGTTTTTTCGTTGTTGTTATTCATCTCAGCCATTTGCATACT
TAGAATATACCATCTATAAACAAATCTATTCATCCTTTCTACATATTCGA
CTTAAAAAAACTGAATAATAAGAGATTTAAGTAATCATATTGCAAATTGA
TTTAACCAAACAAATAAAATTTTGTTTTGTATATGTTCCTTAAGGCTAGA
TCCATATTTACAATTATGTGTAAAATTGACTTCCCAGACATTTCATCATT
TCAACTCATATCGTTATTGCTCAGATTTTAGTTTAAGATGAAGGGGTGCA
CAACAAAGGGGGTCCAGGGATGGCAACTCCTACTCTAATAACAAAAACCA
TACTACTTTAAGTGCTACTATAAATGACATTAAAATATTGTTTAATCTTA
TTGACTAGGGACTACTTGCTGTAGTGCTACCAAAATTTAAAAGACCCGTT
ATAAATCTTAAGTACACGTCGGAAGAGAATGTAAAAGTCGTCTCACAGAA
GATACTTTGCTAAATGAAGTCATCATAGATATCCTAACCAATTTTATCAT
ATAAGAATAATAAATACATAATCAGACATTTTCCATGAAACATTTCGTTG
GTATATACCCAAAATATATGCAAGTAGAGAGCAATGCAATGTTTGCTTTG
AGCTAGCATGCATTGTACAGCGTTTTTACAGCTATATGTTTGCGTTATTA
AGCAATGAGTGTATTATTATTTTAGTACTATTACCTGACTTTTTATGTTC
GGCAATTAACTGTTAGTAATTATGTATTTAAGTAGGTAGTAGTTTTTTGC
TGGGGATTTTAACACTAGAAAATAGGTATTATGAAGTAGTTCCATATTTT
AAAAATTTACTATCAAGCCATGGTCATAAACAAATTGTTCAGTAAGGCAC
AAGAAGCTAAGACTCTCTTGTTTAATTATGCCACTGTCTATTTAAATCTA
TCAAATCATTTCCTACAAAAATAGTTGGTTTCGTGAAAATAACAGATTTA
TAATATAATGTTCACATCAAATTATAATAATCTCTTCTTAAAAGTAAGTT
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CTTAACTGCAAATTTAATAAAGATTTTATTTTATGTATCAAATACTTATA
TCCAATATAATTGTATTGCTGAGAGATAATTTATAAATAAAAAAAAACAT
AACCCTATTAACAGAAGAAGTAAACTTAGGAAAACACATCCGTTATGAAT
GTGTTTCTAAAATCCACCTTTTGCTACATATACAACAAACTAATATTTTT
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TCACCATGAGTATGTGAAAATTGTCGTAATCCTCGCGAGTGTAAATTTTG
AAAAAATGTATATGTTGGTAACATTCAACTTATGAGTGCTTATATAAATT
ATTTCCCCTATTTTGATAATTAAAACGTATTAGCGATCAAGGCGCTATAT
GTAAAGATTTAAAGCAACATGGCGAAATGGGACTGTTAGCTTGAGTAGAT
TCCGTGTCTTAATGGTATATTTTTCCCCACTCAAGAATTCACTTTTTTTA
AACTATAGATGACGTCACTGTATAATTTTCAGTCATTTTTCCTTTAGGAA
GTATGCAAATGTTTCTTTATTTTAATATGATTAATATTCAAAATATATTC
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GTTCGATTATCTTCTGTGTACACTTTGTTTGTTAGTTTTAAAGAGAGGAG
TAGTCGTAGGAGTTAACAAATGAAAATGAAATCTCACACGAAAGTCTCTT
TGAAACATCAACCATTTTAAAAGATGATTCGTTTAACTTTTATGTGCTGT
TGTTTCTCTGTTACTTATACACCCCAGACAATGAAATTTCCTTATAGTAT
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TTATGCGTTCTTATTATTTATCTATCCGAACGAGGAATATGTAAAAGGGA
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TGGGTCCGATATAGTTTATATATTGCTAAAATATTCATTTTAATATTGGG
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TGTTACATACTATATAAAAATCATTTAAGAATTAAAACGTATCATTAGGC
ATCATCCAACTTCCTCCTCCCAACCAATAAAATAATGCACTATCATAGCT
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GTATTTTCTTCATATTTGTTTCCTAAGGAAATTGAAGGCTTTTTTATCTG
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GTCAGAGAGGGTAAACTGTAGAAAACAAAACAATTTTTGTACGACCTCTG
GTTGTGTTACACTTTGAAACATATATATCTCTGATRATAACTATAMATAA
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TCTTTAAATATGTATATTCTCACTAAGTACATGTTCTTCCAATGTTCTTA
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GAATATAAGCATGCATATGAATACAAATATAAGGTCAAATTTATAGACGA
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GAGGAAGGGGCCCTGCAATTTACGTAACTAATAATTATACATACATACAA
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TAGTAGGGATATGGTTCTTGAGATCGGTACTTTTTCTATAGATACATTTT
TGAAGGTCTTAATTTCAATTCCCATCCTCAAAATTTAGGTCTAGTTGACA
AGACCAAGATCAAAGAACTTTTATATTATTTGTGTCTCAGTTCAGTCTTG
ATCCCTTATTCCCTTAGTCTCAGGTAATATTGTATTGAGTACAACCAAGC
CCGGTTTTATCTTGACCTAGGGCTAGAATAAATACGCGAGTACTTTTTTT
TTTTTTTTAATTTTGAATTTATAACTATGGAAAGAGTGAATTACGGTTTT
CCTAAAGAATAACTTTTTTTTAATCATCCAAGTCAGTCACATTGATATAT
TTTTTATTTAAATGTCATTTCTATTTTTACCAGAATTTTATTTCAAATAT
CTTTATATTTATTTTAGAAAAAAGAGATTTCTATATATTTTTACATAATC
TTTTTTAAGAAAACGTCAATTACTTTTTTTTTTTTAAATCTAACCCTGTG
TGAGGGCGGAGAAAATGTATCCCATTCCTAGAAATGTACAATCCTAAACA
TTTTTTAGCGTGCGAGTTATTTTGTTGTTTTTAAGCATTGTTTATTTTTA
TTTTTCAAAGTTGTTATAATTTTTCTTTAATTCTTGAGAGATACGATCTA
AGTATAAAGTGTACCCACGAGAAAGTATGGTCATGATTGACGAAAAACAA
CACTGACGATTTCATAGGGAGATATACCTAAGTGTAAGTCTATGTAGGAC
TCAAAGAAGAATTGAGAATCGACAACAGAGTCATTCCTACCTAGATCCTT
GCTAGATATTGAGTGGGACTTCAGCTAATCTAATAAAGCGTCGTCACAGT
TAAGCTGACCTCTTCCAAAACATTATTCAAATTGGCCAGGTTTAAAGTTT
CTTTATTTTTACAAACCGAAAAGGTTTTAAATCTACAACTCTGCCAATCC
CCTTCTAAACCCGGACCTTATCACAACACTAATATTTAGCTGTGTAGATA
CACTTGTACAACCAACACATGATATAACAGGTTTAACATCTCTAGAGTCA
TCCCTTACGTATTTATTAAAGTATGCATTTGATACAAATAAGATTTTTCT
TTCATTTACAAAGGAGTGGCTAGATTTGAAATATGAGTATCATTTATTTK
TTACGTGAATGTTTTAGAAAATGATAAATTATGGATTTAACTTTCCATTA
ATTTTTGACTATCCCCTTTTTTCCTTTCCTTGTCAGATATAAAGTCCATC
ATGATGATTACCCCCTTTCTGTCCTTGATTTGCGTAAGAGTCTTGGTATG
TAAATGTAGATAGTGTTGTCTGCAGGGGGGGGGGGTCTCTAGCCCYCCCC
CCTCCATTAAGGAATGTTTGCTTCTTAATAGAAAATTCAATTTTTCAATT
TTAACTTTTCAAATATACAATGTTTCTCCAAAAATTTACATTTTCTACAA
ATAGGTATGGATTTTTGAAATTTTTTGTCAACAACTATGGATTTTTGGAT
TTTTTTTTTAATCTAATTTTTTGGAACAGCAGTAAATTTTTGAAAAAAAT
TATGAACAACTCTGAATTTTGGAATTTATTTGAGAATACCTATGAATTTT
TGAAAAAAAATTCCCAGAAATTTAATTTTTGAAATTTTTTTTGGCAAAAA
AAATCAAAAACCAAGTTCCCCCCCCTCAAAAAAAATTTAATTGATATATA
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GCACTTGGATTTTGATCATGTTTGTTTGCTTTTAACAGCATTGAATAACA
AGTTTGAAAACTTATCAGATAATTTTTTAAGTGGGTTTTATTTCCTATGT
GTAAGCATGTACCAACAGCATTTATTGCTACTTCTAAGAACATATTCCTC
CACAAACTACTTTATGTAATCGTCCAGAGGTTTTTTGTTCGGCAACCTGA
TACTATAAGCGTATCGGAGTACCATTGCCTTTAAAATGGTACGATACTCA
ACTAATATTGGAACTGGTACTTCCAGTGTCATTACCCTATAAAAATAATA
TATGTTCGCCAATGACGTAACCCCCTCTCATTTCTGATGTCAAAATTGTC
CATTATAAAAAAAAAACAAGAAACAAAATTGTATTTTACGANNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNACCGGACGCCAAAAGTAAGAGAGCTGTCAAATTTTCAT
TAGAATAACCATATATTTATTTTGCTTTGTTTTTTAAAAACAAAACTGAA
ATTTGTTACATCAAAATTTATTACTCCAAAAAAAAAWTTGAAAAATAATA
ATCAAACTAAAAGTAAGATTAATTATTGACAGAATAATGAAAAATATTAA
AAAGGATTGTATAATTGAAAAAAGATCTGAAATTGATTTTTTTTTTTAAA
TTACTAAGATCCGGAATATATCTTTTAAAAAAAAATCATTTTGTAGAATA
TGAGGAATAAAGTTTACACATTTACTCTGTGAAAATAATGCCATGCCTGT
AAATGTAAATGAATTAACCTTCATTACATTTCTTAAATATGTATGTATAT
CAAAATATGATACCAACTTTGGTATTGGATCCGAAAATTAAATATTGGTA
TCGATATAATTCTAGGTCAGAGTTTTAAAGTTACTTTTAAGGAATCAAAA
TATATACCTATAGTTAACGATAAAACTCATGAATTCTATCTCTACTTTGT
ATTTTGATATCTAACATTCAAAAAGCAATAAAAATCGAGAAGACAATCAT
TAGACCAGTTATTAGACTTGTAAATTAGTTAGGGTATGCTTATTTAATTG
CGTAATGTGTTGACAACAGGAATAAACAAGAACCTTCCTTGTATTATATC
CATTGTTTCCGTATATTTTCTACAGGTGCATGTAAATTAGTGTTGGATTC
GAGCTGTAGCTATGGAGTTTGTTCAAGTTCAAGTTATTGAGTCGATTCGA
GTTTTTGAGCATTGAGTCAAATTGAGTTGGAGTAAAGGTATCTGCCAAAG
GCAACTATTTTTTCATTGAATTGATATAATCTAATTTCATAAATAAAATA
TGCTTGAGTGCCTCAATAATAAGGGAGACAGACAGACAATTATTAATCAA
ATAAATTATTGTTTTTTAAGAAAATATTGATTTGCATAATAGGACATATT
TTGAAAAGTTGGATCCAGATAAATAATCACTAAAAACATTATGAACGACT
CACGCACAGAACTAGTGATGAGTCAGTCCTTATTTAAAACTGAAGACTTC
AGTCTTGTCCAGTGCAGTCTCTGTCCGGTTCAAGACAGTCCTGAAGATCA
GTCCTAAAATTTATATAGTTCGGTCCTTGATGATGAAGTTTCTCAGCTAA
TTTTCTTCTTGTTCTTCTAGTACTGAACCAGTAAGAAGGGCCCAGAGGTT
AAACATTTTATTTTATTCTTTTTGTTATAATTTATCGAAGAGTAGAAAAT
GCCCTCTCACTCGAACTTGACTTACTCAAACAAGTTTGAAAGGGTCTTTT
TCATTTACAGTTCTACTACTTCAATTTATCTTTTATTTCTTCATTCAATA
CAAAGTAGGTGTAGAAACAACTGGAGATGGTATTAATCCAATATTTCCAA
CTTTGATCCTTTAATAAAGTCGAGTTTTTTCTCGAGTTCGAGTTATATTA
TGTATAGTCCAACACTAATATAGATAAACCAACCGTTCCGAGTGTATCTA
TTATTTTTATTGTTTTCCTTTGTTGCCTCCAAGCGATTAATTAATAATAC
TAATTACATGGACATAAAGCATGGATTGTTTTAAAGTCGGTAAAATATTT
TCAAGTTTGCCTAATTTAGATTCATATCTTCTTTAAAGTAGGTAACTCTT
TTCTTTTAAAGAGAATCATAATTATGACATAATTATTACTATTAATATAG
CATAAAGAGCATAGCAATGTCAAAAACAAAGGATTTCAAATCCACGGATA
TGTGAAGAAAGGTCACCACTAAAGAGACTCTAAGGAAAAGGGAGACAAAA
ATAATAATGAAAATAAAATATCATCTTGAATTCTAATAGGTTTAAAGTAG
TCTACTGCACTATGTTCATTTATTTATTTACACGCGTCATTTTTAGGGTT
GGGATTAAAAAAGTCCCATCTCTTGTCATTTGATGATCCTTGGTTTGTGA
CTTAGTAAAAATTATTTAAATAAATGTTTTATTTTCATTATTATTTCATC
CGTCTTGTCCCATCTTTTTTTAGTGTCTCCTTAGCCACTACGACATCAAT
TCCTATTAGTGTTACGGTGGTTGACTTTTTTGAGTTTGCAGATCTTTTGA
ATTAATTAACCACATCAGACCCGCAGCATTTCATCTAATTTGACTACAAA
AGAATATTTGACAAAACATATACAAATATAATTATATATTTTTCCACATT
CTCATCAAATACTTTTTAATTTAATTTATTTAATTAACATTTAGAACTTT
ATTTACATGCCCATGCTCCCTTTCACACACATTTTGGCATGTTCCATGAT
TCCCGTGACATAACAAATAAATAAAACCTTCTATCACAACAATTAGAAAC
AATTTATGTAACTACGTGTCACAGAAATAGCAGAACGTGTCTTTCTTAAC
CATACGTTTAGTTTTATTTTCCACAGAAAGATTGTGACATCAAATTCAGG
GTTACTTTTTCTATGAATAAACAATCTTTCAATAGTTATAACATAGTCCT
CCCAGGAATTATTATTTTAAATGAGAATTTAGGGGGGGGGGGGGGAATAG
TACTGCATCACGGATAACGCGCACTTTTTATGTCCTATATACATAAGGTC
AAAACTTGTATAAAAAACGTTTTTCAAAGAGAAAAAGTGCATATAATTAT
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ATATGCTCCATATCATTCATGTTATAAGTACCTAACTACCTGCACAACGA
CGTTATATTTTTGCCTCAGCTTGTATGTTTGTTAATCATCAAGATTGTAG
CAAAAGTTATAGATCGATTTTAATCAAACTTTGTTTGAAGAATGCATATA
TATGATCAAAGTAAGAGACCATTAAATTTTATACACAAAACCTAAAAAAT
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